Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1486
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1486, 653 aa
1>>>pF1KSDA1486 653 - 653 aa - 653 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.5852+/-0.000377; mu= -13.5540+/- 0.024
mean_var=405.8465+/-84.672, 0's: 0 Z-trim(124.2): 26 B-trim: 767 in 2/56
Lambda= 0.063664
statistics sampled from 45294 (45320) to 45294 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.813), E-opt: 0.2 (0.531), width: 16
Scan time: 13.160
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_005246765 (OMIM: 615478) PREDICTED: neuronal ty ( 653) 4421 420.3 1.1e-116
NP_065915 (OMIM: 615478) neuronal tyrosine-phospho ( 653) 4421 420.3 1.1e-116
XP_016860053 (OMIM: 615478) PREDICTED: neuronal ty ( 719) 4369 415.5 3.3e-115
XP_011509826 (OMIM: 615478) PREDICTED: neuronal ty ( 719) 4369 415.5 3.3e-115
NP_055826 (OMIM: 615479) unconventional myosin-XVI (1858) 1013 107.5 4.4e-22
XP_011519364 (OMIM: 615479) PREDICTED: unconventio (1858) 1013 107.5 4.4e-22
NP_001185879 (OMIM: 615479) unconventional myosin- (1880) 1013 107.5 4.4e-22
XP_016867357 (OMIM: 615477) PREDICTED: neuronal ty ( 677) 581 67.6 1.7e-10
NP_775835 (OMIM: 615477) neuronal tyrosine-phospho ( 841) 581 67.6 2e-10
XP_006715970 (OMIM: 615477) PREDICTED: neuronal ty ( 842) 581 67.6 2e-10
>>XP_005246765 (OMIM: 615478) PREDICTED: neuronal tyrosi (653 aa)
initn: 4421 init1: 4421 opt: 4421 Z-score: 2215.7 bits: 420.3 E(85289): 1.1e-116
Smith-Waterman score: 4421; 99.8% identity (99.8% similar) in 653 aa overlap (1-653:1-653)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MISSKMMSSNPEEDPLDTFLQYIEDMGMKAYDGLVIQNASDIARENDRLRNETNLAYLKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MISSKMMSSNPEEDPLDTFLQYIEDMGMKAYDGLVIQNASDIARENDRLRNETNLAYLKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KNEKRRRQEEAIKRIGGEVGRGHEGSYVGKHFRMGFMTMPAPQDRLPHPCSSGFSVRSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KNEKRRRQEEAIKRIGGEVGRGHEGSYVGKHFRMGFMTMPAPQDRLPHPCSSGFSVRSQS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LHSVGGTDDDSSCGSRRQPPPKPKRDPSTKLSTSSETVSSTAASKSGKTPERTEASAKPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LHSVGGTDDDSSCGSRRQPPPKPKRDPSTKLSTSSETVSSTAASKSGKTPERTEASAKPR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD PHSDEYSKKIPPPKPKRNPNTQLSTSFDETYIKKHGPRRTSLPRDSSLSQMGSPAGDPEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PHSDEYSKKIPPPKPKRNPNTQLSTSFDETYIKKHGPRRTSLPRDSSLSQMGSPAGDPEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD EEPVYIEMVGNILRDFRKEDDDQSEAVYEEMKYPIFDDLGQDAKCDFDHHSCSSQCATPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EEPVYIEMVGNILRDFRKEDDDQSEAVYEEMKYPIFDDLGQDAKCDFDHHSCSSQCATPT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VPDLDFAKASVPCPPKGLLCDIPPPFPNLLSHRPPLLVFPPAPVHCSPNSDESPLTPLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VPDLDFAKASVPCPPKGLLCDIPPPFPNLLSHRPPLLVFPPAPVHCSPNSDESPLTPLEV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TKLPVLENVSYMKQPAGASPSTLPSHVPGHAKLEKEQAAALGPASATPALSSSPPPPSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TKLPVLENVSYMKQPAGASPSTLPSHVPGHAKLEKEQAAALGPASATPALSSSPPPPSTL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD YRTQSPHGYPKSHSTSPSPVSMGRSLTPLSLKRPPPYDAVHSGSLSRSSPSVPHSTPRPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YRTQSPHGYPKSHSTSPSPVSMGRSLTPLSLKRPPPYDAVHSGSLSRSSPSVPHSTPRPV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SQDGAKMVNAAVNTYGAAPGGSRSRTPTSPLEELTSLFSSGRSLLRKSSSGRRSKEPAEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SQDGAKMVNAAVNTYGAAPGGSRSRTPTSPLEELTSLFSSGRSLLRKSSSGRRSKEPAEK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD STEELKVRSHSTEPLPKLDNKERGHHGASSSREPVKAQEWDGTPGPPVVTSRLGRCSVSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
XP_005 STEELKVRSHSTEPLPKLDNKERGHHGASSSREPVKAQEWDGTPGTPVVTSRLGRCSVSP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KSD TLLAGNHSSEPKVSCKLGRSASTSGVPPPSVTPLRQSSDLQQSQVPSSLANRD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TLLAGNHSSEPKVSCKLGRSASTSGVPPPSVTPLRQSSDLQQSQVPSSLANRD
610 620 630 640 650
>>NP_065915 (OMIM: 615478) neuronal tyrosine-phosphoryla (653 aa)
initn: 4421 init1: 4421 opt: 4421 Z-score: 2215.7 bits: 420.3 E(85289): 1.1e-116
Smith-Waterman score: 4421; 99.8% identity (99.8% similar) in 653 aa overlap (1-653:1-653)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MISSKMMSSNPEEDPLDTFLQYIEDMGMKAYDGLVIQNASDIARENDRLRNETNLAYLKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MISSKMMSSNPEEDPLDTFLQYIEDMGMKAYDGLVIQNASDIARENDRLRNETNLAYLKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KNEKRRRQEEAIKRIGGEVGRGHEGSYVGKHFRMGFMTMPAPQDRLPHPCSSGFSVRSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 KNEKRRRQEEAIKRIGGEVGRGHEGSYVGKHFRMGFMTMPAPQDRLPHPCSSGFSVRSQS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LHSVGGTDDDSSCGSRRQPPPKPKRDPSTKLSTSSETVSSTAASKSGKTPERTEASAKPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LHSVGGTDDDSSCGSRRQPPPKPKRDPSTKLSTSSETVSSTAASKSGKTPERTEASAKPR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD PHSDEYSKKIPPPKPKRNPNTQLSTSFDETYIKKHGPRRTSLPRDSSLSQMGSPAGDPEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PHSDEYSKKIPPPKPKRNPNTQLSTSFDETYIKKHGPRRTSLPRDSSLSQMGSPAGDPEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD EEPVYIEMVGNILRDFRKEDDDQSEAVYEEMKYPIFDDLGQDAKCDFDHHSCSSQCATPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 EEPVYIEMVGNILRDFRKEDDDQSEAVYEEMKYPIFDDLGQDAKCDFDHHSCSSQCATPT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VPDLDFAKASVPCPPKGLLCDIPPPFPNLLSHRPPLLVFPPAPVHCSPNSDESPLTPLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VPDLDFAKASVPCPPKGLLCDIPPPFPNLLSHRPPLLVFPPAPVHCSPNSDESPLTPLEV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TKLPVLENVSYMKQPAGASPSTLPSHVPGHAKLEKEQAAALGPASATPALSSSPPPPSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TKLPVLENVSYMKQPAGASPSTLPSHVPGHAKLEKEQAAALGPASATPALSSSPPPPSTL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD YRTQSPHGYPKSHSTSPSPVSMGRSLTPLSLKRPPPYDAVHSGSLSRSSPSVPHSTPRPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 YRTQSPHGYPKSHSTSPSPVSMGRSLTPLSLKRPPPYDAVHSGSLSRSSPSVPHSTPRPV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SQDGAKMVNAAVNTYGAAPGGSRSRTPTSPLEELTSLFSSGRSLLRKSSSGRRSKEPAEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SQDGAKMVNAAVNTYGAAPGGSRSRTPTSPLEELTSLFSSGRSLLRKSSSGRRSKEPAEK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD STEELKVRSHSTEPLPKLDNKERGHHGASSSREPVKAQEWDGTPGPPVVTSRLGRCSVSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
NP_065 STEELKVRSHSTEPLPKLDNKERGHHGASSSREPVKAQEWDGTPGTPVVTSRLGRCSVSP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KSD TLLAGNHSSEPKVSCKLGRSASTSGVPPPSVTPLRQSSDLQQSQVPSSLANRD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TLLAGNHSSEPKVSCKLGRSASTSGVPPPSVTPLRQSSDLQQSQVPSSLANRD
610 620 630 640 650
>>XP_016860053 (OMIM: 615478) PREDICTED: neuronal tyrosi (719 aa)
initn: 4369 init1: 4369 opt: 4369 Z-score: 2189.3 bits: 415.5 E(85289): 3.3e-115
Smith-Waterman score: 4369; 99.8% identity (99.8% similar) in 645 aa overlap (1-645:1-645)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MISSKMMSSNPEEDPLDTFLQYIEDMGMKAYDGLVIQNASDIARENDRLRNETNLAYLKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MISSKMMSSNPEEDPLDTFLQYIEDMGMKAYDGLVIQNASDIARENDRLRNETNLAYLKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KNEKRRRQEEAIKRIGGEVGRGHEGSYVGKHFRMGFMTMPAPQDRLPHPCSSGFSVRSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KNEKRRRQEEAIKRIGGEVGRGHEGSYVGKHFRMGFMTMPAPQDRLPHPCSSGFSVRSQS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LHSVGGTDDDSSCGSRRQPPPKPKRDPSTKLSTSSETVSSTAASKSGKTPERTEASAKPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LHSVGGTDDDSSCGSRRQPPPKPKRDPSTKLSTSSETVSSTAASKSGKTPERTEASAKPR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD PHSDEYSKKIPPPKPKRNPNTQLSTSFDETYIKKHGPRRTSLPRDSSLSQMGSPAGDPEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PHSDEYSKKIPPPKPKRNPNTQLSTSFDETYIKKHGPRRTSLPRDSSLSQMGSPAGDPEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD EEPVYIEMVGNILRDFRKEDDDQSEAVYEEMKYPIFDDLGQDAKCDFDHHSCSSQCATPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EEPVYIEMVGNILRDFRKEDDDQSEAVYEEMKYPIFDDLGQDAKCDFDHHSCSSQCATPT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VPDLDFAKASVPCPPKGLLCDIPPPFPNLLSHRPPLLVFPPAPVHCSPNSDESPLTPLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VPDLDFAKASVPCPPKGLLCDIPPPFPNLLSHRPPLLVFPPAPVHCSPNSDESPLTPLEV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TKLPVLENVSYMKQPAGASPSTLPSHVPGHAKLEKEQAAALGPASATPALSSSPPPPSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TKLPVLENVSYMKQPAGASPSTLPSHVPGHAKLEKEQAAALGPASATPALSSSPPPPSTL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD YRTQSPHGYPKSHSTSPSPVSMGRSLTPLSLKRPPPYDAVHSGSLSRSSPSVPHSTPRPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YRTQSPHGYPKSHSTSPSPVSMGRSLTPLSLKRPPPYDAVHSGSLSRSSPSVPHSTPRPV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SQDGAKMVNAAVNTYGAAPGGSRSRTPTSPLEELTSLFSSGRSLLRKSSSGRRSKEPAEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SQDGAKMVNAAVNTYGAAPGGSRSRTPTSPLEELTSLFSSGRSLLRKSSSGRRSKEPAEK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD STEELKVRSHSTEPLPKLDNKERGHHGASSSREPVKAQEWDGTPGPPVVTSRLGRCSVSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
XP_016 STEELKVRSHSTEPLPKLDNKERGHHGASSSREPVKAQEWDGTPGTPVVTSRLGRCSVSP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KSD TLLAGNHSSEPKVSCKLGRSASTSGVPPPSVTPLRQSSDLQQSQVPSSLANRD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TLLAGNHSSEPKVSCKLGRSASTSGVPPPSVTPLRQSSDLQQSQVACMQWFHGDHTMLEM
610 620 630 640 650 660
XP_016 IEKKRCLCKEIKARQKTEKGLCKQDSMPILPSWKKNAGAKKYSPPPYSKQQTVFWDTAI
670 680 690 700 710
>>XP_011509826 (OMIM: 615478) PREDICTED: neuronal tyrosi (719 aa)
initn: 4369 init1: 4369 opt: 4369 Z-score: 2189.3 bits: 415.5 E(85289): 3.3e-115
Smith-Waterman score: 4369; 99.8% identity (99.8% similar) in 645 aa overlap (1-645:1-645)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MISSKMMSSNPEEDPLDTFLQYIEDMGMKAYDGLVIQNASDIARENDRLRNETNLAYLKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MISSKMMSSNPEEDPLDTFLQYIEDMGMKAYDGLVIQNASDIARENDRLRNETNLAYLKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KNEKRRRQEEAIKRIGGEVGRGHEGSYVGKHFRMGFMTMPAPQDRLPHPCSSGFSVRSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KNEKRRRQEEAIKRIGGEVGRGHEGSYVGKHFRMGFMTMPAPQDRLPHPCSSGFSVRSQS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LHSVGGTDDDSSCGSRRQPPPKPKRDPSTKLSTSSETVSSTAASKSGKTPERTEASAKPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LHSVGGTDDDSSCGSRRQPPPKPKRDPSTKLSTSSETVSSTAASKSGKTPERTEASAKPR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD PHSDEYSKKIPPPKPKRNPNTQLSTSFDETYIKKHGPRRTSLPRDSSLSQMGSPAGDPEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PHSDEYSKKIPPPKPKRNPNTQLSTSFDETYIKKHGPRRTSLPRDSSLSQMGSPAGDPEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD EEPVYIEMVGNILRDFRKEDDDQSEAVYEEMKYPIFDDLGQDAKCDFDHHSCSSQCATPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EEPVYIEMVGNILRDFRKEDDDQSEAVYEEMKYPIFDDLGQDAKCDFDHHSCSSQCATPT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VPDLDFAKASVPCPPKGLLCDIPPPFPNLLSHRPPLLVFPPAPVHCSPNSDESPLTPLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VPDLDFAKASVPCPPKGLLCDIPPPFPNLLSHRPPLLVFPPAPVHCSPNSDESPLTPLEV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TKLPVLENVSYMKQPAGASPSTLPSHVPGHAKLEKEQAAALGPASATPALSSSPPPPSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TKLPVLENVSYMKQPAGASPSTLPSHVPGHAKLEKEQAAALGPASATPALSSSPPPPSTL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD YRTQSPHGYPKSHSTSPSPVSMGRSLTPLSLKRPPPYDAVHSGSLSRSSPSVPHSTPRPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YRTQSPHGYPKSHSTSPSPVSMGRSLTPLSLKRPPPYDAVHSGSLSRSSPSVPHSTPRPV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SQDGAKMVNAAVNTYGAAPGGSRSRTPTSPLEELTSLFSSGRSLLRKSSSGRRSKEPAEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SQDGAKMVNAAVNTYGAAPGGSRSRTPTSPLEELTSLFSSGRSLLRKSSSGRRSKEPAEK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD STEELKVRSHSTEPLPKLDNKERGHHGASSSREPVKAQEWDGTPGPPVVTSRLGRCSVSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
XP_011 STEELKVRSHSTEPLPKLDNKERGHHGASSSREPVKAQEWDGTPGTPVVTSRLGRCSVSP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KSD TLLAGNHSSEPKVSCKLGRSASTSGVPPPSVTPLRQSSDLQQSQVPSSLANRD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TLLAGNHSSEPKVSCKLGRSASTSGVPPPSVTPLRQSSDLQQSQVACMQWFHGDHTMLEM
610 620 630 640 650 660
XP_011 IEKKRCLCKEIKARQKTEKGLCKQDSMPILPSWKKNAGAKKYSPPPYSKQQTVFWDTAI
670 680 690 700 710
>>NP_055826 (OMIM: 615479) unconventional myosin-XVI iso (1858 aa)
initn: 812 init1: 450 opt: 1013 Z-score: 517.5 bits: 107.5 E(85289): 4.4e-22
Smith-Waterman score: 1271; 43.4% identity (61.5% similar) in 590 aa overlap (12-571:1177-1735)
10 20 30 40
pF1KSD MISSKMMSSNPEEDPLDTFLQYIEDMGMKAYDGLVIQNASD
: ...::: ::::.:.::.::::::::
NP_055 LQRKIITCQKVIRGFLARQHLLQRISIRQQEVTSINSFLQNTEDMGLKTYDALVIQNASD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
50 60 70 80 90 100
pF1KSD IARENDRLRNETNLAYLKEKNEKRRRQEEAIKRIGGEVGRGHEGSYVGKHFRMGFMTMPA
:::::::::.: : : ::: : : :::. :: . : .::. . :.. :
NP_055 IARENDRLRSEMNAPYHKEKLEVRNMQEEGSKRTDDKSG--------PRHFHPSSMSVCA
1210 1220 1230 1240 1250
110 120 130 140 150 160
pF1KSD PQDRLPHPCSSGFSVRSQSLHSVGGTDDDSSCGS-RRQPPPKPKRDPSTKLSTSSETVSS
: : . : : :. : ::::: . ::.:: : :.::::::::::.:.::.: :.::
NP_055 AVDGLGQ-CLVGPSIWSPSLHSVFSMDDSSSLPSPRKQPPPKPKRDPNTRLSASYEAVS-
1260 1270 1280 1290 1300 1310
170 180 190 200 210
pF1KSD TAASKSGKTPERTEASAKPRPHSDEYS--KKIPPPKPKRNPNTQLSTSFDETYIKKHGPR
: :. .:: :.::::::.:: ::::: ::::.:::.:: :..: .. :
NP_055 --ACLSAAREAANEALARPRPHSDDYSTMKKIPPRKPKRSPNTKLSGSYEEISGSRPGDA
1320 1330 1340 1350 1360 1370
220 230 240 250 260
pF1KSD RTSLPRDSSLSQM-----------GSPAGDPEEEEPVYIEMVGNILRDFRKEDDDQSEAV
: . .. . ..: :: .. :::::::.:. : .. : .:.:
NP_055 RPAGAPGAAARVLTPGTPQCALPPAAPPGDEDDSEPVYIEMLGHAA---RPDSPDPGESV
1380 1390 1400 1410 1420 1430
270 280 290 300 310 320
pF1KSD YEEMKYPIFDDLGQDAKCDFDHHSCSSQCATPTVPDLDFAKASVPCPPKGLLCDIPPPFP
::::: . :: : : .: :. :.: : : : . : : ::::::::
NP_055 YEEMKCCLPDDGGPGAG-SFLLHG-----ASP--PLLHRAPEDEAAGPPGDACDIPPPFP
1440 1450 1460 1470 1480
330 340 350 360 370 380
pF1KSD NLLSHRPPLLVFPPAPVHCSPNSDESPLTPLEVTKLPVLE-NVSYMKQPAGASPSTLPSH
::: ::::::::::.:: ::: ::::::::::: :::::: :..: :: :.:: . :..
NP_055 NLLPHRPPLLVFPPTPVTCSPASDESPLTPLEVKKLPVLETNLKYPVQPEGSSPLS-PQY
1490 1500 1510 1520 1530 1540
390 400 410 420 430
pF1KSD VP---GHAKLEKEQAAAL--GPASATPALSSSPPPPSTLYRTQSPHGYPKSH---STSPS
: . . :: : . :.: :. :::: .:. : .: :.
NP_055 SKSQKGDGDRPASPGLALFNGSGRASPP-STPPPPPPPPGPPPAPY-RPCAHLAFPPEPA
1550 1560 1570 1580 1590 1600
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pF1KSD PVSMGRSLTPLSLKR--PPPYDAVHSGSLSRSSPSVPHSTPRPVSQDGAKMVNAAVNTYG
::. :.. . : : .: .: : : :..:.: ::. : .:. ..
NP_055 PVNAGKAGPSAEAPKVHPKPNSAPVAGPCS-SFPKIPYS---PVKATRADARKAGSSASP
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pF1KSD AAPGGSRSRTP-TSPLEELTSLFSSGRSLLRKSSSGRRSKEPAEKSTEELKVRSH----S
:: . : : .:::.::.:::.::::.::::..::. .: :: .... :. .
NP_055 PAPYSPPSSRPLSSPLDELASLFNSGRSVLRKSAAGRKIRE-AEGFETNMNISSRDDPST
1660 1670 1680 1690 1700 1710
560 570 580 590 600 610
pF1KSD TEPLPKLDNKERGHHGASSSREPVKAQEWDGTPGPPVVTSRLGRCSVSPTLLAGNHSSEP
.: . .... ..:: . :
NP_055 SEITSETQDRNANNHGIQLSNSLSSAITAENGNSISNGLPEEDGYSRLSISGTGTSTFQR
1720 1730 1740 1750 1760 1770
>>XP_011519364 (OMIM: 615479) PREDICTED: unconventional (1858 aa)
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Smith-Waterman score: 1271; 43.4% identity (61.5% similar) in 590 aa overlap (12-571:1177-1735)
10 20 30 40
pF1KSD MISSKMMSSNPEEDPLDTFLQYIEDMGMKAYDGLVIQNASD
: ...::: ::::.:.::.::::::::
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pF1KSD IARENDRLRNETNLAYLKEKNEKRRRQEEAIKRIGGEVGRGHEGSYVGKHFRMGFMTMPA
:::::::::.: : : ::: : : :::. :: . : .::. . :.. :
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pF1KSD PQDRLPHPCSSGFSVRSQSLHSVGGTDDDSSCGS-RRQPPPKPKRDPSTKLSTSSETVSS
: : . : : :. : ::::: . ::.:: : :.::::::::::.:.::.: :.::
XP_011 AVDGLGQ-CLVGPSIWSPSLHSVFSMDDSSSLPSPRKQPPPKPKRDPNTRLSASYEAVS-
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: :. .:: :.::::::.:: ::::: ::::.:::.:: :..: .. :
XP_011 --ACLSAAREAANEALARPRPHSDDYSTMKKIPPRKPKRSPNTKLSGSYEEISGSRPGDA
1320 1330 1340 1350 1360 1370
220 230 240 250 260
pF1KSD RTSLPRDSSLSQM-----------GSPAGDPEEEEPVYIEMVGNILRDFRKEDDDQSEAV
: . .. . ..: :: .. :::::::.:. : .. : .:.:
XP_011 RPAGAPGAAARVLTPGTPQCALPPAAPPGDEDDSEPVYIEMLGHAA---RPDSPDPGESV
1380 1390 1400 1410 1420 1430
270 280 290 300 310 320
pF1KSD YEEMKYPIFDDLGQDAKCDFDHHSCSSQCATPTVPDLDFAKASVPCPPKGLLCDIPPPFP
::::: . :: : : .: :. :.: : : : . : : ::::::::
XP_011 YEEMKCCLPDDGGPGAG-SFLLHG-----ASP--PLLHRAPEDEAAGPPGDACDIPPPFP
1440 1450 1460 1470 1480
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pF1KSD NLLSHRPPLLVFPPAPVHCSPNSDESPLTPLEVTKLPVLE-NVSYMKQPAGASPSTLPSH
::: ::::::::::.:: ::: ::::::::::: :::::: :..: :: :.:: . :..
XP_011 NLLPHRPPLLVFPPTPVTCSPASDESPLTPLEVKKLPVLETNLKYPVQPEGSSPLS-PQY
1490 1500 1510 1520 1530 1540
390 400 410 420 430
pF1KSD VP---GHAKLEKEQAAAL--GPASATPALSSSPPPPSTLYRTQSPHGYPKSH---STSPS
: . . :: : . :.: :. :::: .:. : .: :.
XP_011 SKSQKGDGDRPASPGLALFNGSGRASPP-STPPPPPPPPGPPPAPY-RPCAHLAFPPEPA
1550 1560 1570 1580 1590 1600
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pF1KSD PVSMGRSLTPLSLKR--PPPYDAVHSGSLSRSSPSVPHSTPRPVSQDGAKMVNAAVNTYG
::. :.. . : : .: .: : : :..:.: ::. : .:. ..
XP_011 PVNAGKAGPSAEAPKVHPKPNSAPVAGPCS-SFPKIPYS---PVKATRADARKAGSSASP
1610 1620 1630 1640 1650
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pF1KSD AAPGGSRSRTP-TSPLEELTSLFSSGRSLLRKSSSGRRSKEPAEKSTEELKVRSH----S
:: . : : .:::.::.:::.::::.::::..::. .: :: .... :. .
XP_011 PAPYSPPSSRPLSSPLDELASLFNSGRSVLRKSAAGRKIRE-AEGFETNMNISSRDDPST
1660 1670 1680 1690 1700 1710
560 570 580 590 600 610
pF1KSD TEPLPKLDNKERGHHGASSSREPVKAQEWDGTPGPPVVTSRLGRCSVSPTLLAGNHSSEP
.: . .... ..:: . :
XP_011 SEITSETQDRNANNHGIQLSNSLSSAITAENGNSISNGLPEEDGYSRLSISGTGTSTFQR
1720 1730 1740 1750 1760 1770
>>NP_001185879 (OMIM: 615479) unconventional myosin-XVI (1880 aa)
initn: 812 init1: 450 opt: 1013 Z-score: 517.4 bits: 107.5 E(85289): 4.4e-22
Smith-Waterman score: 1271; 43.4% identity (61.5% similar) in 590 aa overlap (12-571:1199-1757)
10 20 30 40
pF1KSD MISSKMMSSNPEEDPLDTFLQYIEDMGMKAYDGLVIQNASD
: ...::: ::::.:.::.::::::::
NP_001 LQRKIITCQKVIRGFLARQHLLQRISIRQQEVTSINSFLQNTEDMGLKTYDALVIQNASD
1170 1180 1190 1200 1210 1220
50 60 70 80 90 100
pF1KSD IARENDRLRNETNLAYLKEKNEKRRRQEEAIKRIGGEVGRGHEGSYVGKHFRMGFMTMPA
:::::::::.: : : ::: : : :::. :: . : .::. . :.. :
NP_001 IARENDRLRSEMNAPYHKEKLEVRNMQEEGSKRTDDKSG--------PRHFHPSSMSVCA
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pF1KSD PQDRLPHPCSSGFSVRSQSLHSVGGTDDDSSCGS-RRQPPPKPKRDPSTKLSTSSETVSS
: : . : : :. : ::::: . ::.:: : :.::::::::::.:.::.: :.::
NP_001 AVDGLGQ-CLVGPSIWSPSLHSVFSMDDSSSLPSPRKQPPPKPKRDPNTRLSASYEAVS-
1290 1300 1310 1320 1330
170 180 190 200 210
pF1KSD TAASKSGKTPERTEASAKPRPHSDEYS--KKIPPPKPKRNPNTQLSTSFDETYIKKHGPR
: :. .:: :.::::::.:: ::::: ::::.:::.:: :..: .. :
NP_001 --ACLSAAREAANEALARPRPHSDDYSTMKKIPPRKPKRSPNTKLSGSYEEISGSRPGDA
1340 1350 1360 1370 1380 1390
220 230 240 250 260
pF1KSD RTSLPRDSSLSQM-----------GSPAGDPEEEEPVYIEMVGNILRDFRKEDDDQSEAV
: . .. . ..: :: .. :::::::.:. : .. : .:.:
NP_001 RPAGAPGAAARVLTPGTPQCALPPAAPPGDEDDSEPVYIEMLGHAA---RPDSPDPGESV
1400 1410 1420 1430 1440 1450
270 280 290 300 310 320
pF1KSD YEEMKYPIFDDLGQDAKCDFDHHSCSSQCATPTVPDLDFAKASVPCPPKGLLCDIPPPFP
::::: . :: : : .: :. :.: : : : . : : ::::::::
NP_001 YEEMKCCLPDDGGPGAG-SFLLHG-----ASP--PLLHRAPEDEAAGPPGDACDIPPPFP
1460 1470 1480 1490 1500
330 340 350 360 370 380
pF1KSD NLLSHRPPLLVFPPAPVHCSPNSDESPLTPLEVTKLPVLE-NVSYMKQPAGASPSTLPSH
::: ::::::::::.:: ::: ::::::::::: :::::: :..: :: :.:: . :..
NP_001 NLLPHRPPLLVFPPTPVTCSPASDESPLTPLEVKKLPVLETNLKYPVQPEGSSPLS-PQY
1510 1520 1530 1540 1550 1560
390 400 410 420 430
pF1KSD VP---GHAKLEKEQAAAL--GPASATPALSSSPPPPSTLYRTQSPHGYPKSH---STSPS
: . . :: : . :.: :. :::: .:. : .: :.
NP_001 SKSQKGDGDRPASPGLALFNGSGRASPP-STPPPPPPPPGPPPAPY-RPCAHLAFPPEPA
1570 1580 1590 1600 1610 1620
440 450 460 470 480 490
pF1KSD PVSMGRSLTPLSLKR--PPPYDAVHSGSLSRSSPSVPHSTPRPVSQDGAKMVNAAVNTYG
::. :.. . : : .: .: : : :..:.: ::. : .:. ..
NP_001 PVNAGKAGPSAEAPKVHPKPNSAPVAGPCS-SFPKIPYS---PVKATRADARKAGSSASP
1630 1640 1650 1660 1670
500 510 520 530 540 550
pF1KSD AAPGGSRSRTP-TSPLEELTSLFSSGRSLLRKSSSGRRSKEPAEKSTEELKVRSH----S
:: . : : .:::.::.:::.::::.::::..::. .: :: .... :. .
NP_001 PAPYSPPSSRPLSSPLDELASLFNSGRSVLRKSAAGRKIRE-AEGFETNMNISSRDDPST
1680 1690 1700 1710 1720 1730
560 570 580 590 600 610
pF1KSD TEPLPKLDNKERGHHGASSSREPVKAQEWDGTPGPPVVTSRLGRCSVSPTLLAGNHSSEP
.: . .... ..:: . :
NP_001 SEITSETQDRNANNHGIQLSNSLSSAITAENGNSISNGLPEEDGYSRLSISGTGTSTFQR
1740 1750 1760 1770 1780 1790
>>XP_016867357 (OMIM: 615477) PREDICTED: neuronal tyrosi (677 aa)
initn: 695 init1: 190 opt: 581 Z-score: 309.3 bits: 67.6 E(85289): 1.7e-10
Smith-Waterman score: 754; 34.4% identity (54.4% similar) in 520 aa overlap (54-510:2-479)
30 40 50 60 70
pF1KSD EDMGMKAYDGLVIQNASDIARENDRLRNETNLAYLKEKNEKRRRQEEAIKR---------
:: : : : : :...:: ::
XP_016 MNLLYRKTKLEWRQHKEEEAKRSSSKEVAPA
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80 90 100 110 120
pF1KSD --IGGEVGRG-----HEGSYVGKHFRMGFMTMPAPQDRLPHPCSSGFSVRSQSLHSVGGT
: .:.: .. . . . .::::::::: :.. :::: :... :: : ::::.
XP_016 GSAGPAAGQGPGVRVRDIASLRRSLRMGFMTMPASQEHTPHPCRSAMAPRSLSCHSVGSM
40 50 60 70 80 90
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pF1KSD DD------DSSCG-----SRRQPPPKPKRDPSTKLSTSSETVSSTAASKSGKTPERTEAS
:. .: : : :.:: ::.: :::::: . .: . : . .:
XP_016 DSVGGGPGGASGGLTEDSSTRRPPAKPRRHPSTKLSMVGP------GSGAETPPSKKAGS
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pF1KSD AKPRPHSDEYSKKIPPPKPKRNPNTQLSTSFDETYIKKHGPRRTSLPRDSSLSQMGSPAG
:: :.. : :.:.:: ::.:.::::::.::::. .:: .:: . :.. . ::
XP_016 QKPTPEGRESSRKVPPQKPRRSPNTQLSVSFDESCPPGPSPRGGNLPLQR-LTRGSRVAG
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pF1KSD DPE---EEEPVYIEMVGNILRDFRKE----------------------DDDQSEAVYEEM
::. .::::::::::...: . :...:::.::::
XP_016 DPDVGAQEEPVYIEMVGDVFRGGGRSGGGLAGPPLGGGGPTPPAGADSDSEESEAIYEEM
210 220 230 240 250 260
280 290 300 310 320
pF1KSD KYPIFDDLGQDAKCDFDHHSCSSQCATPTV--PDLDFAKAS-VPC-----PPKGLLCDIP
:::. .. :. . .: : . : :: .: : : :.::
XP_016 KYPLPEEAGEGRANGPPPLTATSPPQQPHALPPHAHRRPASALPSRRDGTPTKTTPCEIP
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pF1KSD PPFPNLLSHRPPLLVFPPAPVHCSPNSDESPLTPLEVTKLPVLENVSYMKQPAGASPSTL
:::::::.::::::.:: : .....: :..:::: . :.:::..:.
XP_016 PPFPNLLQHRPPLLAFPQAK-----SASRTPGDG--VSRLPVL---CHSKEPAGSTPA--
330 340 350 360 370
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pF1KSD PSHVPGHAKLEKEQAAALGPASATPALSSSPPPPSTLYRTQSPHGYPKSHSTSPSPVSMG
: .::.. :.: :: ::::.. .: : .:::: : . :
XP_016 P-QVPAR---ERE----------TPP--PPPPPPAANLLLLGPSGRARSHSTPLPPQGSG
380 390 400 410
450 460 470 480 490 500
pF1KSD RSLTPLSLKRPPPYDAVHSGSLSRSSPSVPHSTPRPVSQDGAKMVNAAVN---TYGAAPG
. : . .. : :: . .. ..: . : :.. . . ::. .:.:.
XP_016 Q---PRGERELP---NSHS-MICPKAAGAPAAPPAPAALLPGPPKDKAVSYTMVYSAVKV
420 430 440 450 460
510 520 530 540 550 560
pF1KSD GSRSRTPTSPLEELTSLFSSGRSLLRKSSSGRRSKEPAEKSTEELKVRSHSTEPLPKLDN
..: :..:
XP_016 TTHSVLPAGPPLGAGEPKTEKEISVLHGMLCTSSRPPVPGKTSPHGGAMGAAAGVLHHRG
470 480 490 500 510 520
>>NP_775835 (OMIM: 615477) neuronal tyrosine-phosphoryla (841 aa)
initn: 742 init1: 190 opt: 581 Z-score: 308.0 bits: 67.6 E(85289): 2e-10
Smith-Waterman score: 754; 34.4% identity (54.4% similar) in 520 aa overlap (54-510:2-479)
30 40 50 60 70
pF1KSD EDMGMKAYDGLVIQNASDIARENDRLRNETNLAYLKEKNEKRRRQEEAIKR---------
:: : : : : :...:: ::
NP_775 MNLLYRKTKLEWRQHKEEEAKRSSSKEVAPA
10 20 30
80 90 100 110 120
pF1KSD --IGGEVGRG-----HEGSYVGKHFRMGFMTMPAPQDRLPHPCSSGFSVRSQSLHSVGGT
: .:.: .. . . . .::::::::: :.. :::: :... :: : ::::.
NP_775 GSAGPAAGQGPGVRVRDIASLRRSLRMGFMTMPASQEHTPHPCRSAMAPRSLSCHSVGSM
40 50 60 70 80 90
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pF1KSD DD------DSSCG-----SRRQPPPKPKRDPSTKLSTSSETVSSTAASKSGKTPERTEAS
:. .: : : :.:: ::.: :::::: . .: . : . .:
NP_775 DSVGGGPGGASGGLTEDSSTRRPPAKPRRHPSTKLSMVGP------GSGAETPPSKKAGS
100 110 120 130 140
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pF1KSD AKPRPHSDEYSKKIPPPKPKRNPNTQLSTSFDETYIKKHGPRRTSLPRDSSLSQMGSPAG
:: :.. : :.:.:: ::.:.::::::.::::. .:: .:: . :.. . ::
NP_775 QKPTPEGRESSRKVPPQKPRRSPNTQLSVSFDESCPPGPSPRGGNLPLQR-LTRGSRVAG
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270
pF1KSD DPE---EEEPVYIEMVGNILRDFRKE----------------------DDDQSEAVYEEM
::. .::::::::::...: . :...:::.::::
NP_775 DPDVGAQEEPVYIEMVGDVFRGGGRSGGGLAGPPLGGGGPTPPAGADSDSEESEAIYEEM
210 220 230 240 250 260
280 290 300 310 320
pF1KSD KYPIFDDLGQDAKCDFDHHSCSSQCATPTV--PDLDFAKAS-VPC-----PPKGLLCDIP
:::. .. :. . .: : . : :: .: : : :.::
NP_775 KYPLPEEAGEGRANGPPPLTATSPPQQPHALPPHAHRRPASALPSRRDGTPTKTTPCEIP
270 280 290 300 310 320
330 340 350 360 370 380
pF1KSD PPFPNLLSHRPPLLVFPPAPVHCSPNSDESPLTPLEVTKLPVLENVSYMKQPAGASPSTL
:::::::.::::::.:: : .....: :..:::: . :.:::..:.
NP_775 PPFPNLLQHRPPLLAFPQAK-----SASRTPGDG--VSRLPVL---CHSKEPAGSTPA--
330 340 350 360 370
390 400 410 420 430 440
pF1KSD PSHVPGHAKLEKEQAAALGPASATPALSSSPPPPSTLYRTQSPHGYPKSHSTSPSPVSMG
: .::.. :.: :: ::::.. .: : .:::: : . :
NP_775 P-QVPAR---ERE----------TPP--PPPPPPAANLLLLGPSGRARSHSTPLPPQGSG
380 390 400 410
450 460 470 480 490 500
pF1KSD RSLTPLSLKRPPPYDAVHSGSLSRSSPSVPHSTPRPVSQDGAKMVNAAVN---TYGAAPG
. : . .. : :: . .. ..: . : :.. . . ::. .:.:.
NP_775 Q---PRGERELP---NSHS-MICPKAAGAPAAPPAPAALLPGPPKDKAVSYTMVYSAVKV
420 430 440 450 460
510 520 530 540 550 560
pF1KSD GSRSRTPTSPLEELTSLFSSGRSLLRKSSSGRRSKEPAEKSTEELKVRSHSTEPLPKLDN
..: :..:
NP_775 TTHSVLPAGPPLGAGEPKTEKEISVLHGMLCTSSRPPVPGKTSPHGGAMGAAAGVLHHRG
470 480 490 500 510 520
>>XP_006715970 (OMIM: 615477) PREDICTED: neuronal tyrosi (842 aa)
initn: 742 init1: 190 opt: 581 Z-score: 308.0 bits: 67.6 E(85289): 2e-10
Smith-Waterman score: 754; 34.4% identity (54.4% similar) in 520 aa overlap (54-510:2-479)
30 40 50 60 70
pF1KSD EDMGMKAYDGLVIQNASDIARENDRLRNETNLAYLKEKNEKRRRQEEAIKR---------
:: : : : : :...:: ::
XP_006 MNLLYRKTKLEWRQHKEEEAKRSSSKEVAPA
10 20 30
80 90 100 110 120
pF1KSD --IGGEVGRG-----HEGSYVGKHFRMGFMTMPAPQDRLPHPCSSGFSVRSQSLHSVGGT
: .:.: .. . . . .::::::::: :.. :::: :... :: : ::::.
XP_006 GSAGPAAGQGPGVRVRDIASLRRSLRMGFMTMPASQEHTPHPCRSAMAPRSLSCHSVGSM
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KSD DD------DSSCG-----SRRQPPPKPKRDPSTKLSTSSETVSSTAASKSGKTPERTEAS
:. .: : : :.:: ::.: :::::: . .: . : . .:
XP_006 DSVGGGPGGASGGLTEDSSTRRPPAKPRRHPSTKLSMVGP------GSGAETPPSKKAGS
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AKPRPHSDEYSKKIPPPKPKRNPNTQLSTSFDETYIKKHGPRRTSLPRDSSLSQMGSPAG
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