FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA1561, 1416 aa 1>>>pF1KSDA1561 1416 - 1416 aa - 1416 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.8112+/-0.00185; mu= -13.8831+/- 0.110 mean_var=657.4120+/-138.649, 0's: 0 Z-trim(106.3): 280 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.050021 statistics sampled from 8690 (8911) to 8690 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.572), E-opt: 0.2 (0.274), width: 16 Scan time: 4.240 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10235.1 UACA gene_id:55075|Hs108|chr15 (1416) 8925 661.5 4.9e-189 CCDS32280.1 UACA gene_id:55075|Hs108|chr15 (1403) 8764 649.9 1.5e-185 CCDS54838.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5 ( 972) 1109 97.3 2.3e-19 CCDS54839.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5 ( 983) 1107 97.1 2.6e-19 CCDS34142.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5 ( 980) 1105 97.0 2.9e-19 CCDS54837.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5 ( 951) 981 88.0 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CCDS54 MEAKTNEWNKNDDRLLQAVENGDAEKVASLLGKKGAS 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KSD PGKLDVEGRSVFHVVTSKGNLECLNAILIHGVDITTSDTAGRNALHLAAKYGHALCLQKL : : ::...::....::..::: ... ::::.:..::.:..::::::: .: :..:: CCDS54 ATKHDSEGKTAFHLAAAKGHVECLRVMITHGVDVTAQDTTGHSALHLAAKNSHHECIRKL 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KSD LQYNCPTEHADLQGRTALHDAAMADCPSSIQLLCDHGASVNAKDVDGRTPLVLATQMSRP :: .::.: .: .:.:::: :: : ...:.::.: . .: ::.:: ::.::.: .. CCDS54 LQSKCPAESVDSSGKTALHYAAAQGCLQAVQILCEHKSPINLKDLDGNIPLLLAVQNGHS 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KSD TICQLLIDRGADVNSRDKQNRTALMLGCEYGCRDAVEVLIKNGADISLLDALGHDSSYYA ::..:.:.:::::::.:..::::::.:: : .:::.:::.:::..:.:.::... .:. CCDS54 EICHFLLDHGADVNSRNKSGRTALMLACEIGSSNAVEALIKKGADLNLVDSLGYNALHYS 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KSD RIGDNLDILTLLKTASENTNKGRELWKKGPSLQQRNLTHMQDEVNVKSHQREHQNIQDLE ....: : .:: :.........:. . .:. : . CCDS54 KLSENAGIQSLL------------------------LSKISQDADLKTPTKPKQHDQVSK 220 230 240 250 310 320 330 340 350 pF1KSD IENEDLKERLRKIQQEQRILLDKVNGLQLQLNEEVMVADDLESEREKLKSLLAAKEK--- : .: .... .. ::. :. : : .. :..::. CCDS54 ISSER-----SGTPKKRKAPPPPISPTQLS---------DVSSPRSITSTPLSGKESVFF 260 270 280 290 360 370 380 390 400 410 pF1KSD ---QHEESLRTIEALKNRFKYFES--DHLGSGSHFSNRKEDMLLKQGQMYMADSQCTSPG . . .:. :.:.. . : : . : ..... ::. : .:. . CCDS54 AEPPFKAEISSIRENKDRLSDSTTGADSLLDISSEADQQD--LLSLLQAKVASLTLHNKE 300 310 320 330 340 350 420 430 440 450 460 470 pF1KSD IPAHMQSRSMLRPLELSLPSQTSYSENEILKKELEAMRTFCESAKQDRLKLQNELAHKVA . ..:..: . : .: .. .: . : : :.. : . . : :... CCDS54 LQDKLQAKSP-KEAEADLSFDSYHSTQTDLGPSLGKP---GETSPPDSKSSPSVLIHSLG 360 370 380 390 400 410 480 490 500 510 520 530 pF1KSD ECKALALECERVKEDSDEQIKQLEDALKDVQKRMYESEGKVKQMQTHFLALKEHLTSEAA . . :.: .:.::.. :.:.:::. ::.. ::.:... . . .:. CCDS54 KSTT----------DNDVRIQQLQEILQDLQKRLESSEAERKQLQVELQSRRAELVCLNN 420 430 440 450 460 540 550 560 570 580 pF1KSD SGNHRLTEELKDQLKDLKVKYEGASAEVGKLRNQIKQNEMIVEEFKR----DEGKLIEEN . . . .:...::. . ::: : :: ....:.: . . : . : .. ::. CCDS54 TEISENSSDLSQKLKETQSKYEEAMKEVLSVQKQMKLGLVSPESMDNYSHFHELRVTEEE 470 480 490 500 510 520 590 600 610 620 630 640 pF1KSD -KRLQKELSMCEMEREKKGRKVTEMEGQAKELSAKLALSIPAEKFENMKSSLSNEVNEKA . :...:. : :.. .:: :.: . : ... :.:..:.:::: . ... CCDS54 INVLKQDLQNALEESERNKEKVRELEEKLVEREKGTVIKPPVEEYEEMKSSYCSVIENMN 530 540 550 560 570 580 650 660 670 680 690 700 pF1KSD KKLVEMEREHEKSLSEIRQLKRELENVKAKLAQHVKPEEHEQVKSRLEQKSGELGKKITE :. . . ...... :: .:: ...:....:... .: :..: ... ::.:...: CCDS54 KEKAFLFEKYQEAQEEIMKLK---DTLKSQMTQEAS-DEAEDMKEAMNRMIDELNKQVSE 590 600 610 620 630 710 720 730 740 750 760 pF1KSD LTLKNQTLQKEIEKVYLDNKLLKEQAHNLTIEMKNHYVPLKVSEDMKKSHDAIIDDLNRK :. . : :.: : : :.. .: : :. : :. ... : . CCDS54 LSQLYKEAQAELED-YRKRKSLED----VTAE----YI-------HKAEHEKLMQLTNVS 640 650 660 670 680 770 780 790 800 810 820 pF1KSD LLDVTQKYTEKKLEMEKLLLENDSLSKDVSRLETVFVPPEKHEKEIIALKSNIVELKKQL . . .: : .. :.: : .:.. :. . : .: . : .:.. :..... CCDS54 RAKAEDALSEMKSQYSKVLNELTQLKQLVDAQKENSVSITEHLQVITTLRTAAKEMEEKI 690 700 710 720 730 740 830 840 850 860 870 880 pF1KSD SELKKKCGEDQEKIHALTSENTNLKKMMSNQYVPVKTHEEVKMTLNDTLAKTNRELLDVK :.::.. . . .. : .. . : :.. .:: ...:... .:.. .. .: . CCDS54 SNLKEHLASKEVEVAKLEKQLLEEKAAMTDAMVPRSSYEKLQSSLESEVSVLASKLKESV 750 760 770 780 790 800 890 900 910 920 930 940 pF1KSD KKFEDINQEFVKIKDKNEILKRNLENTQNQIKAEYISLAEHEAKMSSLSQS---MRKVQD :. : ...: :.:... .::. :: :. .:.. . : :... .. :.. . CCDS54 KEKEKVHSEVVQIRSEVSQVKREKENIQTLLKSKEQEVNELLQKFQQAQEELAEMKRYAE 810 820 830 840 850 860 950 960 970 980 990 1000 pF1KSD SNAEILANYRKGQEEIVTLHAEIKAQKKELDTIQECIKVKYAPIVSFEECER--KFKATE :.... . : .: . :. :. :..... ..:. : .. .. .. CCDS54 SSSKLEEDKDK---KINEMSKEVTKLKEALNSLSQ---LSYSTSSSKRQSQQLEALQQQV 870 880 890 900 910 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KSD KELKDQLSE---QTQK----YSVSEEEVKKNKQEND--KLKKEIFTLQKDLRDKTVLIEK :.:..::.: : :. : . . ......: :. :.:.:. :. .: CCDS54 KQLQNQLAECKKQHQEVISVYRMHLLYAVQGQMDEDVQKVLKQILTMCKNQSQKK 920 930 940 950 960 970 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KSD SHEMERALSRKTDELNKQLKDLSQKYTEVKNVKEKLVEENAKQTSEILAVQNLLQKQHVP >>CCDS54839.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5 (983 aa) initn: 1464 init1: 831 opt: 1107 Z-score: 460.1 bits: 97.1 E(32554): 2.6e-19 Smith-Waterman score: 1228; 27.2% identity (60.8% similar) in 1053 aa overlap (22-1047:10-982) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MKSLKSRLRRQDVPGPASSGAAAASAHAADWNKYDDRLMKAAERGDVEKVTSILAKKGVN .: .. .::: ::::..:.: ::.:::.:.:.:::.. CCDS54 MQPTYLPWLSAKEKKTNEWNKNDDRLLQAVENGDAEKVASLLGKKGAS 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KSD PGKLDVEGRSVFHVVTSKGNLECLNAILIHGVDITTSDTAGRNALHLAAKYGHALCLQKL : : ::...::....::..::: ... ::::.:..::.:..::::::: .: :..:: CCDS54 ATKHDSEGKTAFHLAAAKGHVECLRVMITHGVDVTAQDTTGHSALHLAAKNSHHECIRKL 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KSD LQYNCPTEHADLQGRTALHDAAMADCPSSIQLLCDHGASVNAKDVDGRTPLVLATQMSRP :: .::.: .: .:.:::: :: : ...:.::.: . .: ::.:: ::.::.: .. CCDS54 LQSKCPAESVDSSGKTALHYAAAQGCLQAVQILCEHKSPINLKDLDGNIPLLLAVQNGHS 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KSD TICQLLIDRGADVNSRDKQNRTALMLGCEYGCRDAVEVLIKNGADISLLDALGHDSSYYA ::..:.:.:::::::.:..::::::.:: : .:::.:::.:::..:.:.::... .:. CCDS54 EICHFLLDHGADVNSRNKSGRTALMLACEIGSSNAVEALIKKGADLNLVDSLGYNALHYS 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KSD RIGDNLDILTLLKTASENTNKGRELWKKGPSLQQRNLTHMQDEVNVKSHQREHQNIQDLE ....: : .:: :.........:. . .:. : . CCDS54 KLSENAGIQSLL------------------------LSKISQDADLKTPTKPKQHDQVSK 230 240 250 260 310 320 330 340 350 pF1KSD IENEDLKERLRKIQQEQRILLDKVNGLQLQLNEEVMVADDLESEREKLKSLLAAKEK--- : .: .... .. ::. :. : : .. :..::. CCDS54 ISSER-----SGTPKKRKAPPPPISPTQLS---------DVSSPRSITSTPLSGKESVFF 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KSD ---QHEESLRTIEALKNRFKYFES--DHLGSGSHFSNRKEDMLLKQGQMYMADSQCTSPG . . .:. :.:.. . : : . : ..... ::. : .:. . CCDS54 AEPPFKAEISSIRENKDRLSDSTTGADSLLDISSEADQQD--LLSLLQAKVASLTLHNKE 320 330 340 350 360 420 430 440 450 460 470 pF1KSD IPAHMQSRSMLRPLELSLPSQTSYSENEILKKELEAMRTFCESAKQDRLKLQNELAHKVA . ..:..: . : .: .. .: . : : :.. : . . : :... CCDS54 LQDKLQAKSP-KEAEADLSFDSYHSTQTDLGPSLGKPG---ETSPPDSKSSPSVLIHSLG 370 380 390 400 410 420 480 490 500 510 520 530 pF1KSD ECKALALECERVKEDSDEQIKQLEDALKDVQKRMYESEGKVKQMQTHFLALKEHLTSEAA . :.: .:.::.. :.:.:::. ::.. ::.:... . . .:. CCDS54 ----------KSTTDNDVRIQQLQEILQDLQKRLESSEAERKQLQVELQSRRAELVCLNN 430 440 450 460 470 540 550 560 570 580 pF1KSD SGNHRLTEELKDQLKDLKVKYEGASAEVGKLRNQIKQNEMIVEEFKR----DEGKLIEEN . . . .:...::. . ::: : :: ....:.: . . : . : .. ::. CCDS54 TEISENSSDLSQKLKETQSKYEEAMKEVLSVQKQMKLGLVSPESMDNYSHFHELRVTEEE 480 490 500 510 520 530 590 600 610 620 630 640 pF1KSD -KRLQKELSMCEMEREKKGRKVTEMEGQAKELSAKLALSIPAEKFENMKSSLSNEVNEKA . :...:. : :.. .:: :.: . : ... :.:..:.:::: . ... CCDS54 INVLKQDLQNALEESERNKEKVRELEEKLVEREKGTVIKPPVEEYEEMKSSYCSVIENMN 540 550 560 570 580 590 650 660 670 680 690 700 pF1KSD KKLVEMEREHEKSLSEIRQLKRELENVKAKLAQHVKPEEHEQVKSRLEQKSGELGKKITE :. . . ...... :: .:: ...:....:... .: :..: ... ::.:...: CCDS54 KEKAFLFEKYQEAQEEIMKLK---DTLKSQMTQEAS-DEAEDMKEAMNRMIDELNKQVSE 600 610 620 630 640 650 710 720 730 740 750 760 pF1KSD LTLKNQTLQKEIEKVYLDNKLLKEQAHNLTIEMKNHYVPLKVSEDMKKSHDAIIDDLNRK :. . : :.: : : :.. .: : :. : :. ... : . CCDS54 LSQLYKEAQAELED-YRKRKSLED----VTAE----YI-------HKAEHEKLMQLTNVS 660 670 680 690 770 780 790 800 810 820 pF1KSD LLDVTQKYTEKKLEMEKLLLENDSLSKDVSRLETVFVPPEKHEKEIIALKSNIVELKKQL . . .: : .. :.: : .:.. :. . : .: . : .:.. :..... CCDS54 RAKAEDALSEMKSQYSKVLNELTQLKQLVDAQKENSVSITEHLQVITTLRTAAKEMEEKI 700 710 720 730 740 750 830 840 850 860 870 880 pF1KSD SELKKKCGEDQEKIHALTSENTNLKKMMSNQYVPVKTHEEVKMTLNDTLAKTNRELLDVK :.::.. . . .. : .. . : :.. .:: ...:... .:.. .. .: . CCDS54 SNLKEHLASKEVEVAKLEKQLLEEKAAMTDAMVPRSSYEKLQSSLESEVSVLASKLKESV 760 770 780 790 800 810 890 900 910 920 930 940 pF1KSD KKFEDINQEFVKIKDKNEILKRNLENTQNQIKAEYISLAEHEAKMSSLSQS---MRKVQD :. : ...: :.:... .::. :: :. .:.. . : :... .. :.. . CCDS54 KEKEKVHSEVVQIRSEVSQVKREKENIQTLLKSKEQEVNELLQKFQQAQEELAEMKRYAE 820 830 840 850 860 870 950 960 970 980 990 1000 pF1KSD SNAEILANYRKGQEEIVTLHAEIKAQKKELDTIQECIKVKYAPIVSFEECER--KFKATE :.... . : .: . :. :. :..... ..:. : .. .. .. CCDS54 SSSKLEEDKDK---KINEMSKEVTKLKEALNSLSQ---LSYSTSSSKRQSQQLEALQQQV 880 890 900 910 920 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KSD KELKDQLSE---QTQK----YSVSEEEVKKNKQEND--KLKKEIFTLQKDLRDKTVLIEK :.:..::.: : :. : . . ......: :. :.:.:. :. .: CCDS54 KQLQNQLAECKKQHQEVISVYRMHLLYAVQGQMDEDVQKVLKQILTMCKNQSQKK 930 940 950 960 970 980 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KSD SHEMERALSRKTDELNKQLKDLSQKYTEVKNVKEKLVEENAKQTSEILAVQNLLQKQHVP >>CCDS34142.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5 (980 aa) initn: 1462 init1: 829 opt: 1105 Z-score: 459.4 bits: 97.0 E(32554): 2.9e-19 Smith-Waterman score: 1237; 27.2% identity (60.5% similar) in 1074 aa overlap (1-1047:1-979) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MKSLKSRLRRQDVPGPASSGAAAASAHAADWNKYDDRLMKAAERGDVEKVTSILAKKGVN :::::...:..:. .::: ::::..:.: ::.:::.:.:.:::.. CCDS34 MKSLKAKFRKSDT---------------NEWNKNDDRLLQAVENGDAEKVASLLGKKGAS 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KSD PGKLDVEGRSVFHVVTSKGNLECLNAILIHGVDITTSDTAGRNALHLAAKYGHALCLQKL : : ::...::....::..::: ... ::::.:..::.:..::::::: .: :..:: CCDS34 ATKHDSEGKTAFHLAAAKGHVECLRVMITHGVDVTAQDTTGHSALHLAAKNSHHECIRKL 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KSD LQYNCPTEHADLQGRTALHDAAMADCPSSIQLLCDHGASVNAKDVDGRTPLVLATQMSRP :: .::.: .: .:.:::: :: : ...:.::.: . .: ::.:: ::.::.: .. CCDS34 LQSKCPAESVDSSGKTALHYAAAQGCLQAVQILCEHKSPINLKDLDGNIPLLLAVQNGHS 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KSD TICQLLIDRGADVNSRDKQNRTALMLGCEYGCRDAVEVLIKNGADISLLDALGHDSSYYA ::..:.:.:::::::.:..::::::.:: : .:::.:::.:::..:.:.::... .:. CCDS34 EICHFLLDHGADVNSRNKSGRTALMLACEIGSSNAVEALIKKGADLNLVDSLGYNALHYS 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KSD RIGDNLDILTLLKTASENTNKGRELWKKGPSLQQRNLTHMQDEVNVKSHQREHQNIQDLE ....: : .:: :.........:. . .:. : . CCDS34 KLSENAGIQSLL------------------------LSKISQDADLKTPTKPKQHDQVSK 230 240 250 260 310 320 330 340 350 pF1KSD IENEDLKERLRKIQQEQRILLDKVNGLQLQLNEEVMVADDLESEREKLKSLLAAKEK--- : .: .... .. ::. :. : : .. :..::. CCDS34 ISSER-----SGTPKKRKAPPPPISPTQLS---------DVSSPRSITSTPLSGKESVFF 270 280 290 300 360 370 380 390 400 410 pF1KSD ---QHEESLRTIEALKNRFKYFES--DHLGSGSHFSNRKEDMLLKQGQMYMADSQCTSPG . . .:. :.:.. . : : . : ..... ::. : .:. . CCDS34 AEPPFKAEISSIRENKDRLSDSTTGADSLLDISSEADQQD--LLSLLQAKVASLTLHNKE 310 320 330 340 350 360 420 430 440 450 460 470 pF1KSD IPAHMQSRSMLRPLELSLPSQTSYSENEILKKELEAMRTFCESAKQDRLKLQNELAHKVA . ..:..: . : .: .. .: . : : :.. : . . : :... CCDS34 LQDKLQAKSP-KEAEADLSFDSYHSTQTDLGPSLGKP---GETSPPDSKSSPSVLIHSLG 370 380 390 400 410 420 480 490 500 510 520 530 pF1KSD ECKALALECERVKEDSDEQIKQLEDALKDVQKRMYESEGKVKQMQTHFLALKEHLTSEAA . . :.: .:.::.. :.:.:::. ::.. ::.:... . . .:. 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CCDS34 LSQLYKEAQAELED-YRKRKSLED----VTAE----YI-------HKAEHEKLMQLTNVS 650 660 670 680 690 770 780 790 800 810 820 pF1KSD LLDVTQKYTEKKLEMEKLLLENDSLSKDVSRLETVFVPPEKHEKEIIALKSNIVELKKQL . . .: : .. :.: : .:.. :. . : .: . : .:.. :..... CCDS34 RAKAEDALSEMKSQYSKVLNELTQLKQLVDAQKENSVSITEHLQVITTLRTAAKEMEEKI 700 710 720 730 740 750 830 840 850 860 870 880 pF1KSD SELKKKCGEDQEKIHALTSENTNLKKMMSNQYVPVKTHEEVKMTLNDTLAKTNRELLDVK :.::.. . . .. : .. . : :.. .:: ...:... .:.. .. .: . CCDS34 SNLKEHLASKEVEVAKLEKQLLEEKAAMTDAMVPRSSYEKLQSSLESEVSVLASKLKESV 760 770 780 790 800 810 890 900 910 920 930 940 pF1KSD KKFEDINQEFVKIKDKNEILKRNLENTQNQIKAEYISLAEHEAKMSSLSQS---MRKVQD :. : ...: :.:... .::. :: :. .:.. . : :... .. :.. . CCDS34 KEKEKVHSEVVQIRSEVSQVKREKENIQTLLKSKEQEVNELLQKFQQAQEELAEMKRYAE 820 830 840 850 860 870 950 960 970 980 990 1000 pF1KSD SNAEILANYRKGQEEIVTLHAEIKAQKKELDTIQECIKVKYAPIVSFEECER--KFKATE :.... . : .: . :. :. :.... ...:. : .. .. .. CCDS34 SSSKLEEDKDK---KINEMSKEVTKLKEALNSLS---QLSYSTSSSKRQSQQLEALQQQV 880 890 900 910 920 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KSD KELKDQLSE---QTQK----YSVSEEEVKKNKQEND--KLKKEIFTLQKDLRDKTVLIEK :.:..::.: : :. : . . ......: :. :.:.:. :. .: CCDS34 KQLQNQLAECKKQHQEVISVYRMHLLYAVQGQMDEDVQKVLKQILTMCKNQSQKK 930 940 950 960 970 980 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KSD SHEMERALSRKTDELNKQLKDLSQKYTEVKNVKEKLVEENAKQTSEILAVQNLLQKQHVP >>CCDS54837.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5 (951 aa) initn: 1462 init1: 829 opt: 981 Z-score: 411.2 bits: 88.0 E(32554): 1.4e-16 Smith-Waterman score: 1216; 27.4% identity (61.0% similar) in 1066 aa overlap (1-1047:1-950) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MKSLKSRLRRQDVPGPASSGAAAASAHAADWNKYDDRLMKAAERGDVEKVTSILAKKGVN :::::...:..:. .::: ::::..:.: ::.:::.:.:.:::.. 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CCDS54 KLSENAGIQSLLLS---KISQDADL--KTPT-KPKQLSDVSSPRSITSTPLSGK--ESVF 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KSD IENEDLKERLRKIQQEQRILLDKVNGLQLQLNEEVMVADDLESEREKLKSLLAAKEKQHE . . .: .. .:.... : :...: . :. ... :.... : ::: :: CCDS54 FAEPPFKAEISSIRENKDRLSDSTTGADSLLD----ISS--EADQQDLLSLLQAK----V 280 290 300 310 320 370 380 390 400 410 420 pF1KSD ESLRTIEALKNRFKYFESDHLGSGSHFSNRKEDMLLKQGQMYMADSQCTSPGIPAHMQSR :: .:.:. . .. . :. . :: . : . ... CCDS54 ASL----TLHNK----------------ELQDKLQAKSPKEAEADLSFDS-----YHSTQ 330 340 350 360 430 440 450 460 470 480 pF1KSD SMLRPLELSLPSQTSYSENEILKKELEAMRTFCESAKQDRLKLQNELAHKVAECKALALE . : : :. :..:: : . . : :.... . CCDS54 TDLGP-SLGKPGETS---------------------PPDSKSSPSVLIHSLGKSTT---- 370 380 390 490 500 510 520 530 540 pF1KSD CERVKEDSDEQIKQLEDALKDVQKRMYESEGKVKQMQTHFLALKEHLTSEAASGNHRLTE :.: .:.::.. :.:.:::. ::.. ::.:... . . .:. . . . 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CCDS54 QAELED-YRKRKSLED----VTAE----YI-------HKAEHEKLMQLTNVSRAKAEDAL 630 640 650 660 670 780 790 800 810 820 830 pF1KSD TEKKLEMEKLLLENDSLSKDVSRLETVFVPPEKHEKEIIALKSNIVELKKQLSELKKKCG .: : .. :.: : .:.. :. . : .: . : .:.. :.....:.::.. . CCDS54 SEMKSQYSKVLNELTQLKQLVDAQKENSVSITEHLQVITTLRTAAKEMEEKISNLKEHLA 680 690 700 710 720 730 840 850 860 870 880 890 pF1KSD EDQEKIHALTSENTNLKKMMSNQYVPVKTHEEVKMTLNDTLAKTNRELLDVKKKFEDINQ . .. : .. . : :.. .:: ...:... .:.. .. .: . :. : ... CCDS54 SKEVEVAKLEKQLLEEKAAMTDAMVPRSSYEKLQSSLESEVSVLASKLKESVKEKEKVHS 740 750 760 770 780 790 900 910 920 930 940 950 pF1KSD EFVKIKDKNEILKRNLENTQNQIKAEYISLAEHEAKMSSLSQS---MRKVQDSNAEILAN : :.:... .::. :: :. .:.. . : :... .. :.. .:.... . CCDS54 EVVQIRSEVSQVKREKENIQTLLKSKEQEVNELLQKFQQAQEELAEMKRYAESSSKLEED 800 810 820 830 840 850 960 970 980 990 1000 1010 pF1KSD YRKGQEEIVTLHAEIKAQKKELDTIQECIKVKYAPIVSFEECER--KFKATEKELKDQLS : .: . :. :. :.... ...:. : .. .. .. :.:..::. CCDS54 KDK---KINEMSKEVTKLKEALNSLS---QLSYSTSSSKRQSQQLEALQQQVKQLQNQLA 860 870 880 890 900 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KSD E---QTQK----YSVSEEEVKKNKQEND--KLKKEIFTLQKDLRDKTVLIEKSHEMERAL : : :. : . . ......: :. :.:.:. :. .: CCDS54 ECKKQHQEVISVYRMHLLYAVQGQMDEDVQKVLKQILTMCKNQSQKK 910 920 930 940 950 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KSD SRKTDELNKQLKDLSQKYTEVKNVKEKLVEENAKQTSEILAVQNLLQKQHVPLEQVEALK >>CCDS45925.1 ANKRD24 gene_id:170961|Hs108|chr19 (1146 aa) initn: 1066 init1: 721 opt: 830 Z-score: 351.3 bits: 77.2 E(32554): 3e-13 Smith-Waterman score: 931; 23.3% identity (54.4% similar) in 1214 aa overlap (1-1160:1-1140) 10 20 30 40 pF1KSD MKSLKSRLRRQDV--------------PGPASSGAAAASAHAADWNKYDDRLMKAAERGD ::.:..:... .. : : . :: . .. ::.: :.::..:.: .: CCDS45 MKTLRARFKKTELRLSPTDLGSCPPCGPCPIPKPAARGRRQSQDWGKSDERLLQAVENND 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KSD VEKVTSILAKKGVNPGKLDVEGRSVFHVVTSKGNLECLNAILIHGVDITTSDTAGRNALH . .:....:.::. : ::: ::.:.::... .: ::.... :: .. ..: :: :::: CCDS45 APRVAALIARKGLVPTKLDPEGKSAFHLAAMRGAASCLEVMIAHGSNVMSADGAGYNALH 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KSD LAAKYGHALCLQKLLQYNCPTEHADLQGRTALHDAAMADCPSSIQLLCDHGASVNAKDVD ::::::: ::..::: .: .. .: .: :::: :: . : : ..::. : .: .: . 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