Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1576
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1576, 419 aa
1>>>pF1KSDA1576 419 - 419 aa - 419 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6091+/-0.000788; mu= 15.8324+/- 0.048
mean_var=68.6573+/-13.577, 0's: 0 Z-trim(108.0): 27 B-trim: 6 in 1/49
Lambda= 0.154786
statistics sampled from 9933 (9960) to 9933 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.677), E-opt: 0.2 (0.306), width: 16
Scan time: 2.730
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32492.1 VAT1L gene_id:57687|Hs108|chr16 ( 419) 2759 625.0 4.2e-179
CCDS11451.1 VAT1 gene_id:10493|Hs108|chr17 ( 393) 1070 247.8 1.4e-65
CCDS665.1 CRYZ gene_id:1429|Hs108|chr1 ( 329) 487 117.6 1.8e-26
CCDS44162.1 CRYZ gene_id:1429|Hs108|chr1 ( 295) 423 103.3 3.3e-22
CCDS1708.1 TP53I3 gene_id:9540|Hs108|chr2 ( 332) 413 101.0 1.7e-21
CCDS56112.1 TP53I3 gene_id:9540|Hs108|chr2 ( 248) 352 87.4 1.7e-17
CCDS12008.1 ZADH2 gene_id:284273|Hs108|chr18 ( 377) 306 77.2 3e-14
CCDS30659.1 MECR gene_id:51102|Hs108|chr1 ( 373) 269 68.9 9.2e-12
>>CCDS32492.1 VAT1L gene_id:57687|Hs108|chr16 (419 aa)
initn: 2759 init1: 2759 opt: 2759 Z-score: 3329.0 bits: 625.0 E(32554): 4.2e-179
Smith-Waterman score: 2759; 100.0% identity (100.0% similar) in 419 aa overlap (1-419:1-419)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAKEGVEKAEETEQMIEKEAGKEPAEGGGGDGSHRLGDAQEMRAVVLAGFGGLNKLRLFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MAKEGVEKAEETEQMIEKEAGKEPAEGGGGDGSHRLGDAQEMRAVVLAGFGGLNKLRLFR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KAMPEPQDGELKIRVKACGLNFIDLMVRQGNIDNPPKTPLVPGFECSGIVEALGDSVKGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KAMPEPQDGELKIRVKACGLNFIDLMVRQGNIDNPPKTPLVPGFECSGIVEALGDSVKGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EIGDRVMAFVNYNAWAEVVCTPVEFVYKIPDDMSFSEAAAFPMNFVTAYVMLFEVANLRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EIGDRVMAFVNYNAWAEVVCTPVEFVYKIPDDMSFSEAAAFPMNFVTAYVMLFEVANLRE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GMSVLVHSAGGGVGQAVAQLCSTVPNVTVFGTASTFKHEAIKDSVTHLFDRNADYVQEVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GMSVLVHSAGGGVGQAVAQLCSTVPNVTVFGTASTFKHEAIKDSVTHLFDRNADYVQEVK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RISAEGVDIVLDCLCGDNTGKGLSLLKPLGTYILYGSSNMVTGETKSFFSFAKSWWQVEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RISAEGVDIVLDCLCGDNTGKGLSLLKPLGTYILYGSSNMVTGETKSFFSFAKSWWQVEK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VNPIKLYEENKVIAGFSLLNLLFKQGRAGLIRGVVEKLIGLYNQKKIKPVVDSLWALEEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VNPIKLYEENKVIAGFSLLNLLFKQGRAGLIRGVVEKLIGLYNQKKIKPVVDSLWALEEV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KSD KEAMQRIHDRGNIGKLILDVEKTPTPLMANDSTETSEAGEEEEDHEGDSENKERMPFIQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KEAMQRIHDRGNIGKLILDVEKTPTPLMANDSTETSEAGEEEEDHEGDSENKERMPFIQ
370 380 390 400 410
>>CCDS11451.1 VAT1 gene_id:10493|Hs108|chr17 (393 aa)
initn: 1051 init1: 563 opt: 1070 Z-score: 1291.0 bits: 247.8 E(32554): 1.4e-65
Smith-Waterman score: 1070; 44.0% identity (75.1% similar) in 377 aa overlap (19-390:24-393)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAKEGVEKAEETEQMIEKEAGKEPAEGGGGDGSHRLGDAQEM-RAVVLAGFGGLN
::...: . ....:. . . . : .::.:::: .
CCDS11 MSDEREVAEAATGEDASSPPPKTEAASDPQHPAASEGAAAAAASPPLLRCLVLTGFGGYD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD KLRLFRK--AMPEPQDGELKIRVKACGLNFIDLMVRQGNIDNPPKTPLVPGFECSGIVEA
:..: . : : : :.: .:..:::::: :::.::: : : :..::.: .:.: :
CCDS11 KVKLQSRPAAPPAPGPGQLTLRLRACGLNFADLMARQGLYDRLPPLPVTPGMEGAGVVIA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LGDSVKGYEIGDRVMAFVNYNAWAEVVCTPVEFVYKIPDDMSFSEAAAFPMNFVTAYVML
.:..:. . :::::.. . : : : .: .. ::. :.: ::::. .:..:::..:
CCDS11 VGEGVSDRKAGDRVMVLNRSGMWQEEVTVPSVQTFLIPEAMTFEEAAALLVNYITAYMVL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD FEVANLREGMSVLVHSAGGGVGQAVAQLCSTVPNVTVFGTASTFKHEAIKDS-VTHLFDR
:. .::. : ::::: :.::::.:..::: :: :::::::::. ::::.:.. ::: .:
CCDS11 FDFGNLQPGHSVLVHMAAGGVGMAAVQLCRTVENVTVFGTASASKHEALKENGVTHPIDY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD NA-DYVQEVKRISAEGVDIVLDCLCGDNTGKGLSLLKPLGTYILYGSSNMVTGETKSFFS
.. :::.:.:.:: .:::::.: : :..:.:: .::::.: . :: .:..:: .....
CCDS11 HTTDYVDEIKKISPKGVDIVMDPLGGSDTAKGYNLLKPMGKVVTYGMANLLTGPKRNLMA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD FAKSWWQVEKVNPIKLYEENKVIAGFSLLNLLFKQGRAGLIRGVVEKLIGLYNQKKIKPV
.:..::. .:. ..: . :... :: .: . .:.. :. ::: .:..:::: .:::
CCDS11 LARTWWNQFSVTALQLLQANRAVCGF---HLGYLDGEVELVSGVVARLLALYNQGHIKPH
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD VDSLWALEEVKEAMQRIHDRGNIGKLILDVEKTPTPLMANDSTETSEAGEEEEDHEGDSE
.::.: .:.: .::...... :.::..: .: : :
CCDS11 IDSVWPFEKVADAMKQMQEKKNVGKVLL----VPGPEKEN
360 370 380 390
pF1KSD NKERMPFIQ
>>CCDS665.1 CRYZ gene_id:1429|Hs108|chr1 (329 aa)
initn: 508 init1: 201 opt: 487 Z-score: 588.6 bits: 117.6 E(32554): 1.8e-26
Smith-Waterman score: 544; 32.3% identity (64.3% similar) in 347 aa overlap (42-378:8-327)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD TEQMIEKEAGKEPAEGGGGDGSHRLGDAQEMRAVVLAGFGGLNKLRLFRK-AMPEPQDGE
:::: . ::: . :.: :.: :.: .
CCDS66 MATGQKLMRAVRVFEFGGPEVLKLRSDIAVPIPKDHQ
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KSD LKIRVKACGLNFIDLMVRQGNIDNPPKTPLVPGFECSGIVEALGDSVKGYEIGDRVMAFV
. :.:.:::.: .. ..:.:. . : : .:: . .:..::.::...... ::::..
CCDS66 VLIKVHACGVNPVETYIRSGTYSRKPLLPYTPGSDVAGVIEAVGDNASAFKKGDRVFTSS
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180
pF1KSD NYNA-WAEVVCTPVEFVYKIPDDMSFSEAAAFPMNFVTAYVMLFEVANLREGMSVLVHSA
. .. .:: . . . :::.:. ..:...::. . . ::: :.. : .. : :::::.:
CCDS66 TISGGYAEYALAADHTVYKLPEKLDFKQGAAIGIPYFTAYRALIHSACVKAGESVLVHGA
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GGGVGQAVAQLCSTVPNVTVFGTASTFKHEAI--KDSVTHLFD-RNADYVQEVKR-ISAE
.:::: :. :. . . .. ..:::.: . . : .... ..:. :...:....:. .. .
CCDS66 SGGVGLAACQI-ARAYGLKILGTAGTEEGQKIVLQNGAHEVFNHREVNYIDKIKKYVGEK
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GVDIVLDCLCGDNTGKGLSLLKPLGTYILYGSSNMVTGETKSFFSFAKSWWQVEKVNPIK
:.::... : . : .: ::::. : :. :: . . ..::
CCDS66 GIDIIIEMLANVNLSKDLSLLSHGGRVIVVGSRGTI------------------EINPRD
220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LYEENKVIAGFSLLNLL---FKQGRAGLIRGVVEKLIGLYNQKKIKPVVDSLWALEEVKE
. ... : : .:.. :.: :.: :. :: .:::. : . ::.: :
CCDS66 TMAKESSIIGVTLFSSTKEEFQQYAAALQAGME---IGW-----LKPVIGSQYPLEKVAE
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410
pF1KSD AMQRI-HDRGNIGKLILDVEKTPTPLMANDSTETSEAGEEEEDHEGDSENKERMPFIQ
: . : : : ::.::
CCDS66 AHENIIHGSGATGKMILLL
320
>>CCDS44162.1 CRYZ gene_id:1429|Hs108|chr1 (295 aa)
initn: 452 init1: 201 opt: 423 Z-score: 512.1 bits: 103.3 E(32554): 3.3e-22
Smith-Waterman score: 423; 32.3% identity (72.0% similar) in 232 aa overlap (42-266:8-238)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD TEQMIEKEAGKEPAEGGGGDGSHRLGDAQEMRAVVLAGFGGLNKLRLFRK-AMPEPQDGE
:::: . ::: . :.: :.: :.: .
CCDS44 MATGQKLMRAVRVFEFGGPEVLKLRSDIAVPIPKDHQ
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KSD LKIRVKACGLNFIDLMVRQGNIDNPPKTPLVPGFECSGIVEALGDSVKGYEIGDRVMAFV
. :.:.:::.: .. ..:.:. . : : .:: . .:..::.::...... ::::..
CCDS44 VLIKVHACGVNPVETYIRSGTYSRKPLLPYTPGSDVAGVIEAVGDNASAFKKGDRVFTSS
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180
pF1KSD NYNA-WAEVVCTPVEFVYKIPDDMSFSEAAAFPMNFVTAYVMLFEVANLREGMSVLVHSA
. .. .:: . . . :::.:. ..:...::. . . ::: :.. : .. : :::::.:
CCDS44 TISGGYAEYALAADHTVYKLPEKLDFKQGAAIGIPYFTAYRALIHSACVKAGESVLVHGA
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GGGVGQAVAQLCSTVPNVTVFGTASTFKHEAI--KDSVTHLFD-RNADYVQEVKRISAEG
.:::: :. :. . . .. ..:::.: . . : .... ..:. :...:....: ....:
CCDS44 SGGVGLAACQI-ARAYGLKILGTAGTEEGQKIVLQNGAHEVFNHREVNYIDKIKVVGSRG
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD -VDIV-LDCLCGDNTGKGLSLLKPLGTYILYGSSNMVTGETKSFFSFAKSWWQVEKVNPI
..: : . ... :..:.
CCDS44 TIEINPRDTMAKESSIIGVTLFSSTKEEFQQYAAALQAGMEIGWLKPVIGSQYPLEKVAE
220 230 240 250 260 270
>>CCDS1708.1 TP53I3 gene_id:9540|Hs108|chr2 (332 aa)
initn: 328 init1: 183 opt: 413 Z-score: 499.3 bits: 101.0 E(32554): 1.7e-21
Smith-Waterman score: 467; 28.9% identity (62.2% similar) in 349 aa overlap (42-382:1-332)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD TEQMIEKEAGKEPAEGGGGDGSHRLGDAQEMRAVVLAGFGGLNKLRLFRKAMPEPQDGEL
: :: . :: ..: . . : : : .::.
CCDS17 MLAVHFDKPGGPENLYVKEVAKPSPGEGEV
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KSD KIRVKACGLNFIDLMVRQGNIDNPPKTPLVPGFECSGIVEALGDSVKGY-EIGDRVMAFV
..: : .:: ::: :::. : :: . . :.: :: : :: . .:. .::: .::..
CCDS17 LLKVAASALNRADLMQRQGQYDPPPGASNILGLEASGHVAELGPGCQGHWKIGDTAMALL
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KSD NYNAWAEVVCTPVEFVYKIPDDMSFSEAAAFPMNFVTAYVMLFEVANLREGMSVLVHSAG
.. :. : .: ... ::. .....:::.: ..::. .: :.:.. : ::.:..
CCDS17 PGGGQAQYVTVPEGLLMPIPEGLTLTQAAAIPEAWLTAFQLLHLVGNVQAGDYVLIHAGL
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240
pF1KSD GGVGQAVAQLC---STVPNVTVFGTASTFKHEAIKDSVTHLFDRNADYVQE-VKRISAEG
.::: :. :: ...: ::. :. . .. ... . .. :. . .: .. :
CCDS17 SGVGTAAIQLTRMAGAIPLVTA-GSQKKLQMAEKLGAAAGFNYKKEDFSEATLKFTKGAG
160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VDIVLDCLCGDNTGKGLSLLKPLGTYILYGSSNMVTGETKSFFSFAKSWWQVEKVNPIKL
:...:::. :. :... : : ..::: : :. .. . :.: :
CCDS17 VNLILDCIGGSYWEKNVNCLALDGRWVLYGL--MGGGDINGPL-FSKL-----------L
210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KSD YEENKVIAGFSLLNLLFKQGRAGLIRGVVEKLIGLYNQ---KKIKPVVDSLWALEEVKEA
......:. ::: .. . :. . .:... .. ... ::.: .. . :..::
CCDS17 FKRGSLIT--SLLRSRDNKYKQMLVNAFTEQILPHFSTEGPQRLLPVLDRIYPVTEIQEA
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410
pF1KSD MQRIHDRGNIGKLILDVEKTPTPLMANDSTETSEAGEEEEDHEGDSENKERMPFIQ
. .. ::::..:.. .
CCDS17 HKYMEANKNIGKIVLELPQ
320 330
>>CCDS56112.1 TP53I3 gene_id:9540|Hs108|chr2 (248 aa)
initn: 183 init1: 183 opt: 352 Z-score: 427.6 bits: 87.4 E(32554): 1.7e-17
Smith-Waterman score: 352; 31.0% identity (64.2% similar) in 226 aa overlap (42-263:1-224)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD TEQMIEKEAGKEPAEGGGGDGSHRLGDAQEMRAVVLAGFGGLNKLRLFRKAMPEPQDGEL
: :: . :: ..: . . : : : .::.
CCDS56 MLAVHFDKPGGPENLYVKEVAKPSPGEGEV
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KSD KIRVKACGLNFIDLMVRQGNIDNPPKTPLVPGFECSGIVEALGDSVKGY-EIGDRVMAFV
..: : .:: ::: :::. : :: . . :.: :: : :: . .:. .::: .::..
CCDS56 LLKVAASALNRADLMQRQGQYDPPPGASNILGLEASGHVAELGPGCQGHWKIGDTAMALL
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KSD NYNAWAEVVCTPVEFVYKIPDDMSFSEAAAFPMNFVTAYVMLFEVANLREGMSVLVHSAG
.. :. : .: ... ::. .....:::.: ..::. .: :.:.. : ::.:..
CCDS56 PGGGQAQYVTVPEGLLMPIPEGLTLTQAAAIPEAWLTAFQLLHLVGNVQAGDYVLIHAGL
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240
pF1KSD GGVGQAVAQLC---STVPNVTVFGTASTFKHEAIKDSVTHLFDRNADYVQEVKRISAEGV
.::: :. :: ...: ::. :. . .. ... . .. :. . . ... .
CCDS56 SGVGTAAIQLTRMAGAIPLVTA-GSQKKLQMAEKLGAAAGFNYKKEDFSEATLKFTKVQA
160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KSD DIVLDCLCGDNTGKGLSLLKPLGTYILYGSSNMVTGETKSFFSFAKSWWQVEKVNPIKLY
. . .:. : :... :
CCDS56 N-AGECFHGANSASLLHGGPPTSAAGSGQNLPSDRNPGGP
210 220 230 240
>>CCDS12008.1 ZADH2 gene_id:284273|Hs108|chr18 (377 aa)
initn: 187 init1: 102 opt: 306 Z-score: 369.3 bits: 77.2 E(32554): 3e-14
Smith-Waterman score: 306; 27.8% identity (56.2% similar) in 331 aa overlap (63-383:57-372)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD SHRLGDAQEMRAVVLAGFGGLNKLRLFRKAMPEPQDGELKIRVKACGLNFIDLMVRQGNI
.: : ::.: .: . :.: :. :
CCDS12 SAIPQAMQKLVVTRLSPNFREAVTLSRDCPVPLPGDGDLLVRNRFVGVNASDINYSAGRY
30 40 50 60 70 80
100 110 120 130 140 150
pF1KSD DNPPKTPLVPGFECSGIVEALGDSVKG-YEIGDRVMAFVNYNAWAEVVCTPVEFVYKIPD
: : :. ::: : : ::: :... : .:. : :.. ...:: . .:. .. .:.
CCDS12 DPSVKPPFDIGFEGIGEVVALGLSASARYTVGQAV-AYMAPGSFAEYTVVPASIATPVPS
90 100 110 120 130 140
160 170 180 190 200 210
pF1KSD DMSFSEAAAFPMNFVTAYVMLFEVANLREGMSVLVHSAGGGVGQAVAQLCSTVPNVTVFG
: .. .. .:::. : :...: :: .::: .:.::.:: . :: : . :.:
CCDS12 VKP--EYLTLLVSGTTAYISLKELGGLSEGKKVLVTAAAGGTGQFAMQL-SKKAKCHVIG
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260
pF1KSD TASTFKHEAIKDSVTHLFDRNADYVQE-----VKRISAEGVDIVLDCLCGDNTGKGLSLL
: :. .. :. :. :: .: : .:. ::::.: . . : ... :
CCDS12 TCSSDEKSAFLKSLG--CDRPINYKTEPVGTVLKQEYPEGVDVVYESVGGAMFDLAVDAL
210 220 230 240 250 260
270 280 290 300 310 320
pF1KSD KPLGTYILYGSSNMVTG-ETKSFFSFAKSWWQVEKVNPIKLYEENKVIAGFSLLNLL--F
: :. : ...: .: . .: .:. . : :: ... . :: : . : .
CCDS12 ATKGRLIVIG---FISGYQTPTGLSPVKA-----GTLPAKLLKKSASVQGFFLNHYLSKY
270 280 290 300 310
330 340 350 360 370 380
pF1KSD KQGRAGLIRGVVE-KLIGLYNQKKIKPVVDSLWALEEVKEAMQRIHDRGNIGKLILDVEK
. . . :.. : :. . ..: . .:: . .:.. .. : ::..... .
CCDS12 QAAMSHLLEMCVSGDLVCEVDLGDLSPE-GRFTGLESIFRAVNYMYMGKNTGKIVVELPH
320 330 340 350 360 370
390 400 410
pF1KSD TPTPLMANDSTETSEAGEEEEDHEGDSENKERMPFIQ
.
CCDS12 SVNSKL
>>CCDS30659.1 MECR gene_id:51102|Hs108|chr1 (373 aa)
initn: 131 init1: 107 opt: 269 Z-score: 324.7 bits: 68.9 E(32554): 9.2e-12
Smith-Waterman score: 269; 25.7% identity (56.7% similar) in 268 aa overlap (21-276:19-286)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAKEGVEKAEETEQMIEKEAGKEPAEGGGGDGSHRLGDAQE---MRAVVLAGFGGLNKLR
: :: : : .. . . : .::.: . : :.
CCDS30 MWVCSTLWRVRTPARQWRGLLPASGCHGPAASSYSASAEPARVRALVYGHHGDPAKVV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LFRK-AMPEPQDGELKIRVKACGLNFIDLMVRQGNIDNPPKTPLVPGFECSGIVEALGDS
... . . ....... : .: :. . ::: :. : : : : . : :.:..
CCDS30 ELKNLELAAVRGSDVRVKMLAAPINPSDINMIQGNYGFLPELPAVGGNEGVAQVVAVGSN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD VKGYEIGDRVM-AFVNYNAWAEVVCTPVEFVYKIPDDMSFSEAAAFPMNFVTAYVMLFEV
: : . :: :. : .. ..: . : . ..:.:. .. ::.. .: ::: ::..
CCDS30 VTGLKPGDWVIPANAGLGTWRTEAVFSEEALIQVPSDIPLQSAATLGVNPCTAYRMLMDF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ANLREGMSVLVHSAGGGVGQAVAQLCSTVPNVTVFGTASTFKHEAIKDSVTHLFDRNADY
.:. : ::. .....:::::: :. ... :. . . . ..: . : ...
CCDS30 EQLQPGDSVIQNASNSGVGQAVIQIAAALGLRTINVVRDRPDIQKLSDRLKSLGAEHVIT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KSD VQEVKRISAEGV--DI-----VLDCLCGDNTGKGLSLLKPLGTYILYGSSNMVTGETKSF
.:..: .. :. .:.:. : .. . : : ::.. ::
CCDS30 EEELRRPEMKNFFKDMPQPRLALNCVGGKSSTELLRQLARGGTMVTYGGMAKQPVVASVS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD FSFAKSWWQVEKVNPIKLYEENKVIAGFSLLNLLFKQGRAGLIRGVVEKLIGLYNQKKIK
CCDS30 LLIFKDLKLRGFWLSQWKKDHSPDQFKELILTLCDLIRRGQLTAPACSQVPLQDYQSALE
300 310 320 330 340 350
419 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 06:41:34 2016 done: Thu Nov 3 06:41:34 2016
Total Scan time: 2.730 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]