Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1537
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1537, 590 aa
1>>>pF1KSDA1537 590 - 590 aa - 590 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.6517+/-0.00169; mu= -13.6620+/- 0.100
mean_var=514.9595+/-110.620, 0's: 0 Z-trim(108.9): 93 B-trim: 235 in 2/51
Lambda= 0.056518
statistics sampled from 10490 (10549) to 10490 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.658), E-opt: 0.2 (0.324), width: 16
Scan time: 3.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS81470.1 RUFY2 gene_id:55680|Hs108|chr10 ( 606) 3801 325.3 1.3e-88
CCDS41534.1 RUFY2 gene_id:55680|Hs108|chr10 ( 641) 3801 325.4 1.4e-88
CCDS34312.1 RUFY1 gene_id:80230|Hs108|chr5 ( 600) 2458 215.8 1.2e-55
CCDS4445.2 RUFY1 gene_id:80230|Hs108|chr5 ( 708) 2458 215.9 1.4e-55
CCDS60544.1 RUFY2 gene_id:55680|Hs108|chr10 ( 379) 2148 190.4 3.6e-48
CCDS44414.1 RUFY2 gene_id:55680|Hs108|chr10 ( 403) 1688 152.9 7.4e-37
CCDS75138.1 RUFY3 gene_id:22902|Hs108|chr4 ( 567) 1285 120.2 7.3e-27
CCDS34001.1 RUFY3 gene_id:22902|Hs108|chr4 ( 620) 1285 120.2 7.8e-27
CCDS3547.1 RUFY3 gene_id:22902|Hs108|chr4 ( 469) 1247 117.0 5.5e-26
CCDS47068.1 RUFY3 gene_id:22902|Hs108|chr4 ( 506) 1247 117.0 5.8e-26
>>CCDS81470.1 RUFY2 gene_id:55680|Hs108|chr10 (606 aa)
initn: 3801 init1: 3801 opt: 3801 Z-score: 1704.1 bits: 325.3 E(32554): 1.3e-88
Smith-Waterman score: 3801; 100.0% identity (100.0% similar) in 590 aa overlap (1-590:17-606)
10 20 30 40
pF1KSD MAKLSIKGLIESALSFGRTLDSDYPPLQQFFVVMEHCLKHGLKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MATKDPTAVERANLLNMAKLSIKGLIESALSFGRTLDSDYPPLQQFFVVMEHCLKHGLKV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD RKSFLSYNKTIWGPLELVEKLYPEAEEIGASVRDLPGLKTPLGRARAWLRLALMQKKMAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RKSFLSYNKTIWGPLELVEKLYPEAEEIGASVRDLPGLKTPLGRARAWLRLALMQKKMAD
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD YLRCLIIQRDLLSEFYEYHALMMEEEGAVIVGLLVGLNVIDANLCVKGEDLDSQVGVIDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 YLRCLIIQRDLLSEFYEYHALMMEEEGAVIVGLLVGLNVIDANLCVKGEDLDSQVGVIDF
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KSD SMYLKNEEDIGNKERNVQIAAILDQKNYVEELNRQLNSTVSSLHSRVDSLEKSNTKLIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SMYLKNEEDIGNKERNVQIAAILDQKNYVEELNRQLNSTVSSLHSRVDSLEKSNTKLIEE
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KSD LAIAKNNIIKLQEENHQLRSENKLILMKTQQHLEVTKVDVETELQTYKHSRQGLDEMYNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LAIAKNNIIKLQEENHQLRSENKLILMKTQQHLEVTKVDVETELQTYKHSRQGLDEMYNE
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KSD ARRQLRDESQLRQDVENELAVQVSMKHEIELAMKLLEKDIHEKQDTLIGLRQQLEEVKAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ARRQLRDESQLRQDVENELAVQVSMKHEIELAMKLLEKDIHEKQDTLIGLRQQLEEVKAI
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KSD NIEMYQKLQGSEDGLKEKNEIIARLEEKTNKITAAMRQLEQRLQQAEKAQMEAEDEDEKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NIEMYQKLQGSEDGLKEKNEIIARLEEKTNKITAAMRQLEQRLQQAEKAQMEAEDEDEKY
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KSD LQECLSKSDSLQKQISQKEKQLVQLETDLKIEKEWRQTLQEDLQKEKDALSHLRNETQQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LQECLSKSDSLQKQISQKEKQLVQLETDLKIEKEWRQTLQEDLQKEKDALSHLRNETQQI
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KSD ISLKKEFLNLQDENQQLKKIYHEQEQALQELGNKLSESKLKIEDIKEANKALQGLVWLKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ISLKKEFLNLQDENQQLKKIYHEQEQALQELGNKLSESKLKIEDIKEANKALQGLVWLKD
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KSD KEATHCKLCEKEFSLSKRKHHCRNCGEIFCNACSDNELPLPSSPKPVRVCDSCHALLIQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KEATHCKLCEKEFSLSKRKHHCRNCGEIFCNACSDNELPLPSSPKPVRVCDSCHALLIQR
550 560 570 580 590 600
590
pF1KSD CSSNLP
::::::
CCDS81 CSSNLP
>>CCDS41534.1 RUFY2 gene_id:55680|Hs108|chr10 (641 aa)
initn: 3801 init1: 3801 opt: 3801 Z-score: 1703.8 bits: 325.4 E(32554): 1.4e-88
Smith-Waterman score: 3801; 100.0% identity (100.0% similar) in 590 aa overlap (1-590:52-641)
10 20 30
pF1KSD MAKLSIKGLIESALSFGRTLDSDYPPLQQF
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DAEGGRRGMLTRRSLATKDPTAVERANLLNMAKLSIKGLIESALSFGRTLDSDYPPLQQF
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KSD FVVMEHCLKHGLKVRKSFLSYNKTIWGPLELVEKLYPEAEEIGASVRDLPGLKTPLGRAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FVVMEHCLKHGLKVRKSFLSYNKTIWGPLELVEKLYPEAEEIGASVRDLPGLKTPLGRAR
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KSD AWLRLALMQKKMADYLRCLIIQRDLLSEFYEYHALMMEEEGAVIVGLLVGLNVIDANLCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AWLRLALMQKKMADYLRCLIIQRDLLSEFYEYHALMMEEEGAVIVGLLVGLNVIDANLCV
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KSD KGEDLDSQVGVIDFSMYLKNEEDIGNKERNVQIAAILDQKNYVEELNRQLNSTVSSLHSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KGEDLDSQVGVIDFSMYLKNEEDIGNKERNVQIAAILDQKNYVEELNRQLNSTVSSLHSR
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KSD VDSLEKSNTKLIEELAIAKNNIIKLQEENHQLRSENKLILMKTQQHLEVTKVDVETELQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VDSLEKSNTKLIEELAIAKNNIIKLQEENHQLRSENKLILMKTQQHLEVTKVDVETELQT
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KSD YKHSRQGLDEMYNEARRQLRDESQLRQDVENELAVQVSMKHEIELAMKLLEKDIHEKQDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 YKHSRQGLDEMYNEARRQLRDESQLRQDVENELAVQVSMKHEIELAMKLLEKDIHEKQDT
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KSD LIGLRQQLEEVKAINIEMYQKLQGSEDGLKEKNEIIARLEEKTNKITAAMRQLEQRLQQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LIGLRQQLEEVKAINIEMYQKLQGSEDGLKEKNEIIARLEEKTNKITAAMRQLEQRLQQA
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KSD EKAQMEAEDEDEKYLQECLSKSDSLQKQISQKEKQLVQLETDLKIEKEWRQTLQEDLQKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EKAQMEAEDEDEKYLQECLSKSDSLQKQISQKEKQLVQLETDLKIEKEWRQTLQEDLQKE
450 460 470 480 490 500
460 470 480 490 500 510
pF1KSD KDALSHLRNETQQIISLKKEFLNLQDENQQLKKIYHEQEQALQELGNKLSESKLKIEDIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KDALSHLRNETQQIISLKKEFLNLQDENQQLKKIYHEQEQALQELGNKLSESKLKIEDIK
510 520 530 540 550 560
520 530 540 550 560 570
pF1KSD EANKALQGLVWLKDKEATHCKLCEKEFSLSKRKHHCRNCGEIFCNACSDNELPLPSSPKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EANKALQGLVWLKDKEATHCKLCEKEFSLSKRKHHCRNCGEIFCNACSDNELPLPSSPKP
570 580 590 600 610 620
580 590
pF1KSD VRVCDSCHALLIQRCSSNLP
::::::::::::::::::::
CCDS41 VRVCDSCHALLIQRCSSNLP
630 640
>>CCDS34312.1 RUFY1 gene_id:80230|Hs108|chr5 (600 aa)
initn: 2458 init1: 2458 opt: 2458 Z-score: 1112.3 bits: 215.8 E(32554): 1.2e-55
Smith-Waterman score: 2458; 62.9% identity (88.4% similar) in 587 aa overlap (1-587:11-597)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAKLSIKGLIESALSFGRTLDSDYPPLQQFFVVMEHCLKHGLKVRKSFLS
: ::::: :..::::.::.::.:. :::::::::::::::::::.:::..
CCDS34 MMEERANLMHMMKLSIKVLLQSALSLGRSLDADHAPLQQFFVVMEHCLKHGLKVKKSFIG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD YNKTIWGPLELVEKLYPEAEEIGASVRDLPGLKTPLGRARAWLRLALMQKKMADYLRCLI
::...::::::::: ::: .:..:::.:: ::: .::.:::: :::::::.::::. ::
CCDS34 QNKSFFGPLELVEKLCPEASDIATSVRNLPELKTAVGRGRAWLYLALMQKKLADYLKVLI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IQRDLLSEFYEYHALMMEEEGAVIVGLLVGLNVIDANLCVKGEDLDSQVGVIDFSMYLKN
.. ::::::: .:::::::: :::::::::::.:::::.:::::::::::::::.:::.
CCDS34 DNKHLLSEFYEPEALMMEEEGMVIVGLLVGLNVLDANLCLKGEDLDSQVGVIDFSLYLKD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD EEDIGNKERNVQIAAILDQKNYVEELNRQLNSTVSSLHSRVDSLEKSNTKLIEELAIAKN
.:. . ... .:. .::::::::::::.:. ::..:....:.:::.:.:: :::. : .
CCDS34 VQDLDGGKEHERITDVLDQKNYVEELNRHLSCTVGDLQTKIDGLEKTNSKLQEELSAATD
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD NIIKLQEENHQLRSENKLILMKTQQHLEVTKVDVETELQTYKHSRQGLDEMYNEARRQLR
: .::::..::: .:.:: .... .:.:: :...::.:::..::::::::... .::.
CCDS34 RICSLQEEQQQLREQNELIRERSEKSVEITKQDTKVELETYKQTRQGLDEMYSDVWKQLK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD DESQLRQDVENELAVQVSMKHEIELAMKLLEKDIHEKQDTLIGLRQQLEEVKAINIEMYQ
.:...: ..:.:: .:..:: :.:.:::::::: :::::::..::::::::::::..:..
CCDS34 EEKKVRLELEKELELQIGMKTEMEIAMKLLEKDTHEKQDTLVALRQQLEEVKAINLQMFH
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD KLQGSEDGLKEKNEIIARLEEKTNKITAAMRQLEQRLQQAEKAQMEAEDEDEKYLQECLS
: :..:..:..::: :. .: :::.. ..:.:.:.:::..:.:.. ::....: :: .
CCDS34 KAQNAESSLQQKNEAITSFEGKTNQVMSSMKQMEERLQHSERARQGAEERSHKLQQELGG
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD KSDSLQKQISQKEKQLVQLETDLKIEKEWRQTLQEDLQKEKDALSHLRNETQQIISLKKE
. .:: :.:: ..: .:: .:: ::: ::.::..::.:::. : :: : ::. .::::
CCDS34 RIGALQLQLSQLHEQCSSLEKELKSEKEQRQALQRELQHEKDTSSLLRMELQQVEGLKKE
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD FLNLQDENQQLKKIYHEQEQALQELGNKLSESKLKIEDIKEANKALQGLVWLKDKEATHC
. .::::. .:.:: .::::::::.: .::.::::.:::::.:.::.: .:::: :::::
CCDS34 LRELQDEKAELQKICEEQEQALQEMGLHLSQSKLKMEDIKEVNQALKGHAWLKDDEATHC
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD KLCEKEFSLSKRKHHCRNCGEIFCNACSDNELPLPSSPKPVRVCDSCHALLIQRCSSNLP
. ::::::.:.:::::::::.::::.::.::: ::: :::::::::::.::.:::::
CCDS34 RQCEKEFSISRRKHHCRNCGHIFCNTCSSNELALPSYPKPVRVCDSCHTLLLQRCSSTAS
550 560 570 580 590 600
>>CCDS4445.2 RUFY1 gene_id:80230|Hs108|chr5 (708 aa)
initn: 2458 init1: 2458 opt: 2458 Z-score: 1111.4 bits: 215.9 E(32554): 1.4e-55
Smith-Waterman score: 2458; 62.9% identity (88.4% similar) in 587 aa overlap (1-587:119-705)
10 20 30
pF1KSD MAKLSIKGLIESALSFGRTLDSDYPPLQQF
: ::::: :..::::.::.::.:. :::::
CCDS44 AGLGGGDSGDGTARAASKCQMMEERANLMHMMKLSIKVLLQSALSLGRSLDADHAPLQQF
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KSD FVVMEHCLKHGLKVRKSFLSYNKTIWGPLELVEKLYPEAEEIGASVRDLPGLKTPLGRAR
::::::::::::::.:::.. ::...::::::::: ::: .:..:::.:: ::: .::.:
CCDS44 FVVMEHCLKHGLKVKKSFIGQNKSFFGPLELVEKLCPEASDIATSVRNLPELKTAVGRGR
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KSD AWLRLALMQKKMADYLRCLIIQRDLLSEFYEYHALMMEEEGAVIVGLLVGLNVIDANLCV
::: :::::::.::::. :: .. ::::::: .:::::::: :::::::::::.:::::.
CCDS44 AWLYLALMQKKLADYLKVLIDNKHLLSEFYEPEALMMEEEGMVIVGLLVGLNVLDANLCL
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190 200 210
pF1KSD KGEDLDSQVGVIDFSMYLKNEEDIGNKERNVQIAAILDQKNYVEELNRQLNSTVSSLHSR
:::::::::::::::.:::. .:. . ... .:. .::::::::::::.:. ::..:...
CCDS44 KGEDLDSQVGVIDFSLYLKDVQDLDGGKEHERITDVLDQKNYVEELNRHLSCTVGDLQTK
270 280 290 300 310 320
220 230 240 250 260 270
pF1KSD VDSLEKSNTKLIEELAIAKNNIIKLQEENHQLRSENKLILMKTQQHLEVTKVDVETELQT
.:.:::.:.:: :::. : . : .::::..::: .:.:: .... .:.:: :...::.:
CCDS44 IDGLEKTNSKLQEELSAATDRICSLQEEQQQLREQNELIRERSEKSVEITKQDTKVELET
330 340 350 360 370 380
280 290 300 310 320 330
pF1KSD YKHSRQGLDEMYNEARRQLRDESQLRQDVENELAVQVSMKHEIELAMKLLEKDIHEKQDT
::..::::::::... .::..:...: ..:.:: .:..:: :.:.:::::::: ::::::
CCDS44 YKQTRQGLDEMYSDVWKQLKEEKKVRLELEKELELQIGMKTEMEIAMKLLEKDTHEKQDT
390 400 410 420 430 440
340 350 360 370 380 390
pF1KSD LIGLRQQLEEVKAINIEMYQKLQGSEDGLKEKNEIIARLEEKTNKITAAMRQLEQRLQQA
:..::::::::::::..:..: :..:..:..::: :. .: :::.. ..:.:.:.:::..
CCDS44 LVALRQQLEEVKAINLQMFHKAQNAESSLQQKNEAITSFEGKTNQVMSSMKQMEERLQHS
450 460 470 480 490 500
400 410 420 430 440 450
pF1KSD EKAQMEAEDEDEKYLQECLSKSDSLQKQISQKEKQLVQLETDLKIEKEWRQTLQEDLQKE
:.:.. ::....: :: .. .:: :.:: ..: .:: .:: ::: ::.::..::.:
CCDS44 ERARQGAEERSHKLQQELGGRIGALQLQLSQLHEQCSSLEKELKSEKEQRQALQRELQHE
510 520 530 540 550 560
460 470 480 490 500 510
pF1KSD KDALSHLRNETQQIISLKKEFLNLQDENQQLKKIYHEQEQALQELGNKLSESKLKIEDIK
::. : :: : ::. .::::. .::::. .:.:: .::::::::.: .::.::::.::::
CCDS44 KDTSSLLRMELQQVEGLKKELRELQDEKAELQKICEEQEQALQEMGLHLSQSKLKMEDIK
570 580 590 600 610 620
520 530 540 550 560 570
pF1KSD EANKALQGLVWLKDKEATHCKLCEKEFSLSKRKHHCRNCGEIFCNACSDNELPLPSSPKP
:.:.::.: .:::: :::::. ::::::.:.:::::::::.::::.::.::: ::: :::
CCDS44 EVNQALKGHAWLKDDEATHCRQCEKEFSISRRKHHCRNCGHIFCNTCSSNELALPSYPKP
630 640 650 660 670 680
580 590
pF1KSD VRVCDSCHALLIQRCSSNLP
::::::::.::.:::::
CCDS44 VRVCDSCHTLLLQRCSSTAS
690 700
>>CCDS60544.1 RUFY2 gene_id:55680|Hs108|chr10 (379 aa)
initn: 2148 init1: 2148 opt: 2148 Z-score: 978.3 bits: 190.4 E(32554): 3.6e-48
Smith-Waterman score: 2148; 100.0% identity (100.0% similar) in 342 aa overlap (44-385:2-343)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD LSFGRTLDSDYPPLQQFFVVMEHCLKHGLKVRKSFLSYNKTIWGPLELVEKLYPEAEEIG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MVRKSFLSYNKTIWGPLELVEKLYPEAEEIG
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KSD ASVRDLPGLKTPLGRARAWLRLALMQKKMADYLRCLIIQRDLLSEFYEYHALMMEEEGAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ASVRDLPGLKTPLGRARAWLRLALMQKKMADYLRCLIIQRDLLSEFYEYHALMMEEEGAV
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KSD IVGLLVGLNVIDANLCVKGEDLDSQVGVIDFSMYLKNEEDIGNKERNVQIAAILDQKNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 IVGLLVGLNVIDANLCVKGEDLDSQVGVIDFSMYLKNEEDIGNKERNVQIAAILDQKNYV
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KSD EELNRQLNSTVSSLHSRVDSLEKSNTKLIEELAIAKNNIIKLQEENHQLRSENKLILMKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 EELNRQLNSTVSSLHSRVDSLEKSNTKLIEELAIAKNNIIKLQEENHQLRSENKLILMKT
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KSD QQHLEVTKVDVETELQTYKHSRQGLDEMYNEARRQLRDESQLRQDVENELAVQVSMKHEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 QQHLEVTKVDVETELQTYKHSRQGLDEMYNEARRQLRDESQLRQDVENELAVQVSMKHEI
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KSD ELAMKLLEKDIHEKQDTLIGLRQQLEEVKAINIEMYQKLQGSEDGLKEKNEIIARLEEKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ELAMKLLEKDIHEKQDTLIGLRQQLEEVKAINIEMYQKLQGSEDGLKEKNEIIARLEEKT
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KSD NKITAAMRQLEQRLQQAEKAQMEAEDEDEKYLQECLSKSDSLQKQISQKEKQLVQLETDL
::::::::::::
CCDS60 NKITAAMRQLEQSDNDLLTQTRTIAMSLVKCASSDTQDQYKLVKDISF
340 350 360 370
>>CCDS44414.1 RUFY2 gene_id:55680|Hs108|chr10 (403 aa)
initn: 1668 init1: 1668 opt: 1688 Z-score: 775.2 bits: 152.9 E(32554): 7.4e-37
Smith-Waterman score: 2126; 90.9% identity (91.2% similar) in 385 aa overlap (1-385:17-367)
10 20 30 40
pF1KSD MAKLSIKGLIESALSFGRTLDSDYPPLQQFFVVMEHCLKHGLKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MATKDPTAVERANLLNMAKLSIKGLIESALSFGRTLDSDYPPLQQFFVVMEHCLKHGLKV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD RKSFLSYNKTIWGPLELVEKLYPEAEEIGASVRDLPGLKTPLGRARAWLRLALMQKKMAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RKSFLSYNKTIWGPLELVEKLYPEAEEIGASVRDLPGL----------------------
70 80 90
110 120 130 140 150 160
pF1KSD YLRCLIIQRDLLSEFYEYHALMMEEEGAVIVGLLVGLNVIDANLCVKGEDLDSQVGVIDF
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ------------NEFYEYHALMMEEEGAVIVGLLVGLNVIDANLCVKGEDLDSQVGVIDF
100 110 120 130 140
170 180 190 200 210 220
pF1KSD SMYLKNEEDIGNKERNVQIAAILDQKNYVEELNRQLNSTVSSLHSRVDSLEKSNTKLIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SMYLKNEEDIGNKERNVQIAAILDQKNYVEELNRQLNSTVSSLHSRVDSLEKSNTKLIEE
150 160 170 180 190 200
230 240 250 260 270 280
pF1KSD LAIAKNNIIKLQEENHQLRSENKLILMKTQQHLEVTKVDVETELQTYKHSRQGLDEMYNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LAIAKNNIIKLQEENHQLRSENKLILMKTQQHLEVTKVDVETELQTYKHSRQGLDEMYNE
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KSD ARRQLRDESQLRQDVENELAVQVSMKHEIELAMKLLEKDIHEKQDTLIGLRQQLEEVKAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ARRQLRDESQLRQDVENELAVQVSMKHEIELAMKLLEKDIHEKQDTLIGLRQQLEEVKAI
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KSD NIEMYQKLQGSEDGLKEKNEIIARLEEKTNKITAAMRQLEQRLQQAEKAQMEAEDEDEKY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NIEMYQKLQGSEDGLKEKNEIIARLEEKTNKITAAMRQLEQSDNDLLTQTRTIAMSLVKC
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KSD LQECLSKSDSLQKQISQKEKQLVQLETDLKIEKEWRQTLQEDLQKEKDALSHLRNETQQI
CCDS44 ASSDTQDQYKLVKDISF
390 400
>>CCDS75138.1 RUFY3 gene_id:22902|Hs108|chr4 (567 aa)
initn: 1439 init1: 1210 opt: 1285 Z-score: 595.7 bits: 120.2 E(32554): 7.3e-27
Smith-Waterman score: 1886; 53.1% identity (78.7% similar) in 588 aa overlap (1-588:22-565)
10 20 30
pF1KSD MAKLSIKGLIESALSFGRTLDSDYPPLQQFFVVMEHCLK
::::::::::::::..:::::::: ::::::::::::::
CCDS75 MRDDTEDPNYLMANERMNLMNMAKLSIKGLIESALNLGRTLDSDYAPLQQFFVVMEHCLK
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD HGLKVRKSFLSYNKTIWGPLELVEKLYPEAEEIGASVRDLPGLKTPLGRARAWLRLALMQ
::::..:.::. ::..:::::::::: ::: :: :::.::::::::.::.::::::::::
CCDS75 HGLKAKKTFLGQNKSFWGPLELVEKLVPEAAEITASVKDLPGLKTPVGRGRAWLRLALMQ
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD KKMADYLRCLIIQRDLLSEFYEYHALMMEEEGAVIVGLLVGLNVIDANLCVKGEDLDSQV
::...:.. :: ...::::::: .:::::::::.:.::::::::::::.:.:::::::::
CCDS75 KKLSEYMKALINKKELLSEFYEPNALMMEEEGAIIAGLLVGLNVIDANFCMKGEDLDSQV
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD GVIDFSMYLKNEEDIGNKERNVQIAAILDQKNYVEELNRQLNSTVSSLHSRVDSLEKSNT
::::::::::. .. . : . ::.::::::::::::::.::.::..:...::.::::::
CCDS75 GVIDFSMYLKDGNSSKGTEGDGQITAILDQKNYVEELNRHLNATVNNLQAKVDALEKSNT
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KSD KLIEELAIAKNNIIKLQEENHQLRSENKLILMKTQQHLEVTKVDVETELQTYKHSRQGLD
:: ::::.:.: :: :::: .... :.. :: :.. . :..: .
CCDS75 KLTEELAVANNRIITLQEEMERVKEESSYIL--------------ESNRKGPKQDRTAEG
250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KSD EMYNEARRQLRDESQLRQDVENELAVQVSMKHEIELAMKLLEKDIHEKQDTLIGLRQQLE
. .:::..:..:.::: :::.:: .:.::..:.:::::.::::. ::::.:..:::::.
CCDS75 QALSEARKHLKEETQLRLDVEKELEMQISMRQEMELAMKMLEKDVCEKQDALVSLRQQLD
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KSD EVKAINIEMYQKLQGSEDGLKEKNEIIARLEEKTNKITAAMRQLEQRLQQAEKAQMEAED
...:.. :. :::.:. :.:.:.:. .:::::::...:...::::::.:::.... ::
CCDS75 DLRALKHELAFKLQSSDLGVKQKSELNSRLEEKTNQMAATIKQLEQRLRQAERSRQSAEL
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KSD EDEKYLQECLSKSDSLQKQISQKEKQLVQLETDLKIEKEWRQTLQEDLQKEKDALSHLRN
... . :. .: .::: .. . .: ::: .:: ::: : ::.... .. .
CCDS75 DNRLFKQDFGDKINSLQLEVEELTRQRNQLELELKQEKERR------LQNDRSIPGRGSQ
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KSD ETQQIISLKKEFLNLQDENQQLKKIYHEQEQALQELGNKLSESKLKIEDIKEANKALQGL
.... .. :.. .:.:: .::: .:.. .:. . . : .. :
CCDS75 KSESKMDGKHK---MQEENVKLKKPLEESH-------------RLQPHPMDEQDQLL---
470 480 490 500
520 530 540 550 560 570
pF1KSD VWLKDKEATHCKLCEKEFSLSKRKHHCRNCGEIFCNACSDNELPLPSSPKPVRVCDSCHA
:..: :.::... ::. :. :.::. ::.::: :::::::: : :::. ::
CCDS75 --LSEKPQL-CQLCQEDGSLT--KNVCKNCSGTFCDACSTNELPLPSSIKLERVCNPCHK
510 520 530 540 550
580 590
pF1KSD LLIQRCSSNLP
:... :..
CCDS75 HLMKQYSTSPS
560
>>CCDS34001.1 RUFY3 gene_id:22902|Hs108|chr4 (620 aa)
initn: 1439 init1: 1210 opt: 1285 Z-score: 595.2 bits: 120.2 E(32554): 7.8e-27
Smith-Waterman score: 1886; 53.1% identity (78.7% similar) in 588 aa overlap (1-588:75-618)
10 20 30
pF1KSD MAKLSIKGLIESALSFGRTLDSDYPPLQQF
::::::::::::::..:::::::: :::::
CCDS34 LDDISLTPDPEPTHEDPNYLMANERMNLMNMAKLSIKGLIESALNLGRTLDSDYAPLQQF
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KSD FVVMEHCLKHGLKVRKSFLSYNKTIWGPLELVEKLYPEAEEIGASVRDLPGLKTPLGRAR
:::::::::::::..:.::. ::..:::::::::: ::: :: :::.::::::::.::.:
CCDS34 FVVMEHCLKHGLKAKKTFLGQNKSFWGPLELVEKLVPEAAEITASVKDLPGLKTPVGRGR
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KSD AWLRLALMQKKMADYLRCLIIQRDLLSEFYEYHALMMEEEGAVIVGLLVGLNVIDANLCV
:::::::::::...:.. :: ...::::::: .:::::::::.:.::::::::::::.:.
CCDS34 AWLRLALMQKKLSEYMKALINKKELLSEFYEPNALMMEEEGAIIAGLLVGLNVIDANFCM
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KSD KGEDLDSQVGVIDFSMYLKNEEDIGNKERNVQIAAILDQKNYVEELNRQLNSTVSSLHSR
:::::::::::::::::::. .. . : . ::.::::::::::::::.::.::..:...
CCDS34 KGEDLDSQVGVIDFSMYLKDGNSSKGTEGDGQITAILDQKNYVEELNRHLNATVNNLQAK
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KSD VDSLEKSNTKLIEELAIAKNNIIKLQEENHQLRSENKLILMKTQQHLEVTKVDVETELQT
::.:::::::: ::::.:.: :: :::: .... :.. :: :.. .
CCDS34 VDALEKSNTKLTEELAVANNRIITLQEEMERVKEESSYIL--------------ESNRKG
290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KSD YKHSRQGLDEMYNEARRQLRDESQLRQDVENELAVQVSMKHEIELAMKLLEKDIHEKQDT
:..: . . .:::..:..:.::: :::.:: .:.::..:.:::::.::::. ::::.
CCDS34 PKQDRTAEGQALSEARKHLKEETQLRLDVEKELEMQISMRQEMELAMKMLEKDVCEKQDA
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KSD LIGLRQQLEEVKAINIEMYQKLQGSEDGLKEKNEIIARLEEKTNKITAAMRQLEQRLQQA
:..:::::....:.. :. :::.:. :.:.:.:. .:::::::...:...::::::.::
CCDS34 LVSLRQQLDDLRALKHELAFKLQSSDLGVKQKSELNSRLEEKTNQMAATIKQLEQRLRQA
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KSD EKAQMEAEDEDEKYLQECLSKSDSLQKQISQKEKQLVQLETDLKIEKEWRQTLQEDLQKE
:.... :: ... . :. .: .::: .. . .: ::: .:: ::: : ::..
CCDS34 ERSRQSAELDNRLFKQDFGDKINSLQLEVEELTRQRNQLELELKQEKERR------LQND
460 470 480 490 500
460 470 480 490 500 510
pF1KSD KDALSHLRNETQQIISLKKEFLNLQDENQQLKKIYHEQEQALQELGNKLSESKLKIEDIK
.. .. ..... .. :.. .:.:: .::: .:.. .:. . .
CCDS34 RSIPGRGSQKSESKMDGKHK---MQEENVKLKKPLEESH-------------RLQPHPMD
510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KSD EANKALQGLVWLKDKEATHCKLCEKEFSLSKRKHHCRNCGEIFCNACSDNELPLPSSPKP
: .. : :..: :.::... ::. :. :.::. ::.::: :::::::: :
CCDS34 EQDQLL-----LSEKPQL-CQLCQEDGSLT--KNVCKNCSGTFCDACSTNELPLPSSIKL
550 560 570 580 590 600
580 590
pF1KSD VRVCDSCHALLIQRCSSNLP
:::. :: :... :..
CCDS34 ERVCNPCHKHLMKQYSTSPS
610 620
>>CCDS3547.1 RUFY3 gene_id:22902|Hs108|chr4 (469 aa)
initn: 1338 init1: 1210 opt: 1247 Z-score: 580.0 bits: 117.0 E(32554): 5.5e-26
Smith-Waterman score: 1563; 63.6% identity (87.0% similar) in 385 aa overlap (1-385:75-445)
10 20 30
pF1KSD MAKLSIKGLIESALSFGRTLDSDYPPLQQF
::::::::::::::..:::::::: :::::
CCDS35 LDDISLTPDPEPTHEDPNYLMANERMNLMNMAKLSIKGLIESALNLGRTLDSDYAPLQQF
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KSD FVVMEHCLKHGLKVRKSFLSYNKTIWGPLELVEKLYPEAEEIGASVRDLPGLKTPLGRAR
:::::::::::::..:.::. ::..:::::::::: ::: :: :::.::::::::.::.:
CCDS35 FVVMEHCLKHGLKAKKTFLGQNKSFWGPLELVEKLVPEAAEITASVKDLPGLKTPVGRGR
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KSD AWLRLALMQKKMADYLRCLIIQRDLLSEFYEYHALMMEEEGAVIVGLLVGLNVIDANLCV
:::::::::::...:.. :: ...::::::: .:::::::::.:.::::::::::::.:.
CCDS35 AWLRLALMQKKLSEYMKALINKKELLSEFYEPNALMMEEEGAIIAGLLVGLNVIDANFCM
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KSD KGEDLDSQVGVIDFSMYLKNEEDIGNKERNVQIAAILDQKNYVEELNRQLNSTVSSLHSR
:::::::::::::::::::. .. . : . ::.::::::::::::::.::.::..:...
CCDS35 KGEDLDSQVGVIDFSMYLKDGNSSKGTEGDGQITAILDQKNYVEELNRHLNATVNNLQAK
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KSD VDSLEKSNTKLIEELAIAKNNIIKLQEENHQLRSENKLILMKTQQHLEVTKVDVETELQT
::.:::::::: ::::.:.: :: :::: .... :.. :: :.. .
CCDS35 VDALEKSNTKLTEELAVANNRIITLQEEMERVKEESSYIL--------------ESNRKG
290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KSD YKHSRQGLDEMYNEARRQLRDESQLRQDVENELAVQVSMKHEIELAMKLLEKDIHEKQDT
:..: . . .:::..:..:.::: :::.:: .:.::..:.:::::.::::. ::::.
CCDS35 PKQDRTAEGQALSEARKHLKEETQLRLDVEKELEMQISMRQEMELAMKMLEKDVCEKQDA
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KSD LIGLRQQLEEVKAINIEMYQKLQGSEDGLKEKNEIIARLEEKTNKITAAMRQLEQRLQQA
:..:::::....:.. :. :::.:. :.:.:.:. .:::::::...:...::::
CCDS35 LVSLRQQLDDLRALKHELAFKLQSSDLGVKQKSELNSRLEEKTNQMAATIKQLEQSEKDL
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KSD EKAQMEAEDEDEKYLQECLSKSDSLQKQISQKEKQLVQLETDLKIEKEWRQTLQEDLQKE
CCDS35 VKQAKTLNSAANKLIPKHH
460
>>CCDS47068.1 RUFY3 gene_id:22902|Hs108|chr4 (506 aa)
initn: 1307 init1: 1210 opt: 1247 Z-score: 579.6 bits: 117.0 E(32554): 5.8e-26
Smith-Waterman score: 1570; 63.7% identity (87.0% similar) in 386 aa overlap (1-386:135-506)
10 20 30
pF1KSD MAKLSIKGLIESALSFGRTLDSDYPPLQQF
::::::::::::::..:::::::: :::::
CCDS47 SYPSGGGGSSGSGKHHPNYLMANERMNLMNMAKLSIKGLIESALNLGRTLDSDYAPLQQF
110 120 130 140 150 160
40 50 60 70 80 90
pF1KSD FVVMEHCLKHGLKVRKSFLSYNKTIWGPLELVEKLYPEAEEIGASVRDLPGLKTPLGRAR
:::::::::::::..:.::. ::..:::::::::: ::: :: :::.::::::::.::.:
CCDS47 FVVMEHCLKHGLKAKKTFLGQNKSFWGPLELVEKLVPEAAEITASVKDLPGLKTPVGRGR
170 180 190 200 210 220
100 110 120 130 140 150
pF1KSD AWLRLALMQKKMADYLRCLIIQRDLLSEFYEYHALMMEEEGAVIVGLLVGLNVIDANLCV
:::::::::::...:.. :: ...::::::: .:::::::::.:.::::::::::::.:.
CCDS47 AWLRLALMQKKLSEYMKALINKKELLSEFYEPNALMMEEEGAIIAGLLVGLNVIDANFCM
230 240 250 260 270 280
160 170 180 190 200 210
pF1KSD KGEDLDSQVGVIDFSMYLKNEEDIGNKERNVQIAAILDQKNYVEELNRQLNSTVSSLHSR
:::::::::::::::::::. .. . : . ::.::::::::::::::.::.::..:...
CCDS47 KGEDLDSQVGVIDFSMYLKDGNSSKGTEGDGQITAILDQKNYVEELNRHLNATVNNLQAK
290 300 310 320 330 340
220 230 240 250 260 270
pF1KSD VDSLEKSNTKLIEELAIAKNNIIKLQEENHQLRSENKLILMKTQQHLEVTKVDVETELQT
::.:::::::: ::::.:.: :: :::: .... :.. :: :.. .
CCDS47 VDALEKSNTKLTEELAVANNRIITLQEEMERVKEESSYIL--------------ESNRKG
350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KSD YKHSRQGLDEMYNEARRQLRDESQLRQDVENELAVQVSMKHEIELAMKLLEKDIHEKQDT
:..: . . .:::..:..:.::: :::.:: .:.::..:.:::::.::::. ::::.
CCDS47 PKQDRTAEGQALSEARKHLKEETQLRLDVEKELEMQISMRQEMELAMKMLEKDVCEKQDA
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KSD LIGLRQQLEEVKAINIEMYQKLQGSEDGLKEKNEIIARLEEKTNKITAAMRQLEQRLQQA
:..:::::....:.. :. :::.:. :.:.:.:. .:::::::...:...:::::
CCDS47 LVSLRQQLDDLRALKHELAFKLQSSDLGVKQKSELNSRLEEKTNQMAATIKQLEQR
460 470 480 490 500
400 410 420 430 440 450
pF1KSD EKAQMEAEDEDEKYLQECLSKSDSLQKQISQKEKQLVQLETDLKIEKEWRQTLQEDLQKE
590 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 06:34:32 2016 done: Thu Nov 3 06:34:32 2016
Total Scan time: 3.400 Total Display time: 0.130
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]