Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1860
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1860, 688 aa
1>>>pF1KSDA1860 688 - 688 aa - 688 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.8354+/-0.000508; mu= -15.5654+/- 0.031
mean_var=505.9403+/-113.597, 0's: 0 Z-trim(121.6): 2075 B-trim: 2654 in 2/55
Lambda= 0.057020
statistics sampled from 35919 (38535) to 35919 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.759), E-opt: 0.2 (0.452), width: 16
Scan time: 14.250
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_113605 (OMIM: 606495) MAP/microtubule affinity- ( 688) 4596 393.3 1.6e-108
NP_001186796 (OMIM: 606495) MAP/microtubule affini ( 752) 4194 360.3 1.6e-98
XP_006723370 (OMIM: 606495) PREDICTED: MAP/microtu ( 685) 3627 313.6 1.6e-84
NP_001122391 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affini ( 744) 2730 239.8 2.8e-62
XP_005267698 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 738) 2715 238.6 6.6e-62
NP_001122390 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affini ( 753) 2715 238.6 6.6e-62
NP_002367 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affinity- ( 729) 2709 238.1 9.1e-62
XP_006720209 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 739) 2671 235.0 8.1e-61
XP_005267700 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 643) 2464 217.9 9.7e-56
XP_016876784 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 680) 2372 210.3 1.9e-53
XP_011535071 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 673) 2357 209.1 4.5e-53
XP_016876785 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 674) 2357 209.1 4.5e-53
XP_016876783 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 689) 2357 209.1 4.6e-53
XP_016876787 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 665) 2351 208.6 6.3e-53
XP_005273191 (OMIM: 606511) PREDICTED: serine/thre ( 781) 2179 194.5 1.3e-48
NP_001273053 (OMIM: 606511) serine/threonine-prote ( 796) 2179 194.5 1.3e-48
NP_001273055 (OMIM: 606511) serine/threonine-prote ( 780) 2167 193.5 2.5e-48
NP_061120 (OMIM: 606511) serine/threonine-protein ( 795) 2167 193.5 2.6e-48
XP_011507863 (OMIM: 606511) PREDICTED: serine/thre ( 788) 2141 191.4 1.1e-47
XP_016876791 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 613) 2082 186.4 2.7e-46
XP_016876792 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 607) 2067 185.2 6.3e-46
XP_016876789 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 622) 2067 185.2 6.4e-46
XP_016876790 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 622) 2067 185.2 6.4e-46
XP_016876793 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 598) 2061 184.7 8.8e-46
NP_001122392 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affini ( 713) 2023 181.6 8.7e-45
XP_016876781 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 722) 2023 181.6 8.8e-45
XP_016876780 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 728) 2023 181.7 8.9e-45
XP_005267699 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 737) 2023 181.7 9e-45
XP_016872799 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 763) 2017 181.2 1.3e-44
NP_001156769 (OMIM: 600526) serine/threonine-prote ( 709) 2013 180.8 1.5e-44
NP_004945 (OMIM: 600526) serine/threonine-protein ( 724) 2013 180.8 1.6e-44
NP_001034558 (OMIM: 600526) serine/threonine-prote ( 788) 2006 180.3 2.5e-44
NP_001156768 (OMIM: 600526) serine/threonine-prote ( 719) 2002 179.9 2.9e-44
XP_011543093 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 798) 2003 180.0 3e-44
XP_011543100 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 729) 1992 179.1 5.2e-44
XP_016872800 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 738) 1992 179.1 5.3e-44
XP_011543098 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 744) 1992 179.1 5.3e-44
XP_011543096 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 753) 1992 179.1 5.3e-44
XP_011543092 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 799) 1992 179.1 5.6e-44
NP_059672 (OMIM: 600526) serine/threonine-protein ( 745) 1991 179.0 5.6e-44
XP_011543095 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 784) 1985 178.6 8.2e-44
XP_011543094 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 793) 1985 178.6 8.2e-44
XP_011543091 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 808) 1985 178.6 8.4e-44
XP_011543099 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 739) 1981 178.2 9.8e-44
XP_011543097 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 745) 1981 178.2 9.9e-44
XP_016876782 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 708) 1979 178.0 1.1e-43
XP_016876798 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 587) 1902 171.6 7.5e-42
XP_016876795 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 596) 1887 170.4 1.8e-41
XP_016876796 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 596) 1887 170.4 1.8e-41
XP_016876799 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 572) 1881 169.9 2.4e-41
>>NP_113605 (OMIM: 606495) MAP/microtubule affinity-regu (688 aa)
initn: 4596 init1: 4596 opt: 4596 Z-score: 2069.1 bits: 393.3 E(85289): 1.6e-108
Smith-Waterman score: 4596; 100.0% identity (100.0% similar) in 688 aa overlap (1-688:1-688)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSSRTVLAPGNDRNSDTHGTLGSGRSSDKGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_113 MSSRTVLAPGNDRNSDTHGTLGSGRSSDKGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNYR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_113 LLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_113 LFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVHR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_113 DLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDIW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_113 SLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRCT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_113 LEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNEV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TATYLLLGRKTEEGGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSSTYHRQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_113 TATYLLLGRKTEEGGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSSTYHRQR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RHSDFCGPSPAPLHPKRSPTSTGEAELKEERLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSSPMVSSAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_113 RHSDFCGPSPAPLHPKRSPTSTGEAELKEERLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSSPMVSSAH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKENSSGTPRVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_113 NPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKENSSGTPRVP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PASPSSHSLAPPSGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPASPTLAHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_113 PASPSSHSLAPPSGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPASPTLAHE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD AAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVTLDPSKRQNSNRCVSGASLPQGSKIRSQTNLRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_113 AAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVTLDPSKRQNSNRCVSGASLPQGSKIRSQTNLRE
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KSD SGDLRSQVAIYLGIKRKPPPGCSDSPGV
::::::::::::::::::::::::::::
NP_113 SGDLRSQVAIYLGIKRKPPPGCSDSPGV
670 680
>>NP_001186796 (OMIM: 606495) MAP/microtubule affinity-r (752 aa)
initn: 4265 init1: 4194 opt: 4194 Z-score: 1889.9 bits: 360.3 E(85289): 1.6e-98
Smith-Waterman score: 4194; 99.2% identity (99.7% similar) in 633 aa overlap (1-633:1-633)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSSRTVLAPGNDRNSDTHGTLGSGRSSDKGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSSRTVLAPGNDRNSDTHGTLGSGRSSDKGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNYR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVHR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDIW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRCT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNEV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TATYLLLGRKTEEGGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSSTYHRQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TATYLLLGRKTEEGGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSSTYHRQR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RHSDFCGPSPAPLHPKRSPTSTGEAELKEERLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSSPMVSSAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RHSDFCGPSPAPLHPKRSPTSTGEAELKEERLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSSPMVSSAH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKENSSGTPRVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKENSSGTPRVP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PASPSSHSLAPPSGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPASPTLAHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PASPSSHSLAPPSGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPASPTLAHE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD AAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVTLDPSKRQNSNRCVSGASLPQGSKIRSQTNLRE
:::::::::::::::::::::::::::. .: .
NP_001 AAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVADEPERIGGPEVTSCHLPWDQTETAPRLLRFPW
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KSD SGDLRSQVAIYLGIKRKPPPGCSDSPGV
NP_001 SVKLTSSRPPEALMAALRQATAAARCRCRQPQPFLLACLHGGAGGPEPLSHFEVEVCQLP
670 680 690 700 710 720
>>XP_006723370 (OMIM: 606495) PREDICTED: MAP/microtubule (685 aa)
initn: 3793 init1: 3627 opt: 3627 Z-score: 1638.3 bits: 313.6 E(85289): 1.6e-84
Smith-Waterman score: 3627; 99.1% identity (99.6% similar) in 549 aa overlap (85-633:18-566)
60 70 80 90 100 110
pF1KSD HVGNYRLLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLN
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MSSRTVLAPGNDRNSDTVAIKIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLN
10 20 30 40
120 130 140 150 160 170
pF1KSD HPNIVKLFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 HPNIVKLFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQ
50 60 70 80 90 100
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KNIVHRDLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KNIVHRDLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDG
110 120 130 140 150 160
240 250 260 270 280 290
pF1KSD PEVDIWSLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PEVDIWSLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLN
170 180 190 200 210 220
300 310 320 330 340 350
pF1KSD PAKRCTLEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PAKRCTLEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTS
230 240 250 260 270 280
360 370 380 390 400 410
pF1KSD QKYNEVTATYLLLGRKTEEGGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QKYNEVTATYLLLGRKTEEGGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSS
290 300 310 320 330 340
420 430 440 450 460 470
pF1KSD TYHRQRRHSDFCGPSPAPLHPKRSPTSTGEAELKEERLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TYHRQRRHSDFCGPSPAPLHPKRSPTSTGEAELKEERLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSSP
350 360 370 380 390 400
480 490 500 510 520 530
pF1KSD MVSSAHNPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKENSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MVSSAHNPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKENSS
410 420 430 440 450 460
540 550 560 570 580 590
pF1KSD GTPRVPPASPSSHSLAPPSGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GTPRVPPASPSSHSLAPPSGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPAS
470 480 490 500 510 520
600 610 620 630 640 650
pF1KSD PTLAHEAAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVTLDPSKRQNSNRCVSGASLPQGSKIRS
:::::::::::::::::::::::::::::::::. .: .
XP_006 PTLAHEAAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVADEPERIGGPEVTSCHLPWDQTETAPR
530 540 550 560 570 580
660 670 680
pF1KSD QTNLRESGDLRSQVAIYLGIKRKPPPGCSDSPGV
XP_006 LLRFPWSVKLTSSRPPEALMAALRQATAAARCRCRQPQPFLLACLHGGAGGPEPLSHFEV
590 600 610 620 630 640
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250 260 270 280 290 300
pF1KSD SLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRCT
::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::..:.::::::: :: :
XP_006 SLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGT
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNEV
:::::::.::: :.: .::::..::: :..: :::..::::::..:::.:::...::.:.
XP_006 LEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEI
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410
pF1KSD TATYLLLGRKTEE---GGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSSTYH
::::::::::. : . . .. .:.::.:: :: .:.:..: : : ::: ::. .
XP_006 TATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLNNSTGQSP---HHKVQRSVSSS-Q
350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RQRRHSDFCGPS-PAPL-HPKRSPTSTGEAELKEERLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSSPM
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XP_006 KQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADSDLKEDGISSRKSSGSAVG--GKGIAPASPM
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480 490 500 510 520 530
pF1KSD VSSAHNPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKENSSG
...: :::::.::::.:.:: .: . :::::::::.:: :.: :.. ::::::.
XP_006 LGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSNTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSTI
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KSD TPRVPPASPSSHSLAPP-SGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPAS
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XP_006 PDQRTPVA-STHSISSAATPDRIRFPRGTASRSTFHG-QPRERRTA------TYNGPPAS
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pF1KSD PTLAHEAAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVTLDPSKRQNSNRCVSGASLPQGSKIRS
:.:.:::.:: : : .::::.:::::::::
XP_006 PSLSHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKLTRRNMSFRFIKRLPTEYERNGRYEGSSRNVS
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XP_006 AEQKDENKEAKPRSLRFTWSMKTTSSMDPGDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHG
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::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::: ::::::::
XP_005 LLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVK
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pF1KSD LFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVHR
:::::::::::::.:::::.::::::::.::::::::::.:::::::::.::::: ::::
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pF1KSD DLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDIW
:::::::::::. ::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::.:
XP_005 DLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVW
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRCT
::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::..:.::::::: :: :
XP_005 SLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGT
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNEV
:::::::.::: :.: .::::..::: :..: :::..::::::..:::.:::...::.:.
XP_005 LEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEI
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pF1KSD TATYLLLGRKTEE---GGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSSTYH
::::::::::. : . . .. .:.::.:: :: .:.:..: : : ::: ::. .
XP_005 TATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLNNSTGQS---PHHKVQRSVSSS-Q
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pF1KSD RQRRHSDFCGPS-PAPL-HPKRSPTSTGEAELKEERLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSSPM
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XP_005 KQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADSDLKEDGISSRKSSGSAVGG--KGIAPASPM
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD VSSAHNPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKENSSG
...: :::::.::::.:.:: .: . :::::::::.:: :.: :.. ::::::
XP_005 LGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSNTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSRN
480 490 500 510 520 530
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pF1KSD TPRVPPASPSSHSLAPPSGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPASP
XP_005 VSAEQKDENKEAKPRSLRFTWSMKTTSSMDPGDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCV
540 550 560 570 580 590
>>XP_016876784 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtubule (680 aa)
initn: 2006 init1: 1708 opt: 2372 Z-score: 1080.4 bits: 210.3 E(85289): 1.9e-53
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60 70 80 90 100 110
pF1KSD HVGNYRLLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLN
:::::::::::::.::::::::::::: ::
XP_016 MSTRTPLPTVNERDTENVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILN
10 20 30 40
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pF1KSD HPNIVKLFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQ
:::::::::::::::::::.:::::.::::::::.::::::::::.:::::::::.::::
XP_016 HPNIVKLFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQ
50 60 70 80 90 100
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pF1KSD KNIVHRDLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDG
: :::::::::::::::. ::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::
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110 120 130 140 150 160
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XP_016 PEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLN
170 180 190 200 210 220
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pF1KSD PAKRCTLEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTS
: :: ::::::::.::: :.: .::::..::: :..: :::..::::::..:::.:::..
XP_016 PIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSK
230 240 250 260 270 280
360 370 380 390 400 410
pF1KSD QKYNEVTATYLLLGRKTEE---GGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRS
.::.:.::::::::::. : . . .. .:.::.:: :: .:.:..: : : :::
XP_016 MKYDEITATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLNNSTGQSP---HHKVQRS
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pF1KSD SSSTYHRQRRHSDFCGPS-PAPL-HPKRSPTSTGEAELKEERLPGRKASCSTAGSGSRGL
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XP_016 VSSS-QKQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADSDLKEDGISSRKSSGSAVGG--KGI
350 360 370 380 390 400
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.... . .. :: . .... .. :
XP_016 KDENKEAKPRS-LRFTWSMKTTSSMDPGDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDG
580 590 600 610 620 630
688 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 07:32:06 2016 done: Thu Nov 3 07:32:08 2016
Total Scan time: 14.250 Total Display time: 0.190
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]