Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1813
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1813, 669 aa
1>>>pF1KSDA1813 669 - 669 aa - 669 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.0474+/-0.000389; mu= -20.2518+/- 0.024
mean_var=478.8327+/-101.022, 0's: 0 Z-trim(125.6): 29 B-trim: 1135 in 2/58
Lambda= 0.058611
statistics sampled from 49651 (49684) to 49651 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.829), E-opt: 0.2 (0.583), width: 16
Scan time: 14.240
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001305029 (OMIM: 610454) leucine zipper putativ ( 669) 4469 392.3 3.2e-108
XP_005270279 (OMIM: 610454) PREDICTED: leucine zip ( 669) 4469 392.3 3.2e-108
XP_016872269 (OMIM: 610454) PREDICTED: leucine zip ( 669) 4469 392.3 3.2e-108
NP_115805 (OMIM: 610454) leucine zipper putative t ( 669) 4469 392.3 3.2e-108
NP_001305028 (OMIM: 610454) leucine zipper putativ ( 669) 4469 392.3 3.2e-108
NP_001305030 (OMIM: 610454) leucine zipper putativ ( 449) 2052 187.8 7.6e-47
XP_016872270 (OMIM: 610454) PREDICTED: leucine zip ( 449) 2052 187.8 7.6e-47
XP_005260950 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zip ( 673) 994 98.4 9e-20
XP_005260949 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zip ( 673) 994 98.4 9e-20
XP_011527710 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zip ( 703) 994 98.4 9.4e-20
XP_005260947 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zip ( 703) 994 98.4 9.4e-20
XP_011527711 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zip ( 703) 994 98.4 9.4e-20
XP_011542685 (OMIM: 133239,606551) PREDICTED: leuc ( 596) 673 71.2 1.2e-11
XP_005273451 (OMIM: 133239,606551) PREDICTED: leuc ( 596) 673 71.2 1.2e-11
XP_011542687 (OMIM: 133239,606551) PREDICTED: leuc ( 596) 673 71.2 1.2e-11
NP_066300 (OMIM: 133239,606551) leucine zipper put ( 596) 673 71.2 1.2e-11
XP_011542686 (OMIM: 133239,606551) PREDICTED: leuc ( 596) 673 71.2 1.2e-11
XP_011542688 (OMIM: 133239,606551) PREDICTED: leuc ( 596) 673 71.2 1.2e-11
XP_011527709 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zip ( 682) 611 66.0 5.1e-10
NP_001269462 (OMIM: 610484) leucine zipper putativ ( 627) 593 64.5 1.4e-09
>>NP_001305029 (OMIM: 610454) leucine zipper putative tu (669 aa)
initn: 4469 init1: 4469 opt: 4469 Z-score: 2064.0 bits: 392.3 E(85289): 3.2e-108
Smith-Waterman score: 4469; 100.0% identity (100.0% similar) in 669 aa overlap (1-669:1-669)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAIVQTLPVPLEPAPEAATAPQAPVMGSVSSLISGRPCPGGPAPPRHHGPPGPTFFRQQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAIVQTLPVPLEPAPEAATAPQAPVMGSVSSLISGRPCPGGPAPPRHHGPPGPTFFRQQD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GLLRGGYEAQEPLCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDFRTESPPSPSSDVEDAREQRAHNAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLLRGGYEAQEPLCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDFRTESPPSPSSDVEDAREQRAHNAHL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RGPPPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRGAPSLPSFMGPRATGLSGSQGSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGPPPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRGAPSLPSFMGPRATGLSGSQGSLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCPSGTLSDSGRNSLSSLPTYSTGGAEPTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCPSGTLSDSGRNSLSSLPTYSTGGAEPTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SSPGGHLPSHGSGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVAGGLLGSGTRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSPGGHLPSHGSGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVAGGLLGSGTRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDREAELQQLRDSLDENEATMCQAYEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDREAELQQLRDSLDENEATMCQAYEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RQRHWQREREALREDCAAQAQRAQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQDDFAQLLQEREQLER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RQRHWQREREALREDCAAQAQRAQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQDDFAQLLQEREQLER
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQKGSELVALRVALRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQKGSELVALRVALRE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQELQRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQELQRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PVPPATADPFLLAESDEAKVQRAAAGVGGSLRAQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PVPPATADPFLLAESDEAKVQRAAAGVGGSLRAQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGER
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCIC
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LEEITATEI
:::::::::
NP_001 LEEITATEI
>>XP_005270279 (OMIM: 610454) PREDICTED: leucine zipper (669 aa)
initn: 4469 init1: 4469 opt: 4469 Z-score: 2064.0 bits: 392.3 E(85289): 3.2e-108
Smith-Waterman score: 4469; 100.0% identity (100.0% similar) in 669 aa overlap (1-669:1-669)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAIVQTLPVPLEPAPEAATAPQAPVMGSVSSLISGRPCPGGPAPPRHHGPPGPTFFRQQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MAIVQTLPVPLEPAPEAATAPQAPVMGSVSSLISGRPCPGGPAPPRHHGPPGPTFFRQQD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GLLRGGYEAQEPLCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDFRTESPPSPSSDVEDAREQRAHNAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GLLRGGYEAQEPLCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDFRTESPPSPSSDVEDAREQRAHNAHL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RGPPPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRGAPSLPSFMGPRATGLSGSQGSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RGPPPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRGAPSLPSFMGPRATGLSGSQGSLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCPSGTLSDSGRNSLSSLPTYSTGGAEPTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCPSGTLSDSGRNSLSSLPTYSTGGAEPTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SSPGGHLPSHGSGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVAGGLLGSGTRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SSPGGHLPSHGSGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVAGGLLGSGTRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDREAELQQLRDSLDENEATMCQAYEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDREAELQQLRDSLDENEATMCQAYEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RQRHWQREREALREDCAAQAQRAQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQDDFAQLLQEREQLER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RQRHWQREREALREDCAAQAQRAQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQDDFAQLLQEREQLER
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQKGSELVALRVALRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQKGSELVALRVALRE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQELQRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQELQRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PVPPATADPFLLAESDEAKVQRAAAGVGGSLRAQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PVPPATADPFLLAESDEAKVQRAAAGVGGSLRAQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGER
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCIC
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LEEITATEI
:::::::::
XP_005 LEEITATEI
>>XP_016872269 (OMIM: 610454) PREDICTED: leucine zipper (669 aa)
initn: 4469 init1: 4469 opt: 4469 Z-score: 2064.0 bits: 392.3 E(85289): 3.2e-108
Smith-Waterman score: 4469; 100.0% identity (100.0% similar) in 669 aa overlap (1-669:1-669)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAIVQTLPVPLEPAPEAATAPQAPVMGSVSSLISGRPCPGGPAPPRHHGPPGPTFFRQQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAIVQTLPVPLEPAPEAATAPQAPVMGSVSSLISGRPCPGGPAPPRHHGPPGPTFFRQQD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GLLRGGYEAQEPLCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDFRTESPPSPSSDVEDAREQRAHNAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLLRGGYEAQEPLCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDFRTESPPSPSSDVEDAREQRAHNAHL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RGPPPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRGAPSLPSFMGPRATGLSGSQGSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RGPPPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRGAPSLPSFMGPRATGLSGSQGSLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCPSGTLSDSGRNSLSSLPTYSTGGAEPTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCPSGTLSDSGRNSLSSLPTYSTGGAEPTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SSPGGHLPSHGSGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVAGGLLGSGTRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSPGGHLPSHGSGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVAGGLLGSGTRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDREAELQQLRDSLDENEATMCQAYEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDREAELQQLRDSLDENEATMCQAYEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RQRHWQREREALREDCAAQAQRAQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQDDFAQLLQEREQLER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RQRHWQREREALREDCAAQAQRAQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQDDFAQLLQEREQLER
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQKGSELVALRVALRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQKGSELVALRVALRE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQELQRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQELQRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PVPPATADPFLLAESDEAKVQRAAAGVGGSLRAQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PVPPATADPFLLAESDEAKVQRAAAGVGGSLRAQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGER
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCIC
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LEEITATEI
:::::::::
XP_016 LEEITATEI
>>NP_115805 (OMIM: 610454) leucine zipper putative tumor (669 aa)
initn: 4469 init1: 4469 opt: 4469 Z-score: 2064.0 bits: 392.3 E(85289): 3.2e-108
Smith-Waterman score: 4469; 100.0% identity (100.0% similar) in 669 aa overlap (1-669:1-669)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAIVQTLPVPLEPAPEAATAPQAPVMGSVSSLISGRPCPGGPAPPRHHGPPGPTFFRQQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 MAIVQTLPVPLEPAPEAATAPQAPVMGSVSSLISGRPCPGGPAPPRHHGPPGPTFFRQQD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GLLRGGYEAQEPLCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDFRTESPPSPSSDVEDAREQRAHNAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 GLLRGGYEAQEPLCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDFRTESPPSPSSDVEDAREQRAHNAHL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RGPPPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRGAPSLPSFMGPRATGLSGSQGSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 RGPPPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRGAPSLPSFMGPRATGLSGSQGSLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCPSGTLSDSGRNSLSSLPTYSTGGAEPTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 QLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCPSGTLSDSGRNSLSSLPTYSTGGAEPTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SSPGGHLPSHGSGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVAGGLLGSGTRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 SSPGGHLPSHGSGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVAGGLLGSGTRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDREAELQQLRDSLDENEATMCQAYEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 SPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDREAELQQLRDSLDENEATMCQAYEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RQRHWQREREALREDCAAQAQRAQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQDDFAQLLQEREQLER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 RQRHWQREREALREDCAAQAQRAQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQDDFAQLLQEREQLER
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQKGSELVALRVALRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 RCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQKGSELVALRVALRE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQELQRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 ARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQELQRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PVPPATADPFLLAESDEAKVQRAAAGVGGSLRAQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 PVPPATADPFLLAESDEAKVQRAAAGVGGSLRAQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGER
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 LAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCIC
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LEEITATEI
:::::::::
NP_115 LEEITATEI
>>NP_001305028 (OMIM: 610454) leucine zipper putative tu (669 aa)
initn: 4469 init1: 4469 opt: 4469 Z-score: 2064.0 bits: 392.3 E(85289): 3.2e-108
Smith-Waterman score: 4469; 100.0% identity (100.0% similar) in 669 aa overlap (1-669:1-669)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAIVQTLPVPLEPAPEAATAPQAPVMGSVSSLISGRPCPGGPAPPRHHGPPGPTFFRQQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAIVQTLPVPLEPAPEAATAPQAPVMGSVSSLISGRPCPGGPAPPRHHGPPGPTFFRQQD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GLLRGGYEAQEPLCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDFRTESPPSPSSDVEDAREQRAHNAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLLRGGYEAQEPLCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDFRTESPPSPSSDVEDAREQRAHNAHL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RGPPPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRGAPSLPSFMGPRATGLSGSQGSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGPPPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRGAPSLPSFMGPRATGLSGSQGSLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCPSGTLSDSGRNSLSSLPTYSTGGAEPTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCPSGTLSDSGRNSLSSLPTYSTGGAEPTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SSPGGHLPSHGSGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVAGGLLGSGTRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSPGGHLPSHGSGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVAGGLLGSGTRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDREAELQQLRDSLDENEATMCQAYEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDREAELQQLRDSLDENEATMCQAYEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RQRHWQREREALREDCAAQAQRAQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQDDFAQLLQEREQLER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RQRHWQREREALREDCAAQAQRAQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQDDFAQLLQEREQLER
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQKGSELVALRVALRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQKGSELVALRVALRE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQELQRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQELQRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PVPPATADPFLLAESDEAKVQRAAAGVGGSLRAQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PVPPATADPFLLAESDEAKVQRAAAGVGGSLRAQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGER
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCIC
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LEEITATEI
:::::::::
NP_001 LEEITATEI
>>NP_001305030 (OMIM: 610454) leucine zipper putative tu (449 aa)
initn: 2019 init1: 2019 opt: 2052 Z-score: 962.0 bits: 187.8 E(85289): 7.6e-47
Smith-Waterman score: 2527; 67.1% identity (67.1% similar) in 669 aa overlap (1-669:1-449)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAIVQTLPVPLEPAPEAATAPQAPVMGSVSSLISGRPCPGGPAPPRHHGPPGPTFFRQQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAIVQTLPVPLEPAPEAATAPQAPVMGSVSSLISGRPCPGGPAPPRHHGPPGPTFFRQQD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GLLRGGYEAQEPLCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDFRTESPPSPSSDVEDAREQRAHNAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLLRGGYEAQEPLCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDFRTESPPSPSSDVEDAREQRAHNAHL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RGPPPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRGAPSLPSFMGPRATGLSGSQGSLT
::::::::::::::::
NP_001 RGPPPKLIPVSGKLEK--------------------------------------------
130
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCPSGTLSDSGRNSLSSLPTYSTGGAEPTT
NP_001 ------------------------------------------------------------
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SSPGGHLPSHGSGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVAGGLLGSGTRA
NP_001 ------------------------------------------------------------
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDREAELQQLRDSLDENEATMCQAYEE
::::
NP_001 --------------------------------------------------------AYEE
140
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RQRHWQREREALREDCAAQAQRAQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQDDFAQLLQEREQLER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RQRHWQREREALREDCAAQAQRAQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQDDFAQLLQEREQLER
150 160 170 180 190 200
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQKGSELVALRVALRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQKGSELVALRVALRE
210 220 230 240 250 260
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQELQRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQELQRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREP
270 280 290 300 310 320
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PVPPATADPFLLAESDEAKVQRAAAGVGGSLRAQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PVPPATADPFLLAESDEAKVQRAAAGVGGSLRAQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGER
330 340 350 360 370 380
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCIC
390 400 410 420 430 440
pF1KSD LEEITATEI
:::::::::
NP_001 LEEITATEI
>>XP_016872270 (OMIM: 610454) PREDICTED: leucine zipper (449 aa)
initn: 2019 init1: 2019 opt: 2052 Z-score: 962.0 bits: 187.8 E(85289): 7.6e-47
Smith-Waterman score: 2527; 67.1% identity (67.1% similar) in 669 aa overlap (1-669:1-449)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAIVQTLPVPLEPAPEAATAPQAPVMGSVSSLISGRPCPGGPAPPRHHGPPGPTFFRQQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAIVQTLPVPLEPAPEAATAPQAPVMGSVSSLISGRPCPGGPAPPRHHGPPGPTFFRQQD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GLLRGGYEAQEPLCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDFRTESPPSPSSDVEDAREQRAHNAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLLRGGYEAQEPLCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDFRTESPPSPSSDVEDAREQRAHNAHL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RGPPPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRGAPSLPSFMGPRATGLSGSQGSLT
::::::::::::::::
XP_016 RGPPPKLIPVSGKLEK--------------------------------------------
130
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCPSGTLSDSGRNSLSSLPTYSTGGAEPTT
XP_016 ------------------------------------------------------------
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SSPGGHLPSHGSGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVAGGLLGSGTRA
XP_016 ------------------------------------------------------------
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDREAELQQLRDSLDENEATMCQAYEE
::::
XP_016 --------------------------------------------------------AYEE
140
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RQRHWQREREALREDCAAQAQRAQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQDDFAQLLQEREQLER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RQRHWQREREALREDCAAQAQRAQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQDDFAQLLQEREQLER
150 160 170 180 190 200
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQKGSELVALRVALRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQKGSELVALRVALRE
210 220 230 240 250 260
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQELQRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQELQRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREP
270 280 290 300 310 320
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PVPPATADPFLLAESDEAKVQRAAAGVGGSLRAQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PVPPATADPFLLAESDEAKVQRAAAGVGGSLRAQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGER
330 340 350 360 370 380
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCIC
390 400 410 420 430 440
pF1KSD LEEITATEI
:::::::::
XP_016 LEEITATEI
>>XP_005260950 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zipper (673 aa)
initn: 847 init1: 537 opt: 994 Z-score: 475.9 bits: 98.4 E(85289): 9e-20
Smith-Waterman score: 1114; 38.9% identity (59.5% similar) in 696 aa overlap (1-637:1-639)
10 20 30
pF1KSD MAIVQTLPVPLEPA--PEAATAPQ----AP-----VMGSVSSLIS----------GRPCP
:: ..:::: .:. : : ::. .: .::::.: .. :
XP_005 MAKLETLPVRADPGRDPLLAFAPRPSELGPPDPRLAMGSVGSGVAHAQEFAMKSVGTRTG
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD GGPAPPRHHGPPGPTFFRQQDGLLR---GGYEAQEP-LCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDF
:: . :: : . .: : : : ... : .. . .. : . .
XP_005 GGGSQGSFPGPRG-----SGSGASRERPGRYPSEDKGLANSLYLNGELRGSDHTDVCGNV
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KSD RTESPPSPSSDVED-AREQRAHNAHLRGPPPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPK
: : :: : : : . .: ::::. .::::.. : :.::.:::::.::
XP_005 VGSSGGSSSSGGSDKAPPQYREPSH----PPKLLATSGKLDQCSEP-LVRPSAFKPVVPK
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KSD PRGAPSLPSFMGPRATGLS-GSQGSLTQLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCP
. :. .. :...: : :: :: .. ..: . . : :.:
XP_005 --NFHSMQNLCPPQTNGTPEGRQGP-----GGLKGGLDKSRTMT----P------AGGSG
180 190 200 210
220 230 240 250 260
pF1KSD SGTLSDSGRNSLSSLPTYSTGGAE---PTTSSPGGHL-----PSHGSGRGALPGPARGVP
:: :::::::::.::::::.. .. : ..: . :. :.::: :. : . :
XP_005 SG-LSDSGRNSLTSLPTYSSSYSQHLAPLSASTS-HINRIGTASYGSGSGGSSGGGSGYQ
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KSD TGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVAGGLLGSGTRASPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALL
. :::::.::.....: :: : :::: . : : ::: ::.
XP_005 DLGT-SDSGRASSKSGSSSSMGR--PGHLGSGEGG-------GGGLPFAACSPPSPSALI
280 290 300 310 320
330 340 350 360 370 380
pF1KSD HCVLEGKLRDREAELQQLRDSLDENEATMCQAYEERQRHWQREREALREDCAAQ----AQ
. :: .: ..: :. :: ::...::.. :. ::::. :.:: ::. :... :.
XP_005 QE-LEERLWEKEQEVAALRRSLEQSEAAVAQVLEERQKAWERELAELRQGCSGKLQQVAR
330 340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KSD RAQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQDDFAQLLQEREQLERRCATLEREQRELGPRLEETKW
::::::: :::::..:::.:.:::.. :.:...::.:: . :. ..:: .. ::.:::::
XP_005 RAQRAQQGLQLQVLRLQQDKKQLQEEAARLMRQREELEDKVAACQKEQADFLPRIEETKW
390 400 410 420 430 440
450 460 470 480 490 500
pF1KSD EVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQKGSELVALRVALREARATLRVSEGRARGLQEAARA
:::::.:::::::::::.:::.. :: ::.:.:: :::.::.:: .: . .:... .
XP_005 EVCQKAGEISLLKQQLKDSQADVSQKLSEIVGLRSQLREGRASLREKEEQLLSLRDSFSS
450 460 470 480 490 500
510 520 530 540 550 560
pF1KSD RELELEACSQELQRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREPPVPPATA-DPFLLAESDEAKV
.. :: : : :.: : :: :: : . ::::::.
XP_005 KQASLE---------------LGE--GELPAACLKPALTPVDPAEPQDALATCESDEAKM
510 520 530 540
570 580 590 600
pF1KSD QR-----AAAGV---------GG-----SLRAQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGERL
.: :::.. :: .:: .: ::..:: ::: :.: :: ::
XP_005 RRQAGVAAAASLVSVDGEAEAGGESGTRALRREVGRLQAELAAERRARERQGASFAEERR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD AWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCICL
.: :::.::.:::::: .:..::.::.:::..:..
XP_005 VWLEEKEKVIEYQKQLQLSYVEMYQRNQQLERRLRERGAAGGASTPTPQHGEEKKAWTPS
610 620 630 640 650 660
pF1KSD EEITATEI
XP_005 RLERIESTEI
670
>>XP_005260949 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zipper (673 aa)
initn: 847 init1: 537 opt: 994 Z-score: 475.9 bits: 98.4 E(85289): 9e-20
Smith-Waterman score: 1114; 38.9% identity (59.5% similar) in 696 aa overlap (1-637:1-639)
10 20 30
pF1KSD MAIVQTLPVPLEPA--PEAATAPQ----AP-----VMGSVSSLIS----------GRPCP
:: ..:::: .:. : : ::. .: .::::.: .. :
XP_005 MAKLETLPVRADPGRDPLLAFAPRPSELGPPDPRLAMGSVGSGVAHAQEFAMKSVGTRTG
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD GGPAPPRHHGPPGPTFFRQQDGLLR---GGYEAQEP-LCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDF
:: . :: : . .: : : : ... : .. . .. : . .
XP_005 GGGSQGSFPGPRG-----SGSGASRERPGRYPSEDKGLANSLYLNGELRGSDHTDVCGNV
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KSD RTESPPSPSSDVED-AREQRAHNAHLRGPPPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPK
: : :: : : : . .: ::::. .::::.. : :.::.:::::.::
XP_005 VGSSGGSSSSGGSDKAPPQYREPSH----PPKLLATSGKLDQCSEP-LVRPSAFKPVVPK
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KSD PRGAPSLPSFMGPRATGLS-GSQGSLTQLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCP
. :. .. :...: : :: :: .. ..: . . : :.:
XP_005 --NFHSMQNLCPPQTNGTPEGRQGP-----GGLKGGLDKSRTMT----P------AGGSG
180 190 200 210
220 230 240 250 260
pF1KSD SGTLSDSGRNSLSSLPTYSTGGAE---PTTSSPGGHL-----PSHGSGRGALPGPARGVP
:: :::::::::.::::::.. .. : ..: . :. :.::: :. : . :
XP_005 SG-LSDSGRNSLTSLPTYSSSYSQHLAPLSASTS-HINRIGTASYGSGSGGSSGGGSGYQ
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KSD TGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVAGGLLGSGTRASPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALL
. :::::.::.....: :: : :::: . : : ::: ::.
XP_005 DLGT-SDSGRASSKSGSSSSMGR--PGHLGSGEGG-------GGGLPFAACSPPSPSALI
280 290 300 310 320
330 340 350 360 370 380
pF1KSD HCVLEGKLRDREAELQQLRDSLDENEATMCQAYEERQRHWQREREALREDCAAQ----AQ
. :: .: ..: :. :: ::...::.. :. ::::. :.:: ::. :... :.
XP_005 QE-LEERLWEKEQEVAALRRSLEQSEAAVAQVLEERQKAWERELAELRQGCSGKLQQVAR
330 340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KSD RAQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQDDFAQLLQEREQLERRCATLEREQRELGPRLEETKW
::::::: :::::..:::.:.:::.. :.:...::.:: . :. ..:: .. ::.:::::
XP_005 RAQRAQQGLQLQVLRLQQDKKQLQEEAARLMRQREELEDKVAACQKEQADFLPRIEETKW
390 400 410 420 430 440
450 460 470 480 490 500
pF1KSD EVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQKGSELVALRVALREARATLRVSEGRARGLQEAARA
:::::.:::::::::::.:::.. :: ::.:.:: :::.::.:: .: . .:... .
XP_005 EVCQKAGEISLLKQQLKDSQADVSQKLSEIVGLRSQLREGRASLREKEEQLLSLRDSFSS
450 460 470 480 490 500
510 520 530 540 550 560
pF1KSD RELELEACSQELQRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREPPVPPATA-DPFLLAESDEAKV
.. :: : : :.: : :: :: : . ::::::.
XP_005 KQASLE---------------LGE--GELPAACLKPALTPVDPAEPQDALATCESDEAKM
510 520 530 540
570 580 590 600
pF1KSD QR-----AAAGV---------GG-----SLRAQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGERL
.: :::.. :: .:: .: ::..:: ::: :.: :: ::
XP_005 RRQAGVAAAASLVSVDGEAEAGGESGTRALRREVGRLQAELAAERRARERQGASFAEERR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD AWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLEQELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCICL
.: :::.::.:::::: .:..::.::.:::..:..
XP_005 VWLEEKEKVIEYQKQLQLSYVEMYQRNQQLERRLRERGAAGGASTPTPQHGEEKKAWTPS
610 620 630 640 650 660
pF1KSD EEITATEI
XP_005 RLERIESTEI
670
>>XP_011527710 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zipper (703 aa)
initn: 847 init1: 537 opt: 994 Z-score: 475.6 bits: 98.4 E(85289): 9.4e-20
Smith-Waterman score: 1114; 38.9% identity (59.5% similar) in 696 aa overlap (1-637:31-669)
10 20
pF1KSD MAIVQTLPVPLEPA--PEAATAPQ----AP
:: ..:::: .:. : : ::. .:
XP_011 MAPADRASEGPRLEDPSAPQPLGKCPPGLVMAKLETLPVRADPGRDPLLAFAPRPSELGP
10 20 30 40 50 60
30 40 50 60
pF1KSD -----VMGSVSSLIS----------GRPCPGGPAPPRHHGPPGPTFFRQQDGLLR---GG
.::::.: .. : :: . :: : . .: : :
XP_011 PDPRLAMGSVGSGVAHAQEFAMKSVGTRTGGGGSQGSFPGPRG-----SGSGASRERPGR
70 80 90 100 110
70 80 90 100 110 120
pF1KSD YEAQEP-LCPAVPPRKAVPVTSFTYINEDFRTESPPSPSSDVED-AREQRAHNAHLRGPP
: ... : .. . .. : . . : : :: : : : . .: :
XP_011 YPSEDKGLANSLYLNGELRGSDHTDVCGNVVGSSGGSSSSGGSDKAPPQYREPSH----P
120 130 140 150 160 170
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRGAPSLPSFMGPRATGLS-GSQGSLTQLF
:::. .::::.. : :.::.:::::.:: . :. .. :...: : ::
XP_011 PKLLATSGKLDQCSEP-LVRPSAFKPVVPK--NFHSMQNLCPPQTNGTPEGRQGP-----
180 190 200 210 220
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCPSGTLSDSGRNSLSSLPTYSTGGAE---PTT
:: .. ..: . . : :.: :: :::::::::.::::::.. .. : .
XP_011 GGLKGGLDKSRTMT----P------AGGSGSG-LSDSGRNSLTSLPTYSSSYSQHLAPLS
230 240 250 260 270
250 260 270 280 290
pF1KSD SSPGGHL-----PSHGSGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSSSSKSTGSLGGRVAGGLLG
.: . :. :.::: :. : . : . :::::.::.....: :: : ::
XP_011 ASTS-HINRIGTASYGSGSGGSSGGGSGYQDLGT-SDSGRASSKSGSSSSMGR--PGHLG
280 290 300 310 320
300 310 320 330 340 350
pF1KSD SGTRASPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDREAELQQLRDSLDENEATMC
:: . : : ::: ::.. :: .: ..: :. :: ::...::..
XP_011 SGEGG-------GGGLPFAACSPPSPSALIQE-LEERLWEKEQEVAALRRSLEQSEAAVA
330 340 350 360 370 380
360 370 380 390 400 410
pF1KSD QAYEERQRHWQREREALREDCAAQ----AQRAQRAQQLLQLQVFQLQQEKRQLQDDFAQL
:. ::::. :.:: ::. :... :.::::::: :::::..:::.:.:::.. :.:
XP_011 QVLEERQKAWERELAELRQGCSGKLQQVARRAQRAQQGLQLQVLRLQQDKKQLQEEAARL
390 400 410 420 430 440
420 430 440 450 460 470
pF1KSD LQEREQLERRCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLLKQQLKESQAELVQKGSEL
...::.:: . :. ..:: .. ::.::::::::::.:::::::::::.:::.. :: ::.
XP_011 MRQREELEDKVAACQKEQADFLPRIEETKWEVCQKAGEISLLKQQLKDSQADVSQKLSEI
450 460 470 480 490 500
480 490 500 510 520 530
pF1KSD VALRVALREARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQELQRHRQEAEQLREKAGQLD
:.:: :::.::.:: .: . .:... ... :: : : :.:
XP_011 VGLRSQLREGRASLREKEEQLLSLRDSFSSKQASLE---------------LGE--GELP
510 520 530 540
540 550 560 570
pF1KSD AEAAGLREPPVPPATA-DPFLLAESDEAKVQR-----AAAGV---------GG-----SL
: :: :: : . ::::::..: :::.. :: .:
XP_011 AACLKPALTPVDPAEPQDALATCESDEAKMRRQAGVAAAASLVSVDGEAEAGGESGTRAL
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KSD RAQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGERLAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQL
: .: ::..:: ::: :.: :: :: .: :::.::.:::::: .:..::.::.::
XP_011 RREVGRLQAELAAERRARERQGASFAEERRVWLEEKEKVIEYQKQLQLSYVEMYQRNQQL
610 620 630 640 650 660
640 650 660
pF1KSD EQELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCICLEEITATEI
:..:..
XP_011 ERRLRERGAAGGASTPTPQHGEEKKAWTPSRLERIESTEI
670 680 690 700
669 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 07:25:36 2016 done: Thu Nov 3 07:25:38 2016
Total Scan time: 14.240 Total Display time: 0.140
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]