FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1750, 417 aa
1>>>pF1KSDA1750 417 - 417 aa - 417 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2945+/-0.000756; mu= 14.5198+/- 0.046
mean_var=123.8200+/-24.855, 0's: 0 Z-trim(113.1): 29 B-trim: 217 in 2/50
Lambda= 0.115260
statistics sampled from 13725 (13750) to 13725 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.757), E-opt: 0.2 (0.422), width: 16
Scan time: 3.460
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34927.1 TSPYL5 gene_id:85453|Hs108|chr8 ( 417) 2807 477.5 1e-134
CCDS5106.1 TSPYL4 gene_id:23270|Hs108|chr6 ( 414) 784 141.1 1.9e-33
CCDS34518.1 TSPYL1 gene_id:7259|Hs108|chr6 ( 437) 784 141.1 1.9e-33
CCDS42682.1 TSPYL6 gene_id:388951|Hs108|chr2 ( 410) 707 128.3 1.3e-29
CCDS14350.1 TSPYL2 gene_id:64061|Hs108|chrX ( 693) 672 122.7 1.1e-27
CCDS65365.1 TSPY10 gene_id:100289087|Hs108|chrY ( 308) 553 102.6 5.5e-22
CCDS48204.1 TSPY3 gene_id:728137|Hs108|chrY ( 308) 553 102.6 5.5e-22
CCDS48202.1 TSPY4 gene_id:728395|Hs108|chrY ( 314) 553 102.6 5.6e-22
CCDS35465.1 TSPY2 gene_id:64591|Hs108|chrY ( 308) 552 102.4 6.1e-22
CCDS59533.1 TSPY8 gene_id:728403|Hs108|chrY ( 308) 539 100.3 2.7e-21
CCDS48205.1 TSPY1 gene_id:7258|Hs108|chrY ( 308) 538 100.1 3.1e-21
CCDS83519.1 TSPY10 gene_id:100289087|Hs108|chrY ( 294) 485 91.3 1.3e-18
CCDS76071.1 TSPY1 gene_id:7258|Hs108|chrY ( 294) 470 88.8 7.6e-18
CCDS48037.1 SET gene_id:6418|Hs108|chr9 ( 290) 418 80.1 3e-15
CCDS59150.1 SET gene_id:6418|Hs108|chr9 ( 266) 397 76.6 3.2e-14
CCDS59149.1 SET gene_id:6418|Hs108|chr9 ( 268) 394 76.1 4.5e-14
CCDS6907.1 SET gene_id:6418|Hs108|chr9 ( 277) 394 76.1 4.6e-14
CCDS72821.1 SETSIP gene_id:646817|Hs108|chr1 ( 302) 390 75.5 7.8e-14
>>CCDS34927.1 TSPYL5 gene_id:85453|Hs108|chr8 (417 aa)
initn: 2807 init1: 2807 opt: 2807 Z-score: 2532.1 bits: 477.5 E(32554): 1e-134
Smith-Waterman score: 2807; 100.0% identity (100.0% similar) in 417 aa overlap (1-417:1-417)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSGRSRGRKSSRAKNRGKGRAKARVRPAPDDAPRDPDPSQYQSLGEDTQAAQVQAGAGWG
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CCDS34 MSGRSRGRKSSRAKNRGKGRAKARVRPAPDDAPRDPDPSQYQSLGEDTQAAQVQAGAGWG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GLEAAASAQLLRLGEEAACRLPLDCGLALRARAAGDHGQAAARPGPGKAASLSERLAADT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GLEAAASAQLLRLGEEAACRLPLDCGLALRARAAGDHGQAAARPGPGKAASLSERLAADT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VFVGTAGTVGRPKNAPRVGNRRGPAGKKAPETCSTAGRGPQVIAGGRQKKGAAGENTSVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VFVGTAGTVGRPKNAPRVGNRRGPAGKKAPETCSTAGRGPQVIAGGRQKKGAAGENTSVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD AGEEKKEERDAGSGPPATEGSMDTLENVQLKLENMNAQADRAYLRLSRKFGQLRLQHLER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AGEEKKEERDAGSGPPATEGSMDTLENVQLKLENMNAQADRAYLRLSRKFGQLRLQHLER
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RNHLIQNIPGFWGQAFQNHPQLASFLNSQEKEVLSYLNSLEVEELGLARLGYKIKFYFDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RNHLIQNIPGFWGQAFQNHPQLASFLNSQEKEVLSYLNSLEVEELGLARLGYKIKFYFDR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD NPYFQNKVLIKEYGCGPSGQVVSRSTPIQWLPGHDLQSLSQGNPENNRSFFGWFSNHSSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NPYFQNKVLIKEYGCGPSGQVVSRSTPIQWLPGHDLQSLSQGNPENNRSFFGWFSNHSSI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KSD ESDKIVEIINEELWPNPLQFYLLSEGARVEKGKEKEGRQGPGKQPMETTQPGVSQSN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ESDKIVEIINEELWPNPLQFYLLSEGARVEKGKEKEGRQGPGKQPMETTQPGVSQSN
370 380 390 400 410
>>CCDS5106.1 TSPYL4 gene_id:23270|Hs108|chr6 (414 aa)
initn: 1034 init1: 523 opt: 784 Z-score: 714.1 bits: 141.1 E(32554): 1.9e-33
Smith-Waterman score: 1008; 43.3% identity (67.2% similar) in 439 aa overlap (1-416:1-413)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSGRSRGRKSSRAKNRGKGRAKARVRPAPDDAPRDPDPSQYQSLGEDTQAAQVQAGAGWG
::: . : : :.. : . ::: : ::: .: :.: :.:.:.::.:..: :
CCDS51 MSGLDGGNKLPLAQTGGLA--------APDHASGDPDRDQCQGLREETEATQVMANTGGG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GLEAAASAQLLRLGEEAACRLPLDCGLALRARAAGDHGQAAARPGPGKAASLSERLAADT
.::..: : .: . :.::: :::. .::..: ::.. : : .. : : .
CCDS51 SLETVA--------EGGASQDPVDCGPALRVPVAGSRGGAATKAGQEDAPPSTKGLEAAS
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KSD VFVGTAGTVGRPKNAPRVGNRRGPAGKKAPETCSTAGRGPQVIAGGRQKK--------GA
.. .. . ::. ..:. :::::.:: :.:...: : :.: : . :. .:
CCDS51 ---AAEAADSSQKNGCQLGEPRGPAGQKALEACGAGGLGSQMIPGKKAKEVTTKKRAISA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210
pF1KSD A--GENTSVSAGEEKK----EERDAG-----SGP--PATEGSMDTLENVQLKLENMNAQA
: :. . .: :::: :.. :: . : : .. ::.:: .. .: :.::::
CCDS51 AVEKEGEAGAAMEEKKVVQKEKKVAGGVKEETRPRAPKINNCMDSLEAIDQELSNVNAQA
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KSD DRAYLRLSRKFGQLRLQHLERRNHLIQNIPGFWGQAFQNHPQLASFLNSQEKEVLSYLNS
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CCDS51 DRAFLQLERKFGRMRRLHMQRRSFIIQNIPGFWVTAFRNHPQLSPMISGQDEDMLRYMIN
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LEVEELGLARLGYKIKFYFDRNPYFQNKVLIKEYGCGPSGQVVSRSTPIQWLPGHDLQSL
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CCDS51 LEVEELKHPRAGCKFKFIFQGNPYFRNEGLVKEYERRSSGRVVSLSTPIRWHRGQDPQAH
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KSD SQGNPENNR--SFFGWFSNHSSIESDKIVEIINEELWPNPLQFYLLSEGARVEKGKEKEG
. : :.: :::.:::.:: .: :.:.:::. ::::::::.::..:: : .:
CCDS51 IHRNREGNTIPSFFNWFSDHSLLEFDRIAEIIKGELWPNPLQYYLMGEGPR-------RG
350 360 370 380 390
400 410
pF1KSD RQGPGKQPMETTQPGVSQSN
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CCDS51 IRGPPRQPVESARSFRFQSG
400 410
>>CCDS34518.1 TSPYL1 gene_id:7259|Hs108|chr6 (437 aa)
initn: 835 init1: 742 opt: 784 Z-score: 713.8 bits: 141.1 E(32554): 1.9e-33
Smith-Waterman score: 852; 39.8% identity (62.8% similar) in 425 aa overlap (30-416:22-436)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSGRSRGRKSSRAKNRGKGRAKARVRPAPDDAPRDPDPSQYQSLGEDTQAAQVQAGAGWG
:..: : : :: : ....:.::.: : :
CCDS34 MSGLDGVKRTTPLQTHSIIISDQVPSDQDAHQYLRLRDQSEATQVMAEPGEG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD GLEAAASAQLLRLGEEAACRLPLDC---GLALRARAAGDHGQAAARPGPGKAASLSERLA
: :..: .::.. .: : : . . :..: .:..: . : .. .: ::
CCDS34 GSETVALPPP-PPSEEGG--VPQDAAGRGGTPQIRVVGGRGHVAIKAGQEEGQPPAEGLA
60 70 80 90 100
120 130 140 150
pF1KSD ADTVFVGT-----AGTVGRPKNAPRVGNRRGP----AGKKAPET------CSTAG-----
: .: ... :. : : : .:. :: .: :.:..
CCDS34 AASVVMAADRSLKKGVQGGEKALEICGAQRSASELTAGAEAEAEEVKTGKCATVSAAVAE
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200
pF1KSD -RGPQVIAGGRQKKGAA------------GENTSVSAGEEKKEERDAGSGP-PATEG-SM
.. .:. : .: . ::. :. .. .:: :: : :. :
CCDS34 RESAEVVKEGLAEKEVMEEQMEVEEQPPEGEEIEVAEEDRLEEEAREEEGPWPLHEALRM
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KSD DTLENVQLKLENMNAQADRAYLRLSRKFGQLRLQHLERRNHLIQNIPGFWGQAFQNHPQL
: :: .::.:...:::::::. .: .:::..: ..:::::..:::::::: ::.:::::
CCDS34 DPLEAIQLELDTVNAQADRAFQQLEHKFGRMRRHYLERRNYIIQNIPGFWMTAFRNHPQL
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KSD ASFLNSQEKEVLSYLNSLEVEELGLARLGYKIKFYFDRNPYFQNKVLIKEYGCGPSGQVV
.... .:. :.: :...:::.:: : : :.::.: :::::.::...::: ::.::
CCDS34 SAMIRGQDAEMLRYITNLEVKELRHPRTGCKFKFFFRRNPYFRNKLIVKEYEVRSSGRVV
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KSD SRSTPIQWLPGHDLQSLSQGNPENNRSFFGWFSNHSSIESDKIVEIINEELWPNPLQFYL
: :::: : ::. ::. . : . ::: :::.:: :::::.:::.:.:::::::.::
CCDS34 SLSTPIIWRRGHEPQSFIRRNQDLICSFFTWFSDHSLPESDKIAEIIKEDLWPNPLQYYL
350 360 370 380 390 400
390 400 410
pF1KSD LSEGARVEKGKEKEGRQGPGKQPMETTQPGVSQSN
: ::.: ..:. : ..:.: .: ::
CCDS34 LREGVR-------RARRRPLREPVEIPRPFGFQSG
410 420 430
>>CCDS42682.1 TSPYL6 gene_id:388951|Hs108|chr2 (410 aa)
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Smith-Waterman score: 776; 40.0% identity (63.5% similar) in 408 aa overlap (27-411:10-404)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSGRSRGRKSSRAKNRGKGRAKARVRPAPDDAPRDPDPSQYQSLGEDTQAAQVQAGAGWG
:: : . :: : : : ..:..:.: :
CCDS42 MSLPESPHSPATLDYALE-DPHQGQRSREKSKATEVMADMFDG
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KSD GLEAAASAQLLRLGEEA-ACRLPLDCGLALRARAAGDHGQAAARPGPGKAASLSERLAAD
:: . :: ::. : . : : : ... . . ....: . : . .: : :
CCDS42 RLEPIVFPPP-RLPEEGVAPQDPADGGHTFHILVDAGRSHGAIKAGQEVTPPPAEGLEAA
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD TVFVGTAGTVGRPKNAPRVGNRRGPAGKKAPETCSTAGRGP-QVIAGGRQKKGAAGENTS
.. . : :.. ::. . .: .:.:: :::. :::. .::: :. . : .
CCDS42 SASLTTDGSL---KNGFPGEETHGLGGEKALETCG-AGRSESEVIAEGKAEDVKPEECAM
110 120 130 140 150
180 190 200 210
pF1KSD VSA-------GEEKK--EE--------RDAGSGP---PATEG-SMDTLENVQLKLENMNA
:: ::: :: :.:: :: : . : .. ::..::.:...::
CCDS42 FSAPVDEKPGGEEMDVAEENRAIDEVNREAGPGPGPGPLNVGLHLNPLESIQLELDSVNA
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KSD QADRAYLRLSRKFGQLRLQHLERRNHLIQNIPGFWGQAFQNHPQLASFLNSQEKEVLSYL
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CCDS42 EADRALLQVERRFGQIHEYYLEQRNDIIRNIPGFWVTAFRHHPQLSAMIRGQDAEMLSYL
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KSD NSLEVEELGLARLGYKIKFYFDRNPYFQNKVLIKEYGCGPSGQVVSRSTPIQWLPGHDLQ
..:::.:: : : :.::.:.:::::.::...: : ::::: :: :.: :: :
CCDS42 TNLEVKELRHPRTGCKFKFFFQRNPYFRNKLIVKVYEVRSFGQVVSFSTLIMWRRGHGPQ
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KSD SLSQGNPENNRSFFGWFSNHSSIESDKIVEIINEELWPNPLQFYLLSEGARVEKGKEKEG
:. . : . ::: :::.:: :::.:..::.:.:: ::::.:::.: :. ..
CCDS42 SFIHRNRHVICSFFTWFSDHSLPESDRIAQIIKEDLWSNPLQYYLLGEDAH-------RA
340 350 360 370 380 390
400 410
pF1KSD RQGPGKQPMETTQPGVSQSN
:. ..:.: .:
CCDS42 RRRLVREPVEIPRPFGFQCG
400 410
>>CCDS14350.1 TSPYL2 gene_id:64061|Hs108|chrX (693 aa)
initn: 735 init1: 659 opt: 672 Z-score: 610.6 bits: 122.7 E(32554): 1.1e-27
Smith-Waterman score: 733; 34.5% identity (62.9% similar) in 420 aa overlap (13-403:10-418)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSGRSRGRKSSRAKNRGKGRAKARVR-PAPDDAPRD------PDPSQYQSLGEDTQAAQV
::.: . ... : : : : : :.: : :.:.::::
CCDS14 MDRPDEGPPAKTRRLSSSESPQRDPPPPPPPPPLLRLPLPPPQQRPRLQEETEAAQV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD QA---GAGWGGLEAAASAQLLRLGEEAACRLPLDCGLALRARAAGDHGQAAARPGPGKAA
: :.: : : . ::.. : . : :. : ... . : :.:
CCDS14 LADMRGVGLG--PALPPPPPYVILEEGGIRAYFTLG----AECPG--WDSTIESGYGEAP
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD SLSERLAADTVFVGTAGTVGRPKNAPRVGNRRGPAGKKAPETCSTAGRGPQVIAGGRQKK
.: : : . ...:.. . .: . . .:. : ::::..: .:: .. ..:.
CCDS14 PPTESLEALPTPEASGGSL---EIDFQVVQSSSFGGEGALETCSAVGWAPQRLVDPKSKE
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210
pF1KSD GAA--------GENTSVSAGEEKKEERDAGS----------GPPATEGSMDTLENVQLKL
: : :. ........: . . :. ...::..:: :
CCDS14 EAIIIVEDEDEDERESMRSSRRRRRRRRRKQRKVKRESRERNAERMESILQALEDIQLDL
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KSD ENMNAQADRAYLRLSRKFGQLRLQHLERRNHLIQNIPGFWGQAFQNHPQLASFLNSQEKE
: .: .: .:.:::.::: :.: ::::. .::.::::: .:: :::... ..: ....
CCDS14 EAVNIKAGKAFLRLKRKFIQMRRPFLERRDLIIQHIPGFWVKAFLNHPRISILINRRDED
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KSD VLSYLNSLEVEELGLARLGYKIKFYFDRNPYFQNKVLIKEYGCGPSGQVVSRSTPIQWLP
.. ::..:.:..: .:::.:.::. :::: : :..::. . ::..::.::::.:
CCDS14 IFRYLTNLQVQDLRHISMGYKMKLYFQTNPYFTNMVIVKEFQRNRSGRLVSHSTPIRWHR
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KSD GHDLQSLSQGNPENNRSFFGWFSNHSSIESDKIVEIINEELWPNPLQFYLLSEGARVEKG
:.. :. .:: . ..:::.:::::: :.:.:.:::...:: :::..:: .:.:...
CCDS14 GQEPQARRHGNQDASHSFFSWFSNHSLPEADRIAEIIKNDLWVNPLRYYLRERGSRIKRK
350 360 370 380 390 400
400 410
pF1KSD K-EKEGRQGPGKQPMETTQPGVSQSN
: : . :. :.
CCDS14 KQEMKKRKTRGRCEVVIMEDAPDYYAVEDIFSEISDIDETIHDIKISDFMETTDYFETTD
410 420 430 440 450 460
>>CCDS65365.1 TSPY10 gene_id:100289087|Hs108|chrY (308 aa)
initn: 571 init1: 538 opt: 553 Z-score: 508.2 bits: 102.6 E(32554): 5.5e-22
Smith-Waterman score: 553; 39.2% identity (70.0% similar) in 227 aa overlap (173-397:78-302)
150 160 170 180 190 200
pF1KSD GPAGKKAPETCSTAGRGPQVIAGGRQKKGAAGENTSVSAGEEKKEERDA--GSGPPATEG
: :. : :: .. ..: : :: . :.
CCDS65 GAAGVESEQAALGEEAVLLLDDIMAEVEVVAEEEGLVERREEAQRAQQAVPGPGPMTPES
50 60 70 80 90 100
210 220 230 240 250 260
pF1KSD SMDTLENVQLKLENMNAQADRAYLRLSRKFGQLRLQHLERRNHLIQNIPGFWGQAFQNHP
... : ::..:: .:::: .:. : .:. . : ::.::. .::..::::.... :::
CCDS65 ALEELLAVQVELEPVNAQARKAFSRQREKMERRRKPHLDRRGAVIQSVPGFWANVIANHP
110 120 130 140 150 160
270 280 290 300 310 320
pF1KSD QLASFLNSQEKEVLSYLNSLEVEELGLARLGYKIKFYFDRNPYFQNKVLIKEYGCGPSGQ
:............:::. :::::: :: ..: ::::::::. ::: . .
CCDS65 QMSALITDEDEDMLSYMVSLEVEEEKHPVHLCKIMLFFRSNPYFQNKVITKEYLVNITEY
170 180 190 200 210 220
330 340 350 360 370 380
pF1KSD VVSRSTPIQWLPGHDLQSLSQGNPENNRSFFGWFSNHSSIESDKIVEIINEELWPNPLQF
.:.::::.: : ..... . . ... .::.:::.:. :.::.::. ..:: ::::.
CCDS65 RASHSTPIEWYPDYEVEAYRRRHHNSSLNFFNWFSDHNFAGSNKIAEILCKDLWRNPLQY
230 240 250 260 270 280
390 400 410
pF1KSD YLLSEGARVEKGKEKEGRQGPGKQPMETTQPGVSQSN
: . :.: : :
CCDS65 YKRMKPP--EEGTETSGDSQLLS
290 300
>>CCDS48204.1 TSPY3 gene_id:728137|Hs108|chrY (308 aa)
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]