Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1412
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1412, 1383 aa
1>>>pF1KSDA1412 1383 - 1383 aa - 1383 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4558+/-0.000978; mu= 17.8224+/- 0.059
mean_var=84.3329+/-16.823, 0's: 0 Z-trim(106.4): 19 B-trim: 332 in 1/52
Lambda= 0.139661
statistics sampled from 8924 (8937) to 8924 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16
Scan time: 5.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6638.1 TMEM2 gene_id:23670|Hs108|chr9 (1383) 9377 1899.9 0
CCDS47979.1 TMEM2 gene_id:23670|Hs108|chr9 (1320) 6318 1283.6 0
CCDS10315.1 CEMIP gene_id:57214|Hs108|chr15 (1361) 3076 630.3 1.1e-179
CCDS47911.1 PKHD1L1 gene_id:93035|Hs108|chr8 (4243) 302 71.6 5.4e-11
>>CCDS6638.1 TMEM2 gene_id:23670|Hs108|chr9 (1383 aa)
initn: 9377 init1: 9377 opt: 9377 Z-score: 10200.8 bits: 1899.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9377; 100.0% identity (100.0% similar) in 1383 aa overlap (1-1383:1-1383)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MYATDSRGHSPAFLQPQNGNSRHPSGYVPGKVVPLRPPPPPKSQASAKFTSIRREDRATF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MYATDSRGHSPAFLQPQNGNSRHPSGYVPGKVVPLRPPPPPKSQASAKFTSIRREDRATF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AFSPEEQQAQRESQKQKRHKNTFICFAITSFSFFIALAIILGISSKYAPDENCPDQNPRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 AFSPEEQQAQRESQKQKRHKNTFICFAITSFSFFIALAIILGISSKYAPDENCPDQNPRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RNWDPGQDSAKQVVIKEGDMLRLTSDATVHSIVIQDGGLLVFGDNKDGSRNITLRTHYIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RNWDPGQDSAKQVVIKEGDMLRLTSDATVHSIVIQDGGLLVFGDNKDGSRNITLRTHYIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IQDGGALHIGAEKCRYKSKATITLYGKSDEGESMPTFGKKFIGVEAGGTLELHGARKASW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 IQDGGALHIGAEKCRYKSKATITLYGKSDEGESMPTFGKKFIGVEAGGTLELHGARKASW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TLLARTLNSSGLPFGSYTFEKDFSRGLNVRVIDQDTAKILESERFDTHEYRNESRRLQEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 TLLARTLNSSGLPFGSYTFEKDFSRGLNVRVIDQDTAKILESERFDTHEYRNESRRLQEF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LRFQDPGRIVAIAVGDSAAKSLLQGTIQMIQERLGSELIQGLGYRQAWALVGVIDGGSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LRFQDPGRIVAIAVGDSAAKSLLQGTIQMIQERLGSELIQGLGYRQAWALVGVIDGGSTS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD CNESVRNYENHSSGGKALAQREFYTVDGQKFSVTAYSEWIEGVSLSGFRVEVVDGVKLNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 CNESVRNYENHSSGGKALAQREFYTVDGQKFSVTAYSEWIEGVSLSGFRVEVVDGVKLNL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LDDVSSWKPGDQIVVASTDYSMYQAEEFTLLPCSECSHFQVKVKETPQFLHMGEIIDGVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LDDVSSWKPGDQIVVASTDYSMYQAEEFTLLPCSECSHFQVKVKETPQFLHMGEIIDGVD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD MRAEVGILTRNIVIQGEVEDSCYAENQCQFFDYDTFGGHIMIMKNFTSVHLSYVELKHMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MRAEVGILTRNIVIQGEVEDSCYAENQCQFFDYDTFGGHIMIMKNFTSVHLSYVELKHMG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QQQMGRYPVHFHLCGDVDYKGGYRHATFVDGLSIHHSFSRCITVHGTNGLLIKDTIGFDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 QQQMGRYPVHFHLCGDVDYKGGYRHATFVDGLSIHHSFSRCITVHGTNGLLIKDTIGFDT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LGHCFFLEDGIEQRNTLFHNLGLLTKPGTLLPTDRNNSMCTTMRDKVFGNYIPVPATDCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LGHCFFLEDGIEQRNTLFHNLGLLTKPGTLLPTDRNNSMCTTMRDKVFGNYIPVPATDCM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD AVSTFWIAHPNNNLINNAAAGSQDAGIWYLFHKEPTGESSGLQLLAKPELTPLGIFYNNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 AVSTFWIAHPNNNLINNAAAGSQDAGIWYLFHKEPTGESSGLQLLAKPELTPLGIFYNNR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD VHSNFKAGLFIDKGVKTTNSSAADPREYLCLDNSARFRPHQDANPEKPRVAALIDRLIAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VHSNFKAGLFIDKGVKTTNSSAADPREYLCLDNSARFRPHQDANPEKPRVAALIDRLIAF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD KNNDNGAWVRGGDIIVQNSAFADNGIGLTFASDGSFPSDEGSSQEVSESLFVGESRNYGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KNNDNGAWVRGGDIIVQNSAFADNGIGLTFASDGSFPSDEGSSQEVSESLFVGESRNYGF
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD QGGQNKYVGTGGIDQKPRTLPRNRTFPIRGFQIYDGPIHLTRSTFKKYVPTPDRYSSAIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 QGGQNKYVGTGGIDQKPRTLPRNRTFPIRGFQIYDGPIHLTRSTFKKYVPTPDRYSSAIG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD FLMKNSWQITPRNNISLVKFGPHVSLNVFFGKPGPWFEDCEMDGDKNSIFHDIDGSVTGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 FLMKNSWQITPRNNISLVKFGPHVSLNVFFGKPGPWFEDCEMDGDKNSIFHDIDGSVTGY
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD KDAYVGRMDNYLIRHPSCVNVSKWNAVICSGTYAQVYVQTWSTQNLSMTITRDEYPSNPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KDAYVGRMDNYLIRHPSCVNVSKWNAVICSGTYAQVYVQTWSTQNLSMTITRDEYPSNPM
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD VLRGINQKAAFPQYQPVVMLEKGYTIHWNGPAPRTTFLYLVNFNKNDWIRVGLCYPSNTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VLRGINQKAAFPQYQPVVMLEKGYTIHWNGPAPRTTFLYLVNFNKNDWIRVGLCYPSNTS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD FQVTFGYLQRQNGSLSKIEEYEPVHSLEELQRKQSERKFYFDSSTGLLFLYLKAKSHRHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 FQVTFGYLQRQNGSLSKIEEYEPVHSLEELQRKQSERKFYFDSSTGLLFLYLKAKSHRHG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD HSYCSSQGCERVKIQAATDSKDISNCMAKAYPQYYRKPSVVKRMPAMLTGLCQGCGTRQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 HSYCSSQGCERVKIQAATDSKDISNCMAKAYPQYYRKPSVVKRMPAMLTGLCQGCGTRQV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD VFTSDPHKSYLPVQFQSPDKAETQRGDPSVISVNGTDFTFRSAGVLLLVVDPCSVPFRLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VFTSDPHKSYLPVQFQSPDKAETQRGDPSVISVNGTDFTFRSAGVLLLVVDPCSVPFRLT
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD EKTVFPLADVSRIEEYLKTGIPPRSIVLLSTRGEIKQLNISHLLVPLGLAKPAHLYDKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EKTVFPLADVSRIEEYLKTGIPPRSIVLLSTRGEIKQLNISHLLVPLGLAKPAHLYDKGS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD TIFLGFSGNFKPSWTKLFTSPAGQGLGVLEQFIPLQLDEYGCPRATTVRRRDLELLKQAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 TIFLGFSGNFKPSWTKLFTSPAGQGLGVLEQFIPLQLDEYGCPRATTVRRRDLELLKQAS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD KAH
:::
CCDS66 KAH
>>CCDS47979.1 TMEM2 gene_id:23670|Hs108|chr9 (1320 aa)
initn: 6301 init1: 6301 opt: 6318 Z-score: 6870.0 bits: 1283.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8823; 95.4% identity (95.4% similar) in 1383 aa overlap (1-1383:1-1320)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MYATDSRGHSPAFLQPQNGNSRHPSGYVPGKVVPLRPPPPPKSQASAKFTSIRREDRATF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MYATDSRGHSPAFLQPQNGNSRHPSGYVPGKVVPLRPPPPPKSQASAKFTSIRREDRATF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AFSPEEQQAQRESQKQKRHKNTFICFAITSFSFFIALAIILGISSKYAPDENCPDQNPRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AFSPEEQQAQRESQKQKRHKNTFICFAITSFSFFIALAIILGISSKYAPDENCPDQNPRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RNWDPGQDSAKQVVIKEGDMLRLTSDATVHSIVIQDGGLLVFGDNKDGSRNITLRTHYIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RNWDPGQDSAKQVVIKEGDMLRLTSDATVHSIVIQDGGLLVFGDNKDGSRNITLRTHYIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IQDGGALHIGAEKCRYKSKATITLYGKSDEGESMPTFGKKFIGVEAGGTLELHGARKASW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IQDGGALHIGAEKCRYKSKATITLYGKSDEGESMPTFGKKFIGVEAGGTLELHGARKASW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TLLARTLNSSGLPFGSYTFEKDFSRGLNVRVIDQDTAKILESERFDTHEYRNESRRLQEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TLLARTLNSSGLPFGSYTFEKDFSRGLNVRVIDQDTAKILESERFDTHEYRNESRRLQEF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LRFQDPGRIVAIAVGDSAAKSLLQGTIQMIQERLGSELIQGLGYRQAWALVGVIDGGSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LRFQDPGRIVAIAVGDSAAKSLLQGTIQMIQERLGSELIQGLGYRQAWALVGVIDGGSTS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD CNESVRNYENHSSGGKALAQREFYTVDGQKFSVTAYSEWIEGVSLSGFRVEVVDGVKLNL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 CNESVRNYENHSSGGKALAQREFYTVDGQKFSVTAYSEWIE-------------------
370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LDDVSSWKPGDQIVVASTDYSMYQAEEFTLLPCSECSHFQVKVKETPQFLHMGEIIDGVD
::::::::::::::::
CCDS47 --------------------------------------------ETPQFLHMGEIIDGVD
410
490 500 510 520 530 540
pF1KSD MRAEVGILTRNIVIQGEVEDSCYAENQCQFFDYDTFGGHIMIMKNFTSVHLSYVELKHMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MRAEVGILTRNIVIQGEVEDSCYAENQCQFFDYDTFGGHIMIMKNFTSVHLSYVELKHMG
420 430 440 450 460 470
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QQQMGRYPVHFHLCGDVDYKGGYRHATFVDGLSIHHSFSRCITVHGTNGLLIKDTIGFDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QQQMGRYPVHFHLCGDVDYKGGYRHATFVDGLSIHHSFSRCITVHGTNGLLIKDTIGFDT
480 490 500 510 520 530
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LGHCFFLEDGIEQRNTLFHNLGLLTKPGTLLPTDRNNSMCTTMRDKVFGNYIPVPATDCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LGHCFFLEDGIEQRNTLFHNLGLLTKPGTLLPTDRNNSMCTTMRDKVFGNYIPVPATDCM
540 550 560 570 580 590
670 680 690 700 710 720
pF1KSD AVSTFWIAHPNNNLINNAAAGSQDAGIWYLFHKEPTGESSGLQLLAKPELTPLGIFYNNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AVSTFWIAHPNNNLINNAAAGSQDAGIWYLFHKEPTGESSGLQLLAKPELTPLGIFYNNR
600 610 620 630 640 650
730 740 750 760 770 780
pF1KSD VHSNFKAGLFIDKGVKTTNSSAADPREYLCLDNSARFRPHQDANPEKPRVAALIDRLIAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VHSNFKAGLFIDKGVKTTNSSAADPREYLCLDNSARFRPHQDANPEKPRVAALIDRLIAF
660 670 680 690 700 710
790 800 810 820 830 840
pF1KSD KNNDNGAWVRGGDIIVQNSAFADNGIGLTFASDGSFPSDEGSSQEVSESLFVGESRNYGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KNNDNGAWVRGGDIIVQNSAFADNGIGLTFASDGSFPSDEGSSQEVSESLFVGESRNYGF
720 730 740 750 760 770
850 860 870 880 890 900
pF1KSD QGGQNKYVGTGGIDQKPRTLPRNRTFPIRGFQIYDGPIHLTRSTFKKYVPTPDRYSSAIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QGGQNKYVGTGGIDQKPRTLPRNRTFPIRGFQIYDGPIHLTRSTFKKYVPTPDRYSSAIG
780 790 800 810 820 830
910 920 930 940 950 960
pF1KSD FLMKNSWQITPRNNISLVKFGPHVSLNVFFGKPGPWFEDCEMDGDKNSIFHDIDGSVTGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FLMKNSWQITPRNNISLVKFGPHVSLNVFFGKPGPWFEDCEMDGDKNSIFHDIDGSVTGY
840 850 860 870 880 890
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD KDAYVGRMDNYLIRHPSCVNVSKWNAVICSGTYAQVYVQTWSTQNLSMTITRDEYPSNPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KDAYVGRMDNYLIRHPSCVNVSKWNAVICSGTYAQVYVQTWSTQNLSMTITRDEYPSNPM
900 910 920 930 940 950
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD VLRGINQKAAFPQYQPVVMLEKGYTIHWNGPAPRTTFLYLVNFNKNDWIRVGLCYPSNTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VLRGINQKAAFPQYQPVVMLEKGYTIHWNGPAPRTTFLYLVNFNKNDWIRVGLCYPSNTS
960 970 980 990 1000 1010
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD FQVTFGYLQRQNGSLSKIEEYEPVHSLEELQRKQSERKFYFDSSTGLLFLYLKAKSHRHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FQVTFGYLQRQNGSLSKIEEYEPVHSLEELQRKQSERKFYFDSSTGLLFLYLKAKSHRHG
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD HSYCSSQGCERVKIQAATDSKDISNCMAKAYPQYYRKPSVVKRMPAMLTGLCQGCGTRQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HSYCSSQGCERVKIQAATDSKDISNCMAKAYPQYYRKPSVVKRMPAMLTGLCQGCGTRQV
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD VFTSDPHKSYLPVQFQSPDKAETQRGDPSVISVNGTDFTFRSAGVLLLVVDPCSVPFRLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VFTSDPHKSYLPVQFQSPDKAETQRGDPSVISVNGTDFTFRSAGVLLLVVDPCSVPFRLT
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD EKTVFPLADVSRIEEYLKTGIPPRSIVLLSTRGEIKQLNISHLLVPLGLAKPAHLYDKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EKTVFPLADVSRIEEYLKTGIPPRSIVLLSTRGEIKQLNISHLLVPLGLAKPAHLYDKGS
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD TIFLGFSGNFKPSWTKLFTSPAGQGLGVLEQFIPLQLDEYGCPRATTVRRRDLELLKQAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TIFLGFSGNFKPSWTKLFTSPAGQGLGVLEQFIPLQLDEYGCPRATTVRRRDLELLKQAS
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KSD KAH
:::
CCDS47 KAH
1320
>>CCDS10315.1 CEMIP gene_id:57214|Hs108|chr15 (1361 aa)
initn: 1916 init1: 1300 opt: 3076 Z-score: 3339.5 bits: 630.3 E(32554): 1.1e-179
Smith-Waterman score: 3667; 43.3% identity (69.7% similar) in 1358 aa overlap (80-1337:6-1338)
50 60 70 80 90 100
pF1KSD TSIRREDRATFAFSPEEQQAQRESQKQKRHKNTFICFAITSFSFFIALAIILGISSKYAP
.. :. :. ..:. ..:. . : .: :
CCDS10 MGAAGRQDFLFKAMLTISW-LTLTCFPGATSTVA-
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KSD DENCPDQNPRLRNWDPGQDSAKQVVIKEGDMLRLTSDATVHSIVIQDGGLLVFGDNKDGS
.::::.:.:. :.::.:. ..: : .: : :::.:::.:: :..:: ::. :: .
CCDS10 -AGCPDQSPELQPWNPGHDQDHHVHIGQGKTLLLTSSATVYSIHISEGGKLVI---KDHD
40 50 60 70 80
170 180 190 200 210 220
pF1KSD RNITLRTHYILIQDGGALHIGAEKCRYKSKATITLYGKSDEG-ESMPTFGKKFIGVEAGG
. :.:::..:::..:: :: :. : .... :: :::..::: . : .: :.::: ::
CCDS10 EPIVLRTRHILIDNGGELHAGSALCPFQGNFTIILYGRADEGIQPDPYYGLKYIGVGKGG
90 100 110 120 130 140
230 240 250 260 270 280
pF1KSD TLELHGARKASWTLLARTLNSSGLPFGSYTFEKDFS-RGLNVRVIDQDTAKILESERFDT
.::::: .: :::.: .::. .:. :.: ::.... ::. :.::: .. ...:.::::
CCDS10 ALELHGQKKLSWTFLNKTLHPGGMAEGGYFFERSWGHRGVIVHVIDPKSGTVIHSDRFDT
150 160 170 180 190 200
290 300 310 320 330 340
pF1KSD HEYRNESRRLQEFLRFQDPGRIVAIAVGDSAAKSLLQGTIQMIQERLGSELIQGLGYRQA
.. ..::.:: ..: :::...::.: ....: . . . .:::. . ::.:.
CCDS10 YRSKKESERLVQYLNAVPDGRILSVAVNDEGSRNL-DDMARKAMTKLGSKHFLHLGFRHP
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KSD WALVGVIDGGSTSCNESVRNYENHSSGGKALAQREFYTVDGQKFSVTAYSEWIE------
:... : . :.: .. .. :..: ... : . . : : :. :.:. :::..
CCDS10 WSFLTVKGNPSSSVEDHIE-YHGHRGSAAARVFKLFQTEHGEYFNVSLSSEWVQDVEWTE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]