FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA1542, 1649 aa 1>>>pF1KSDA1542 1649 - 1649 aa - 1649 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2478+/-0.00103; mu= -0.5773+/- 0.063 mean_var=390.5693+/-77.635, 0's: 0 Z-trim(115.3): 122 B-trim: 0 in 0/55 Lambda= 0.064897 statistics sampled from 15708 (15820) to 15708 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.768), E-opt: 0.2 (0.486), width: 16 Scan time: 7.560 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS65988.1 PHRF1 gene_id:57661|Hs108|chr11 (1649) 11098 1054.6 0 CCDS44507.1 PHRF1 gene_id:57661|Hs108|chr11 (1648) 11081 1053.0 0 CCDS65989.1 PHRF1 gene_id:57661|Hs108|chr11 (1647) 11063 1051.3 0 CCDS65987.1 PHRF1 gene_id:57661|Hs108|chr11 (1645) 11050 1050.1 0 >>CCDS65988.1 PHRF1 gene_id:57661|Hs108|chr11 (1649 aa) initn: 11098 init1: 11098 opt: 11098 Z-score: 5629.4 bits: 1054.6 E(32554): 0 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