Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1722
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1722, 1499 aa
1>>>pF1KSDA1722 1499 - 1499 aa - 1499 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9204+/-0.000461; mu= 8.7806+/- 0.029
mean_var=221.4198+/-44.757, 0's: 0 Z-trim(118.5): 366 B-trim: 1028 in 2/50
Lambda= 0.086192
statistics sampled from 31098 (31484) to 31098 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.369), width: 16
Scan time: 12.380
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004482 (OMIM: 605277) rho GTPase-activating pro (1499) 9953 1251.8 0
XP_016882203 (OMIM: 605277) PREDICTED: rho GTPase- (1499) 9953 1251.8 0
XP_011525175 (OMIM: 605277) PREDICTED: rho GTPase- (1415) 9136 1150.2 0
XP_016876777 (OMIM: 602680) PREDICTED: rho GTPase- (1501) 4021 514.2 3.2e-144
NP_001164 (OMIM: 602680) rho GTPase-activating pro (1501) 4021 514.2 3.2e-144
XP_005267693 (OMIM: 602680) PREDICTED: rho GTPase- (1502) 4021 514.2 3.2e-144
XP_005267692 (OMIM: 602680) PREDICTED: rho GTPase- (1502) 4021 514.2 3.2e-144
XP_016876776 (OMIM: 602680) PREDICTED: rho GTPase- (1502) 4021 514.2 3.2e-144
NP_001025226 (OMIM: 602680) rho GTPase-activating (1502) 4021 514.2 3.2e-144
XP_011522776 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 581) 486 74.3 3.2e-12
XP_011522774 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 722) 486 74.4 3.8e-12
XP_011522773 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 865) 486 74.4 4.4e-12
XP_011522771 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 900) 486 74.4 4.5e-12
XP_011522770 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 922) 486 74.4 4.6e-12
XP_016879800 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 922) 486 74.4 4.6e-12
NP_954976 (OMIM: 610591) rho GTPase-activating pro ( 548) 476 73.0 7.3e-12
XP_005257185 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 667) 476 73.1 8.5e-12
XP_016879801 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 689) 476 73.1 8.7e-12
XP_006721810 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 867) 476 73.2 1e-11
NP_001269219 (OMIM: 610591) rho GTPase-activating ( 889) 476 73.2 1.1e-11
XP_006721808 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 889) 476 73.2 1.1e-11
NP_001193531 (OMIM: 118423,604356) N-chimaerin iso ( 334) 438 68.1 1.3e-10
NP_001020372 (OMIM: 118423,604356) N-chimaerin iso ( 433) 438 68.2 1.6e-10
NP_001813 (OMIM: 118423,604356) N-chimaerin isofor ( 459) 438 68.2 1.7e-10
NP_001280010 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform ( 261) 427 66.7 2.8e-10
NP_001280002 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform ( 287) 427 66.7 3e-10
NP_001035025 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform ( 332) 427 66.8 3.4e-10
NP_001280000 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform ( 433) 427 66.8 4.2e-10
NP_001280001 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform ( 453) 427 66.9 4.3e-10
NP_004058 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform 2 ( 468) 427 66.9 4.4e-10
NP_001279999 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform ( 481) 427 66.9 4.5e-10
XP_011513409 (OMIM: 602857) PREDICTED: beta-chimae ( 494) 427 66.9 4.6e-10
XP_016867211 (OMIM: 602857) PREDICTED: beta-chimae ( 500) 427 66.9 4.7e-10
NP_001279998 (OMIM: 602857) beta-chimaerin isoform ( 543) 427 66.9 5e-10
XP_011513408 (OMIM: 602857) PREDICTED: beta-chimae ( 556) 427 66.9 5e-10
XP_011513407 (OMIM: 602857) PREDICTED: beta-chimae ( 569) 427 66.9 5.1e-10
XP_016867210 (OMIM: 602857) PREDICTED: beta-chimae ( 575) 427 66.9 5.2e-10
XP_011509785 (OMIM: 610578) PREDICTED: rho GTPase- ( 397) 415 65.3 1.1e-09
XP_016872443 (OMIM: 610577) PREDICTED: rho GTPase- ( 742) 420 66.2 1.2e-09
XP_016859989 (OMIM: 610578) PREDICTED: rho GTPase- ( 432) 415 65.4 1.2e-09
NP_001257627 (OMIM: 610577) rho GTPase-activating ( 769) 420 66.2 1.2e-09
XP_011518063 (OMIM: 610577) PREDICTED: rho GTPase- ( 772) 420 66.2 1.2e-09
XP_005252701 (OMIM: 610577) PREDICTED: rho GTPase- ( 794) 420 66.2 1.2e-09
NP_001257628 (OMIM: 610577) rho GTPase-activating ( 794) 420 66.2 1.2e-09
NP_001257626 (OMIM: 610577) rho GTPase-activating ( 799) 420 66.2 1.2e-09
NP_001257625 (OMIM: 610577) rho GTPase-activating ( 816) 420 66.2 1.2e-09
NP_060930 (OMIM: 610578) rho GTPase-activating pro ( 475) 415 65.4 1.3e-09
XP_016859988 (OMIM: 610578) PREDICTED: rho GTPase- ( 475) 415 65.4 1.3e-09
XP_011509781 (OMIM: 610578) PREDICTED: rho GTPase- ( 475) 415 65.4 1.3e-09
NP_001257624 (OMIM: 610577) rho GTPase-activating ( 841) 420 66.2 1.3e-09
>>NP_004482 (OMIM: 605277) rho GTPase-activating protein (1499 aa)
initn: 9953 init1: 9953 opt: 9953 Z-score: 6696.8 bits: 1251.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9953; 100.0% identity (100.0% similar) in 1499 aa overlap (1-1499:1-1499)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MMMARKQDVRIPTYNISVVGLSGTEKEKGQCGIGKSCLCNRFVRPSADEFHLDHTSVLST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MMMARKQDVRIPTYNISVVGLSGTEKEKGQCGIGKSCLCNRFVRPSADEFHLDHTSVLST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SDFGGRVVNNDHFLYWGEVSRSLEDCVECKMHIVEQTEFIDDQTFQPHRSTALQPYIKRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SDFGGRVVNNDHFLYWGEVSRSLEDCVECKMHIVEQTEFIDDQTFQPHRSTALQPYIKRA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AATKLASAEKLMYFCTDQLGLEQDFEQKQMPDGKLLVDGFLLGIDVSRGMNRNFDDQLKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AATKLASAEKLMYFCTDQLGLEQDFEQKQMPDGKLLVDGFLLGIDVSRGMNRNFDDQLKF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VSNLYNQLAKTKKPIVVVLTKCDEGVERYIRDAHTFALSKKNLQVVETSARSNVNVDLAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VSNLYNQLAKTKKPIVVVLTKCDEGVERYIRDAHTFALSKKNLQVVETSARSNVNVDLAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD STLVQLIDKSRGKTKIIPYFEALKQQSQQIATAKDKYEWLVSRIVKNHNENWLSVSRKMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 STLVQLIDKSRGKTKIIPYFEALKQQSQQIATAKDKYEWLVSRIVKNHNENWLSVSRKMQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ASPEYQDYVYLEGTQKAKKLFLQHIHRLKHEHIERRRKLYLAALPLAFEALIPNLDEIDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ASPEYQDYVYLEGTQKAKKLFLQHIHRLKHEHIERRRKLYLAALPLAFEALIPNLDEIDH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LSCIKAKKLLETKPEFLKWFVVLEETPWDATSHIDNMENERIPFDLMDTVPAEQLYEAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LSCIKAKKLLETKPEFLKWFVVLEETPWDATSHIDNMENERIPFDLMDTVPAEQLYEAHL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EKLRNERKRVEMRRAFKENLETSPFITPGKPWEEARSFIMNEDFYQWLEESVYMDIYGKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EKLRNERKRVEMRRAFKENLETSPFITPGKPWEEARSFIMNEDFYQWLEESVYMDIYGKH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QKQIIDKAKEEFQELLLEYSELFYELELDAKPSKEKMGVIQDVLGEEQRFKALQKLQAER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QKQIIDKAKEEFQELLLEYSELFYELELDAKPSKEKMGVIQDVLGEEQRFKALQKLQAER
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD DALILKHIHFVYHPTKETCPSCPACVDAKIEHLISSRFIRPSDRNQKNSLSDPNIDRINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DALILKHIHFVYHPTKETCPSCPACVDAKIEHLISSRFIRPSDRNQKNSLSDPNIDRINL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD VILGKDGLARELANEIRALCTNDDKYVIDGKMYELSLRPIEGNVRLPVNSFQTPTFQPHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VILGKDGLARELANEIRALCTNDDKYVIDGKMYELSLRPIEGNVRLPVNSFQTPTFQPHG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD CLCLYNSKESLSYVVESIEKSRESTLGRRDNHLVHLPLTLILVNKRGDTSGETLHSLIQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 CLCLYNSKESLSYVVESIEKSRESTLGRRDNHLVHLPLTLILVNKRGDTSGETLHSLIQQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD GQQIASKLQCVFLDPASAGIGYGRNINEKQISQVLKGLLDSKRNLNLVSSTASIKDLADV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GQQIASKLQCVFLDPASAGIGYGRNINEKQISQVLKGLLDSKRNLNLVSSTASIKDLADV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DLRIVMCLMCGDPFSADDILFPVLQSQTCKSSHCGSNNSVLLELPIGLHKKRIELSVLSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DLRIVMCLMCGDPFSADDILFPVLQSQTCKSSHCGSNNSVLLELPIGLHKKRIELSVLSY
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD HSSFSIRKSRLVHGYIVFYSAKRKASLAMLRAFLCEVQDIIPIQLVALTDGAVDVLDNDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HSSFSIRKSRLVHGYIVFYSAKRKASLAMLRAFLCEVQDIIPIQLVALTDGAVDVLDNDL
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pF1KSD SREQLTEGEEIAQEIDGRFTSIPCSQPQHKLEIFHPFFKDVVEKKNIIEATHMYDNAAEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SREQLTEGEEIAQEIDGRFTSIPCSQPQHKLEIFHPFFKDVVEKKNIIEATHMYDNAAEA
910 920 930 940 950 960
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pF1KSD CSTTEEVFNSPRAGSPLCNSNLQDSEEDIEPSYSLFREDTSLPSLSKDHSKLSMELEGND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 CSTTEEVFNSPRAGSPLCNSNLQDSEEDIEPSYSLFREDTSLPSLSKDHSKLSMELEGND
970 980 990 1000 1010 1020
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pF1KSD GLSFIMSNFESKLNNKVPPPVKPKPPVHFEITKGDLSYLDQGHRDGQRKSVSSSPWLPQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GLSFIMSNFESKLNNKVPPPVKPKPPVHFEITKGDLSYLDQGHRDGQRKSVSSSPWLPQD
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pF1KSD GFDPSDYAEPMDAVVKPRNEEENIYSVPHDSTQGKIITIRNINKAQSNGSGNGSDSEMDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GFDPSDYAEPMDAVVKPRNEEENIYSVPHDSTQGKIITIRNINKAQSNGSGNGSDSEMDT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KSD SSLERGRKVSIVSKPVLYRTRCTRLGRFASYRTSFSVGSDDELGPIRKKEEDQASQGYKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SSLERGRKVSIVSKPVLYRTRCTRLGRFASYRTSFSVGSDDELGPIRKKEEDQASQGYKG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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pF1KSD DNAVIPYETDEDPRRRNILRSLRRNTKKPKPKPRPSITKATWESNYFGVPLTTVVTPEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DNAVIPYETDEDPRRRNILRSLRRNTKKPKPKPRPSITKATWESNYFGVPLTTVVTPEKP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
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pF1KSD IPIFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQRQFDQDHNLDLAEKDFTVNTVAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 IPIFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQRQFDQDHNLDLAEKDFTVNTVAGA
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD MKSFFSELPDPLVPYNMQIDLVEAHKINDREQKLHALKEVLKKFPKENHEVFKYVISHLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MKSFFSELPDPLVPYNMQIDLVEAHKINDREQKLHALKEVLKKFPKENHEVFKYVISHLN
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD KVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMRPDFSTMDALTATRTYQTIIELFIQQCPFFFYNRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMRPDFSTMDALTATRTYQTIIELFIQQCPFFFYNRP
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490
pF1KSD ITEPPGARPSSPSAVASTVPFLTSTPVTSQPSPPQSPPPTPQSPMQPLLPSQLQAEHTL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ITEPPGARPSSPSAVASTVPFLTSTPVTSQPSPPQSPPPTPQSPMQPLLPSQLQAEHTL
1450 1460 1470 1480 1490
>>XP_016882203 (OMIM: 605277) PREDICTED: rho GTPase-acti (1499 aa)
initn: 9953 init1: 9953 opt: 9953 Z-score: 6696.8 bits: 1251.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9953; 100.0% identity (100.0% similar) in 1499 aa overlap (1-1499:1-1499)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MMMARKQDVRIPTYNISVVGLSGTEKEKGQCGIGKSCLCNRFVRPSADEFHLDHTSVLST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MMMARKQDVRIPTYNISVVGLSGTEKEKGQCGIGKSCLCNRFVRPSADEFHLDHTSVLST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SDFGGRVVNNDHFLYWGEVSRSLEDCVECKMHIVEQTEFIDDQTFQPHRSTALQPYIKRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SDFGGRVVNNDHFLYWGEVSRSLEDCVECKMHIVEQTEFIDDQTFQPHRSTALQPYIKRA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AATKLASAEKLMYFCTDQLGLEQDFEQKQMPDGKLLVDGFLLGIDVSRGMNRNFDDQLKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AATKLASAEKLMYFCTDQLGLEQDFEQKQMPDGKLLVDGFLLGIDVSRGMNRNFDDQLKF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VSNLYNQLAKTKKPIVVVLTKCDEGVERYIRDAHTFALSKKNLQVVETSARSNVNVDLAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VSNLYNQLAKTKKPIVVVLTKCDEGVERYIRDAHTFALSKKNLQVVETSARSNVNVDLAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD STLVQLIDKSRGKTKIIPYFEALKQQSQQIATAKDKYEWLVSRIVKNHNENWLSVSRKMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 STLVQLIDKSRGKTKIIPYFEALKQQSQQIATAKDKYEWLVSRIVKNHNENWLSVSRKMQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ASPEYQDYVYLEGTQKAKKLFLQHIHRLKHEHIERRRKLYLAALPLAFEALIPNLDEIDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASPEYQDYVYLEGTQKAKKLFLQHIHRLKHEHIERRRKLYLAALPLAFEALIPNLDEIDH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LSCIKAKKLLETKPEFLKWFVVLEETPWDATSHIDNMENERIPFDLMDTVPAEQLYEAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSCIKAKKLLETKPEFLKWFVVLEETPWDATSHIDNMENERIPFDLMDTVPAEQLYEAHL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EKLRNERKRVEMRRAFKENLETSPFITPGKPWEEARSFIMNEDFYQWLEESVYMDIYGKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EKLRNERKRVEMRRAFKENLETSPFITPGKPWEEARSFIMNEDFYQWLEESVYMDIYGKH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QKQIIDKAKEEFQELLLEYSELFYELELDAKPSKEKMGVIQDVLGEEQRFKALQKLQAER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QKQIIDKAKEEFQELLLEYSELFYELELDAKPSKEKMGVIQDVLGEEQRFKALQKLQAER
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD DALILKHIHFVYHPTKETCPSCPACVDAKIEHLISSRFIRPSDRNQKNSLSDPNIDRINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DALILKHIHFVYHPTKETCPSCPACVDAKIEHLISSRFIRPSDRNQKNSLSDPNIDRINL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VILGKDGLARELANEIRALCTNDDKYVIDGKMYELSLRPIEGNVRLPVNSFQTPTFQPHG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CSTTEEVFNSPRAGSPLCNSNLQDSEEDIEPSYSLFREDTSLPSLSKDHSKLSMELEGND
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IPIFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQRQFDQDHNLDLAEKDFTVNTVAGA
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XP_016 MKSFFSELPDPLVPYNMQIDLVEAHKINDREQKLHALKEVLKKFPKENHEVFKYVISHLN
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ITEPPGARPSSPSAVASTVPFLTSTPVTSQPSPPQSPPPTPQSPMQPLLPSQLQAEHTL
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>>XP_011525175 (OMIM: 605277) PREDICTED: rho GTPase-acti (1415 aa)
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SDFGGRVVNNDHFLYWGEVSRSLEDCVECKMHIVEQTEFIDDQTFQPHRSTALQPYIKRA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSCIKAKKLLETKPEFLKWFVVLEETPWDATSHIDNMENERIPFDLMDTVPAEQLYEAHL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EKLRNERKRVEMRRAFKENLETSPFITPGKPWEEARSFIMNEDFYQWLEESVYMDIYGKH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QKQIIDKAKEEFQELLLEYSELFYELELDAKPSKEKMGVIQDVLGEEQRFKALQKLQAER
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pF1KSD DALILKHIHFVYHPTKETCPSCPACVDAKIEHLISSRFIRPSDRNQKNSLSDPNIDRINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DALILKHIHFVYHPTKETCPSCPACVDAKIEHLISSRFIRPSDRNQKNSLSDPNIDRINL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CLCLYNSKESLSYVVESIEKSRESTLGRRDNHLVHLPLTLILVNKRGDTSGETLHSLIQQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GQQIASKLQCVFLDPASAGIGYGRNINEKQISQVLKGLLDSKRNLNLVSSTASIKDLADV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DLRIVMCLMCGDPFSADDILFPVLQSQTCKSSHCGSNNSVLLELPIGLHKKRIELSVLSY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HSSFSIRKSRLVHGYIVFYSAKRKASLAMLRAFLCEVQDIIPIQLVALTDGAVDVLDNDL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CSTTEEVFNSPRAGSPLCNSNLQDSEEDIEPSYSLFREDTSLPSLSKDHSKLSMELEGND
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLSFIMSNFESKLNNKVPPPVKPKPPVHFEITKGDLSYLDQGHRDGQRKSVSSSPWLPQD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GFDPSDYAEPMDAVVKPRNEEENIYSVPHDSTQGKIITIRNINKAQSNGSGNGSDSEMDT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSLERGRKVSIVSKPVLYRTRCTRLGRFASYRTSFSVGSDDELGPIRKKEEDQASQGYKG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DNAVIPYETDEDPRRRNILRSLRRNTKKPKPKPRPSITKATWESNYFGVPLTTVVTPEKP
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pF1KSD IPIFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQRQFDQDHNLDLAEKDFTVNTVAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IPIFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQRQFDQDHNLDLAEKDFTVNTVAGA
1270 1280 1290 1300 1310 1320
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pF1KSD MKSFFSELPDPLVPYNMQIDLVEAHKINDREQKLHALKEVLKKFPKENHEVFKYVISHLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MKSFFSELPDPLVPYNMQIDLVEAHKINDREQKLHALKEVLKKFPKENHEVFKYVISHLN
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KSD KVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMRPDFSTMDALTATRTYQTIIELFIQQCPFFFYNRP
XP_011 NWGEPGHCTSRDVLQETASLRHGAQPQAGGRMVVP
1390 1400 1410
>>XP_016876777 (OMIM: 602680) PREDICTED: rho GTPase-acti (1501 aa)
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Smith-Waterman score: 4987; 50.9% identity (78.3% similar) in 1513 aa overlap (2-1491:1-1495)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MMMARKQDVRIPTYNISVVGLSGTEKEKGQCGIGKSCLCNRFVRPSADEFHLDHTSVLST
:::.... : :.:.::.::::::::.::.::.::::::::::: .:::.. .:::::::
XP_016 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLST
10 20 30 40 50
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pF1KSD SDFGGRVVNNDHFLYWGEVSRSLEDCVECKMHIVEQTEFIDDQTFQPHRSTALQPYIKRA
::::::::::::::::.. .. :: ::::.:..::::::::::: ::::: ::::::::
XP_016 IDFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRA
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD AATKLASAEKLMYFCTDQLGLEQDFEQKQMPDGKLLVDGFLLGIDVSRGMNRNFDDQLKF
::.:: :::::::.:::::::::::::::::.::: :::::: ::::.: ::.:::::::
XP_016 AASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VSNLYNQLAKTKKPIVVVLTKCDEGVERYIRDAHTFALSKKNLQVVETSARSNVNVDLAF
:.::. ::.:.:::.... ::::: :..:.:....:: .:::: ::::::: :::.. :
XP_016 VNNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCF
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD STLVQLIDKSRGKTKIIPYFEALKQQSQQIATAKDKYEWLVSRIVKNHNENWLSVSRKMQ
..:::..::.:.: :::::..: : : : ..:: ::.: :: . :.... .: .:: :..
XP_016 TALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLV-QTVRDYHATWKTVSNKLK
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ASPEYQDYVYLEGTQKAKKLFLQHIHRLKHEHIERRRKLYLAALPLAFEALIPNLDEIDH
:.:..:. ::::.::.. : .::..::.:::..::. :. .:: ::..:.:::.::.:
XP_016 NHPDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEH
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD LSCIKAKKLLETKPEFLKWFVVLEETPWDATSHIDNMENERIPFDLMDTVPAEQLYEAHL
:. .: ::.: . .: :::::.:::: :.:::.....::::::..:. ::..:. :.
XP_016 LNWSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHV
360 370 380 390 400 410
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pF1KSD EKLRNERKRVEMRRAFKENLETSPFITPGKPWEEARSFIMNEDFYQWLEESVYMDIYGKH
..: .:..::::.. ::..:: ::.::.::::. :.:... :... :. ..::.:
XP_016 QHLISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRH
420 430 440 450 460 470
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pF1KSD QKQIIDKAKEEFQELLLEYSELFYELELDAKPSKEKMGVIQDVLGEEQRFKALQKLQAER
:..:..::::::::.:.:.:::::.:.:.: ::..::. :. ::.:: :.:::::: .:
XP_016 QREIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDR
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KSD DALILKHIHFVYHPTKETCPSCPACVDAKIEHLISSRFIRPSDRNQKNSLSDPNIDRINL
..:.:::: :::::::::: : :.: :.:.:..: ... . . .. :::..::
XP_016 ESLLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNL
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KSD VILGKDGLARELANEIRALCTNDDKYVIDGKMYELSLRPIEGNVRLPVNSFQTPTFQPHG
::::::::.:::::::. : ::.:..:::.:::.:::.... .... : .:.:::
XP_016 FILGKDGLAQELANEIRTQST-DDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHG
600 610 620 630 640 650
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pF1KSD CLCLYNSKESLSYVVESIEKSR-ESTLGRRDNHLVHLPLTLILVNKRGDTSGETLHSLIQ
:.:..:: ::::.. : : : : :.. :.:.....::.::::.:.: :. ...: : .
XP_016 CFCVFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQR-DSISKNLPILRH
660 670 680 690 700 710
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pF1KSD QGQQIASKLQCVFLDPASAGIGYGRNINEKQISQVLKGLLDS-KRNLNLVSSTASIKDLA
::::.:.:::: :.: . :: : :..:: ::.:.:.:.:.: :.::..:: . :::.
XP_016 QGQQLANKLQCPFVD-VPAGT-YPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLS
720 730 740 750 760 770
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pF1KSD DVDLRIVMCLMCGDPFSADDILFPVLQSQTCKSSHCGSNNSVLLELPIGLHKKRIELSVL
..::::::: :::::::.: :: : :.:..:.... :.:::..:. :: ...::....:
XP_016 EADLRIVMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITIL
780 790 800 810 820 830
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pF1KSD SYHSSFSIRKSRLVHGYIVFYSAKRKASLAMLRAFLCEVQDIIPIQLVALTDGAVDVLDN
:::::...::..::::::. ::::::::..:::::: :::: ::.::::.::. .: ..:
XP_016 SYHSSIGVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFEN
840 850 860 870 880 890
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pF1KSD DLSREQLTEGEEIAQEIDGRFTSI-PCSQPQHKLEIFHPFFKDVVEKKNIIEATHMYDNA
. .: .::::.:: :: ..::.. :: ... :.: ::.::.::::.:: ... ::.
XP_016 EAIKELMTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNT
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960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD AEACSTTEEVF-NSPRAGSPLCNSNLQDSEEDIE--PSYSLFREDTSLPSLSKDHSKLSM
:. .:.:: ::: : .: ::..: : : :: . .:..: .:.:. .
XP_016 RESTHQSEDVFLPSPRDCFPY--NNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRL
960 970 980 990 1000 1010
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pF1KSD ELEGNDGLSFIMSN-FESKLNNKVPPPVKPKPPV-HFEITKGD---LSYLDQGHRDGQRK
.::::. : . . :.:::::.:::: : . .. : : :. .. : . ::
XP_016 DLEGNEYPIHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRK
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD SVSSSPWLPQDGFDPSD-YAEPMDAVVKPRNEEENIYSVPHDSTQGKIITIRN--INKAQ
..: : . .:::: ::::.:.. : .. ..:: :: :: :..: ::: .:..:
XP_016 QTSRVPLAHPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDS-QNRI-KIRNSFVNNTQ
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD SNGSGNGSDSEMDTSSLERGRKVSIVSKPVLYRTRC--TRLGRFASYRTSFSVGSDDELG
.. .. :: . . .: : . :: .. ... : :: .:.... . :
XP_016 GDEENGFSDRTSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKG
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD PIRKKEED---QASQGYKG--DNAVIPYETDEDPRR-RNILRSLRRNTKKPKPKPRPSIT
: .::: . . .:: :: .: . . : .. .. ...... :: : : :
XP_016 RHRGSEEDPLLSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKKKKTKNFNPPT
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KSD KATWESNYFGVPLTTVVTPEKPIPIFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQRQ
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XP_016 RRNWESNYFGMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQ
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KSD FDQDHNLDLAEKDFTVNTVAGAMKSFFSELPDPLVPYNMQIDLVEAHKINDREQKLHALK
::::::..:. . :::.::::.:.::..:::::.::... .:.:: :: :. ..:::::
XP_016 FDQDHNINLVSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALK
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KSD EVLKKFPKENHEVFKYVISHLNKVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMRPDFSTMDALTAT
:..::: :..::.:::.:::.::...:.::::..::::::::::::::: . . :..:
XP_016 EIVKKFHPVNYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTT
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KSD RTYQTIIELFIQQCPFFFYNRPITEPPG-ARPSSPSAVASTVPFLTSTPVTSQPSPPQSP
. .:...: ::::: ::::: :.: . . : :: .. : :.. : : :
XP_016 KIHQSVVETFIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVE-----PMV----PLQLP
1440 1450 1460 1470 1480
1480 1490
pF1KSD PPTPQSPMQPLLPSQLQAEHTL
:: . .:: : .
XP_016 PPLQPQLIQPQLQTDPLGII
1490 1500
>>NP_001164 (OMIM: 602680) rho GTPase-activating protein (1501 aa)
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Smith-Waterman score: 4987; 50.9% identity (78.3% similar) in 1513 aa overlap (2-1491:1-1495)
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pF1KSD MMMARKQDVRIPTYNISVVGLSGTEKEKGQCGIGKSCLCNRFVRPSADEFHLDHTSVLST
:::.... : :.:.::.::::::::.::.::.::::::::::: .:::.. .:::::::
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pF1KSD VSNLYNQLAKTKKPIVVVLTKCDEGVERYIRDAHTFALSKKNLQVVETSARSNVNVDLAF
:.::. ::.:.:::.... ::::: :..:.:....:: .:::: ::::::: :::.. :
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pF1KSD STLVQLIDKSRGKTKIIPYFEALKQQSQQIATAKDKYEWLVSRIVKNHNENWLSVSRKMQ
..:::..::.:.: :::::..: : : : ..:: ::.: :: . :.... .: .:: :..
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pF1KSD ASPEYQDYVYLEGTQKAKKLFLQHIHRLKHEHIERRRKLYLAALPLAFEALIPNLDEIDH
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360 370 380 390 400 410
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pF1KSD EKLRNERKRVEMRRAFKENLETSPFITPGKPWEEARSFIMNEDFYQWLEESVYMDIYGKH
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NP_001 QHLISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRH
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pF1KSD QKQIIDKAKEEFQELLLEYSELFYELELDAKPSKEKMGVIQDVLGEEQRFKALQKLQAER
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NP_001 QREIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDR
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pF1KSD DALILKHIHFVYHPTKETCPSCPACVDAKIEHLISSRFIRPSDRNQKNSLSDPNIDRINL
..:.:::: :::::::::: : :.: :.:.:..: ... . . .. :::..::
NP_001 ESLLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNL
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pF1KSD VILGKDGLARELANEIRALCTNDDKYVIDGKMYELSLRPIEGNVRLPVNSFQTPTFQPHG
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NP_001 FILGKDGLAQELANEIRTQST-DDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHG
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670 680 690 700 710
pF1KSD CLCLYNSKESLSYVVESIEKSR-ESTLGRRDNHLVHLPLTLILVNKRGDTSGETLHSLIQ
:.:..:: ::::.. : : : : :.. :.:.....::.::::.:.: :. ...: : .
NP_001 CFCVFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQR-DSISKNLPILRH
660 670 680 690 700 710
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pF1KSD QGQQIASKLQCVFLDPASAGIGYGRNINEKQISQVLKGLLDS-KRNLNLVSSTASIKDLA
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NP_001 QGQQLANKLQCPFVD-VPAGT-YPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLS
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780 790 800 810 820 830
pF1KSD DVDLRIVMCLMCGDPFSADDILFPVLQSQTCKSSHCGSNNSVLLELPIGLHKKRIELSVL
..::::::: :::::::.: :: : :.:..:.... :.:::..:. :: ...::....:
NP_001 EADLRIVMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITIL
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pF1KSD SYHSSFSIRKSRLVHGYIVFYSAKRKASLAMLRAFLCEVQDIIPIQLVALTDGAVDVLDN
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NP_001 SYHSSIGVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFEN
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pF1KSD DLSREQLTEGEEIAQEIDGRFTSI-PCSQPQHKLEIFHPFFKDVVEKKNIIEATHMYDNA
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NP_001 EAIKELMTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNT
900 910 920 930 940 950
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pF1KSD AEACSTTEEVF-NSPRAGSPLCNSNLQDSEEDIE--PSYSLFREDTSLPSLSKDHSKLSM
:. .:.:: ::: : .: ::..: : : :: . .:..: .:.:. .
NP_001 RESTHQSEDVFLPSPRDCFPY--NNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRL
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD ELEGNDGLSFIMSN-FESKLNNKVPPPVKPKPPV-HFEITKGD---LSYLDQGHRDGQRK
.::::. : . . :.:::::.:::: : . .. : : :. .. : . ::
NP_001 DLEGNEYPIHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRK
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD SVSSSPWLPQDGFDPSD-YAEPMDAVVKPRNEEENIYSVPHDSTQGKIITIRN--INKAQ
..: : . .:::: ::::.:.. : .. ..:: :: :: :..: ::: .:..:
NP_001 QTSRVPLAHPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDS-QNRI-KIRNSFVNNTQ
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD SNGSGNGSDSEMDTSSLERGRKVSIVSKPVLYRTRC--TRLGRFASYRTSFSVGSDDELG
.. .. :: . . .: : . :: .. ... : :: .:.... . :
NP_001 GDEENGFSDRTSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKG
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD PIRKKEED---QASQGYKG--DNAVIPYETDEDPRR-RNILRSLRRNTKKPKPKPRPSIT
: .::: . . .:: :: .: . . : .. .. ...... :: : : :
NP_001 RHRGSEEDPLLSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKKKKTKNFNPPT
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KSD KATWESNYFGVPLTTVVTPEKPIPIFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQRQ
. .:::::::.:: .:: :::::.:.:.:.:.:: ::: :::.:::::::......:.:
NP_001 RRNWESNYFGMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQ
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KSD FDQDHNLDLAEKDFTVNTVAGAMKSFFSELPDPLVPYNMQIDLVEAHKINDREQKLHALK
::::::..:. . :::.::::.:.::..:::::.::... .:.:: :: :. ..:::::
NP_001 FDQDHNINLVSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALK
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KSD EVLKKFPKENHEVFKYVISHLNKVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMRPDFSTMDALTAT
:..::: :..::.:::.:::.::...:.::::..::::::::::::::: . . :..:
NP_001 EIVKKFHPVNYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTT
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KSD RTYQTIIELFIQQCPFFFYNRPITEPPG-ARPSSPSAVASTVPFLTSTPVTSQPSPPQSP
. .:...: ::::: ::::: :.: . . : :: .. : :.. : : :
NP_001 KIHQSVVETFIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVE-----PMV----PLQLP
1440 1450 1460 1470 1480
1480 1490
pF1KSD PPTPQSPMQPLLPSQLQAEHTL
:: . .:: : .
NP_001 PPLQPQLIQPQLQTDPLGII
1490 1500
>>XP_005267693 (OMIM: 602680) PREDICTED: rho GTPase-acti (1502 aa)
initn: 3300 init1: 1368 opt: 4021 Z-score: 2710.3 bits: 514.2 E(85289): 3.2e-144
Smith-Waterman score: 4975; 50.9% identity (78.0% similar) in 1515 aa overlap (2-1491:1-1496)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MMMARKQDVRIPTYNISVVGLSGTEKEKGQCGIGKSCLCNRFVRPSADEFHLDHTSVLST
:::.... : :.:.::.::::::::.::.::.::::::::::: .:::.. .:::::::
XP_005 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLST
10 20 30 40 50
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pF1KSD SDFGGRVVNNDHFLYWGEVSRSLEDCVECKMHIVEQTEFIDDQTFQPHRSTALQPYIKRA
::::::::::::::::.. .. :: ::::.:..::::::::::: ::::: ::::::::
XP_005 IDFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AATKLASAEKLMYFCTDQLGLEQDFEQKQMPDGKLLVDGFLLGIDVSRGMNRNFDDQLKF
::.:: :::::::.:::::::::::::::::.::: :::::: ::::.: ::.:::::::
XP_005 AASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VSNLYNQLAKTKKPIVVVLTKCDEGVERYIRDAHTFALSKKNLQVVETSARSNVNVDLAF
:.::. ::.:.:::.... ::::: :..:.:....:: .:::: ::::::: :::.. :
XP_005 VNNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD STLVQLIDKSRGKTKIIPYFEALKQQSQQIATAKDKYEWLVSRIVKNHNENWLSVSRKMQ
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XP_005 TALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLV-QTVRDYHATWKTVSNKLK
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ASPEYQDYVYLEGTQKAKKLFLQHIHRLKHEHIERRRKLYLAALPLAFEALIPNLDEIDH
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XP_005 NHPDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEH
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LSCIKAKKLLETKPEFLKWFVVLEETPWDATSHIDNMENERIPFDLMDTVPAEQLYEAHL
:. .: ::.: . .: :::::.:::: :.:::.....::::::..:. ::..:. :.
XP_005 LNWSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHV
360 370 380 390 400 410
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pF1KSD EKLRNERKRVEMRRAFKENLETSPFITPGKPWEEARSFIMNEDFYQWLEESVYMDIYGKH
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XP_005 QHLISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRH
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QKQIIDKAKEEFQELLLEYSELFYELELDAKPSKEKMGVIQDVLGEEQRFKALQKLQAER
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XP_005 QREIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDR
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KSD DALILKHIHFVYHPTKETCPSCPACVDAKIEHLISSRFIRPSDRNQKNSLSDPNIDRINL
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XP_005 ESLLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNL
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KSD VILGKDGLARELANEIRALCTNDDKYVIDGKMYELSLRPIEGNVRLPVNSFQTPTFQPHG
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XP_005 FILGKDGLAQELANEIRTQST-DDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHG
600 610 620 630 640 650
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pF1KSD CLCLYNSKESLSYVVESIEKSR-ESTLGRRDNHLVHLPLTLILVNKRGDTSGETLHSLIQ
:.:..:: ::::.. : : : : :.. :.:.....::.::::.:.: :. ...: : .
XP_005 CFCVFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQR-DSISKNLPILRH
660 670 680 690 700 710
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pF1KSD QGQQIASKLQCVFLDPASAGIGYGRNINEKQISQVLKGLLDS-KRNLNLVSSTASIKDLA
::::.:.:::: :.: . :: : :..:: ::.:.:.:.:.: :.::..:: . :::.
XP_005 QGQQLANKLQCPFVD-VPAGT-YPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLS
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KSD DVDLRIVMCLMCGDPFSADDILFPVLQSQTCKSSHCGSNNSVLLELPIGLHKKRIELSVL
..::::::: :::::::.: :: : :.:..:.... :.:::..:. :: ...::....:
XP_005 EADLRIVMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITIL
780 790 800 810 820 830
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pF1KSD SYHSSFSIRKSRLVHGYIVFYSAKRKASLAMLRAFLCEVQDIIPIQLVALTDGAVDVLDN
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XP_005 SYHSSIGVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFEN
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KSD DLSREQLTEGEEIAQEIDGRFTSI-PCSQPQHKLEIFHPFFKDVVEKKNIIEATHMYDNA
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pF1KSD DLSREQLTEGEEIAQEIDGRFTSI-PCSQPQHKLEIFHPFFKDVVEKKNIIEATHMYDNA
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900 910 920 930 940 950
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pF1KSD AEACSTTEEVF-NSPRAGSPLCNSNLQDSEEDIE--PSYSLFREDTSLPSLSKDHSKLSM
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XP_016 RESTHQSEDVFLPSPRDCFPY--NNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRL
960 970 980 990 1000 1010
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1020 1030 1040 1050 1060 1070
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD SVSSSPWLPQDGFDPSD-YAEPMDAVVKPRNEEENIYSVPHDSTQGKIITIRN--INKAQ
..: : . .:::: ::::.:.. : .. ..:: :: :: :..: ::: .:..:
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1080 1090 1100 1110 1120 1130
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pF1KSD SNGSGNGSDSEMDTSSLERGRKVSIVSKPVLYRTRC--TRLGRFASYRTSFSVGSDDELG
.. .. :: . . .: : . :: .. ... : :: .:.... . :
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pF1KSD PIRKKEED---QASQGYKG--DNAVIPYETDEDPRRRNILRSLRRNTKKPKPKPR---PS
: .::: . . .:: :: .: . . : .. . .. :: : : . :
XP_016 RHRGSEEDPLLSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPP
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pF1KSD LKEVLKKFPKENHEVFKYVISHLNKVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMRPDFSTMDALT
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XP_016 LKEIVKKFHPVNYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLS
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pF1KSD ATRTYQTIIELFIQQCPFFFYNRPITEPPG-ARPSSPSAVASTVPFLTSTPVTSQPSPPQ
.:. .:...: ::::: ::::: :.: . . : :: .. : :.. : :
XP_016 TTKIHQSVVETFIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVE-----PMV----PLQ
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1480 1490
pF1KSD SPPPTPQSPMQPLLPSQLQAEHTL
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XP_016 LPPPLQPQLIQPQLQTDPLGII
1490 1500
>>NP_001025226 (OMIM: 602680) rho GTPase-activating prot (1502 aa)
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pF1KSD MMMARKQDVRIPTYNISVVGLSGTEKEKGQCGIGKSCLCNRFVRPSADEFHLDHTSVLST
:::.... : :.:.::.::::::::.::.::.::::::::::: .:::.. .:::::::
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pF1KSD SDFGGRVVNNDHFLYWGEVSRSLEDCVECKMHIVEQTEFIDDQTFQPHRSTALQPYIKRA
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pF1KSD AATKLASAEKLMYFCTDQLGLEQDFEQKQMPDGKLLVDGFLLGIDVSRGMNRNFDDQLKF
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pF1KSD VSNLYNQLAKTKKPIVVVLTKCDEGVERYIRDAHTFALSKKNLQVVETSARSNVNVDLAF
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NP_001 TALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLV-QTVRDYHATWKTVSNKLK
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pF1KSD ASPEYQDYVYLEGTQKAKKLFLQHIHRLKHEHIERRRKLYLAALPLAFEALIPNLDEIDH
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pF1KSD EKLRNERKRVEMRRAFKENLETSPFITPGKPWEEARSFIMNEDFYQWLEESVYMDIYGKH
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pF1KSD DALILKHIHFVYHPTKETCPSCPACVDAKIEHLISSRFIRPSDRNQKNSLSDPNIDRINL
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NP_001 ESLLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNL
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NP_001 FILGKDGLAQELANEIRTQST-DDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHG
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NP_001 CFCVFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQR-DSISKNLPILRH
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pF1KSD QGQQIASKLQCVFLDPASAGIGYGRNINEKQISQVLKGLLDS-KRNLNLVSSTASIKDLA
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NP_001 QGQQLANKLQCPFVD-VPAGT-YPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLS
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pF1KSD DVDLRIVMCLMCGDPFSADDILFPVLQSQTCKSSHCGSNNSVLLELPIGLHKKRIELSVL
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NP_001 EADLRIVMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITIL
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pF1KSD SYHSSFSIRKSRLVHGYIVFYSAKRKASLAMLRAFLCEVQDIIPIQLVALTDGAVDVLDN
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NP_001 SYHSSIGVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFEN
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pF1KSD DLSREQLTEGEEIAQEIDGRFTSI-PCSQPQHKLEIFHPFFKDVVEKKNIIEATHMYDNA
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NP_001 EAIKELMTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNT
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pF1KSD AEACSTTEEVF-NSPRAGSPLCNSNLQDSEEDIE--PSYSLFREDTSLPSLSKDHSKLSM
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NP_001 DLEGNEYPIHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRK
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pF1KSD SVSSSPWLPQDGFDPSD-YAEPMDAVVKPRNEEENIYSVPHDSTQGKIITIRN--INKAQ
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NP_001 QTSRVPLAHPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDS-QNRI-KIRNSFVNNTQ
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pF1KSD SNGSGNGSDSEMDTSSLERGRKVSIVSKPVLYRTRC--TRLGRFASYRTSFSVGSDDELG
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NP_001 GDEENGFSDRTSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKG
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pF1KSD PIRKKEED---QASQGYKG--DNAVIPYETDEDPRRRNILRSLRRNTKKPKPKPR---PS
: .::: . . .:: :: .: . . : .. . .. :: : : . :
NP_001 RHRGSEEDPLLSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPP
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pF1KSD ITKATWESNYFGVPLTTVVTPEKPIPIFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQ
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NP_001 -TRRNWESNYFGMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQ
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pF1KSD RQFDQDHNLDLAEKDFTVNTVAGAMKSFFSELPDPLVPYNMQIDLVEAHKINDREQKLHA
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NP_001 KQFDQDHNINLVSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHA
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pF1KSD LKEVLKKFPKENHEVFKYVISHLNKVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMRPDFSTMDALT
:::..::: :..::.:::.:::.::...:.::::..::::::::::::::: . . :.
NP_001 LKEIVKKFHPVNYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLS
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pF1KSD ATRTYQTIIELFIQQCPFFFYNRPITEPPG-ARPSSPSAVASTVPFLTSTPVTSQPSPPQ
.:. .:...: ::::: ::::: :.: . . : :: .. : :.. : :
NP_001 TTKIHQSVVETFIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVE-----PMV----PLQ
1430 1440 1450 1460 1470 1480
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pF1KSD SPPPTPQSPMQPLLPSQLQAEHTL
::: . .:: : .
NP_001 LPPPLQPQLIQPQLQTDPLGII
1490 1500
>>XP_011522776 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase-acti (581 aa)
initn: 450 init1: 266 opt: 486 Z-score: 340.3 bits: 74.3 E(85289): 3.2e-12
Smith-Waterman score: 488; 26.9% identity (62.2% similar) in 368 aa overlap (1076-1436:227-578)
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pF1KSD PVHFEITKGDLSYLDQGHRDGQRKSVSSSPWLPQDGFDPSDYAEPMDAVVKPRNEEENIY
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XP_011 SKTSAAGGLRQPSKFSTPEYTVELRGATLSWAPKDKSSRKN-------VLELRSRDGSEY
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XP_011 LIQHDSE--AIISTWHKAIAQGIQELGSMQLREVNVLRLTGGGPAAG-SRPRLSEAMGIQ
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XP_011 SAELPPEESESSRVDFGSSERLGSWQEKEEDARPNAAAPALGPVGLESDLSKVRHKLRKF
310 320 330 340 350 360
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pF1KSD LRRNTKKPKPKPRPSITKATWESNYFGVPLTTVVTPEKP-IPIFIERCIEYIEATGLSTE
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XP_011 LQR-----RPTLQSLREKGYIKDQVFGCALAALCERERSRVPRFVQQCIRAVEARGLDID
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pF1KSD DLVEAHKINDREQKLHALKEVLKKFPKENHEVFKYVISHLNKVSHNNKVNLMTSENLSIC
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XP_011 QFIAAIKLQDQARRSRCVRDLVRSLPAPNHDTLRMLFQHLCRVIEHGEQNRMSVQSVAIV
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XP_011 FGPTLLRPEVEET-SMPMTMVFQNQVVELILQQCADIFPPH
550 560 570 580
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pF1KSD VPFLTSTPVTSQPSPPQSPPPTPQSPMQPLLPSQLQAEHTL
1499 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 07:05:27 2016 done: Thu Nov 3 07:05:29 2016
Total Scan time: 12.380 Total Display time: 0.840
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]