FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA1547, 760 aa 1>>>pF1KSDA1547 760 - 760 aa - 760 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4119+/- 0.001; mu= -7.6692+/- 0.060 mean_var=303.7845+/-64.452, 0's: 0 Z-trim(113.6): 82 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.073585 statistics sampled from 14187 (14264) to 14187 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.752), E-opt: 0.2 (0.438), width: 16 Scan time: 4.540 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS58375.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 ( 760) 5156 561.3 2e-159 CCDS61692.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 ( 764) 5077 552.9 6.8e-157 CCDS61691.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 ( 767) 5071 552.3 1.1e-156 CCDS73747.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 ( 699) 4605 502.8 7.6e-142 CCDS43837.1 TLE4 gene_id:7091|Hs108|chr9 ( 773) 4002 438.8 1.5e-122 CCDS65070.1 TLE4 gene_id:7091|Hs108|chr9 ( 748) 3326 367.0 6e-101 CCDS61689.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 ( 762) 3014 333.9 5.7e-91 CCDS45294.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 ( 769) 3014 333.9 5.8e-91 CCDS45293.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 ( 772) 2991 331.5 3.1e-90 CCDS75851.1 TLE4 gene_id:7091|Hs108|chr9 ( 704) 2708 301.4 3.2e-81 CCDS65069.1 TLE4 gene_id:7091|Hs108|chr9 ( 805) 2701 300.7 6e-81 CCDS6661.1 TLE1 gene_id:7088|Hs108|chr9 ( 770) 2647 295.0 3.1e-79 CCDS74255.1 TLE2 gene_id:7089|Hs108|chr19 ( 744) 2501 279.4 1.4e-74 CCDS45911.1 TLE2 gene_id:7089|Hs108|chr19 ( 743) 2500 279.3 1.5e-74 CCDS45912.1 TLE2 gene_id:7089|Hs108|chr19 ( 621) 2404 269.1 1.5e-71 CCDS45913.1 TLE2 gene_id:7089|Hs108|chr19 ( 706) 2122 239.2 1.7e-62 CCDS12102.1 AES gene_id:166|Hs108|chr19 ( 197) 792 97.7 1.9e-20 CCDS12101.1 AES gene_id:166|Hs108|chr19 ( 264) 771 95.5 1.1e-19 CCDS12100.1 TLE6 gene_id:79816|Hs108|chr19 ( 449) 705 88.7 2.3e-17 CCDS45910.1 TLE6 gene_id:79816|Hs108|chr19 ( 572) 705 88.7 2.8e-17 >>CCDS58375.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 (760 aa) initn: 5156 init1: 5156 opt: 5156 Z-score: 2975.6 bits: 561.3 E(32554): 2e-159 Smith-Waterman score: 5156; 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97.9% identity (97.9% similar) in 704 aa overlap (67-760:1-699) 40 50 60 70 80 90 pF1KSD QAQYHSLKVEYDKLANEKTEMQRHYVMYYEMSYGLNIEMHKQTEIAKRLNTILAQIMPFL :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 MSYGLNIEMHKQTEIAKRLNTILAQIMPFL 10 20 30 100 110 120 130 140 pF1KSD SQEHQQQVAQAVERAKQVTMTELNAIIG----------QQQLQAQHLSHATHGPPVQLPP :::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::: CCDS73 SQEHQQQVAQAVERAKQVTMTELNAIIGVRGLPNLPLTQQQLQAQHLSHATHGPPVQLPP 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KSD HPSGLQPPGIPPVTGSSSGLLALGALGSQAHLTVKDEKNHHELDHRERESSANNSVSPSE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 HPSGLQPPGIPPVTGSSSGLLALGALGSQAHLTVKDEKNHHELDHRERESSANNSVSPSE 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KSD SLRASEKHRGSADYSMEAKKRKAEEKDSLSRYDSDGDKSDDLVVDVSNEDPATPRVSPAH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 SLRASEKHRGSADYSMEAKKRKAEEKDSLSRYDSDGDKSDDLVVDVSNEDPATPRVSPAH 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 pF1KSD SPPENGLDKARSLKKDAPTSPASVASSSSTPSSKTKDLGHNDKSSTPGLKSNTPTPRNDA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 SPPENGLDKARSLKKDAPTSPASVASSSSTPSSKTKDLGHNDKSSTPGLKSNTPTPRNDA 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 pF1KSD PTPGTSTTPGLRSMPASALRTPISITSSYAAPFAMMSHHEMNGSLTSPGAYAGLHNIPPQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 PTPGTSTTPGLRSMPASALRTPISITSSYAAPFAMMSHHEMNGSLTSPGAYAGLHNIPPQ 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 pF1KSD MSAAAAAAAAAYGRSPMVSFGAVGFDPHPPMRATGLPSSLASIPGGKPAYSFHVSADGQM :::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 MSAAAAAAAAAYGRSPMV-----GFDPHPPMRATGLPSSLASIPGGKPAYSFHVSADGQM 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 pF1KSD QPVPFPHDALAGPGIPRHARQINTLSHGEVVCAVTISNPTRHVYTGGKGCVKIWDISQPG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 QPVPFPHDALAGPGIPRHARQINTLSHGEVVCAVTISNPTRHVYTGGKGCVKIWDISQPG 390 400 410 420 430 440 510 520 530 540 550 560 pF1KSD SKSPISQLDCLNRDNYIRSCKLLPDGRTLIVGGEASTLTIWDLASPTPRIKAELTSSAPA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 SKSPISQLDCLNRDNYIRSCKLLPDGRTLIVGGEASTLTIWDLASPTPRIKAELTSSAPA 450 460 470 480 490 500 570 580 590 600 610 620 pF1KSD CYALAISPDAKVCFSCCSDGNIAVWDLHNQTLVRQFQGHTDGASCIDISHDGTKLWTGGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 CYALAISPDAKVCFSCCSDGNIAVWDLHNQTLVRQFQGHTDGASCIDISHDGTKLWTGGL 510 520 530 540 550 560 630 640 650 660 670 680 pF1KSD DNTVRSWDLREGRQLQQHDFTSQIFSLGYCPTGEWLAVGMESSNVEVLHHTKPDKYQLHL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 DNTVRSWDLREGRQLQQHDFTSQIFSLGYCPTGEWLAVGMESSNVEVLHHTKPDKYQLHL 570 580 590 600 610 620 690 700 710 720 730 740 pF1KSD HESCVLSLKFAYCGKWFVSTGKDNLLNAWRTPYGASIFQSKESSSVLSCDISADDKYIVT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 HESCVLSLKFAYCGKWFVSTGKDNLLNAWRTPYGASIFQSKESSSVLSCDISADDKYIVT 630 640 650 660 670 680 750 760 pF1KSD GSGDKKATVYEVIY :::::::::::::: CCDS73 GSGDKKATVYEVIY 690 >>CCDS43837.1 TLE4 gene_id:7091|Hs108|chr9 (773 aa) initn: 3451 init1: 2318 opt: 4002 Z-score: 2313.4 bits: 438.8 E(32554): 1.5e-122 Smith-Waterman score: 4240; 81.7% identity (92.0% similar) in 775 aa overlap (1-760:8-773) 10 20 30 40 50 pF1KSD MYPQGRHPAPHQPGQPGFKFTVAESCDRIKDEFQFLQAQYHSLKVEYDKLANE :::: ::::::::.:: ::::..:::::::.:::::::::::::.: .:::.: CCDS43 MIRDLSKMYPQTRHPAPHQPAQP-FKFTISESCDRIKEEFQFLQAQYHSLKLECEKLASE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KSD KTEMQRHYVMYYEMSYGLNIEMHKQTEIAKRLNTILAQIMPFLSQEHQQQVAQAVERAKQ :::::::::::::::::::::::::.::.::::.: ::..:::::::::::.:::::::: CCDS43 KTEMQRHYVMYYEMSYGLNIEMHKQAEIVKRLNAICAQVIPFLSQEHQQQVVQAVERAKQ 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KSD VTMTELNAIIGQQQLQAQHLSHATHGPPVQLPPHPSGLQPPGIPPVTGSSSGLLALG-AL :::.::::::::: ::::::::. :: :: : :::::::::.:::. :::.:::::. :: CCDS43 VTMAELNAIIGQQ-LQAQHLSHG-HGLPVPLTPHPSGLQPPAIPPI-GSSAGLLALSSAL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KSD GSQAHLTVKDEKNHHELDH-RERESSANNSVSPSESLRASEKHRGSADYSMEAKKRKAEE :.:.:: .::::.::. :: :.:.: ..::::: :.:..::::.::::: :.::.:.:: CCDS43 GGQSHLPIKDEKKHHDNDHQRDRDSIKSSSVSPSASFRGAEKHRNSADYSSESKKQKTEE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KSD KDSLSRYDSDGDKSDD-LVVDVSNEDPATPRVSPAHSPPENGLDKARSLKKDAPTSPASV :. .::::::.:::: ::::::::::..:: :::::: ::::::.: :::::: ::::. 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