FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA1438, 931 aa 1>>>pF1KSDA1438 931 - 931 aa - 931 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.0449+/-0.000939; mu= -8.1961+/- 0.057 mean_var=358.0896+/-72.758, 0's: 0 Z-trim(116.4): 31 B-trim: 93 in 1/53 Lambda= 0.067776 statistics sampled from 17013 (17039) to 17013 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.799), E-opt: 0.2 (0.523), width: 16 Scan time: 5.970 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS14003.1 MKL1 gene_id:57591|Hs108|chr22 ( 931) 6163 616.9 5.7e-176 CCDS82720.1 MKL1 gene_id:57591|Hs108|chr22 ( 966) 6163 616.9 5.9e-176 CCDS74866.1 MKL1 gene_id:57591|Hs108|chr22 ( 798) 4982 501.3 2.9e-141 CCDS74865.1 MKL1 gene_id:57591|Hs108|chr22 ( 881) 4909 494.2 4.4e-139 CCDS76823.1 MKL2 gene_id:57496|Hs108|chr16 (1099) 1362 147.5 1.4e-34 CCDS32391.1 MKL2 gene_id:57496|Hs108|chr16 (1049) 1316 143.0 2.9e-33 CCDS54091.1 MYOCD gene_id:93649|Hs108|chr17 ( 986) 862 98.5 6.5e-20 CCDS11163.1 MYOCD gene_id:93649|Hs108|chr17 ( 938) 653 78.1 8.8e-14 >>CCDS14003.1 MKL1 gene_id:57591|Hs108|chr22 (931 aa) initn: 6163 init1: 6163 opt: 6163 Z-score: 3272.7 bits: 616.9 E(32554): 5.7e-176 Smith-Waterman score: 6163; 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94.6% identity (94.6% similar) in 931 aa overlap (1-931:1-881) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MPPLKSPAAFHEQRRSLERARTEDYLKRKIRSRPERSELVRMHILEETSAEPSLQAKQLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 MPPLKSPAAFHEQRRSLERARTEDYLKRKIRSRPERSELVRMHILEETSAEPSLQAKQLK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KSD LKRARLADDLNEKIAQRPGPMELVEKNILPVESSLKEAIIVGQVNYPKVADSSSFDEDSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 LKRARLADDLNEKIAQRPGPMELVEKNILPVESSLKEAIIVGQVNYPKVADSSSFDEDSS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KSD DALSPEQPASHESQGSVPSPLEARVSEPLLSATSASPTQVVSQLPMGRDSREMLFLAEQP ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 DALSPEQPASHESQGSVPSPLEARVSEPLLSATSASPTQ--------------------- 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KSD PLPPPPLLPPSLTNGTTIPTAKSTPTLIKQSQPKSASEKSQRSKKAKELKPKVKKLKYHQ ::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 -----------------------------QSQPKSASEKSQRSKKAKELKPKVKKLKYHQ 160 170 180 190 250 260 270 280 290 300 pF1KSD YIPPDQKQDRGAPPMDSSYAKILQQQQLFLQLQILNQQQQQHHNYQAILPAPPKSAGEAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 YIPPDQKQDRGAPPMDSSYAKILQQQQLFLQLQILNQQQQQHHNYQAILPAPPKSAGEAL 200 210 220 230 240 250 310 320 330 340 350 360 pF1KSD GSSGTPPVRSLSTTNSSSSSGAPGPCGLARQNSTSLTGKPGALPANLDDMKVAELKQELK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 GSSGTPPVRSLSTTNSSSSSGAPGPCGLARQNSTSLTGKPGALPANLDDMKVAELKQELK 260 270 280 290 300 310 370 380 390 400 410 420 pF1KSD LRSLPVSGTKTELIERLRAYQDQISPVPGAPKAPAATSILHKAGEVVVAFPAARLSTGPA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 LRSLPVSGTKTELIERLRAYQDQISPVPGAPKAPAATSILHKAGEVVVAFPAARLSTGPA 320 330 340 350 360 370 430 440 450 460 470 480 pF1KSD LVAAGLAPAEVVVATVASSGVVKFGSTGSTPPVSPTPSERSLLSTGDENSTPGDTFGEMV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 LVAAGLAPAEVVVATVASSGVVKFGSTGSTPPVSPTPSERSLLSTGDENSTPGDTFGEMV 380 390 400 410 420 430 490 500 510 520 530 540 pF1KSD TSPLTQLTLQASPLQILVKEEGPRAGSCCLSPGGRAELEGRDKDQMLQEKDKQIEALTRM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 TSPLTQLTLQASPLQILVKEEGPRAGSCCLSPGGRAELEGRDKDQMLQEKDKQIEALTRM 440 450 460 470 480 490 550 560 570 580 590 600 pF1KSD LRQKQQLVERLKLQLEQEKRAQQPAPAPAPLGTPVKQENSFSSCQLSQQPLGPAHPFNPS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 LRQKQQLVERLKLQLEQEKRAQQPAPAPAPLGTPVKQENSFSSCQLSQQPLGPAHPFNPS 500 510 520 530 540 550 610 620 630 640 650 660 pF1KSD LAAPATNHIDPCAVAPGPPSVVVKQEALQPEPEPVPAPQLLLGPQGPSLIKGVAPPTLIT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 LAAPATNHIDPCAVAPGPPSVVVKQEALQPEPEPVPAPQLLLGPQGPSLIKGVAPPTLIT 560 570 580 590 600 610 670 680 690 700 710 720 pF1KSD DSTGTHLVLTVTNKNADSPGLSSGSPQQPSSQPGSPAPAPSAQMDLEHPLQPLFGTPTSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 DSTGTHLVLTVTNKNADSPGLSSGSPQQPSSQPGSPAPAPSAQMDLEHPLQPLFGTPTSL 620 630 640 650 660 670 730 740 750 760 770 780 pF1KSD LKKEPPGYEEAMSQQPKQQENGSSSQQMDDLFDILIQSGEISADFKEPPSLPGKEKPSPK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 LKKEPPGYEEAMSQQPKQQENGSSSQQMDDLFDILIQSGEISADFKEPPSLPGKEKPSPK 680 690 700 710 720 730 790 800 810 820 830 840 pF1KSD TVCGSPLAAQPSPSAELPQAAPPPPGSPSLPGRLEDFLESSTGLPLLTSGHDGPEPLSLI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 TVCGSPLAAQPSPSAELPQAAPPPPGSPSLPGRLEDFLESSTGLPLLTSGHDGPEPLSLI 740 750 760 770 780 790 850 860 870 880 890 900 pF1KSD DDLHSQMLSSTAILDHPPSPMDTSELHFVPEPSSTMGLDLADGHLDSMDWLELSSGGPVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 DDLHSQMLSSTAILDHPPSPMDTSELHFVPEPSSTMGLDLADGHLDSMDWLELSSGGPVL 800 810 820 830 840 850 910 920 930 pF1KSD SLAPLSTTAPSLFSTDFLDGHDLQLHWDSCL ::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 SLAPLSTTAPSLFSTDFLDGHDLQLHWDSCL 860 870 880 >>CCDS76823.1 MKL2 gene_id:57496|Hs108|chr16 (1099 aa) initn: 1764 init1: 571 opt: 1362 Z-score: 734.6 bits: 147.5 E(32554): 1.4e-34 Smith-Waterman score: 2082; 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CCDS76 SPVTTNTPAQFASVSPTVPEFLKTPPTADQPPPRPAAPVLP---TN--TVSSAKPGPALV 230 240 250 260 270 210 220 230 240 250 260 pF1KSD KQSQPKSASEKSQRSKKAKELKPKVKKLKYHQYIPPDQKQDRGAPPMDSSYAKILQQQQL :::.::. ..: .:::: :. ::.::::::::::::::: ... : :::.::..:::::: CCDS76 KQSHPKNPNDK-HRSKKCKDPKPRVKKLKYHQYIPPDQKGEKNEPQMDSNYARLLQQQQL 280 290 300 310 320 330 270 280 290 300 310 320 pF1KSD FLQLQILNQQQQQHHNYQAILPAPPKSAGEALGSSGTPPVRSLSTTNSSSSSGAPGPCGL :::::::.::.: :.:::.::::: : .. ..:: ::. ....: . CCDS76 FLQLQILSQQKQ-HYNYQTILPAPFKPLNDKNSNSG----------NSALNNATP---NT 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 pF1KSD ARQNSTSLTGKPGALPANLDDMKVAELKQELKLRSLPVSGTKTELIERLRAYQDQISP-- :::... . ::: ::..:::.::.::: :::::.::::::: .:::::. ::. : CCDS76 PRQNTSTPVRKPGPLPSSLDDLKVSELKTELKLRGLPVSGTKPDLIERLKPYQEVNSSGL 390 400 410 420 430 440 390 400 410 420 430 440 pF1KSD VPGAPKAPAATSILHKAGEVVVAFPAARLSTGPALVAAGLAPAEVVVATVASSGVVKFGS . :. : ....:. . ::.::.:.. : . :..... .. . ...:.... . CCDS76 AAGGIVAVSSSAIVTSNPEVTVALPVTTLHN---TVTSSVSTLKAELPPTGTSNATRVEN 450 460 470 480 490 450 460 470 480 490 500 pF1KSD TGSTPPVSPTPSERSLLSTGDENSTPGDTFGEMVTSPLTQLTLQASPLQILVKEEGPRAG . : :.::.:::.: ::: : : . ::: :..: . :..:::.. .:.. CCDS76 VHSPLPISPSPSEQSSLSTDDTNMA--DTFTEIMTMMSPSQFLSSSPLRMTNNEDSLSPT 500 510 520 530 540 550 510 520 530 540 550 560 pF1KSD SCCLSPGGRAELEGRDKDQMLQEKDKQIEALTRMLRQKQQLVERLKLQLEQEKRAQQPAP : :: ::.. .::. ::::.:::: : : :.:.:.::: ::.::: :::.:: : CCDS76 SSTLS---NLELDAAEKDRKLQEKEKQIEELKRKLEQEQKLVEVLKMQLEVEKRGQQQRP 560 570 580 590 600 610 570 580 590 600 pF1KSD ---AP-AP------------LGTPVKQENSFSSCQLSQQPLGPA-HPFNPSLAAPATNHI : :: ::. .:.: :. .:. :.::. : : . ... . . . CCDS76 LEAQPSAPGHSVKSDQKHGSLGSSIKDEASLPDCSSSRQPIPVASHAVGQPVSTGGQTLV 620 630 640 650 660 670 610 620 pF1KSD DPCAVA-----P-G-------------------PPSVVVKQEAL---------------- ::. : : ::.::.. .:: CCDS76 AKKAVVIKQEVPVGQAEQQSVVSQFYVSSQGQPPPAVVAQPQALLTTQTAQLLLPVSIQG 680 690 700 710 720 730 630 640 650 660 pF1KSD ---------------QPEPEP--VPAPQLLLGPQGPS--LIKGVAPPTLITDSTGTHLVL : :. ::. . : :. : .:.:: . :..: . :: CCDS76 SSVTSVQLPVGSLKLQTSPQAGMQTQPQIATAAQIPTAALASGLAPTVPQTQDTFPQHVL 740 750 760 770 780 790 670 680 690 700 pF1KSD T-------VTNKNADS----PGLSSGSP--QQP-------SSQPGSPAPAPSAQMDLEHP . : ...:.: : .: ::: : . :: :: : . : CCDS76 SQPQQVRKVFTNSASSNTVLPYQRHPAPAVQQPFINKASNSVLQSRNAPLPSLQNGPNTP 800 810 820 830 840 850 710 720 730 740 750 pF1KSD LQP--------------LFGTPTSLLKKEPPGYEEAM-----SQQPKQQENGSSSQQMDD .: :::.:.. : .:: ::::. .: : . ... :::::: CCDS76 NKPSSPPPPQQFVVQHSLFGSPVAKTK-DPPRYEEAIKQTRSTQAPLPEISNAHSQQMDD 860 870 880 890 900 910 760 770 780 790 800 pF1KSD LFDILIQSGEISADFKEPPSLPGKEKPSPKTVCGSPL---AAQPSPSAEL-PQAAPPPPG ::::::.::::: .:: :: .: .: .. :. ...: :.... : .. : : CCDS76 LFDILIKSGEISLPIKEEPSPISKMRPVTASITTMPVNTVVSRPPPQVQMAPPVSLEPMG 920 930 940 950 960 970 810 820 830 840 850 860 pF1KSD S--PSLPGRLEDFLE----SSTGLPLLTSGHDGPEPLSLIDDLHSQMLSSTAILDHPPSP : :: ..:: ::. :.. .: : :. . ::.:::.::....:: ...::: :: CCDS76 SLSASLENQLEAFLDGTLPSANEIPPLQSSSEDREPFSLIEDLQNDLLSHSGMLDHSHSP 980 990 1000 1010 1020 1030 870 880 890 900 910 920 pF1KSD MDTSELHFVPEPSSTMGLDLADGHLDSMDWLELSSGGPVLSLAPLSTTAPSLFSTDFLDG :. CCDS76 METSETQFAAGTPCLSLDLSDSNLDNMEWLDITMPNSSSGLTPLSTTAPSMFSADFLDPQ 1040 1050 1060 1070 1080 1090 >>CCDS32391.1 MKL2 gene_id:57496|Hs108|chr16 (1049 aa) initn: 1764 init1: 571 opt: 1316 Z-score: 710.5 bits: 143.0 E(32554): 2.9e-33 Smith-Waterman score: 2301; 45.2% identity (67.7% similar) in 993 aa overlap (1-913:72-1034) 10 20 30 pF1KSD MPPLKSPAAFHEQRRSLERARTEDYLKRKI ::::::::::::: .::::::::..::.:: CCDS32 NLPPLNERKNVLQLRLQQRRTREQLVDQGIMPPLKSPAAFHEQIKSLERARTENFLKHKI 50 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 90 pF1KSD RSRPERSELVRMHILEETSAEPSLQAKQLKLKRARLADDLNEKIAQRPGPMELVEKNILP ::::.::::::::::::: ::::::: :.::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 RSRPDRSELVRMHILEETFAEPSLQATQMKLKRARLADDLNEKIAQRPGPMELVEKNILP 110 120 130 140 150 160 100 110 120 130 140 pF1KSD VESSLKEAII-VGQVNYPKVADSSSFDEDSSDALSPEQPASHESQGSVPSPLEARVSEPL :.::.::::: ::. .::.. . ::::::::::::.::::.:::::. :: : .::: CCDS32 VDSSVKEAIIGVGKEDYPHTQGDFSFDEDSSDALSPDQPASQESQGSAASPSEPKVSESP 170 180 190 200 210 220 150 160 170 180 190 200 pF1KSD LSATSASPTQVVSQLPMGRDSREMLFLAEQPP-LPPPPLLPPSLTNGTTIPTAKSTPTLI .:. .:.: .: : . . :.::: : :.:: :: :. .:: :.:. CCDS32 SPVTTNTPAQFASVSPTVPEFLKTPPTADQPPPRPAAPVLP---TN--TVSSAKPGPALV 230 240 250 260 270 210 220 230 240 250 260 pF1KSD KQSQPKSASEKSQRSKKAKELKPKVKKLKYHQYIPPDQKQDRGAPPMDSSYAKILQQQQL :::.::. ..: .:::: :. ::.::::::::::::::: ... : :::.::..:::::: CCDS32 KQSHPKNPNDK-HRSKKCKDPKPRVKKLKYHQYIPPDQKGEKNEPQMDSNYARLLQQQQL 280 290 300 310 320 330 270 280 290 300 310 320 pF1KSD FLQLQILNQQQQQHHNYQAILPAPPKSAGEALGSSGTPPVRSLSTTNSSSSSGAPGPCGL :::::::.::.: :.:::.::::: : .. ..:: ::. ....:. CCDS32 FLQLQILSQQKQ-HYNYQTILPAPFKPLNDKNSNSG----------NSALNNATPNT--- 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 pF1KSD ARQNSTSLTGKPGALPANLDDMKVAELKQELKLRSLPVSGTKTELIERLRAYQDQISP-- :::... . ::: ::..:::.::.::: :::::.::::::: .:::::. ::. : CCDS32 PRQNTSTPVRKPGPLPSSLDDLKVSELKTELKLRGLPVSGTKPDLIERLKPYQEVNSSGL 390 400 410 420 430 440 390 400 410 420 430 440 pF1KSD VPGAPKAPAATSILHKAGEVVVAFPAARLSTGPALVAAGLAPAEVVVATVASSGVVKFGS . :. : ....:. . ::.::.:.. : . :..... .. . ...:.... . CCDS32 AAGGIVAVSSSAIVTSNPEVTVALPVTTLHN---TVTSSVSTLKAELPPTGTSNATRVEN 450 460 470 480 490 450 460 470 480 490 500 pF1KSD TGSTPPVSPTPSERSLLSTGDENSTPGDTFGEMVTSPLTQLTLQASPLQILVKEEGPRAG . : :.::.:::.: ::: : : . ::: :..: . :..:::.. .:.. CCDS32 VHSPLPISPSPSEQSSLSTDDTNMA--DTFTEIMTMMSPSQFLSSSPLRMTNNEDSLSPT 500 510 520 530 540 550 510 520 530 540 550 560 pF1KSD SCCLSPGGRAELEGRDKDQMLQEKDKQIEALTRMLRQKQQLVERLKLQLEQEKRAQQPAP : :: ::.. .::. ::::.:::: : : :.:.:.::: ::.::: :::.:: : CCDS32 SSTLS---NLELDAAEKDRKLQEKEKQIEELKRKLEQEQKLVEVLKMQLEVEKRGQQQRP 560 570 580 590 600 610 570 580 590 600 pF1KSD ---AP-AP------------LGTPVKQENSFSSCQLSQQPLGPA-HPFNPSLAAPATNHI : :: ::. .:.: :. .:. :.::. : : . ... . . . CCDS32 LEAQPSAPGHSVKSDQKHGSLGSSIKDEASLPDCSSSRQPIPVASHAVGQPVSTGGQTLV 620 630 640 650 660 670 610 620 630 640 650 pF1KSD DPCAVA-----P---GPPSVVVKQEALQPEPEPVPAPQLLLGPQGPS--LIKGVAPPTLI ::. : . . ::.: .:. ::. . : :. : .:.:: . CCDS32 AKKAVVIKQEVPVGQAEQQSVVSQFYTSPQAGMQTQPQIATAAQIPTAALASGLAPTVPQ 680 690 700 710 720 730 660 670 680 690 pF1KSD TDSTGTHLVLT-------VTNKNADS----PGLSSGSP--QQP-------SSQPGSPAPA :..: . ::. : ...:.: : .: ::: : . :: CCDS32 TQDTFPQHVLSQPQQVRKVFTNSASSNTVLPYQRHPAPAVQQPFINKASNSVLQSRNAPL 740 750 760 770 780 790 700 710 720 730 740 pF1KSD PSAQMDLEHPLQP--------------LFGTPTSLLKKEPPGYEEAM-----SQQPKQQE :: : . : .: :::.:.. : .:: ::::. .: : . CCDS32 PSLQNGPNTPNKPSSPPPPQQFVVQHSLFGSPVAKTK-DPPRYEEAIKQTRSTQAPLPEI 800 810 820 830 840 850 750 760 770 780 790 pF1KSD NGSSSQQMDDLFDILIQSGEISADFKEPPSLPGKEKPSPKTVCGSPL---AAQPSPSAEL ... ::::::::::::.::::: .:: :: .: .: .. :. ...: :.... CCDS32 SNAHSQQMDDLFDILIKSGEISLPIKEEPSPISKMRPVTASITTMPVNTVVSRPPPQVQM 860 870 880 890 900 910 800 810 820 830 840 850 pF1KSD -PQAAPPPPGS--PSLPGRLEDFLE----SSTGLPLLTSGHDGPEPLSLIDDLHSQMLSS : .. : :: :: ..:: ::. :.. .: : :. . ::.:::.::....:: CCDS32 APPVSLEPMGSLSASLENQLEAFLDGTLPSANEIPPLQSSSEDREPFSLIEDLQNDLLSH 920 930 940 950 960 970 860 870 880 890 900 910 pF1KSD TAILDHPPSPMDTSELHFVPEPSSTMGLDLADGHLDSMDWLELSSGGPVLSLAPLSTTAP ...::: :::.::: .:. . ..:::.:..::.:.::... . .:.::::::: CCDS32 SGMLDHSHSPMETSETQFAA-GTPCLSLDLSDSNLDNMEWLDITMPNSSSGLTPLSTTAP 980 990 1000 1010 1020 1030 920 930 pF1KSD SLFSTDFLDGHDLQLHWDSCL :.: CCDS32 SMFSADFLDPQDLPLPWD 1040 >>CCDS54091.1 MYOCD gene_id:93649|Hs108|chr17 (986 aa) initn: 1379 init1: 471 opt: 862 Z-score: 471.0 bits: 98.5 E(32554): 6.5e-20 Smith-Waterman score: 1637; 36.2% identity (61.6% similar) in 1005 aa overlap (1-926:39-976) 10 20 30 pF1KSD MPPLKSPAAFHEQRRSLERARTEDYLKRKI .:::: :: :::::. :. .... :::: CCDS54 SLLIRSKFRSVLQLRLQQRRTQEQLANQGIIPPLKRPAEFHEQRKHLDSDKAKNSLKRKA 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KSD RSRPERSELVRMHILEETSAEPSLQAKQLKLKRARLADDLNEKIAQRPGPMELVEKNILP :.: . ..:: ::::. ..:: :. . :.:::::::::::::::: ::::.::::::::: CCDS54 RNRCNSADLVNMHILQASTAERSIPTAQMKLKRARLADDLNEKIALRPGPLELVEKNILP 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 pF1KSD VESSLKEAIIVGQVNYPKVADSSSFDEDSS-DALSPEQPASHESQGSVPSPLEARVSEPL :.:..:::: .::.. : .:. .:.:::: :.:::.: :.. :.:. :: .:..:. CCDS54 VDSAVKEAIKGNQVSFSKSTDAFAFEEDSSSDGLSPDQTRSEDPQNSAGSPPDAKASDTP 130 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 200 pF1KSD LSATSASPTQVVSQLPMGRDSREMLFLAEQPPLPPPPLLPPSLTNGTTIPTAKSTPTLIK ... .. ...: :.. : :: . .: : ::: .. CCDS54 STGSLGTNQDLASGSENDRNDS-----ASQPSHQ-----SDAGKQGLGPP---STPIAVH 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KSD QS-QPKSASEKSQRSKKAKELKPKVKKLKYHQYIPPDQKQDRGAPPMDSSYAKILQQQQL . . :: .....: :: :. :::::::::::::::::: ... :::::.::..:::::: CCDS54 AAVKSKSLGDSKNRHKKPKDPKPKVKKLKYHQYIPPDQKAEKSPPPMDSAYARLLQQQQL 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KSD FLQLQILNQQQQQHHNYQAILPAPPKSAGEALGSSGTPPVRSLSTTNSSSSSGAPGPCGL :::::::.:::::... . : : .. : . . . ::::. . : . CCDS54 FLQLQILSQQQQQQQHRFSYL-------GMHQAQLKEPNEQMVRNPNSSSTPLSNTPLSP 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KSD ARQNSTSLTG----KPGALPANLDDMKVAELKQELKLRSLPVSGTKTELIERLRAYQD-Q .... .. :: ::: :: ::::.::.::.:.:..:.:::::::: :..::: .:: . CCDS54 VKNSFSGQTGVSSFKPGPLPPNLDDLKVSELRQQLRIRGLPVSGTKTALMDRLRPFQDCS 350 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 440 pF1KSD ISPVPGAPKAPAATSILHKAGEVV-VAFPAARLSTGPALVAAGLAPAEVVVATVASSGVV .:::. :... :.::.. .: : ... . : :.: CCDS54 GNPVPNF-------------GDITTVTFPVTP-NTLPNYQSSSSTSA-------LSNGFY 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KSD KFGSTGSTPPVSPTPSERSLLSTGDENSTPGDTFGEMVTSPLTQLTLQASPLQILVKEEG .::::.:.::.::. :. :. .: : :::.. .:: .. :. ::... ..: CCDS54 HFGSTSSSPPISPASSDLSV-----AGSLP-DTFND--ASP--SFGLHPSPVHVCTEE-- 450 460 470 480 490 510 520 530 540 550 pF1KSD PRAGSCCLSPGGR-AELEGRD--KDQMLQEKDKQIEALTRMLRQKQQLVERLKLQLEQEK . :. :. .::.: : ::.:: ::.: :. :: :.:.:. ::.:..::...: CCDS54 --SLMSSLNGGSVPSELDGLDSEKDKMLVEKQKVINELTWKLQQEQRQVEELRMQLQKQK 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 pF1KSD RAQQPAPAPAP-LGTPVKQENSFSSCQL-SQQPL------GPAHPFNPSLAAPATNHI-D : . : : :.. .:::.. ::: . :: :. . :: :. : . . . CCDS54 RNNCSEKKPLPFLAASIKQEEAVSSCPFASQVPVKRQSSSSECHP--PACEAAQLQPLGN 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KSD PCAVAPGPPSVVVKQEALQPEPEPVPAPQ-LLLGPQGPSLIKGVAPPTLITDSTGTH--- : . . :... :.:. : .: . .:: :: . : .. .:.:.. CCDS54 AHCVESSDQTNVLSSTFLSPQCSPQHSPLGAVKSPQHISLPPSPNNPHFLPSSSGAQGEG 620 630 640 650 660 670 670 680 690 700 pF1KSD ---------LVLTVTNKNADSPGLSSGSPQQPSSQP--------------GSPAP-APSA : :. :..: . : ::.. : .: :.: : .: . CCDS54 HRVSSPISSQVCTAQNSGAHDGHPPSFSPHSSSLHPPFSGAQADSSHGAGGNPCPKSPCV 680 690 700 710 720 730 710 720 730 740 pF1KSD QMDLE--HP---LQPLFGTPTSLLKK---------EPPGYEEAMSQQPKQQENGSSSQQM :. . : . : :. :. ..: .::.::.:..:: . :::: CCDS54 QQKMAGLHSSDKVGPKFSIPSPTFSKSSSAISEVTQPPSYEDAVKQQM------TRSQQM 740 750 760 770 780 750 760 770 780 790 800 pF1KSD DDLFDILIQSGEISADFKEPPSLPGKEKPSPKTVCGSPLAAQPSPSAELPQAA-----PP :.:.:.::.:::. :: .: : : :.. :: :. .::: . ::. : CCDS54 DELLDVLIESGEMPADAREDHSCLQKVPKIPRS-SRSPTAVLTKPSASFEQASSGSQIPF 790 800 810 820 830 840 810 820 830 840 850 pF1KSD PPGSPSLPGRLEDFLESSTGL------PLLTSGHDGPEPLSLIDDLHSQ----MLSSTAI : . . .:: .:.:.. : :: : . :. ...: . .. .... : CCDS54 DPYATDSDEHLEVLLNSQSPLGKMSDVTLLKIGSEEPHFDGIMDGFSGKAAEDLFNAHEI 850 860 870 880 890 900 860 870 880 890 900 910 pF1KSD LDHPPSPMDTSELHFVPEPSSTMGLDLA--DGHLDSMDWLELSSGGPVLSLAPLSTTAPS : : :::.: .: : .. ::.:. .. ..:.::.:. . . ... :.:..:: CCDS54 LPGPLSPMQT---QFSPSSVDSNGLQLSFTESPWETMEWLDLTPPNSTPGFSALTTSSPS 910 920 930 940 950 960 920 930 pF1KSD LFSTDFLDGHDLQLHWDSCL .:. :::: ::.:. CCDS54 IFNIDFLDVTDLNLNSSMDLHLQQW 970 980 >>CCDS11163.1 MYOCD gene_id:93649|Hs108|chr17 (938 aa) initn: 1379 init1: 471 opt: 653 Z-score: 360.9 bits: 78.1 E(32554): 8.8e-14 Smith-Waterman score: 1639; 36.7% identity (63.3% similar) in 966 aa overlap (1-926:39-928) 10 20 30 pF1KSD MPPLKSPAAFHEQRRSLERARTEDYLKRKI .:::: :: :::::. :. .... :::: CCDS11 SLLIRSKFRSVLQLRLQQRRTQEQLANQGIIPPLKRPAEFHEQRKHLDSDKAKNSLKRKA 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KSD RSRPERSELVRMHILEETSAEPSLQAKQLKLKRARLADDLNEKIAQRPGPMELVEKNILP :.: . ..:: ::::. ..:: :. . :.:::::::::::::::: ::::.::::::::: CCDS11 RNRCNSADLVNMHILQASTAERSIPTAQMKLKRARLADDLNEKIALRPGPLELVEKNILP 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 pF1KSD VESSLKEAIIVGQVNYPKVADSSSFDEDSS-DALSPEQPASHESQGSVPSPLEARVSEPL :.:..:::: .::.. : .:. .:.:::: :.:::.: :.. :.:. :: .:..:. CCDS11 VDSAVKEAIKGNQVSFSKSTDAFAFEEDSSSDGLSPDQTRSEDPQNSAGSPPDAKASDTP 130 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 200 pF1KSD LSATSASPTQVVSQLPMGRDSREMLFLAEQPPLPPPPLLPPSLTNGTTIPTAKSTPTLIK ... .. ...: :.. : :: . .: : ::: .. CCDS11 STGSLGTNQDLASGSENDRNDS-----ASQPSHQ-----SDAGKQGLGPP---STPIAVH 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KSD QS-QPKSASEKSQRSKKAKELKPKVKKLKYHQYIPPDQKQDRGAPPMDSSYAKILQQQQL . . :: .....: :: :. :::::::::::::::::: ... :::::.::..:::::: CCDS11 AAVKSKSLGDSKNRHKKPKDPKPKVKKLKYHQYIPPDQKAEKSPPPMDSAYARLLQQQQL 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KSD FLQLQILNQQQQQHHNYQAILPAPPKSAGEALGSSGTPPVRSLSTTNSSSSSGAPGPCGL :::::::.:::::... . : : .. : . . . ::::. . : . CCDS11 FLQLQILSQQQQQQQHRFSYL-------GMHQAQLKEPNEQMVRNPNSSSTPLSNTPLSP 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KSD ARQNSTSLTG----KPGALPANLDDMKVAELKQELKLRSLPVSGTKTELIERLRAYQD-Q .... .. :: ::: :: ::::.::.::.:.:..:.:::::::: :..::: .:: . CCDS11 VKNSFSGQTGVSSFKPGPLPPNLDDLKVSELRQQLRIRGLPVSGTKTALMDRLRPFQDCS 350 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 440 pF1KSD ISPVPGAPKAPAATSILHKAGEVV-VAFPAARLSTGPALVAAGLAPAEVVVATVASSGVV .:::. :... :.::.. .: : ... . : :.: CCDS11 GNPVPNF-------------GDITTVTFPVTP-NTLPNYQSSSSTSA-------LSNGFY 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KSD KFGSTGSTPPVSPTPSERSLLSTGDENSTPGDTFGEMVTSPLTQLTLQASPLQILVKEEG .::::.:.::.::. :. :. .: : :::.. .:: .. :. ::... ..: CCDS11 HFGSTSSSPPISPASSDLSV-----AGSLP-DTFND--ASP--SFGLHPSPVHVCTEE-- 450 460 470 480 490 510 520 530 540 550 pF1KSD PRAGSCCLSPGGR-AELEGRD--KDQMLQEKDKQIEALTRMLRQKQQLVERLKLQLEQEK . :. :. .::.: : ::.:: ::.: :. :: :.:.:. ::.:..::...: CCDS11 --SLMSSLNGGSVPSELDGLDSEKDKMLVEKQKVINELTWKLQQEQRQVEELRMQLQKQK 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 pF1KSD RAQQPAPAPAP-LGTPVKQENSFSSCQL-SQQPL------GPAHPFNPSLAAPATNHI-D : . : : :.. .:::.. ::: . :: :. . :: :. : . . . CCDS11 RNNCSEKKPLPFLAASIKQEEAVSSCPFASQVPVKRQSSSSECHP--PACEAAQLQPLGN 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KSD PCAVAPGPPSVVVKQEALQPEPEPVPAPQ-LLLGPQGPSLIKGVAPPTLITDSTGTHLVL : . . :... :.:. : .: . .:: :: . : .. .:.:.. CCDS11 AHCVESSDQTNVLSSTFLSPQCSPQHSPLGAVKSPQHISLPPSPNNPHFLPSSSGAQG-- 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KSD TVTNKNADSPGLSSGSPQQPSSQPGSPAPAPSAQMDLEHPLQPLFGTPTSLLKK--EPPG .. ..:: :. : .. .: .:. .. : .: :. .: ... .::. CCDS11 --EGHRVSSPISSQVCTAQMAGLHSSDKVGPKFSI----P-SPTFSKSSSAISEVTQPPS 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KSD YEEAMSQQPKQQENGSSSQQMDDLFDILIQSGEISADFKEPPSLPGKEKPSPKTVCGSPL ::.:..:: . :::::.:.:.::.:::. :: .: : : :.. :: CCDS11 YEDAVKQQM------TRSQQMDELLDVLIESGEMPADAREDHSCLQKVPKIPRS-SRSPT 730 740 750 760 770 790 800 810 820 830 pF1KSD AAQPSPSAELPQAA-----PPPPGSPSLPGRLEDFLESSTGL------PLLTSGHDGPEP :. .::: . ::. : : . . .:: .:.:.. : :: : . :. CCDS11 AVLTKPSASFEQASSGSQIPFDPYATDSDEHLEVLLNSQSPLGKMSDVTLLKIGSEEPHF 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KSD LSLIDDLHSQ----MLSSTAILDHPPSPMDTSELHFVPEPSSTMGLDLA--DGHLDSMDW ...: . .. .... :: : :::.: .: : .. ::.:. .. ..:.: CCDS11 DGIMDGFSGKAAEDLFNAHEILPGPLSPMQT---QFSPSSVDSNGLQLSFTESPWETMEW 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 pF1KSD LELSSGGPVLSLAPLSTTAPSLFSTDFLDGHDLQLHWDSCL :.:. . . ... :.:..::.:. :::: ::.:. CCDS11 LDLTPPNSTPGFSALTTSSPSIFNIDFLDVTDLNLNSSMDLHLQQW 900 910 920 930 931 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 06:17:13 2016 done: Thu Nov 3 06:17:14 2016 Total Scan time: 5.970 Total Display time: 0.370 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]