Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1754
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1754, 547 aa
1>>>pF1KSDA1754 547 - 547 aa - 547 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1909+/-0.000814; mu= 14.3896+/- 0.049
mean_var=88.8827+/-17.201, 0's: 0 Z-trim(109.5): 13 B-trim: 11 in 1/51
Lambda= 0.136040
statistics sampled from 10921 (10928) to 10921 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.708), E-opt: 0.2 (0.336), width: 16
Scan time: 3.680
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7557.1 ITPRIP gene_id:85450|Hs108|chr10 ( 547) 3736 743.4 1.6e-214
CCDS54378.1 ITPRIPL1 gene_id:150771|Hs108|chr2 ( 547) 629 133.6 6.1e-31
CCDS46360.1 ITPRIPL1 gene_id:150771|Hs108|chr2 ( 555) 629 133.6 6.1e-31
CCDS33250.1 ITPRIPL1 gene_id:150771|Hs108|chr2 ( 563) 629 133.6 6.2e-31
>>CCDS7557.1 ITPRIP gene_id:85450|Hs108|chr10 (547 aa)
initn: 3736 init1: 3736 opt: 3736 Z-score: 3964.6 bits: 743.4 E(32554): 1.6e-214
Smith-Waterman score: 3736; 100.0% identity (100.0% similar) in 547 aa overlap (1-547:1-547)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAMGLFRVCLVVVTAIINHPLLFPRENATVPENEEEIIRKMQAHQEKLQLEQLRLEEEVA
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CCDS75 MAMGLFRVCLVVVTAIINHPLLFPRENATVPENEEEIIRKMQAHQEKLQLEQLRLEEEVA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RLAAEKEALEQVAEEGRQQNETRVAWDLWSTLCMILFLMIEVWRQDHQEGPSPECLGGEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RLAAEKEALEQVAEEGRQQNETRVAWDLWSTLCMILFLMIEVWRQDHQEGPSPECLGGEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DELPGLGGAPLQGLTLPNKATLGHFYERCIRGATADAARTREFLEGFVDDLLEALRSLCN
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CCDS75 DELPGLGGAPLQGLTLPNKATLGHFYERCIRGATADAARTREFLEGFVDDLLEALRSLCN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RDTDMEVEDFIGVDSMYENWQVDRPLLCHLFVPFTPPEPYRFHPELWCSGRSVPLDRQGY
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CCDS75 RDTDMEVEDFIGVDSMYENWQVDRPLLCHLFVPFTPPEPYRFHPELWCSGRSVPLDRQGY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GQIKVVRADGDTLSCICGKTKLGEDMLCLLHGRNSMAPPCGDMENLLCATDSLYLDTMQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GQIKVVRADGDTLSCICGKTKLGEDMLCLLHGRNSMAPPCGDMENLLCATDSLYLDTMQV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD MKWFQTALTRAWKGIAHKYEFDLAFGQLDSPGSLKIKFRSGKFMPFNLIPVIQCDDSDLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MKWFQTALTRAWKGIAHKYEFDLAFGQLDSPGSLKIKFRSGKFMPFNLIPVIQCDDSDLY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD FVSHLPREPSEGTPASSTDWLLSFAVYERHFLRTTLKALPEGACHLSCLQIASFLLSKQS
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CCDS75 FVSHLPREPSEGTPASSTDWLLSFAVYERHFLRTTLKALPEGACHLSCLQIASFLLSKQS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RLTGPSGLSSYHLKTALLHLLLLRQAADWKAGQLDARLHELLCFLEKSLLQKKLHHFFIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RLTGPSGLSSYHLKTALLHLLLLRQAADWKAGQLDARLHELLCFLEKSLLQKKLHHFFIG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NRKVPEAMGLPEAVLRAEPLNLFRPFVLQRSLYRKTLDSFYEMLKNAPALISEYSLHVPS
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CCDS75 NRKVPEAMGLPEAVLRAEPLNLFRPFVLQRSLYRKTLDSFYEMLKNAPALISEYSLHVPS
490 500 510 520 530 540
pF1KSD DQPTPKS
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CCDS75 DQPTPKS
>>CCDS54378.1 ITPRIPL1 gene_id:150771|Hs108|chr2 (547 aa)
initn: 797 init1: 255 opt: 629 Z-score: 669.0 bits: 133.6 E(32554): 6.1e-31
Smith-Waterman score: 840; 30.5% identity (63.3% similar) in 561 aa overlap (3-530:1-538)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAMGLFRVCLVVVTAIINHPLLFP-RENATVPENEEEIIRKMQAHQEKLQLEQLRLEEEV
:... . ...: ...:::. : . . ... ..:. :...: ....::.
CCDS54 MAVISLLFLAVMYVVHHPLMVSDRMDLDTLARSRQLEKRMS---EEMRLLEMEFEER-
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KSD ARLAAEKEALEQ--VAEEGRQQ----------------NETRVAW---DLWSTLCMILFL
: : ... :. ... . .: .: ..: .::.: . :::
CCDS54 KRAAEQRQKAENFWTGDTSSDQLVLGKKDMGWPFQADGQEGPLGWMLGNLWNTGLFCLFL
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KSD MIEVWRQDHQEGPSPECLGGEEDELPGLGGAPLQG---LT-LPNKATLGHFYERCIRGAT
..:. ::. :. :. . . ::.: . .:. . :: .:.. .: ::.. ...:
CCDS54 VFELLRQNMQHEPAFDSSSEEEEEEVRV--VPVTSYNWLTDFPSQEALDSFYKHYVQNAI
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KSD ADAARTREFLEGFVDDLLEALRSLCNRDTDMEVEDFIGVDSMYENW-QVDRPLLCHLFVP
: : ::.:.:::::.:: : : ... ..:: .:. . .:.: . . ..::
CCDS54 RDLPCTCEFVESFVDDLIEACRVLSRQEAHPQLEDCLGIGAAFEKWGTLHETQKFDILVP
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KSD FTPPEPYRFHPELWCSGRSVPLDRQGYGQIKVVRADGDTLSCICGKTKLGEDMLCLLHG-
..::. : :. :. : :. : . .:... :.: . :: :.:::.:
CCDS54 IVPPQGTMFVLEM----RDPALGRRC-GCV-LVESE-----CVCKREKLLGDVLCLVHHH
240 250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KSD RNSMA--PPCGD-MENLLCATDSLYLDTMQVMKWFQTALTRAWKGIAHKYEFDLAFGQLD
:. : :.. .. ::. ...::. ....::.. . :: .::::.: :..
CCDS54 RDPSAVLGKCSSSIKAALCT--GFHLDVCKTVQWFRNMMGNAWALVAHKYDFKLSLPPST
290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KSD SPGSLKIKFRSGKFMPFNLIPVIQCDDSDLYFVSHLPREPSEGTPASSTDWLLSFAVYER
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CCDS54 TSCKLRLDYRSGRFLSIHLVLGVQREDTLVYLVSQAPDQEQ----LTSVDWPESFVACEH
340 350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KSD HFLRTTLKALPEGACHLSCLQIASFLLSKQSRLTGPSG--LSSYHLKTALLHLLLLRQAA
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CCDS54 LFLKLVGRFAPENTCHLKCLQIILSLRQHQSLPHGASRPILTSYHFKTALMHLLLRLPLT
400 410 420 430 440 450
450 460 470 480 490 500
pF1KSD DWKAGQLDARLHELLCFLEKSLLQKKLHHFFIGNRKVPEAMGLPEAVLRAEPLNLFRPFV
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CCDS54 DWAHNMLSQRLQDILWFLGRGLQQRSLHHFLIGNNFLPLTIPIPKTFRNAEPVNLFQHLV
460 470 480 490 500 510
510 520 530 540
pF1KSD LQRSLYRKTLDSFYEMLKNAPALISEYSLHVPSDQPTPKS
:. . . .... : ..: .. .:
CCDS54 LNPKAHSQAVEEFQNLLTQVKTLPHAPLAAAP
520 530 540
>>CCDS46360.1 ITPRIPL1 gene_id:150771|Hs108|chr2 (555 aa)
initn: 797 init1: 255 opt: 629 Z-score: 668.9 bits: 133.6 E(32554): 6.1e-31
Smith-Waterman score: 841; 30.1% identity (63.5% similar) in 562 aa overlap (2-530:8-546)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAMGLFRVCLVVVTAIINHPLLFP-RENATVPENEEEIIRKMQAHQEKLQLEQL
.:... . ...: ...:::. : . . ... ..:. :...: ..
CCDS46 MNVDAEASMAVISLLFLAVMYVVHHPLMVSDRMDLDTLARSRQLEKRMS---EEMRLLEM
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KSD RLEEEVARLAAEKEALEQ--VAEEGRQQ----------------NETRVAW---DLWSTL
..::. : : ... :. ... . .: .: ..: .::.:
CCDS46 EFEER-KRAAEQRQKAENFWTGDTSSDQLVLGKKDMGWPFQADGQEGPLGWMLGNLWNTG
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KSD CMILFLMIEVWRQDHQEGPSPECLGGEEDELPGLGGAPLQG---LT-LPNKATLGHFYER
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CCDS46 LFCLFLVFELLRQNMQHEPAFDSSSEEEEEEVRV--VPVTSYNWLTDFPSQEALDSFYKH
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KSD CIRGATADAARTREFLEGFVDDLLEALRSLCNRDTDMEVEDFIGVDSMYENW-QVDRPLL
...: : : ::.:.:::::.:: : : ... ..:: .:. . .:.: . .
CCDS46 YVQNAIRDLPCTCEFVESFVDDLIEACRVLSRQEAHPQLEDCLGIGAAFEKWGTLHETQK
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KSD CHLFVPFTPPEPYRFHPELWCSGRSVPLDRQGYGQIKVVRADGDTLSCICGKTKLGEDML
..::..::. : :. :. : :. : . .:... :.: . :: :.:
CCDS46 FDILVPIVPPQGTMFVLEM----RDPALGRRC-GCV-LVESE-----CVCKREKLLGDVL
240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KSD CLLHGR---NSMAPPCGD-MENLLCATDSLYLDTMQVMKWFQTALTRAWKGIAHKYEFDL
::.: . ... :.. .. ::. ...::. ....::.. . :: .::::.: :
CCDS46 CLVHHHRDPSAVLGKCSSSIKAALCT--GFHLDVCKTVQWFRNMMGNAWALVAHKYDFKL
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KSD AFGQLDSPGSLKIKFRSGKFMPFNLIPVIQCDDSDLYFVSHLPREPSEGTPASSTDWLLS
.. . .:.. .:::.:. ..:. .: .:. .:.::. : . . .:.:: :
CCDS46 SLPPSTTSCKLRLDYRSGRFLSIHLVLGVQREDTLVYLVSQAPDQEQ----LTSVDWPES
350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KSD FAVYERHFLRTTLKALPEGACHLSCLQIASFLLSKQSRLTGPSG--LSSYHLKTALLHLL
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CCDS46 FVACEHLFLKLVGRFAPENTCHLKCLQIILSLRQHQSLPHGASRPILTSYHFKTALMHLL
400 410 420 430 440 450
450 460 470 480 490 500
pF1KSD LLRQAADWKAGQLDARLHELLCFLEKSLLQKKLHHFFIGNRKVPEAMGLPEAVLRAEPLN
: .:: ..:. ::...: :: ..: :..::::.::: .: .. .:.. :::.:
CCDS46 LRLPLTDWAHNMLSQRLQDILWFLGRGLQQRSLHHFLIGNNFLPLTIPIPKTFRNAEPVN
460 470 480 490 500 510
510 520 530 540
pF1KSD LFRPFVLQRSLYRKTLDSFYEMLKNAPALISEYSLHVPSDQPTPKS
::. .::. . . .... : ..: .. .:
CCDS46 LFQHLVLNPKAHSQAVEEFQNLLTQVKTLPHAPLAAAP
520 530 540 550
>>CCDS33250.1 ITPRIPL1 gene_id:150771|Hs108|chr2 (563 aa)
initn: 797 init1: 255 opt: 629 Z-score: 668.8 bits: 133.6 E(32554): 6.2e-31
Smith-Waterman score: 841; 30.1% identity (63.5% similar) in 562 aa overlap (2-530:16-554)
10 20 30 40
pF1KSD MAMGLFRVCLVVVTAIINHPLLFP-RENATVPENEEEIIRKMQAHQ
.:... . ...: ...:::. : . . ... ..:.
CCDS33 MTTDSYSPTSPDAEASMAVISLLFLAVMYVVHHPLMVSDRMDLDTLARSRQLEKRMS---
10 20 30 40 50
50 60 70 80
pF1KSD EKLQLEQLRLEEEVARLAAEKEALEQ--VAEEGRQQ----------------NETRVAW-
:...: ....::. : : ... :. ... . .: .: ..:
CCDS33 EEMRLLEMEFEER-KRAAEQRQKAENFWTGDTSSDQLVLGKKDMGWPFQADGQEGPLGWM
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KSD --DLWSTLCMILFLMIEVWRQDHQEGPSPECLGGEEDELPGLGGAPLQG---LT-LPNKA
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CCDS33 LGNLWNTGLFCLFLVFELLRQNMQHEPAFDSSSEEEEEEVRV--VPVTSYNWLTDFPSQE
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KSD TLGHFYERCIRGATADAARTREFLEGFVDDLLEALRSLCNRDTDMEVEDFIGVDSMYENW
.: ::.. ...: : : ::.:.:::::.:: : : ... ..:: .:. . .:.:
CCDS33 ALDSFYKHYVQNAIRDLPCTCEFVESFVDDLIEACRVLSRQEAHPQLEDCLGIGAAFEKW
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250
pF1KSD -QVDRPLLCHLFVPFTPPEPYRFHPELWCSGRSVPLDRQGYGQIKVVRADGDTLSCICGK
. . ..::..::. : :. :. : :. : . .:... :.: .
CCDS33 GTLHETQKFDILVPIVPPQGTMFVLEM----RDPALGRRC-GCV-LVESE-----CVCKR
240 250 260 270 280
260 270 280 290 300 310
pF1KSD TKLGEDMLCLLHGR---NSMAPPCGD-MENLLCATDSLYLDTMQVMKWFQTALTRAWKGI
:: :.:::.: . ... :.. .. ::. ...::. ....::.. . :: .
CCDS33 EKLLGDVLCLVHHHRDPSAVLGKCSSSIKAALCT--GFHLDVCKTVQWFRNMMGNAWALV
290 300 310 320 330 340
320 330 340 350 360 370
pF1KSD AHKYEFDLAFGQLDSPGSLKIKFRSGKFMPFNLIPVIQCDDSDLYFVSHLPREPSEGTPA
::::.: :.. . .:.. .:::.:. ..:. .: .:. .:.::. : . .
CCDS33 AHKYDFKLSLPPSTTSCKLRLDYRSGRFLSIHLVLGVQREDTLVYLVSQAPDQEQ----L
350 360 370 380 390
380 390 400 410 420 430
pF1KSD SSTDWLLSFAVYERHFLRTTLKALPEGACHLSCLQIASFLLSKQSRLTGPSG--LSSYHL
.:.:: ::.. :. ::. . . ::..:::.:::: : ..:: : : :.:::.
CCDS33 TSVDWPESFVACEHLFLKLVGRFAPENTCHLKCLQIILSLRQHQSLPHGASRPILTSYHF
400 410 420 430 440 450
440 450 460 470 480 490
pF1KSD KTALLHLLLLRQAADWKAGQLDARLHELLCFLEKSLLQKKLHHFFIGNRKVPEAMGLPEA
::::.:::: .:: ..:. ::...: :: ..: :..::::.::: .: .. .:..
CCDS33 KTALMHLLLRLPLTDWAHNMLSQRLQDILWFLGRGLQQRSLHHFLIGNNFLPLTIPIPKT
460 470 480 490 500 510
500 510 520 530 540
pF1KSD VLRAEPLNLFRPFVLQRSLYRKTLDSFYEMLKNAPALISEYSLHVPSDQPTPKS
:::.:::. .::. . . .... : ..: .. .:
CCDS33 FRNAEPVNLFQHLVLNPKAHSQAVEEFQNLLTQVKTLPHAPLAAAP
520 530 540 550 560
547 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 07:15:10 2016 done: Thu Nov 3 07:15:11 2016
Total Scan time: 3.680 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]