Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA1561
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1561, 1416 aa
  1>>>pF1KSDA1561 1416 - 1416 aa - 1416 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.8112+/-0.00185; mu= -13.8831+/- 0.110
 mean_var=657.4120+/-138.649, 0's: 0 Z-trim(106.3): 280  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.050021
 statistics sampled from 8690 (8911) to 8690 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.572), E-opt: 0.2 (0.274), width:  16
 Scan time:  4.240

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10235.1 UACA gene_id:55075|Hs108|chr15         (1416) 8925 661.5 4.9e-189
CCDS32280.1 UACA gene_id:55075|Hs108|chr15         (1403) 8764 649.9 1.5e-185
CCDS54838.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5         ( 972) 1109 97.3 2.3e-19
CCDS54839.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5         ( 983) 1107 97.1 2.6e-19
CCDS34142.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5         ( 980) 1105 97.0 2.9e-19
CCDS54837.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5         ( 951)  981 88.0 1.4e-16
CCDS45925.1 ANKRD24 gene_id:170961|Hs108|chr19     (1146)  830 77.2   3e-13


>>CCDS10235.1 UACA gene_id:55075|Hs108|chr15              (1416 aa)
 initn: 8925 init1: 8925 opt: 8925  Z-score: 3507.3  bits: 661.5 E(32554): 4.9e-189
Smith-Waterman score: 8925; 100.0% identity (100.0% similar) in 1416 aa overlap (1-1416:1-1416)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MKSLKSRLRRQDVPGPASSGAAAASAHAADWNKYDDRLMKAAERGDVEKVTSILAKKGVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MKSLKSRLRRQDVPGPASSGAAAASAHAADWNKYDDRLMKAAERGDVEKVTSILAKKGVN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD PGKLDVEGRSVFHVVTSKGNLECLNAILIHGVDITTSDTAGRNALHLAAKYGHALCLQKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PGKLDVEGRSVFHVVTSKGNLECLNAILIHGVDITTSDTAGRNALHLAAKYGHALCLQKL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD LQYNCPTEHADLQGRTALHDAAMADCPSSIQLLCDHGASVNAKDVDGRTPLVLATQMSRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LQYNCPTEHADLQGRTALHDAAMADCPSSIQLLCDHGASVNAKDVDGRTPLVLATQMSRP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD TICQLLIDRGADVNSRDKQNRTALMLGCEYGCRDAVEVLIKNGADISLLDALGHDSSYYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TICQLLIDRGADVNSRDKQNRTALMLGCEYGCRDAVEVLIKNGADISLLDALGHDSSYYA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD RIGDNLDILTLLKTASENTNKGRELWKKGPSLQQRNLTHMQDEVNVKSHQREHQNIQDLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RIGDNLDILTLLKTASENTNKGRELWKKGPSLQQRNLTHMQDEVNVKSHQREHQNIQDLE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD IENEDLKERLRKIQQEQRILLDKVNGLQLQLNEEVMVADDLESEREKLKSLLAAKEKQHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IENEDLKERLRKIQQEQRILLDKVNGLQLQLNEEVMVADDLESEREKLKSLLAAKEKQHE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD ESLRTIEALKNRFKYFESDHLGSGSHFSNRKEDMLLKQGQMYMADSQCTSPGIPAHMQSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ESLRTIEALKNRFKYFESDHLGSGSHFSNRKEDMLLKQGQMYMADSQCTSPGIPAHMQSR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD SMLRPLELSLPSQTSYSENEILKKELEAMRTFCESAKQDRLKLQNELAHKVAECKALALE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SMLRPLELSLPSQTSYSENEILKKELEAMRTFCESAKQDRLKLQNELAHKVAECKALALE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD CERVKEDSDEQIKQLEDALKDVQKRMYESEGKVKQMQTHFLALKEHLTSEAASGNHRLTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CERVKEDSDEQIKQLEDALKDVQKRMYESEGKVKQMQTHFLALKEHLTSEAASGNHRLTE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD ELKDQLKDLKVKYEGASAEVGKLRNQIKQNEMIVEEFKRDEGKLIEENKRLQKELSMCEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ELKDQLKDLKVKYEGASAEVGKLRNQIKQNEMIVEEFKRDEGKLIEENKRLQKELSMCEM
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD EREKKGRKVTEMEGQAKELSAKLALSIPAEKFENMKSSLSNEVNEKAKKLVEMEREHEKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EREKKGRKVTEMEGQAKELSAKLALSIPAEKFENMKSSLSNEVNEKAKKLVEMEREHEKS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD LSEIRQLKRELENVKAKLAQHVKPEEHEQVKSRLEQKSGELGKKITELTLKNQTLQKEIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LSEIRQLKRELENVKAKLAQHVKPEEHEQVKSRLEQKSGELGKKITELTLKNQTLQKEIE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD KVYLDNKLLKEQAHNLTIEMKNHYVPLKVSEDMKKSHDAIIDDLNRKLLDVTQKYTEKKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KVYLDNKLLKEQAHNLTIEMKNHYVPLKVSEDMKKSHDAIIDDLNRKLLDVTQKYTEKKL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD EMEKLLLENDSLSKDVSRLETVFVPPEKHEKEIIALKSNIVELKKQLSELKKKCGEDQEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EMEKLLLENDSLSKDVSRLETVFVPPEKHEKEIIALKSNIVELKKQLSELKKKCGEDQEK
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD IHALTSENTNLKKMMSNQYVPVKTHEEVKMTLNDTLAKTNRELLDVKKKFEDINQEFVKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IHALTSENTNLKKMMSNQYVPVKTHEEVKMTLNDTLAKTNRELLDVKKKFEDINQEFVKI
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD KDKNEILKRNLENTQNQIKAEYISLAEHEAKMSSLSQSMRKVQDSNAEILANYRKGQEEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KDKNEILKRNLENTQNQIKAEYISLAEHEAKMSSLSQSMRKVQDSNAEILANYRKGQEEI
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD VTLHAEIKAQKKELDTIQECIKVKYAPIVSFEECERKFKATEKELKDQLSEQTQKYSVSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VTLHAEIKAQKKELDTIQECIKVKYAPIVSFEECERKFKATEKELKDQLSEQTQKYSVSE
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD EEVKKNKQENDKLKKEIFTLQKDLRDKTVLIEKSHEMERALSRKTDELNKQLKDLSQKYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EEVKKNKQENDKLKKEIFTLQKDLRDKTVLIEKSHEMERALSRKTDELNKQLKDLSQKYT
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD EVKNVKEKLVEENAKQTSEILAVQNLLQKQHVPLEQVEALKKSLNGTIENLKEELKSMQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EVKNVKEKLVEENAKQTSEILAVQNLLQKQHVPLEQVEALKKSLNGTIENLKEELKSMQR
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD CYEKEQQTVTKLHQLLENQKNSSVPLAEHLQIKEAFEKEVGIIKASLREKEEESQNKMEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CYEKEQQTVTKLHQLLENQKNSSVPLAEHLQIKEAFEKEVGIIKASLREKEEESQNKMEE
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD VSKLQSEVQNTKQALKKLETREVVDLSKYKATKSDLETQISSLNEKLANLNRKYEEVCEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VSKLQSEVQNTKQALKKLETREVVDLSKYKATKSDLETQISSLNEKLANLNRKYEEVCEE
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD VLHAKKKEISAKDEKELLHFSIEQEIKDQKERCDKSLTTITELQRRIQESAKQIEAKDNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VLHAKKKEISAKDEKELLHFSIEQEIKDQKERCDKSLTTITELQRRIQESAKQIEAKDNK
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD ITELLNDVERLKQALNGLSQLTYTSGNPTKRQSQLIDTLQHQVKSLEQQLADADRQHQEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ITELLNDVERLKQALNGLSQLTYTSGNPTKRQSQLIDTLQHQVKSLEQQLADADRQHQEV
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      
pF1KSD IAIYRTHLLSAAQGHMDEDVQEALLQIIQMRQGLVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IAIYRTHLLSAAQGHMDEDVQEALLQIIQMRQGLVC
             1390      1400      1410      

>>CCDS32280.1 UACA gene_id:55075|Hs108|chr15              (1403 aa)
 initn: 8764 init1: 8764 opt: 8764  Z-score: 3444.6  bits: 649.9 E(32554): 1.5e-185
Smith-Waterman score: 8764; 100.0% identity (100.0% similar) in 1390 aa overlap (27-1416:14-1403)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MKSLKSRLRRQDVPGPASSGAAAASAHAADWNKYDDRLMKAAERGDVEKVTSILAKKGVN
                                 ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32              MMNCWFSCTPKNRHAADWNKYDDRLMKAAERGDVEKVTSILAKKGVN
                            10        20        30        40       

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD PGKLDVEGRSVFHVVTSKGNLECLNAILIHGVDITTSDTAGRNALHLAAKYGHALCLQKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PGKLDVEGRSVFHVVTSKGNLECLNAILIHGVDITTSDTAGRNALHLAAKYGHALCLQKL
        50        60        70        80        90       100       

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD LQYNCPTEHADLQGRTALHDAAMADCPSSIQLLCDHGASVNAKDVDGRTPLVLATQMSRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LQYNCPTEHADLQGRTALHDAAMADCPSSIQLLCDHGASVNAKDVDGRTPLVLATQMSRP
       110       120       130       140       150       160       

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD TICQLLIDRGADVNSRDKQNRTALMLGCEYGCRDAVEVLIKNGADISLLDALGHDSSYYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TICQLLIDRGADVNSRDKQNRTALMLGCEYGCRDAVEVLIKNGADISLLDALGHDSSYYA
       170       180       190       200       210       220       

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD RIGDNLDILTLLKTASENTNKGRELWKKGPSLQQRNLTHMQDEVNVKSHQREHQNIQDLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RIGDNLDILTLLKTASENTNKGRELWKKGPSLQQRNLTHMQDEVNVKSHQREHQNIQDLE
       230       240       250       260       270       280       

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD IENEDLKERLRKIQQEQRILLDKVNGLQLQLNEEVMVADDLESEREKLKSLLAAKEKQHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IENEDLKERLRKIQQEQRILLDKVNGLQLQLNEEVMVADDLESEREKLKSLLAAKEKQHE
       290       300       310       320       330       340       

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD ESLRTIEALKNRFKYFESDHLGSGSHFSNRKEDMLLKQGQMYMADSQCTSPGIPAHMQSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ESLRTIEALKNRFKYFESDHLGSGSHFSNRKEDMLLKQGQMYMADSQCTSPGIPAHMQSR
       350       360       370       380       390       400       

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD SMLRPLELSLPSQTSYSENEILKKELEAMRTFCESAKQDRLKLQNELAHKVAECKALALE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SMLRPLELSLPSQTSYSENEILKKELEAMRTFCESAKQDRLKLQNELAHKVAECKALALE
       410       420       430       440       450       460       

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD CERVKEDSDEQIKQLEDALKDVQKRMYESEGKVKQMQTHFLALKEHLTSEAASGNHRLTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CERVKEDSDEQIKQLEDALKDVQKRMYESEGKVKQMQTHFLALKEHLTSEAASGNHRLTE
       470       480       490       500       510       520       

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD ELKDQLKDLKVKYEGASAEVGKLRNQIKQNEMIVEEFKRDEGKLIEENKRLQKELSMCEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ELKDQLKDLKVKYEGASAEVGKLRNQIKQNEMIVEEFKRDEGKLIEENKRLQKELSMCEM
       530       540       550       560       570       580       

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD EREKKGRKVTEMEGQAKELSAKLALSIPAEKFENMKSSLSNEVNEKAKKLVEMEREHEKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EREKKGRKVTEMEGQAKELSAKLALSIPAEKFENMKSSLSNEVNEKAKKLVEMEREHEKS
       590       600       610       620       630       640       

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD LSEIRQLKRELENVKAKLAQHVKPEEHEQVKSRLEQKSGELGKKITELTLKNQTLQKEIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LSEIRQLKRELENVKAKLAQHVKPEEHEQVKSRLEQKSGELGKKITELTLKNQTLQKEIE
       650       660       670       680       690       700       

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pF1KSD KVYLDNKLLKEQAHNLTIEMKNHYVPLKVSEDMKKSHDAIIDDLNRKLLDVTQKYTEKKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KVYLDNKLLKEQAHNLTIEMKNHYVPLKVSEDMKKSHDAIIDDLNRKLLDVTQKYTEKKL
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pF1KSD EMEKLLLENDSLSKDVSRLETVFVPPEKHEKEIIALKSNIVELKKQLSELKKKCGEDQEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EMEKLLLENDSLSKDVSRLETVFVPPEKHEKEIIALKSNIVELKKQLSELKKKCGEDQEK
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              850       860       870       880       890       900
pF1KSD IHALTSENTNLKKMMSNQYVPVKTHEEVKMTLNDTLAKTNRELLDVKKKFEDINQEFVKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IHALTSENTNLKKMMSNQYVPVKTHEEVKMTLNDTLAKTNRELLDVKKKFEDINQEFVKI
       830       840       850       860       870       880       

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD KDKNEILKRNLENTQNQIKAEYISLAEHEAKMSSLSQSMRKVQDSNAEILANYRKGQEEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KDKNEILKRNLENTQNQIKAEYISLAEHEAKMSSLSQSMRKVQDSNAEILANYRKGQEEI
       890       900       910       920       930       940       

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD VTLHAEIKAQKKELDTIQECIKVKYAPIVSFEECERKFKATEKELKDQLSEQTQKYSVSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VTLHAEIKAQKKELDTIQECIKVKYAPIVSFEECERKFKATEKELKDQLSEQTQKYSVSE
       950       960       970       980       990      1000       

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pF1KSD EEVKKNKQENDKLKKEIFTLQKDLRDKTVLIEKSHEMERALSRKTDELNKQLKDLSQKYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EEVKKNKQENDKLKKEIFTLQKDLRDKTVLIEKSHEMERALSRKTDELNKQLKDLSQKYT
      1010      1020      1030      1040      1050      1060       

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD EVKNVKEKLVEENAKQTSEILAVQNLLQKQHVPLEQVEALKKSLNGTIENLKEELKSMQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EVKNVKEKLVEENAKQTSEILAVQNLLQKQHVPLEQVEALKKSLNGTIENLKEELKSMQR
      1070      1080      1090      1100      1110      1120       

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pF1KSD CYEKEQQTVTKLHQLLENQKNSSVPLAEHLQIKEAFEKEVGIIKASLREKEEESQNKMEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CYEKEQQTVTKLHQLLENQKNSSVPLAEHLQIKEAFEKEVGIIKASLREKEEESQNKMEE
      1130      1140      1150      1160      1170      1180       

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD VSKLQSEVQNTKQALKKLETREVVDLSKYKATKSDLETQISSLNEKLANLNRKYEEVCEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VSKLQSEVQNTKQALKKLETREVVDLSKYKATKSDLETQISSLNEKLANLNRKYEEVCEE
      1190      1200      1210      1220      1230      1240       

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD VLHAKKKEISAKDEKELLHFSIEQEIKDQKERCDKSLTTITELQRRIQESAKQIEAKDNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VLHAKKKEISAKDEKELLHFSIEQEIKDQKERCDKSLTTITELQRRIQESAKQIEAKDNK
      1250      1260      1270      1280      1290      1300       

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD ITELLNDVERLKQALNGLSQLTYTSGNPTKRQSQLIDTLQHQVKSLEQQLADADRQHQEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ITELLNDVERLKQALNGLSQLTYTSGNPTKRQSQLIDTLQHQVKSLEQQLADADRQHQEV
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             1390      1400      1410      
pF1KSD IAIYRTHLLSAAQGHMDEDVQEALLQIIQMRQGLVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IAIYRTHLLSAAQGHMDEDVQEALLQIIQMRQGLVC
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>>CCDS54838.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5              (972 aa)
 initn: 1466 init1: 833 opt: 1109  Z-score: 461.0  bits: 97.3 E(32554): 2.3e-19
Smith-Waterman score: 1230; 27.3% identity (61.0% similar) in 1049 aa overlap (26-1047:3-971)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MKSLKSRLRRQDVPGPASSGAAAASAHAADWNKYDDRLMKAAERGDVEKVTSILAKKGVN
                                :.. .::: ::::..:.: ::.:::.:.:.:::..
CCDS54                        MEAKTNEWNKNDDRLLQAVENGDAEKVASLLGKKGAS
                                      10        20        30       

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD PGKLDVEGRSVFHVVTSKGNLECLNAILIHGVDITTSDTAGRNALHLAAKYGHALCLQKL
         : : ::...::....::..::: ... ::::.:..::.:..::::::: .:  :..::
CCDS54 ATKHDSEGKTAFHLAAAKGHVECLRVMITHGVDVTAQDTTGHSALHLAAKNSHHECIRKL
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              130       140       150       160       170       180
pF1KSD LQYNCPTEHADLQGRTALHDAAMADCPSSIQLLCDHGASVNAKDVDGRTPLVLATQMSRP
       :: .::.: .: .:.:::: ::   : ...:.::.: . .: ::.::  ::.::.: .. 
CCDS54 LQSKCPAESVDSSGKTALHYAAAQGCLQAVQILCEHKSPINLKDLDGNIPLLLAVQNGHS
       100       110       120       130       140       150       

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD TICQLLIDRGADVNSRDKQNRTALMLGCEYGCRDAVEVLIKNGADISLLDALGHDSSYYA
        ::..:.:.:::::::.:..::::::.:: :  .:::.:::.:::..:.:.::... .:.
CCDS54 EICHFLLDHGADVNSRNKSGRTALMLACEIGSSNAVEALIKKGADLNLVDSLGYNALHYS
       160       170       180       190       200       210       

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD RIGDNLDILTLLKTASENTNKGRELWKKGPSLQQRNLTHMQDEVNVKSHQREHQNIQDLE
       ....:  : .::                        :.........:.  . .:. :  .
CCDS54 KLSENAGIQSLL------------------------LSKISQDADLKTPTKPKQHDQVSK
       220                               230       240       250   

              310       320       330       340       350          
pF1KSD IENEDLKERLRKIQQEQRILLDKVNGLQLQLNEEVMVADDLESEREKLKSLLAAKEK---
       : .:          ....     ..  ::.         :. : :   .. :..::.   
CCDS54 ISSER-----SGTPKKRKAPPPPISPTQLS---------DVSSPRSITSTPLSGKESVFF
                260       270                280       290         

          360       370         380       390       400       410  
pF1KSD ---QHEESLRTIEALKNRFKYFES--DHLGSGSHFSNRKEDMLLKQGQMYMADSQCTSPG
            .  . .:.  :.:..   .  : : . :  .....  ::.  :  .:.    .  
CCDS54 AEPPFKAEISSIRENKDRLSDSTTGADSLLDISSEADQQD--LLSLLQAKVASLTLHNKE
     300       310       320       330         340       350       

            420       430       440       450       460       470  
pF1KSD IPAHMQSRSMLRPLELSLPSQTSYSENEILKKELEAMRTFCESAKQDRLKLQNELAHKVA
       .  ..:..:  .  : .:  .. .: .  :   :       :..  :  .  . : :...
CCDS54 LQDKLQAKSP-KEAEADLSFDSYHSTQTDLGPSLGKP---GETSPPDSKSSPSVLIHSLG
       360        370       380       390          400       410   

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pF1KSD ECKALALECERVKEDSDEQIKQLEDALKDVQKRMYESEGKVKQMQTHFLALKEHLTSEAA
       .  .          :.: .:.::.. :.:.:::.  ::.. ::.:... . . .:.    
CCDS54 KSTT----------DNDVRIQQLQEILQDLQKRLESSEAERKQLQVELQSRRAELVCLNN
                     420       430       440       450       460   

            540       550       560       570           580        
pF1KSD SGNHRLTEELKDQLKDLKVKYEGASAEVGKLRNQIKQNEMIVEEFKR----DEGKLIEEN
       .   . . .:...::. . ::: :  :: ....:.: . .  : .       : .. ::.
CCDS54 TEISENSSDLSQKLKETQSKYEEAMKEVLSVQKQMKLGLVSPESMDNYSHFHELRVTEEE
           470       480       490       500       510       520   

       590       600       610       620       630       640       
pF1KSD -KRLQKELSMCEMEREKKGRKVTEMEGQAKELSAKLALSIPAEKFENMKSSLSNEVNEKA
        . :...:.    : :.. .:: :.: .  :     ... :.:..:.::::  . ...  
CCDS54 INVLKQDLQNALEESERNKEKVRELEEKLVEREKGTVIKPPVEEYEEMKSSYCSVIENMN
           530       540       550       560       570       580   

       650       660       670       680       690       700       
pF1KSD KKLVEMEREHEKSLSEIRQLKRELENVKAKLAQHVKPEEHEQVKSRLEQKSGELGKKITE
       :. . . ......  :: .::   ...:....:... .: :..:  ...   ::.:...:
CCDS54 KEKAFLFEKYQEAQEEIMKLK---DTLKSQMTQEAS-DEAEDMKEAMNRMIDELNKQVSE
           590       600          610        620       630         

       710       720       730       740       750       760       
pF1KSD LTLKNQTLQKEIEKVYLDNKLLKEQAHNLTIEMKNHYVPLKVSEDMKKSHDAIIDDLNRK
       :.   .  : :.:  :   : :..    .: :    :.        :  :. ...  : .
CCDS54 LSQLYKEAQAELED-YRKRKSLED----VTAE----YI-------HKAEHEKLMQLTNVS
     640       650        660                      670       680   

       770       780       790       800       810       820       
pF1KSD LLDVTQKYTEKKLEMEKLLLENDSLSKDVSRLETVFVPPEKHEKEIIALKSNIVELKKQL
          . .  .: : .. :.: :  .:.. :.  .   :   .: . : .:..   :.....
CCDS54 RAKAEDALSEMKSQYSKVLNELTQLKQLVDAQKENSVSITEHLQVITTLRTAAKEMEEKI
           690       700       710       720       730       740   

       830       840       850       860       870       880       
pF1KSD SELKKKCGEDQEKIHALTSENTNLKKMMSNQYVPVKTHEEVKMTLNDTLAKTNRELLDVK
       :.::.. .  . ..  : ..  . :  :.. .:: ...:... .:.. ..    .: .  
CCDS54 SNLKEHLASKEVEVAKLEKQLLEEKAAMTDAMVPRSSYEKLQSSLESEVSVLASKLKESV
           750       760       770       780       790       800   

       890       900       910       920       930          940    
pF1KSD KKFEDINQEFVKIKDKNEILKRNLENTQNQIKAEYISLAEHEAKMSSLSQS---MRKVQD
       :. : ...: :.:...   .::. :: :. .:..   . :   :... ..    :..  .
CCDS54 KEKEKVHSEVVQIRSEVSQVKREKENIQTLLKSKEQEVNELLQKFQQAQEELAEMKRYAE
           810       820       830       840       850       860   

          950       960       970       980       990        1000  
pF1KSD SNAEILANYRKGQEEIVTLHAEIKAQKKELDTIQECIKVKYAPIVSFEECER--KFKATE
       :....  .  :   .:  .  :.   :. :.....   ..:.   : .. ..   ..   
CCDS54 SSSKLEEDKDK---KINEMSKEVTKLKEALNSLSQ---LSYSTSSSKRQSQQLEALQQQV
           870          880       890          900       910       

           1010             1020      1030        1040      1050   
pF1KSD KELKDQLSE---QTQK----YSVSEEEVKKNKQEND--KLKKEIFTLQKDLRDKTVLIEK
       :.:..::.:   : :.    : .    . ......:  :. :.:.:. :.  .:      
CCDS54 KQLQNQLAECKKQHQEVISVYRMHLLYAVQGQMDEDVQKVLKQILTMCKNQSQKK     
       920       930       940       950       960       970       

          1060      1070      1080      1090      1100      1110   
pF1KSD SHEMERALSRKTDELNKQLKDLSQKYTEVKNVKEKLVEENAKQTSEILAVQNLLQKQHVP

>>CCDS54839.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5              (983 aa)
 initn: 1464 init1: 831 opt: 1107  Z-score: 460.1  bits: 97.1 E(32554): 2.6e-19
Smith-Waterman score: 1228; 27.2% identity (60.8% similar) in 1053 aa overlap (22-1047:10-982)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MKSLKSRLRRQDVPGPASSGAAAASAHAADWNKYDDRLMKAAERGDVEKVTSILAKKGVN
                            .:   .. .::: ::::..:.: ::.:::.:.:.:::..
CCDS54             MQPTYLPWLSAKEKKTNEWNKNDDRLLQAVENGDAEKVASLLGKKGAS
                           10        20        30        40        

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pF1KSD PGKLDVEGRSVFHVVTSKGNLECLNAILIHGVDITTSDTAGRNALHLAAKYGHALCLQKL
         : : ::...::....::..::: ... ::::.:..::.:..::::::: .:  :..::
CCDS54 ATKHDSEGKTAFHLAAAKGHVECLRVMITHGVDVTAQDTTGHSALHLAAKNSHHECIRKL
       50        60        70        80        90       100        

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pF1KSD LQYNCPTEHADLQGRTALHDAAMADCPSSIQLLCDHGASVNAKDVDGRTPLVLATQMSRP
       :: .::.: .: .:.:::: ::   : ...:.::.: . .: ::.::  ::.::.: .. 
CCDS54 LQSKCPAESVDSSGKTALHYAAAQGCLQAVQILCEHKSPINLKDLDGNIPLLLAVQNGHS
      110       120       130       140       150       160        

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pF1KSD TICQLLIDRGADVNSRDKQNRTALMLGCEYGCRDAVEVLIKNGADISLLDALGHDSSYYA
        ::..:.:.:::::::.:..::::::.:: :  .:::.:::.:::..:.:.::... .:.
CCDS54 EICHFLLDHGADVNSRNKSGRTALMLACEIGSSNAVEALIKKGADLNLVDSLGYNALHYS
      170       180       190       200       210       220        

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pF1KSD RIGDNLDILTLLKTASENTNKGRELWKKGPSLQQRNLTHMQDEVNVKSHQREHQNIQDLE
       ....:  : .::                        :.........:.  . .:. :  .
CCDS54 KLSENAGIQSLL------------------------LSKISQDADLKTPTKPKQHDQVSK
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              310       320       330       340       350          
pF1KSD IENEDLKERLRKIQQEQRILLDKVNGLQLQLNEEVMVADDLESEREKLKSLLAAKEK---
       : .:          ....     ..  ::.         :. : :   .. :..::.   
CCDS54 ISSER-----SGTPKKRKAPPPPISPTQLS---------DVSSPRSITSTPLSGKESVFF
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pF1KSD ---QHEESLRTIEALKNRFKYFES--DHLGSGSHFSNRKEDMLLKQGQMYMADSQCTSPG
            .  . .:.  :.:..   .  : : . :  .....  ::.  :  .:.    .  
CCDS54 AEPPFKAEISSIRENKDRLSDSTTGADSLLDISSEADQQD--LLSLLQAKVASLTLHNKE
              320       330       340       350         360        

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pF1KSD IPAHMQSRSMLRPLELSLPSQTSYSENEILKKELEAMRTFCESAKQDRLKLQNELAHKVA
       .  ..:..:  .  : .:  .. .: .  :   :       :..  :  .  . : :...
CCDS54 LQDKLQAKSP-KEAEADLSFDSYHSTQTDLGPSLGKPG---ETSPPDSKSSPSVLIHSLG
      370        380       390       400          410       420    

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pF1KSD ECKALALECERVKEDSDEQIKQLEDALKDVQKRMYESEGKVKQMQTHFLALKEHLTSEAA
                 .   :.: .:.::.. :.:.:::.  ::.. ::.:... . . .:.    
CCDS54 ----------KSTTDNDVRIQQLQEILQDLQKRLESSEAERKQLQVELQSRRAELVCLNN
                    430       440       450       460       470    

            540       550       560       570           580        
pF1KSD SGNHRLTEELKDQLKDLKVKYEGASAEVGKLRNQIKQNEMIVEEFKR----DEGKLIEEN
       .   . . .:...::. . ::: :  :: ....:.: . .  : .       : .. ::.
CCDS54 TEISENSSDLSQKLKETQSKYEEAMKEVLSVQKQMKLGLVSPESMDNYSHFHELRVTEEE
          480       490       500       510       520       530    

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pF1KSD -KRLQKELSMCEMEREKKGRKVTEMEGQAKELSAKLALSIPAEKFENMKSSLSNEVNEKA
        . :...:.    : :.. .:: :.: .  :     ... :.:..:.::::  . ...  
CCDS54 INVLKQDLQNALEESERNKEKVRELEEKLVEREKGTVIKPPVEEYEEMKSSYCSVIENMN
          540       550       560       570       580       590    

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pF1KSD KKLVEMEREHEKSLSEIRQLKRELENVKAKLAQHVKPEEHEQVKSRLEQKSGELGKKITE
       :. . . ......  :: .::   ...:....:... .: :..:  ...   ::.:...:
CCDS54 KEKAFLFEKYQEAQEEIMKLK---DTLKSQMTQEAS-DEAEDMKEAMNRMIDELNKQVSE
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pF1KSD LTLKNQTLQKEIEKVYLDNKLLKEQAHNLTIEMKNHYVPLKVSEDMKKSHDAIIDDLNRK
       :.   .  : :.:  :   : :..    .: :    :.        :  :. ...  : .
CCDS54 LSQLYKEAQAELED-YRKRKSLED----VTAE----YI-------HKAEHEKLMQLTNVS
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pF1KSD LLDVTQKYTEKKLEMEKLLLENDSLSKDVSRLETVFVPPEKHEKEIIALKSNIVELKKQL
          . .  .: : .. :.: :  .:.. :.  .   :   .: . : .:..   :.....
CCDS54 RAKAEDALSEMKSQYSKVLNELTQLKQLVDAQKENSVSITEHLQVITTLRTAAKEMEEKI
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pF1KSD SELKKKCGEDQEKIHALTSENTNLKKMMSNQYVPVKTHEEVKMTLNDTLAKTNRELLDVK
       :.::.. .  . ..  : ..  . :  :.. .:: ...:... .:.. ..    .: .  
CCDS54 SNLKEHLASKEVEVAKLEKQLLEEKAAMTDAMVPRSSYEKLQSSLESEVSVLASKLKESV
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pF1KSD KKFEDINQEFVKIKDKNEILKRNLENTQNQIKAEYISLAEHEAKMSSLSQS---MRKVQD
       :. : ...: :.:...   .::. :: :. .:..   . :   :... ..    :..  .
CCDS54 KEKEKVHSEVVQIRSEVSQVKREKENIQTLLKSKEQEVNELLQKFQQAQEELAEMKRYAE
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pF1KSD SNAEILANYRKGQEEIVTLHAEIKAQKKELDTIQECIKVKYAPIVSFEECER--KFKATE
       :....  .  :   .:  .  :.   :. :.....   ..:.   : .. ..   ..   
CCDS54 SSSKLEEDKDK---KINEMSKEVTKLKEALNSLSQ---LSYSTSSSKRQSQQLEALQQQV
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pF1KSD KELKDQLSE---QTQK----YSVSEEEVKKNKQEND--KLKKEIFTLQKDLRDKTVLIEK
       :.:..::.:   : :.    : .    . ......:  :. :.:.:. :.  .:      
CCDS54 KQLQNQLAECKKQHQEVISVYRMHLLYAVQGQMDEDVQKVLKQILTMCKNQSQKK     
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pF1KSD SHEMERALSRKTDELNKQLKDLSQKYTEVKNVKEKLVEENAKQTSEILAVQNLLQKQHVP

>>CCDS34142.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5              (980 aa)
 initn: 1462 init1: 829 opt: 1105  Z-score: 459.4  bits: 97.0 E(32554): 2.9e-19
Smith-Waterman score: 1237; 27.2% identity (60.5% similar) in 1074 aa overlap (1-1047:1-979)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MKSLKSRLRRQDVPGPASSGAAAASAHAADWNKYDDRLMKAAERGDVEKVTSILAKKGVN
       :::::...:..:.                .::: ::::..:.: ::.:::.:.:.:::..
CCDS34 MKSLKAKFRKSDT---------------NEWNKNDDRLLQAVENGDAEKVASLLGKKGAS
               10                       20        30        40     

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pF1KSD PGKLDVEGRSVFHVVTSKGNLECLNAILIHGVDITTSDTAGRNALHLAAKYGHALCLQKL
         : : ::...::....::..::: ... ::::.:..::.:..::::::: .:  :..::
CCDS34 ATKHDSEGKTAFHLAAAKGHVECLRVMITHGVDVTAQDTTGHSALHLAAKNSHHECIRKL
          50        60        70        80        90       100     

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pF1KSD LQYNCPTEHADLQGRTALHDAAMADCPSSIQLLCDHGASVNAKDVDGRTPLVLATQMSRP
       :: .::.: .: .:.:::: ::   : ...:.::.: . .: ::.::  ::.::.: .. 
CCDS34 LQSKCPAESVDSSGKTALHYAAAQGCLQAVQILCEHKSPINLKDLDGNIPLLLAVQNGHS
         110       120       130       140       150       160     

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pF1KSD TICQLLIDRGADVNSRDKQNRTALMLGCEYGCRDAVEVLIKNGADISLLDALGHDSSYYA
        ::..:.:.:::::::.:..::::::.:: :  .:::.:::.:::..:.:.::... .:.
CCDS34 EICHFLLDHGADVNSRNKSGRTALMLACEIGSSNAVEALIKKGADLNLVDSLGYNALHYS
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pF1KSD RIGDNLDILTLLKTASENTNKGRELWKKGPSLQQRNLTHMQDEVNVKSHQREHQNIQDLE
       ....:  : .::                        :.........:.  . .:. :  .
CCDS34 KLSENAGIQSLL------------------------LSKISQDADLKTPTKPKQHDQVSK
         230                               240       250       260 

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pF1KSD IENEDLKERLRKIQQEQRILLDKVNGLQLQLNEEVMVADDLESEREKLKSLLAAKEK---
       : .:          ....     ..  ::.         :. : :   .. :..::.   
CCDS34 ISSER-----SGTPKKRKAPPPPISPTQLS---------DVSSPRSITSTPLSGKESVFF
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pF1KSD ---QHEESLRTIEALKNRFKYFES--DHLGSGSHFSNRKEDMLLKQGQMYMADSQCTSPG
            .  . .:.  :.:..   .  : : . :  .....  ::.  :  .:.    .  
CCDS34 AEPPFKAEISSIRENKDRLSDSTTGADSLLDISSEADQQD--LLSLLQAKVASLTLHNKE
       310       320       330       340         350       360     

            420       430       440       450       460       470  
pF1KSD IPAHMQSRSMLRPLELSLPSQTSYSENEILKKELEAMRTFCESAKQDRLKLQNELAHKVA
       .  ..:..:  .  : .:  .. .: .  :   :       :..  :  .  . : :...
CCDS34 LQDKLQAKSP-KEAEADLSFDSYHSTQTDLGPSLGKP---GETSPPDSKSSPSVLIHSLG
         370        380       390       400          410       420 

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pF1KSD ECKALALECERVKEDSDEQIKQLEDALKDVQKRMYESEGKVKQMQTHFLALKEHLTSEAA
       .  .          :.: .:.::.. :.:.:::.  ::.. ::.:... . . .:.    
CCDS34 KSTT----------DNDVRIQQLQEILQDLQKRLESSEAERKQLQVELQSRRAELVCLNN
                       430       440       450       460       470 

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pF1KSD SGNHRLTEELKDQLKDLKVKYEGASAEVGKLRNQIKQNEMIVEEFKR----DEGKLIEEN
       .   . . .:...::. . ::: :  :: ....:.: . .  : .       : .. ::.
CCDS34 TEISENSSDLSQKLKETQSKYEEAMKEVLSVQKQMKLGLVSPESMDNYSHFHELRVTEEE
             480       490       500       510       520       530 

       590       600       610       620       630       640       
pF1KSD -KRLQKELSMCEMEREKKGRKVTEMEGQAKELSAKLALSIPAEKFENMKSSLSNEVNEKA
        . :...:.    : :.. .:: :.: .  :     ... :.:..:.::::  . ...  
CCDS34 INVLKQDLQNALEESERNKEKVRELEEKLVEREKGTVIKPPVEEYEEMKSSYCSVIENMN
             540       550       560       570       580       590 

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pF1KSD KKLVEMEREHEKSLSEIRQLKRELENVKAKLAQHVKPEEHEQVKSRLEQKSGELGKKITE
       :. . . ......  :: .::   ...:....:... .: :..:  ...   ::.:...:
CCDS34 KEKAFLFEKYQEAQEEIMKLK---DTLKSQMTQEAS-DEAEDMKEAMNRMIDELNKQVSE
             600       610          620        630       640       

       710       720       730       740       750       760       
pF1KSD LTLKNQTLQKEIEKVYLDNKLLKEQAHNLTIEMKNHYVPLKVSEDMKKSHDAIIDDLNRK
       :.   .  : :.:  :   : :..    .: :    :.        :  :. ...  : .
CCDS34 LSQLYKEAQAELED-YRKRKSLED----VTAE----YI-------HKAEHEKLMQLTNVS
       650       660        670                      680       690 

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pF1KSD LLDVTQKYTEKKLEMEKLLLENDSLSKDVSRLETVFVPPEKHEKEIIALKSNIVELKKQL
          . .  .: : .. :.: :  .:.. :.  .   :   .: . : .:..   :.....
CCDS34 RAKAEDALSEMKSQYSKVLNELTQLKQLVDAQKENSVSITEHLQVITTLRTAAKEMEEKI
             700       710       720       730       740       750 

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pF1KSD SELKKKCGEDQEKIHALTSENTNLKKMMSNQYVPVKTHEEVKMTLNDTLAKTNRELLDVK
       :.::.. .  . ..  : ..  . :  :.. .:: ...:... .:.. ..    .: .  
CCDS34 SNLKEHLASKEVEVAKLEKQLLEEKAAMTDAMVPRSSYEKLQSSLESEVSVLASKLKESV
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pF1KSD KKFEDINQEFVKIKDKNEILKRNLENTQNQIKAEYISLAEHEAKMSSLSQS---MRKVQD
       :. : ...: :.:...   .::. :: :. .:..   . :   :... ..    :..  .
CCDS34 KEKEKVHSEVVQIRSEVSQVKREKENIQTLLKSKEQEVNELLQKFQQAQEELAEMKRYAE
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pF1KSD SNAEILANYRKGQEEIVTLHAEIKAQKKELDTIQECIKVKYAPIVSFEECER--KFKATE
       :....  .  :   .:  .  :.   :. :....   ...:.   : .. ..   ..   
CCDS34 SSSKLEEDKDK---KINEMSKEVTKLKEALNSLS---QLSYSTSSSKRQSQQLEALQQQV
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pF1KSD KELKDQLSE---QTQK----YSVSEEEVKKNKQEND--KLKKEIFTLQKDLRDKTVLIEK
       :.:..::.:   : :.    : .    . ......:  :. :.:.:. :.  .:      
CCDS34 KQLQNQLAECKKQHQEVISVYRMHLLYAVQGQMDEDVQKVLKQILTMCKNQSQKK     
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pF1KSD SHEMERALSRKTDELNKQLKDLSQKYTEVKNVKEKLVEENAKQTSEILAVQNLLQKQHVP

>>CCDS54837.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5              (951 aa)
 initn: 1462 init1: 829 opt: 981  Z-score: 411.2  bits: 88.0 E(32554): 1.4e-16
Smith-Waterman score: 1216; 27.4% identity (61.0% similar) in 1066 aa overlap (1-1047:1-950)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MKSLKSRLRRQDVPGPASSGAAAASAHAADWNKYDDRLMKAAERGDVEKVTSILAKKGVN
       :::::...:..:.                .::: ::::..:.: ::.:::.:.:.:::..
CCDS54 MKSLKAKFRKSDT---------------NEWNKNDDRLLQAVENGDAEKVASLLGKKGAS
               10                       20        30        40     

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pF1KSD PGKLDVEGRSVFHVVTSKGNLECLNAILIHGVDITTSDTAGRNALHLAAKYGHALCLQKL
         : : ::...::....::..::: ... ::::.:..::.:..::::::: .:  :..::
CCDS54 ATKHDSEGKTAFHLAAAKGHVECLRVMITHGVDVTAQDTTGHSALHLAAKNSHHECIRKL
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pF1KSD LQYNCPTEHADLQGRTALHDAAMADCPSSIQLLCDHGASVNAKDVDGRTPLVLATQMSRP
       :: .::.: .: .:.:::: ::   : ...:.::.: . .: ::.::  ::.::.: .. 
CCDS54 LQSKCPAESVDSSGKTALHYAAAQGCLQAVQILCEHKSPINLKDLDGNIPLLLAVQNGHS
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pF1KSD TICQLLIDRGADVNSRDKQNRTALMLGCEYGCRDAVEVLIKNGADISLLDALGHDSSYYA
        ::..:.:.:::::::.:..::::::.:: :  .:::.:::.:::..:.:.::... .:.
CCDS54 EICHFLLDHGADVNSRNKSGRTALMLACEIGSSNAVEALIKKGADLNLVDSLGYNALHYS
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pF1KSD RIGDNLDILTLLKTASENTNKGRELWKKGPSLQQRNLTHMQDEVNVKSHQREHQNIQDLE
       ....:  : .:: .   . ..  .:  : :. . ..:. ...  .. :     .  ... 
CCDS54 KLSENAGIQSLLLS---KISQDADL--KTPT-KPKQLSDVSSPRSITSTPLSGK--ESVF
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              310       320       330       340       350       360
pF1KSD IENEDLKERLRKIQQEQRILLDKVNGLQLQLNEEVMVADDLESEREKLKSLLAAKEKQHE
       . .  .: .. .:....  : :...: .  :.    ...  :.... : ::: ::     
CCDS54 FAEPPFKAEISSIRENKDRLSDSTTGADSLLD----ISS--EADQQDLLSLLQAK----V
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pF1KSD ESLRTIEALKNRFKYFESDHLGSGSHFSNRKEDMLLKQGQMYMADSQCTSPGIPAHMQSR
        ::    .:.:.                . .. .  :. .   :: .  :     . ...
CCDS54 ASL----TLHNK----------------ELQDKLQAKSPKEAEADLSFDS-----YHSTQ
       330                           340       350            360  

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pF1KSD SMLRPLELSLPSQTSYSENEILKKELEAMRTFCESAKQDRLKLQNELAHKVAECKALALE
       . : :  :. :..::                       :  .  . : :....  .    
CCDS54 TDLGP-SLGKPGETS---------------------PPDSKSSPSVLIHSLGKSTT----
             370                            380       390          

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pF1KSD CERVKEDSDEQIKQLEDALKDVQKRMYESEGKVKQMQTHFLALKEHLTSEAASGNHRLTE
             :.: .:.::.. :.:.:::.  ::.. ::.:... . . .:.    .   . . 
CCDS54 ------DNDVRIQQLQEILQDLQKRLESSEAERKQLQVELQSRRAELVCLNNTEISENSS
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pF1KSD ELKDQLKDLKVKYEGASAEVGKLRNQIKQNEMIVEEFKR----DEGKLIEEN-KRLQKEL
       .:...::. . ::: :  :: ....:.: . .  : .       : .. ::. . :...:
CCDS54 DLSQKLKETQSKYEEAMKEVLSVQKQMKLGLVSPESMDNYSHFHELRVTEEEINVLKQDL
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pF1KSD SMCEMEREKKGRKVTEMEGQAKELSAKLALSIPAEKFENMKSSLSNEVNEKAKKLVEMER
       .    : :.. .:: :.: .  :     ... :.:..:.::::  . ...  :. . . .
CCDS54 QNALEESERNKEKVRELEEKLVEREKGTVIKPPVEEYEEMKSSYCSVIENMNKEKAFLFE
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pF1KSD EHEKSLSEIRQLKRELENVKAKLAQHVKPEEHEQVKSRLEQKSGELGKKITELTLKNQTL
       .....  :: .::   ...:....:... .: :..:  ...   ::.:...::.   .  
CCDS54 KYQEAQEEIMKLK---DTLKSQMTQEAS-DEAEDMKEAMNRMIDELNKQVSELSQLYKEA
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pF1KSD QKEIEKVYLDNKLLKEQAHNLTIEMKNHYVPLKVSEDMKKSHDAIIDDLNRKLLDVTQKY
       : :.:  :   : :..    .: :    :.        :  :. ...  : .   . .  
CCDS54 QAELED-YRKRKSLED----VTAE----YI-------HKAEHEKLMQLTNVSRAKAEDAL
        630        640                      650       660       670

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pF1KSD TEKKLEMEKLLLENDSLSKDVSRLETVFVPPEKHEKEIIALKSNIVELKKQLSELKKKCG
       .: : .. :.: :  .:.. :.  .   :   .: . : .:..   :.....:.::.. .
CCDS54 SEMKSQYSKVLNELTQLKQLVDAQKENSVSITEHLQVITTLRTAAKEMEEKISNLKEHLA
              680       690       700       710       720       730

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pF1KSD EDQEKIHALTSENTNLKKMMSNQYVPVKTHEEVKMTLNDTLAKTNRELLDVKKKFEDINQ
         . ..  : ..  . :  :.. .:: ...:... .:.. ..    .: .  :. : ...
CCDS54 SKEVEVAKLEKQLLEEKAAMTDAMVPRSSYEKLQSSLESEVSVLASKLKESVKEKEKVHS
              740       750       760       770       780       790

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pF1KSD EFVKIKDKNEILKRNLENTQNQIKAEYISLAEHEAKMSSLSQS---MRKVQDSNAEILAN
       : :.:...   .::. :: :. .:..   . :   :... ..    :..  .:....  .
CCDS54 EVVQIRSEVSQVKREKENIQTLLKSKEQEVNELLQKFQQAQEELAEMKRYAESSSKLEED
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pF1KSD YRKGQEEIVTLHAEIKAQKKELDTIQECIKVKYAPIVSFEECER--KFKATEKELKDQLS
         :   .:  .  :.   :. :....   ...:.   : .. ..   ..   :.:..::.
CCDS54 KDK---KINEMSKEVTKLKEALNSLS---QLSYSTSSSKRQSQQLEALQQQVKQLQNQLA
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pF1KSD E---QTQK----YSVSEEEVKKNKQEND--KLKKEIFTLQKDLRDKTVLIEKSHEMERAL
       :   : :.    : .    . ......:  :. :.:.:. :.  .:              
CCDS54 ECKKQHQEVISVYRMHLLYAVQGQMDEDVQKVLKQILTMCKNQSQKK             
          910       920       930       940       950              

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pF1KSD SRKTDELNKQLKDLSQKYTEVKNVKEKLVEENAKQTSEILAVQNLLQKQHVPLEQVEALK

>>CCDS45925.1 ANKRD24 gene_id:170961|Hs108|chr19          (1146 aa)
 initn: 1066 init1: 721 opt: 830  Z-score: 351.3  bits: 77.2 E(32554): 3e-13
Smith-Waterman score: 931; 23.3% identity (54.4% similar) in 1214 aa overlap (1-1160:1-1140)

               10                      20        30        40      
pF1KSD MKSLKSRLRRQDV--------------PGPASSGAAAASAHAADWNKYDDRLMKAAERGD
       ::.:..:... ..              : :  . :: .  .. ::.: :.::..:.: .:
CCDS45 MKTLRARFKKTELRLSPTDLGSCPPCGPCPIPKPAARGRRQSQDWGKSDERLLQAVENND
               10        20        30        40        50        60

         50        60        70        80        90       100      
pF1KSD VEKVTSILAKKGVNPGKLDVEGRSVFHVVTSKGNLECLNAILIHGVDITTSDTAGRNALH
       . .:....:.::. : ::: ::.:.::... .:   ::.... :: .. ..: :: ::::
CCDS45 APRVAALIARKGLVPTKLDPEGKSAFHLAAMRGAASCLEVMIAHGSNVMSADGAGYNALH
               70        80        90       100       110       120

        110       120       130       140       150       160      
pF1KSD LAAKYGHALCLQKLLQYNCPTEHADLQGRTALHDAAMADCPSSIQLLCDHGASVNAKDVD
       :::::::  ::..::: .: .. .: .: :::: :: . : :  ..::.  : .: .: .
CCDS45 LAAKYGHPQCLKQLLQASCVVDVVDSSGWTALHHAAAGGCLSCSEVLCSFKAHLNPQDRS
              130       140       150       160       170       180

        170       180       190       200       210       220      
pF1KSD GRTPLVLATQMSRPTICQLLIDRGADVNSRDKQNRTALMLGCEYGCRDAVEVLIKNGADI
       : :::..:.:: .  .:.::...:: .:..: :.::::::.:: .  ..::::...::. 
CCDS45 GATPLIIAAQMCHTDLCRLLLQQGAAANDQDLQGRTALMLACEGASPETVEVLLQGGAQP
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pF1KSD SLLDALGHDSSYY-ARIGDNLDILTLLKTASENTNKGRELWK--KGPSLQQRNLTHMQDE
       .. ::::.:...: :  ::.: :: ::. :..  .    : .  .: . .: ...    .
CCDS45 GITDALGQDAAHYGALAGDKL-ILHLLQEAAQRPSPPSALTEDDSGEASSQNSMSSHGKQ
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          :...      .    ...:  :.. ...::.  ::.:. ::.       : . :.  
CCDS45 GAPKKRKAPPPPASIPMPDDRDAYEEIVRLRQERGRLLQKIRGLEQHKERRQQESPEASS
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          :: . ..:..::. .....:   : .:.:..:.. .:... ...   .. . :.  :
CCDS45 LHILERQVQELQQLLVERQEEKESLGREVESLQSRLSLLENERENTSYDVTTLQDEEGEL
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        .  :   . . :  ::.   :. :      :. ..   :   .:. : .... ...:  
CCDS45 PDLPGAEVLLSRQ-LSPSAQEHLAS------LQEQVAVLTR--QNQELMEKVQILENF--
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         ..:. ... :    .::   :::  . .. . :.  .:  .::.            ..
CCDS45 --EKDETQMEVE---ALAEVIPLALY-DSLRAEFDQLRRQHAEALQ-----------ALR
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       :..:. .  .:     :: :. ...     .    ... .:. :     .....  : : 
CCDS45 QQETREVPREEG----AACGESEVAGATATKNGPTHMELNGSVAP----ETKVNGAETID
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       ::   ::     : . .. : .  :    :  : ::::    .:  .:..     .:.  
CCDS45 EEAAGDE---TMEARTMEAEATGAEATGAEATGAKVTE----TKPTGAEVREMETTEEEA
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pF1KSD NM--KSSLSNEVNEKAKKLVEMEREHEKSLSEIRQLKRELENVKAKLAQHVKPEEHE-QV
       ::  : . .. .. ..  .  :  :  :. .:    . :..   .  .:   :     ..
CCDS45 NMETKPTGAQATDTETTGVEAMGVEATKTKAE----EAEMQAYGVGAGQAEPPVTGTTNM
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pF1KSD KSRLEQKSGELGKKITELTLKNQTLQKEIEKVYLDNKLLKEQAHNLTIEMKNHYVPLKVS
       ..   . .:  .  ..   ..:  ..  .  .     :              :    ..:
CCDS45 EATGSRATGMESTGVSATGVENPGVEATVPGISAGPIL--------------HPGAAEAS
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pF1KSD EDMKKSHDAIIDDLNRKLLDVTQKYTEKKLEMEKLLLENDSLSKDVSRLETVFVPPEKHE
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CCDS45 EKLQVELETRIRGLEEAL---RQREREAAAELEAALGKCEAAEAEAGRLRERVREAEGSG
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pF1KSD KEIIALKSNIVELKKQLSELKKKCGEDQEKIHALTSENTNLKKMMSNQYVPVKTHEEVKM
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CCDS45 ASGGG-GGDTTQLRAALEQAREDLRDRDSRLRELEAASACLDEARASRLLA----EEEAR
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pF1KSD TLNDTLAKTNRELLDVKKKFEDINQEFVKIKDKNEILKRNLENTQNQIKAEYISLAEHEA
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CCDS45 GLRAELAQREEARLEQSRELEVLREQLATARATGEQQRTAAAELGRARDAAEARVAELPA
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pF1KSD KMSSLSQSMRKVQDSNAEI------LANYRKGQEEIV-------TLHAEIKAQKKELDTI
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CCDS45 ACEEARQGLAELREASEALRQSVVPASEHRRLQEEALELRGRAASLEQEVVATGKEAARL
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CCDS45 RAELERERVCSVALSEHERIVGTLQANVAQLEGQLEELGRRHEKTSAEVFQVQREALFMK
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pF1KSD KE-------IFTLQKDLRDKTVLIEKSHEMERALSRKTDELNKQLKDLSQKYTEVKNVKE
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CCDS45 SERHAAEAQLATAEQQLRGLRTEAERARQAQSRAQEALDKAKEKDKKITELSKEVFNLKE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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