Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1437
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1437, 810 aa
1>>>pF1KSDA1437 810 - 810 aa - 810 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6372+/-0.00126; mu= 13.3974+/- 0.076
mean_var=97.3541+/-19.973, 0's: 0 Z-trim(103.6): 182 B-trim: 298 in 1/49
Lambda= 0.129986
statistics sampled from 7285 (7490) to 7285 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.584), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 3.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35155.1 LRRC8A gene_id:56262|Hs108|chr9 ( 810) 5363 1017.2 0
CCDS724.1 LRRC8B gene_id:23507|Hs108|chr1 ( 803) 3188 609.3 8.2e-174
CCDS725.1 LRRC8C gene_id:84230|Hs108|chr1 ( 803) 3182 608.1 1.8e-173
CCDS726.1 LRRC8D gene_id:55144|Hs108|chr1 ( 858) 2846 545.2 1.8e-154
CCDS12189.1 LRRC8E gene_id:80131|Hs108|chr19 ( 796) 2632 505.0 2e-142
CCDS81341.1 LRRC7 gene_id:57554|Hs108|chr1 (1495) 403 87.1 2.3e-16
CCDS645.1 LRRC7 gene_id:57554|Hs108|chr1 (1537) 403 87.1 2.4e-16
CCDS4953.2 LRRC1 gene_id:55227|Hs108|chr6 ( 524) 387 83.9 7.6e-16
CCDS46951.1 LRRIQ4 gene_id:344657|Hs108|chr3 ( 560) 379 82.4 2.3e-15
CCDS66873.1 LRRC28 gene_id:123355|Hs108|chr15 ( 312) 346 76.1 1e-13
CCDS34844.1 MFHAS1 gene_id:9258|Hs108|chr8 (1052) 353 77.7 1.1e-13
CCDS10380.1 LRRC28 gene_id:123355|Hs108|chr15 ( 367) 346 76.2 1.1e-13
CCDS646.1 LRRC40 gene_id:55631|Hs108|chr1 ( 602) 340 75.1 3.8e-13
CCDS6411.1 SCRIB gene_id:23513|Hs108|chr8 (1630) 342 75.7 7e-13
CCDS6412.1 SCRIB gene_id:23513|Hs108|chr8 (1655) 342 75.7 7.1e-13
CCDS44508.1 PIDD1 gene_id:55367|Hs108|chr11 ( 893) 331 73.5 1.7e-12
CCDS7716.1 PIDD1 gene_id:55367|Hs108|chr11 ( 910) 331 73.5 1.8e-12
CCDS58095.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10 ( 536) 324 72.1 2.8e-12
CCDS7568.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10 ( 582) 320 71.4 5e-12
CCDS42409.1 LRRC30 gene_id:339291|Hs108|chr18 ( 301) 306 68.6 1.8e-11
CCDS31157.1 RSU1 gene_id:6251|Hs108|chr10 ( 224) 302 67.8 2.3e-11
CCDS61194.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 883) 306 68.8 4.4e-11
CCDS766.1 LRRC39 gene_id:127495|Hs108|chr1 ( 335) 296 66.8 7.1e-11
>>CCDS35155.1 LRRC8A gene_id:56262|Hs108|chr9 (810 aa)
initn: 5363 init1: 5363 opt: 5363 Z-score: 5438.2 bits: 1017.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5363; 100.0% identity (100.0% similar) in 810 aa overlap (1-810:1-810)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MIPVTELRYFADTQPAYRILKPWWDVFTDYISIVMLMIAVFGGTLQVTQDKMICLPCKWV
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CCDS35 MIPVTELRYFADTQPAYRILKPWWDVFTDYISIVMLMIAVFGGTLQVTQDKMICLPCKWV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TKDSCNDSFRGWAAPGPEPTYPNSTILPTPDTGPTGIKYDLDRHQYNYVDAVCYENRLHW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TKDSCNDSFRGWAAPGPEPTYPNSTILPTPDTGPTGIKYDLDRHQYNYVDAVCYENRLHW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD FAKYFPYLVLLHTLIFLACSNFWFKFPRTSSKLEHFVSILLKCFDSPWTTRALSETVVEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FAKYFPYLVLLHTLIFLACSNFWFKFPRTSSKLEHFVSILLKCFDSPWTTRALSETVVEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SDPKPAFSKMNGSMDKKSSTVSEDVEATVPMLQRTKSRIEQGIVDRSETGVLDKKEGEQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SDPKPAFSKMNGSMDKKSSTVSEDVEATVPMLQRTKSRIEQGIVDRSETGVLDKKEGEQA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KALFEKVKKFRTHVEEGDIVYRLYMRQTIIKVIKFILIICYTVYYVHNIKFDVDCTVDIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KALFEKVKKFRTHVEEGDIVYRLYMRQTIIKVIKFILIICYTVYYVHNIKFDVDCTVDIE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SLTGYRTYRCAHPLATLFKILASFYISLVIFYGLICMYTLWWMLRRSLKKYSFESIREES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SLTGYRTYRCAHPLATLFKILASFYISLVIFYGLICMYTLWWMLRRSLKKYSFESIREES
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SYSDIPDVKNDFAFMLHLIDQYDPLYSKRFAVFLSEVSENKLRQLNLNNEWTLDKLRQRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SYSDIPDVKNDFAFMLHLIDQYDPLYSKRFAVFLSEVSENKLRQLNLNNEWTLDKLRQRL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TKNAQDKLELHLFMLSGIPDTVFDLVELEVLKLELIPDVTIPPSIAQLTGLKELWLYHTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TKNAQDKLELHLFMLSGIPDTVFDLVELEVLKLELIPDVTIPPSIAQLTGLKELWLYHTA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD AKIEAPALAFLRENLRALHIKFTDIKEIPLWIYSLKTLEELHLTGNLSAENNRYIVIDGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AKIEAPALAFLRENLRALHIKFTDIKEIPLWIYSLKTLEELHLTGNLSAENNRYIVIDGL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RELKRLKVLRLKSNLSKLPQVVTDVGVHLQKLSINNEGTKLIVLNSLKKMANLTELELIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 RELKRLKVLRLKSNLSKLPQVVTDVGVHLQKLSINNEGTKLIVLNSLKKMANLTELELIR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD CDLERIPHSIFSLHNLQEIDLKDNNLKTIEEIISFQHLHRLTCLKLWYNHIAYIPIQIGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 CDLERIPHSIFSLHNLQEIDLKDNNLKTIEEIISFQHLHRLTCLKLWYNHIAYIPIQIGN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LTNLERLYLNRNKIEKIPTQLFYCRKLRYLDLSHNNLTFLPADIGLLQNLQNLAITANRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LTNLERLYLNRNKIEKIPTQLFYCRKLRYLDLSHNNLTFLPADIGLLQNLQNLAITANRI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD ETLPPELFQCRKLRALHLGNNVLQSLPSRVGELTNLTQIELRGNRLECLPVELGECPLLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ETLPPELFQCRKLRALHLGNNVLQSLPSRVGELTNLTQIELRGNRLECLPVELGECPLLK
730 740 750 760 770 780
790 800 810
pF1KSD RSGLVVEEDLFNTLPPEVKERLWRADKEQA
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 RSGLVVEEDLFNTLPPEVKERLWRADKEQA
790 800 810
>>CCDS724.1 LRRC8B gene_id:23507|Hs108|chr1 (803 aa)
initn: 3161 init1: 2464 opt: 3188 Z-score: 3233.9 bits: 609.3 E(32554): 8.2e-174
Smith-Waterman score: 3188; 59.0% identity (82.8% similar) in 803 aa overlap (1-802:1-796)
10 20 30 40 50
pF1KSD MIPVTELRYFADTQPAYRILKPWWDVFTDYISIVMLMIAVFGGTLQVTQDKMIC-LPCKW
:: .:::. .::.: .:.::::::::: ::...::..::..:.::.::....: ::::
CCDS72 MITLTELKCLADAQSSYHILKPWWDVFWYYITLIMLLVAVLAGALQLTQSRVLCCLPCKV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD VTKDSCNDSFRGWAAPGPEPTYPNSTILPTPDTGPTGIKYDLDRHQYNYVDAVCYENRLH
. : . : . :.. : : : :. :: :.::.:.::::::..::
CCDS72 EFDNHCAVPWDILKASMNTSSNPGT---PLPL--PLRIQNDLHRQQYSYIDAVCYEKQLH
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD WFAKYFPYLVLLHTLIFLACSNFWFKFPRTSSKLEHFVSILLKCFDSPWTTRALSETVVE
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CCDS72 WFAKFFPYLVLLHTLIFAACSNFWLHYPSTSSRLEHFVAILHKCFDSPWTTRALSETVAE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ESDPKPAFSKMNGSMDKKSSTVSEDVEATVPMLQRTKSRIEQGIVDRSETGVLDKKEGEQ
.: .:: ... .:: : :... : . .:.. .. ..:::::::::
CCDS72 QSVRPLKLSK--SKILLSSSGCSADIDSGKQSLPYPQPGLESAGIESPTSSVLDKKEGEQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD AKALFEKVKKFRTHVEEGDIVYRLYMRQTIIKVIKFILIICYTVYYVHNIKFDVDCTVDI
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CCDS72 AKAIFEKVKRFRMHVEQKDIIYRVYLKQIIVKVILFVLIITYVPYFLTHITLEIDCSVDV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ESLTGYRTYRCAHPLATLFKILASFYISLVIFYGLICMYTLWWMLRRSLKKYSFESIREE
...:::. :.:.. :: .::.:::::. :::.::: :.:::::: :::.::::..::.
CCDS72 QAFTGYKRYQCVYSLAEIFKVLASFYVILVILYGLTSSYSLWWMLRSSLKQYSFEALREK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SSYSDIPDVKNDFAFMLHLIDQYDPLYSKRFAVFLSEVSENKLRQLNLNNEWTLDKLRQR
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CCDS72 SNYSDIPDVKNDFAFILHLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVEKLKSK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD LTKNAQDKLELHLFMLSGIPDTVFDLVELEVLKLELIPDVTIPPSIAQLTGLKELWLYHT
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CCDS72 LVKNAQDKIELHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKELRVYHS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD AAKIEAPALAFLRENLRALHIKFTDIKEIPLWIYSLKTLEELHLTGNLSAENNRYIVIDG
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CCDS72 SLVVDHPALAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEQLSTMQLEG
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD LRELKRLKVLRLKSNLSKLPQVVTDVGVHLQKLSINNEGTKLIVLNSLKKMANLTELELI
...:: :..: :::.::..::::::. :::::..:::.::.:::.::::.:: ::::
CCDS72 FQDLKNLRTLYLKSSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELI
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD RCDLERIPHSIFSLHNLQEIDLKDNNLKTIEEIISFQHLHRLTCLKLWYNHIAYIPIQIG
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CCDS72 SCDLERIPHSIFSLNNLHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIG
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KSD NLTNLERLYLNRNKIEKIPTQLFYCRKLRYLDLSHNNLTFLPADIGLLQNLQNLAITANR
:.:::.: :..:.::..: ::: : ::.:::::.:.:::.: .: :.::: .:.: :
CCDS72 ALSNLEQLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNN
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KSD IETLPPELFQCRKLRALHLGNNVLQSLPSRVGELTNLTQIELRGNRLECLPVELGECPLL
:: :: ::::.::. : ::.: :..: .::::.:::..:: :: :: :: :: : :
CCDS72 IEMLPDGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPELEGCQSL
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810
pF1KSD KRSGLVVEEDLFNTLPPEVKERLWRADKEQA
::. :.:::.:.:::: : :::
CCDS72 KRNCLIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC
780 790 800
>>CCDS725.1 LRRC8C gene_id:84230|Hs108|chr1 (803 aa)
initn: 3524 init1: 2421 opt: 3182 Z-score: 3227.8 bits: 608.1 E(32554): 1.8e-173
Smith-Waterman score: 3182; 57.8% identity (83.9% similar) in 806 aa overlap (1-802:1-800)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MIPVTELRYFADTQPAYRILKPWWDVFTDYISIVMLMIAVFGGTLQVTQDKMICLPCKWV
::::::.: :.. :::.:.:::::::::::.:..::::.::: :::: :::.:::: .
CCDS72 MIPVTEFRQFSEQQPAFRVLKPWWDVFTDYLSVAMLMIGVFGCTLQVMQDKIICLPKR--
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD TKDSCNDSFRGWAAPGPEPTYPNSTILPTPDTGPT----GIKYDLDRHQYNYVDAVCYEN
.. . : : . .. . : : :.: . : :.: ::: .::.... .:::
CCDS72 VQPAQNHSSLSNVSQAVASTTPLPPPKPSPANPITVEMKGLKTDLDLQQYSFINQMCYER
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD RLHWFAKYFPYLVLLHTLIFLACSNFWFKFPRTSSKLEHFVSILLKCFDSPWTTRALSET
:::.:::::::::.:::.:. ::::::::: .:::.:::.::: ::::::::::::::.
CCDS72 ALHWYAKYFPYLVLIHTLVFMLCSNFWFKFPGSSSKIEHFISILGKCFDSPWTTRALSEV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD VVEESDPKPAFSKMNGSMDKKSSTVSEDVEATVPMLQRTKSRIEQGIVDRSETGVLDKKE
:.:. : .. ...:.. :.:.. : .. : :: :. .::.: .:.:::::
CCDS72 SGEDSEEK---DNRKNNMNR-SNTIQSGPEDSLVNSQSLKSIPEKFVVDKSTAGALDKKE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD GEQAKALFEKVKKFRTHVEEGDIVYRLYMRQTIIKVIKFILIICYTVYYVHNIKFDVDCT
::::::::::::::: :::::::.: .:.:::..:::::..:: :. : ...: :::.
CCDS72 GEQAKALFEKVKKFRLHVEEGDILYAMYVRQTVLKVIKFLIIIAYNSALVSKVQFTVDCN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD VDIESLTGYRTYRCAHPLATLFKILASFYISLVIFYGLICMYTLWWMLRRSLKKYSFESI
:::...:::... : : .: ::. :. :. .: .::: :.:::.:.. :::..:::: .
CCDS72 VDIQDMTGYKNFSCNHTMAHLFSKLSFCYLCFVSIYGLTCLYTLYWLFYRSLREYSFEYV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD REESSYSDIPDVKNDFAFMLHLIDQYDPLYSKRFAVFLSEVSENKLRQLNLNNEWTLDKL
:.:.. .::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.::::::::: :::
CCDS72 RQETGIDDIPDVKNDFAFMLHMIDQYDPLYSKRFAVFLSEVSENKLKQLNLNNEWTPDKL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RQRLTKNAQDKLELHLFMLSGIPDTVFDLVELEVLKLELIPDVTIPPSIAQLTGLKELWL
::.: ::...::: :.::::.:::::...::. ::::.: .: :: .:::: .:.:: :
CCDS72 RQKLQTNAHNRLELPLIMLSGLPDTVFEITELQSLKLEIIKNVMIPATIAQLDNLQELSL
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD YHTAAKIEAPALAFLRENLRALHIKFTDIKEIPLWIYSLKTLEELHLTGNLSAENNRYIV
.. ..::.. ::.::.:::..: .:: :..:.: :.:.:..::::.:.:.:: . .: ..
CCDS72 HQCSVKIHSAALSFLKENLKVLSVKFDDMRELPPWMYGLRNLEELYLVGSLSHDISRNVT
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD IDGLRELKRLKVLRLKSNLSKLPQVVTDVGVHLQKLSINNEGTKLIVLNSLKKMANLTEL
...::.:: ::.: .:::.::.::.:.::. ::::. :.:.::::..::.::::.:::::
CCDS72 LESLRDLKSLKILSIKSNVSKIPQAVVDVSSHLQKMCIHNDGTKLVMLNNLKKMTNLTEL
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD ELIRCDLERIPHSIFSLHNLQEIDLKDNNLKTIEEIISFQHLHRLTCLKLWYNHIAYIPI
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CCDS72 ELVHCDLERIPHAVFSLLSLQELDLKENNLKSIEEIVSFQHLRKLTVLKLWHNSITYIPE
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KSD QIGNLTNLERLYLNRNKIEKIPTQLFYCRKLRYLDLSHNNLTFLPADIGLLQNLQNLAIT
.: .::.:::: ...:::: .:..:: : :.::::::.:.. :.: .::.::.:: ..::
CCDS72 HIKKLTSLERLSFSHNKIEVLPSHLFLCNKIRYLDLSYNDIRFIPPEIGVLQSLQYFSIT
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KSD ANRIETLPPELFQCRKLRALHLGNNVLQSLPSRVGELTNLTQIELRGNRLECLPVELGEC
:..:.:: ::. :.::..:..:.: :. : ..:.: :. ....::..: :: :::.:
CCDS72 CNKVESLPDELYFCKKLKTLKIGKNSLSVLSPKIGNLLFLSYLDVKGNHFEILPPELGDC
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810
pF1KSD PLLKRSGLVVEEDLFNTLPPEVKERLWRADKEQA
:::.:::::. ::.::: .:.:..
CCDS72 RALKRAGLVVEDALFETLPSDVREQMKTE
780 790 800
>>CCDS726.1 LRRC8D gene_id:55144|Hs108|chr1 (858 aa)
initn: 3535 init1: 2415 opt: 2846 Z-score: 2886.9 bits: 545.2 E(32554): 1.8e-154
Smith-Waterman score: 3035; 55.0% identity (80.3% similar) in 833 aa overlap (14-802:14-846)
10 20 30 40 50
pF1KSD MIPVTELRYFADTQPAYRILKPWWDVFTDYISIVMLMIAVFGGTLQVTQDKMICLPC---
::.::::::::::: ::...::::.:.:.::.:.:.:...:::
CCDS72 MFTLAEVASLNDIQPTYRILKPWWDVFMDYLAVVMLMVAIFAGTMQLTKDQVVCLPVLPS
10 20 30 40 50 60
60 70 80
pF1KSD ------------KWVTKD---------------SCNDSFRGWAAPGPE-P---TYPNSTI
:: . . :: : .: :. : ::: . .
CCDS72 PVNSKAHTPPGNAEVTTNIPKMEAATNQDQDGRTTNDISFGTSAVTPDIPLRATYPRTDF
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KSD -LPTPDT-----GPTGIKYDLDRHQYNYVDAVCYENRLHWFAKYFPYLVLLHTLIFLACS
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CCDS72 ALPNQEAKKEKKDPTGRKTNLDFQQYVFINQMCYHLALPWYSKYFPYLALIHTIILMVSS
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KSD NFWFKFPRTSSKLEHFVSILLKCFDSPWTTRALSETVVEESDPKPAFSKMNGSMDKKSST
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CCDS72 NFWFKYPKTCSKVEHFVSILGKCFESPWTTKALSETACEDSEENKQRITGAQTLPKHVST
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250
pF1KSD VSED--VEATVPMLQRT--KSRIEQGIVDRSETGVLDKKEGEQAKALFEKVKKFRTHVEE
:.. :..::...: : :. ... .::::.:::::::::::.:::.:::.
CCDS72 SSDEGSPSASTPMINKTGFKFSAEKPVIEVPSMTILDKKDGEQAKALFEKVRKFRAHVED
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KSD GDIVYRLYMRQTIIKVIKFILIICYTVYYVHNIKFDVDCTVDIESLTGYRTYRCAHPLAT
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CCDS72 SDLIYKLYVVQTVIKTAKFIFILCYTANFVNAISFEHVCKPKVEHLIGYEVFECTHNMAY
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KSD LFKILASFYISLVIFYGLICMYTLWWMLRRSLKKYSFESIREESSYSDIPDVKNDFAFML
..: : :::.. ::.::.:::.:..: ::.::::..:::::.::::::::::::.:
CCDS72 MLKKLLISYISIICVYGFICLYTLFWLFRIPLKEYSFEKVREESSFSDIPDVKNDFAFLL
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KSD HLIDQYDPLYSKRFAVFLSEVSENKLRQLNLNNEWTLDKLRQRLTKNAQDKLELHLFMLS
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CCDS72 HMVDQYDQLYSKRFGVFLSEVSENKLREISLNHEWTFEKLRQHISRNAQDKQELHLFMLS
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KSD GIPDTVFDLVELEVLKLELIPDVTIPPSIAQLTGLKELWLYHTAAKIEAPALAFLRENLR
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CCDS72 GVPDAVFDLTDLDVLKLELIPEAKIPAKISQMTNLQELHLCHCPAKVEQTAFSFLRDHLR
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KSD ALHIKFTDIKEIPLWIYSLKTLEELHLTGNLSAENNRYIVIDGLRELKRLKVLRLKSNLS
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CCDS72 CLHVKFTDVAEIPAWVYLLKNLRELYLIGNLNSENNKMIGLESLRELRHLKILHVKSNLT
550 560 570 580 590 600
560 570 580 590 600 610
pF1KSD KLPQVVTDVGVHLQKLSINNEGTKLIVLNSLKKMANLTELELIRCDLERIPHSIFSLHNL
:.:. .:::. :: :: :.:.::::.:::::::: :..:::: :.::::::.:::: ::
CCDS72 KVPSNITDVAPHLTKLVIHNDGTKLLVLNSLKKMMNVAELELQNCELERIPHAIFSLSNL
610 620 630 640 650 660
620 630 640 650 660 670
pF1KSD QEIDLKDNNLKTIEEIISFQHLHRLTCLKLWYNHIAYIPIQIGNLTNLERLYLNRNKIEK
::.:::.::..:::::::::::.::::::::.:.:. :: .: .. ::: ::.. ::.:.
CCDS72 QELDLKSNNIRTIEEIISFQHLKRLTCLKLWHNKIVTIPPSITHVKNLESLYFSNNKLES
670 680 690 700 710 720
680 690 700 710 720 730
pF1KSD IPTQLFYCRKLRYLDLSHNNLTFLPADIGLLQNLQNLAITANRIETLPPELFQCRKLRAL
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CCDS72 LPVAVFSLQKLRCLDVSYNNISMIPIEIGLLQNLQHLHITGNKVDILPKQLFKCIKLRTL
730 740 750 760 770 780
740 750 760 770 780 790
pF1KSD HLGNNVLQSLPSRVGELTNLTQIELRGNRLECLPVELGECPLLKRSGLVVEEDLFNTLPP
.::.: . ::: .::.:..:::.::.:: :. ::..::.: .::.::::::. ::.:::
CCDS72 NLGQNCITSLPEKVGQLSQLTQLELKGNCLDRLPAQLGQCRMLKKSGLVVEDHLFDTLPL
790 800 810 820 830 840
800 810
pF1KSD EVKERLWRADKEQA
:::: :
CCDS72 EVKEALNQDINIPFANGI
850
>>CCDS12189.1 LRRC8E gene_id:80131|Hs108|chr19 (796 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MIPVTELRYFADTQPAYRILKPWWDVFTDYISIVMLMIAVFGGTLQVTQDKMICLPCKWV
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CCDS12 MIPVAEFKQFTEQQPAFKVLKPWWDVLAEYLTVAMLMIGVFGCTLQVTQDKIICLPNHEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KSD TKDSCNDSFRGWAAPG-PEPTYPNSTILPTPDTGPTGIKYDLDRHQYNYVDAVCYENRLH
.. . . : :: . . :.: .:: .::.... .:::. ::
CCDS12 QENLSEAPCQQLLPRGIPEQIGALQEV--------KGLKNNLDLQQYSFINQLCYETALH
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD WFAKYFPYLVLLHTLIFLACSNFWFKFPRTSSKLEHFVSILLKCFDSPWTTRALSETVVE
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CCDS12 WYAKYFPYLVVIHTLIFMVCTSFWFKFPGTSSKIEHFISILGKCFDSPWTTRALSEVSGE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ESDPKPAFSKMNGSMDKKSSTVSEDVEATVPMLQRTKSRIEQGIVDRSETGVLDKKEGEQ
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CCDS12 NQKGPAATERAAATIVAMAGTGPG--KAGEGEKEKVLAEPEKVVTEPPVVTLLDKKEGEQ
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD AKALFEKVKKFRTHVEEGDIVYRLYMRQTIIKVIKFILIICYTVYYVHNIKFDVDCTVDI
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CCDS12 AKALFEKVKKFRMHVEEGDILYTMYIRQTVLKVCKFLAILVYNLVYVEKISFLVACRVET
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD ESLTGYRTYRCAHPLATLFKILASFYISLVIFYGLICMYTLWWMLRRSLKKYSFESIREE
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CCDS12 SEVTGYASFCCNHTKAHLFSKLAFCYISFVCIYGLTCIYTLYWLFHRPLKEYSFRSVREE
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD SSYSDIPDVKNDFAFMLHLIDQYDPLYSKRFAVFLSEVSENKLRQLNLNNEWTLDKLRQR
....:::::::::::::::::::: :::::::::::::::..:.:::::.::: .::::.
CCDS12 TGMGDIPDVKNDFAFMLHLIDQYDSLYSKRFAVFLSEVSESRLKQLNLNHEWTPEKLRQK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD LTKNAQDKLELHLFMLSGIPDTVFDLVELEVLKLELIPDVTIPPSIAQLTGLKELWLYHT
: .:: .::: : :: :.:::::.: :.: :.:: : :.:.::...::. :.:: : :.
CCDS12 LQRNAAGRLELALCMLPGLPDTVFELSEVESLRLEAICDITFPPGLSQLVHLQELSLLHS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD AAKIEAPALAFLRENLRALHIKFTDIKEIPLWIYSLKTLEELHLTGNLSAENNRYIVIDG
:.. .:::..:.....: ...:.:::...:. :::::: : . : : ....
CCDS12 PARLPFSLQVFLRDHLKVMRVKCEELREVPLWVFGLRGLEELHLEGLFPQELARAATLES
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD LRELKRLKVLRLKSNLSKLPQVVTDVGVHLQKLSINNEGTKLIVLNSLKKMANLTELELI
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CCDS12 LRELKQLKVLSLRSNAGKVPASVTDVAGHLQRLSLHNDGARLVALNSLKKLAALRELELV
540 550 560 570 580 590
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pF1KSD RCDLERIPHSIFSLHNLQEIDLKDNNLKTIEEIISFQHLHRLTCLKLWYNHIAYIPIQIG
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CCDS12 ACGLERIPHAVFSLGALQELDLKDNHLRSIEEILSFQHCRKLVTLRLWHNQIAYVPEHVR
600 610 620 630 640 650
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pF1KSD NLTNLERLYLNRNKIEKIPTQLFYCRKLRYLDLSHNNLTFLPADIGLLQNLQNLAITANR
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CCDS12 KLRSLEQLYLSYNKLETLPSQLGLCSGLRLLDVSHNGLHSLPPEVGLLQNLQHLALSYNA
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KSD IETLPPELFQCRKLRALHLGNNVLQSLPSRVGELTNLTQIELRGNRLECLPVELGECPLL
.:.:: ::: :::::.: ::.: :..: .:: : :...::.::::: :: :::.: :
CCDS12 LEALPEELFFCRKLRTLLLGDNQLSQLSPHVGALRALSRLELKGNRLEALPEELGNCGGL
720 730 740 750 760 770
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pF1KSD KRSGLVVEEDLFNTLPPEVKERLWRADKEQA
:..::.::. :.. :: ::....
CCDS12 KKAGLLVEDTLYQGLPAEVRDKMEEE
780 790
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pF1KSD PSIAQLTGLKELWLYHTAAKIEAPALAFLRENLRALHIKFTDIKEIPLWIYSL-KTLEEL
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CCDS81 MQCLEMTTKRKIIGRLVPCRCFRGEEEIISVLDYSHCSLQQVPKEVFNFERTLEEL
10 20 30 40 50
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pF1KSD HLTGNLSAENNRYIVIDGLRELKRLKVLRLKSNLSKLPQVVTDVGVHLQKLSINNEGTKL
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CCDS81 YLDANQIEELPKQLF--NCQALRKLSIP--DNDLSNLPTTIASL-VNLKELDISKNGVQE
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pF1KSD IVLNSLKKMANLTELELIRCDLERIPHSIFSLHNLQEIDLKDNNLKTIEEIISFQHLHRL
. : .: :: .: . ..: .. .: :: .. :.: :. . .: .: .:
CCDS81 FPEN-IKCCKCLTIIEASVNPISKLPDGFTQLLNLTQLYLNDAFLEFLP--ANFGRLVKL
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:.: ::. .: .. .:..:::: :. :.. ..: : ..:: : ...: : ::
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170 180 190 200 210 220
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..:: :. : : .. :::::. .. :. :. : :..:.::.::. .: : .:: ...
CCDS81 GSIGKLKMLVYLDMSKNRIETVDMDISGCEALEDLLLSSNMLQQLPDSIGLLKKLTTLKV
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pF1KSD RGNRLECLPVELGECPLLKRSGLVVEEDLFNTLPPEVKERLWRADKEQA
:.: :: .:. ::.. .: ...:: .
CCDS81 DDNQLTMLPNTIGNLSLLEEFDCSCNE--LESLPSTIGYLHSLRTLAVDENFLPELPREI
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CCDS81 GSCKNVTVMSLRSNKLEFLPEEIGQMQKLRVLNLSDNRLKNLPFSFTKLKELAALWLSDN
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Smith-Waterman score: 403; 29.6% identity (63.8% similar) in 307 aa overlap (493-798:22-318)
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pF1KSD PSIAQLTGLKELWLYHTAAKIEAPALAFLRENLRALHIKFTDIKEIPLWIYSL-KTLEEL
: . .: . .....: .... .:::::
CCDS64 MTTKRKIIGRLVPCRCFRGEEEIISVLDYSHCSLQQVPKEVFNFERTLEEL
10 20 30 40 50
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pF1KSD HLTGNLSAENNRYIVIDGLRELKRLKVLRLKSNLSKLPQVVTDVGVHLQKLSINNEGTKL
.: .: : . . . . :..:.. ..::.:: ..... :.:..:.:...:..
CCDS64 YLDANQIEELPKQLF--NCQALRKLSIP--DNDLSNLPTTIASL-VNLKELDISKNGVQE
60 70 80 90 100
590 600 610 620 630 640
pF1KSD IVLNSLKKMANLTELELIRCDLERIPHSIFSLHNLQEIDLKDNNLKTIEEIISFQHLHRL
. : .: :: .: . ..: .. .: :: .. :.: :. . .: .: .:
CCDS64 FPEN-IKCCKCLTIIEASVNPISKLPDGFTQLLNLTQLYLNDAFLEFLP--ANFGRLVKL
110 120 130 140 150 160
650 660 670 680 690 700
pF1KSD TCLKLWYNHIAYIPIQIGNLTNLERLYLNRNKIEKIPTQLFYCRKLRYLDLSHNNLTFLP
:.: ::. .: .. .:..:::: :. :.. ..: : ..:: : ...: : ::
CCDS64 RILELRENHLKTLPKSMHKLAQLERLDLGNNEFGELPEVLDQIQNLRELWMDNNALQVLP
170 180 190 200 210 220
710 720 730 740 750 760
pF1KSD ADIGLLQNLQNLAITANRIETLPPELFQCRKLRALHLGNNVLQSLPSRVGELTNLTQIEL
..:: :. : : .. :::::. .. :. :. : :..:.::.::. .: : .:: ...
CCDS64 GSIGKLKMLVYLDMSKNRIETVDMDISGCEALEDLLLSSNMLQQLPDSIGLLKKLTTLKV
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pF1KSD RGNRLECLPVELGECPLLKRSGLVVEEDLFNTLPPEVKERLWRADKEQA
:.: :: .:. ::.. .: ...:: .
CCDS64 DDNQLTMLPNTIGNLSLLEEFDCSCNE--LESLPSTIGYLHSLRTLAVDENFLPELPREI
290 300 310 320 330 340
CCDS64 GSCKNVTVMSLRSNKLEFLPEEIGQMQKLRVLNLSDNRLKNLPFSFTKLKELAALWLSDN
350 360 370 380 390 400
>>CCDS4953.2 LRRC1 gene_id:55227|Hs108|chr6 (524 aa)
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.:. : . ....:.: ...: :..: :
CCDS49 LWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVKLRKLGL
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD TGNLSAENNRYIV-IDGLRELKRLKVLRLKSNLSKLPQVVTDVGVHLQKLSINN-EGTKL
. : : .: : .. .: .: : : ... ..:. .. . :.. . :. :
CCDS49 SDN---EIQRLPPEIANFMQLVELDVSR--NEIPEIPESIS----FCKALQVADFSGNPL
70 80 90 100 110
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pF1KSD IVL-NSLKKMANLTELELIRCDLERIPHSIFSLHNLQEIDLKDNNLKTIEEIISFQHLHR
: .:. .. ::: : . .:. .:..: .:.:: ..:..: : . . :. .:.:
CCDS49 TRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPD--SLTQLRR
120 130 140 150 160 170
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pF1KSD LTCLKLWYNHIAYIPIQIGNLTNLERLYLNRNKIEKIPTQLFYCRKLRYLDLSHNNLTFL
: : : :.: .: .:: : .:. :.:. :.. ..: .. ..: ::.:.: : :
CCDS49 LEELDLGNNEIYNLPESIGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERL
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD PADIGLLQNLQNLAITANRIETLPPELFQCRKLRALHLGNNVLQSLPSRVGELTNLTQIE
: .:. : .: .:.:. : .::.: . . .:: :.. .: : .:: ::: .::..
CCDS49 PEEISGLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELV
240 250 260 270 280 290
770 780 790 800 810
pF1KSD LRGNRLECLPVELGECPLLKRSGLVVEEDLFNTLPPEVKERLWRADKEQA
: :.: :: .:. : : :.: .... . .:: :.
CCDS49 LTENQLLTLPKSIGK--LKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAE
300 310 320 330 340 350
CCDS49 VSQATELHVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTGEKILTC
360 370 380 390 400 410
>>CCDS46951.1 LRRIQ4 gene_id:344657|Hs108|chr3 (560 aa)
initn: 770 init1: 322 opt: 379 Z-score: 389.4 bits: 82.4 E(32554): 2.3e-15
Smith-Waterman score: 410; 33.0% identity (62.4% similar) in 279 aa overlap (494-770:24-273)
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pF1KSD SIAQLTGLKELWLYHTAAKIEAPALAFLRENLRALHIKFTD--IKEIPLWIYSLKTLEEL
: :.. : .. . ::: :... :::.
CCDS46 MSKDIKSVEHSPKIHQRNDPQHVNDRTFFIDASNQSLTAIPLEIFTFTELEEV
10 20 30 40 50
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pF1KSD HLTGNLSAENNRYIVIDGLRELKRLKVLRLKSNLSKLPQVVTDVGVHLQKLSINNEGTKL
:: :::. : .:..::: .:. ..:.: .. . :
CCDS46 HL------ENNQIEEIP--QEIQRLKNIRV---------------LYLDKNNLRSLCPAL
60 70 80 90
590 600 610 620 630 640
pF1KSD IVLNSLKKMANLTELELIRCDLERIPHSIFSLHNLQEIDLKDNNLKTIEEIISFQHLHRL
.:.::... .:. .. .: . :: :.:. : ...:: : .: :..::.:
CCDS46 GLLSSLESL-DLSYNPIFSSSLVVVSF----LHALRELRLYQTDLKEIPVVI-FKNLHHL
100 110 120 130 140
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