Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1848
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1848, 404 aa
1>>>pF1KSDA1848 404 - 404 aa - 404 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6554+/-0.000902; mu= 6.8044+/- 0.054
mean_var=127.5453+/-26.052, 0's: 0 Z-trim(110.2): 50 B-trim: 392 in 1/50
Lambda= 0.113564
statistics sampled from 11382 (11431) to 11382 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.706), E-opt: 0.2 (0.351), width: 16
Scan time: 2.910
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS69680.1 SH3GLB2 gene_id:56904|Hs108|chr9 ( 404) 2611 438.8 4.3e-123
CCDS6916.1 SH3GLB2 gene_id:56904|Hs108|chr9 ( 395) 1812 307.9 1.1e-83
CCDS72819.1 SH3GLB1 gene_id:51100|Hs108|chr1 ( 394) 1228 212.2 6.8e-55
CCDS55612.1 SH3GLB1 gene_id:51100|Hs108|chr1 ( 386) 900 158.5 1e-38
CCDS710.1 SH3GLB1 gene_id:51100|Hs108|chr1 ( 365) 897 158.0 1.3e-38
CCDS55613.1 SH3GLB1 gene_id:51100|Hs108|chr1 ( 265) 387 74.3 1.5e-13
>>CCDS69680.1 SH3GLB2 gene_id:56904|Hs108|chr9 (404 aa)
initn: 2611 init1: 2611 opt: 2611 Z-score: 2323.4 bits: 438.8 E(32554): 4.3e-123
Smith-Waterman score: 2611; 100.0% identity (100.0% similar) in 404 aa overlap (1-404:1-404)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDFNMKKLASDAGIFFTRAVQFTEEKFGQAEKTELDAHFENLLARADSTKNWTEKILRQT
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CCDS69 MDFNMKKLASDAGIFFTRAVQFTEEKFGQAEKTELDAHFENLLARADSTKNWTEKILRQT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EVLLQPNPSARVEEFLYEKLDRKVPSRVTNGELLAQYMADAASELGPTTPYGKTLIKVAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 EVLLQPNPSARVEEFLYEKLDRKVPSRVTNGELLAQYMADAASELGPTTPYGKTLIKVAE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AEKQLGAAERDFIHTASISFLTPLRNFLEGDWKTISKERRLLQNRRLDLDACKARLKKAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 AEKQLGAAERDFIHTASISFLTPLRNFLEGDWKTISKERRLLQNRRLDLDACKARLKKAK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD AAEAKATCEGDTVPDFQETRPRNYILSASASALWNDEVDKAEQELRVAQTEFDRQAEVTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 AAEAKATCEGDTVPDFQETRPRNYILSASASALWNDEVDKAEQELRVAQTEFDRQAEVTR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LLLEGISSTHVNHLRCLHEFVKSQTTYYAQCYRHMLDLQKQLGSSQGAIFPGTFVGTTEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LLLEGISSTHVNHLRCLHEFVKSQTTYYAQCYRHMLDLQKQLGSSQGAIFPGTFVGTTEP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ASPPLSSTSPTTAAATMPVVPSVASLAPPGEASLCLEEVAPPASGTRKARVLYDYEAADS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ASPPLSSTSPTTAAATMPVVPSVASLAPPGEASLCLEEVAPPASGTRKARVLYDYEAADS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KSD SELALLADELITVYSLPGMDPDWLIGERGNKKGKVPVTYLELLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 SELALLADELITVYSLPGMDPDWLIGERGNKKGKVPVTYLELLS
370 380 390 400
>>CCDS6916.1 SH3GLB2 gene_id:56904|Hs108|chr9 (395 aa)
initn: 1922 init1: 1191 opt: 1812 Z-score: 1616.1 bits: 307.9 E(32554): 1.1e-83
Smith-Waterman score: 2502; 97.5% identity (97.5% similar) in 404 aa overlap (1-404:1-395)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDFNMKKLASDAGIFFTRAVQFTEEKFGQAEKTELDAHFENLLARADSTKNWTEKILRQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 MDFNMKKLASDAGIFFTRAVQFTEEKFGQAEKTELDAHFENLLARADSTKNWTEKILRQT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EVLLQPNPSARVEEFLYEKLDRKVPSRVTNGELLAQYMADAASELGPTTPYGKTLIKVAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 EVLLQPNPSARVEEFLYEKLDRKVPSRVTNGELLAQYMADAASELGPTTPYGKTLIKVAE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AEKQLGAAERDFIHTASISFLTPLRNFLEGDWKTISKERRLLQNRRLDLDACKARLKKAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 AEKQLGAAERDFIHTASISFLTPLRNFLEGDWKTISKERRLLQNRRLDLDACKARLKKAK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD AAEAKATCEGDTVPDFQETRPRNYILSASASALWNDEVDKAEQELRVAQTEFDRQAEVTR
::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 AAEAKAT----TVPDFQETRPRNYILSASASALWNDEVDKAEQELRVAQTEFDRQAEVTR
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LLLEGISSTHVNHLRCLHEFVKSQTTYYAQCYRHMLDLQKQLGSSQGAIFPGTFVGTTEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS69 LLLEGISSTHVNHLRCLHEFVKSQTTYYAQCYRHMLDLQKQLGR-----FPGTFVGTTEP
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ASPPLSSTSPTTAAATMPVVPSVASLAPPGEASLCLEEVAPPASGTRKARVLYDYEAADS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ASPPLSSTSPTTAAATMPVVPSVASLAPPGEASLCLEEVAPPASGTRKARVLYDYEAADS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400
pF1KSD SELALLADELITVYSLPGMDPDWLIGERGNKKGKVPVTYLELLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 SELALLADELITVYSLPGMDPDWLIGERGNKKGKVPVTYLELLS
360 370 380 390
>>CCDS72819.1 SH3GLB1 gene_id:51100|Hs108|chr1 (394 aa)
initn: 1551 init1: 892 opt: 1228 Z-score: 1099.0 bits: 212.2 E(32554): 6.8e-55
Smith-Waterman score: 1539; 60.2% identity (84.2% similar) in 412 aa overlap (1-404:4-394)
10 20 30 40 50
pF1KSD MDFNMKKLASDAGIFFTRAVQFTEEKFGQAEKTELDAHFENLLARADSTKNWTEKIL
::::.::::.::: :..:::::::::.:::::::::::.::::..:. :: :::::.
CCDS72 MNIMDFNVKKLAADAGTFLSRAVQFTEEKLGQAEKTELDAHLENLLSKAECTKIWTEKIM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD RQTEVLLQPNPSARVEEFLYEKLDRKVPSRVTNGELLAQYMADAASELGPTTPYGKTLIK
.::::::::::.::.:::.:::::::.:::..: :::.::: ::..:.:: : ::..:::
CCDS72 KQTEVLLQPNPNARIEEFVYEKLDRKAPSRINNPELLGQYMIDAGTEFGPGTAYGNALIK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD VAEAEKQLGAAERDFIHTASISFLTPLRNFLEGDWKTISKERRLLQNRRLDLDACKARLK
.:..:..:.:.:..:.:....::::::::.:::.:::.:::.::::.:::::: :.:::
CCDS72 CGETQKRIGTADRELIQTSALNFLTPLRNFIEGDYKTIAKERKLLQNKRLDLDAAKTRLK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KAKAAEAK------ATCEGDTVP-DFQETRPRNYILSASASALWNDEVDKAEQELRVAQT
::::::.. : :::.. .: .:.:. . : :.:::::..:.
CCDS72 KAKAAETRNSQLNSARLEGDNIMVNF------SYMLNF-LHVKWL----KSEQELRITQS
190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD EFDRQAEVTRLLLEGISSTHVNHLRCLHEFVKSQTTYYAQCYRHMLDLQKQLGSSQGAIF
:::::::.::::::::::::..:::::..::..: :::::::..:::::::::: :
CCDS72 EFDRQAEITRLLLEGISSTHAHHLRCLNDFVEAQMTYYAQCYQYMLDLQKQLGS-----F
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KSD PGTFVGTTEPAS-PPLSSTSPTTAAATMPVVPSVASLAPPGEASLCLEEVAPPASGTRKA
:........ .: :. :. :.. ... . : .. :.. : :.: ::.:::
CCDS72 PSNYLSNNNQTSVTPVPSVLPNAIGSSAMASTSGLVITSPSNLSD-LKEC----SGSRKA
290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KSD RVLYDYEAADSSELALLADELITVYSLPGMDPDWLIGERGNKKGKVPVTYLELLS
::::::.::.:.::.:::::.:::.:. ::: :::.:::::.:::::.::::::.
CCDS72 RVLYDYDAANSTELSLLADEVITVFSVVGMDSDWLMGERGNQKGKVPITYLELLN
340 350 360 370 380 390
>>CCDS55612.1 SH3GLB1 gene_id:51100|Hs108|chr1 (386 aa)
initn: 1579 init1: 892 opt: 900 Z-score: 808.7 bits: 158.5 E(32554): 1e-38
Smith-Waterman score: 1564; 60.7% identity (84.9% similar) in 405 aa overlap (1-404:4-386)
10 20 30 40 50
pF1KSD MDFNMKKLASDAGIFFTRAVQFTEEKFGQAEKTELDAHFENLLARADSTKNWTEKIL
::::.::::.::: :..:::::::::.:::::::::::.::::..:. :: :::::.
CCDS55 MNIMDFNVKKLAADAGTFLSRAVQFTEEKLGQAEKTELDAHLENLLSKAECTKIWTEKIM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD RQTEVLLQPNPSARVEEFLYEKLDRKVPSRVTNGELLAQYMADAASELGPTTPYGKTLIK
.::::::::::.::.:::.:::::::.:::..: :::.::: ::..:.:: : ::..:::
CCDS55 KQTEVLLQPNPNARIEEFVYEKLDRKAPSRINNPELLGQYMIDAGTEFGPGTAYGNALIK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD VAEAEKQLGAAERDFIHTASISFLTPLRNFLEGDWKTISKERRLLQNRRLDLDACKARLK
.:..:..:.:.:..:.:....::::::::.:::.:::.:::.::::.:::::: :.:::
CCDS55 CGETQKRIGTADRELIQTSALNFLTPLRNFIEGDYKTIAKERKLLQNKRLDLDAAKTRLK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KAKAAEAKATCEGDTVPDFQETRPRNYILSASASALWNDEVDKAEQELRVAQTEFDRQAE
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CCDS55 KAKAAETRNS---------QLNSAR---LEGDNIMIWAEEVTKSEQELRITQSEFDRQAE
190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VTRLLLEGISSTHVNHLRCLHEFVKSQTTYYAQCYRHMLDLQKQLGSSQGAIFPGTFVGT
.::::::::::::..:::::..::..: :::::::..:::::::::: ::......
CCDS55 ITRLLLEGISSTHAHHLRCLNDFVEAQMTYYAQCYQYMLDLQKQLGS-----FPSNYLSN
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TEPAS-PPLSSTSPTTAAATMPVVPSVASLAPPGEASLCLEEVAPPASGTRKARVLYDYE
.. .: :. :. :.. ... . : .. :.. : :.: ::.:::::::::.
CCDS55 NNQTSVTPVPSVLPNAIGSSAMASTSGLVITSPSNLSD-LKEC----SGSRKARVLYDYD
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400
pF1KSD AADSSELALLADELITVYSLPGMDPDWLIGERGNKKGKVPVTYLELLS
::.:.::.:::::.:::.:. ::: :::.:::::.:::::.::::::.
CCDS55 AANSTELSLLADEVITVFSVVGMDSDWLMGERGNQKGKVPITYLELLN
340 350 360 370 380
>>CCDS710.1 SH3GLB1 gene_id:51100|Hs108|chr1 (365 aa)
initn: 1228 init1: 897 opt: 897 Z-score: 806.4 bits: 158.0 E(32554): 1.3e-38
Smith-Waterman score: 1491; 59.0% identity (82.2% similar) in 405 aa overlap (1-404:4-365)
10 20 30 40 50
pF1KSD MDFNMKKLASDAGIFFTRAVQFTEEKFGQAEKTELDAHFENLLARADSTKNWTEKIL
::::.::::.::: :..:::::::::.:::::::::::.::::..:. :: :::::.
CCDS71 MNIMDFNVKKLAADAGTFLSRAVQFTEEKLGQAEKTELDAHLENLLSKAECTKIWTEKIM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD RQTEVLLQPNPSARVEEFLYEKLDRKVPSRVTNGELLAQYMADAASELGPTTPYGKTLIK
.::::::::::.::.:::.:::::::.:::..: :::.::: ::..:.:: : ::..:::
CCDS71 KQTEVLLQPNPNARIEEFVYEKLDRKAPSRINNPELLGQYMIDAGTEFGPGTAYGNALIK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD VAEAEKQLGAAERDFIHTASISFLTPLRNFLEGDWKTISKERRLLQNRRLDLDACKARLK
.:..:..:.:.:..:.:....::::::::.:::.:::.:::.::::.:::::: :.:::
CCDS71 CGETQKRIGTADRELIQTSALNFLTPLRNFIEGDYKTIAKERKLLQNKRLDLDAAKTRLK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KAKAAEAKATCEGDTVPDFQETRPRNYILSASASALWNDEVDKAEQELRVAQTEFDRQAE
::::::.. ...:::::..:.:::::::
CCDS71 KAKAAETR---------------------------------NSSEQELRITQSEFDRQAE
190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VTRLLLEGISSTHVNHLRCLHEFVKSQTTYYAQCYRHMLDLQKQLGSSQGAIFPGTFVGT
.::::::::::::..:::::..::..: :::::::..:::::::::: ::......
CCDS71 ITRLLLEGISSTHAHHLRCLNDFVEAQMTYYAQCYQYMLDLQKQLGS-----FPSNYLSN
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TEPAS-PPLSSTSPTTAAATMPVVPSVASLAPPGEASLCLEEVAPPASGTRKARVLYDYE
.. .: :. :. :.. ... . : .. :.. : :.: ::.:::::::::.
CCDS71 NNQTSVTPVPSVLPNAIGSSAMASTSGLVITSPSNLSD-LKEC----SGSRKARVLYDYD
270 280 290 300 310
360 370 380 390 400
pF1KSD AADSSELALLADELITVYSLPGMDPDWLIGERGNKKGKVPVTYLELLS
::.:.::.:::::.:::.:. ::: :::.:::::.:::::.::::::.
CCDS71 AANSTELSLLADEVITVFSVVGMDSDWLMGERGNQKGKVPITYLELLN
320 330 340 350 360
>>CCDS55613.1 SH3GLB1 gene_id:51100|Hs108|chr1 (265 aa)
initn: 709 init1: 381 opt: 387 Z-score: 357.0 bits: 74.3 E(32554): 1.5e-13
Smith-Waterman score: 981; 53.2% identity (77.9% similar) in 308 aa overlap (98-404:1-265)
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PSARVEEFLYEKLDRKVPSRVTNGELLAQYMADAASELGPTTPYGKTLIKVAEAEKQLGA
: ::..:.:: : ::..::: .:..:..:.
CCDS55 MIDAGTEFGPGTAYGNALIKCGETQKRIGT
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AERDFIHTASISFLTPLRNFLEGDWKTISKERRLLQNRRLDLDACKARLKKAKAAEAKAT
:.:..:.:....::::::::.:::.:::.:::.::::.:::::: :.:::::::::..
CCDS55 ADRELIQTSALNFLTPLRNFIEGDYKTIAKERKLLQNKRLDLDAAKTRLKKAKAAETR--
40 50 60 70 80
190 200 210 220 230 240
pF1KSD CEGDTVPDFQETRPRNYILSASASALWNDEVDKAEQELRVAQTEFDRQAEVTRLLLEGIS
...:::::..:.:::::::.:::::::::
CCDS55 -------------------------------NSSEQELRITQSEFDRQAEITRLLLEGIS
90 100 110
250 260 270 280 290 300
pF1KSD STHVNHLRCLHEFVKSQTTYYAQCYRHMLDLQKQLGSSQGAIFPGTFVGTTEPAS-PPLS
:::..:::::..::..: :::::::..:::::::::: ::........ .: :.
CCDS55 STHAHHLRCLNDFVEAQMTYYAQCYQYMLDLQKQLGS-----FPSNYLSNNNQTSVTPVP
120 130 140 150 160 170
310 320 330 340 350 360
pF1KSD STSPTTAAATMPVVPSVASLAPPGEASLCLEEVAPPASGTRKARVLYDYEAADSSELALL
:. :.. ... . : .. :.. : :.: ::.:::::::::.::.:.::.::
CCDS55 SVLPNAIGSSAMASTSGLVITSPSNLSD-LKEC----SGSRKARVLYDYDAANSTELSLL
180 190 200 210 220
370 380 390 400
pF1KSD ADELITVYSLPGMDPDWLIGERGNKKGKVPVTYLELLS
:::.:::.:. ::: :::.:::::.:::::.::::::.
CCDS55 ADEVITVFSVVGMDSDWLMGERGNQKGKVPITYLELLN
230 240 250 260
404 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 07:29:17 2016 done: Thu Nov 3 07:29:18 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]