Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1427
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1427, 426 aa
1>>>pF1KSDA1427 426 - 426 aa - 426 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6498+/-0.000831; mu= 11.5396+/- 0.050
mean_var=103.9225+/-20.172, 0's: 0 Z-trim(110.5): 53 B-trim: 7 in 1/52
Lambda= 0.125811
statistics sampled from 11577 (11630) to 11577 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.723), E-opt: 0.2 (0.357), width: 16
Scan time: 3.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31470.1 SYT13 gene_id:57586|Hs108|chr11 ( 426) 2844 526.6 1.8e-149
CCDS76582.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 ( 419) 510 102.9 5.9e-22
CCDS9017.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 ( 422) 510 103.0 6e-22
CCDS74455.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 ( 382) 504 101.8 1.2e-21
CCDS12919.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 ( 386) 497 100.6 2.8e-21
CCDS1427.1 SYT2 gene_id:127833|Hs108|chr1 ( 419) 496 100.4 3.5e-21
CCDS871.1 SYT6 gene_id:148281|Hs108|chr1 ( 425) 495 100.2 4e-21
CCDS7778.1 SYT9 gene_id:143425|Hs108|chr11 ( 491) 475 96.6 5.5e-20
CCDS8732.1 SYT10 gene_id:341359|Hs108|chr12 ( 523) 469 95.6 1.2e-19
CCDS12798.1 SYT3 gene_id:84258|Hs108|chr19 ( 590) 434 89.2 1.1e-17
CCDS31577.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 403) 431 88.6 1.2e-17
CCDS73298.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 447) 431 88.6 1.3e-17
CCDS58139.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 478) 431 88.6 1.4e-17
CCDS81952.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16 ( 413) 419 86.4 5.5e-17
CCDS76835.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16 ( 470) 419 86.5 6.1e-17
CCDS10575.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16 ( 474) 419 86.5 6.2e-17
CCDS1122.1 SYT11 gene_id:23208|Hs108|chr1 ( 431) 413 85.4 1.2e-16
CCDS11922.1 SYT4 gene_id:6860|Hs108|chr18 ( 425) 389 81.0 2.5e-15
CCDS8154.1 SYT12 gene_id:91683|Hs108|chr11 ( 421) 382 79.7 5.9e-15
CCDS7726.2 SYT8 gene_id:90019|Hs108|chr11 ( 401) 360 75.7 9e-14
CCDS73103.1 SYT15 gene_id:83849|Hs108|chr10 ( 421) 333 70.8 2.8e-12
>>CCDS31470.1 SYT13 gene_id:57586|Hs108|chr11 (426 aa)
initn: 2844 init1: 2844 opt: 2844 Z-score: 2797.0 bits: 526.6 E(32554): 1.8e-149
Smith-Waterman score: 2844; 100.0% identity (100.0% similar) in 426 aa overlap (1-426:1-426)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVLSVPVIALGATLGTATSILALCGVTCLCRHMHPKKGLLPRDQDPDLEKAKPSLLGSAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MVLSVPVIALGATLGTATSILALCGVTCLCRHMHPKKGLLPRDQDPDLEKAKPSLLGSAQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QFNVKKSTEPVQPRALLKFPDIYGPRPAVTAPEVINYADYSLRSTEEPTAPASPQPPNDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QFNVKKSTEPVQPRALLKFPDIYGPRPAVTAPEVINYADYSLRSTEEPTAPASPQPPNDS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RLKRQVTEELFILPQNGVVEDVCVMETWNPEKAASWNQAPKLHYCLDYDCQKAELFVTRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RLKRQVTEELFILPQNGVVEDVCVMETWNPEKAASWNQAPKLHYCLDYDCQKAELFVTRL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EAVTSNHDGGCDCYVQGSVANRTGSVEAQTALKKRQLHTTWEEGLVLPLAEEELPTATLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EAVTSNHDGGCDCYVQGSVANRTGSVEAQTALKKRQLHTTWEEGLVLPLAEEELPTATLT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LTLRTCDRFSRHSVAGELRLGLDGTSVPLGAAQWGELKTSAKEPSAGAGEVLLSISYLPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LTLRTCDRFSRHSVAGELRLGLDGTSVPLGAAQWGELKTSAKEPSAGAGEVLLSISYLPA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ANRLLVVLIKAKNLHSNQSKELLGKDVSVKVTLKHQARKLKKKQTKRAKHKINPVWNEMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ANRLLVVLIKAKNLHSNQSKELLGKDVSVKVTLKHQARKLKKKQTKRAKHKINPVWNEMI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD MFELPDDLLQASSVELEVLGQDDSGQSCALGHCSLGLHTSGSERSHWEEMLKNPRRQIAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MFELPDDLLQASSVELEVLGQDDSGQSCALGHCSLGLHTSGSERSHWEEMLKNPRRQIAM
370 380 390 400 410 420
pF1KSD WHQLHL
::::::
CCDS31 WHQLHL
>>CCDS76582.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 (419 aa)
initn: 562 init1: 272 opt: 510 Z-score: 507.6 bits: 102.9 E(32554): 5.9e-22
Smith-Waterman score: 510; 32.6% identity (66.3% similar) in 270 aa overlap (161-426:142-407)
140 150 160 170 180
pF1KSD FILPQNGVVEDVCVMETWNPEKAASWNQAPKLHYCLDYDCQKAELFVTRLEAV---TSNH
::.: :::: :. .:.: ..:. . .
CCDS76 KTMKDQDDDAETGLTDGEEKEEPKEEEKLGKLQYSLDYDFQNNQLLVGIIQAAELPALDM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DGGCDCYVQGSV-ANRTGSVEAQTALKKRQLHTTWEEGLVLPLAEEELPTATLTLTLRTC
: : ::. . .. . : : .... :. ...: ... . :: ::....
CCDS76 GGTSDPYVKVFLLPDKKKKFE--TKVHRKTLNPVFNEQFTFKVPYSELGGKTLVMAVYDF
180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KSD DRFSRHSVAGELRLGLDGTSVPLGAAQWGELKTSAKEPSAGAGEVLLSISYLPAANRLLV
::::.:.. ::... .. .. . .: .:... :: . :.. .:. :.:.:..: :
CCDS76 DRFSKHDIIGEFKVPMNTVDFGHVTEEWRDLQSAEKEEQEKLGDICFSLRYVPTAGKLTV
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VLIKAKNLHSNQSKELLGKDVSVKVTLKHQARKLKKKQTKRAKHKINPVWNEMIMFELPD
:...::::.. . : .: ::. : .....::::.: :. .:: .:: . ::.:
CCDS76 VILEAKNLKKMDVGGL--SDPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTIKKNTLNPYYNESFSFEVPF
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DLLQASSVELEVLGQDDSGQSCALGHCSLGLHTSGSERSHWEEMLKNPRRQIAMWHQLHL
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CCDS76 EQIQKVQVVVTVLDYDKIGKNDAIGKVFVGYNSTGAELRHWSDMLANPRRPIAQWHTLQV
350 360 370 380 390 400
CCDS76 EEEVDAMLAVKK
410
>>CCDS9017.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 (422 aa)
initn: 562 init1: 272 opt: 510 Z-score: 507.6 bits: 103.0 E(32554): 6e-22
Smith-Waterman score: 510; 32.6% identity (66.3% similar) in 270 aa overlap (161-426:145-410)
140 150 160 170 180
pF1KSD FILPQNGVVEDVCVMETWNPEKAASWNQAPKLHYCLDYDCQKAELFVTRLEAV---TSNH
::.: :::: :. .:.: ..:. . .
CCDS90 KDQALKDDDAETGLTDGEEKEEPKEEEKLGKLQYSLDYDFQNNQLLVGIIQAAELPALDM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DGGCDCYVQGSV-ANRTGSVEAQTALKKRQLHTTWEEGLVLPLAEEELPTATLTLTLRTC
: : ::. . .. . : : .... :. ...: ... . :: ::....
CCDS90 GGTSDPYVKVFLLPDKKKKFE--TKVHRKTLNPVFNEQFTFKVPYSELGGKTLVMAVYDF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD DRFSRHSVAGELRLGLDGTSVPLGAAQWGELKTSAKEPSAGAGEVLLSISYLPAANRLLV
::::.:.. ::... .. .. . .: .:... :: . :.. .:. :.:.:..: :
CCDS90 DRFSKHDIIGEFKVPMNTVDFGHVTEEWRDLQSAEKEEQEKLGDICFSLRYVPTAGKLTV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VLIKAKNLHSNQSKELLGKDVSVKVTLKHQARKLKKKQTKRAKHKINPVWNEMIMFELPD
:...::::.. . : .: ::. : .....::::.: :. .:: .:: . ::.:
CCDS90 VILEAKNLKKMDVGGL--SDPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTIKKNTLNPYYNESFSFEVPF
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DLLQASSVELEVLGQDDSGQSCALGHCSLGLHTSGSERSHWEEMLKNPRRQIAMWHQLHL
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CCDS90 EQIQKVQVVVTVLDYDKIGKNDAIGKVFVGYNSTGAELRHWSDMLANPRRPIAQWHTLQV
360 370 380 390 400 410
CCDS90 EEEVDAMLAVKK
420
>>CCDS74455.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 (382 aa)
initn: 414 init1: 273 opt: 504 Z-score: 502.3 bits: 101.8 E(32554): 1.2e-21
Smith-Waterman score: 504; 32.3% identity (61.0% similar) in 328 aa overlap (104-424:50-370)
80 90 100 110 120 130
pF1KSD RALLKFPDIYGPRPAVTAPEVINYADYSLRSTEEPTAPASPQPPNDSRLKRQVTEELFIL
: : :::: . : : :
CCDS74 SWSSLLCVGLKGRLGWEWGTRVLECLCRKDSRTPPPCSRSPQPRGLHRPTRLPTPVASAT
20 30 40 50 60 70
140 150 160 170 180
pF1KSD PQ-NGVVEDVCVMETWNPEKAASWNQAPKLHYCLDYDCQKAELFVTRLEAV---TSNHDG
: . ::.. . ...:. .. .:.: :::: :...:.: :.:. . . :
CCDS74 AQVQPEVEELEPAPSGPGQQVADKHELGRLQYSLDYDFQSGQLLVGILQAMGLAALDLGG
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GCDCYVQGSV-ANRTGSVEAQTALKKRQLHTTWEEGLVLPLAEEELPTATLTLTLRTCDR
. : ::. . .. : : .... :. . : ... . :: .:.... ::
CCDS74 SSDPYVRVYLLPDKRRRYE--TKVHRQTLNPHFGETFAFKVPYVELGGRVLVMAVYDFDR
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FSRHSVAGELRLGLDGTSVPLG--AAQWGELKTSAKEPSAGAGEVLLSISYLPAANRLLV
:::... ::.:. . .:: :: . : ::... .: :.. .:. :.:.:..: :
CCDS74 FSRNDAIGEVRVPM--SSVDLGRPVQAWRELQAAPREEEK-LGDICFSLRYVPTAGKLTV
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VLIKAKNLHSNQSKELLGKDVSVKVTLKHQARKLKKKQTKRAKHKINPVWNEMIMFELPD
....::::.. . : .: ::: : . ..:..::.: :. .:: .:: . ::.:
CCDS74 IVLEAKNLKKMDVGGL--SDPYVKVHLLQGGKKVRKKKTTIKKNTLNPYYNEAFSFEVPC
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DLLQASSVELEVLGQDDSGQSCALGHCSLGLHTSGSERSHWEEMLKNPRRQIAMWHQLHL
: .: .::: :: : :.. :.:. ..: ..:. :: .:: :::: ::.::.:
CCDS74 DQVQKVQVELTVLDYDKLGKNEAIGRVAVGAAAGGAGLRHWADMLANPRRPIAQWHSLRP
320 330 340 350 360 370
CCDS74 PDRVRLLPAP
380
>>CCDS12919.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 (386 aa)
initn: 504 init1: 273 opt: 497 Z-score: 495.4 bits: 100.6 E(32554): 2.8e-21
Smith-Waterman score: 497; 32.9% identity (64.7% similar) in 292 aa overlap (139-424:89-374)
110 120 130 140 150 160
pF1KSD TAPASPQPPNDSRLKRQVTEELFILPQNGVVEDVCVMETWNPEKAASWNQAPKLHYCLDY
::.. . ...:. .. .:.: :::
CCDS12 TGKKSQAQAQVHLQEVKGLGQSYIDKVQPEVEELEPAPSGPGQQVADKHELGRLQYSLDY
60 70 80 90 100 110
170 180 190 200 210 220
pF1KSD DCQKAELFVTRLEAV---TSNHDGGCDCYVQGSV-ANRTGSVEAQTALKKRQLHTTWEEG
: :...:.: :.:. . . :. : ::. . .. : : .... :. . :
CCDS12 DFQSGQLLVGILQAMGLAALDLGGSSDPYVRVYLLPDKRRRYE--TKVHRQTLNPHFGET
120 130 140 150 160 170
230 240 250 260 270 280
pF1KSD LVLPLAEEELPTATLTLTLRTCDRFSRHSVAGELRLGLDGTSVPLG--AAQWGELKTSAK
... . :: .:.... :::::... ::.:. . .:: :: . : ::... .
CCDS12 FAFKVPYVELGGRVLVMAVYDFDRFSRNDAIGEVRVPM--SSVDLGRPVQAWRELQAAPR
180 190 200 210 220 230
290 300 310 320 330 340
pF1KSD EPSAGAGEVLLSISYLPAANRLLVVLIKAKNLHSNQSKELLGKDVSVKVTLKHQARKLKK
: . :.. .:. :.:.:..: :....::::.. . : .: ::: : . ..:..:
CCDS12 EEQEKLGDICFSLRYVPTAGKLTVIVLEAKNLKKMDVGGL--SDPYVKVHLLQGGKKVRK
240 250 260 270 280 290
350 360 370 380 390 400
pF1KSD KQTKRAKHKINPVWNEMIMFELPDDLLQASSVELEVLGQDDSGQSCALGHCSLGLHTSGS
:.: :. .:: .:: . ::.: : .: .::: :: : :.. :.:. ..: ..:.
CCDS12 KKTTIKKNTLNPYYNEAFSFEVPCDQVQKVQVELTVLDYDKLGKNEAIGRVAVGAAAGGA
300 310 320 330 340 350
410 420
pF1KSD ERSHWEEMLKNPRRQIAMWHQLHL
:: .:: :::: ::.::.:
CCDS12 GLRHWADMLANPRRPIAQWHSLRPPDRVRLLPAP
360 370 380
>>CCDS1427.1 SYT2 gene_id:127833|Hs108|chr1 (419 aa)
initn: 488 init1: 268 opt: 496 Z-score: 493.9 bits: 100.4 E(32554): 3.5e-21
Smith-Waterman score: 496; 32.2% identity (64.4% similar) in 267 aa overlap (161-424:142-405)
140 150 160 170 180
pF1KSD FILPQNGVVEDVCVMETWNPEKAASWNQAPKLHYCLDYDCQKAELFVTRLEAV---TSNH
::.. :::: : .: : :.:. . .
CCDS14 KGGQDDDDAETGLTEGEGEGEEEKEPENLGKLQFSLDYDFQANQLTVGVLQAAELPALDM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DGGCDCYVQGSVANRTGSVEAQTALKKRQLHTTWEEGLVLPLAEEELPTATLTLTLRTCD
: : ::. . . . .: .... :. ...: ... . .:: ::.... :
CCDS14 GGTSDPYVKVFLLPDKKK-KYETKVHRKTLNPAFNETFTFKVPYQELGGKTLVMAIYDFD
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RFSRHSVAGELRLGLDGTSVPLGAAQWGELKTSAKEPSAGAGEVLLSISYLPAANRLLVV
:::.:.. ::... .. ... .: .:. . :: :.. :. :.:.:..: :
CCDS14 RFSKHDIIGEVKVPMNTVDLGQPIEEWRDLQGGEKEEPEKLGDICTSLRYVPTAGKLTVC
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LIKAKNLHSNQSKELLGKDVSVKVTLKHQARKLKKKQTKRAKHKINPVWNEMIMFELPDD
...::::.. . : .: ::. : .....::::.: :. .:: .:: . ::.: .
CCDS14 ILEAKNLKKMDVGGL--SDPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTVKKKTLNPYFNESFSFEIPFE
300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LLQASSVELEVLGQDDSGQSCALGHCSLGLHTSGSERSHWEEMLKNPRRQIAMWHQLHL
.: .: . :: : :.. :.:. .: ...:.: :: .:: :::: ::.::.:
CCDS14 QIQKVQVVVTVLDYDKLGKNEAIGKIFVGSNATGTELRHWSDMLANPRRPIAQWHSLKPE
350 360 370 380 390 400
CCDS14 EEVDALLGKNK
410
>>CCDS871.1 SYT6 gene_id:148281|Hs108|chr1 (425 aa)
initn: 547 init1: 274 opt: 495 Z-score: 492.8 bits: 100.2 E(32554): 4e-21
Smith-Waterman score: 507; 30.2% identity (61.6% similar) in 367 aa overlap (65-424:76-411)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD PKKGLLPRDQDPDLEKAKPSLLGSAQQFNVKKSTEPVQPRALLKFPDIYGPRPAVTAPEV
...:::.. .: . ::
CCDS87 AVKISHTSPDIPAEVQMSVKEHIMRHTRLQRQTTEPASSTRHTSFKR-HLPRQMH-----
50 60 70 80 90
100 110 120 130 140 150
pF1KSD INYADYSLRSTEEPTAPASPQPPNDSRLKRQVTEELFILPQNGVVEDVCVMETWNPEKAA
.. .::. .: : ::. :: . .:.: .. .. . .: ::. :.
CCDS87 VSSVDYG---NELP--PAAEQPTSIGRIKPELYKQKSV---DG--EDA---------KSE
100 110 120 130 140
160 170 180 190 200 210
pF1KSD SWNQAPKLHYCLDYDCQKAELFVTRLEAV---TSNHDGGCDCYVQGSV-ANRTGSVEAQT
. .. :... : :: . :.: :.: ... :. : ::. . .: . . ::
CCDS87 ATKSCGKINFSLRYDYETETLIVRILKAFDLPAKDFCGSSDPYVKIYLLPDR--KCKLQT
150 160 170 180 190
220 230 240 250 260
pF1KSD ALKKRQLHTTWEEGLVLPLAEEELPTATLTLTLRTCDRFSRHSVAGELRLG--LDGTSVP
.... :. :..:.. .:. ::: : :.. ::::::.. ::. : ......
CCDS87 RVHRKTLNPTFDENFHFPVPYEELADRKLHLSVFDFDRFSRHDMIGEVILDNLFEASDLS
200 210 220 230 240 250
270 280 290 300 310 320
pF1KSD LGAAQWGELKTSAKEPSAGAGEVLLSISYLPAANRLLVVLIKAKNLHSNQSKELLG-KDV
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CCDS87 RETSIWKDIQYATSE-SVDLGEIMFSLCYLPTAGRLTLTVIKCRNL---KAMDITGYSDP
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CCDS87 YVKVSLLCDGRRLKKKKTTIKKNTLNPVYNEAIIFDIPPENMDQVSLLISVMDYDRVGHN
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CCDS87 EIIGVCRVGITAEGLGRDHWNEMLAYPRKPIAHWHSLVEVKKSFKEGNPRL
380 390 400 410 420
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40 50 60 70 80 90
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380 390 400 410 420
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CCDS87 DRFSRHDMIGEVILDNLFEVSDLSREATVWKDIHCATTE-SIDLGEIMFSLCYLPTAGRM
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:
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CCDS12 ---GGGPGSGEAGTGAPCGRISFALRYLYGSDQLVVRILQALDLPAKDSNGFSDPYVKIY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]