Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1412
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1412, 1383 aa
1>>>pF1KSDA1412 1383 - 1383 aa - 1383 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2307+/-0.000391; mu= 19.6013+/- 0.025
mean_var=92.0232+/-18.633, 0's: 0 Z-trim(113.7): 72 B-trim: 1068 in 1/56
Lambda= 0.133698
statistics sampled from 23031 (23104) to 23031 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.6), E-opt: 0.2 (0.271), width: 16
Scan time: 16.780
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_037522 (OMIM: 605835) transmembrane protein 2 i (1383) 9377 1819.8 0
XP_005251926 (OMIM: 605835) PREDICTED: transmembra (1383) 9377 1819.8 0
NP_001129292 (OMIM: 605835) transmembrane protein (1320) 6318 1229.8 0
NP_001280227 (OMIM: 608366) cell migration-inducin (1361) 3076 604.4 1.8e-171
NP_061159 (OMIM: 608366) cell migration-inducing a (1361) 3076 604.4 1.8e-171
NP_001280233 (OMIM: 608366) cell migration-inducin (1361) 3076 604.4 1.8e-171
XP_016869463 (OMIM: 607843) PREDICTED: fibrocystin (3045) 302 69.6 4.1e-10
XP_016869462 (OMIM: 607843) PREDICTED: fibrocystin (3259) 302 69.6 4.4e-10
XP_016869461 (OMIM: 607843) PREDICTED: fibrocystin (4152) 302 69.6 5.4e-10
XP_016869460 (OMIM: 607843) PREDICTED: fibrocystin (4199) 302 69.6 5.4e-10
XP_016869459 (OMIM: 607843) PREDICTED: fibrocystin (4215) 302 69.6 5.4e-10
NP_803875 (OMIM: 607843) fibrocystin-L precursor [ (4243) 302 69.6 5.5e-10
XP_011515673 (OMIM: 607843) PREDICTED: fibrocystin (4243) 302 69.6 5.5e-10
XP_016869458 (OMIM: 607843) PREDICTED: fibrocystin (4253) 302 69.6 5.5e-10
XP_016866441 (OMIM: 263200,606702) PREDICTED: fibr (2770) 221 53.9 1.9e-05
XP_016866440 (OMIM: 263200,606702) PREDICTED: fibr (2941) 221 53.9 2e-05
XP_011512990 (OMIM: 263200,606702) PREDICTED: fibr (3278) 221 53.9 2.2e-05
XP_011512989 (OMIM: 263200,606702) PREDICTED: fibr (3395) 221 54.0 2.3e-05
NP_733842 (OMIM: 263200,606702) fibrocystin isofor (3396) 221 54.0 2.3e-05
XP_011512988 (OMIM: 263200,606702) PREDICTED: fibr (3402) 221 54.0 2.3e-05
XP_016866439 (OMIM: 263200,606702) PREDICTED: fibr (3403) 221 54.0 2.3e-05
XP_011512987 (OMIM: 263200,606702) PREDICTED: fibr (3416) 221 54.0 2.3e-05
XP_016866438 (OMIM: 263200,606702) PREDICTED: fibr (3454) 221 54.0 2.3e-05
XP_016866437 (OMIM: 263200,606702) PREDICTED: fibr (3837) 221 54.0 2.5e-05
XP_011512986 (OMIM: 263200,606702) PREDICTED: fibr (3837) 221 54.0 2.5e-05
XP_011512985 (OMIM: 263200,606702) PREDICTED: fibr (3860) 221 54.0 2.6e-05
XP_016866436 (OMIM: 263200,606702) PREDICTED: fibr (3986) 221 54.0 2.6e-05
XP_016866435 (OMIM: 263200,606702) PREDICTED: fibr (4009) 221 54.0 2.6e-05
XP_011512984 (OMIM: 263200,606702) PREDICTED: fibr (4028) 221 54.0 2.6e-05
XP_016866434 (OMIM: 263200,606702) PREDICTED: fibr (4049) 221 54.0 2.7e-05
NP_619639 (OMIM: 263200,606702) fibrocystin isofor (4074) 221 54.0 2.7e-05
XP_011512982 (OMIM: 263200,606702) PREDICTED: fibr (4074) 221 54.0 2.7e-05
XP_016866433 (OMIM: 263200,606702) PREDICTED: fibr (4074) 221 54.0 2.7e-05
XP_011512992 (OMIM: 263200,606702) PREDICTED: fibr (2099) 175 45.0 0.0072
XP_011512993 (OMIM: 263200,606702) PREDICTED: fibr (2099) 175 45.0 0.0072
>>NP_037522 (OMIM: 605835) transmembrane protein 2 isofo (1383 aa)
initn: 9377 init1: 9377 opt: 9377 Z-score: 9767.7 bits: 1819.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9377; 100.0% identity (100.0% similar) in 1383 aa overlap (1-1383:1-1383)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MYATDSRGHSPAFLQPQNGNSRHPSGYVPGKVVPLRPPPPPKSQASAKFTSIRREDRATF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 MYATDSRGHSPAFLQPQNGNSRHPSGYVPGKVVPLRPPPPPKSQASAKFTSIRREDRATF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AFSPEEQQAQRESQKQKRHKNTFICFAITSFSFFIALAIILGISSKYAPDENCPDQNPRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 AFSPEEQQAQRESQKQKRHKNTFICFAITSFSFFIALAIILGISSKYAPDENCPDQNPRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RNWDPGQDSAKQVVIKEGDMLRLTSDATVHSIVIQDGGLLVFGDNKDGSRNITLRTHYIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 RNWDPGQDSAKQVVIKEGDMLRLTSDATVHSIVIQDGGLLVFGDNKDGSRNITLRTHYIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IQDGGALHIGAEKCRYKSKATITLYGKSDEGESMPTFGKKFIGVEAGGTLELHGARKASW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 IQDGGALHIGAEKCRYKSKATITLYGKSDEGESMPTFGKKFIGVEAGGTLELHGARKASW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TLLARTLNSSGLPFGSYTFEKDFSRGLNVRVIDQDTAKILESERFDTHEYRNESRRLQEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 TLLARTLNSSGLPFGSYTFEKDFSRGLNVRVIDQDTAKILESERFDTHEYRNESRRLQEF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LRFQDPGRIVAIAVGDSAAKSLLQGTIQMIQERLGSELIQGLGYRQAWALVGVIDGGSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 LRFQDPGRIVAIAVGDSAAKSLLQGTIQMIQERLGSELIQGLGYRQAWALVGVIDGGSTS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD CNESVRNYENHSSGGKALAQREFYTVDGQKFSVTAYSEWIEGVSLSGFRVEVVDGVKLNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 CNESVRNYENHSSGGKALAQREFYTVDGQKFSVTAYSEWIEGVSLSGFRVEVVDGVKLNL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LDDVSSWKPGDQIVVASTDYSMYQAEEFTLLPCSECSHFQVKVKETPQFLHMGEIIDGVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 LDDVSSWKPGDQIVVASTDYSMYQAEEFTLLPCSECSHFQVKVKETPQFLHMGEIIDGVD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD MRAEVGILTRNIVIQGEVEDSCYAENQCQFFDYDTFGGHIMIMKNFTSVHLSYVELKHMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 MRAEVGILTRNIVIQGEVEDSCYAENQCQFFDYDTFGGHIMIMKNFTSVHLSYVELKHMG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QQQMGRYPVHFHLCGDVDYKGGYRHATFVDGLSIHHSFSRCITVHGTNGLLIKDTIGFDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 QQQMGRYPVHFHLCGDVDYKGGYRHATFVDGLSIHHSFSRCITVHGTNGLLIKDTIGFDT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LGHCFFLEDGIEQRNTLFHNLGLLTKPGTLLPTDRNNSMCTTMRDKVFGNYIPVPATDCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 LGHCFFLEDGIEQRNTLFHNLGLLTKPGTLLPTDRNNSMCTTMRDKVFGNYIPVPATDCM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD AVSTFWIAHPNNNLINNAAAGSQDAGIWYLFHKEPTGESSGLQLLAKPELTPLGIFYNNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 AVSTFWIAHPNNNLINNAAAGSQDAGIWYLFHKEPTGESSGLQLLAKPELTPLGIFYNNR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD VHSNFKAGLFIDKGVKTTNSSAADPREYLCLDNSARFRPHQDANPEKPRVAALIDRLIAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 VHSNFKAGLFIDKGVKTTNSSAADPREYLCLDNSARFRPHQDANPEKPRVAALIDRLIAF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD KNNDNGAWVRGGDIIVQNSAFADNGIGLTFASDGSFPSDEGSSQEVSESLFVGESRNYGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 KNNDNGAWVRGGDIIVQNSAFADNGIGLTFASDGSFPSDEGSSQEVSESLFVGESRNYGF
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD QGGQNKYVGTGGIDQKPRTLPRNRTFPIRGFQIYDGPIHLTRSTFKKYVPTPDRYSSAIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 QGGQNKYVGTGGIDQKPRTLPRNRTFPIRGFQIYDGPIHLTRSTFKKYVPTPDRYSSAIG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD FLMKNSWQITPRNNISLVKFGPHVSLNVFFGKPGPWFEDCEMDGDKNSIFHDIDGSVTGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 FLMKNSWQITPRNNISLVKFGPHVSLNVFFGKPGPWFEDCEMDGDKNSIFHDIDGSVTGY
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD KDAYVGRMDNYLIRHPSCVNVSKWNAVICSGTYAQVYVQTWSTQNLSMTITRDEYPSNPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 KDAYVGRMDNYLIRHPSCVNVSKWNAVICSGTYAQVYVQTWSTQNLSMTITRDEYPSNPM
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD VLRGINQKAAFPQYQPVVMLEKGYTIHWNGPAPRTTFLYLVNFNKNDWIRVGLCYPSNTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 VLRGINQKAAFPQYQPVVMLEKGYTIHWNGPAPRTTFLYLVNFNKNDWIRVGLCYPSNTS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD FQVTFGYLQRQNGSLSKIEEYEPVHSLEELQRKQSERKFYFDSSTGLLFLYLKAKSHRHG
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NP_037 FQVTFGYLQRQNGSLSKIEEYEPVHSLEELQRKQSERKFYFDSSTGLLFLYLKAKSHRHG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD HSYCSSQGCERVKIQAATDSKDISNCMAKAYPQYYRKPSVVKRMPAMLTGLCQGCGTRQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 HSYCSSQGCERVKIQAATDSKDISNCMAKAYPQYYRKPSVVKRMPAMLTGLCQGCGTRQV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD VFTSDPHKSYLPVQFQSPDKAETQRGDPSVISVNGTDFTFRSAGVLLLVVDPCSVPFRLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 VFTSDPHKSYLPVQFQSPDKAETQRGDPSVISVNGTDFTFRSAGVLLLVVDPCSVPFRLT
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD EKTVFPLADVSRIEEYLKTGIPPRSIVLLSTRGEIKQLNISHLLVPLGLAKPAHLYDKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 EKTVFPLADVSRIEEYLKTGIPPRSIVLLSTRGEIKQLNISHLLVPLGLAKPAHLYDKGS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD TIFLGFSGNFKPSWTKLFTSPAGQGLGVLEQFIPLQLDEYGCPRATTVRRRDLELLKQAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 TIFLGFSGNFKPSWTKLFTSPAGQGLGVLEQFIPLQLDEYGCPRATTVRRRDLELLKQAS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD KAH
:::
NP_037 KAH
>>XP_005251926 (OMIM: 605835) PREDICTED: transmembrane p (1383 aa)
initn: 9377 init1: 9377 opt: 9377 Z-score: 9767.7 bits: 1819.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9377; 100.0% identity (100.0% similar) in 1383 aa overlap (1-1383:1-1383)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MYATDSRGHSPAFLQPQNGNSRHPSGYVPGKVVPLRPPPPPKSQASAKFTSIRREDRATF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MYATDSRGHSPAFLQPQNGNSRHPSGYVPGKVVPLRPPPPPKSQASAKFTSIRREDRATF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AFSPEEQQAQRESQKQKRHKNTFICFAITSFSFFIALAIILGISSKYAPDENCPDQNPRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AFSPEEQQAQRESQKQKRHKNTFICFAITSFSFFIALAIILGISSKYAPDENCPDQNPRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RNWDPGQDSAKQVVIKEGDMLRLTSDATVHSIVIQDGGLLVFGDNKDGSRNITLRTHYIL
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XP_005 RNWDPGQDSAKQVVIKEGDMLRLTSDATVHSIVIQDGGLLVFGDNKDGSRNITLRTHYIL
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190 200 210 220 230 240
pF1KSD IQDGGALHIGAEKCRYKSKATITLYGKSDEGESMPTFGKKFIGVEAGGTLELHGARKASW
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XP_005 IQDGGALHIGAEKCRYKSKATITLYGKSDEGESMPTFGKKFIGVEAGGTLELHGARKASW
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250 260 270 280 290 300
pF1KSD TLLARTLNSSGLPFGSYTFEKDFSRGLNVRVIDQDTAKILESERFDTHEYRNESRRLQEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TLLARTLNSSGLPFGSYTFEKDFSRGLNVRVIDQDTAKILESERFDTHEYRNESRRLQEF
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310 320 330 340 350 360
pF1KSD LRFQDPGRIVAIAVGDSAAKSLLQGTIQMIQERLGSELIQGLGYRQAWALVGVIDGGSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LRFQDPGRIVAIAVGDSAAKSLLQGTIQMIQERLGSELIQGLGYRQAWALVGVIDGGSTS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD CNESVRNYENHSSGGKALAQREFYTVDGQKFSVTAYSEWIEGVSLSGFRVEVVDGVKLNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CNESVRNYENHSSGGKALAQREFYTVDGQKFSVTAYSEWIEGVSLSGFRVEVVDGVKLNL
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430 440 450 460 470 480
pF1KSD LDDVSSWKPGDQIVVASTDYSMYQAEEFTLLPCSECSHFQVKVKETPQFLHMGEIIDGVD
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XP_005 LDDVSSWKPGDQIVVASTDYSMYQAEEFTLLPCSECSHFQVKVKETPQFLHMGEIIDGVD
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490 500 510 520 530 540
pF1KSD MRAEVGILTRNIVIQGEVEDSCYAENQCQFFDYDTFGGHIMIMKNFTSVHLSYVELKHMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MRAEVGILTRNIVIQGEVEDSCYAENQCQFFDYDTFGGHIMIMKNFTSVHLSYVELKHMG
490 500 510 520 530 540
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pF1KSD QQQMGRYPVHFHLCGDVDYKGGYRHATFVDGLSIHHSFSRCITVHGTNGLLIKDTIGFDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QQQMGRYPVHFHLCGDVDYKGGYRHATFVDGLSIHHSFSRCITVHGTNGLLIKDTIGFDT
550 560 570 580 590 600
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pF1KSD LGHCFFLEDGIEQRNTLFHNLGLLTKPGTLLPTDRNNSMCTTMRDKVFGNYIPVPATDCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LGHCFFLEDGIEQRNTLFHNLGLLTKPGTLLPTDRNNSMCTTMRDKVFGNYIPVPATDCM
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670 680 690 700 710 720
pF1KSD AVSTFWIAHPNNNLINNAAAGSQDAGIWYLFHKEPTGESSGLQLLAKPELTPLGIFYNNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AVSTFWIAHPNNNLINNAAAGSQDAGIWYLFHKEPTGESSGLQLLAKPELTPLGIFYNNR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD VHSNFKAGLFIDKGVKTTNSSAADPREYLCLDNSARFRPHQDANPEKPRVAALIDRLIAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VHSNFKAGLFIDKGVKTTNSSAADPREYLCLDNSARFRPHQDANPEKPRVAALIDRLIAF
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790 800 810 820 830 840
pF1KSD KNNDNGAWVRGGDIIVQNSAFADNGIGLTFASDGSFPSDEGSSQEVSESLFVGESRNYGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KNNDNGAWVRGGDIIVQNSAFADNGIGLTFASDGSFPSDEGSSQEVSESLFVGESRNYGF
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD QGGQNKYVGTGGIDQKPRTLPRNRTFPIRGFQIYDGPIHLTRSTFKKYVPTPDRYSSAIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QGGQNKYVGTGGIDQKPRTLPRNRTFPIRGFQIYDGPIHLTRSTFKKYVPTPDRYSSAIG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD FLMKNSWQITPRNNISLVKFGPHVSLNVFFGKPGPWFEDCEMDGDKNSIFHDIDGSVTGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FLMKNSWQITPRNNISLVKFGPHVSLNVFFGKPGPWFEDCEMDGDKNSIFHDIDGSVTGY
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD KDAYVGRMDNYLIRHPSCVNVSKWNAVICSGTYAQVYVQTWSTQNLSMTITRDEYPSNPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KDAYVGRMDNYLIRHPSCVNVSKWNAVICSGTYAQVYVQTWSTQNLSMTITRDEYPSNPM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VLRGINQKAAFPQYQPVVMLEKGYTIHWNGPAPRTTFLYLVNFNKNDWIRVGLCYPSNTS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KSD FQVTFGYLQRQNGSLSKIEEYEPVHSLEELQRKQSERKFYFDSSTGLLFLYLKAKSHRHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FQVTFGYLQRQNGSLSKIEEYEPVHSLEELQRKQSERKFYFDSSTGLLFLYLKAKSHRHG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EKTVFPLADVSRIEEYLKTGIPPRSIVLLSTRGEIKQLNISHLLVPLGLAKPAHLYDKGS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TIFLGFSGNFKPSWTKLFTSPAGQGLGVLEQFIPLQLDEYGCPRATTVRRRDLELLKQAS
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pF1KSD KAH
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XP_005 KAH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AFSPEEQQAQRESQKQKRHKNTFICFAITSFSFFIALAIILGISSKYAPDENCPDQNPRL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLLARTLNSSGLPFGSYTFEKDFSRGLNVRVIDQDTAKILESERFDTHEYRNESRRLQEF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MRAEVGILTRNIVIQGEVEDSCYAENQCQFFDYDTFGGHIMIMKNFTSVHLSYVELKHMG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QQQMGRYPVHFHLCGDVDYKGGYRHATFVDGLSIHHSFSRCITVHGTNGLLIKDTIGFDT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGHCFFLEDGIEQRNTLFHNLGLLTKPGTLLPTDRNNSMCTTMRDKVFGNYIPVPATDCM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVSTFWIAHPNNNLINNAAAGSQDAGIWYLFHKEPTGESSGLQLLAKPELTPLGIFYNNR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VHSNFKAGLFIDKGVKTTNSSAADPREYLCLDNSARFRPHQDANPEKPRVAALIDRLIAF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KNNDNGAWVRGGDIIVQNSAFADNGIGLTFASDGSFPSDEGSSQEVSESLFVGESRNYGF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLMKNSWQITPRNNISLVKFGPHVSLNVFFGKPGPWFEDCEMDGDKNSIFHDIDGSVTGY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDAYVGRMDNYLIRHPSCVNVSKWNAVICSGTYAQVYVQTWSTQNLSMTITRDEYPSNPM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLRGINQKAAFPQYQPVVMLEKGYTIHWNGPAPRTTFLYLVNFNKNDWIRVGLCYPSNTS
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pF1KSD FQVTFGYLQRQNGSLSKIEEYEPVHSLEELQRKQSERKFYFDSSTGLLFLYLKAKSHRHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FQVTFGYLQRQNGSLSKIEEYEPVHSLEELQRKQSERKFYFDSSTGLLFLYLKAKSHRHG
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pF1KSD HSYCSSQGCERVKIQAATDSKDISNCMAKAYPQYYRKPSVVKRMPAMLTGLCQGCGTRQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HSYCSSQGCERVKIQAATDSKDISNCMAKAYPQYYRKPSVVKRMPAMLTGLCQGCGTRQV
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pF1KSD VFTSDPHKSYLPVQFQSPDKAETQRGDPSVISVNGTDFTFRSAGVLLLVVDPCSVPFRLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VFTSDPHKSYLPVQFQSPDKAETQRGDPSVISVNGTDFTFRSAGVLLLVVDPCSVPFRLT
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pF1KSD EKTVFPLADVSRIEEYLKTGIPPRSIVLLSTRGEIKQLNISHLLVPLGLAKPAHLYDKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKTVFPLADVSRIEEYLKTGIPPRSIVLLSTRGEIKQLNISHLLVPLGLAKPAHLYDKGS
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pF1KSD TIFLGFSGNFKPSWTKLFTSPAGQGLGVLEQFIPLQLDEYGCPRATTVRRRDLELLKQAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TIFLGFSGNFKPSWTKLFTSPAGQGLGVLEQFIPLQLDEYGCPRATTVRRRDLELLKQAS
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pF1KSD KAH
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NP_001 KAH
1320
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pF1KSD TSIRREDRATFAFSPEEQQAQRESQKQKRHKNTFICFAITSFSFFIALAIILGISSKYAP
.. :. :. ..:. ..:. . : .: :
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pF1KSD DENCPDQNPRLRNWDPGQDSAKQVVIKEGDMLRLTSDATVHSIVIQDGGLLVFGDNKDGS
.::::.:.:. :.::.:. ..: : .: : :::.:::.:: :..:: ::. :: .
NP_001 -AGCPDQSPELQPWNPGHDQDHHVHIGQGKTLLLTSSATVYSIHISEGGKLVI---KDHD
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pF1KSD RNITLRTHYILIQDGGALHIGAEKCRYKSKATITLYGKSDEG-ESMPTFGKKFIGVEAGG
. :.:::..:::..:: :: :. : .... :: :::..::: . : .: :.::: ::
NP_001 EPIVLRTRHILIDNGGELHAGSALCPFQGNFTIILYGRADEGIQPDPYYGLKYIGVGKGG
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pF1KSD TLELHGARKASWTLLARTLNSSGLPFGSYTFEKDFS-RGLNVRVIDQDTAKILESERFDT
.::::: .: :::.: .::. .:. :.: ::.... ::. :.::: .. ...:.::::
NP_001 ALELHGQKKLSWTFLNKTLHPGGMAEGGYFFERSWGHRGVIVHVIDPKSGTVIHSDRFDT
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pF1KSD HEYRNESRRLQEFLRFQDPGRIVAIAVGDSAAKSLLQGTIQMIQERLGSELIQGLGYRQA
.. ..::.:: ..: :::...::.: ....: . . . .:::. . ::.:.
NP_001 YRSKKESERLVQYLNAVPDGRILSVAVNDEGSRNL-DDMARKAMTKLGSKHFLHLGFRHP
210 220 230 240 250 260
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pF1KSD WALVGVIDGGSTSCNESVRNYENHSSGGKALAQREFYTVDGQKFSVTAYSEWIE------
:... : . :.: .. .. :..: ... : . . : : :. :.:. :::..
NP_001 WSFLTVKGNPSSSVEDHIE-YHGHRGSAAARVFKLFQTEHGEYFNVSLSSEWVQDVEWTE
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pF1KSD ----------------------------------------GVSLS---------------
::.::
NP_001 WFDHDKVSQTKGGEKISDLWKAHPGKICNRPIDIQATTMDGVNLSTEVVYKKGQDYRFAC
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pF1KSD --------GFRVEV-----------------VDGVKLNLLDDVSSWKPGDQIVVASTDYS
..::. :... ::: :.:.:::::: .:.::::::
NP_001 YDRGRACRSYRVRFLCGKPVRPKLTVTIDTNVNSTILNLEDNVQSWKPGDTLVIASTDYS
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pF1KSD MYQAEEFTLLPCSECSHFQVKVKETPQFLHMGEIIDGVDMRAEVGILTRNIVIQGEVEDS
::::::: .::: :. :::: :..::.:: :::::::::::.:.:::...::.::.
NP_001 MYQAEEFQVLPCRSCAPNQVKVAGKPMYLHIGEEIDGVDMRAEVGLLSRNIIVMGEMEDK
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pF1KSD CYA-ENQ-CQFFDYDTFGGHIMIMKNFTSVHLSYVELKHMGQQQMGRYPVHFHLCGDVDY
:: .:. :.:::.::::::: . .: ..:: .:::::::: .:.::.:::: ::::
NP_001 CYPYRNHICNFFDFDTFGGHIKFALGFKAAHLEGTELKHMGQQLVGQYPIHFHLAGDVDE
510 520 530 540 550 560
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pF1KSD KGGYRHATFVDGLSIHHSFSRCITVHGTNGLLIKDTIGFDTLGHCFFLEDGIEQRNTLFH
.::: :.. :::::.::::.::::.:::::::..:...:::::: ::: :.:::. :
NP_001 RGGYDPPTYIRDLSIHHTFSRCVTVHGSNGLLIKDVVGYNSLGHCFFTEDGPEERNTFDH
570 580 590 600 610 620
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pF1KSD NLGLLTKPGTLLPTDRNNSMCTTMRDKVFGNYIPVPATDCMAVSTFWIAHPNNNLINNAA
::::.: :::::.::...:: . . . .::: : :: ::::::.:.::::::: ::
NP_001 CLGLLVKSGTLLPSDRDSKMCKMITEDSYPGYIPKPRQDCNAVSTFWMANPNNNLINCAA
630 640 650 660 670 680
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pF1KSD AGSQDAGIWYLFHKEPTGESSGLQLLAKPELTPLGIFYNNRVHSNFKAGLFIDKGVKTTN
:::...:.:..::. ::: : :. . : ::: :::::.:::..::..::.:::::.
NP_001 AGSEETGFWFIFHHVPTGPSVGMYSPGYSEHIPLGKFYNNRAHSNYRAGMIIDNGVKTTE
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pF1KSD SSAADPREYLCLDNSARFRPHQDANPEKPRVAALIDRLIAFKNNDNGAWVRGGDIIVQNS
.:: : : .: . :::. :::::.: ::: :.: ..::.::.:.:::.::::. ...
NP_001 ASAKDKRPFLSI-ISARYSPHQDADPLKPREPAIIRHFIAYKNQDHGAWLRGGDVWLDSC
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pF1KSD AFADNGIGLTFASDGSFPSDEGSSQEVSESLFVGESRNYGFQGGQNKYVGTGGIDQKPRT
:::::::::.:: :.:: :.::.::...::::::: : : . .:. : ::.:.. ::
NP_001 RFADNGIGLTLASGGTFPYDDGSKQEIKNSLFVGESGNVGTEMMDNRIWGPGGLDHSGRT
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pF1KSD LPRNRTFPIRGFQIYDGPIHLTRSTFKKYVPTPDRYSSAIGFLMKNSWQITPRNNISLVK
:: ...:::::.:.:::::.. ::.:.: :..::..: ..:.:: :.::.. .
NP_001 LPIGQNFPIRGIQLYDGPINIQNCTFRKFVALEGRHTSALAFRLNNAWQSCPHNNVTGIA
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pF1KSD FGP-HVSLNVFFGKPGPWFEDCEMDGDKNSIFHDIDGSVTGYKDAYVGRMDNYLIRHPSC
: .. ::::.:::::.. .:::::.:.:::.::::. : .:. . ::.:.:::.:
NP_001 FEDVPITSRVFFGEPGPWFNQLDMDGDKTSVFHDVDGSVSEYPGSYLTKNDNWLVRHPDC
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pF1KSD VNVSKWNAVICSGTYAQVYVQTWSTQNLSMTITRDEYPSNPMVLRG-INQKAAFPQYQPV
.:: : ..:::: :::.:.:...:.:: : : ....::.:. :.: ..... . :::::
NP_001 INVPDWRGAICSGCYAQMYIQAYKTSNLRMKIIKNDFPSHPLYLEGALTRSTHYQQYQPV
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pF1KSD VMLEKGYTIHWNGPAPRTTFLYLVNFNKNDWIRVGLCYPSNTSFQVTFGYLQRQNGSLSK
: :.:::::::. :: ..:.::::.:::::::::: .:.:.. .: . ::
NP_001 VTLQKGYTIHWDQTAPAELAIWLINFNKGDWIRVGLCYPRGTTFSILSDVHNRLLKQTSK
1050 1060 1070 1080 1090 1100
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pF1KSD IEEYEPVHSLEELQRKQSERK-FYFDSSTGLLFLYLKAKSHRHGHSYCSSQGCERVKIQA
. . ........ :. .:.: ..::::: :::...:. ..:: .::::.::.:
NP_001 TGVFVRTLQMDKVEQSYPGRSHYYWDEDSGLLFLKLKAQNEREKFAFCSMKGCERIKIKA
1110 1120 1130 1140 1150 1160
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pF1KSD -ATDSKDISNCMAKAYPQYYRKPSVVKRMPAMLTGLCQGCGTRQVVFTSDPHKSYLPVQF
. .:.: : :::.. .. : :: : : . . :.: : .: :..
NP_001 LIPKNAGVSDCTATAYPKFTERAVVDVPMPKKLFG--------SQLKTKD-H--FLEVKM
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pF1KSD QSPDKAETQR-GDPSVISVNGTDFTFRSAGVLLLVVDPCSVPFRLTEKTVFP---LADVS
.: . . .: . : :.: . :. ..:.: . :.. .: : : .
NP_001 ESSKQHFFHLWNDFAYIEVDGKKYPSSEDGIQVVVID--GNQGRVVSHTSFRNSILQGIP
1220 1230 1240 1250 1260 1270
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pF1KSD -RIEEYLKTGIPPRSIVLLSTRGE-IKQLNISHLLVPLGLAKPAHLYDKGSTIFLGFSGN
.. .:. : :: ::::....:. ... ...: :: . .: : . :.::.:.
NP_001 WQLFNYVAT-IPDNSIVLMASKGRYVSRGPWTRVLEKLGADRGLKL--KEQMAFVGFKGS
1280 1290 1300 1310 1320 1330
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD FKPSWTKLFTSPAGQGLGVLEQFIPLQLDEYGCPRATTVRRRDLELLKQASKAH
:.: :. :
NP_001 FRPIWVTLDTEDHKAKIFQVVPIPVVKKKKL
1340 1350 1360
>>NP_061159 (OMIM: 608366) cell migration-inducing and h (1361 aa)
initn: 1916 init1: 1300 opt: 3076 Z-score: 3199.4 bits: 604.4 E(85289): 1.8e-171
Smith-Waterman score: 3667; 43.3% identity (69.7% similar) in 1358 aa overlap (80-1337:6-1338)
50 60 70 80 90 100
pF1KSD TSIRREDRATFAFSPEEQQAQRESQKQKRHKNTFICFAITSFSFFIALAIILGISSKYAP
.. :. :. ..:. ..:. . : .: :
NP_061 MGAAGRQDFLFKAMLTISW-LTLTCFPGATSTVA-
10 20 30
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. :.:::..:::..:: :: :. : .... :: :::..::: . : .: :.::: ::
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.::::: .: :::.: .::. .:. :.: ::.... ::. :.::: .. ...:.::::
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.. ..::.:: ..: :::...::.: ....: . . . .:::. . ::.:.
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. . ........ :. .:.: ..::::: :::...:. ..:: .::::.::.:
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. .:.: : :::.. .. : :: : : . . :.: : .: :..
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.:: . . .:. .: .: :: .: :. ..:...::::: :
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:. .. :: : . :: .: . .:.. :
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: ::.. ... . :. :: ..: . : :.. : . . . .. .:
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:.:.: ....: .:.. :.:.: ..: . ::. . . ..: . : :
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.. .. : . ... . : .: . :::.. .:.: .:. . :.
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.... :. :. :. ..: . . ::
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.... .::. . : .:.. : .:: .. . . . :. .: : ..
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