Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1809
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1809, 773 aa
1>>>pF1KSDA1809 773 - 773 aa - 773 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.2760+/-0.00111; mu= -13.2128+/- 0.066
mean_var=680.8458+/-168.726, 0's: 0 Z-trim(116.9): 19 B-trim: 963 in 1/52
Lambda= 0.049153
statistics sampled from 17522 (17539) to 17522 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.813), E-opt: 0.2 (0.539), width: 16
Scan time: 4.880
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1861.1 BCL11A gene_id:53335|Hs108|chr2 ( 773) 5350 395.0 2.5e-109
CCDS1862.1 BCL11A gene_id:53335|Hs108|chr2 ( 835) 5155 381.2 3.8e-105
CCDS9949.1 BCL11B gene_id:64919|Hs108|chr14 ( 823) 2344 181.8 3.8e-45
CCDS9950.1 BCL11B gene_id:64919|Hs108|chr14 ( 894) 2345 182.0 3.8e-45
CCDS46295.1 BCL11A gene_id:53335|Hs108|chr2 ( 243) 1496 121.1 2.2e-27
>>CCDS1861.1 BCL11A gene_id:53335|Hs108|chr2 (773 aa)
initn: 5350 init1: 5350 opt: 5350 Z-score: 2076.4 bits: 395.0 E(32554): 2.5e-109
Smith-Waterman score: 5350; 100.0% identity (100.0% similar) in 773 aa overlap (1-773:1-773)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSRRKQGKPQHLSKREFSPEPLEAILTDDEPDHGPLGAPEGDHDLLTCGQCQMNFPLGDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MSRRKQGKPQHLSKREFSPEPLEAILTDDEPDHGPLGAPEGDHDLLTCGQCQMNFPLGDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LIFIEHKRKQCNGSLCLEKAVDKPPSPSPIEMKKASNPVEVGIQVTPEDDDCLSTSSRGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 LIFIEHKRKQCNGSLCLEKAVDKPPSPSPIEMKKASNPVEVGIQVTPEDDDCLSTSSRGI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD CPKQEHIADKLLHWRGLSSPRSAHGALIPTPGMSAEYAPQGICKDEPSSYTCTTCKQPFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 CPKQEHIADKLLHWRGLSSPRSAHGALIPTPGMSAEYAPQGICKDEPSSYTCTTCKQPFT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SAWFLLQHAQNTHGLRIYLESEHGSPLTPRVGIPSGLGAECPSQPPLHGIHIADNNPFNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 SAWFLLQHAQNTHGLRIYLESEHGSPLTPRVGIPSGLGAECPSQPPLHGIHIADNNPFNL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LRIPGSVSREASGLAEGRFPPTPPLFSPPPRHHLDPHRIERLGAEEMALATHHPSAFDRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 LRIPGSVSREASGLAEGRFPPTPPLFSPPPRHHLDPHRIERLGAEEMALATHHPSAFDRV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LRLNPMAMEPPAMDFSRRLRELAGNTSSPPLSPGRPSPMQRLLQPFQPGSKPPFLATPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 LRLNPMAMEPPAMDFSRRLRELAGNTSSPPLSPGRPSPMQRLLQPFQPGSKPPFLATPPL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PPLQSAPPPSQPPVKSKSCEFCGKTFKFQSNLVVHRRSHTGEKPYKCNLCDHACTQASKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 PPLQSAPPPSQPPVKSKSCEFCGKTFKFQSNLVVHRRSHTGEKPYKCNLCDHACTQASKL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KRHMKTHMHKSSPMTVKSDDGLSTASSPEPGTSDLVGSASSALKSVVAKFKSENDPNLIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KRHMKTHMHKSSPMTVKSDDGLSTASSPEPGTSDLVGSASSALKSVVAKFKSENDPNLIP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ENGDEEEEEDDEEEEEEEEEEEEELTESERVDYGFGLSLEAARHHENSSRGAVVGVGDES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 ENGDEEEEEDDEEEEEEEEEEEEELTESERVDYGFGLSLEAARHHENSSRGAVVGVGDES
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RALPDVMQGMVLSSMQHFSEAFHQVLGEKHKRGHLAEAEGHRDTCDEDSVAGESDRIDDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 RALPDVMQGMVLSSMQHFSEAFHQVLGEKHKRGHLAEAEGHRDTCDEDSVAGESDRIDDG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD TVNGRGCSPGESASGGLSKKLLLGSPSSLSPFSKRIKLEKEFDLPPAAMPNTENVYSQWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 TVNGRGCSPGESASGGLSKKLLLGSPSSLSPFSKRIKLEKEFDLPPAAMPNTENVYSQWL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD AGYAASRQLKDPFLSFGDSRQSPFASSSEHSSENGSLRFSTPPGELDGGISGRSGTGSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 AGYAASRQLKDPFLSFGDSRQSPFASSSEHSSENGSLRFSTPPGELDGGISGRSGTGSGG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KSD STPHISGPGPGRPSSKEGRRSDTCSSHTPIRRSTQRAQDVWQFSDGSSRALKF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 STPHISGPGPGRPSSKEGRRSDTCSSHTPIRRSTQRAQDVWQFSDGSSRALKF
730 740 750 760 770
>>CCDS1862.1 BCL11A gene_id:53335|Hs108|chr2 (835 aa)
initn: 5155 init1: 5155 opt: 5155 Z-score: 2001.3 bits: 381.2 E(32554): 3.8e-105
Smith-Waterman score: 5155; 100.0% identity (100.0% similar) in 744 aa overlap (1-744:1-744)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSRRKQGKPQHLSKREFSPEPLEAILTDDEPDHGPLGAPEGDHDLLTCGQCQMNFPLGDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MSRRKQGKPQHLSKREFSPEPLEAILTDDEPDHGPLGAPEGDHDLLTCGQCQMNFPLGDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LIFIEHKRKQCNGSLCLEKAVDKPPSPSPIEMKKASNPVEVGIQVTPEDDDCLSTSSRGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 LIFIEHKRKQCNGSLCLEKAVDKPPSPSPIEMKKASNPVEVGIQVTPEDDDCLSTSSRGI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD CPKQEHIADKLLHWRGLSSPRSAHGALIPTPGMSAEYAPQGICKDEPSSYTCTTCKQPFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 CPKQEHIADKLLHWRGLSSPRSAHGALIPTPGMSAEYAPQGICKDEPSSYTCTTCKQPFT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SAWFLLQHAQNTHGLRIYLESEHGSPLTPRVGIPSGLGAECPSQPPLHGIHIADNNPFNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 SAWFLLQHAQNTHGLRIYLESEHGSPLTPRVGIPSGLGAECPSQPPLHGIHIADNNPFNL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LRIPGSVSREASGLAEGRFPPTPPLFSPPPRHHLDPHRIERLGAEEMALATHHPSAFDRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 LRIPGSVSREASGLAEGRFPPTPPLFSPPPRHHLDPHRIERLGAEEMALATHHPSAFDRV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LRLNPMAMEPPAMDFSRRLRELAGNTSSPPLSPGRPSPMQRLLQPFQPGSKPPFLATPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 LRLNPMAMEPPAMDFSRRLRELAGNTSSPPLSPGRPSPMQRLLQPFQPGSKPPFLATPPL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PPLQSAPPPSQPPVKSKSCEFCGKTFKFQSNLVVHRRSHTGEKPYKCNLCDHACTQASKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 PPLQSAPPPSQPPVKSKSCEFCGKTFKFQSNLVVHRRSHTGEKPYKCNLCDHACTQASKL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KRHMKTHMHKSSPMTVKSDDGLSTASSPEPGTSDLVGSASSALKSVVAKFKSENDPNLIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KRHMKTHMHKSSPMTVKSDDGLSTASSPEPGTSDLVGSASSALKSVVAKFKSENDPNLIP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ENGDEEEEEDDEEEEEEEEEEEEELTESERVDYGFGLSLEAARHHENSSRGAVVGVGDES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 ENGDEEEEEDDEEEEEEEEEEEEELTESERVDYGFGLSLEAARHHENSSRGAVVGVGDES
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RALPDVMQGMVLSSMQHFSEAFHQVLGEKHKRGHLAEAEGHRDTCDEDSVAGESDRIDDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 RALPDVMQGMVLSSMQHFSEAFHQVLGEKHKRGHLAEAEGHRDTCDEDSVAGESDRIDDG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD TVNGRGCSPGESASGGLSKKLLLGSPSSLSPFSKRIKLEKEFDLPPAAMPNTENVYSQWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 TVNGRGCSPGESASGGLSKKLLLGSPSSLSPFSKRIKLEKEFDLPPAAMPNTENVYSQWL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD AGYAASRQLKDPFLSFGDSRQSPFASSSEHSSENGSLRFSTPPGELDGGISGRSGTGSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 AGYAASRQLKDPFLSFGDSRQSPFASSSEHSSENGSLRFSTPPGELDGGISGRSGTGSGG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KSD STPHISGPGPGRPSSKEGRRSDTCSSHTPIRRSTQRAQDVWQFSDGSSRALKF
::::::::::::::::::::::::
CCDS18 STPHISGPGPGRPSSKEGRRSDTCEYCGKVFKNCSNLTVHRRSHTGERPYKCELCNYACA
730 740 750 760 770 780
>>CCDS9949.1 BCL11B gene_id:64919|Hs108|chr14 (823 aa)
initn: 1706 init1: 615 opt: 2344 Z-score: 924.1 bits: 181.8 E(32554): 3.8e-45
Smith-Waterman score: 2824; 59.5% identity (76.6% similar) in 782 aa overlap (1-744:1-727)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSRRKQGKPQHLSKREF-SPEP--LEA-ILTDDE----PDHGPLGAPEG--DHDLLTCGQ
:::::::.:::::.::. .:: .:: :: .:: . . :: : : :::::::
CCDS99 MSRRKQGNPQHLSQRELITPEADHVEAAILEEDEGLEIEEPSGLGLMVGGPDPDLLTCGQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KSD CQMNFPLGDILIFIEHKRKQCNGSL--CLEKAVDK--PPSPSPIEMKKASNPVEVGIQVT
:::::::::::.:::::::::.::: : .::.:: :: : :..:.:.:::.:::::
CCDS99 CQMNFPLGDILVFIEHKRKQCGGSLGACYDKALDKDSPPPSSRSELRKVSEPVEIGIQVT
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD PEDDDCLSTSSRGICPKQEHIADKLLHWRGLSSPRSAHGALIPTPGMSAEYAPQGICKDE
:..:: : . ..:::::::.:: : ::
CCDS99 PDEDDHLLSPTKGICPKQENIAGK----------------------------------DE
130 140
170 180 190 200 210 220
pF1KSD PSSYTCTTCKQPFTSAWFLLQHAQNTHGLRIYLE-SEHGSPLTPRVGIPSGLGAECPSQP
:::: ::::::::.::::::::::::::.::::: . .: ::::. :: :: : .:
CCDS99 PSSYICTTCKQPFNSAWFLLQHAQNTHGFRIYLEPGPASSSLTPRLTIPPPLGPEAVAQS
150 160 170 180 190 200
230 240 250 260 270 280
pF1KSD PLHGIHIADNNPFNLLRIPGSVSREASGLAEGRFPPTPPLFSPPPRHHLDPHRIERLGAE
:: .. ..:.:::::::. : . :. :..:::.: ::::::::::::::::: :.::
CCDS99 PLMNF-LGDSNPFNLLRMTGPILRDHPGFGEGRLPGTPPLFSPPPRHHLDPHR---LSAE
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KSD EMALATHHPSAFDRVLRLNPMAMEPPAMDFSRRLRELAGNTSSPP-LSPGRPSPMQRLLQ
::.:...::::::::.::::::.. :::::::::::::::.:.:: .:::: .::.:::.
CCDS99 EMGLVAQHPSAFDRVMRLNPMAIDSPAMDFSRRLRELAGNSSTPPPVSPGRGNPMHRLLN
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KSD PFQPGSKPPFLATPPLPPLQ-SAPPPSQPPVKSKSCEFCGKTFKFQSNLVVHRRSHTGEK
::::. : :::.::::::. .. :: :::.::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS99 PFQPSPKSPFLSTPPLPPMPPGGTPPPQPPAKSKSCEFCGKTFKFQSNLIVHRRSHTGEK
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KSD PYKCNLCDHACTQASKLKRHMKTHMHKSSPMTVKSDDGLSTASSPEPGTSDLVGSASSAL
::::.::::::.:::::::::::::::.. .. .::::::.:::::::::.:.: . :
CCDS99 PYKCQLCDHACSQASKLKRHMKTHMHKAGSLAGRSDDGLSAASSPEPGTSELAGEG---L
390 400 410 420 430
470 480 490 500 510 520
pF1KSD KSVVAKFKS-ENDPNLIPENGDEEEEEDDEEEEEEEEEEEEELTESE-RVDYGFGLSLEA
:.. . :. :.::.: : : :::: ::::::::: : :.: : . .:... :
CCDS99 KAADGDFRHHESDPSL----GHEPEEED----EEEEEEEEELLLENESRPESSFSMDSEL
440 450 460 470 480 490
530 540 550 560
pF1KSD ARHHENSSRGAVVGV----GDESRALPD--------VMQGMVLSSMQHFSEAFHQVLGEK
.:..::.. :.: :: : ..:: : ::... :... ...: .:..:
CCDS99 SRNRENGG-GGVPGVPGAGGGAAKALADEKALVLGKVMENVGLGALPQYGE----LLADK
500 510 520 530 540
570 580 590 600 610 620
pF1KSD HKRG-HLAEAEGHRDTCDEDSVAGESDRIDDGTVNGRG--CSPGESASGGL--SKKLLLG
.::: : .: : :. :.:...: .: :.::::: .:: :: : :
CCDS99 QKRGAFLKRAAGGGDAGDDDDAGGCGDAGAGGAVNGRGGGFAPGTEPFPGLFPRKPAPLP
550 560 570 580 590 600
630 640 650 660 670 680
pF1KSD SPSSLSPFSKRIKLEKEFDLPPAAMPNTENVYSQWLAGYAASRQ-LKDPFLSFGDSRQSP
::. :. .::::.::...:::::. .::::::::.::::::. .:::::.: :.::::
CCDS99 SPG-LNSAAKRIKVEKDLELPPAALIPSENVYSQWLVGYAASRHFMKDPFLGFTDARQSP
610 620 630 640 650 660
690 700 710 720 730 740
pF1KSD FASSSEHSSENGSLRFSTPPGEL-DGGISGRSGTGSGGSTPHISGPGPGRPSSKEGRRSD
::.::::::::::::::::::.: :::.::::::.:::::::..::::::::::::::::
CCDS99 FATSSEHSSENGSLRFSTPPGDLLDGGLSGRSGTASGGSTPHLGGPGPGRPSSKEGRRSD
670 680 690 700 710 720
750 760 770
pF1KSD TCSSHTPIRRSTQRAQDVWQFSDGSSRALKF
::
CCDS99 TCEYCGKVFKNCSNLTVHRRSHTGERPYKCELCNYACAQSSKLTRHMKTHGQIGKEVYRC
730 740 750 760 770 780
>>CCDS9950.1 BCL11B gene_id:64919|Hs108|chr14 (894 aa)
initn: 1873 init1: 615 opt: 2345 Z-score: 924.0 bits: 182.0 E(32554): 3.8e-45
Smith-Waterman score: 2776; 58.5% identity (75.3% similar) in 792 aa overlap (24-744:28-798)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSRRKQGKPQHLSKREFSPEPLEAILTDDE----PDHGPLGAPEG--DHDLLTCGQ
::: .:: . . :: : : :::::::
CCDS99 MSRRKQGNPQHLSQRELITPEADHVEAAILEEDEGLEIEEPSGLGLMVGGPDPDLLTCGQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KSD CQMNFPLGDILIFIEHKRKQCNGSL--CLEKAVDK--PPSPSPIEMKKASNPVEVGIQVT
:::::::::::.:::::::::.::: : .::.:: :: : :..:.:.:::.:::::
CCDS99 CQMNFPLGDILVFIEHKRKQCGGSLGACYDKALDKDSPPPSSRSELRKVSEPVEIGIQVT
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140
pF1KSD PEDDDCLSTSSRGICPKQEHIADKLL----------------HWRGLSSPRSAHGAL---
:..:: : . ..:::::::.:: : ..:: : :::
CCDS99 PDEDDHLLSPTKGICPKQENIAGPCRPAQLPAVAPIAASSHPHSSVITSPLRALGALPPC
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180
pF1KSD IPTPGMSAE-------------YAPQGI-C----KDEPSSYTCTTCKQPFTSAWFLLQHA
.: : ::. :: : : ::::::: ::::::::.:::::::::
CCDS99 LPLPCCSARPVSGDGTQGEGQTEAPFGCQCQLSGKDEPSSYICTTCKQPFNSAWFLLQHA
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QNTHGLRIYLE-SEHGSPLTPRVGIPSGLGAECPSQPPLHGIHIADNNPFNLLRIPGSVS
:::::.::::: . .: ::::. :: :: : .: :: .. ..:.:::::::. : .
CCDS99 QNTHGFRIYLEPGPASSSLTPRLTIPPPLGPEAVAQSPLMNF-LGDSNPFNLLRMTGPIL
250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KSD REASGLAEGRFPPTPPLFSPPPRHHLDPHRIERLGAEEMALATHHPSAFDRVLRLNPMAM
:. :..:::.: ::::::::::::::::: :.::::.:...::::::::.::::::.
CCDS99 RDHPGFGEGRLPGTPPLFSPPPRHHLDPHR---LSAEEMGLVAQHPSAFDRVMRLNPMAI
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KSD EPPAMDFSRRLRELAGNTSSPP-LSPGRPSPMQRLLQPFQPGSKPPFLATPPLPPLQ-SA
. :::::::::::::::.:.:: .:::: .::.:::.::::. : :::.::::::. ..
CCDS99 DSPAMDFSRRLRELAGNSSTPPPVSPGRGNPMHRLLNPFQPSPKSPFLSTPPLPPMPPGG
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PPPSQPPVKSKSCEFCGKTFKFQSNLVVHRRSHTGEKPYKCNLCDHACTQASKLKRHMKT
:: :::.::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::.:::::::::::
CCDS99 TPPPQPPAKSKSCEFCGKTFKFQSNLIVHRRSHTGEKPYKCQLCDHACSQASKLKRHMKT
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
pF1KSD HMHKSSPMTVKSDDGLSTASSPEPGTSDLVGSASSALKSVVAKFKS-ENDPNLIPENGDE
::::.. .. .::::::.:::::::::.:.: .::.. . :. :.::.: : :
CCDS99 HMHKAGSLAGRSDDGLSAASSPEPGTSELAG---EGLKAADGDFRHHESDPSL----GHE
480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KSD EEEEDDEEEEEEEEEEEEELTESE-RVDYGFGLSLEAARHHENSSRGAVVGV----GDES
:::: ::::::::: : :.: : . .:... : .:..::.. :.: :: : .
CCDS99 PEEED----EEEEEEEEELLLENESRPESSFSMDSELSRNRENGG-GGVPGVPGAGGGAA
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580 590
pF1KSD RALPD--------VMQGMVLSSMQHFSEAFHQVLGEKHKRG-HLAEAEGHRDTCDEDSVA
.:: : ::... :... ...: .:..:.::: : .: : :. :.:...
CCDS99 KALADEKALVLGKVMENVGLGALPQYGE----LLADKQKRGAFLKRAAGGGDAGDDDDAG
590 600 610 620 630 640
600 610 620 630 640
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: .: :.::::: .:: :: : : ::. :. .::::.::...::::
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:. .::::::::.::::::. .:::::.: :.::::::.::::::::::::::::::.:
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pF1KSD -DGGISGRSGTGSGGSTPHISGPGPGRPSSKEGRRSDTCSSHTPIRRSTQRAQDVWQFSD
:::.::::::.:::::::..::::::::::::::::::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]