Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1441
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1441, 1237 aa
1>>>pF1KSDA1441 1237 - 1237 aa - 1237 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.5799+/-0.00105; mu= -13.6192+/- 0.062
mean_var=622.5431+/-144.916, 0's: 0 Z-trim(117.1): 73 B-trim: 854 in 1/52
Lambda= 0.051403
statistics sampled from 17710 (17773) to 17710 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.805), E-opt: 0.2 (0.546), width: 16
Scan time: 5.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS992.1 ZNF687 gene_id:57592|Hs108|chr1 (1237) 8587 652.9 1.4e-186
CCDS11969.1 ZNF532 gene_id:55205|Hs108|chr18 (1301) 1729 144.3 1.9e-33
>>CCDS992.1 ZNF687 gene_id:57592|Hs108|chr1 (1237 aa)
initn: 8587 init1: 8587 opt: 8587 Z-score: 3463.0 bits: 652.9 E(32554): 1.4e-186
Smith-Waterman score: 8587; 100.0% identity (100.0% similar) in 1237 aa overlap (1-1237:1-1237)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGDMKTPDFDDLLAAFDIPDIDANEAIHSGPEENEGPGGPGKPEPGVGSESEDTAAASAG
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CCDS99 MGDMKTPDFDDLLAAFDIPDIDANEAIHSGPEENEGPGGPGKPEPGVGSESEDTAAASAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DGPGVPAQASDHGLPPPDISVVSVIVKNTVCPEQSEALAGGSAGDGAQAAGVTKEGPVGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 DGPGVPAQASDHGLPPPDISVVSVIVKNTVCPEQSEALAGGSAGDGAQAAGVTKEGPVGP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HRMQNGFGSPEPSLPGTPHSPAPPSGGTWKEKGMEGKTPLDLFAHFGPEPGDHSDPLPPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 HRMQNGFGSPEPSLPGTPHSPAPPSGGTWKEKGMEGKTPLDLFAHFGPEPGDHSDPLPPS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD APSPTREGALTPPPFPSSFELAQENGPGMQPPVSSPPLGALKQESCSPHHPQVLAQQGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 APSPTREGALTPPPFPSSFELAQENGPGMQPPVSSPPLGALKQESCSPHHPQVLAQQGSG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SSPKATDIPASASPPPVAGVPFFKQSPGHQSPLASPKVPVCQPLKEEDDDEGPVDKSSPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 SSPKATDIPASASPPPVAGVPFFKQSPGHQSPLASPKVPVCQPLKEEDDDEGPVDKSSPG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SPQSPSSGAEAADEDSNDSPASSSSRPLKVRIKTIKTSCGNITRTVTQVPSDPDPPAPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 SPQSPSSGAEAADEDSNDSPASSSSRPLKVRIKTIKTSCGNITRTVTQVPSDPDPPAPLA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EGAFLAEASLLKLSPATPTSEGPKVVSVQLGDGTRLKGTVLPVATIQNASTAMLMAASVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 EGAFLAEASLLKLSPATPTSEGPKVVSVQLGDGTRLKGTVLPVATIQNASTAMLMAASVA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RKAVVLPGGTATSPKMIAKNVLGLVPQALPKADGRAGLGTGGQKVNGASVVMVQPSKTAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 RKAVVLPGGTATSPKMIAKNVLGLVPQALPKADGRAGLGTGGQKVNGASVVMVQPSKTAT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD GPSTGGGTVISRTQSSLVEAFNKILNSKNLLPAYRPNLSPPAEAGLALPPTGYRCLECGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 GPSTGGGTVISRTQSSLVEAFNKILNSKNLLPAYRPNLSPPAEAGLALPPTGYRCLECGD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD AFSLEKSLARHYDRRSMRIEVTCNHCARRLVFFNKCSLLLHAREHKDKGLVMQCSHLVMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 AFSLEKSLARHYDRRSMRIEVTCNHCARRLVFFNKCSLLLHAREHKDKGLVMQCSHLVMR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PVALDQMVGQPDITPLLPVAVPPVSGPLALPALGKGEGAITSSAITTVAAEAPVLPLSTE
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CCDS99 PVALDQMVGQPDITPLLPVAVPPVSGPLALPALGKGEGAITSSAITTVAAEAPVLPLSTE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PPAAPATSAYTCFRCLECKEQCRDKAGMAAHFQQLGPPAPGATSNVCPTCPMMLPNRCSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 PPAAPATSAYTCFRCLECKEQCRDKAGMAAHFQQLGPPAPGATSNVCPTCPMMLPNRCSF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SAHQRMHKNRPPHVCPECGGNFLQANFQTHLREACLHVSRRVGYRCPSCSVVFGGVNSIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 SAHQRMHKNRPPHVCPECGGNFLQANFQTHLREACLHVSRRVGYRCPSCSVVFGGVNSIK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD SHIQTSHCEVFHKCPICPMAFKSGPSAHAHLYSQHPSFQTQQAKLIYKCAMCDTVFTHKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 SHIQTSHCEVFHKCPICPMAFKSGPSAHAHLYSQHPSFQTQQAKLIYKCAMCDTVFTHKP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LLSSHFDQHLLPQRVSVFKCPSCPLLFAQKRTMLEHLKNTHQSGRLEETAGKGAGGALLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 LLSSHFDQHLLPQRVSVFKCPSCPLLFAQKRTMLEHLKNTHQSGRLEETAGKGAGGALLT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD PKTEPEELAVSQGGAAPATEESSSSSEEEEVPSSPEPPRPAKRPRRELGSKGLKGGGGGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 PKTEPEELAVSQGGAAPATEESSSSSEEEEVPSSPEPPRPAKRPRRELGSKGLKGGGGGP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD GGWTCGLCHSWFPERDEYVAHMKKEHGKSVKKFPCRLCERSFCSAPSLRRHVRVNHEGIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 GGWTCGLCHSWFPERDEYVAHMKKEHGKSVKKFPCRLCERSFCSAPSLRRHVRVNHEGIK
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD RVYPCRYCTEGKRTFSSRLILEKHVQVRHGLQLGAQSPGRGTTLARGSSARAQGPGRKRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 RVYPCRYCTEGKRTFSSRLILEKHVQVRHGLQLGAQSPGRGTTLARGSSARAQGPGRKRR
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD QSSDSCSEEPDSTTPPAKSPRGGPGSGGHGPLRYRSSSSTEQSLMMGLRVEDGAQQCLDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 QSSDSCSEEPDSTTPPAKSPRGGPGSGGHGPLRYRSSSSTEQSLMMGLRVEDGAQQCLDC
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD GLCFASPGSLSRHRFISHKKRRGVGKASALGLGDGEEEAPPSRSDPDGGDSPLPASGGPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 GLCFASPGSLSRHRFISHKKRRGVGKASALGLGDGEEEAPPSRSDPDGGDSPLPASGGPL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230
pF1KSD TCKVCGKSCDSPLNLKTHFRTHGMAFIRARQGAVGDN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 TCKVCGKSCDSPLNLKTHFRTHGMAFIRARQGAVGDN
1210 1220 1230
>>CCDS11969.1 ZNF532 gene_id:55205|Hs108|chr18 (1301 aa)
initn: 2365 init1: 839 opt: 1729 Z-score: 714.1 bits: 144.3 E(32554): 1.9e-33
Smith-Waterman score: 2387; 35.7% identity (61.7% similar) in 1321 aa overlap (3-1231:50-1295)
10 20 30
pF1KSD MGDMKTPDFDDLLAAFDIPDIDANEAIHSGPE
: ..:. .:. .. . .. .. ..: .
CCDS11 IPDMVDPKAAIESGHDDHESHMKQNAHGEDDSHAPSSSDVGVSVIVKNVRNIDSSEGGEK
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80
pF1KSD ENEGPGGPGKPE-----PGVGSESEDTAAASAGDGPGVPAQASDHGLPPPDISVVSVIVK
....: : : . .. : :.: : . :: :. . .: . ..: .: ..
CCDS11 DGHNPTGNGLHNGFLTASSLDSYSKDGAKSLKGDVPASEVTLKDSTFS--QFSPISS-AE
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KSD NTVCPEQSEALAGGSAGD---GAQAAGVTKEGPVGPHRMQNGFGSPEPSLPGTPHSPAPP
. :. :. . : . .. .: .: . ...:. . : : :
CCDS11 EFDDDEKIEVDDPPDKEDMRSSFRSNVLTGSAPQQDYDKLKALGGENSSKTGLSTSGNVE
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KSD SGGTWKEKGMEGKTPLDLFAHFGPEPGDHSDPLPPSAPSPTREGALTPPPFPSSFELAQE
.. . :.. .. :... : . .. : : :. . .. .: .:..:
CCDS11 KNKAVKRETEASSINLSVYEPFKVRKAE--DKLKESSDKVLENRVLDG-------KLSSE
200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KSD NGPGMQPPVS-SPPLGALKQESCSPHHPQVLAQQGSGSSPKATDIPASASPPPVAGVPFF
.. : :. : .. : :: . :......: : :.. : . :.
CCDS11 KNDTSLPSVAPSKTKSSSKLSSCIAAIAALSAKKAASDSCKE---PVANSRE---SSPLP
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KSD KQSPGHQSPLASPKVPVCQPLKEEDDDEGPVDKSSPGSPQSPSSGAEAADEDSNDSPASS
:. ..:: :. : : : : : . : :. : ::.: :: : ... : .:::.:
CCDS11 KEV--NDSPRAADKSPESQNLI--DGTKKPSLKQ-PDSPRSISS--ENSSKGSPSSPAGS
310 320 330 340 350
330 340 350
pF1KSD SSRPLKVRIKTIKTSCGNITRTVTQV-----------PSD---------------P----
. :::::::::: :.: ::::.: ::. :
CCDS11 TPAIPKVRIKTIKTSSGEIKRTVTRVLPEVDLDSGKKPSEQTASVMASVTSLLSSPASAA
360 370 380 390 400 410
360 370 380 390
pF1KSD ---DPP-APLAEGAFLAEASLLKLSP--------AT---PTSE----GPKVVSVQLGDGT
.:: ::: .. .: .:.: :: :.: : .:....:...:
CCDS11 VLSSPPRAPLQSAVVTNAVSPAELTPKQVTIKPVATAFLPVSAVKTAGSQVINLKLANNT
420 430 440 450 460 470
400 410 420 430 440
pF1KSD RLKGTVLPVATIQNASTAMLMAAS-VARKAVVLPGGTATSPKMIAKNV----LGLVPQ-A
.:.::. .:..:.::.:.. ::. . ...::.:... .. :.. :.: :.:.:: :
CCDS11 TVKATVISAASVQSASSAIIKAANAIQQQTVVVPASSLANAKLVPKTVHLANLNLLPQGA
480 490 500 510 520 530
450 460 470 480 490 500
pF1KSD LPKADGRAGLGTGGQKVNGASV--VMVQPSKTATGPSTGGGTVISRTQSSLVEAFNKILN
.. : : :... : . . :: : .. . :.: :::.::::::.:.
CCDS11 QATSELRQVLTKPQQQIKQAIINAAASQPPKKVSRVQ-----VVSSLQSSVVEAFNKVLS
540 550 560 570 580
510 520 530 540 550 560
pF1KSD SKNLLPAYRPNLSPPAEAGLALPPTGYRCLECGDAFSLEKSLARHYDRRSMRIEVTCNHC
: : .:.: :::::::.::..:: ::.::::::.:.:::::..::::::.:::::::::
CCDS11 SVNPVPVYIPNLSPPANAGITLPTRGYKCLECGDSFALEKSLTQHYDRRSVRIEVTCNHC
590 600 610 620 630 640
570 580 590 600 610 620
pF1KSD ARRLVFFNKCSLLLHAREHKDKGLVMQCSHLVMRPVALDQMVGQPDI---TPLLPVAVPP
.. :::.:::::: ::: ::.::.:::::::...:: :::. .:. : . :
CCDS11 TKNLVFYNKCSLLSHARGHKEKGVVMQCSHLILKPVPADQMIVSPSSNTSTSTSTLQSPV
650 660 670 680 690 700
630 640 650 660 670 680
pF1KSD VSGPLALPALGKG-EGAITSSAITTVAAEAPVLPLSTEPPAAPATSAYTCFRCLECKEQC
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CCDS11 GAGTHTVTKIQSGITGTVISAPSSTPI--TPAMPLDEDPSKLCRHS----LKCLECNEVF
710 720 730 740 750 760
690 700 710 720 730 740
pF1KSD RDKAGMAAHFQQLGPPAPGATSNVCPTCPMMLPNRCSFSAHQRMHKNRPPHVCPECGGNF
.:....:.:::: : . ...: : :.:::.::...:::.:... :..:::::.
CCDS11 QDETSLATHFQQ---AADTSGQKTCTICQMLLPNQCSYASHQRIHQHKSPYTCPECGAIC
770 780 790 800 810 820
750 760 770 780 790 800
pF1KSD LQANFQTHLREACLHVSRRVGYRCPSCSVVFGGVNSIKSHIQTSHCEVFHKCPICPMAFK
...::::. . ::: .::::.:: :.::.. : ..::::: ::::::.::::::::::
CCDS11 RSVHFQTHVTKNCLHYTRRVGFRCVHCNVVYSDVAALKSHIQGSHCEVFYKCPICPMAFK
830 840 850 860 870 880
810 820 830 840 850 860
pF1KSD SGPSAHAHLYSQHPSFQTQQAKLIYKCAMCDTVFTHKPLLSSHFDQHLLPQRVSVFKCPS
:.::.:.: :.:::... . :.::::.::::::: . :: :::::. :.:::::::.
CCDS11 SAPSTHSHAYTQHPGIKIGEPKIIYKCSMCDTVFTLQTLLYRHFDQHIENQKVSVFKCPD
890 900 910 920 930 940
870 880 890 900 910 920
pF1KSD CPLLFAQKRTMLEHLKNTHQSGRLEETAGKGAGGALLTPKTEPEELAVSQGGAAPATEES
: ::.:::. :..:.:. : : :. : : : . .: ..:..: :..
CCDS11 CSLLYAQKQLMMDHIKSMH--GTLKSIEGPPNLGINLPLSIKP----ATQNSANQNKEDT
950 960 970 980 990
930 940 950 960 970 980
pF1KSD SSSSEEEEVPSSPEPPRPAKRPRRELGSKGLKGGGGGPGGWTCGLCHSWFPERDEYVAHM
.: . .:.. . . : :.:. . .: . ..:: ::: : : .:: :..:.
CCDS11 KSMNGKEKLEK--KSPSPVKK---SMETKKV----ASPG-WTCWECDCLFMQRDVYISHV
1000 1010 1020 1030 1040
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KSD KKEHGKSVKKFPCRLCERSFCSAPSLRRHVRVNHEGIKRVYPCRYCTEGKRTFSSRLILE
.:::::..:: ::: :..:: :. :: :: :..:.::..:: : .: ...:::..::.::
CCDS11 RKEHGKQMKKHPCRQCDKSFSSSHSLCRHNRIKHKGIRKVYACSHCPDSRRTFTKRLMLE
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KSD KHVQVRHGLQLGAQSPGRGTTLARGSSAR--AQGPGRKRRQSSDSCSEEPDSTTPPAKSP
::::. ::.. . .: . . . .. :. ::. ::: : :
CCDS11 KHVQLMHGIKDPDLKEMTDATNEEETEIKEDTKVPSPKRKL------EEPVLEFRP---P
1110 1120 1130 1140 1150
1110 1120 1130 1140
pF1KSD RGGPGSGGHGPLR------YRSSS------STEQSLMMGLRVE----DGAQ-QCLDCGLC
::. . ::. .. . .::. :.. .. ::.. :: .::::
CCDS11 RGAITQ----PLKKLKINVFKVHKCAVCGFTTENLLQFHEHIPQHKSDGSSYQCRECGLC
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD FASPGSLSRHRFISHKKRRGVGKASALGLG-DGEEEAPPSRSD--PDGGDSPLPASGGPL
..: ::::: :: :: .. .. : : :...: ::. : :::. :
CCDS11 YTSHVSLSRHLFIVHKLKEPQPVSKQNGAGEDNQQENKPSHEDESPDGAVSDRK------
1220 1230 1240 1250 1260
1210 1220 1230
pF1KSD TCKVCGKSCDSPLNLKTHFRTHGMAFIRARQGAVGDN
::::.:. .. :.::.::::::::....
CCDS11 -CKVCAKTFETEAALNTHMRTHGMAFIKSKRMSSAEK
1270 1280 1290 1300
1237 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 06:19:17 2016 done: Thu Nov 3 06:19:18 2016
Total Scan time: 5.380 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]