Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1710
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1710, 470 aa
1>>>pF1KSDA1710 470 - 470 aa - 470 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3885+/-0.00228; mu= 15.6705+/- 0.137
mean_var=318.1860+/-57.487, 0's: 0 Z-trim(105.1): 958 B-trim: 117 in 1/50
Lambda= 0.071901
statistics sampled from 7200 (8268) to 7200 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.565), E-opt: 0.2 (0.254), width: 16
Scan time: 2.940
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1697 191.2 2.9e-48
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1697 191.2 2.9e-48
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1697 191.2 2.9e-48
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1675 188.9 1.4e-47
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CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1672 188.6 1.8e-47
CCDS12966.1 ZNF256 gene_id:10172|Hs108|chr19 ( 627) 1660 187.3 4e-47
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1659 187.3 4.7e-47
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1658 187.2 5e-47
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 1654 186.5 5.6e-47
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1654 186.7 6.5e-47
CCDS74462.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 617) 1649 186.1 8.8e-47
CCDS12950.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 659) 1649 186.2 9.1e-47
CCDS77365.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 706) 1649 186.2 9.4e-47
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1647 186.0 1.1e-46
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1647 186.0 1.1e-46
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 1647 186.0 1.1e-46
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1647 186.0 1.1e-46
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 1647 186.0 1.1e-46
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1643 185.5 1.4e-46
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1642 185.6 1.6e-46
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1635 184.6 2.3e-46
CCDS12968.1 ZNF606 gene_id:80095|Hs108|chr19 ( 792) 1627 184.0 4.8e-46
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1626 183.8 4.9e-46
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 1624 183.5 5.2e-46
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 676) 1624 183.6 5.6e-46
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 1624 183.6 5.6e-46
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1624 183.7 5.9e-46
CCDS33102.1 ZNF331 gene_id:55422|Hs108|chr19 ( 463) 1618 182.7 7.2e-46
CCDS12955.1 ZNF530 gene_id:348327|Hs108|chr19 ( 599) 1618 182.9 8.1e-46
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 1611 182.0 1.2e-45
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1605 181.5 2e-45
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1605 181.5 2.1e-45
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1605 181.6 2.1e-45
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1603 181.3 2.3e-45
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1607 182.2 2.3e-45
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1607 182.2 2.3e-45
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1600 180.9 2.7e-45
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1602 181.4 2.9e-45
CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19 ( 499) 1595 180.4 3.9e-45
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 1597 181.0 4.3e-45
CCDS32330.1 ZNF774 gene_id:342132|Hs108|chr15 ( 483) 1592 180.0 4.8e-45
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1587 179.8 8e-45
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1582 179.1 1e-44
CCDS43307.1 PRDM9 gene_id:56979|Hs108|chr5 ( 894) 1585 179.8 1e-44
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 1580 178.8 1.1e-44
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1583 179.5 1.1e-44
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 1580 178.8 1.1e-44
>>CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 (470 aa)
initn: 3352 init1: 3352 opt: 3352 Z-score: 1909.0 bits: 362.6 E(32554): 5.2e-100
Smith-Waterman score: 3352; 100.0% identity (100.0% similar) in 470 aa overlap (1-470:1-470)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAATLLMAGSQAPVTFEDMAMYLTREEWRPLDAAQRDLYRDVMQENYGNVVSLDFEIRSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 MAATLLMAGSQAPVTFEDMAMYLTREEWRPLDAAQRDLYRDVMQENYGNVVSLDFEIRSE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NEVNPKQEISEDVQFGTTSERPAENAEENPESEEGFESGDRSERQWGDLTAEEWVSYPLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 NEVNPKQEISEDVQFGTTSERPAENAEENPESEEGFESGDRSERQWGDLTAEEWVSYPLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCGKAFSQISDLNRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 PVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCGKAFSQISDLNRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQTIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 LIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQTIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTGEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 QRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTGEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPYHCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 TGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPYHCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNECWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 PYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNECWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYEC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KSD VQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKSFSRSSALIKHKRVHTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 VQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKSFSRSSALIKHKRVHTD
430 440 450 460 470
>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (616 aa)
initn: 1697 init1: 1697 opt: 1697 Z-score: 980.2 bits: 191.1 E(32554): 2.8e-48
Smith-Waterman score: 1697; 62.9% identity (85.5% similar) in 345 aa overlap (125-469:215-559)
100 110 120 130 140 150
pF1KSD GFESGDRSERQWGDLTAEEWVSYPLQPVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCGKAFSQISDLN
: :...::: . . :..::..:.::. :
CCDS74 SALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLI
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KSD RHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQT
.::.::::..::.: ::::.:: : . ::.::::::.::.:.::::.: .: :: ::
CCDS74 QHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLR
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220 230 240 250 260 270
pF1KSD IHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTG
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CCDS74 IHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTG
310 320 330 340 350 360
280 290 300 310 320 330
pF1KSD EKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPY
::::::.:::..::. . : .: :.::::.:: :.::::.::..:.: .:.:.:::::::
CCDS74 EKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPY
370 380 390 400 410 420
340 350 360 370 380 390
pF1KSD HCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNE
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CCDS74 ECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQ
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pF1KSD CWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKS
: :.:.. . ::.::: ::::::::: :::..:.::: :: :::.:: :::: :.:: ::
CCDS74 CGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKS
490 500 510 520 530 540
460 470
pF1KSD FSRSSALIKHKRVHTD
::.::.: .:.:.::
CCDS74 FSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHS
550 560 570 580 590 600
>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (658 aa)
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Smith-Waterman score: 1697; 62.9% identity (85.5% similar) in 345 aa overlap (125-469:257-601)
100 110 120 130 140 150
pF1KSD GFESGDRSERQWGDLTAEEWVSYPLQPVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCGKAFSQISDLN
: :...::: . . :..::..:.::. :
CCDS74 SALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLI
230 240 250 260 270 280
160 170 180 190 200 210
pF1KSD RHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQT
.::.::::..::.: ::::.:: : . ::.::::::.::.:.::::.: .: :: ::
CCDS74 QHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLR
290 300 310 320 330 340
220 230 240 250 260 270
pF1KSD IHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTG
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CCDS74 IHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTG
350 360 370 380 390 400
280 290 300 310 320 330
pF1KSD EKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPY
::::::.:::..::. . : .: :.::::.:: :.::::.::..:.: .:.:.:::::::
CCDS74 EKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPY
410 420 430 440 450 460
340 350 360 370 380 390
pF1KSD HCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNE
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CCDS74 ECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQ
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400 410 420 430 440 450
pF1KSD CWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKS
: :.:.. . ::.::: ::::::::: :::..:.::: :: :::.:: :::: :.:: ::
CCDS74 CGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKS
530 540 550 560 570 580
460 470
pF1KSD FSRSSALIKHKRVHTD
::.::.: .:.:.::
CCDS74 FSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHS
590 600 610 620 630 640
>>CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (670 aa)
initn: 1697 init1: 1697 opt: 1697 Z-score: 979.9 bits: 191.2 E(32554): 2.9e-48
Smith-Waterman score: 1697; 62.9% identity (85.5% similar) in 345 aa overlap (125-469:269-613)
100 110 120 130 140 150
pF1KSD GFESGDRSERQWGDLTAEEWVSYPLQPVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCGKAFSQISDLN
: :...::: . . :..::..:.::. :
CCDS12 SALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLI
240 250 260 270 280 290
160 170 180 190 200 210
pF1KSD RHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQT
.::.::::..::.: ::::.:: : . ::.::::::.::.:.::::.: .: :: ::
CCDS12 QHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLR
300 310 320 330 340 350
220 230 240 250 260 270
pF1KSD IHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTG
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CCDS12 IHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTG
360 370 380 390 400 410
280 290 300 310 320 330
pF1KSD EKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPY
::::::.:::..::. . : .: :.::::.:: :.::::.::..:.: .:.:.:::::::
CCDS12 EKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPY
420 430 440 450 460 470
340 350 360 370 380 390
pF1KSD HCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNE
.:..::. : . .::.:::: :::::::::: :::.::.:: : ::.:::::::::::.
CCDS12 ECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQ
480 490 500 510 520 530
400 410 420 430 440 450
pF1KSD CWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKS
: :.:.. . ::.::: ::::::::: :::..:.::: :: :::.:: :::: :.:: ::
CCDS12 CGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKS
540 550 560 570 580 590
460 470
pF1KSD FSRSSALIKHKRVHTD
::.::.: .:.:.::
CCDS12 FSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHS
600 610 620 630 640 650
>>CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (682 aa)
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Smith-Waterman score: 1697; 62.9% identity (85.5% similar) in 345 aa overlap (125-469:281-625)
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: :...::: . . :..::..:.::. :
CCDS54 SALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLI
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160 170 180 190 200 210
pF1KSD RHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQT
.::.::::..::.: ::::.:: : . ::.::::::.::.:.::::.: .: :: ::
CCDS54 QHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLR
320 330 340 350 360 370
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CCDS54 IHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTG
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pF1KSD EKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPY
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CCDS54 EKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPY
440 450 460 470 480 490
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pF1KSD HCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNE
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CCDS54 ECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQ
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pF1KSD CWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKS
: :.:.. . ::.::: ::::::::: :::..:.::: :: :::.:: :::: :.:: ::
CCDS54 CGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKS
560 570 580 590 600 610
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pF1KSD FSRSSALIKHKRVHTD
::.::.: .:.:.::
CCDS54 FSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHS
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.... :.. ::: : :..: :.:: :.
CCDS12 KKCHLILHKIIHTGERPYECSDREKAFIHKSEFIHHQRRHTGGVRHECGECRKTFSYKSN
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: .::..:::.:::.: ::::.: .:: :..:::.:.:::::.: :::::: . .::.:
CCDS12 LIEHQRVHTGERPYECGECGKSFRQSSSLFRHQRVHSGERPYQCCECGKSFRQIFNLIRH
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. .:::: :..:..::::: :.:::::: ::::.::::.:::::: . :.: .:. :
CCDS12 RRVHTGEMPYQCSDCGKSFSCKSELIQHQRIHSGERPYECRECGKSFRQFSNLIRHRSIH
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pF1KSD TGEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEK
::..::::.:: ..::.. ::.: :::::::::.:.::::.:...:::..::: ::: .
CCDS12 TGDRPYECSECEKSFSRKFILIQHQRVHTGERPYECSECGKSFTRKSDLIQHRRIHTGTR
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pF1KSD PYHCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYEC
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CCDS12 PYECSECGKSFRQRSGLIQHRRLHTGERPYECSECGKSFSQSASLIQHQRVHTGERPYEC
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pF1KSD NECWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECE
.:: .::.. :.::.::: ::::.:::: :::: ::..:.:: ::::::::.::::.::
CCDS12 SECGKSFSQSSSLIQHQRGHTGERPYECSQCGKPFTHKSDLIQHQRVHTGERPYECSECG
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pF1KSD KSFSRSSALIKHKRVHTD
:::::.: ::.:.::::.
CCDS12 KSFSRKSNLIRHRRVHTEERP
650 660 670
>>CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 (461 aa)
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100 110 120 130 140 150
pF1KSD EEGFESGDRSERQWGDLTAEEWVSYPLQPVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCGKAFSQISD
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CCDS44 QNSELIKTQRMFVGKKIYECNQCSKTFSQSSSLLKHQRIHTGEKPYKCNVCGKHFIERSS
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:. ::. :::..:::: ::::.::.: .: ::::::::.::.:.::::.: ..: ::::
CCDS44 LTVHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQH
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pF1KSD QTIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTH
. :::::::.:::::::.: . .: :::::.:::::::.::::.::.: :: :::.:
CCDS44 ERIHTGEKPYKCNECGKAFTQSMNLTVHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSMHLIVHQRSH
210 220 230 240 250 260
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pF1KSD TGEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEK
::::::::..::..::. : : : : ::::.::::..:::.:::.. :..:.: :.: :
CCDS44 TGEKPYECSQCGKAFSKSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGVK
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:..:::::. ::. : :.::.: ::::::::: .::: :. : : .:: ::::::::::
CCDS44 PFECNECGKAFSKNSSLTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPYEC
330 340 350 360 370 380
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pF1KSD NECWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECE
::: ..:.. . ::.::: ::::::::: ::::.: ..:.: .:::.:::::::.:.::
CCDS44 NECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLTVHQRTHTGEKPYQCNECG
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pF1KSD KSFSRSSALIKHKRVHTD
:.::::. : .:.:.::
CCDS44 KAFSRSTNLTRHQRTHT
450 460
>>CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 (682 aa)
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Smith-Waterman score: 1672; 63.9% identity (86.7% similar) in 338 aa overlap (132-469:259-596)
110 120 130 140 150 160
pF1KSD SERQWGDLTAEEWVSYPLQPVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCGKAFSQISDLNRHQKTHT
: . . . ::.::::: ::..:::. :.
CCDS64 IVHTGEASFMCDDCGKTFSQNSVLKNRHRSHMSEKAYQCSECGKAFRGHSDFSRHQSHHS
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..::: : ::::.::..: : .::..: .:.::.::::::.: :::.::::: ::.::::
CCDS64 SERPYMCNECGKAFSQNSSLKKHQKSHMSEKPYECNECGKAFRRSSNLIQHQRIHSGEKP
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230 240 250 260 270 280
pF1KSD HKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTGEKPYECN
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CCDS64 YVCSECGKAFRRSSNLIKHHRTHTGEKPFECGECGKAFSQSAHLRKHQRVHTGEKPYECN
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pF1KSD ECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPYHCNECGE
.::. ::. :.::::.::::::.::::..::: :::.:.:..::: ::::::. :: ::.
CCDS64 DCGKPFSRVSNLIKHHRVHTGEKPYKCSDCGKAFSQSSSLIQHRRIHTGEKPHVCNVCGK
410 420 430 440 450 460
350 360 370 380 390 400
pF1KSD NFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNECWRSFGE
:: : : .:: :::::::.:..:::.::.:: :: :: .:::.::: :.:: ..::.
CCDS64 AFSYSSVLRKHQIIHTGEKPYRCSVCGKAFSHSSALIQHQGVHTGDKPYACHECGKTFGR
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pF1KSD RSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKSFSRSSAL
:.:: :::.:::::::::..::: :.:::.:: :::.:.: ::.::..: :.:.::: :
CCDS64 SSNLILHQRVHTGEKPYECTECGKTFSQSSTLIQHQRIHNGLKPHECNQCGKAFNRSSNL
530 540 550 560 570 580
470
pF1KSD IKHKRVHTD
:.:..:::
CCDS64 IHHQKVHTGEKPYTCVECGKGFSQSSHLIQHQIIHTGERPYKCSECGKAFSQRSVLIQHQ
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..:..:...:::.: : :..::: :.. :
CCDS12 TSCSLSDHLRVHTSEKPYTCGECGKSYRQSSSLITHRRIHTGVRPHQCDECGKLFNRKYD
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160 170 180 190 200 210
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: ::..:::.::::: ::::.::.:: :: ::: ::: :::.:.:::::: .:: :: :
CCDS12 LLIHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSECGKSFIHSSSLITH
310 320 330 340 350 360
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: .::: .:. :.:::::: . :::.:.: : :: :::: :::: :. :.. ::::.:
CCDS12 QRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKLFTYRSRFFQHQRVH
370 380 390 400 410 420
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:: . .::.:::. ::.. ::: : :::::::::.:.::::.:. .: :. : ..::: .
CCDS12 TGVRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCKSYLISHWKVHTGAR
430 440 450 460 470 480
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::.:.:::..:.. : :.::::.::::.::::: ::: ::.:: :: :.. ::::.::::
CCDS12 PYECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPYECNECGKFFSQSSSLIRHRRSHTGERPYEC
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.:::.::...:.:.::.:.::::.:::: .:::.:.::::: .:::.:.::.::::..:
CCDS12 SECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQRIHSGERPYECSDCG
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pF1KSD KSFSRSSALIKHKRVHTD
: :. .: :.::. ::
CCDS12 KFFTFNSNLLKHQNVHKG
610 620
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10 20 30 40 50
pF1KSD MAATLLMAGSQAPVTFEDMAMYLTREEWRPLDAAQRDLYRDVMQENYGNVVSLD
...:. : .:: : ..: ::. ...::
CCDS27 NSGDQAGATVLRMVRPQDTVAYEDLSVDYTQKKWKSLTLSQRALQWNMMPENHHSMASLA
220 230 240 250 260 270
60 70 80 90
pF1KSD FE-IRSENEVNPKQEI---SEDVQ------FGTT--SERPAENAEENPESEEGF---ESG
: . . .:..::::. ::. . ::.. . . .. :.. . :: : :
CCDS27 GENMMKGSELTPKQEFFKGSESSNRTSGGLFGVVPGAAETGDVCEDTFKELEGQTSDEEG
280 290 300 310 320 330
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CCDS27 SRLENDFLEITDEDKKKSTKDRYDKYKEVGEHPPLSSSPVEHEGVLKGQKSYRCDECGKA
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CCDS27 FNRSSHLIGHQRIHTGEKPYECNECGKTFRQTSQLIVHLRTHTGEKPYECSECGKAYRHS
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::::::: .:.::::.:::::.:.: . :.: .:::::.:::::::.:::..: ::. ::
CCDS27 SHLIQHQRLHNGEKPYKCNECAKAFTQSSRLTDHQRTHTGEKPYECNECGEAFIRSKSLA
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.:: :::.:::.::::::.: .:: : :.::::.::.:.:::: ::... :.::.
CCDS27 RHQVLHTGKKPYKCNECGRAFCSNRNLIDHQRIHTGEKPYECSECGKAFSRSKCLIRHQS
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CCDS27 LHTGEKPYKCSECGKAFNQNSQLIEHERIHTGEKPFECSECGKAFGLSKCLIRHQRLHTG
580 590 600 610 620 630
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pF1KSD EKPYECNECWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPY
::::.:::: .::.. : :: ::: ::::::::: .::: :. ::.:..:::.:::::::
CCDS27 EKPYKCNECGKSFNQNSHLIIHQRIHTGEKPYECNECGKVFSYSSSLMVHQRTHTGEKPY
640 650 660 670 680 690
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pF1KSD ECTECEKSFSRSSALIKHKRVHTD
.:..: :.:: :: :: :.::::
CCDS27 KCNDCGKAFSDSSQLIVHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQRSTFNHHQRTHTGEKSSGLAW
700 710 720 730 740 750
470 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]