Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1813
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1813, 669 aa
1>>>pF1KSDA1813 669 - 669 aa - 669 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.2856+/-0.000921; mu= -9.6938+/- 0.055
mean_var=427.8890+/-88.481, 0's: 0 Z-trim(117.7): 15 B-trim: 150 in 1/54
Lambda= 0.062002
statistics sampled from 18439 (18453) to 18439 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.819), E-opt: 0.2 (0.567), width: 16
Scan time: 4.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7507.1 LZTS2 gene_id:84445|Hs108|chr10 ( 669) 4469 413.9 3.7e-115
CCDS6015.1 LZTS1 gene_id:11178|Hs108|chr8 ( 596) 673 74.3 5.6e-13
CCDS63218.1 LZTS3 gene_id:9762|Hs108|chr20 ( 627) 593 67.2 8.3e-11
>>CCDS7507.1 LZTS2 gene_id:84445|Hs108|chr10 (669 aa)
initn: 4469 init1: 4469 opt: 4469 Z-score: 2180.9 bits: 413.9 E(32554): 3.7e-115
Smith-Waterman score: 4469; 100.0% identity (100.0% similar) in 669 aa overlap (1-669:1-669)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAIVQTLPVPLEPAPEAATAPQAPVMGSVSSLISGRPCPGGPAPPRHHGPPGPTFFRQQD
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CCDS75 MAIVQTLPVPLEPAPEAATAPQAPVMGSVSSLISGRPCPGGPAPPRHHGPPGPTFFRQQD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GLLRGGYEAQEPLCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDFRTESPPSPSSDVEDAREQRAHNAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GLLRGGYEAQEPLCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDFRTESPPSPSSDVEDAREQRAHNAHL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RGPPPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRGAPSLPSFMGPRATGLSGSQGSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RGPPPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRGAPSLPSFMGPRATGLSGSQGSLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCPSGTLSDSGRNSLSSLPTYSTGGAEPTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCPSGTLSDSGRNSLSSLPTYSTGGAEPTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SSPGGHLPSHGSGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVAGGLLGSGTRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SSPGGHLPSHGSGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVAGGLLGSGTRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDREAELQQLRDSLDENEATMCQAYEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDREAELQQLRDSLDENEATMCQAYEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RQRHWQREREALREDCAAQAQRAQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQDDFAQLLQEREQLER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RQRHWQREREALREDCAAQAQRAQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQDDFAQLLQEREQLER
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQKGSELVALRVALRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQKGSELVALRVALRE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQELQRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQELQRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PVPPATADPFLLAESDEAKVQRAAAGVGGSLRAQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PVPPATADPFLLAESDEAKVQRAAAGVGGSLRAQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGER
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCIC
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LEEITATEI
:::::::::
CCDS75 LEEITATEI
>>CCDS6015.1 LZTS1 gene_id:11178|Hs108|chr8 (596 aa)
initn: 1122 init1: 541 opt: 673 Z-score: 346.5 bits: 74.3 E(32554): 5.6e-13
Smith-Waterman score: 1095; 39.3% identity (62.4% similar) in 659 aa overlap (26-669:1-596)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAIVQTLPVPLEPAPEAATAPQAPVMGSVSSLISG-----RPCPGGPAPPRHHGPPGPTF
:::::::::: . : .. :. . .
CCDS60 MGSVSSLISGHSFHSKHCRASQYKLRKSSHL-KKL
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KSD FRQQDGLLRGGYEAQEPLCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDFRTESPPSPSSDVEDAREQRA
: .::::: :. .:. . : .: ::. . .... :. . .. . .
CCDS60 NRYSDGLLRFGF-SQDS-GHGKSSSKMGKSEDFFYIKVSQKARGSHHPDYTALSSGDLGG
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KSD HNAHLRGP--PPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRGAPSLPSFMGPRATGLS
. . : ::::.: :..:: . :: .::::::::::. :
CCDS60 QAGVDFDPSTPPKLMPFSNQLEMGSEKGAVRPTAFKPVLPR------------------S
100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KSD GSQGSLTQLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCPSGTLSDSGRNSLSSLPTYST
:. : ..: :.: . . ::: . : ::.::::::::.:::::.::
CCDS60 GAI-----LHSSPESASHQLHPAPP-DKPKEQELKPGLC-SGALSDSGRNSMSSLPTHST
140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KSD GGA---EPTTSSPGGHLPSHGSGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVA
... .: .. : : :. : : :... : .::. : . . : ::
CCDS60 SSSYQLDPLVT-PVG--PTSRFG-----GSAHNITQGIVLQDSNMMSLKALSFSDGG---
190 200 210 220 230
300 310 320 330 340 350
pF1KSD GGLLGSGTRASPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDREAELQQLRDSLDEN
. :: ...:. . :: :: : .:: .. :: :: .::. ::.:. :..:.
CCDS60 -SKLGHSNKADK-GPSC-VRS-----PISTDECSIQE-LEQKLLEREGALQKLQRSFEEK
240 250 260 270 280
360 370 380 390 400
pF1KSD EATMCQAYEERQRHWQREREALREDCAAQ----AQRAQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQD
: . ::::: :. . : :. . . . .:..:::::.:.:::.:::::::::..
CCDS60 ELASSLAYEERPRRCRDELEGPEPKGGNKLKQASQKSQRAQQVLHLQVLQLQQEKRQLRQ
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450 460
pF1KSD DFAQLLQEREQLERRCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQ
.. .:..:.. :: . . :::. .:: ::::.:::::::::::::::::::::.:.
CCDS60 ELESLMKEQDLLETKLRSYEREKTSFGPALEETQWEVCQKSGEISLLKQQLKESQTEVNA
350 360 370 380 390 400
470 480 490 500 510 520
pF1KSD KGSELVALRVALREARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQELQRHRQEAEQLREK
:.::...:.. :...:. :. : :.. :. : :.. ::::.: .::::...::: ::::
CCDS60 KASEILGLKAQLKDTRGKLEGLELRTQDLEGALRTKGLELEVCENELQRKKNEAELLREK
410 420 430 440 450 460
530 540 550 560 570 580
pF1KSD AGQLDAEAAGLREPPVPPATADPFLLAESDEAKVQRAAAGVGGSLRAQVERLRVELQRER
.. :. : :: . : . : : .:: ..::::.:: ::.
CCDS60 VNLLEQELQELRAQAALARDMGPPTFPE-DVPALQR-----------ELERLRAEL-REE
470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KSD RRGEEQRDS-FEGERLAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELEAR
:.:..: .: :. :::.:. :::.::.::::::..:. ::.::..::. ::::. :
CCDS60 RQGHDQMSSGFQHERLVWKEEKEKVIQYQKQLQQSYVAMYQRNQRLEKALQQLARGDSAG
520 530 540 550 560 570
650 660
pF1KSD ELADLGLAEQAPCICLEEITATEI
: .. : : : : :.: ::::
CCDS60 EPLEVDL-EGAD-IPYEDIIATEI
580 590
>>CCDS63218.1 LZTS3 gene_id:9762|Hs108|chr20 (627 aa)
initn: 752 init1: 384 opt: 593 Z-score: 307.5 bits: 67.2 E(32554): 8.3e-11
Smith-Waterman score: 868; 35.5% identity (54.8% similar) in 692 aa overlap (1-637:1-593)
10 20 30
pF1KSD MAIVQTLPVPLEPA--PEAATAPQ----AP-----VMGSVSSLIS----------GRPCP
:: ..:::: .:. : : ::. .: .::::.: .. :
CCDS63 MAKLETLPVRADPGRDPLLAFAPRPSELGPPDPRLAMGSVGSGVAHAQEFAMKSVGTRTG
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD GGPAPPRHHGPPGPTFFRQQDGLLR---GGYEAQEP-LCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDF
:: . :: : . .: : : : ... : .. . .. : . .
CCDS63 GGGSQGSFPGPRG-----SGSGASRERPGRYPSEDKGLANSLYLNGELRGSDHTDVCGNV
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KSD RTESPPSPSSDVED-AREQRAHNAHLRGPPPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPK
: : :: : : : . .: ::::. .::::.. : :.::.:::::.::
CCDS63 VGSSGGSSSSGGSDKAPPQYREPSH----PPKLLATSGKLDQCSEP-LVRPSAFKPVVPK
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KSD PRGAPSLPSFMGPRATGLS-GSQGSLTQLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCP
. :. .. :...: : :: :: .. ..: . . : :.:
CCDS63 --NFHSMQNLCPPQTNGTPEGRQGP-----GGLKGGLDKSRTMT----P------AGGSG
180 190 200 210
220 230 240 250 260
pF1KSD SGTLSDSGRNSLSSLPTYSTGGAE---PTTSSPGGHL-----PSHGSGRGALPGPARGVP
:: :::::::::.::::::.. .. : ..: . :. :.::: :. : . :
CCDS63 SG-LSDSGRNSLTSLPTYSSSYSQHLAPLSASTS-HINRIGTASYGSGSGGSSGGGSGYQ
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KSD TGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVAGGLLGSGTRASPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALL
. :::::.::.....: :: : :::: . : : ::: ::.
CCDS63 DLGT-SDSGRASSKSGSSSSMGR--PGHLGSGEGG-------GGGLPFAACSPPSPSALI
280 290 300 310 320
330 340 350 360 370 380
pF1KSD HCVLEGKLRDREAELQQLRDSLDENEATMCQAYEERQRHWQREREALREDCAAQAQRAQR
. :: .: ..: :. :: ::...::..
CCDS63 QE-LEERLWEKEQEVAALRRSLEQSEAAVA------------------------------
330 340 350
390 400 410 420 430 440
pF1KSD AQQLLQLQVFQLQQEKRQLQDDFAQLLQEREQLERRCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQ
::.:.:::.. :.:...::.:: . :. ..:: .. ::.:::::::::
CCDS63 ------------QQDKKQLQEEAARLMRQREELEDKVAACQKEQADFLPRIEETKWEVCQ
360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KSD KSGEISLLKQQLKESQAELVQKGSELVALRVALREARATLRVSEGRARGLQEAARARELE
:.:::::::::::.:::.. :: ::.:.:: :::.::.:: .: . .:... ...
CCDS63 KAGEISLLKQQLKDSQADVSQKLSEIVGLRSQLREGRASLREKEEQLLSLRDSFSSKQAS
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KSD LEACSQELQRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREPPVPPATA-DPFLLAESDEAKVQR--
:: : : :.: : :: :: : . ::::::..:
CCDS63 LE---------------LGE--GELPAACLKPALTPVDPAEPQDALATCESDEAKMRRQA
460 470 480 490 500
570 580 590 600
pF1KSD ---AAAGV---------GG-----SLRAQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGERLAWQA
:::.. :: .:: .: ::..:: ::: :.: :: :: .:
CCDS63 GVAAAASLVSVDGEAEAGGESGTRALRREVGRLQAELAAERRARERQGASFAEERRVWLE
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KSD EKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCICLEEIT
:::.::.:::::: .:..::.::.:::..:..
CCDS63 EKEKVIEYQKQLQLSYVEMYQRNQQLERRLRERGAAGGASTPTPQHGEEKKAWTPSRLER
570 580 590 600 610 620
pF1KSD ATEI
CCDS63 IESTEI
669 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 07:25:35 2016 done: Thu Nov 3 07:25:36 2016
Total Scan time: 4.970 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]