Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1617
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1617, 894 aa
1>>>pF1KSDA1617 894 - 894 aa - 894 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5072+/-0.000384; mu= 11.4064+/- 0.024
mean_var=148.0020+/-29.113, 0's: 0 Z-trim(117.6): 115 B-trim: 227 in 1/52
Lambda= 0.105424
statistics sampled from 29572 (29687) to 29572 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.686), E-opt: 0.2 (0.348), width: 16
Scan time: 14.400
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011517913 (OMIM: 615392) PREDICTED: scm-like wi ( 894) 6149 947.7 0
NP_001025051 (OMIM: 615392) scm-like with four MBT ( 894) 6149 947.7 0
NP_001018049 (OMIM: 615392) scm-like with four MBT ( 894) 6149 947.7 0
XP_016871955 (OMIM: 615392) PREDICTED: scm-like wi ( 894) 6149 947.7 0
XP_006717553 (OMIM: 615392) PREDICTED: scm-like wi ( 725) 4825 746.3 1.2e-214
XP_005252608 (OMIM: 615392) PREDICTED: scm-like wi ( 642) 4407 682.7 1.6e-195
XP_006713267 (OMIM: 607319) PREDICTED: scm-like wi ( 866) 3268 509.5 2.8e-143
XP_011532126 (OMIM: 607319) PREDICTED: scm-like wi ( 866) 3268 509.5 2.8e-143
XP_011532127 (OMIM: 607319) PREDICTED: scm-like wi ( 866) 3268 509.5 2.8e-143
XP_005265278 (OMIM: 607319) PREDICTED: scm-like wi ( 866) 3268 509.5 2.8e-143
NP_057413 (OMIM: 607319) scm-like with four MBT do ( 866) 3268 509.5 2.8e-143
XP_006713266 (OMIM: 607319) PREDICTED: scm-like wi ( 866) 3268 509.5 2.8e-143
XP_011528723 (OMIM: 611865) PREDICTED: lethal(3)ma ( 614) 504 89.0 7.5e-17
XP_011528722 (OMIM: 611865) PREDICTED: lethal(3)ma ( 687) 504 89.0 8.2e-17
NP_113676 (OMIM: 611865) lethal(3)malignant brain ( 705) 504 89.1 8.4e-17
XP_016884469 (OMIM: 611865) PREDICTED: lethal(3)ma ( 408) 472 84.0 1.6e-15
XP_016884465 (OMIM: 611865) PREDICTED: lethal(3)ma ( 621) 472 84.1 2.2e-15
NP_056293 (OMIM: 608802) lethal(3)malignant brain ( 772) 445 80.1 4.5e-14
NP_115479 (OMIM: 608802) lethal(3)malignant brain ( 840) 445 80.1 4.8e-14
XP_006722427 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 485) 439 79.1 5.9e-14
XP_016881564 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 488) 439 79.1 5.9e-14
XP_016881565 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 488) 439 79.1 5.9e-14
XP_011524067 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 497) 439 79.1 6e-14
XP_011524065 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 521) 439 79.1 6.2e-14
XP_011524064 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 567) 439 79.1 6.7e-14
XP_016881563 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 574) 439 79.1 6.7e-14
NP_001317488 (OMIM: 617135) lethal(3)malignant bra ( 614) 439 79.1 7.1e-14
NP_775735 (OMIM: 617135) lethal(3)malignant brain ( 623) 439 79.1 7.2e-14
XP_011524063 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 623) 439 79.1 7.2e-14
XP_011524062 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 642) 439 79.1 7.4e-14
XP_011524061 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 651) 439 79.1 7.4e-14
XP_011524060 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 651) 439 79.1 7.4e-14
XP_011524059 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 651) 439 79.1 7.4e-14
XP_006724521 (OMIM: 300208) PREDICTED: sex comb on ( 609) 431 77.9 1.6e-13
XP_016884710 (OMIM: 300208) PREDICTED: sex comb on ( 609) 431 77.9 1.6e-13
XP_016884708 (OMIM: 300208) PREDICTED: sex comb on ( 700) 431 77.9 1.8e-13
NP_006080 (OMIM: 300208) sex comb on midleg-like p ( 700) 431 77.9 1.8e-13
XP_016884709 (OMIM: 300208) PREDICTED: sex comb on ( 700) 431 77.9 1.8e-13
XP_016884466 (OMIM: 611865) PREDICTED: lethal(3)ma ( 595) 429 77.6 2e-13
XP_016881566 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 370) 422 76.4 2.9e-13
XP_016884467 (OMIM: 611865) PREDICTED: lethal(3)ma ( 495) 413 75.1 9.3e-13
XP_016884468 (OMIM: 611865) PREDICTED: lethal(3)ma ( 495) 413 75.1 9.3e-13
XP_011539342 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 523) 356 66.5 3.9e-10
XP_011539341 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 550) 356 66.5 4.1e-10
XP_011539336 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 621) 356 66.5 4.5e-10
NP_001165690 (OMIM: 616396) polycomb protein SCMH1 ( 648) 356 66.5 4.7e-10
XP_006710525 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 670) 356 66.5 4.8e-10
XP_011539334 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 670) 356 66.5 4.8e-10
XP_016856187 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 618) 351 65.7 7.6e-10
XP_011539335 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 660) 351 65.8 8e-10
>>XP_011517913 (OMIM: 615392) PREDICTED: scm-like with f (894 aa)
initn: 6149 init1: 6149 opt: 6149 Z-score: 5061.3 bits: 947.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6149; 100.0% identity (100.0% similar) in 894 aa overlap (1-894:1-894)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MESTLSASNMQDPSSSPLEKCLGSANGNGDLDSEEGSSLEETGFNWGEYLEETGASAAPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MESTLSASNMQDPSSSPLEKCLGSANGNGDLDSEEGSSLEETGFNWGEYLEETGASAAPH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TSFKHVEISIQSNFQPGMKLEVANKNNPDTYWVATIITTCGQLLLLRYCGYGEDRRADFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TSFKHVEISIQSNFQPGMKLEVANKNNPDTYWVATIITTCGQLLLLRYCGYGEDRRADFW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD CDVVIADLHPVGWCTQNNKVLMPPDAIKEKYTDWTEFLIRDLTGSRTAPANLLEGPLRGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CDVVIADLHPVGWCTQNNKVLMPPDAIKEKYTDWTEFLIRDLTGSRTAPANLLEGPLRGK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GPIDLITVGSLIELQDSQNPFQYWIVSVIENVGGRLRLRYVGLEDTESYDQWLFYLDYRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GPIDLITVGSLIELQDSQNPFQYWIVSVIENVGGRLRLRYVGLEDTESYDQWLFYLDYRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RPVGWCQENKYRMDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKFPLPMEVFKDHADLRSHFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RPVGWCQENKYRMDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKFPLPMEVFKDHADLRSHFF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TVGMKLETVNMCEPFYISPASVTKVFNNHFFQVTIDDLRPEPSKLSMLCHADSLGILPVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TVGMKLETVNMCEPFYISPASVTKVFNNHFFQVTIDDLRPEPSKLSMLCHADSLGILPVQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD WCLKNGVSLTPPKGYSGQDFDWADYHKQHGAQEAPPFCFRNTSFSRGFTKNMKLEAVNPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WCLKNGVSLTPPKGYSGQDFDWADYHKQHGAQEAPPFCFRNTSFSRGFTKNMKLEAVNPR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD NPGELCVASVVSVKGRLMWLHLEGLQTPVPEVIVDVESMDIFPVGWCEANSYPLTAPHKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NPGELCVASVVSVKGRLMWLHLEGLQTPVPEVIVDVESMDIFPVGWCEANSYPLTAPHKT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD VSQKKRKIAVVQPEKQLPPTVPVKKIPHDLCLFPHLDTTGTVNGKYCCPQLFINHRCFSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSQKKRKIAVVQPEKQLPPTVPVKKIPHDLCLFPHLDTTGTVNGKYCCPQLFINHRCFSG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PYLNKGRIAELPQSVGPGKCVLVLKEVLSMIINAAYKPGRVLRELQLVEDPHWNFQEETL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PYLNKGRIAELPQSVGPGKCVLVLKEVLSMIINAAYKPGRVLRELQLVEDPHWNFQEETL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KAKYRGKTYRAVVKIVRTSDQVANFCRRVCAKLECCPNLFSPVLISENCPENCSIHTKTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KAKYRGKTYRAVVKIVRTSDQVANFCRRVCAKLECCPNLFSPVLISENCPENCSIHTKTK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD YTYYYGKRKKISKPPIGESNPDSGHPKPARRRKRRKSIFVQKKRRSSAVDFTAGSGEESE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YTYYYGKRKKISKPPIGESNPDSGHPKPARRRKRRKSIFVQKKRRSSAVDFTAGSGEESE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EEDADAMDDDTASEETGSELRDDQTDTSSAEVPSARPRRAVTLRSGSEPVRRPPPERTRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EEDADAMDDDTASEETGSELRDDQTDTSSAEVPSARPRRAVTLRSGSEPVRRPPPERTRR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD GRGAPAASSAEEGEKCPPTKPEGTEDTKQEEEERLVLESNPLEWTVTDVVRFIKLTDCAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GRGAPAASSAEEGEKCPPTKPEGTEDTKQEEEERLVLESNPLEWTVTDVVRFIKLTDCAP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KSD LAKIFQEQDIDGQALLLLTLPTVQECMELKLGPAIKLCHQIERVKVAFYAQYAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LAKIFQEQDIDGQALLLLTLPTVQECMELKLGPAIKLCHQIERVKVAFYAQYAN
850 860 870 880 890
>>NP_001025051 (OMIM: 615392) scm-like with four MBT dom (894 aa)
initn: 6149 init1: 6149 opt: 6149 Z-score: 5061.3 bits: 947.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6149; 100.0% identity (100.0% similar) in 894 aa overlap (1-894:1-894)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MESTLSASNMQDPSSSPLEKCLGSANGNGDLDSEEGSSLEETGFNWGEYLEETGASAAPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MESTLSASNMQDPSSSPLEKCLGSANGNGDLDSEEGSSLEETGFNWGEYLEETGASAAPH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TSFKHVEISIQSNFQPGMKLEVANKNNPDTYWVATIITTCGQLLLLRYCGYGEDRRADFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSFKHVEISIQSNFQPGMKLEVANKNNPDTYWVATIITTCGQLLLLRYCGYGEDRRADFW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD CDVVIADLHPVGWCTQNNKVLMPPDAIKEKYTDWTEFLIRDLTGSRTAPANLLEGPLRGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CDVVIADLHPVGWCTQNNKVLMPPDAIKEKYTDWTEFLIRDLTGSRTAPANLLEGPLRGK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GPIDLITVGSLIELQDSQNPFQYWIVSVIENVGGRLRLRYVGLEDTESYDQWLFYLDYRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GPIDLITVGSLIELQDSQNPFQYWIVSVIENVGGRLRLRYVGLEDTESYDQWLFYLDYRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RPVGWCQENKYRMDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKFPLPMEVFKDHADLRSHFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RPVGWCQENKYRMDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKFPLPMEVFKDHADLRSHFF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TVGMKLETVNMCEPFYISPASVTKVFNNHFFQVTIDDLRPEPSKLSMLCHADSLGILPVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVGMKLETVNMCEPFYISPASVTKVFNNHFFQVTIDDLRPEPSKLSMLCHADSLGILPVQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD WCLKNGVSLTPPKGYSGQDFDWADYHKQHGAQEAPPFCFRNTSFSRGFTKNMKLEAVNPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WCLKNGVSLTPPKGYSGQDFDWADYHKQHGAQEAPPFCFRNTSFSRGFTKNMKLEAVNPR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD NPGELCVASVVSVKGRLMWLHLEGLQTPVPEVIVDVESMDIFPVGWCEANSYPLTAPHKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NPGELCVASVVSVKGRLMWLHLEGLQTPVPEVIVDVESMDIFPVGWCEANSYPLTAPHKT
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pF1KSD VSQKKRKIAVVQPEKQLPPTVPVKKIPHDLCLFPHLDTTGTVNGKYCCPQLFINHRCFSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSQKKRKIAVVQPEKQLPPTVPVKKIPHDLCLFPHLDTTGTVNGKYCCPQLFINHRCFSG
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pF1KSD PYLNKGRIAELPQSVGPGKCVLVLKEVLSMIINAAYKPGRVLRELQLVEDPHWNFQEETL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PYLNKGRIAELPQSVGPGKCVLVLKEVLSMIINAAYKPGRVLRELQLVEDPHWNFQEETL
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610 620 630 640 650 660
pF1KSD KAKYRGKTYRAVVKIVRTSDQVANFCRRVCAKLECCPNLFSPVLISENCPENCSIHTKTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KAKYRGKTYRAVVKIVRTSDQVANFCRRVCAKLECCPNLFSPVLISENCPENCSIHTKTK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD YTYYYGKRKKISKPPIGESNPDSGHPKPARRRKRRKSIFVQKKRRSSAVDFTAGSGEESE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YTYYYGKRKKISKPPIGESNPDSGHPKPARRRKRRKSIFVQKKRRSSAVDFTAGSGEESE
670 680 690 700 710 720
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pF1KSD EEDADAMDDDTASEETGSELRDDQTDTSSAEVPSARPRRAVTLRSGSEPVRRPPPERTRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EEDADAMDDDTASEETGSELRDDQTDTSSAEVPSARPRRAVTLRSGSEPVRRPPPERTRR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD GRGAPAASSAEEGEKCPPTKPEGTEDTKQEEEERLVLESNPLEWTVTDVVRFIKLTDCAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GRGAPAASSAEEGEKCPPTKPEGTEDTKQEEEERLVLESNPLEWTVTDVVRFIKLTDCAP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KSD LAKIFQEQDIDGQALLLLTLPTVQECMELKLGPAIKLCHQIERVKVAFYAQYAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAKIFQEQDIDGQALLLLTLPTVQECMELKLGPAIKLCHQIERVKVAFYAQYAN
850 860 870 880 890
>>NP_001018049 (OMIM: 615392) scm-like with four MBT dom (894 aa)
initn: 6149 init1: 6149 opt: 6149 Z-score: 5061.3 bits: 947.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6149; 100.0% identity (100.0% similar) in 894 aa overlap (1-894:1-894)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MESTLSASNMQDPSSSPLEKCLGSANGNGDLDSEEGSSLEETGFNWGEYLEETGASAAPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MESTLSASNMQDPSSSPLEKCLGSANGNGDLDSEEGSSLEETGFNWGEYLEETGASAAPH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TSFKHVEISIQSNFQPGMKLEVANKNNPDTYWVATIITTCGQLLLLRYCGYGEDRRADFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSFKHVEISIQSNFQPGMKLEVANKNNPDTYWVATIITTCGQLLLLRYCGYGEDRRADFW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD CDVVIADLHPVGWCTQNNKVLMPPDAIKEKYTDWTEFLIRDLTGSRTAPANLLEGPLRGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CDVVIADLHPVGWCTQNNKVLMPPDAIKEKYTDWTEFLIRDLTGSRTAPANLLEGPLRGK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GPIDLITVGSLIELQDSQNPFQYWIVSVIENVGGRLRLRYVGLEDTESYDQWLFYLDYRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GPIDLITVGSLIELQDSQNPFQYWIVSVIENVGGRLRLRYVGLEDTESYDQWLFYLDYRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RPVGWCQENKYRMDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKFPLPMEVFKDHADLRSHFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RPVGWCQENKYRMDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKFPLPMEVFKDHADLRSHFF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVGMKLETVNMCEPFYISPASVTKVFNNHFFQVTIDDLRPEPSKLSMLCHADSLGILPVQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WCLKNGVSLTPPKGYSGQDFDWADYHKQHGAQEAPPFCFRNTSFSRGFTKNMKLEAVNPR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NPGELCVASVVSVKGRLMWLHLEGLQTPVPEVIVDVESMDIFPVGWCEANSYPLTAPHKT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSQKKRKIAVVQPEKQLPPTVPVKKIPHDLCLFPHLDTTGTVNGKYCCPQLFINHRCFSG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PYLNKGRIAELPQSVGPGKCVLVLKEVLSMIINAAYKPGRVLRELQLVEDPHWNFQEETL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YTYYYGKRKKISKPPIGESNPDSGHPKPARRRKRRKSIFVQKKRRSSAVDFTAGSGEESE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EEDADAMDDDTASEETGSELRDDQTDTSSAEVPSARPRRAVTLRSGSEPVRRPPPERTRR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GRGAPAASSAEEGEKCPPTKPEGTEDTKQEEEERLVLESNPLEWTVTDVVRFIKLTDCAP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAKIFQEQDIDGQALLLLTLPTVQECMELKLGPAIKLCHQIERVKVAFYAQYAN
850 860 870 880 890
>>XP_016871955 (OMIM: 615392) PREDICTED: scm-like with f (894 aa)
initn: 6149 init1: 6149 opt: 6149 Z-score: 5061.3 bits: 947.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6149; 100.0% identity (100.0% similar) in 894 aa overlap (1-894:1-894)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MESTLSASNMQDPSSSPLEKCLGSANGNGDLDSEEGSSLEETGFNWGEYLEETGASAAPH
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TSFKHVEISIQSNFQPGMKLEVANKNNPDTYWVATIITTCGQLLLLRYCGYGEDRRADFW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CDVVIADLHPVGWCTQNNKVLMPPDAIKEKYTDWTEFLIRDLTGSRTAPANLLEGPLRGK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RPVGWCQENKYRMDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKFPLPMEVFKDHADLRSHFF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TVGMKLETVNMCEPFYISPASVTKVFNNHFFQVTIDDLRPEPSKLSMLCHADSLGILPVQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WCLKNGVSLTPPKGYSGQDFDWADYHKQHGAQEAPPFCFRNTSFSRGFTKNMKLEAVNPR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NPGELCVASVVSVKGRLMWLHLEGLQTPVPEVIVDVESMDIFPVGWCEANSYPLTAPHKT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VSQKKRKIAVVQPEKQLPPTVPVKKIPHDLCLFPHLDTTGTVNGKYCCPQLFINHRCFSG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PYLNKGRIAELPQSVGPGKCVLVLKEVLSMIINAAYKPGRVLRELQLVEDPHWNFQEETL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KAKYRGKTYRAVVKIVRTSDQVANFCRRVCAKLECCPNLFSPVLISENCPENCSIHTKTK
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pF1KSD YTYYYGKRKKISKPPIGESNPDSGHPKPARRRKRRKSIFVQKKRRSSAVDFTAGSGEESE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YTYYYGKRKKISKPPIGESNPDSGHPKPARRRKRRKSIFVQKKRRSSAVDFTAGSGEESE
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pF1KSD EEDADAMDDDTASEETGSELRDDQTDTSSAEVPSARPRRAVTLRSGSEPVRRPPPERTRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EEDADAMDDDTASEETGSELRDDQTDTSSAEVPSARPRRAVTLRSGSEPVRRPPPERTRR
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pF1KSD GRGAPAASSAEEGEKCPPTKPEGTEDTKQEEEERLVLESNPLEWTVTDVVRFIKLTDCAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GRGAPAASSAEEGEKCPPTKPEGTEDTKQEEEERLVLESNPLEWTVTDVVRFIKLTDCAP
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pF1KSD LAKIFQEQDIDGQALLLLTLPTVQECMELKLGPAIKLCHQIERVKVAFYAQYAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LAKIFQEQDIDGQALLLLTLPTVQECMELKLGPAIKLCHQIERVKVAFYAQYAN
850 860 870 880 890
>>XP_006717553 (OMIM: 615392) PREDICTED: scm-like with f (725 aa)
initn: 4825 init1: 4825 opt: 4825 Z-score: 3974.3 bits: 746.3 E(85289): 1.2e-214
Smith-Waterman score: 4825; 99.9% identity (100.0% similar) in 701 aa overlap (194-894:25-725)
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:.::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KSD EDTESYDQWLFYLDYRLRPVGWCQENKYRMDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EDTESYDQWLFYLDYRLRPVGWCQENKYRMDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKFP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LPMEVFKDHADLRSHFFTVGMKLETVNMCEPFYISPASVTKVFNNHFFQVTIDDLRPEPS
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pF1KSD KLSMLCHADSLGILPVQWCLKNGVSLTPPKGYSGQDFDWADYHKQHGAQEAPPFCFRNTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KLSMLCHADSLGILPVQWCLKNGVSLTPPKGYSGQDFDWADYHKQHGAQEAPPFCFRNTS
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pF1KSD FSRGFTKNMKLEAVNPRNPGELCVASVVSVKGRLMWLHLEGLQTPVPEVIVDVESMDIFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 FSRGFTKNMKLEAVNPRNPGELCVASVVSVKGRLMWLHLEGLQTPVPEVIVDVESMDIFP
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pF1KSD VGWCEANSYPLTAPHKTVSQKKRKIAVVQPEKQLPPTVPVKKIPHDLCLFPHLDTTGTVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VGWCEANSYPLTAPHKTVSQKKRKIAVVQPEKQLPPTVPVKKIPHDLCLFPHLDTTGTVN
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pF1KSD GKYCCPQLFINHRCFSGPYLNKGRIAELPQSVGPGKCVLVLKEVLSMIINAAYKPGRVLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GKYCCPQLFINHRCFSGPYLNKGRIAELPQSVGPGKCVLVLKEVLSMIINAAYKPGRVLR
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pF1KSD ELQLVEDPHWNFQEETLKAKYRGKTYRAVVKIVRTSDQVANFCRRVCAKLECCPNLFSPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ELQLVEDPHWNFQEETLKAKYRGKTYRAVVKIVRTSDQVANFCRRVCAKLECCPNLFSPV
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pF1KSD LISENCPENCSIHTKTKYTYYYGKRKKISKPPIGESNPDSGHPKPARRRKRRKSIFVQKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LISENCPENCSIHTKTKYTYYYGKRKKISKPPIGESNPDSGHPKPARRRKRRKSIFVQKK
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pF1KSD RRSSAVDFTAGSGEESEEEDADAMDDDTASEETGSELRDDQTDTSSAEVPSARPRRAVTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RRSSAVDFTAGSGEESEEEDADAMDDDTASEETGSELRDDQTDTSSAEVPSARPRRAVTL
540 550 560 570 580 590
770 780 790 800 810 820
pF1KSD RSGSEPVRRPPPERTRRGRGAPAASSAEEGEKCPPTKPEGTEDTKQEEEERLVLESNPLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RSGSEPVRRPPPERTRRGRGAPAASSAEEGEKCPPTKPEGTEDTKQEEEERLVLESNPLE
600 610 620 630 640 650
830 840 850 860 870 880
pF1KSD WTVTDVVRFIKLTDCAPLAKIFQEQDIDGQALLLLTLPTVQECMELKLGPAIKLCHQIER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 WTVTDVVRFIKLTDCAPLAKIFQEQDIDGQALLLLTLPTVQECMELKLGPAIKLCHQIER
660 670 680 690 700 710
890
pF1KSD VKVAFYAQYAN
:::::::::::
XP_006 VKVAFYAQYAN
720
>>XP_005252608 (OMIM: 615392) PREDICTED: scm-like with f (642 aa)
initn: 4407 init1: 4407 opt: 4407 Z-score: 3631.5 bits: 682.7 E(85289): 1.6e-195
Smith-Waterman score: 4407; 100.0% identity (100.0% similar) in 642 aa overlap (253-894:1-642)
230 240 250 260 270 280
pF1KSD LEDTESYDQWLFYLDYRLRPVGWCQENKYRMDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKF
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKF
10 20 30
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pF1KSD PLPMEVFKDHADLRSHFFTVGMKLETVNMCEPFYISPASVTKVFNNHFFQVTIDDLRPEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PLPMEVFKDHADLRSHFFTVGMKLETVNMCEPFYISPASVTKVFNNHFFQVTIDDLRPEP
40 50 60 70 80 90
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pF1KSD SKLSMLCHADSLGILPVQWCLKNGVSLTPPKGYSGQDFDWADYHKQHGAQEAPPFCFRNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SKLSMLCHADSLGILPVQWCLKNGVSLTPPKGYSGQDFDWADYHKQHGAQEAPPFCFRNT
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pF1KSD SFSRGFTKNMKLEAVNPRNPGELCVASVVSVKGRLMWLHLEGLQTPVPEVIVDVESMDIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SFSRGFTKNMKLEAVNPRNPGELCVASVVSVKGRLMWLHLEGLQTPVPEVIVDVESMDIF
160 170 180 190 200 210
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pF1KSD PVGWCEANSYPLTAPHKTVSQKKRKIAVVQPEKQLPPTVPVKKIPHDLCLFPHLDTTGTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PVGWCEANSYPLTAPHKTVSQKKRKIAVVQPEKQLPPTVPVKKIPHDLCLFPHLDTTGTV
220 230 240 250 260 270
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pF1KSD NGKYCCPQLFINHRCFSGPYLNKGRIAELPQSVGPGKCVLVLKEVLSMIINAAYKPGRVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NGKYCCPQLFINHRCFSGPYLNKGRIAELPQSVGPGKCVLVLKEVLSMIINAAYKPGRVL
280 290 300 310 320 330
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pF1KSD RELQLVEDPHWNFQEETLKAKYRGKTYRAVVKIVRTSDQVANFCRRVCAKLECCPNLFSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RELQLVEDPHWNFQEETLKAKYRGKTYRAVVKIVRTSDQVANFCRRVCAKLECCPNLFSP
340 350 360 370 380 390
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pF1KSD VLISENCPENCSIHTKTKYTYYYGKRKKISKPPIGESNPDSGHPKPARRRKRRKSIFVQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VLISENCPENCSIHTKTKYTYYYGKRKKISKPPIGESNPDSGHPKPARRRKRRKSIFVQK
400 410 420 430 440 450
710 720 730 740 750 760
pF1KSD KRRSSAVDFTAGSGEESEEEDADAMDDDTASEETGSELRDDQTDTSSAEVPSARPRRAVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KRRSSAVDFTAGSGEESEEEDADAMDDDTASEETGSELRDDQTDTSSAEVPSARPRRAVT
460 470 480 490 500 510
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pF1KSD LRSGSEPVRRPPPERTRRGRGAPAASSAEEGEKCPPTKPEGTEDTKQEEEERLVLESNPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LRSGSEPVRRPPPERTRRGRGAPAASSAEEGEKCPPTKPEGTEDTKQEEEERLVLESNPL
520 530 540 550 560 570
830 840 850 860 870 880
pF1KSD EWTVTDVVRFIKLTDCAPLAKIFQEQDIDGQALLLLTLPTVQECMELKLGPAIKLCHQIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EWTVTDVVRFIKLTDCAPLAKIFQEQDIDGQALLLLTLPTVQECMELKLGPAIKLCHQIE
580 590 600 610 620 630
890
pF1KSD RVKVAFYAQYAN
::::::::::::
XP_005 RVKVAFYAQYAN
640
>>XP_006713267 (OMIM: 607319) PREDICTED: scm-like with f (866 aa)
initn: 2886 init1: 1581 opt: 3268 Z-score: 2693.4 bits: 509.5 E(85289): 2.8e-143
Smith-Waterman score: 3268; 55.4% identity (77.8% similar) in 882 aa overlap (26-894:2-866)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MESTLSASNMQDPSSSPLEKCLGSANGNGDLDSEEGSSLEETGFNWGEYLEETGASAAPH
::. .::.. ::..::. ..: .::::::..:.:.
XP_006 MNGEQQLDADAGSGMEEVELSWEDYLEETGSTAVPY
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TSFKHVEISIQSNFQPGMKLEVANKNNPDTYWVATIITTCGQLLLLRYCGYGEDRRADFW
:::::. .:..: :::::::: ...:.::::::.:::: ::::::: :::::::::::
XP_006 GSFKHVDTRLQNGFAPGMKLEVAVRTDPETYWVATVITTCEQLLLLRYDGYGEDRRADFW
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD CDVVIADLHPVGWCTQNNKVLMPPDAIKEKYTDWTEFLIRDLTGSRTAPANLLEGPLRGK
::. :::.:.::: ::.:.: :..:..: .:: ::: . : :. . :. :::: :.
XP_006 CDIRKADLYPIGWCEQNKKTLEAPEGIRDKVSDWDEFLRQTLIGACSPPVPLLEGLRNGR
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GPIDLITVGSLIELQDSQNPFQYWIVSVIENVGGRLRLRYVGLEDTESYDQWLFYLDYRL
.:.:::. :: .: : :. .. :::.:.::.::::.::: :::....:..::.::: :
XP_006 NPLDLIAPGSRLECQAFQDSLSTWIVTVVENIGGRLKLRYEGLESSDNYEHWLYYLDPFL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RPVGWCQENKYRMDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKFPLPMEVFKDHADLRSHFF
. ::: .. :...::: : :: .::. : : . . . ::: .:::. . : :
XP_006 HHVGWAAQQGYELQPPSAIRHLKNEAEWQEILAK-VKEEEEEPLPSYLFKDKQVIGIHTF
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KSD TVGMKLETVNMCEPFYISPASVTKVFNNHFFQVTIDDLRPEP-SKLSMLCHADSLGILPV
.:.::::.:. :: ::::.:.:::....: : .:::::: .. :..::::: ::.::
XP_006 SVNMKLEAVDPWSPFGISPATVVKVFDEKYFLVEMDDLRPENHARRSFVCHADSPGIFPV
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD QWCLKNGVSLTPPKGYSGQDFDWADYHKQHGAQEAPPFCFRNTSFSRGFTKNMKLEAVNP
:: ::::. ..:: :: .:::::::: :: ::. :: :: . : .:::::::::
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XP_011 FYEQFAN
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