Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1719
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1719, 1043 aa
1>>>pF1KSDA1719 1043 - 1043 aa - 1043 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7582+/-0.000421; mu= 0.9687+/- 0.026
mean_var=276.7381+/-57.176, 0's: 0 Z-trim(119.8): 178 B-trim: 797 in 1/56
Lambda= 0.077097
statistics sampled from 34102 (34299) to 34102 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.723), E-opt: 0.2 (0.402), width: 16
Scan time: 17.590
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016874587 (OMIM: 219000,604597) PREDICTED: glut (1188) 2095 247.6 3e-64
NP_001171545 (OMIM: 219000,604597) glutamate recep (1061) 2062 243.9 3.6e-63
XP_016874589 (OMIM: 219000,604597) PREDICTED: glut (1136) 2062 243.9 3.7e-63
XP_005268814 (OMIM: 219000,604597) PREDICTED: glut (1102) 2052 242.8 7.9e-63
XP_011536395 (OMIM: 219000,604597) PREDICTED: glut (1128) 2052 242.8 8.1e-63
XP_005268811 (OMIM: 219000,604597) PREDICTED: glut (1129) 2052 242.8 8.1e-63
XP_016874588 (OMIM: 219000,604597) PREDICTED: glut (1154) 2052 242.8 8.2e-63
NP_066973 (OMIM: 219000,604597) glutamate receptor (1076) 2019 239.1 9.9e-62
XP_016874590 (OMIM: 219000,604597) PREDICTED: glut (1102) 2019 239.1 1e-61
XP_016874591 (OMIM: 219000,604597) PREDICTED: glut (1101) 2016 238.8 1.3e-61
>>XP_016874587 (OMIM: 219000,604597) PREDICTED: glutamat (1188 aa)
initn: 3372 init1: 929 opt: 2095 Z-score: 1274.3 bits: 247.6 E(85289): 3e-64
Smith-Waterman score: 3969; 59.9% identity (79.4% similar) in 1083 aa overlap (13-1036:93-1160)
10 20 30 40
pF1KSD MLCGLSRETPGEADDGPYSKGGKDAGGADVSLACRRQSIPEE
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XP_016 DDFHLNYEPPDIDTKVNLDQSPLEFLAKSNSDESPYTKSASQTKPPDGALAVRRQSIPEE
70 80 90 100 110 120
50 60 70 80 90 100
pF1KSD FRGITVVELIKKEGSTLGLTISGGTDKDGKPRVSNLRPGGLAARSDLLNIGDYIRSVNGI
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XP_016 FKGSTVVELMKKEGTTLGLTVSGGIDKDGKPRVSNLRQGGIAARSDQLDVGDYIKAVNGI
130 140 150 160 170 180
110 120 130 140 150 160
pF1KSD HLTRLRHDEIITLLKNVGERVVLEVEYELPPPAPENNPRIISKTVDVSLYKEGNSFGFVL
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XP_016 NLAKFRHDEIISLLKNVGERVVLEVEYELPPVSVQGSS-VIFRTVEVTLHKEGNTFGFVI
190 200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
pF1KSD RGGAHEDGHKSRPLVLTYVRPGGPADREGSLKVGDRLLSVDGIPLHGASHATALATLRQC
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XP_016 RGGAHDDRNKSRPVVITCVRPGGPADREGTIKPGDRLLSVDGIRLLGTTHAEAMSILKQC
250 260 270 280 290 300
230 240 250 260 270 280
pF1KSD SHEALFQVEYDVATPDTVANASGPLMVEIVKTPGSALGISLTTTSLRNKSVITIDRIKPA
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XP_016 GQEAALLIEYDVSVMDSVATASGPLLVEVAKTPGASLGVALTTSMCCNKQVIVIDKIKSA
310 320 330 340 350 360
290 300 310 320 330 340
pF1KSD SVVDRSGALHPGDHILSIDGTSMEHCSLLEATKLLASISEKVRLEILPVPQSQRPLRPSE
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XP_016 SIADRCGALHVGDHILSIDGTSMEYCTLAEATQFLANTTDQVKLEILPHHQTRLALKGPD
370 380 390 400 410 420
350 360 370 380 390
pF1KSD AVKVQRSEQLHRWDPCVPSCHSP----------RPGHCRMPTWATPAGQDQSR--SLSST
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XP_016 HVKIQRSDRQLTWDS-WASNHSSLHTNHHYNTYHPDHCRVPALTFPKAPPPNSPPALVSS
430 440 450 460 470 480
400 410 420 430 440
pF1KSD PFSSPTLNHAFSCN--NPSTLPRGSQPMSPRTTMGRRRQRRREHKSSLSLASSTVGPGGQ
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XP_016 SFS-PTSMSAYSLSSLNMGTLPRSLYSTSPRGTMMRRRLKKKDFKSSLSLASSTVGLAGQ
490 500 510 520 530
450 460 470 480 490 500
pF1KSD IVHTETTEVVLCGDPLSGFGLQLQGGIFATETLSSPPLVCFIEPDSPAERCGLLQVGDRV
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XP_016 VVHTETTEVVLTADPVTGFGIQLQGSVFATETLSSPPLISYIEADSPAERCGVLQIGDRV
540 550 560 570 580 590
510 520 530 540 550 560
pF1KSD LSINGIATEDGTMEEANQLLRDAALAHKVVLEVEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKRSVEL
..:::: :::.:.:::.:::::.... ::.::.::::::::::::::::::::::..:::
XP_016 MAINGIPTEDSTFEEASQLLRDSSITSKVTLEIEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKHNVEL
600 610 620 630 640 650
570 580 590 600 610 620
pF1KSD GITISS-ASRKRGEPLIISDIKKGSVAHRTGTLEPGDKLLAIDNIRLDNCPMEDAVQILR
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XP_016 GITISSPSSRKPGDPLVISDIKKGSVAHRTGTLELGDKLLAIDNIRLDNCSMEDAVQILQ
660 670 680 690 700 710
630 640 650 660 670 680
pF1KSD QCEDLVKLKIRKDEDNSDELETTGAVSYTVELKRYGGPLGITISGTEEPFDPIVISGLTK
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XP_016 QCEDLVKLKIRKDEDNSDEQESSGAIIYTVELKRYGGPLGITISGTEEPFDPIIISSLTK
720 730 740 750 760 770
690 700 710 720 730 740
pF1KSD RGLAERTGAIHVGDRILAINNVSLKGRPLSEAIHLLQVAGETVTLKIKKQLDRPLL--PR
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XP_016 GGLAERTGAIHIGDRILAINSSSLKGKPLSEAIHLLQMAGETVTLKIKKQTDAQSASSPK
780 790 800 810 820 830
750 760 770 780 790 800
pF1KSD K---SGSLSETSDADEDPADALKGGLPAARFSPAVPSVDSAVESWDSSATEGGFGGPGSY
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XP_016 KFPISSHLSDLGDVEEDSSPAQKPGKLSDMYPSTVPSVDSAVDSWDGSAIDTSYGTQGT-
840 850 860 870 880 890
810 820 830 840 850 860
pF1KSD TPQAAARGTTPQERRPGWLRGS-PPPTEPRRTSYTPTPADESFPEEEEGDDWEPPTSPA-
. ::.. . . . : ::: : :.:: .: : : .. : ::. :. .
XP_016 SFQASGYNFNTYDWRSPKQRGSLSPVTKPRSQTY-P---DVGLSYE----DWDRSTASGF
900 910 920 930 940 950
870 880 890 900
pF1KSD PGPA------REEGFWRMFGEALEDLESCGQSELLRELEASIMTGTVQRVALEG------
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XP_016 AGAADSAETEQEENFW---SQALEDLETCGQSGILRELEATIMSGSTMSLNHEAPTPRSQ
960 970 980 990 1000
910 920 930 940
pF1KSD -------------RPGHR--------PWQRGRE---VRASPAEMEELLLPTPLEMHKVTL
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XP_016 LGRQASFQERSSSRPHYSQTTRSNTLPSDVGRKSVTLRKMKQEIKEIMSPTPVELHKVTL
1010 1020 1030 1040 1050 1060
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD HKDPMRHDFGFSVSDGLLEKGVYVHTVRPDGPAHRGGLQPFDRVLQVNHVRTRDFDCCLA
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XP_016 YKDSDMEDFGFSVADGLLEKGVYVKNIRPAGPGDLGGLKPYDRLLQVNHVRTRDFDCCLV
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1010 1020 1030 1040
pF1KSD VPLLAEAGDVLELIISRKPHTAHSSRAPRS-PGPSSPRML
:::.::.:. :.:.:::.: ....: .: ::
XP_016 VPLIAESGNKLDLVISRNPLASQKSIDQQSLPGDWSEQNSAFFQQPSHGGNLETREPTNT
1130 1140 1150 1160 1170 1180
XP_016 L
>>NP_001171545 (OMIM: 219000,604597) glutamate receptor- (1061 aa)
initn: 3321 init1: 929 opt: 2062 Z-score: 1255.2 bits: 243.9 E(85289): 3.6e-63
Smith-Waterman score: 3824; 59.3% identity (78.2% similar) in 1070 aa overlap (14-1036:19-1033)
10 20 30 40 50
pF1KSD MLCGLSRETPGEADDGPYSKGGKDAGGADVSLACRRQSIPEEFRGITVVELIKKE
:..::.:..... : .:: :::::::::.: :::::.:::
NP_001 MIAVSFKCRCQILRRLTKDESPYTKSASQTKPPDGALAVRRQSIPEEFKGSTVVELMKKE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD GSTLGLTISGGTDKDGKPRVSNLRPGGLAARSDLLNIGDYIRSVNGIHLTRLRHDEIITL
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NP_001 GTTLGLTVSGGIDKDGKPRVSNLRQGGIAARSDQLDVGDYIKAVNGINLAKFRHDEIISL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LKNVGERVVLEVEYELPPPAPENNPRIISKTVDVSLYKEGNSFGFVLRGGAHEDGHKSRP
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NP_001 LKNVGERVVLEVEYELPPVSVQGSS-VIFRTVEVTLHKEGNTFGFVIRGGAHDDRNKSRP
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LVLTYVRPGGPADREGSLKVGDRLLSVDGIPLHGASHATALATLRQCSHEALFQVEYDVA
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NP_001 VVITCVRPGGPADREGTIKPGDRLLSVDGIRLLGTTHAEAMSILKQCGQEAALLIEYDVS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD TPDTVANASGPLMVEIVKTPGSALGISLTTTSLRNKSVITIDRIKPASVVDRSGALHPGD
. :.::.:::::.::..::::..::..:::. ::.::.::.:: ::..:: :::: ::
NP_001 VMDSVATASGPLLVEVAKTPGASLGVALTTSMCCNKQVIVIDKIKSASIADRCGALHVGD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD HILSIDGTSMEHCSLLEATKLLASISEKVRLEILPVPQSQRPLRPSEAVKVQRSEQLHRW
:::::::::::.:.: :::..::. ...:.::::: :.. :.
NP_001 HILSIDGTSMEYCTLAEATQFLANTTDQVKLEILPHHQTRLALK----------------
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KSD DPCVPSCHSPRPGHCRMPTWATPAGQDQSRSLSSTPFSSPTLNHAFSCN--NPSTLPRGS
: :.. .: :. :: :: :.: . : .::::.
NP_001 ------------------------GPDHA-ALVSSSFS-PTSMSAYSLSSLNMGTLPRSL
350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KSD QPMSPRTTMGRRRQRRREHKSSLSLASSTVGPGGQIVHTETTEVVLCGDPLSGFGLQLQG
::: :: ::: .... :::::::::::: .::.:::::::::: .::..:::.::::
NP_001 YSTSPRGTMMRRRLKKKDFKSSLSLASSTVGLAGQVVHTETTEVVLTADPVTGFGIQLQG
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KSD GIFATETLSSPPLVCFIEPDSPAERCGLLQVGDRVLSINGIATEDGTMEEANQLLRDAAL
..:::::::::::. .:: ::::::::.::.::::..:::: :::.:.:::.:::::...
NP_001 SVFATETLSSPPLISYIEADSPAERCGVLQIGDRVMAINGIPTEDSTFEEASQLLRDSSI
440 450 460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KSD AHKVVLEVEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKRSVELGITISS-ASRKRGEPLIISDIKKGS
. ::.::.::::::::::::::::::::::..::::::::: .::: :.::.::::::::
NP_001 TSKVTLEIEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKHNVELGITISSPSSRKPGDPLVISDIKKGS
500 510 520 530 540 550
600 610 620 630 640 650
pF1KSD VAHRTGTLEPGDKLLAIDNIRLDNCPMEDAVQILRQCEDLVKLKIRKDEDNSDELETTGA
::::::::: ::::::::::::::: ::::::::.::::::::::::::::::: :..::
NP_001 VAHRTGTLELGDKLLAIDNIRLDNCSMEDAVQILQQCEDLVKLKIRKDEDNSDEQESSGA
560 570 580 590 600 610
660 670 680 690 700 710
pF1KSD VSYTVELKRYGGPLGITISGTEEPFDPIVISGLTKRGLAERTGAIHVGDRILAINNVSLK
. ::::::::::::::::::::::::::.::.::: ::::::::::.::::::::. :::
NP_001 IIYTVELKRYGGPLGITISGTEEPFDPIIISSLTKGGLAERTGAIHIGDRILAINSSSLK
620 630 640 650 660 670
720 730 740 750 760
pF1KSD GRPLSEAIHLLQVAGETVTLKIKKQLDRPLL--PRK---SGSLSETSDADEDPADALKGG
:.::::::::::.:::::::::::: : :.: :. ::. .:..:: . : : :
NP_001 GKPLSEAIHLLQMAGETVTLKIKKQTDAQSASSPKKFPISSHLSDLGDVEEDSSPAQKPG
680 690 700 710 720 730
770 780 790 800 810 820
pF1KSD LPAARFSPAVPSVDSAVESWDSSATEGGFGGPGSYTPQAAARGTTPQERRPGWLRGS-PP
. . .::::::::.:::.:: . ..: :. . ::.. . . . : ::: :
NP_001 KLSDMYPSTVPSVDSAVDSWDGSAIDTSYGTQGT-SFQASGYNFNTYDWRSPKQRGSLSP
740 750 760 770 780 790
830 840 850 860 870
pF1KSD PTEPRRTSYTPTPADESFPEEEEGDDWEPPTSPA-PGPA------REEGFWRMFGEALED
:.:: .: : : .. : ::. :. . : : .::.:: ..::::
NP_001 VTKPRSQTY-P---DVGLSYE----DWDRSTASGFAGAADSAETEQEENFW---SQALED
800 810 820 830 840
880 890 900 910
pF1KSD LESCGQSELLRELEASIMTGTVQRVALEG-------------------RPGHR-------
::.:::: .::::::.::.:... . :. :: .
NP_001 LETCGQSGILRELEATIMSGSTMSLNHEAPTPRSQLGRQASFQERSSSRPHYSQTTRSNT
850 860 870 880 890 900
920 930 940 950 960
pF1KSD -PWQRGRE---VRASPAEMEELLLPTPLEMHKVTLHKDPMRHDFGFSVSDGLLEKGVYVH
: . ::. .: :..:.. :::.:.:::::.:: .::::::.::::::::::.
NP_001 LPSDVGRKSVTLRKMKQEIKEIMSPTPVELHKVTLYKDSDMEDFGFSVADGLLEKGVYVK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD TVRPDGPAHRGGLQPFDRVLQVNHVRTRDFDCCLAVPLLAEAGDVLELIISRKPHTAHSS
..:: ::. :::.:.::.:::::::::::::::.:::.::.:. :.:.:::.: ....:
NP_001 NIRPAGPGDLGGLKPYDRLLQVNHVRTRDFDCCLVVPLIAESGNKLDLVISRNPLASQKS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040
pF1KSD RAPRS-PGPSSPRML
.: ::
NP_001 IDQQSLPGDWSEQNSAFFQQPSHGGNLETREPTNTL
1030 1040 1050 1060
>>XP_016874589 (OMIM: 219000,604597) PREDICTED: glutamat (1136 aa)
initn: 3321 init1: 929 opt: 2062 Z-score: 1254.8 bits: 243.9 E(85289): 3.7e-63
Smith-Waterman score: 3825; 59.3% identity (78.2% similar) in 1071 aa overlap (13-1036:93-1108)
10 20 30 40
pF1KSD MLCGLSRETPGEADDGPYSKGGKDAGGADVSLACRRQSIPEE
.:..::.:..... : .:: ::::::::
XP_016 DDFHLNYEPPDIDTKVNLDQSPLEFLAKSNSDESPYTKSASQTKPPDGALAVRRQSIPEE
70 80 90 100 110 120
50 60 70 80 90 100
pF1KSD FRGITVVELIKKEGSTLGLTISGGTDKDGKPRVSNLRPGGLAARSDLLNIGDYIRSVNGI
:.: :::::.::::.:::::.::: :::::::::::: ::.::::: :..::::..::::
XP_016 FKGSTVVELMKKEGTTLGLTVSGGIDKDGKPRVSNLRQGGIAARSDQLDVGDYIKAVNGI
130 140 150 160 170 180
110 120 130 140 150 160
pF1KSD HLTRLRHDEIITLLKNVGERVVLEVEYELPPPAPENNPRIISKTVDVSLYKEGNSFGFVL
.:...::::::.::::::::::::::::::: . ... .: .::.:.:.::::.::::.
XP_016 NLAKFRHDEIISLLKNVGERVVLEVEYELPPVSVQGSS-VIFRTVEVTLHKEGNTFGFVI
190 200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
pF1KSD RGGAHEDGHKSRPLVLTYVRPGGPADREGSLKVGDRLLSVDGIPLHGASHATALATLRQC
:::::.: .::::.:.: :::::::::::..: :::::::::: : :..:: :.. :.::
XP_016 RGGAHDDRNKSRPVVITCVRPGGPADREGTIKPGDRLLSVDGIRLLGTTHAEAMSILKQC
250 260 270 280 290 300
230 240 250 260 270 280
pF1KSD SHEALFQVEYDVATPDTVANASGPLMVEIVKTPGSALGISLTTTSLRNKSVITIDRIKPA
..:: . .::::.. :.::.:::::.::..::::..::..:::. ::.::.::.:: :
XP_016 GQEAALLIEYDVSVMDSVATASGPLLVEVAKTPGASLGVALTTSMCCNKQVIVIDKIKSA
310 320 330 340 350 360
290 300 310 320 330 340
pF1KSD SVVDRSGALHPGDHILSIDGTSMEHCSLLEATKLLASISEKVRLEILPVPQSQRPLRPSE
:..:: :::: :::::::::::::.:.: :::..::. ...:.::::: :.. :.
XP_016 SIADRCGALHVGDHILSIDGTSMEYCTLAEATQFLANTTDQVKLEILPHHQTRLALK---
370 380 390 400 410
350 360 370 380 390 400
pF1KSD AVKVQRSEQLHRWDPCVPSCHSPRPGHCRMPTWATPAGQDQSRSLSSTPFSSPTLNHAFS
: :.. .: :. :: :: :.:
XP_016 -------------------------------------GPDHA-ALVSSSFS-PTSMSAYS
420 430
410 420 430 440 450 460
pF1KSD CN--NPSTLPRGSQPMSPRTTMGRRRQRRREHKSSLSLASSTVGPGGQIVHTETTEVVLC
. : .::::. ::: :: ::: .... :::::::::::: .::.::::::::::
XP_016 LSSLNMGTLPRSLYSTSPRGTMMRRRLKKKDFKSSLSLASSTVGLAGQVVHTETTEVVLT
440 450 460 470 480 490
470 480 490 500 510 520
pF1KSD GDPLSGFGLQLQGGIFATETLSSPPLVCFIEPDSPAERCGLLQVGDRVLSINGIATEDGT
.::..:::.::::..:::::::::::. .:: ::::::::.::.::::..:::: :::.:
XP_016 ADPVTGFGIQLQGSVFATETLSSPPLISYIEADSPAERCGVLQIGDRVMAINGIPTEDST
500 510 520 530 540 550
530 540 550 560 570
pF1KSD MEEANQLLRDAALAHKVVLEVEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKRSVELGITISS-ASRKR
.:::.:::::.... ::.::.::::::::::::::::::::::..::::::::: .:::
XP_016 FEEASQLLRDSSITSKVTLEIEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKHNVELGITISSPSSRKP
560 570 580 590 600 610
580 590 600 610 620 630
pF1KSD GEPLIISDIKKGSVAHRTGTLEPGDKLLAIDNIRLDNCPMEDAVQILRQCEDLVKLKIRK
:.::.::::::::::::::::: ::::::::::::::: ::::::::.::::::::::::
XP_016 GDPLVISDIKKGSVAHRTGTLELGDKLLAIDNIRLDNCSMEDAVQILQQCEDLVKLKIRK
620 630 640 650 660 670
640 650 660 670 680 690
pF1KSD DEDNSDELETTGAVSYTVELKRYGGPLGITISGTEEPFDPIVISGLTKRGLAERTGAIHV
::::::: :..::. ::::::::::::::::::::::::::.::.::: ::::::::::.
XP_016 DEDNSDEQESSGAIIYTVELKRYGGPLGITISGTEEPFDPIIISSLTKGGLAERTGAIHI
680 690 700 710 720 730
700 710 720 730 740 750
pF1KSD GDRILAINNVSLKGRPLSEAIHLLQVAGETVTLKIKKQLDRPLL--PRK---SGSLSETS
::::::::. ::::.::::::::::.:::::::::::: : :.: :. ::. .
XP_016 GDRILAINSSSLKGKPLSEAIHLLQMAGETVTLKIKKQTDAQSASSPKKFPISSHLSDLG
740 750 760 770 780 790
760 770 780 790 800 810
pF1KSD DADEDPADALKGGLPAARFSPAVPSVDSAVESWDSSATEGGFGGPGSYTPQAAARGTTPQ
:..:: . : : : . . .::::::::.:::.:: . ..: :. . ::.. . .
XP_016 DVEEDSSPAQKPGKLSDMYPSTVPSVDSAVDSWDGSAIDTSYGTQGT-SFQASGYNFNTY
800 810 820 830 840 850
820 830 840 850 860
pF1KSD ERRPGWLRGS-PPPTEPRRTSYTPTPADESFPEEEEGDDWEPPTSPA-PGPA------RE
. : ::: : :.:: .: : : .. : ::. :. . : : .:
XP_016 DWRSPKQRGSLSPVTKPRSQTY-P---DVGLSYE----DWDRSTASGFAGAADSAETEQE
860 870 880 890 900 910
870 880 890 900
pF1KSD EGFWRMFGEALEDLESCGQSELLRELEASIMTGTVQRVALEG------------------
:.:: ..::::::.:::: .::::::.::.:... . :.
XP_016 ENFW---SQALEDLETCGQSGILRELEATIMSGSTMSLNHEAPTPRSQLGRQASFQERSS
920 930 940 950 960
910 920 930 940 950
pF1KSD -RPGHR--------PWQRGRE---VRASPAEMEELLLPTPLEMHKVTLHKDPMRHDFGFS
:: . : . ::. .: :..:.. :::.:.:::::.:: .:::::
XP_016 SRPHYSQTTRSNTLPSDVGRKSVTLRKMKQEIKEIMSPTPVELHKVTLYKDSDMEDFGFS
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960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD VSDGLLEKGVYVHTVRPDGPAHRGGLQPFDRVLQVNHVRTRDFDCCLAVPLLAEAGDVLE
:.::::::::::...:: ::. :::.:.::.:::::::::::::::.:::.::.:. :.
XP_016 VADGLLEKGVYVKNIRPAGPGDLGGLKPYDRLLQVNHVRTRDFDCCLVVPLIAESGNKLD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1020 1030 1040
pF1KSD LIISRKPHTAHSSRAPRS-PGPSSPRML
:.:::.: ....: .: ::
XP_016 LVISRNPLASQKSIDQQSLPGDWSEQNSAFFQQPSHGGNLETREPTNTL
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pF1KSD GEADDGPYSKGGKDAGGADVSLACRRQSIPEEFRGITVVELIKKEGSTLGLTISGGTDKD
:::.: :::::.::::.:::::.::: :::
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pF1KSD GKPRVSNLRPGGLAARSDLLNIGDYIRSVNGIHLTRLRHDEIITLLKNVGERVVLEVEYE
::::::::: ::.::::: :..::::..::::.:...::::::.::::::::::::::::
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::: . ... .: .::.:.:.::::.::::.:::::.: .::::.:.: ::::::::::
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:..: :::::::::: : :..:: :.. :.::..:: . .::::.. :.::.:::::.::
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pF1KSD IVKTPGSALGISLTTTSLRNKSVITIDRIKPASVVDRSGALHPGDHILSIDGTSMEHCSL
..::::..::..:::. ::.::.::.:: ::..:: :::: :::::::::::::.:.:
XP_005 VAKTPGASLGVALTTSMCCNKQVIVIDKIKSASIADRCGALHVGDHILSIDGTSMEYCTL
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:::..::. ...:.::::: :.. :. . ::.:::.. :: : ::
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.: :::.:. . : . . .: :. :: :: :.: . : .::::.
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::: :: ::: .... :::::::::::: .::.:::::::::: .::..:::.::::..:
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pF1KSD ATETLSSPPLVCFIEPDSPAERCGLLQVGDRVLSINGIATEDGTMEEANQLLRDAALAHK
::::::::::. .:: ::::::::.::.::::..:::: :::.:.:::.:::::.... :
XP_005 ATETLSSPPLISYIEADSPAERCGVLQIGDRVMAINGIPTEDSTFEEASQLLRDSSITSK
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:.::.::::::::::::::::::::::..::::::::: .::: :.::.:::::::::::
XP_005 VTLEIEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKHNVELGITISSPSSRKPGDPLVISDIKKGSVAH
530 540 550 560 570 580
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pF1KSD RTGTLEPGDKLLAIDNIRLDNCPMEDAVQILRQCEDLVKLKIRKDEDNSDELETTGAVSY
:::::: ::::::::::::::: ::::::::.::::::::::::::::::: :..::. :
XP_005 RTGTLELGDKLLAIDNIRLDNCSMEDAVQILQQCEDLVKLKIRKDEDNSDEQESSGAIIY
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pF1KSD TVELKRYGGPLGITISGTEEPFDPIVISGLTKRGLAERTGAIHVGDRILAINNVSLKGRP
:::::::::::::::::::::::::.::.::: ::::::::::.::::::::. ::::.:
XP_005 TVELKRYGGPLGITISGTEEPFDPIIISSLTKGGLAERTGAIHIGDRILAINSSSLKGKP
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pF1KSD LSEAIHLLQVAGETVTLKIKKQLDRPLL--PRK---SGSLSETSDADEDPADALKGGLPA
:::::::::.:::::::::::: : :.: :. ::. .:..:: . : : : .
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pF1KSD ARFSPAVPSVDSAVESWDSSATEGGFGGPGSYTPQAAARGTTPQERRPGWLRGS-PPPTE
. .::::::::.:::.:: . ..: :. . ::.. . . . : ::: : :.
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pF1KSD PRRTSYTPTPADESFPEEEEGDDWEPPTSPA-PGPA------REEGFWRMFGEALEDLES
:: .: : : .. : ::. :. . : : .::.:: ..::::::.
XP_005 PRSQTY---P-DVGLSYE----DWDRSTASGFAGAADSAETEQEENFW---SQALEDLET
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pF1KSD CGQSELLRELE---------------ASIMTGTVQRVALEG-------------------
:::: .::::: :.::.:... . :.
XP_005 CGQSGILRELEEKADRRVSLRNMTLLATIMSGSTMSLNHEAPTPRSQLGRQASFQERSSS
880 890 900 910 920 930
910 920 930 940 950
pF1KSD RPGHR--------PWQRGRE---VRASPAEMEELLLPTPLEMHKVTLHKDPMRHDFGFSV
:: . : . ::. .: :..:.. :::.:.:::::.:: .::::::
XP_005 RPHYSQTTRSNTLPSDVGRKSVTLRKMKQEIKEIMSPTPVELHKVTLYKDSDMEDFGFSV
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960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD SDGLLEKGVYVHTVRPDGPAHRGGLQPFDRVLQVNHVRTRDFDCCLAVPLLAEAGDVLEL
.::::::::::...:: ::. :::.:.::.:::::::::::::::.:::.::.:. :.:
XP_005 ADGLLEKGVYVKNIRPAGPGDLGGLKPYDRLLQVNHVRTRDFDCCLVVPLIAESGNKLDL
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1020 1030 1040
pF1KSD IISRKPHTAHSSRAPRSPGPSSPRML
.:::.: ....:
XP_005 VISRNPLASQKSIDQQSLPGDWSEQNSAFFQQPSHGGNLETREPTNTL
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10 20 30 40 50
pF1KSD MLCGLSRETPGEADDGPYSKGGKDAGGADVSLACRRQSIPEEFRGITVVELIKKE
:..::.:..... : .:: :::::::::.: :::::.:::
XP_011 MIAVSFKCRCQILRRLTKDESPYTKSASQTKPPDGALAVRRQSIPEEFKGSTVVELMKKE
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD GSTLGLTISGGTDKDGKPRVSNLRPGGLAARSDLLNIGDYIRSVNGIHLTRLRHDEIITL
:.:::::.::: :::::::::::: ::.::::: :..::::..::::.:...::::::.:
XP_011 GTTLGLTVSGGIDKDGKPRVSNLRQGGIAARSDQLDVGDYIKAVNGINLAKFRHDEIISL
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pF1KSD LKNVGERVVLEVEYELPPPAPENNPRIISKTVDVSLYKEGNSFGFVLRGGAHEDGHKSRP
:::::::::::::::::: . ... .: .::.:.:.::::.::::.:::::.: .::::
XP_011 LKNVGERVVLEVEYELPPVSVQGSS-VIFRTVEVTLHKEGNTFGFVIRGGAHDDRNKSRP
130 140 150 160 170
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pF1KSD LVLTYVRPGGPADREGSLKVGDRLLSVDGIPLHGASHATALATLRQCSHEALFQVEYDVA
.:.: :::::::::::..: :::::::::: : :..:: :.. :.::..:: . .::::.
XP_011 VVITCVRPGGPADREGTIKPGDRLLSVDGIRLLGTTHAEAMSILKQCGQEAALLIEYDVS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD TPDTVANASGPLMVEIVKTPGSALGISLTTTSLRNKSVITIDRIKPASVVDRSGALHPGD
. :.::.:::::.::..::::..::..:::. ::.::.::.:: ::..:: :::: ::
XP_011 VMDSVATASGPLLVEVAKTPGASLGVALTTSMCCNKQVIVIDKIKSASIADRCGALHVGD
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pF1KSD HILSIDGTSMEHCSLLEATKLLASISEKVRLEILPVPQSQRPLRPSEAVKVQRSEQLHRW
:::::::::::.:.: :::..::. ...:.::::: :.. :. . ::.:::.. :
XP_011 HILSIDGTSMEYCTLAEATQFLANTTDQVKLEILPHHQTRLALKGPDHVKIQRSDRQLTW
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD DPCVPSCHSP----------RPGHCRMPTWATPAGQDQSR--SLSSTPFSSPTLNHAFSC
: : :: .: :::.:. . : . . .: :. :: :: :.:
XP_011 DS-WASNHSSLHTNHHYNTYHPDHCRVPALTFPKAPPPNSPPALVSSSFS-PTSMSAYSL
360 370 380 390 400 410
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pF1KSD N--NPSTLPRGSQPMSPRTTMGRRRQRRREHKSSLSLASSTVGPGGQIVHTETTEVVLCG
. : .::::. ::: :: ::: .... :::::::::::: .::.:::::::::: .
XP_011 SSLNMGTLPRSLYSTSPRGTMMRRRLKKKDFKSSLSLASSTVGLAGQVVHTETTEVVLTA
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD DPLSGFGLQLQGGIFATETLSSPPLVCFIEPDSPAERCGLLQVGDRVLSINGIATEDGTM
::..:::.::::..:::::::::::. .:: ::::::::.::.::::..:::: :::.:.
XP_011 DPVTGFGIQLQGSVFATETLSSPPLISYIEADSPAERCGVLQIGDRVMAINGIPTEDSTF
480 490 500 510 520 530
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pF1KSD EEANQLLRDAALAHKVVLEVEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKRSVELGITISS-ASRKRG
:::.:::::.... ::.::.::::::::::::::::::::::..::::::::: .::: :
XP_011 EEASQLLRDSSITSKVTLEIEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKHNVELGITISSPSSRKPG
540 550 560 570 580 590
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pF1KSD EPLIISDIKKGSVAHRTGTLEPGDKLLAIDNIRLDNCPMEDAVQILRQCEDLVKLKIRKD
.::.::::::::::::::::: ::::::::::::::: ::::::::.:::::::::::::
XP_011 DPLVISDIKKGSVAHRTGTLELGDKLLAIDNIRLDNCSMEDAVQILQQCEDLVKLKIRKD
600 610 620 630 640 650
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pF1KSD EDNSDELETTGAVSYTVELKRYGGPLGITISGTEEPFDPIVISGLTKRGLAERTGAIHVG
:::::: :..::. ::::::::::::::::::::::::::.::.::: ::::::::::.:
XP_011 EDNSDEQESSGAIIYTVELKRYGGPLGITISGTEEPFDPIIISSLTKGGLAERTGAIHIG
660 670 680 690 700 710
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pF1KSD DRILAINNVSLKGRPLSEAIHLLQVAGETVTLKIKKQLDRPLL--PRK---SGSLSETSD
:::::::. ::::.::::::::::.:::::::::::: : :.: :. ::. .:
XP_011 DRILAINSSSLKGKPLSEAIHLLQMAGETVTLKIKKQTDAQSASSPKKFPISSHLSDLGD
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KSD ADEDPADALKGGLPAARFSPAVPSVDSAVESWDSSATEGGFGGPGSYTPQAAARGTTPQE
..:: . : : : . . .::::::::.:::.:: . ..: :. . ::.. . . .
XP_011 VEEDSSPAQKPGKLSDMYPSTVPSVDSAVDSWDGSAIDTSYGTQGT-SFQASGYNFNTYD
780 790 800 810 820 830
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pF1KSD RRPGWLRGS-PPPTEPRRTSYTPTPADESFPEEEEGDDWEPPTSPA-PGPA------REE
: ::: : :.:: .: : : .. : ::. :. . : : .::
XP_011 WRSPKQRGSLSPVTKPRSQTY---P-DVGLSYE----DWDRSTASGFAGAADSAETEQEE
840 850 860 870 880
870 880 890 900
pF1KSD GFWRMFGEALEDLESCGQSELLRELE---------------ASIMTGTVQRVALEG----
.:: ..::::::.:::: .::::: :.::.:... . :.
XP_011 NFW---SQALEDLETCGQSGILRELEEKADRRVSLRNMTLLATIMSGSTMSLNHEAPTPR
890 900 910 920 930 940
910 920 930 940
pF1KSD ---------------RPGHR--------PWQRGRE---VRASPAEMEELLLPTPLEMHKV
:: . : . ::. .: :..:.. :::.:.:::
XP_011 SQLGRQASFQERSSSRPHYSQTTRSNTLPSDVGRKSVTLRKMKQEIKEIMSPTPVELHKV
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950 960 970 980 990 1000
pF1KSD TLHKDPMRHDFGFSVSDGLLEKGVYVHTVRPDGPAHRGGLQPFDRVLQVNHVRTRDFDCC
::.:: .::::::.::::::::::...:: ::. :::.:.::.::::::::::::::
XP_011 TLYKDSDMEDFGFSVADGLLEKGVYVKNIRPAGPGDLGGLKPYDRLLQVNHVRTRDFDCC
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1010 1020 1030 1040
pF1KSD LAVPLLAEAGDVLELIISRKPHTAHSSRAPRSPGPSSPRML
:.:::.::.:. :.:.:::.: ....:
XP_011 LVVPLIAESGNKLDLVISRNPLASQKSIDQQSLPGDWSEQNSAFFQQPSHGGNLETREPT
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>>XP_005268811 (OMIM: 219000,604597) PREDICTED: glutamat (1129 aa)
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pF1KSD MLCGLSRETPGEADDGPYSKGGKDAGGADVSLACRRQSIPEEFRGITVVELI
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XP_005 MPGWKKNIPICLQAEEQ--ERDESPYTKSASQTKPPDGALAVRRQSIPEEFKGSTVVELM
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pF1KSD KKEGSTLGLTISGGTDKDGKPRVSNLRPGGLAARSDLLNIGDYIRSVNGIHLTRLRHDEI
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pF1KSD ITLLKNVGERVVLEVEYELPPPAPENNPRIISKTVDVSLYKEGNSFGFVLRGGAHEDGHK
:.::::::::::::::::::: . ... .: .::.:.:.::::.::::.:::::.: .:
XP_005 ISLLKNVGERVVLEVEYELPPVSVQGSS-VIFRTVEVTLHKEGNTFGFVIRGGAHDDRNK
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pF1KSD SRPLVLTYVRPGGPADREGSLKVGDRLLSVDGIPLHGASHATALATLRQCSHEALFQVEY
:::.:.: :::::::::::..: :::::::::: : :..:: :.. :.::..:: . .::
XP_005 SRPVVITCVRPGGPADREGTIKPGDRLLSVDGIRLLGTTHAEAMSILKQCGQEAALLIEY
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::.. :.::.:::::.::..::::..::..:::. ::.::.::.:: ::..:: ::::
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pF1KSD PGDHILSIDGTSMEHCSLLEATKLLASISEKVRLEILPVPQSQRPLRPSEAVKVQRSEQL
:::::::::::::.:.: :::..::. ...:.::::: :.. :. . ::.:::..
XP_005 VGDHILSIDGTSMEYCTLAEATQFLANTTDQVKLEILPHHQTRLALKGPDHVKIQRSDRQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KSD HRWDPCVPSCHSP----------RPGHCRMPTWATPAGQDQSR--SLSSTPFSSPTLNHA
:: : :: .: :::.:. . : . . .: :. :: :: :
XP_005 LTWDS-WASNHSSLHTNHHYNTYHPDHCRVPALTFPKAPPPNSPPALVSSSFS-PTSMSA
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KSD FSCN--NPSTLPRGSQPMSPRTTMGRRRQRRREHKSSLSLASSTVGPGGQIVHTETTEVV
.: . : .::::. ::: :: ::: .... :::::::::::: .::.:::::::::
XP_005 YSLSSLNMGTLPRSLYSTSPRGTMMRRRLKKKDFKSSLSLASSTVGLAGQVVHTETTEVV
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KSD LCGDPLSGFGLQLQGGIFATETLSSPPLVCFIEPDSPAERCGLLQVGDRVLSINGIATED
: .::..:::.::::..:::::::::::. .:: ::::::::.::.::::..:::: :::
XP_005 LTADPVTGFGIQLQGSVFATETLSSPPLISYIEADSPAERCGVLQIGDRVMAINGIPTED
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KSD GTMEEANQLLRDAALAHKVVLEVEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKRSVELGITISS-ASR
.:.:::.:::::.... ::.::.::::::::::::::::::::::..::::::::: .::
XP_005 STFEEASQLLRDSSITSKVTLEIEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKHNVELGITISSPSSR
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KSD KRGEPLIISDIKKGSVAHRTGTLEPGDKLLAIDNIRLDNCPMEDAVQILRQCEDLVKLKI
: :.::.::::::::::::::::: ::::::::::::::: ::::::::.::::::::::
XP_005 KPGDPLVISDIKKGSVAHRTGTLELGDKLLAIDNIRLDNCSMEDAVQILQQCEDLVKLKI
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KSD RKDEDNSDELETTGAVSYTVELKRYGGPLGITISGTEEPFDPIVISGLTKRGLAERTGAI
::::::::: :..::. ::::::::::::::::::::::::::.::.::: :::::::::
XP_005 RKDEDNSDEQESSGAIIYTVELKRYGGPLGITISGTEEPFDPIIISSLTKGGLAERTGAI
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KSD HVGDRILAINNVSLKGRPLSEAIHLLQVAGETVTLKIKKQLDRPLL--PRK---SGSLSE
:.::::::::. ::::.::::::::::.:::::::::::: : :.: :. ::.
XP_005 HIGDRILAINSSSLKGKPLSEAIHLLQMAGETVTLKIKKQTDAQSASSPKKFPISSHLSD
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KSD TSDADEDPADALKGGLPAARFSPAVPSVDSAVESWDSSATEGGFGGPGSYTPQAAARGTT
.:..:: . : : : . . .::::::::.:::.:: . ..: :. . ::.. . .
XP_005 LGDVEEDSSPAQKPGKLSDMYPSTVPSVDSAVDSWDGSAIDTSYGTQGT-SFQASGYNFN
780 790 800 810 820 830
820 830 840 850 860
pF1KSD PQERRPGWLRGS-PPPTEPRRTSYTPTPADESFPEEEEGDDWEPPTSPA-PGPA------
. : ::: : :.:: .: : : .. : ::. :. . : :
XP_005 TYDWRSPKQRGSLSPVTKPRSQTY-P---DVGLSYE----DWDRSTASGFAGAADSAETE
840 850 860 870 880
870 880 890 900
pF1KSD REEGFWRMFGEALEDLESCGQSELLRELE---------------ASIMTGTVQRVALEG-
.::.:: ..::::::.:::: .::::: :.::.:... . :.
XP_005 QEENFW---SQALEDLETCGQSGILRELEEKADRRVSLRNMTLLATIMSGSTMSLNHEAP
890 900 910 920 930 940
910 920 930
pF1KSD ------------------RPGHR--------PWQRGRE---VRASPAEMEELLLPTPLEM
:: . : . ::. .: :..:.. :::.:.
XP_005 TPRSQLGRQASFQERSSSRPHYSQTTRSNTLPSDVGRKSVTLRKMKQEIKEIMSPTPVEL
950 960 970 980 990 1000
940 950 960 970 980 990
pF1KSD HKVTLHKDPMRHDFGFSVSDGLLEKGVYVHTVRPDGPAHRGGLQPFDRVLQVNHVRTRDF
:::::.:: .::::::.::::::::::...:: ::. :::.:.::.:::::::::::
XP_005 HKVTLYKDSDMEDFGFSVADGLLEKGVYVKNIRPAGPGDLGGLKPYDRLLQVNHVRTRDF
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1000 1010 1020 1030 1040
pF1KSD DCCLAVPLLAEAGDVLELIISRKPHTAHSSRAPRSPGPSSPRML
::::.:::.::.:. :.:.:::.: ....:
XP_005 DCCLVVPLIAESGNKLDLVISRNPLASQKSIDQQSLPGDWSEQNSAFFQQPSHGGNLETR
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10 20 30 40
pF1KSD MLCGLSRETPGEADDGPYSKGGKDAGGADVSLACRRQSIPEEF
...::.:..... : .:: :::::::::
XP_016 RRRKGKKYRPEEDYHEGYEDVYYYASEHFRNESPYTKSASQTKPPDGALAVRRQSIPEEF
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KSD RGITVVELIKKEGSTLGLTISGGTDKDGKPRVSNLRPGGLAARSDLLNIGDYIRSVNGIH
.: :::::.::::.:::::.::: :::::::::::: ::.::::: :..::::..::::.
XP_016 KGSTVVELMKKEGTTLGLTVSGGIDKDGKPRVSNLRQGGIAARSDQLDVGDYIKAVNGIN
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KSD LTRLRHDEIITLLKNVGERVVLEVEYELPPPAPENNPRIISKTVDVSLYKEGNSFGFVLR
:...::::::.::::::::::::::::::: . ... .: .::.:.:.::::.::::.:
XP_016 LAKFRHDEIISLLKNVGERVVLEVEYELPPVSVQGSS-VIFRTVEVTLHKEGNTFGFVIR
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170 180 190 200 210 220
pF1KSD GGAHEDGHKSRPLVLTYVRPGGPADREGSLKVGDRLLSVDGIPLHGASHATALATLRQCS
::::.: .::::.:.: :::::::::::..: :::::::::: : :..:: :.. :.::.
XP_016 GGAHDDRNKSRPVVITCVRPGGPADREGTIKPGDRLLSVDGIRLLGTTHAEAMSILKQCG
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KSD HEALFQVEYDVATPDTVANASGPLMVEIVKTPGSALGISLTTTSLRNKSVITIDRIKPAS
.:: . .::::.. :.::.:::::.::..::::..::..:::. ::.::.::.:: ::
XP_016 QEAALLIEYDVSVMDSVATASGPLLVEVAKTPGASLGVALTTSMCCNKQVIVIDKIKSAS
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KSD VVDRSGALHPGDHILSIDGTSMEHCSLLEATKLLASISEKVRLEILPVPQSQRPLRPSEA
..:: :::: :::::::::::::.:.: :::..::. ...:.::::: :.. :. .
XP_016 IADRCGALHVGDHILSIDGTSMEYCTLAEATQFLANTTDQVKLEILPHHQTRLALKGPDH
320 330 340 350 360 370
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pF1KSD VKVQRSEQLHRWDPCVPSCHSP----------RPGHCRMPTWATPAGQDQSR--SLSSTP
::.:::.. :: : :: .: :::.:. . : . . .: :.
XP_016 VKIQRSDRQLTWDS-WASNHSSLHTNHHYNTYHPDHCRVPALTFPKAPPPNSPPALVSSS
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440
pF1KSD FSSPTLNHAFSCN--NPSTLPRGSQPMSPRTTMGRRRQRRREHKSSLSLASSTVGPGGQI
:: :: :.: . : .::::. ::: :: ::: .... :::::::::::: .::.
XP_016 FS-PTSMSAYSLSSLNMGTLPRSLYSTSPRGTMMRRRLKKKDFKSSLSLASSTVGLAGQV
440 450 460 470 480 490
450 460 470 480 490 500
pF1KSD VHTETTEVVLCGDPLSGFGLQLQGGIFATETLSSPPLVCFIEPDSPAERCGLLQVGDRVL
:::::::::: .::..:::.::::..:::::::::::. .:: ::::::::.::.::::.
XP_016 VHTETTEVVLTADPVTGFGIQLQGSVFATETLSSPPLISYIEADSPAERCGVLQIGDRVM
500 510 520 530 540 550
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pF1KSD SINGIATEDGTMEEANQLLRDAALAHKVVLEVEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKRSVELG
.:::: :::.:.:::.:::::.... ::.::.::::::::::::::::::::::..::::
XP_016 AINGIPTEDSTFEEASQLLRDSSITSKVTLEIEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKHNVELG
560 570 580 590 600 610
570 580 590 600 610 620
pF1KSD ITISS-ASRKRGEPLIISDIKKGSVAHRTGTLEPGDKLLAIDNIRLDNCPMEDAVQILRQ
::::: .::: :.::.::::::::::::::::: ::::::::::::::: ::::::::.:
XP_016 ITISSPSSRKPGDPLVISDIKKGSVAHRTGTLELGDKLLAIDNIRLDNCSMEDAVQILQQ
620 630 640 650 660 670
630 640 650 660 670 680
pF1KSD CEDLVKLKIRKDEDNSDELETTGAVSYTVELKRYGGPLGITISGTEEPFDPIVISGLTKR
:::::::::::::::::: :..::. ::::::::::::::::::::::::::.::.:::
XP_016 CEDLVKLKIRKDEDNSDEQESSGAIIYTVELKRYGGPLGITISGTEEPFDPIIISSLTKG
680 690 700 710 720 730
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pF1KSD GLAERTGAIHVGDRILAINNVSLKGRPLSEAIHLLQVAGETVTLKIKKQLDRPLL--PRK
::::::::::.::::::::. ::::.::::::::::.:::::::::::: : :.:
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750 760 770 780 790 800
pF1KSD ---SGSLSETSDADEDPADALKGGLPAARFSPAVPSVDSAVESWDSSATEGGFGGPGSYT
:. ::. .:..:: . : : : . . .::::::::.:::.:: . ..: :. .
XP_016 FPISSHLSDLGDVEEDSSPAQKPGKLSDMYPSTVPSVDSAVDSWDGSAIDTSYGTQGT-S
800 810 820 830 840 850
810 820 830 840 850 860
pF1KSD PQAAARGTTPQERRPGWLRGS-PPPTEPRRTSYTPTPADESFPEEEEGDDWEPPTSPA-P
::.. . . . : ::: : :.:: .: : : .. : ::. :. .
XP_016 FQASGYNFNTYDWRSPKQRGSLSPVTKPRSQTY---P-DVGLSYE----DWDRSTASGFA
860 870 880 890 900
870 880 890 900
pF1KSD GPA------REEGFWRMFGEALEDLESCGQSELLRELE---------------ASIMTGT
: : .::.:: ..::::::.:::: .::::: :.::.:.
XP_016 GAADSAETEQEENFW---SQALEDLETCGQSGILRELEEKADRRVSLRNMTLLATIMSGS
910 920 930 940 950
910 920 930
pF1KSD VQRVALEG-------------------RPGHR--------PWQRGRE---VRASPAEMEE
.. . :. :: . : . ::. .: :..:
XP_016 TMSLNHEAPTPRSQLGRQASFQERSSSRPHYSQTTRSNTLPSDVGRKSVTLRKMKQEIKE
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940 950 960 970 980 990
pF1KSD LLLPTPLEMHKVTLHKDPMRHDFGFSVSDGLLEKGVYVHTVRPDGPAHRGGLQPFDRVLQ
.. :::.:.:::::.:: .::::::.::::::::::...:: ::. :::.:.::.::
XP_016 IMSPTPVELHKVTLYKDSDMEDFGFSVADGLLEKGVYVKNIRPAGPGDLGGLKPYDRLLQ
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1000 1010 1020 1030 1040
pF1KSD VNHVRTRDFDCCLAVPLLAEAGDVLELIISRKPHTAHSSRAPRSPGPSSPRML
:::::::::::::.:::.::.:. :.:.:::.: ....:
XP_016 VNHVRTRDFDCCLVVPLIAESGNKLDLVISRNPLASQKSIDQQSLPGDWSEQNSAFFQQP
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XP_016 SHGGNLETREPTNTL
1140 1150
>>NP_066973 (OMIM: 219000,604597) glutamate receptor-int (1076 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KSD MLCGLSRETPGEADDGPYSKGGKDAGGADVSLACRRQSIPEEFRGITVVELIKKE
:..::.:..... : .:: :::::::::.: :::::.:::
NP_066 MIAVSFKCRCQILRRLTKDESPYTKSASQTKPPDGALAVRRQSIPEEFKGSTVVELMKKE
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD GSTLGLTISGGTDKDGKPRVSNLRPGGLAARSDLLNIGDYIRSVNGIHLTRLRHDEIITL
:.:::::.::: :::::::::::: ::.::::: :..::::..::::.:...::::::.:
NP_066 GTTLGLTVSGGIDKDGKPRVSNLRQGGIAARSDQLDVGDYIKAVNGINLAKFRHDEIISL
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pF1KSD LKNVGERVVLEVEYELPPPAPENNPRIISKTVDVSLYKEGNSFGFVLRGGAHEDGHKSRP
:::::::::::::::::: . ... .: .::.:.:.::::.::::.:::::.: .::::
NP_066 LKNVGERVVLEVEYELPPVSVQGSS-VIFRTVEVTLHKEGNTFGFVIRGGAHDDRNKSRP
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pF1KSD LVLTYVRPGGPADREGSLKVGDRLLSVDGIPLHGASHATALATLRQCSHEALFQVEYDVA
.:.: :::::::::::..: :::::::::: : :..:: :.. :.::..:: . .::::.
NP_066 VVITCVRPGGPADREGTIKPGDRLLSVDGIRLLGTTHAEAMSILKQCGQEAALLIEYDVS
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD TPDTVANASGPLMVEIVKTPGSALGISLTTTSLRNKSVITIDRIKPASVVDRSGALHPGD
. :.::.:::::.::..::::..::..:::. ::.::.::.:: ::..:: :::: ::
NP_066 VMDSVATASGPLLVEVAKTPGASLGVALTTSMCCNKQVIVIDKIKSASIADRCGALHVGD
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD HILSIDGTSMEHCSLLEATKLLASISEKVRLEILPVPQSQRPLRPSEAVKVQRSEQLHRW
:::::::::::.:.: :::..::. ...:.::::: :.. :.
NP_066 HILSIDGTSMEYCTLAEATQFLANTTDQVKLEILPHHQTRLALK----------------
300 310 320 330 340
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pF1KSD DPCVPSCHSPRPGHCRMPTWATPAGQDQSRSLSSTPFSSPTLNHAFSCN--NPSTLPRGS
: :.. .: :. :: :: :.: . : .::::.
NP_066 ------------------------GPDHA-ALVSSSFS-PTSMSAYSLSSLNMGTLPRSL
350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KSD QPMSPRTTMGRRRQRRREHKSSLSLASSTVGPGGQIVHTETTEVVLCGDPLSGFGLQLQG
::: :: ::: .... :::::::::::: .::.:::::::::: .::..:::.::::
NP_066 YSTSPRGTMMRRRLKKKDFKSSLSLASSTVGLAGQVVHTETTEVVLTADPVTGFGIQLQG
380 390 400 410 420 430
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pF1KSD GIFATETLSSPPLVCFIEPDSPAERCGLLQVGDRVLSINGIATEDGTMEEANQLLRDAAL
..:::::::::::. .:: ::::::::.::.::::..:::: :::.:.:::.:::::...
NP_066 SVFATETLSSPPLISYIEADSPAERCGVLQIGDRVMAINGIPTEDSTFEEASQLLRDSSI
440 450 460 470 480 490
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pF1KSD AHKVVLEVEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKRSVELGITISS-ASRKRGEPLIISDIKKGS
. ::.::.::::::::::::::::::::::..::::::::: .::: :.::.::::::::
NP_066 TSKVTLEIEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKHNVELGITISSPSSRKPGDPLVISDIKKGS
500 510 520 530 540 550
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pF1KSD VAHRTGTLEPGDKLLAIDNIRLDNCPMEDAVQILRQCEDLVKLKIRKDEDNSDELETTGA
::::::::: ::::::::::::::: ::::::::.::::::::::::::::::: :..::
NP_066 VAHRTGTLELGDKLLAIDNIRLDNCSMEDAVQILQQCEDLVKLKIRKDEDNSDEQESSGA
560 570 580 590 600 610
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pF1KSD VSYTVELKRYGGPLGITISGTEEPFDPIVISGLTKRGLAERTGAIHVGDRILAINNVSLK
. ::::::::::::::::::::::::::.::.::: ::::::::::.::::::::. :::
NP_066 IIYTVELKRYGGPLGITISGTEEPFDPIIISSLTKGGLAERTGAIHIGDRILAINSSSLK
620 630 640 650 660 670
720 730 740 750 760
pF1KSD GRPLSEAIHLLQVAGETVTLKIKKQLDRPLL--PRK---SGSLSETSDADEDPADALKGG
:.::::::::::.:::::::::::: : :.: :. ::. .:..:: . : : :
NP_066 GKPLSEAIHLLQMAGETVTLKIKKQTDAQSASSPKKFPISSHLSDLGDVEEDSSPAQKPG
680 690 700 710 720 730
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pF1KSD LPAARFSPAVPSVDSAVESWDSSATEGGFGGPGSYTPQAAARGTTPQERRPGWLRGS-PP
. . .::::::::.:::.:: . ..: :. . ::.. . . . : ::: :
NP_066 KLSDMYPSTVPSVDSAVDSWDGSAIDTSYGTQGT-SFQASGYNFNTYDWRSPKQRGSLSP
740 750 760 770 780 790
830 840 850 860 870
pF1KSD PTEPRRTSYTPTPADESFPEEEEGDDWEPPTSPA-PGPA------REEGFWRMFGEALED
:.:: .: : : .. : ::. :. . : : .::.:: ..::::
NP_066 VTKPRSQTY---P-DVGLSYE----DWDRSTASGFAGAADSAETEQEENFW---SQALED
800 810 820 830 840
880 890 900
pF1KSD LESCGQSELLRELE---------------ASIMTGTVQRVALEG----------------
::.:::: .::::: :.::.:... . :.
NP_066 LETCGQSGILRELEEKADRRVSLRNMTLLATIMSGSTMSLNHEAPTPRSQLGRQASFQER
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950
pF1KSD ---RPGHR--------PWQRGRE---VRASPAEMEELLLPTPLEMHKVTLHKDPMRHDFG
:: . : . ::. .: :..:.. :::.:.:::::.:: .:::
NP_066 SSSRPHYSQTTRSNTLPSDVGRKSVTLRKMKQEIKEIMSPTPVELHKVTLYKDSDMEDFG
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD FSVSDGLLEKGVYVHTVRPDGPAHRGGLQPFDRVLQVNHVRTRDFDCCLAVPLLAEAGDV
:::.::::::::::...:: ::. :::.:.::.:::::::::::::::.:::.::.:.
NP_066 FSVADGLLEKGVYVKNIRPAGPGDLGGLKPYDRLLQVNHVRTRDFDCCLVVPLIAESGNK
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040
pF1KSD LELIISRKPHTAHSSRAPRSPGPSSPRML
:.:.:::.: ....:
NP_066 LDLVISRNPLASQKSIDQQSLPGDWSEQNSAFFQQPSHGGNLETREPTNTL
1030 1040 1050 1060 1070
>>XP_016874590 (OMIM: 219000,604597) PREDICTED: glutamat (1102 aa)
initn: 2538 init1: 934 opt: 2019 Z-score: 1229.1 bits: 239.1 E(85289): 1e-61
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10 20 30 40
pF1KSD MLCGLSRETPGEADDGPYSKGGKDAGGADVSLACRRQSIPEEF
...::.:..... : .:: :::::::::
XP_016 RRRKGKKYRPEEDYHEGYEDVYYYASEHFRNESPYTKSASQTKPPDGALAVRRQSIPEEF
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KSD RGITVVELIKKEGSTLGLTISGGTDKDGKPRVSNLRPGGLAARSDLLNIGDYIRSVNGIH
.: :::::.::::.:::::.::: :::::::::::: ::.::::: :..::::..::::.
XP_016 KGSTVVELMKKEGTTLGLTVSGGIDKDGKPRVSNLRQGGIAARSDQLDVGDYIKAVNGIN
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KSD LTRLRHDEIITLLKNVGERVVLEVEYELPPPAPENNPRIISKTVDVSLYKEGNSFGFVLR
:...::::::.::::::::::::::::::: . ... .: .::.:.:.::::.::::.:
XP_016 LAKFRHDEIISLLKNVGERVVLEVEYELPPVSVQGSS-VIFRTVEVTLHKEGNTFGFVIR
140 150 160 170 180 190
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..:: :::: :::::::::::::.:.: :::..::. ...:.::::: :.. :.
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: :.. .: :. :: :: :.:
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. : .::::. ::: :: ::: .... :::::::::::: .::.:::::::::: .
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::..:::.::::..:::::::::::. .:: ::::::::.::.::::..:::: :::.:.
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:::.:::::.... ::.::.::::::::::::::::::::::..::::::::: .::: :
XP_016 EEASQLLRDSSITSKVTLEIEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKHNVELGITISSPSSRKPG
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.::.::::::::::::::::: ::::::::::::::: ::::::::.:::::::::::::
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:::::: :..::. ::::::::::::::::::::::::::.::.::: ::::::::::.:
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:::::::. ::::.::::::::::.:::::::::::: : :.: :. ::. .:
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..:: . : : : . . .::::::::.:::.:: . ..: :. . ::.. . . .
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: ::: : :.:: .: : : .. : ::. :. . : : .::
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.:: ..::::::.:::: .::::: :.::.:... . :.
XP_016 NFW---SQALEDLETCGQSGILRELEEKADRRVSLRNMTLLATIMSGSTMSLNHEAPTPR
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pF1KSD ---------------RPGHR--------PWQRGRE---VRASPAEMEELLLPTPLEMHKV
:: . : . ::. .: :..:.. :::.:.:::
XP_016 SQLGRQASFQERSSSRPHYSQTTRSNTLPSDVGRKSVTLRKMKQEIKEIMSPTPVELHKV
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::.:: .::::::.::::::::::...:: ::. :::.:.::.::::::::::::::
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:.:::.::.:. :.:.:::.: ....:
XP_016 LVVPLIAESGNKLDLVISRNPLASQKSIDQQSLPGDWSEQNSAFFQQPSHGGNLETREPT
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>>XP_016874591 (OMIM: 219000,604597) PREDICTED: glutamat (1101 aa)
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10 20 30 40
pF1KSD MLCGLSRETPGEADDGPYSKGGKDAGGADVSLACRRQSIPEEF
...::.:..... : .:: :::::::::
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50 60 70 80 90 100
pF1KSD RGITVVELIKKEGSTLGLTISGGTDKDGKPRVSNLRPGGLAARSDLLNIGDYIRSVNGIH
.: :::::.::::.:::::.::: :::::::::::: ::.::::: :..::::..::::.
XP_016 KGSTVVELMKKEGTTLGLTVSGGIDKDGKPRVSNLRQGGIAARSDQLDVGDYIKAVNGIN
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110 120 130 140 150 160
pF1KSD LTRLRHDEIITLLKNVGERVVLEVEYELPPPAPENNPRIISKTVDVSLYKEGNSFGFVLR
:...::::::.::::::::::::::::::: . ... .: .::.:.:.::::.::::.:
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60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 07:03:15 2016 done: Thu Nov 3 07:03:17 2016
Total Scan time: 17.590 Total Display time: 0.550
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]