FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1518, 851 aa
1>>>pF1KSDA1518 851 - 851 aa - 851 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0171+/-0.000973; mu= 5.5436+/- 0.059
mean_var=245.4489+/-48.799, 0's: 0 Z-trim(114.1): 102 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.081864
statistics sampled from 14542 (14645) to 14542 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.76), E-opt: 0.2 (0.45), width: 16
Scan time: 4.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12255.1 KANK2 gene_id:25959|Hs108|chr19 ( 851) 5604 675.5 1.1e-193
CCDS54219.1 KANK2 gene_id:25959|Hs108|chr19 ( 859) 5578 672.4 9.2e-193
CCDS6441.1 KANK1 gene_id:23189|Hs108|chr9 (1194) 1101 143.8 1.7e-33
CCDS34976.1 KANK1 gene_id:23189|Hs108|chr9 (1352) 1101 143.8 1.9e-33
CCDS620.1 KANK4 gene_id:163782|Hs108|chr1 ( 995) 941 124.8 7.4e-28
CCDS81334.1 KANK4 gene_id:163782|Hs108|chr1 ( 367) 909 120.7 4.9e-27
CCDS12199.1 KANK3 gene_id:256949|Hs108|chr19 ( 821) 870 116.3 2.1e-25
>>CCDS12255.1 KANK2 gene_id:25959|Hs108|chr19 (851 aa)
initn: 5604 init1: 5604 opt: 5604 Z-score: 3590.8 bits: 675.5 E(32554): 1.1e-193
Smith-Waterman score: 5604; 99.9% identity (100.0% similar) in 851 aa overlap (1-851:1-851)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAQVLHVPAPFPGTPGPASPPAFPAKDPDPPYSVETPYGYRLDLDFLKYVDDIEKGHTLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAQVLHVPAPFPGTPGPASPPAFPAKDPDPPYSVETPYGYRLDLDFLKYVDDIEKGHTLR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RVAVQRRPRLSSLPRGPGSWWTSTESLCSNASGDSRHSAYSYCGRGFYPQYGALETRGGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RVAVQRRPRLSSLPRGPGSWWTSTESLCSNASGDSRHSAYSYCGRGFYPQYGALETRGGF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD NPRVERTLLDARRRLEDQAATPTGLGSLTPSAAGSTASLVGVGLPPPTPRSSGLSTPVPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NPRVERTLLDARRRLEDQAATPTGLGSLTPSAAGSTASLVGVGLPPPTPRSSGLSTPVPP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SAGHLAHVREQMAGALRKLRQLEEQVKLIPVLQVKLSVLQEEKRQLTVQLKSQKFLGHPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SAGHLAHVREQMAGALRKLRQLEEQVKLIPVLQVKLSVLQEEKRQLTVQLKSQKFLGHPT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AGRGRSELCLDLPDPPEDPVALETRSVGTWVRERDLGMPDGEAALAAKVAVLETQLKKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AGRGRSELCLDLPDPPEDPVALETRSVGTWVRERDLGMPDGEAALAAKVAVLETQLKKAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD QELQAAQARQADPQPQAWPPPDSPVRVDTVRVVEGPREVEVVASTAAGAPAQRAQSLEPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QELQAAQARQADPQPQAWPPPDSPVRVDTVRVVEGPREVEVVASTAAGAPAQRAQSLEPY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GTGLRALAMPGRPESPPVFRSQEVVETMCPVPAAATSNVHMVKKISITERSCDGAAGLPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GTGLRALAMPGRPESPPVFRSQEVVETMCPVPAAATSNVHMVKKISITERSCDGAAGLPE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VPAESSSSPPGSEVASLTQPEKSTGRVPTQEPTHREPTRQAASQESEEAGGTGGPPAGVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VPAESSSSPPGSEVASLTQPEKSTGRVPTQEPTHREPTRQAASQESEEAGGTGGPPAGVR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SIMKRKEEVADPTAHRRSLQFVGVNGGYESSSEDSSTAENISDNNSTENEAPEPRERVPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS12 SIMKRKEEVADPTAHRRSLQFVGVNGGYESSSEDSSTAENISDNDSTENEAPEPRERVPS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VAEAPQLRPAGTAAAKTSRQECQLSRESQHIPTAEGASGSNTEEEIRMELSPDLISACLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VAEAPQLRPAGTAAAKTSRQECQLSRESQHIPTAEGASGSNTEEEIRMELSPDLISACLA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LEKYLDNPNALTERELKVAYTTVLQEWLRLACRSDAHPELVRRHLVTFRAMSARLLDYVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LEKYLDNPNALTERELKVAYTTVLQEWLRLACRSDAHPELVRRHLVTFRAMSARLLDYVV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD NIADSNGNTALHYSVSHANFPVVQQLLDSGVCKVDKQNRAGYSPIMLTALATLKTQDDIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NIADSNGNTALHYSVSHANFPVVQQLLDSGVCKVDKQNRAGYSPIMLTALATLKTQDDIE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD TVLQLFRLGNINAKASQAGQTALMLAVSHGRVDVVKALLACEADVNVQDDDGSTALMCAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TVLQLFRLGNINAKASQAGQTALMLAVSHGRVDVVKALLACEADVNVQDDDGSTALMCAC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD EHGHKEIAGLLLAVPSCDISLTDRDGSTALMVALDAGQSEIASMLYSRMNIKCSFAPMSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EHGHKEIAGLLLAVPSCDISLTDRDGSTALMVALDAGQSEIASMLYSRMNIKCSFAPMSD
790 800 810 820 830 840
850
pF1KSD DESPTSSSAEE
:::::::::::
CCDS12 DESPTSSSAEE
850
>>CCDS54219.1 KANK2 gene_id:25959|Hs108|chr19 (859 aa)
initn: 5638 init1: 3175 opt: 5578 Z-score: 3574.2 bits: 672.4 E(32554): 9.2e-193
Smith-Waterman score: 5578; 99.0% identity (99.1% similar) in 859 aa overlap (1-851:1-859)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAQVLHVPAPFPGTPGPASPPAFPAKDPDPPYSVETPYGYRLDLDFLKYVDDIEKGHTLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MAQVLHVPAPFPGTPGPASPPAFPAKDPDPPYSVETPYGYRLDLDFLKYVDDIEKGHTLR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RVAVQRRPRLSSLPRGPGSWWTSTESLCSNASGDSRHSAYSYCGRGFYPQYGALETRGGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RVAVQRRPRLSSLPRGPGSWWTSTESLCSNASGDSRHSAYSYCGRGFYPQYGALETRGGF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD NPRVERTLLDARRRLEDQAATPTGLGSLTPSAAGSTASLVGVGLPPPTPRSSGLSTPVPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NPRVERTLLDARRRLEDQAATPTGLGSLTPSAAGSTASLVGVGLPPPTPRSSGLSTPVPP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SAGHLAHVREQMAGALRKLRQLEEQVKLIPVLQVKLSVLQEEKRQLTVQLKSQKFLGHPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SAGHLAHVREQMAGALRKLRQLEEQVKLIPVLQVKLSVLQEEKRQLTVQLKSQKFLGHPT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AGRGRSELCLDLPDPPEDPVALETRSVGTWVRERDLGMPDGEAALAAKVAVLETQLKKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AGRGRSELCLDLPDPPEDPVALETRSVGTWVRERDLGMPDGEAALAAKVAVLETQLKKAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD QELQAAQARQADPQPQAWPPPDSPVRVDTVRVVEGPREVEVVASTAAGAPAQRAQSLEPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QELQAAQARQADPQPQAWPPPDSPVRVDTVRVVEGPREVEVVASTAAGAPAQRAQSLEPY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GTGLRALAMPGRPESPPVFRSQEVVETMCPVPAAATSNVHMVKKISITERSCDGAAGLPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GTGLRALAMPGRPESPPVFRSQEVVETMCPVPAAATSNVHMVKKISITERSCDGAAGLPE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KSD VPAESSSSPPGSEVASLTQPEKSTGRVPTQEPTHREPTRQAASQESEEAGGT--------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VPAESSSSPPGSEVASLTQPEKSTGRVPTQEPTHREPTRQAASQESEEAGGTAPPLSSPP
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD GGPPAGVRSIMKRKEEVADPTAHRRSLQFVGVNGGYESSSEDSSTAENISDNNSTENEAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS54 GGPPAGVRSIMKRKEEVADPTAHRRSLQFVGVNGGYESSSEDSSTAENISDNDSTENEAP
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD EPRERVPSVAEAPQLRPAGTAAAKTSRQECQLSRESQHIPTAEGASGSNTEEEIRMELSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EPRERVPSVAEAPQLRPAGTAAAKTSRQECQLSRESQHIPTAEGASGSNTEEEIRMELSP
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD DLISACLALEKYLDNPNALTERELKVAYTTVLQEWLRLACRSDAHPELVRRHLVTFRAMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DLISACLALEKYLDNPNALTERELKVAYTTVLQEWLRLACRSDAHPELVRRHLVTFRAMS
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KSD ARLLDYVVNIADSNGNTALHYSVSHANFPVVQQLLDSGVCKVDKQNRAGYSPIMLTALAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ARLLDYVVNIADSNGNTALHYSVSHANFPVVQQLLDSGVCKVDKQNRAGYSPIMLTALAT
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KSD LKTQDDIETVLQLFRLGNINAKASQAGQTALMLAVSHGRVDVVKALLACEADVNVQDDDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LKTQDDIETVLQLFRLGNINAKASQAGQTALMLAVSHGRVDVVKALLACEADVNVQDDDG
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KSD STALMCACEHGHKEIAGLLLAVPSCDISLTDRDGSTALMVALDAGQSEIASMLYSRMNIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 STALMCACEHGHKEIAGLLLAVPSCDISLTDRDGSTALMVALDAGQSEIASMLYSRMNIK
790 800 810 820 830 840
840 850
pF1KSD CSFAPMSDDESPTSSSAEE
:::::::::::::::::::
CCDS54 CSFAPMSDDESPTSSSAEE
850
>>CCDS6441.1 KANK1 gene_id:23189|Hs108|chr9 (1194 aa)
initn: 1499 init1: 1026 opt: 1101 Z-score: 714.7 bits: 143.8 E(32554): 1.7e-33
Smith-Waterman score: 1101; 44.6% identity (73.5% similar) in 419 aa overlap (422-837:759-1174)
400 410 420 430 440 450
pF1KSD PAAATSNVHMVKKISITERSCDGAAGLPEVPAESSSSPPGSEVA-SLTQPEKSTGRVPTQ
: :..: : .::. : .: .: :::
CCDS64 NPDFQKTSLGKITGNYLGYTCKCGGLQSGSPLSSQTSQPEQEVGTSEGKPISSLDAFPTQ
730 740 750 760 770 780
460 470 480 490 500 510
pF1KSD EPTHREPTRQAASQESEEAGGTGGPPAGVRSIMKRKEEVADPTAHRRSLQFVGVNGGYES
: : :. . .: . . . . ..::::.:. : .. ...:::::.:::::.
CCDS64 EGTLS-PVNLTDDQIAAGLYACTNNESTLKSIMKKKDGNKDSNGAKKNLQFVGINGGYET
790 800 810 820 830 840
520 530 540 550 560
pF1KSD -SSEDSSTAENISDNNSTENEAPE-PRERVPSVAEAPQLRPAGTAAAKTSRQECQLSRES
::.:::. :. :.... : .. : : :. : . : . . .. . . .:
CCDS64 TSSDDSSSDESSSSESDDECDVIEYPLEE-EEEEEDEDTRGMAEGHHAVNIEGLKSARVE
850 860 870 880 890 900
570 580 590 600 610 620
pF1KSD QHIPTAEGASGSNTEEEIRMELSPDLISACLALEKYLDNPNALTERELKVAYTTVLQEWL
... . : ..: . :.::: ..::: :.. ...:.::: .... .:. .::.
CCDS64 DEMQVQE-CEPEKVEIRERYELSEKMLSACNLLKNTINDPKALTSKDMRFCLNTLQHEWF
910 920 930 940 950 960
630 640 650 660 670 680
pF1KSD RLACRSDAHPELVRRHLVTFRAMSARLLDYVVNIADSNGNTALHYSVSHANFPVVQQLLD
:.. ...: : .: ....:.:.: .: ::.:.::.::::::::::::.:: .:. :::
CCDS64 RVSSQKSAIPAMVGDYIAAFEAISPDVLRYVINLADGNGNTALHYSVSHSNFEIVKLLLD
970 980 990 1000 1010 1020
690 700 710 720 730 740
pF1KSD SGVCKVDKQNRAGYSPIMLTALATLKTQDDIETVLQLFRLGNINAKASQAGQTALMLAVS
. ::.::.::.:::.::::.:::..... :.. : .:: :..:::::::::::::::::
CCDS64 ADVCNVDHQNKAGYTPIMLAALAAVEAEKDMRIVEELFGCGDVNAKASQAGQTALMLAVS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
750 760 770 780 790 800
pF1KSD HGRVDVVKALLACEADVNVQDDDGSTALMCACEHGHKEIAGLLLAVPSCDISLTDRDGST
:::.:.::.:::: ::::.:::.:::::::: :::: ::. :::: :.:. : : ::::
CCDS64 HGRIDMVKGLLACGADVNIQDDEGSTALMCASEHGHVEIVKLLLAQPGCNGHLEDNDGST
1090 1100 1110 1120 1130 1140
810 820 830 840 850
pF1KSD ALMVALDAGQSEIASMLYSRMNIKCSFAPMSDDESPTSSSAEE
:: .::.::...:: .::...:. . .:
CCDS64 ALSIALEAGHKDIAVLLYAHVNFAKAQSPGTPRLGRKTSPGPTHRGSFD
1150 1160 1170 1180 1190
>>CCDS34976.1 KANK1 gene_id:23189|Hs108|chr9 (1352 aa)
initn: 1724 init1: 1026 opt: 1101 Z-score: 714.0 bits: 143.8 E(32554): 1.9e-33
Smith-Waterman score: 1101; 44.6% identity (73.5% similar) in 419 aa overlap (422-837:917-1332)
400 410 420 430 440 450
pF1KSD PAAATSNVHMVKKISITERSCDGAAGLPEVPAESSSSPPGSEVA-SLTQPEKSTGRVPTQ
: :..: : .::. : .: .: :::
CCDS34 NPDFQKTSLGKITGNYLGYTCKCGGLQSGSPLSSQTSQPEQEVGTSEGKPISSLDAFPTQ
890 900 910 920 930 940
460 470 480 490 500 510
pF1KSD EPTHREPTRQAASQESEEAGGTGGPPAGVRSIMKRKEEVADPTAHRRSLQFVGVNGGYES
: : :. . .: . . . . ..::::.:. : .. ...:::::.:::::.
CCDS34 EGTLS-PVNLTDDQIAAGLYACTNNESTLKSIMKKKDGNKDSNGAKKNLQFVGINGGYET
950 960 970 980 990 1000
520 530 540 550 560
pF1KSD -SSEDSSTAENISDNNSTENEAPE-PRERVPSVAEAPQLRPAGTAAAKTSRQECQLSRES
::.:::. :. :.... : .. : : :. : . : . . .. . . .:
CCDS34 TSSDDSSSDESSSSESDDECDVIEYPLEE-EEEEEDEDTRGMAEGHHAVNIEGLKSARVE
1010 1020 1030 1040 1050 1060
570 580 590 600 610 620
pF1KSD QHIPTAEGASGSNTEEEIRMELSPDLISACLALEKYLDNPNALTERELKVAYTTVLQEWL
... . : ..: . :.::: ..::: :.. ...:.::: .... .:. .::.
CCDS34 DEMQVQE-CEPEKVEIRERYELSEKMLSACNLLKNTINDPKALTSKDMRFCLNTLQHEWF
1070 1080 1090 1100 1110 1120
630 640 650 660 670 680
pF1KSD RLACRSDAHPELVRRHLVTFRAMSARLLDYVVNIADSNGNTALHYSVSHANFPVVQQLLD
:.. ...: : .: ....:.:.: .: ::.:.::.::::::::::::.:: .:. :::
CCDS34 RVSSQKSAIPAMVGDYIAAFEAISPDVLRYVINLADGNGNTALHYSVSHSNFEIVKLLLD
1130 1140 1150 1160 1170 1180
690 700 710 720 730 740
pF1KSD SGVCKVDKQNRAGYSPIMLTALATLKTQDDIETVLQLFRLGNINAKASQAGQTALMLAVS
. ::.::.::.:::.::::.:::..... :.. : .:: :..:::::::::::::::::
CCDS34 ADVCNVDHQNKAGYTPIMLAALAAVEAEKDMRIVEELFGCGDVNAKASQAGQTALMLAVS
1190 1200 1210 1220 1230 1240
750 760 770 780 790 800
pF1KSD HGRVDVVKALLACEADVNVQDDDGSTALMCACEHGHKEIAGLLLAVPSCDISLTDRDGST
:::.:.::.:::: ::::.:::.:::::::: :::: ::. :::: :.:. : : ::::
CCDS34 HGRIDMVKGLLACGADVNIQDDEGSTALMCASEHGHVEIVKLLLAQPGCNGHLEDNDGST
1250 1260 1270 1280 1290 1300
810 820 830 840 850
pF1KSD ALMVALDAGQSEIASMLYSRMNIKCSFAPMSDDESPTSSSAEE
:: .::.::...:: .::...:. . .:
CCDS34 ALSIALEAGHKDIAVLLYAHVNFAKAQSPGTPRLGRKTSPGPTHRGSFD
1310 1320 1330 1340 1350
>>CCDS620.1 KANK4 gene_id:163782|Hs108|chr1 (995 aa)
initn: 1144 init1: 776 opt: 941 Z-score: 613.6 bits: 124.8 E(32554): 7.4e-28
Smith-Waterman score: 960; 30.5% identity (57.3% similar) in 857 aa overlap (2-825:167-983)
10 20
pF1KSD MAQVLHVPAPF-PGTP-GPASPPAFPAKDPD
: .:: : :: :: .:::.:
CCDS62 TRQLEAAEPEDAELTFGSGRPQLLRASSMPATLLHSRASEEPGLSLGPPAPPALP-----
140 150 160 170 180 190
30 40 50 60 70
pF1KSD PPYSVETPYGYRLDLDFLKYVDDIEKGHTLRRVAVQRRPRL----SSLPRG---------
: . : : : : . .. . :. : : :.: . :.:
CCDS62 -PLQGE---GSVCDGTF-EPAEGLAGFHSSSPRASTRIPELVQEGAEPPEGVVKVPNHLP
200 210 220 230 240
80 90 100 110 120 130
pF1KSD -PGSWWTSTESLCSNASGDSRHSAYSYCGRGFYPQYGALETRGGFNPRVERTLLDARRRL
:: .. . : . ...:.: : : . .: : :: . .:
CCDS62 LPGPPFSFQNVLVVLEDKEDEHNARE-AEVLFTPGSPTPSPPPLPSPIPENELLLEEIEL
250 260 270 280 290 300
140 150 160 170 180 190
pF1KSD EDQAATPTGLGSLTPSAAGSTASLVGVGLPPPTPRS-SGLSTPVPPSAGHLAHVREQMAG
. . : . . : .. ..:: : : :.:. : :.:. :..:
CCDS62 NISEIPPPPPVEVDMRSIGIRVTEESLGLARVDPGSISSLKQQVSALEGELSGRTEELAQ
310 320 330 340 350 360
200 210 220 230 240 250
pF1KSD ALRKLRQLEEQVKLIPVLQVKLSVLQEEKRQLTV-QLKSQKFLGHPTAGRGRSELCLDLP
. :.: ::..: .. . ..: ..:: ::..: . .:.... ..
CCDS62 VRTALQQQEEEIK------AREQRIREL--EFTVAQLEGQFHQENAKDTQGQTDVMVNT-
370 380 390 400 410
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::: .: :: : .. :: ..:. . .. : : :. :
CCDS62 ----DPVHGLLTRESCDKGIEVNLLGSMESESWGHRGEENGLLWGPDGHKQGNQSPAERV
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320 330 340 350 360
pF1KSD ADPQPQAWPPPDSPVRVDTVRV---VEGPREVEVVASTAAGAP--AQRAQSLEPYGTGLR
:: . :..: .: : : . ..: ... :.: . :. . .:. :
CCDS62 LLPQLSL---PQGPEQVLTSSVHSFLSTELRIEEAGTEQEGGPQGGTRGAGGFLWGSD-R
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370 380 390 400 410 420
pF1KSD ALAMPGRPESPPVFRSQEVVETMCPVPAAATSNVHMVKKIS--ITER-SCDGAAGLPEVP
:: :. . ..: :. :: . ..::::. . :. .: : ::.
CCDS62 KTPPAGREETSSNLPGKEHPGRPPSSPTDATIG-QYVKKIQELLQEQWNCL-EHGYPELA
530 540 550 560 570 580
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pF1KSD AESSSSPPGSEVASL-TQPEKSTGRVPTQEPTHREPTRQAASQESEEAGGTGGPPAGVRS
:. . :.:...:. .: .: . . . .. .: .. .. : . : ....:
CCDS62 --SAIKQPASKLSSIQSQLLSSLNLLLSAYSAQAHPPKEPPASSSSPPVEIS-PSTSLKS
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:::.:. : .. ...:::::::::::..: . ...:. . .. ...:: : . :
CCDS62 IMKKKDYGFRAGGNGTKKNLQFVGVNGGYETTSSEETSGEDSTPEDLSDSEA-EKKCDGP
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pF1KSD SVAEAPQLRPAGTAAAKTSRQECQLSRESQHIPTAEGASGSNTEEEIRMELSPDLISACL
. .. . . . :. . :. ..:: . : ... : :.. : ....::
CCDS62 DHKHVKDAHLTCEAGQGIPEGTCHAAQES-----GPGEEVPHSKAE-RYKPSEEFLNACR
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:: ..: . .. :.. :. . .:. :::.:.. :... : .: .: . : ..: .
CCDS62 ALSQHLPETGTTTDQLLRQSLNTISQEWFRVSSRKSSSPAVVASYLHEVQPHSPHFLKLL
760 770 780 790 800 810
660 670 680 690 700 710
pF1KSD VNIADSNGNTALHYSVSHANFPVVQQLLDSGVCKVDKQNRAGYSPIMLTALATLKTQDDI
::.:: ::::::::::::.:: .:. ::..:::.::.::.:::. .:.: ::. .:..:.
CCDS62 VNLADHNGNTALHYSVSHSNFSIVKLLLETGVCNVDHQNKAGYTAVMITPLASAETNEDM
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720 730 740 750 760 770
pF1KSD ETVLQLFRLGNINAKASQAGQTALMLAVSHGRVDVVKALLACEADVNVQDDDGSTALMCA
.: .:.: ::.: .:.:.:::::::.::: : :.:.:::.:.::::.:: :::.::: :
CCDS62 AVVWKLLREGNVNIQATQGGQTALMLGVSHDREDMVQALLSCQADVNLQDHDGSSALMVA
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pF1KSD CEHGHKEIAGLLLAVPSCDISLTDRDGSTALMVALDAG-QSEIASMLYSRMNIKCSFAPM
:.::. ... :::: :.:: ::::. : ::: .:: . . :::..:
CCDS62 CHHGNVDLVRLLLAHPACDSSLTDKAGRTALSIALKSPTHMEIAGLLRAHAEQGRSLGL
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CCDS81 GVNGGYETTSSEETSGEDSTPEDLSDSEA-EKKCDGPDHKHVKDAHLTCEAGQGIPEGTC
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CCDS81 HAAQESG--P-GEEVPHSKAE---RYKPSEEFLNACRALSQHLPETGTTTDQLLRQSLNT
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CCDS81 ISQEWFRVSSRKSSSPAVVASYLHEVQPHSPHFLKLLVNLADHNGNTALHYSVSHSNFSI
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CCDS81 VKLLLETGVCNVDHQNKAGYTAVMITPLASAETNEDMAVVWKLLREGNVNIQATQGGQTA
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CCDS81 LMLGVSHDREDMVQALLSCQADVNLQDHDGSSALMVACHHGNVDLVRLLLAHPACDSSLT
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CCDS81 DKAGRTALSIALKSPTHMEIAGLLRAHAEQGRSLGL
340 350 360
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CCDS12 AARRAPGPPTSRRPR-APRPGLAGARSPGAW-TSSESLASDDGGAPGILSQGAPSGLLMQ
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CCDS12 PLSPRAPVR---NPRVEHTLRETSRRLE-LAQTH----ERAPSP--------GRGVPR-S
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CCDS12 PRGSGRSSPAPNLAPASPGPAQLQLVREQMAAALRRLRELEDQARTLPELQEQVRALRAE
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CCDS12 KARLL-------------AGRAQ-------PEP--DGEA-ETR-------------PD--
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]