Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1809
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1809, 773 aa
1>>>pF1KSDA1809 773 - 773 aa - 773 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4922+/-0.000428; mu= -2.5775+/- 0.027
mean_var=707.4803+/-167.338, 0's: 0 Z-trim(124.8): 18 B-trim: 2578 in 1/57
Lambda= 0.048219
statistics sampled from 47074 (47097) to 47074 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.818), E-opt: 0.2 (0.552), width: 16
Scan time: 15.350
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_060484 (OMIM: 606557,617101) B-cell lymphoma/le ( 773) 5350 387.9 8.6e-107
XP_011531212 (OMIM: 606557,617101) PREDICTED: B-ce ( 827) 5155 374.4 1.1e-102
XP_011531211 (OMIM: 606557,617101) PREDICTED: B-ce ( 835) 5155 374.4 1.1e-102
NP_075044 (OMIM: 606557,617101) B-cell lymphoma/le ( 835) 5155 374.4 1.1e-102
XP_016859822 (OMIM: 606557,617101) PREDICTED: B-ce ( 833) 5023 365.2 6.3e-100
XP_016859825 (OMIM: 606557,617101) PREDICTED: B-ce ( 724) 4250 311.4 9e-84
XP_016859826 (OMIM: 606557,617101) PREDICTED: B-ce ( 683) 4077 299.3 3.6e-80
XP_016859827 (OMIM: 606557,617101) PREDICTED: B-ce ( 683) 4077 299.3 3.6e-80
XP_011531214 (OMIM: 606557,617101) PREDICTED: B-ce ( 793) 4001 294.1 1.5e-78
XP_016859824 (OMIM: 606557,617101) PREDICTED: B-ce ( 799) 4001 294.1 1.6e-78
XP_016859823 (OMIM: 606557,617101) PREDICTED: B-ce ( 801) 4001 294.1 1.6e-78
NP_001269166 (OMIM: 606558) B-cell lymphoma/leukem ( 893) 2345 179.0 7.9e-44
NP_612808 (OMIM: 606558) B-cell lymphoma/leukemia ( 894) 2345 179.0 7.9e-44
NP_001269167 (OMIM: 606558) B-cell lymphoma/leukem ( 822) 2344 178.8 7.9e-44
NP_075049 (OMIM: 606558) B-cell lymphoma/leukemia ( 823) 2344 178.8 7.9e-44
NP_612569 (OMIM: 606557,617101) B-cell lymphoma/le ( 243) 1496 119.1 2.3e-26
>>NP_060484 (OMIM: 606557,617101) B-cell lymphoma/leukem (773 aa)
initn: 5350 init1: 5350 opt: 5350 Z-score: 2038.3 bits: 387.9 E(85289): 8.6e-107
Smith-Waterman score: 5350; 100.0% identity (100.0% similar) in 773 aa overlap (1-773:1-773)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSRRKQGKPQHLSKREFSPEPLEAILTDDEPDHGPLGAPEGDHDLLTCGQCQMNFPLGDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 MSRRKQGKPQHLSKREFSPEPLEAILTDDEPDHGPLGAPEGDHDLLTCGQCQMNFPLGDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LIFIEHKRKQCNGSLCLEKAVDKPPSPSPIEMKKASNPVEVGIQVTPEDDDCLSTSSRGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LIFIEHKRKQCNGSLCLEKAVDKPPSPSPIEMKKASNPVEVGIQVTPEDDDCLSTSSRGI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD CPKQEHIADKLLHWRGLSSPRSAHGALIPTPGMSAEYAPQGICKDEPSSYTCTTCKQPFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 CPKQEHIADKLLHWRGLSSPRSAHGALIPTPGMSAEYAPQGICKDEPSSYTCTTCKQPFT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SAWFLLQHAQNTHGLRIYLESEHGSPLTPRVGIPSGLGAECPSQPPLHGIHIADNNPFNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 SAWFLLQHAQNTHGLRIYLESEHGSPLTPRVGIPSGLGAECPSQPPLHGIHIADNNPFNL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LRIPGSVSREASGLAEGRFPPTPPLFSPPPRHHLDPHRIERLGAEEMALATHHPSAFDRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LRIPGSVSREASGLAEGRFPPTPPLFSPPPRHHLDPHRIERLGAEEMALATHHPSAFDRV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LRLNPMAMEPPAMDFSRRLRELAGNTSSPPLSPGRPSPMQRLLQPFQPGSKPPFLATPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LRLNPMAMEPPAMDFSRRLRELAGNTSSPPLSPGRPSPMQRLLQPFQPGSKPPFLATPPL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PPLQSAPPPSQPPVKSKSCEFCGKTFKFQSNLVVHRRSHTGEKPYKCNLCDHACTQASKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 PPLQSAPPPSQPPVKSKSCEFCGKTFKFQSNLVVHRRSHTGEKPYKCNLCDHACTQASKL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KRHMKTHMHKSSPMTVKSDDGLSTASSPEPGTSDLVGSASSALKSVVAKFKSENDPNLIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 KRHMKTHMHKSSPMTVKSDDGLSTASSPEPGTSDLVGSASSALKSVVAKFKSENDPNLIP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ENGDEEEEEDDEEEEEEEEEEEEELTESERVDYGFGLSLEAARHHENSSRGAVVGVGDES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 ENGDEEEEEDDEEEEEEEEEEEEELTESERVDYGFGLSLEAARHHENSSRGAVVGVGDES
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RALPDVMQGMVLSSMQHFSEAFHQVLGEKHKRGHLAEAEGHRDTCDEDSVAGESDRIDDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 RALPDVMQGMVLSSMQHFSEAFHQVLGEKHKRGHLAEAEGHRDTCDEDSVAGESDRIDDG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD TVNGRGCSPGESASGGLSKKLLLGSPSSLSPFSKRIKLEKEFDLPPAAMPNTENVYSQWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 TVNGRGCSPGESASGGLSKKLLLGSPSSLSPFSKRIKLEKEFDLPPAAMPNTENVYSQWL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD AGYAASRQLKDPFLSFGDSRQSPFASSSEHSSENGSLRFSTPPGELDGGISGRSGTGSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 AGYAASRQLKDPFLSFGDSRQSPFASSSEHSSENGSLRFSTPPGELDGGISGRSGTGSGG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KSD STPHISGPGPGRPSSKEGRRSDTCSSHTPIRRSTQRAQDVWQFSDGSSRALKF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 STPHISGPGPGRPSSKEGRRSDTCSSHTPIRRSTQRAQDVWQFSDGSSRALKF
730 740 750 760 770
>>XP_011531212 (OMIM: 606557,617101) PREDICTED: B-cell l (827 aa)
initn: 5155 init1: 5155 opt: 5155 Z-score: 1964.7 bits: 374.4 E(85289): 1.1e-102
Smith-Waterman score: 5155; 100.0% identity (100.0% similar) in 744 aa overlap (1-744:1-744)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSRRKQGKPQHLSKREFSPEPLEAILTDDEPDHGPLGAPEGDHDLLTCGQCQMNFPLGDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSRRKQGKPQHLSKREFSPEPLEAILTDDEPDHGPLGAPEGDHDLLTCGQCQMNFPLGDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LIFIEHKRKQCNGSLCLEKAVDKPPSPSPIEMKKASNPVEVGIQVTPEDDDCLSTSSRGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LIFIEHKRKQCNGSLCLEKAVDKPPSPSPIEMKKASNPVEVGIQVTPEDDDCLSTSSRGI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD CPKQEHIADKLLHWRGLSSPRSAHGALIPTPGMSAEYAPQGICKDEPSSYTCTTCKQPFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CPKQEHIADKLLHWRGLSSPRSAHGALIPTPGMSAEYAPQGICKDEPSSYTCTTCKQPFT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SAWFLLQHAQNTHGLRIYLESEHGSPLTPRVGIPSGLGAECPSQPPLHGIHIADNNPFNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SAWFLLQHAQNTHGLRIYLESEHGSPLTPRVGIPSGLGAECPSQPPLHGIHIADNNPFNL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LRIPGSVSREASGLAEGRFPPTPPLFSPPPRHHLDPHRIERLGAEEMALATHHPSAFDRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LRIPGSVSREASGLAEGRFPPTPPLFSPPPRHHLDPHRIERLGAEEMALATHHPSAFDRV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LRLNPMAMEPPAMDFSRRLRELAGNTSSPPLSPGRPSPMQRLLQPFQPGSKPPFLATPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LRLNPMAMEPPAMDFSRRLRELAGNTSSPPLSPGRPSPMQRLLQPFQPGSKPPFLATPPL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PPLQSAPPPSQPPVKSKSCEFCGKTFKFQSNLVVHRRSHTGEKPYKCNLCDHACTQASKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PPLQSAPPPSQPPVKSKSCEFCGKTFKFQSNLVVHRRSHTGEKPYKCNLCDHACTQASKL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KRHMKTHMHKSSPMTVKSDDGLSTASSPEPGTSDLVGSASSALKSVVAKFKSENDPNLIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KRHMKTHMHKSSPMTVKSDDGLSTASSPEPGTSDLVGSASSALKSVVAKFKSENDPNLIP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ENGDEEEEEDDEEEEEEEEEEEEELTESERVDYGFGLSLEAARHHENSSRGAVVGVGDES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ENGDEEEEEDDEEEEEEEEEEEEELTESERVDYGFGLSLEAARHHENSSRGAVVGVGDES
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RALPDVMQGMVLSSMQHFSEAFHQVLGEKHKRGHLAEAEGHRDTCDEDSVAGESDRIDDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RALPDVMQGMVLSSMQHFSEAFHQVLGEKHKRGHLAEAEGHRDTCDEDSVAGESDRIDDG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD TVNGRGCSPGESASGGLSKKLLLGSPSSLSPFSKRIKLEKEFDLPPAAMPNTENVYSQWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TVNGRGCSPGESASGGLSKKLLLGSPSSLSPFSKRIKLEKEFDLPPAAMPNTENVYSQWL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD AGYAASRQLKDPFLSFGDSRQSPFASSSEHSSENGSLRFSTPPGELDGGISGRSGTGSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGYAASRQLKDPFLSFGDSRQSPFASSSEHSSENGSLRFSTPPGELDGGISGRSGTGSGG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KSD STPHISGPGPGRPSSKEGRRSDTCSSHTPIRRSTQRAQDVWQFSDGSSRALKF
::::::::::::::::::::::::
XP_011 STPHISGPGPGRPSSKEGRRSDTCEYCGKVFKNCSNLTVHRRSHTGERPYKCELCNYACA
730 740 750 760 770 780
>>XP_011531211 (OMIM: 606557,617101) PREDICTED: B-cell l (835 aa)
initn: 5155 init1: 5155 opt: 5155 Z-score: 1964.6 bits: 374.4 E(85289): 1.1e-102
Smith-Waterman score: 5155; 100.0% identity (100.0% similar) in 744 aa overlap (1-744:1-744)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSRRKQGKPQHLSKREFSPEPLEAILTDDEPDHGPLGAPEGDHDLLTCGQCQMNFPLGDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSRRKQGKPQHLSKREFSPEPLEAILTDDEPDHGPLGAPEGDHDLLTCGQCQMNFPLGDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LIFIEHKRKQCNGSLCLEKAVDKPPSPSPIEMKKASNPVEVGIQVTPEDDDCLSTSSRGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LIFIEHKRKQCNGSLCLEKAVDKPPSPSPIEMKKASNPVEVGIQVTPEDDDCLSTSSRGI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD CPKQEHIADKLLHWRGLSSPRSAHGALIPTPGMSAEYAPQGICKDEPSSYTCTTCKQPFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CPKQEHIADKLLHWRGLSSPRSAHGALIPTPGMSAEYAPQGICKDEPSSYTCTTCKQPFT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SAWFLLQHAQNTHGLRIYLESEHGSPLTPRVGIPSGLGAECPSQPPLHGIHIADNNPFNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SAWFLLQHAQNTHGLRIYLESEHGSPLTPRVGIPSGLGAECPSQPPLHGIHIADNNPFNL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LRIPGSVSREASGLAEGRFPPTPPLFSPPPRHHLDPHRIERLGAEEMALATHHPSAFDRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LRIPGSVSREASGLAEGRFPPTPPLFSPPPRHHLDPHRIERLGAEEMALATHHPSAFDRV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LRLNPMAMEPPAMDFSRRLRELAGNTSSPPLSPGRPSPMQRLLQPFQPGSKPPFLATPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LRLNPMAMEPPAMDFSRRLRELAGNTSSPPLSPGRPSPMQRLLQPFQPGSKPPFLATPPL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PPLQSAPPPSQPPVKSKSCEFCGKTFKFQSNLVVHRRSHTGEKPYKCNLCDHACTQASKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PPLQSAPPPSQPPVKSKSCEFCGKTFKFQSNLVVHRRSHTGEKPYKCNLCDHACTQASKL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KRHMKTHMHKSSPMTVKSDDGLSTASSPEPGTSDLVGSASSALKSVVAKFKSENDPNLIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KRHMKTHMHKSSPMTVKSDDGLSTASSPEPGTSDLVGSASSALKSVVAKFKSENDPNLIP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ENGDEEEEEDDEEEEEEEEEEEEELTESERVDYGFGLSLEAARHHENSSRGAVVGVGDES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ENGDEEEEEDDEEEEEEEEEEEEELTESERVDYGFGLSLEAARHHENSSRGAVVGVGDES
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RALPDVMQGMVLSSMQHFSEAFHQVLGEKHKRGHLAEAEGHRDTCDEDSVAGESDRIDDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RALPDVMQGMVLSSMQHFSEAFHQVLGEKHKRGHLAEAEGHRDTCDEDSVAGESDRIDDG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD TVNGRGCSPGESASGGLSKKLLLGSPSSLSPFSKRIKLEKEFDLPPAAMPNTENVYSQWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TVNGRGCSPGESASGGLSKKLLLGSPSSLSPFSKRIKLEKEFDLPPAAMPNTENVYSQWL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD AGYAASRQLKDPFLSFGDSRQSPFASSSEHSSENGSLRFSTPPGELDGGISGRSGTGSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGYAASRQLKDPFLSFGDSRQSPFASSSEHSSENGSLRFSTPPGELDGGISGRSGTGSGG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KSD STPHISGPGPGRPSSKEGRRSDTCSSHTPIRRSTQRAQDVWQFSDGSSRALKF
::::::::::::::::::::::::
XP_011 STPHISGPGPGRPSSKEGRRSDTCEYCGKVFKNCSNLTVHRRSHTGERPYKCELCNYACA
730 740 750 760 770 780
>>NP_075044 (OMIM: 606557,617101) B-cell lymphoma/leukem (835 aa)
initn: 5155 init1: 5155 opt: 5155 Z-score: 1964.6 bits: 374.4 E(85289): 1.1e-102
Smith-Waterman score: 5155; 100.0% identity (100.0% similar) in 744 aa overlap (1-744:1-744)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSRRKQGKPQHLSKREFSPEPLEAILTDDEPDHGPLGAPEGDHDLLTCGQCQMNFPLGDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_075 MSRRKQGKPQHLSKREFSPEPLEAILTDDEPDHGPLGAPEGDHDLLTCGQCQMNFPLGDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LIFIEHKRKQCNGSLCLEKAVDKPPSPSPIEMKKASNPVEVGIQVTPEDDDCLSTSSRGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_075 LIFIEHKRKQCNGSLCLEKAVDKPPSPSPIEMKKASNPVEVGIQVTPEDDDCLSTSSRGI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD CPKQEHIADKLLHWRGLSSPRSAHGALIPTPGMSAEYAPQGICKDEPSSYTCTTCKQPFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_075 CPKQEHIADKLLHWRGLSSPRSAHGALIPTPGMSAEYAPQGICKDEPSSYTCTTCKQPFT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SAWFLLQHAQNTHGLRIYLESEHGSPLTPRVGIPSGLGAECPSQPPLHGIHIADNNPFNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_075 SAWFLLQHAQNTHGLRIYLESEHGSPLTPRVGIPSGLGAECPSQPPLHGIHIADNNPFNL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LRIPGSVSREASGLAEGRFPPTPPLFSPPPRHHLDPHRIERLGAEEMALATHHPSAFDRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_075 LRIPGSVSREASGLAEGRFPPTPPLFSPPPRHHLDPHRIERLGAEEMALATHHPSAFDRV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LRLNPMAMEPPAMDFSRRLRELAGNTSSPPLSPGRPSPMQRLLQPFQPGSKPPFLATPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_075 LRLNPMAMEPPAMDFSRRLRELAGNTSSPPLSPGRPSPMQRLLQPFQPGSKPPFLATPPL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PPLQSAPPPSQPPVKSKSCEFCGKTFKFQSNLVVHRRSHTGEKPYKCNLCDHACTQASKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_075 PPLQSAPPPSQPPVKSKSCEFCGKTFKFQSNLVVHRRSHTGEKPYKCNLCDHACTQASKL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KRHMKTHMHKSSPMTVKSDDGLSTASSPEPGTSDLVGSASSALKSVVAKFKSENDPNLIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_075 KRHMKTHMHKSSPMTVKSDDGLSTASSPEPGTSDLVGSASSALKSVVAKFKSENDPNLIP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_075 ENGDEEEEEDDEEEEEEEEEEEEELTESERVDYGFGLSLEAARHHENSSRGAVVGVGDES
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RALPDVMQGMVLSSMQHFSEAFHQVLGEKHKRGHLAEAEGHRDTCDEDSVAGESDRIDDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_075 RALPDVMQGMVLSSMQHFSEAFHQVLGEKHKRGHLAEAEGHRDTCDEDSVAGESDRIDDG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_075 TVNGRGCSPGESASGGLSKKLLLGSPSSLSPFSKRIKLEKEFDLPPAAMPNTENVYSQWL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_075 AGYAASRQLKDPFLSFGDSRQSPFASSSEHSSENGSLRFSTPPGELDGGISGRSGTGSGG
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::::::::::::::::::::::::
NP_075 STPHISGPGPGRPSSKEGRRSDTCEYCGKVFKNCSNLTVHRRSHTGERPYKCELCNYACA
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LIFIEHKRKQCNGSLCLEKAVDKPPSPSPIEMKKASNPVEVGIQVTPEDDDCLSTSSRGI
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XP_016 CPKQEHIADKLLHWRGLSSPRSAHGALIPTPGMSAEYAPQGICKDEPSSYTCTTCKQPFT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KRHMKTHMHKSSPMTVKSDDGLSTASSPEPGTSDLVGSASSALKSVVAKFKSENDPNLIP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ENGDEEEEEDDEEEEEEEEEEEEELTESERVDYGFGLSLEAARHHENSSRGAVVGVGDES
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RALPDVMQGMVLSSMQHFSEAFHQVLGEKHKRGHLAEAEGHRDTCDEDSVAGESDRIDDG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::
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: :. ::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSPGRPSPMQRLLQPFQPGSKPPFLATPPLPPLQSAPPPSQPPVKSKSCEFCGKTFKFQS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PFSKRIKLEKEFDLPPAAMPNTENVYSQWLAGYAASRQLKDPFLSFGDSRQSPFASSSEH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KSD HMKTHMHKSSPMTVKSDDGLSTASSPEPGTSDLVGSASSALKSVVAKFKSENDPNLIPEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HMKTHMHKSSPMTVKSDDGLSTASSPEPGTSDLVGSASSALKSVVAKFKSENDPNLIPEN
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pF1KSD GDEEEEEDDEEEEEEEEEEEEELTESERVDYGFGLSLEAARHHENSSRGAVVGVGDESRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GDEEEEEDDEEEEEEEEEEEEELTESERVDYGFGLSLEAARHHENSSRGAVVGVGDESRA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KSD NGRGCSPGESASGGLSKKLLLGSPSSLSPFSKRIKLEKEFDLPPAAMPNTENVYSQWLAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NGRGCSPGESASGGLSKKLLLGSPSSLSPFSKRIKLEKEFDLPPAAMPNTENVYSQWLAG
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pF1KSD YAASRQLKDPFLSFGDSRQSPFASSSEHSSENGSLRFSTPPGELDGGISGRSGTGSGGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YAASRQLKDPFLSFGDSRQSPFASSSEHSSENGSLRFSTPPGELDGGISGRSGTGSGGST
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pF1KSD PHISGPGPGRPSSKEGRRSDTCSSHTPIRRSTQRAQDVWQFSDGSSRALKF
::::::::::::::::::::::
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>>XP_016859827 (OMIM: 606557,617101) PREDICTED: B-cell l (683 aa)
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pF1KSD KQEHIADKLLHWRGLSSPRSAHGALIPTPGMSAEYAPQGICKDEPSSYTCTTCKQPFTSA
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MSAEYAPQGICKDEPSSYTCTTCKQPFTSA
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pF1KSD WFLLQHAQNTHGLRIYLESEHGSPLTPRVGIPSGLGAECPSQPPLHGIHIADNNPFNLLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WFLLQHAQNTHGLRIYLESEHGSPLTPRVGIPSGLGAECPSQPPLHGIHIADNNPFNLLR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IPGSVSREASGLAEGRFPPTPPLFSPPPRHHLDPHRIERLGAEEMALATHHPSAFDRVLR
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pF1KSD LNPMAMEPPAMDFSRRLRELAGNTSSPPLSPGRPSPMQRLLQPFQPGSKPPFLATPPLPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNPMAMEPPAMDFSRRLRELAGNTSSPPLSPGRPSPMQRLLQPFQPGSKPPFLATPPLPP
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370 380 390 400 410 420
pF1KSD LQSAPPPSQPPVKSKSCEFCGKTFKFQSNLVVHRRSHTGEKPYKCNLCDHACTQASKLKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LQSAPPPSQPPVKSKSCEFCGKTFKFQSNLVVHRRSHTGEKPYKCNLCDHACTQASKLKR
220 230 240 250 260 270
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pF1KSD HMKTHMHKSSPMTVKSDDGLSTASSPEPGTSDLVGSASSALKSVVAKFKSENDPNLIPEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HMKTHMHKSSPMTVKSDDGLSTASSPEPGTSDLVGSASSALKSVVAKFKSENDPNLIPEN
280 290 300 310 320 330
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pF1KSD GDEEEEEDDEEEEEEEEEEEEELTESERVDYGFGLSLEAARHHENSSRGAVVGVGDESRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GDEEEEEDDEEEEEEEEEEEEELTESERVDYGFGLSLEAARHHENSSRGAVVGVGDESRA
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pF1KSD LPDVMQGMVLSSMQHFSEAFHQVLGEKHKRGHLAEAEGHRDTCDEDSVAGESDRIDDGTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LPDVMQGMVLSSMQHFSEAFHQVLGEKHKRGHLAEAEGHRDTCDEDSVAGESDRIDDGTV
400 410 420 430 440 450
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pF1KSD NGRGCSPGESASGGLSKKLLLGSPSSLSPFSKRIKLEKEFDLPPAAMPNTENVYSQWLAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NGRGCSPGESASGGLSKKLLLGSPSSLSPFSKRIKLEKEFDLPPAAMPNTENVYSQWLAG
460 470 480 490 500 510
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pF1KSD YAASRQLKDPFLSFGDSRQSPFASSSEHSSENGSLRFSTPPGELDGGISGRSGTGSGGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YAASRQLKDPFLSFGDSRQSPFASSSEHSSENGSLRFSTPPGELDGGISGRSGTGSGGST
520 530 540 550 560 570
730 740 750 760 770
pF1KSD PHISGPGPGRPSSKEGRRSDTCSSHTPIRRSTQRAQDVWQFSDGSSRALKF
::::::::::::::::::::::
XP_016 PHISGPGPGRPSSKEGRRSDTCEYCGKVFKNCSNLTVHRRSHTGERPYKCELCNYACAQS
580 590 600 610 620 630
>>XP_011531214 (OMIM: 606557,617101) PREDICTED: B-cell l (793 aa)
initn: 3998 init1: 3998 opt: 4001 Z-score: 1531.0 bits: 294.1 E(85289): 1.5e-78
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pF1KSD MSRRKQGKPQHLSKREFSPEPLEAILTDDEPDHGPLGAPEGDHDLLTCGQCQMNFPLGDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSRRKQGKPQHLSKREFSPEPLEAILTDDEPDHGPLGAPEGDHDLLTCGQCQMNFPLGDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LIFIEHKRKQCNGSLCLEKAVDKPPSPSPIEMKKASNPVEVGIQVTPEDDDCLSTSSRGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LIFIEHKRKQCNGSLCLEKAVDKPPSPSPIEMKKASNPVEVGIQVTPEDDDCLSTSSRGI
70 80 90 100 110 120
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pF1KSD CPKQEHIADKLLHWRGLSSPRSAHGALIPTPGMSAEYAPQGICKDEPSSYTCTTCKQPFT
:::::::: : ::::::::::::::::
XP_011 CPKQEHIAGK----------------------------------DEPSSYTCTTCKQPFT
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pF1KSD SAWFLLQHAQNTHGLRIYLESEHGSPLTPRVGIPSGLGAECPSQPPLHGIHIADNNPFNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SAWFLLQHAQNTHGLRIYLESEHGSPLTPRVGIPSGLGAECPSQPPLHGIHIADNNPFNL
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LRIPGSVSREASGLAEGRFPPTPPLFSPPPRHHLDPHRIERLGAEEMALATHHPSAFDRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]