Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1617
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1617, 894 aa
1>>>pF1KSDA1617 894 - 894 aa - 894 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0913+/-0.000945; mu= 14.2198+/- 0.057
mean_var=144.3962+/-27.909, 0's: 0 Z-trim(110.2): 37 B-trim: 4 in 1/51
Lambda= 0.106732
statistics sampled from 11408 (11443) to 11408 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.7), E-opt: 0.2 (0.352), width: 16
Scan time: 3.960
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31138.1 SFMBT2 gene_id:57713|Hs108|chr10 ( 894) 6149 959.2 0
CCDS2867.1 SFMBT1 gene_id:51460|Hs108|chr3 ( 866) 3268 515.5 1.6e-145
CCDS14011.1 L3MBTL2 gene_id:83746|Hs108|chr22 ( 705) 504 89.9 1.8e-17
CCDS13319.1 L3MBTL1 gene_id:26013|Hs108|chr20 ( 772) 445 80.8 1.1e-14
CCDS46602.2 L3MBTL1 gene_id:26013|Hs108|chr20 ( 840) 445 80.8 1.1e-14
CCDS82238.1 L3MBTL4 gene_id:91133|Hs108|chr18 ( 614) 439 79.8 1.7e-14
CCDS11839.2 L3MBTL4 gene_id:91133|Hs108|chr18 ( 623) 439 79.8 1.7e-14
CCDS14185.1 SCML2 gene_id:10389|Hs108|chrX ( 700) 431 78.6 4.4e-14
CCDS11581.2 MBTD1 gene_id:54799|Hs108|chr17 ( 628) 420 76.9 1.3e-13
CCDS34538.1 L3MBTL3 gene_id:84456|Hs108|chr6 ( 755) 361 67.9 8.2e-11
CCDS34537.1 L3MBTL3 gene_id:84456|Hs108|chr6 ( 780) 361 67.9 8.4e-11
>>CCDS31138.1 SFMBT2 gene_id:57713|Hs108|chr10 (894 aa)
initn: 6149 init1: 6149 opt: 6149 Z-score: 5123.3 bits: 959.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6149; 100.0% identity (100.0% similar) in 894 aa overlap (1-894:1-894)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MESTLSASNMQDPSSSPLEKCLGSANGNGDLDSEEGSSLEETGFNWGEYLEETGASAAPH
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CCDS31 MESTLSASNMQDPSSSPLEKCLGSANGNGDLDSEEGSSLEETGFNWGEYLEETGASAAPH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TSFKHVEISIQSNFQPGMKLEVANKNNPDTYWVATIITTCGQLLLLRYCGYGEDRRADFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TSFKHVEISIQSNFQPGMKLEVANKNNPDTYWVATIITTCGQLLLLRYCGYGEDRRADFW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD CDVVIADLHPVGWCTQNNKVLMPPDAIKEKYTDWTEFLIRDLTGSRTAPANLLEGPLRGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CDVVIADLHPVGWCTQNNKVLMPPDAIKEKYTDWTEFLIRDLTGSRTAPANLLEGPLRGK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GPIDLITVGSLIELQDSQNPFQYWIVSVIENVGGRLRLRYVGLEDTESYDQWLFYLDYRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GPIDLITVGSLIELQDSQNPFQYWIVSVIENVGGRLRLRYVGLEDTESYDQWLFYLDYRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RPVGWCQENKYRMDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKFPLPMEVFKDHADLRSHFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RPVGWCQENKYRMDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKFPLPMEVFKDHADLRSHFF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TVGMKLETVNMCEPFYISPASVTKVFNNHFFQVTIDDLRPEPSKLSMLCHADSLGILPVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TVGMKLETVNMCEPFYISPASVTKVFNNHFFQVTIDDLRPEPSKLSMLCHADSLGILPVQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD WCLKNGVSLTPPKGYSGQDFDWADYHKQHGAQEAPPFCFRNTSFSRGFTKNMKLEAVNPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 WCLKNGVSLTPPKGYSGQDFDWADYHKQHGAQEAPPFCFRNTSFSRGFTKNMKLEAVNPR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD NPGELCVASVVSVKGRLMWLHLEGLQTPVPEVIVDVESMDIFPVGWCEANSYPLTAPHKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NPGELCVASVVSVKGRLMWLHLEGLQTPVPEVIVDVESMDIFPVGWCEANSYPLTAPHKT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD VSQKKRKIAVVQPEKQLPPTVPVKKIPHDLCLFPHLDTTGTVNGKYCCPQLFINHRCFSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VSQKKRKIAVVQPEKQLPPTVPVKKIPHDLCLFPHLDTTGTVNGKYCCPQLFINHRCFSG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PYLNKGRIAELPQSVGPGKCVLVLKEVLSMIINAAYKPGRVLRELQLVEDPHWNFQEETL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PYLNKGRIAELPQSVGPGKCVLVLKEVLSMIINAAYKPGRVLRELQLVEDPHWNFQEETL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KAKYRGKTYRAVVKIVRTSDQVANFCRRVCAKLECCPNLFSPVLISENCPENCSIHTKTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KAKYRGKTYRAVVKIVRTSDQVANFCRRVCAKLECCPNLFSPVLISENCPENCSIHTKTK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD YTYYYGKRKKISKPPIGESNPDSGHPKPARRRKRRKSIFVQKKRRSSAVDFTAGSGEESE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YTYYYGKRKKISKPPIGESNPDSGHPKPARRRKRRKSIFVQKKRRSSAVDFTAGSGEESE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EEDADAMDDDTASEETGSELRDDQTDTSSAEVPSARPRRAVTLRSGSEPVRRPPPERTRR
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CCDS31 EEDADAMDDDTASEETGSELRDDQTDTSSAEVPSARPRRAVTLRSGSEPVRRPPPERTRR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD GRGAPAASSAEEGEKCPPTKPEGTEDTKQEEEERLVLESNPLEWTVTDVVRFIKLTDCAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GRGAPAASSAEEGEKCPPTKPEGTEDTKQEEEERLVLESNPLEWTVTDVVRFIKLTDCAP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KSD LAKIFQEQDIDGQALLLLTLPTVQECMELKLGPAIKLCHQIERVKVAFYAQYAN
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CCDS31 LAKIFQEQDIDGQALLLLTLPTVQECMELKLGPAIKLCHQIERVKVAFYAQYAN
850 860 870 880 890
>>CCDS2867.1 SFMBT1 gene_id:51460|Hs108|chr3 (866 aa)
initn: 2886 init1: 1581 opt: 3268 Z-score: 2726.0 bits: 515.5 E(32554): 1.6e-145
Smith-Waterman score: 3268; 55.4% identity (77.8% similar) in 882 aa overlap (26-894:2-866)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MESTLSASNMQDPSSSPLEKCLGSANGNGDLDSEEGSSLEETGFNWGEYLEETGASAAPH
::. .::.. ::..::. ..: .::::::..:.:.
CCDS28 MNGEQQLDADAGSGMEEVELSWEDYLEETGSTAVPY
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TSFKHVEISIQSNFQPGMKLEVANKNNPDTYWVATIITTCGQLLLLRYCGYGEDRRADFW
:::::. .:..: :::::::: ...:.::::::.:::: ::::::: :::::::::::
CCDS28 GSFKHVDTRLQNGFAPGMKLEVAVRTDPETYWVATVITTCEQLLLLRYDGYGEDRRADFW
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD CDVVIADLHPVGWCTQNNKVLMPPDAIKEKYTDWTEFLIRDLTGSRTAPANLLEGPLRGK
::. :::.:.::: ::.:.: :..:..: .:: ::: . : :. . :. :::: :.
CCDS28 CDIRKADLYPIGWCEQNKKTLEAPEGIRDKVSDWDEFLRQTLIGACSPPVPLLEGLRNGR
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GPIDLITVGSLIELQDSQNPFQYWIVSVIENVGGRLRLRYVGLEDTESYDQWLFYLDYRL
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CCDS28 NPLDLIAPGSRLECQAFQDSLSTWIVTVVENIGGRLKLRYEGLESSDNYEHWLYYLDPFL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RPVGWCQENKYRMDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKFPLPMEVFKDHADLRSHFF
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CCDS28 HHVGWAAQQGYELQPPSAIRHLKNEAEWQEILAK-VKEEEEEPLPSYLFKDKQVIGIHTF
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KSD TVGMKLETVNMCEPFYISPASVTKVFNNHFFQVTIDDLRPEP-SKLSMLCHADSLGILPV
.:.::::.:. :: ::::.:.:::....: : .:::::: .. :..::::: ::.::
CCDS28 SVNMKLEAVDPWSPFGISPATVVKVFDEKYFLVEMDDLRPENHARRSFVCHADSPGIFPV
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD QWCLKNGVSLTPPKGYSGQDFDWADYHKQHGAQEAPPFCFRNTSFSRGFTKNMKLEAVNP
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CCDS28 QWSLKNGLHISPPPGYPSQDFDWADYLKQCGAEAAPQRCFPPLISEHEFKENMKLEAVNP
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RNPGELCVASVVSVKGRLMWLHLEGLQTPVPEVIVDVESMDIFPVGWCEANSYPLTAPHK
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CCDS28 ILPEEVCVATITAVRGSYLWLQLEGSKKPIPECIVSVESMDIFPLGWCETNGHPLSTPRR
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD TVSQKKRKIAVVQPEKQLPPTVPVKKIPHDLCLFPHLDTTGTV--NGKYCCPQLFINHRC
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CCDS28 ARVYKQRKIAVVQPEKQVPSSRTV----HEGLRNQELNSTESVMINGKYCCPKIYFNHRC
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KSD FSGPYLNKGRIAELPQSVGPGKCVLVLKEVLSMIINAAYKPGRVLRELQLVEDPHWNFQE
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CCDS28 FSGPYLNKGRIAELPQCVGPGNCVLVLREVLTLLINAAYKPSRVLRELQLDKDSVWHGCG
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KSD ETLKAKYRGKTYRAVVKIVRTSDQVANFCRRVCAKLECCPNLFSPVLISENCPENCSIHT
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CCDS28 EVLKAKYKGKSYRATVEIVKTADRVTEFCRQTCIKLECCPNLFGPRMVLDKCSENCSVLT
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KSD KTKYTYYYGKRK--KISKPPIGESNPDSGHPKPARRRKRRKSIFVQKKRRSSA-VDFT-A
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CCDS28 KTKYTHYYGKKKNKRIGRPPGGHSNLACALKKASKRRKRRKNVFVHKKKRSSASVDNTPA
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760
pF1KSD GSGEES---EEEDADAMDDDTASEETGSELRDD---QTDTSSAEVPSARPRRAVTLRSGS
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CCDS28 GSPQGSGGEDEDDPDEGDDDSLSEGSTSEQQDELQEESEMSEKKSCSSSP-------TQS
700 710 720 730 740
770 780 790 800 810 820
pF1KSD EPVRRPPPERTRRGRGAPAASSAEEGEKCPPTKPEGTEDTKQEEEERLVLESNPLEWTVT
: ::.: :: : . : ... :. ::. : . : ::: :.::::.:.:.
CCDS28 EISTSLPPDRQRRKRELRTFSFSDD-ENKPPSPKE----IRIEVAERLHLDSNPLKWSVA
750 760 770 780 790
830 840 850 860 870 880
pF1KSD DVVRFIKLTDCAPLAKIFQEQDIDGQALLLLTLPTVQECMELKLGPAIKLCHQIERVKVA
::::::. :::::::.:: .:.::::::::::::::::::.:::::::::::.:::.: :
CCDS28 DVVRFIRSTDCAPLARIFLDQEIDGQALLLLTLPTVQECMDLKLGPAIKLCHHIERIKFA
800 810 820 830 840 850
890
pF1KSD FYAQYAN
:: :.::
CCDS28 FYEQFAN
860
>>CCDS14011.1 L3MBTL2 gene_id:83746|Hs108|chr22 (705 aa)
initn: 794 init1: 326 opt: 504 Z-score: 427.0 bits: 89.9 E(32554): 1.8e-17
Smith-Waterman score: 908; 34.2% identity (61.2% similar) in 497 aa overlap (25-500:158-636)
10 20 30 40 50
pF1KSD MESTLSASNMQDPSSSPLEKCLGSANGNGDL--DSEEGSSLEETGFNWGEYLEE
..:.:.: . :.. ::.::..:..
CCDS14 LARLQGKPPTKKAKVLHKAAWSAKIGAFLHSQGTGQLADGTPTGQDALVLGFDWGKFLKD
130 140 150 160 170 180
60 70 80 90 100
pF1KSD TGASAAPHTSFKHVEISIQ-SNFQPGMKLEVANKNN--PD-TYWVATIITTCGQLLLLRY
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CCDS14 HSYKAAPVSCFKHVPLYDQWEDVMKGMKVEVLNSDAVLPSRVYWIASVIQTAGYRVLLRY
190 200 210 220 230 240
110 120 130 140 150 160
pF1KSD CGYGEDRRADFWCDVVIADLHPVGWCTQNNKVLMPPDAIKEKYTDWTEFLIRDLTGSRTA
:. .: ::::.. .:.::.:::. :.:.:.:: .:. :.::: .:.. :.::::
CCDS14 EGFENDASHDFWCNLGTVDVHPIGWCAINSKILVPPRTIHAKFTDWKGYLMKRLVGSRTL
250 260 270 280 290 300
170 180 190 200 210 220
pF1KSD PANL-LEGPLRGKGPIDLITVGSLIELQDSQNPFQYWIVSVIENVGGRLRLRYVGLEDTE
:... .. : :. : .:. :... . .. : .:::::: : :: .
CCDS14 PVDFHIKMVESMKYPF---RQGMRLEVVDKSQVSRTRMAVVDTVIGGRLRLLY---EDGD
310 320 330 340 350 360
230 240 250 260 270 280
pF1KSD SYDQ-WLFYLDYRLRPVGWCQENKYRMDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKFPLPM
: :. : . . ..:::: . :. .. . . :..: ::. .
CCDS14 SDDDFWCHMWSPLIHPVGWSR----RVGHGIKMSERRSDMAHHPTFRKIYCDAVPY----
370 380 390 400 410
290 300 310 320 330 340
pF1KSD EVFKDHADLRSH--FFTVGMKLETVNMCEPFYISPASVTKVFNNHFFQVTIDDLRPEPSK
.:: . .. .: :::::... . : :.: ::. . .... .: : .
CCDS14 -LFKKVRAVYTEGGWFEEGMKLEAIDPLNLGNICVATVCKVLLDGYLMICVDG-GPSTDG
420 430 440 450 460 470
350 360 370 380 390 400
pF1KSD LSMLC-HADSLGILPVQWCLKNGVSLTPPKGYSGQDFDWADYHKQHGAQEAPPFCFRNTS
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CCDS14 LDWFCYHASSHAIFPATFCQKNDIELTPPKGYEAQTFNWENYLEKTKSKAAPSRLFNMDC
480 490 500 510 520 530
410 420 430 440 450 460
pF1KSD FSRGFTKNMKLEAVNPRNPGELCVASVVSVKGRLMWLHLEGLQTPVPEVIVDVESMDIFP
..:: .::::::. .: .:::.: : ::. .:..: .. . :: :: ::.:
CCDS14 PNHGFKVGMKLEAVDLMEPRLICVATVKRVVHRLLSIHFDGWDSEYDQW-VDCESPDIYP
540 550 560 570 580 590
470 480 490 500 510
pF1KSD VGWCEANSYPLTAP----------HKTVSQKKRKIAVVQPEKQLPPTVPVKKIPHDLCLF
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CCDS14 VGWCELTGYQLQPPVAAEPATPLKAKEATKKKKK-QFGKKRKRIPPTKTRPLRQGSKKPL
600 610 620 630 640
520 530 540 550 560 570
pF1KSD PHLDTTGTVNGKYCCPQLFINHRCFSGPYLNKGRIAELPQSVGPGKCVLVLKEVLSMIIN
CCDS14 LEDDPQGARKISSEPVPGEIIAVRVKEEHLDVASPDKASSPELPVSVENIKQETDD
650 660 670 680 690 700
>>CCDS13319.1 L3MBTL1 gene_id:26013|Hs108|chr20 (772 aa)
initn: 296 init1: 172 opt: 445 Z-score: 377.4 bits: 80.8 E(32554): 1.1e-14
Smith-Waterman score: 586; 30.8% identity (56.0% similar) in 468 aa overlap (143-599:197-637)
120 130 140 150 160 170
pF1KSD EDRRADFWCDVVIADLHPVGWCTQNNKVLMPPDAIKEKYTDWTEFLIRDLTGSRTAPANL
: . :.. .: .: . . :::..:
CCDS13 EAMEKQEEGKDPEGQPTASTPESEEWSSSQPATGEKKECWSWESYL--EEQKAITAPVSL
170 180 190 200 210 220
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LEGPLRGKGPIDLITVGSLIELQDSQNPFQYWIVSVIENVGGRLRLRYVGLEDTESYDQW
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CCDS13 FQDSQAVTHNKNGFKLGMKLEGIDPQHPSMYFILTVAEVCGYRLRLHFDGY--SECHDFW
230 240 250 260 270 280
240 250 260 270 280 290
pF1KSD LFYLDYRLRPVGWCQENKYRMDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKFPLPMEVFKDH
. . ..:.:: ... ....:: . : . : :. :... .:: : . : ..:
CCDS13 VNANSPDIHPAGWFEKTGHKLQPP-KGYKEEEFS-WSQYLRSTRAQAA--PKHLFVSQSH
290 300 310 320 330
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ADLRSHFFTVGMKLETVNMCEPFYISPASVTKVFNNHFFQVTIDDLRPEPSKLSMLCHAD
. : ::::::.:. .: . :::: : ...:. : .:. . .. : .
CCDS13 SP-PPLGFQVGMKLEAVDRMNPSLVCVASVTDVVDSRFL-VHFDNW---DDTYDYWCDPS
340 350 360 370 380 390
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SLGILPVQWCLKNGVSLTPPKGYSGQD-FDWADYHKQHGAQEAPPFCFRNTSFSRGFTKN
: : :: :: :.: ::::. : : : : : .. ::. .: . :. . ..: :
CCDS13 SPYIHPVGWCQKQGKPLTPPQDYPDPDNFCWEKYLEETGASAVPTWAFK-VRPPHSFLVN
400 410 420 430 440 450
420 430 440 450 460 470
pF1KSD MKLEAVNPRNPGELCVASVVSVKGRLMWLHLEGLQTPVPEVIVDVESMDIFPVGWCEANS
::::::. :::. . :::: .:. . . .:..: . . .:.. :: :.::: ..
CCDS13 MKLEAVDRRNPALIRVASVEDVEDHRIKIHFDGWSHGY-DFWIDADHPDIHPAGWCSKTG
460 470 480 490 500 510
480 490 500 510 520
pF1KSD YPLTAPHKTVSQKKRKIAVVQP--EKQLPPTVPVK-KIPHDLCLFPHLDTTGTVNGKYCC
.:: : .. . . : ..:: : : .. : : : : .: :.::
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520 530 540 550 560
530 540 550 560 570 580
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: :.:.:: : :..:. ::: .: . .. :. :: . . :: ::.
CCDS13 ---FTAHHCLSGCPLAERNQSRLKAELSDSEASAR-----KKNLSGF-SPRKKPRHHGRI
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590 600 610 620 630 640
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: . . :. .:: :
CCDS13 GRPPKYRKIPQEDFQTLTPDVVHQSLFMSALSAHPDRSLSVCWEQHCKLLPGVAGISAST
620 630 640 650 660 670
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.. . . .: .: : :.: .:.:..: : : ::::.. : .: .: :
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240 250 260 270 280 290
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. . ..:.:: ... ....:: . : . : :. :... .:: : . : ..:
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. : ::::::.:. .: . :::: : ...:. : .:. . .. : .
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: : :: :: :.: ::::. : : : : : .. ::. .: . :. . ..: :
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::::::. :::. . :::: .:. . . .:..: . . .:.. :: :.::: ..
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.:: : .. . . : ..:: : : .. : : : : .: :.::
CCDS46 HPLQPPLGPREPSSASPGGCPPLSYRSLPHTRTSKYSFHHRKCPTPGCDGSGHVTGK---
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530 540 550 560 570 580
pF1KSD PQLFINHRCFSGPYL---NKGRI-AELPQSVGPGKCVLVLKEVLSMIINAAYKP---GRV
: :.:.:: : :..:. ::: .: . .. :. :: . . :: ::.
CCDS46 ---FTAHHCLSGCPLAERNQSRLKAELSDSEASAR-----KKNLSGF-SPRKKPRHHGRI
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: . . :. .:: :
CCDS46 GRPPKYRKIPQEDFQTLTPDVVHQSLFMSALSAHPDRSLSVCWEQHCKLLPGVAGISAST
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:.: . .: :. ... . .::..:.
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. . .: .: : ..: . ..:: : : ::::.. : :: :
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. ..:::::...:... :. :.. : :. .. : : ..:....
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:. : ::::::.:. .: . :... . ..... : .:. .. .. : .
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.: . :: :: .:: .: :.:: . ..:.:..: . .. .: :. . .::
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pF1KSD SYPLTAPHKTVSQKKRKIAVVQPEKQLPPTVPVKKIPHDLCLFPHLDTTGTVNGKYCCPQ
..:: .:..: . : . : . . :: . : :
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CCDS82 KKEATLHDRLREQTQANLESDSSHSKSKSLCSLNFNGKHEKVNSQPRLVQQAKCLKIKGK
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CCDS11 SKERLDQDGRLEQAEEEKKPKDSTTPLSHVPSAAAQGAWSW-EWYLKEQKAV-AAPVELF
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. . .: .: : ..: . ..:: : : ::::.. : :: :
CCDS11 SKDQSFPEHENGFQIGMRLEGIDPRHPSVFCVLSVAEVCGYRLRLHFDGY--LSCYDFWT
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pF1KSD FYLDYRLRPVGWCQENKYRMDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKFPLPMEVFKDHA
. ..:::::...:... :. :.. : :. .. : : ..:....
CCDS11 NAGSPDIHPVGWCEKTKHELHIPKGYRKDKFV--WMDYLKACKLQNA----PKKLFRNRS
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:. : ::::::.:. .: . :... . ..... : .:. .. .. : .
CCDS11 PNGPMSKEFQVGMKLEAVDRKNPSLVCVATIADIVEDRLL-VHFDNW---DDSYDYWCDV
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.: . :: :: .:: .: :.:: . ..:.:..: . .. .: :. . .::
CCDS11 NSPYVQPVGWCQENGRTLIAPQGYPNPENFSWTEYLEATQTNAVPAKVFK-MRLPHGFLP
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:::::.:. ::: . ::..:.: . . .:..: . . :...: :: :.:::...
CCDS11 NMKLEVVDKRNPRLIRVATIVDVDDQRVKVHFDGWDHKY-DYWVEADSPDIHPIGWCDVT
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..:: .:..: . : . : . . :: . : :
CCDS11 GHPLEVPQRTNDLK------ILPGQAVCPTPGCRGIGHIRGPRYSGHHSAFGCPYSDMNL
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CCDS11 KKEATLHDRLREQTQANLESDSSHSKSKSLCSLNFNGKHEKVNSQPRLVQQAKCLKIKGK
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CCDS14 MGQTVNEDSMDVKKENQEKTPQSSTSSVQRDDFHWEEYLKETGSISAPSECFRQS
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pF1KSD EISIQSNFQPGMKLEVANKNNPDTYWVATIITTCGQLLLLRYCGYGEDRRADFWCDVVIA
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CCDS14 QIPPVNDFKVGMKLEARDPRNATSVCIATVIGITGARLRLRL--DGSDNRNDFWRLVDSP
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CCDS14 DIQPVGTCEKEGDLLQPPLGYQMNTSSWPMFLLKTLNGSEMASATLFKKEPP---KPPLN
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pF1KSD LITVGSLIELQDSQNPFQYWIVSVIENVGGRLRLRYVGLEDTESYDQWLFYLDYRLRPVG
. :: .: :..::. ... . : .... . : . ..: : : . . :.:
CCDS14 NFKVGMKLEAIDKKNPYLICPATIGDVKGDEVHITFDGW--SGAFDYWCKYDSRDIFPAG
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CCDS14 WCRLTGDVLQPPGTSVP--------------------------IVKNIAKTES-------
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::. ... : .: :.: .. :::.: ..
CCDS14 -------------SPSEASQ----HSMQ--------SPQKTTL--------ILPTQQ-VR
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. . :: : .: :..: .:: ..::. :
CCDS14 RSSRIKPP-----------------GPTAVPK---RSSS-----VKN-----ITPRKKGP
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.:. . :.: . : ... : . . ..
CCDS14 --------NSGKK--------EKPLPVI--------------CSTSAASLKSLTRDRGML
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pF1KSD KRKIAVVQPEKQLPPTVPVKKIPHDLCLFPHLDTTGTVNGKYCCPQLFINHRCFSGPYLN
. .: . : : . .:.. :: .: : ::.:.
CCDS14 YKDVA----------SGPCKIVMSTVCVY--------VN----------KHGNF-GPHLD
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pF1KSD KGRIAELPQSVGPGKCVLVLKEVLSMIINAAYKPGRVLRELQLVEDPHWNFQEETLKAKY
:: .::. ::: .::..... .. : . :. :. : : :.. :..
CCDS14 PKRIQQLPDHFGPGPVNVVLRRIVQACVDCALETKTVFGYLK----PD-NRGGEVITASF
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pF1KSD RGKTYRAVVKIVRTSDQVANFCRRVCAKLECCPNLFS--PVLISENCPENCSIHTKTKYT
:.:. . : ... . : . : .:.: ::.: : :.. .. . : :.. .
CCDS14 DGETHSIQLPPVNSASFALRFLENFCHSLQC-DNLLSSQPFSSSRGHTHSSAEHDKNQSA
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pF1KSD YYYGKRKKISKPPIGESNPDSGHPKPARRRKRRKSIFVQKKRRSSAVDFTAGSGEESEEE
... .: .. : .: : :. :. : . . ::.. .::
CCDS14 KEDVTERQSTKRSPQQTVPYVVPLSP----KLPKT----KEYASEGEPLFAGGSAIPKEE
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pF1KSD DADAMDDDTASEETGSELRDDQTDTSSAEVPSAR-PRRAVTLRSGSEPVRRPPPERTRR-
. . :. ..: ..:. : :. : : : : :. : : :
CCDS14 NLSE-DSKSSSLNSGNYLN-----------PACRNPMYIHT--SVSQDFSRSVPGTTSSP
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pF1KSD --GRGAPAASSAEEGEKCPPTKPEGTEDTKQEEEERLV--LESNPLEWTVTDVVRFIKLT
: .: :: .: . : :. . : . ..: :.: .:..:.: :
CCDS14 LVGDISPK-SSPHEVKFQMQRKSEAPSYIAVPDPSVLKQGFSKDPSTWSVDEVIQFMKHT
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pF1KSD D---CAPLAKIFQEQDIDGQALLLLTLPTVQECMELKLGPAIKLCHQIERVKVAFYAQYA
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CCDS14 DPQISGPLADLFRQHEIDGKALFLLKSDVMMKYMGLKLGPALKLCYYIEKLKEGKYS
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pF1KSD N
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pF1KSD PSSSPLEKCLGSANGNGDLDSEEGSSLEETGFNWGEYLEETGASAAPHTSFKHVEI-SIQ
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CCDS11 QPLVAKLAAYAQYQATLQNQAKTKAAVSMEGFSWGNYINSNSFIAAPVTCFKHAPMGTCW
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pF1KSD SNFQPGMKLEVANKNN--PD-TYWVATIITTCGQLLLLRYCGYGEDRRADFWCDVVIADL
.... ....:: : . : ..:.: :. : :::: :. .: ::::.. .:.
CCDS11 GDISENVRVEVPNTDCSLPTKVFWIAGIVKLAGYNALLRYEGFENDSGLDFWCNICGSDI
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CCDS11 HPVGWCAASGKPLVPPRTIQHKYTNWKAFLVKRLTGAKTLPPDFSQKVSESMQYPFKPCM
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pF1KSD VGSLIELQDSQNPFQYWIVSVIENV-GGRLRLRYVGLEDTESYDQWLFYLDYRLRPVGWC
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CCDS11 ---RVEVVDKRHLCRTR-VAVVESVIGGRLRLVYEESED-RTDDFWCHMHSPLIHHIGWS
290 300 310 320 330 340
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pF1KSD QENKYRMDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKFPLPMEVFKD--HADLRSHFFTVGM
. .:. . . :. . ..: : ..: ..: ...: ::
CCDS11 RSIGHRFK--------------RSDITKK--QDGHFDTPPHLFAKVKEVDQSGEWFKEGM
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:::... . : :.. ::. . :... :: . .. . .: :: : .:.:: .:
CCDS11 KLEAIDPLNLSTICVATIRKVLADGFLMIGIDGSEAADGS-DWFCYHATSPSIFPVGFCE
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CCDS11 INMIELTPPRGYTKLPFKWFDYLRETGSIAAPVKLFNKDVPNHGFRVGMKLEAVDLMEPR
450 460 470 480 490 500
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pF1KSD ELCVASVVSVKGRLMWLHLEGLQTPVPEVIVDVESMDIFPVGWCEANSYPLTAPHKTVSQ
.:::.:. . ::. .:..: . . :: :: :..:::::. ..: : : . :.
CCDS11 LICVATVTRIIHRLLRIHFDGWEEEYDQW-VDCESPDLYPVGWCQLTGYQLQPPASQSSR
510 520 530 540 550 560
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pF1KSD KKRKIAVVQPEKQLPPTVPVKKIPHDLCLFPHLDTTGTVNGKYCCPQLFINHRCFSGPYL
.... . : .:
CCDS11 ENQSASSKQKKKAKSQQYKGHKKMTTLQLKEELLDGEDYNFLQGASDQESNGSANFYIKQ
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