Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1473
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1473, 531 aa
1>>>pF1KSDA1473 531 - 531 aa - 531 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2702+/-0.00111; mu= 17.2894+/- 0.069
mean_var=374.6155+/-75.216, 0's: 0 Z-trim(107.4): 2058 B-trim: 103 in 2/47
Lambda= 0.066265
statistics sampled from 13147 (15433) to 13147 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.449), E-opt: 0.2 (0.181), width: 16
Scan time: 7.470
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011526007 (OMIM: 603980) PREDICTED: zinc finger ( 531) 3635 363.5 9.1e-100
NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 ( 572) 3635 363.6 9.4e-100
XP_016881605 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2668 271.0 6e-72
NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 2669 271.2 6e-72
NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 73 ( 536) 2668 271.1 6.1e-72
NP_001303925 (OMIM: 606957) zinc finger protein 25 ( 531) 2654 269.7 1.5e-71
NP_258429 (OMIM: 606957) zinc finger protein 257 i ( 563) 2654 269.8 1.6e-71
XP_016883005 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2649 269.4 2.3e-71
NP_001265606 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2649 269.4 2.3e-71
XP_011526746 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2649 269.4 2.3e-71
NP_001265591 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2649 269.4 2.3e-71
XP_016883004 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2649 269.4 2.3e-71
XP_016883003 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2649 269.4 2.3e-71
XP_011526745 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2649 269.4 2.3e-71
NP_001265590 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2649 269.4 2.3e-71
NP_975011 (OMIM: 604768) zinc finger protein 254 i ( 659) 2649 269.4 2.4e-71
NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 2629 267.5 8.7e-71
XP_011525901 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 2625 267.0 1.1e-70
XP_006722660 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 2625 267.0 1.1e-70
XP_011525900 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 2622 266.7 1.3e-70
XP_005259754 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 2622 266.7 1.3e-70
NP_689839 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 is ( 586) 2604 265.0 4.4e-70
XP_011526567 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2589 264.1 1.6e-69
XP_016882724 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2589 264.1 1.6e-69
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 2589 264.2 1.6e-69
XP_016867185 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2536 258.4 3.8e-68
XP_016867186 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2536 258.4 3.8e-68
XP_016867178 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2536 258.4 3.8e-68
XP_016867187 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2536 258.4 3.8e-68
XP_016867179 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2536 258.4 3.8e-68
XP_016867183 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2536 258.4 3.8e-68
XP_016867181 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2536 258.4 3.8e-68
XP_016867180 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2536 258.4 3.8e-68
XP_016867184 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2536 258.4 3.8e-68
XP_016867182 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2536 258.4 3.8e-68
NP_066971 (OMIM: 604756) zinc finger protein 273 [ ( 569) 2536 258.5 4e-68
XP_016867177 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 569) 2536 258.5 4e-68
NP_775802 (OMIM: 603982) zinc finger protein 100 [ ( 542) 2522 257.1 9.8e-68
NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 852) 2508 256.2 3e-67
XP_016882705 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2487 254.1 1.2e-66
XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2487 254.1 1.2e-66
XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2487 254.1 1.2e-66
XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2487 254.1 1.2e-66
XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2487 254.1 1.2e-66
NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2487 254.1 1.2e-66
NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2487 254.1 1.2e-66
XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2487 254.1 1.2e-66
XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2487 254.1 1.2e-66
XP_011526561 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2487 254.1 1.2e-66
XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2487 254.1 1.2e-66
>>XP_011526007 (OMIM: 603980) PREDICTED: zinc finger pro (531 aa)
initn: 3635 init1: 3635 opt: 3635 Z-score: 1912.1 bits: 363.5 E(85289): 9.1e-100
Smith-Waterman score: 3635; 97.9% identity (98.7% similar) in 531 aa overlap (1-531:1-531)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLENYRNLVFVGIAASKPDLITCLEQGKEPWNVKRHEMVAEPPVVCSYFARDLWPKQGKK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: ::::.:::::::::
XP_011 MLENYRNLVFVGIAASKPDLITCLEQGKEPWNVKRHEMVTEPPVVYSYFAQDLWPKQGKK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NYFQKVILRRYKKCGCENLQLRKYCKSMDECKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQCDKYVK
::::::::: ::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
XP_011 NYFQKVILRTYKKCGRENLQLRKYCKSMDECKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQYDKYVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VFHKFSNSNRHTIRHTGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNE
::::::::::: : ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VFHKFSNSNRHKIGHTGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TSNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANL
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IIHTGEKFYKCEECGKAFSQLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHA
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IIHTGEKFYKCEECGKAFSRLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD YKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKYEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCE
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KSD ECGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ECGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
490 500 510 520 530
>>NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 [Ho (572 aa)
initn: 3635 init1: 3635 opt: 3635 Z-score: 1911.9 bits: 363.6 E(85289): 9.4e-100
Smith-Waterman score: 3635; 97.9% identity (98.7% similar) in 531 aa overlap (1-531:42-572)
10 20 30
pF1KSD MLENYRNLVFVGIAASKPDLITCLEQGKEP
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLTFRDVALEFSLEEWQCLDTAQQNLYRNVMLENYRNLVFVGIAASKPDLITCLEQGKEP
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KSD WNVKRHEMVAEPPVVCSYFARDLWPKQGKKNYFQKVILRRYKKCGCENLQLRKYCKSMDE
:::::::::.::::: ::::.:::::::::::::::::: ::::: ::::::::::::::
NP_001 WNVKRHEMVTEPPVVYSYFAQDLWPKQGKKNYFQKVILRTYKKCGRENLQLRKYCKSMDE
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KSD CKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQCDKYVKVFHKFSNSNRHTIRHTGKKSFKCKECEKSF
:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::: : ::::::::::::::::
NP_001 CKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQYDKYVKVFHKFSNSNRHKIGHTGKKSFKCKECEKSF
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KSD CMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNETSNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLS
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNEASNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLS
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KSD HLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTA
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KSD HKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGEKFYKCEECGKAFSQLSHLTTHKRI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
NP_001 HKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGEKFYKCEECGKAFSRLSHLTTHKRI
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KSD HSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHAGEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHAGEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGE
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KSD KPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYK
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KSD YEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCEECGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCEECGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESC
500 510 520 530 540 550
520 530
pF1KSD NNACDNIAKISKYKRNCAGEK
:::::::::::::::::::::
NP_001 NNACDNIAKISKYKRNCAGEK
560 570
>>XP_016881605 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger pro (504 aa)
initn: 2668 init1: 2668 opt: 2668 Z-score: 1412.7 bits: 271.0 E(85289): 6e-72
Smith-Waterman score: 2668; 75.2% identity (89.7% similar) in 504 aa overlap (1-504:1-504)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLENYRNLVFVGIAASKPDLITCLEQGKEPWNVKRHEMVAEPPVVCSYFARDLWPKQGKK
::::::::::.::..:::::::::::::.: ..:.:::::.: :.::.:::::::.:. :
XP_016 MLENYRNLVFLGIVVSKPDLITCLEQGKKPLTMKKHEMVANPSVTCSHFARDLWPEQSIK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NYFQKVILRRYKKCGCENLQLRKYCKSMDECKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQCDKYVK
. :::: ::::.. : .:::..: :.:.:::::::. :::::: :::::.::::::::::
XP_016 DSFQKVTLRRYENYGHDNLQFKKGCESVDECKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIFQCDKYVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VFHKFSNSNRHTIRHTGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNE
:.::::::::: ::::::: ::: :: :.: . : :. ::.::.::::.::.:::::.:
XP_016 VIHKFSNSNRHKIRHTGKKPFKCIECGKAFNQSSTLTTHKKIHTGEKPFKCEECGKAFNW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TSNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANL
.:.:.::::::::.: ::::.:::::.:.:.::.:::::.:.::::::::::::..:.::
XP_016 SSHLTTHKRIHTGEKRYKCEDCGKAFSRFSYLTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKRSSNL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHK
:::: ::::::::::::::.::..:: ::::::::.::::::::::::::.. :.:::::
XP_016 TTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSILTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKHPSVLTTHK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IIHTGEKFYKCEECGKAFSQLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHA
:::::: :::::::.::. .: ::::: :::::::::::::::::. :: ::::::::.
XP_016 RIHTGEKPYKCEECGRAFKYFSSLTTHKIIHSGEKPYKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKP
::: :::: :..::. : ::::: ::::..:.:::::::::. : ::::: :::::::
XP_016 GEKPYKCEECGEAFKYSSSLTTHKIIHTGQQPFKCEECGKAFKCFSILTTHKRIHTGEKP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD YKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKYEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCE
:::::::::::.:: :. :: ::::::::: :.:::::..: :: :: :::::::::::
XP_016 YKCEECGKAFNSSSHLTAHKRIHTGEKPYKCERCGKAFKRSFILTRHKRIHTGEKPYKCE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KSD ECGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
::::.:. : :. ::.:::::::
XP_016 ECGKGFKCPSTLTTHKVIHTGEKL
490 500
>>NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 isofor (595 aa)
initn: 2462 init1: 2462 opt: 2669 Z-score: 1412.7 bits: 271.2 E(85289): 6e-72
Smith-Waterman score: 2722; 70.2% identity (84.3% similar) in 560 aa overlap (1-531:33-592)
10 20 30
pF1KSD MLENYRNLVFVGIAASKPDLITCLEQGKEP
::::::::::.::..::::::::::::::
NP_003 PLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGITVSKPDLITCLEQGKEA
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80
pF1KSD WNVKRHE-MVAEPPVVCSYFARDLWPKQGKKNYFQKVILRRYKKCGCENLQLRKYCKSMD
:..:::: :::.: :.::.::.::::.:. :. :::: :.:: :: ::: ::: :.:::
NP_003 WSMKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMD
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KSD ECKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQCDKYVKVFHKFSNSNRHTIRHTGKKSFKCKECEKS
:::.:: ::::::::.::.::::::::::: ::::::::: :::: :: ::: .: ::
NP_003 ECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKS
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180
pF1KSD F----CMLSH------------------------LAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNET
: :. : :..:::::.:::::::.:::::.:..
NP_003 FGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQS
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANLT
::: ::.::::.::::::::::.:::.: ::::::::::.:::::.:::::::.:..::
NP_003 SNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLT
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KSD THKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKI
::..::::::::::::::.::.:::.::.:::::.:::::::..:::::.::. ::::..
NP_003 THRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEV
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IHTGEKFYKCEECGKAFSQLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHAG
:::::: ::::.:::::...::::::: ::.:::::::.:::::::.::::: :: ::.:
NP_003 IHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTG
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKPY
:: :::. : :::.. :.:: ::.::::::::.::.:::::: ::.:: :: :: ::::
NP_003 EKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPY
430 440 450 460 470 480
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKYEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCEE
:::::::.:. :::. ::.::::::::: :::::::::::.:: :: :::::::: :::
NP_003 KCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEE
490 500 510 520 530 540
490 500 510 520 530
pF1KSD CGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
::::::.:: :..:: :::::: :: : :..: . ..:.: .:::
NP_003 CGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
550 560 570 580 590
>>NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 737 [H (536 aa)
initn: 2668 init1: 2668 opt: 2668 Z-score: 1412.5 bits: 271.1 E(85289): 6.1e-72
Smith-Waterman score: 2668; 75.2% identity (89.7% similar) in 504 aa overlap (1-504:33-536)
10 20 30
pF1KSD MLENYRNLVFVGIAASKPDLITCLEQGKEP
::::::::::.::..:::::::::::::.:
NP_001 PLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGIVVSKPDLITCLEQGKKP
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD WNVKRHEMVAEPPVVCSYFARDLWPKQGKKNYFQKVILRRYKKCGCENLQLRKYCKSMDE
..:.:::::.: :.::.:::::::.:. :. :::: ::::.. : .:::..: :.:.::
NP_001 LTMKKHEMVANPSVTCSHFARDLWPEQSIKDSFQKVTLRRYENYGHDNLQFKKGCESVDE
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD CKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQCDKYVKVFHKFSNSNRHTIRHTGKKSFKCKECEKSF
:::::. :::::: :::::.:::::::::::.::::::::: ::::::: ::: :: :.:
NP_001 CKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIFQCDKYVKVIHKFSNSNRHKIRHTGKKPFKCIECGKAF
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD CMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNETSNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLS
. : :. ::.::.::::.::.:::::.: .:.:.::::::::.: ::::.:::::.:.:
NP_001 NQSSTLTTHKKIHTGEKPFKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKRYKCEDCGKAFSRFS
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KSD HLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTA
.::.:::::.:.::::::::::::..:.:::::: ::::::::::::::.::..:: :::
NP_001 YLTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKRSSNLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSILTA
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KSD HKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGEKFYKCEECGKAFSQLSHLTTHKRI
:::::.::::::::::::::.. :.::::: :::::: :::::::.::. .: ::::: :
NP_001 HKIIHSGEKPYKCEECGKAFKHPSVLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFKYFSSLTTHKII
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KSD HSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHAGEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGE
::::::::::::::::. :: ::::::::.::: :::: :..::. : ::::: ::::.
NP_001 HSGEKPYKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGEAFKYSSSLTTHKIIHTGQ
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KSD KPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYK
.:.:::::::::. : ::::: ::::::::::::::::::.:: :. :: :::::::::
NP_001 QPFKCEECGKAFKCFSILTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNSSSHLTAHKRIHTGEKPYK
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KSD YEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCEECGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESC
:.:::::..: :: :: :::::::::::::::.:. : :. ::.:::::::
NP_001 CERCGKAFKRSFILTRHKRIHTGEKPYKCEECGKGFKCPSTLTTHKVIHTGEKL
490 500 510 520 530
520 530
pF1KSD NNACDNIAKISKYKRNCAGEK
>>NP_001303925 (OMIM: 606957) zinc finger protein 257 is (531 aa)
initn: 5103 init1: 1383 opt: 2654 Z-score: 1405.3 bits: 269.7 E(85289): 1.5e-71
Smith-Waterman score: 2654; 72.2% identity (85.8% similar) in 529 aa overlap (1-523:1-529)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLENYRNLVFVGIAASKPDLITCLEQGKEPWNVKRHEMVAEPPVVCSYFARDLWPKQGKK
::::::::::.:::.::::::::::::::: :.:::::::.:::.::..:.:: :.. :
NP_001 MLENYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQGKEPCNMKRHEMVAKPPVMCSHIAEDLCPERDIK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NYFQKVILRRYKKCGCENLQLRKYCKSMDECKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQCDKYVK
.::::::::: :: ::::::: :::.::::: : :::::::: :::.:..:::::::
NP_001 YFFQKVILRRYDKCEHENLQLRKGCKSVDECKVCKGGYNGLNQCLITTQSKMYQCDKYVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VFHKFSNSNRHTIRHTGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNE
::.:::::.:: :::: ::. ::::: :::::::.:..::::: :. .::.:::::.:.
NP_001 VFYKFSNSDRHKIRHTEKKTCKCKECGKSFCMLSQLTRHKRIHIRENSHKCEECGKAFNQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TSNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANL
.: :. :: :::.:::::::::::::: :::: ::.::: .:::::::::::::.:...
NP_001 SSALTRHKMTHTGEKPYKCEECGKAFNRSSHLTQHKVIHTREKPYKCEECGKAFNRSSHI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KSD TTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSS---TLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLT
: :::::. :::.: .:: .::. :: ::: :: ::.::::::::::::::.:::.::
NP_001 TQHKRIHNREKPFKYDECCKAFKWSSALTTLTQHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSALT
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD THKIIHTGEKFYKCEECGKAFSQLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKR
::.:::::: ..::::::::.. :::: :: ::. :::::::::::::..:: :: :::
NP_001 RHKMIHTGEKPFQCEECGKAFNRSSHLTQHKIIHTKEKPYKCEECGKAFNRSSHLTKHKR
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD IHAGEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTT---HKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKII
::. :: :::. :::. : ::: :: :::::::::::::::::: :: : ::::
NP_001 IHTREKAYKCDEYCKAFNWSSALTTLTQHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSYLIRHKII
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD HTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKYEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGE
:::::::::::::::::::: :..::.::::::::: ::::::::.::::. ::.:::::
NP_001 HTGEKPYKCEECGKAFNQSSHLTQHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSHLSQHKIIHTGE
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD KPYKCEECGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
:::::::::: :: : :. :: ::.::. : : :..::.. ....:.
NP_001 KPYKCEECGKPFNRFSYLTVHKRIHAGENPNKYEECGKACNHSSNLTKHNS
490 500 510 520 530
>>NP_258429 (OMIM: 606957) zinc finger protein 257 isofo (563 aa)
initn: 3636 init1: 1383 opt: 2654 Z-score: 1405.1 bits: 269.8 E(85289): 1.6e-71
Smith-Waterman score: 2654; 72.2% identity (85.8% similar) in 529 aa overlap (1-523:33-561)
10 20 30
pF1KSD MLENYRNLVFVGIAASKPDLITCLEQGKEP
::::::::::.:::.:::::::::::::::
NP_258 PLTIRDVTVEFSLEEWHCLDTAQQNLYRDVMLENYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQGKEP
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD WNVKRHEMVAEPPVVCSYFARDLWPKQGKKNYFQKVILRRYKKCGCENLQLRKYCKSMDE
:.:::::::.:::.::..:.:: :.. : .::::::::: :: ::::::: :::.::
NP_258 CNMKRHEMVAKPPVMCSHIAEDLCPERDIKYFFQKVILRRYDKCEHENLQLRKGCKSVDE
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD CKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQCDKYVKVFHKFSNSNRHTIRHTGKKSFKCKECEKSF
::: : :::::::: :::.:..:::::::::.:::::.:: :::: ::. ::::: :::
NP_258 CKVCKGGYNGLNQCLITTQSKMYQCDKYVKVFYKFSNSDRHKIRHTEKKTCKCKECGKSF
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD CMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNETSNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLS
::::.:..::::: :. .::.:::::.:..: :. :: :::.:::::::::::::: :
NP_258 CMLSQLTRHKRIHIRENSHKCEECGKAFNQSSALTRHKMTHTGEKPYKCEECGKAFNRSS
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KSD HLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSS---T
::: ::.::: .:::::::::::::.:...: :::::. :::.: .:: .::. :: :
NP_258 HLTQHKVIHTREKPYKCEECGKAFNRSSHITQHKRIHNREKPFKYDECCKAFKWSSALTT
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KSD LTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGEKFYKCEECGKAFSQLSHLTTH
:: :: ::.::::::::::::::.:::.:: ::.:::::: ..::::::::.. :::: :
NP_258 LTQHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSALTRHKMIHTGEKPFQCEECGKAFNRSSHLTQH
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KSD KRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHAGEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTT---HK
: ::. :::::::::::::..:: :: :::::. :: :::. :::. : ::: ::
NP_258 KIIHTKEKPYKCEECGKAFNRSSHLTKHKRIHTREKAYKCDEYCKAFNWSSALTTLTQHK
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KSD RIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHT
:::::::::::::::::: :: : :::::::::::::::::::::::: :..::.:::
NP_258 IIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSYLIRHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSHLTQHKIIHT
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KSD GEKPYKYEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCEECGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKL
:::::: ::::::::.::::. ::.::::::::::::::: :: : :. :: ::.::.
NP_258 GEKPYKCEECGKAFNRSSHLSQHKIIHTGEKPYKCEECGKPFNRFSYLTVHKRIHAGENP
490 500 510 520 530 540
510 520 530
pF1KSD YKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
: : :..::.. ....:.
NP_258 NKYEECGKACNHSSNLTKHNS
550 560
>>XP_016883005 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger pro (618 aa)
initn: 2649 init1: 2649 opt: 2649 Z-score: 1402.2 bits: 269.4 E(85289): 2.3e-71
Smith-Waterman score: 2649; 72.9% identity (86.4% similar) in 531 aa overlap (1-531:1-531)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLENYRNLVFVGIAASKPDLITCLEQGKEPWNVKRHEMVAEPPVVCSYFARDLWPKQGKK
::::::::.:.:::.:::::::::::::::::.:::::: ::: .: .::.::::.:: .
XP_016 MLENYRNLAFLGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHEMVDEPPGMCPHFAQDLWPEQGME
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NYFQKVILRRYKKCGCENLQLRKYCKSMDECKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQCDKYVK
. :::.::::: : : ::::::: :::.:: ::.:: :::::::.::.:.:.::::::.:
XP_016 DSFQKAILRRYGKYGHENLQLRKGCKSVDEYKVNKEGYNGLNQCFTTAQSKVFQCDKYLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VFHKFSNSNRHTIRHTGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNE
::.:: :::: :::: :::::::. : :::::: .::: :. :: ::::::::..:
XP_016 VFYKFLNSNRPKIRHTEKKSFKCKKRVKLFCMLSHKTQHKSIYHREKSYKCKECGKTFNW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TSNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANL
.:.:..:..:.: .::::::: .:. ..:: ::::.:::.:.: :::::::.:::.:.::
XP_016 SSTLTNHRKIYTEEKPYKCEEYNKSPKQLSTLTTHEIIHAGEKLYKCEECGEAFNRSSNL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHK
:::: ::::::::::::::.:: ::::: :: ::. .:::::::::::: ::::: ::
XP_016 TTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFIWSSTLTEHKKIHTRKKPYKCEECGKAFIWSSTLTRHK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IIHTGEKFYKCEECGKAFSQLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHA
.::::: :::::::::::: : ::::: ::.::: ::: :::::::: ::::::: ::.
XP_016 RMHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGEKRYKCLECGKAFKQLSTLTTHKIIHV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKP
:::.:::: :.:.:.: :.::::: ::::::::::::::::: :: :: :: ::: :::
XP_016 GEKLYKCEECGKGFNRSSNLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFIWSSTLTKHKRIHTREKP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD YKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKYEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCE
:::::::::: ::::..:: .:::::::: :::::.:.::: :::::.:::::::::::
XP_016 YKCEECGKAFIWSSTLTRHKRMHTGEKPYKCEECGKSFSQSSTLTTHKIIHTGEKPYKCE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KSD ECGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
::::::: :: :..::.::: :: :: :.:..: . . ....:: .:::
XP_016 ECGKAFNWSSTLTKHKIIHTEEKPYKCEKCGKAFKQSSILTNHKRIHTGEKPYKCEECGK
490 500 510 520 530 540
XP_016 SFNRSSTFTKHKVIHTGVKPYKCEECGKAFFWSSTLTKHKRIHTGEQPYKWEKFGKAFNR
550 560 570 580 590 600
>--
initn: 1492 init1: 432 opt: 432 Z-score: 256.8 bits: 57.4 E(85289): 1.5e-07
Smith-Waterman score: 432; 76.2% identity (87.5% similar) in 80 aa overlap (392-471:532-611)
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKPY
:::::::::.:: :: .: ::.:::: :::
XP_016 EKPYKCEKCGKAFKQSSILTNHKRIHTGEKPYKCEECGKSFNRSSTFTKHKVIHTGVKPY
510 520 530 540 550 560
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKYEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCEE
::::::::: ::::.::: :::::.:::.:. :::::.:::::: :. :
XP_016 KCEECGKAFFWSSTLTKHKRIHTGEQPYKWEKFGKAFNRSSHLTTDKITHWREILQV
570 580 590 600 610
490 500 510 520 530
pF1KSD CGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
>>NP_001265606 (OMIM: 604768) zinc finger protein 254 is (618 aa)
initn: 2649 init1: 2649 opt: 2649 Z-score: 1402.2 bits: 269.4 E(85289): 2.3e-71
Smith-Waterman score: 2649; 72.9% identity (86.4% similar) in 531 aa overlap (1-531:1-531)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLENYRNLVFVGIAASKPDLITCLEQGKEPWNVKRHEMVAEPPVVCSYFARDLWPKQGKK
::::::::.:.:::.:::::::::::::::::.:::::: ::: .: .::.::::.:: .
NP_001 MLENYRNLAFLGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHEMVDEPPGMCPHFAQDLWPEQGME
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NYFQKVILRRYKKCGCENLQLRKYCKSMDECKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQCDKYVK
. :::.::::: : : ::::::: :::.:: ::.:: :::::::.::.:.:.::::::.:
NP_001 DSFQKAILRRYGKYGHENLQLRKGCKSVDEYKVNKEGYNGLNQCFTTAQSKVFQCDKYLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VFHKFSNSNRHTIRHTGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNE
::.:: :::: :::: :::::::. : :::::: .::: :. :: ::::::::..:
NP_001 VFYKFLNSNRPKIRHTEKKSFKCKKRVKLFCMLSHKTQHKSIYHREKSYKCKECGKTFNW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TSNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANL
.:.:..:..:.: .::::::: .:. ..:: ::::.:::.:.: :::::::.:::.:.::
NP_001 SSTLTNHRKIYTEEKPYKCEEYNKSPKQLSTLTTHEIIHAGEKLYKCEECGEAFNRSSNL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHK
:::: ::::::::::::::.:: ::::: :: ::. .:::::::::::: ::::: ::
NP_001 TTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFIWSSTLTEHKKIHTRKKPYKCEECGKAFIWSSTLTRHK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IIHTGEKFYKCEECGKAFSQLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHA
.::::: :::::::::::: : ::::: ::.::: ::: :::::::: ::::::: ::.
NP_001 RMHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGEKRYKCLECGKAFKQLSTLTTHKIIHV
310 320 330 340 350 360
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pF1KSD GEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKP
:::.:::: :.:.:.: :.::::: ::::::::::::::::: :: :: :: ::: :::
NP_001 GEKLYKCEECGKGFNRSSNLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFIWSSTLTKHKRIHTREKP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD YKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKYEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCE
:::::::::: ::::..:: .:::::::: :::::.:.::: :::::.:::::::::::
NP_001 YKCEECGKAFIWSSTLTRHKRMHTGEKPYKCEECGKSFSQSSTLTTHKIIHTGEKPYKCE
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pF1KSD ECGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
::::::: :: :..::.::: :: :: :.:..: . . ....:: .:::
NP_001 ECGKAFNWSSTLTKHKIIHTEEKPYKCEKCGKAFKQSSILTNHKRIHTGEKPYKCEECGK
490 500 510 520 530 540
NP_001 SFNRSSTFTKHKVIHTGVKPYKCEECGKAFFWSSTLTKHKRIHTGEQPYKWEKFGKAFNR
550 560 570 580 590 600
>--
initn: 1492 init1: 432 opt: 432 Z-score: 256.8 bits: 57.4 E(85289): 1.5e-07
Smith-Waterman score: 432; 76.2% identity (87.5% similar) in 80 aa overlap (392-471:532-611)
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKPY
:::::::::.:: :: .: ::.:::: :::
NP_001 EKPYKCEKCGKAFKQSSILTNHKRIHTGEKPYKCEECGKSFNRSSTFTKHKVIHTGVKPY
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pF1KSD KCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKYEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCEE
::::::::: ::::.::: :::::.:::.:. :::::.:::::: :. :
NP_001 KCEECGKAFFWSSTLTKHKRIHTGEQPYKWEKFGKAFNRSSHLTTDKITHWREILQV
570 580 590 600 610
490 500 510 520 530
pF1KSD CGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
>>XP_011526746 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger pro (618 aa)
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Smith-Waterman score: 2649; 72.9% identity (86.4% similar) in 531 aa overlap (1-531:1-531)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLENYRNLVFVGIAASKPDLITCLEQGKEPWNVKRHEMVAEPPVVCSYFARDLWPKQGKK
::::::::.:.:::.:::::::::::::::::.:::::: ::: .: .::.::::.:: .
XP_011 MLENYRNLAFLGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHEMVDEPPGMCPHFAQDLWPEQGME
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD NYFQKVILRRYKKCGCENLQLRKYCKSMDECKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQCDKYVK
. :::.::::: : : ::::::: :::.:: ::.:: :::::::.::.:.:.::::::.:
XP_011 DSFQKAILRRYGKYGHENLQLRKGCKSVDEYKVNKEGYNGLNQCFTTAQSKVFQCDKYLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VFHKFSNSNRHTIRHTGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNE
::.:: :::: :::: :::::::. : :::::: .::: :. :: ::::::::..:
XP_011 VFYKFLNSNRPKIRHTEKKSFKCKKRVKLFCMLSHKTQHKSIYHREKSYKCKECGKTFNW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TSNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANL
.:.:..:..:.: .::::::: .:. ..:: ::::.:::.:.: :::::::.:::.:.::
XP_011 SSTLTNHRKIYTEEKPYKCEEYNKSPKQLSTLTTHEIIHAGEKLYKCEECGEAFNRSSNL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHK
:::: ::::::::::::::.:: ::::: :: ::. .:::::::::::: ::::: ::
XP_011 TTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFIWSSTLTEHKKIHTRKKPYKCEECGKAFIWSSTLTRHK
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.::::: :::::::::::: : ::::: ::.::: ::: :::::::: ::::::: ::.
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pF1KSD GEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKP
:::.:::: :.:.:.: :.::::: ::::::::::::::::: :: :: :: ::: :::
XP_011 GEKLYKCEECGKGFNRSSNLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFIWSSTLTKHKRIHTREKP
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:::::::::: ::::..:: .:::::::: :::::.:.::: :::::.:::::::::::
XP_011 YKCEECGKAFIWSSTLTRHKRMHTGEKPYKCEECGKSFSQSSTLTTHKIIHTGEKPYKCE
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::::::: :: :..::.::: :: :: :.:..: . . ....:: .:::
XP_011 ECGKAFNWSSTLTKHKIIHTEEKPYKCEKCGKAFKQSSILTNHKRIHTGEKPYKCEECGK
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initn: 1492 init1: 432 opt: 432 Z-score: 256.8 bits: 57.4 E(85289): 1.5e-07
Smith-Waterman score: 432; 76.2% identity (87.5% similar) in 80 aa overlap (392-471:532-611)
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570 580 590 600 610
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pF1KSD CGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
531 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]