Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1872
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1872, 371 aa
1>>>pF1KSDA1872 371 - 371 aa - 371 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6340+/-0.000761; mu= 15.1874+/- 0.046
mean_var=74.2049+/-14.603, 0's: 0 Z-trim(108.8): 20 B-trim: 7 in 1/52
Lambda= 0.148887
statistics sampled from 10401 (10420) to 10401 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.32), width: 16
Scan time: 2.620
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45923.1 ATCAY gene_id:85300|Hs108|chr19 ( 371) 2476 541.0 6.4e-154
CCDS83375.1 PRUNE2 gene_id:158471|Hs108|chr9 ( 353) 1004 224.8 9.3e-59
CCDS47982.1 PRUNE2 gene_id:158471|Hs108|chr9 (3088) 1012 227.0 1.7e-58
CCDS81889.1 BNIP2 gene_id:663|Hs108|chr15 ( 376) 974 218.3 8.5e-57
CCDS10174.2 BNIP2 gene_id:663|Hs108|chr15 ( 435) 974 218.4 9.6e-57
CCDS978.2 BNIPL gene_id:149428|Hs108|chr1 ( 357) 969 217.3 1.7e-56
CCDS78407.1 PRUNE2 gene_id:158471|Hs108|chr9 (3062) 976 219.3 3.7e-56
CCDS53362.1 BNIPL gene_id:149428|Hs108|chr1 ( 275) 845 190.6 1.4e-48
CCDS56233.1 ARHGAP8 gene_id:23779|Hs108|chr22 ( 305) 348 83.8 2.1e-16
CCDS7922.1 ARHGAP1 gene_id:392|Hs108|chr11 ( 439) 349 84.1 2.5e-16
CCDS14060.2 ARHGAP8 gene_id:23779|Hs108|chr22 ( 433) 348 83.9 2.9e-16
CCDS54538.2 ARHGAP8 gene_id:553158|Hs108|chr22 ( 564) 348 84.0 3.6e-16
>>CCDS45923.1 ATCAY gene_id:85300|Hs108|chr19 (371 aa)
initn: 2476 init1: 2476 opt: 2476 Z-score: 2876.9 bits: 541.0 E(32554): 6.4e-154
Smith-Waterman score: 2476; 100.0% identity (100.0% similar) in 371 aa overlap (1-371:1-371)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGTTEATLRMENVDVKEEWQDEDLPRPLPEETGVELLGSPVEDTSSPPNTLNFNGAHRKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MGTTEATLRMENVDVKEEWQDEDLPRPLPEETGVELLGSPVEDTSSPPNTLNFNGAHRKR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KTLVAPEINISLDQSEGSLLSDDFLDTPDDLDINVDDIETPDETDSLEFLGNGNELEWED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KTLVAPEINISLDQSEGSLLSDDFLDTPDDLDINVDDIETPDETDSLEFLGNGNELEWED
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DTPVATAKNMPGDSADLFGDGTTEDGSAANGRLWRTVIIGEQEHRIDLHMIRPYMKVVTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DTPVATAKNMPGDSADLFGDGTTEDGSAANGRLWRTVIIGEQEHRIDLHMIRPYMKVVTH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GGYYGEGLNAIIVFAACFLPDSSLPDYHYIMENLFLYVISSLELLVAEDYMIVYLNGATP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GGYYGEGLNAIIVFAACFLPDSSLPDYHYIMENLFLYVISSLELLVAEDYMIVYLNGATP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RRRMPGIGWLKKCYQMIDRRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTVLAISRPFISVKFINKIQYVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RRRMPGIGWLKKCYQMIDRRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTVLAISRPFISVKFINKIQYVH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SLEDLEQLIPMEHVQIPDCVLQYEEERLKARRESARPQPEFVLPRSEEKPEVAPVENRSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SLEDLEQLIPMEHVQIPDCVLQYEEERLKARRESARPQPEFVLPRSEEKPEVAPVENRSA
310 320 330 340 350 360
370
pF1KSD LVSEDQETSMS
:::::::::::
CCDS45 LVSEDQETSMS
370
>>CCDS83375.1 PRUNE2 gene_id:158471|Hs108|chr9 (353 aa)
initn: 1249 init1: 962 opt: 1004 Z-score: 1168.4 bits: 224.8 E(32554): 9.3e-59
Smith-Waterman score: 1275; 61.6% identity (82.5% similar) in 315 aa overlap (22-336:27-328)
10 20 30 40 50
pF1KSD MGTTEATLRMENVDVKEEWQDEDLPRPLPEETGVELLGSPVEDTSSPPNTLNFNG
::. .: : :: : : .. :::.:..:
CCDS83 MLKSCSRASFSPSVRKPPLILRRLLSEDVGMDIPFEEGV-LSPSAADMRPEPPNSLDLND
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD AHRKRKTLVAPEINISLDQSEGSLLSDDFLDTPDDLDINVDDIETPDETDSLEFLGNGNE
.: .: :.::.::.::::::::.:::: ::.::..:::::...::::.::.:. :.
CCDS83 THPRRIKLTAPNINLSLDQSEGSILSDDNLDSPDEIDINVDELDTPDEADSFEYTGH---
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LEWEDDTPVATAKNMPGDSADLFGDGTTEDGSAANGRLWRTVIIGEQEHRIDLHMIRPYM
:: : ::.. :. .. . . :.:. : ::::::.:::::.:::...:.::
CCDS83 ---ED--P--TANKDSGQESESIPEYTAEEEREDN-RLWRTVVIGEQEQRIDMKVIEPYR
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KVVTHGGYYGEGLNAIIVFAACFLPDSSLPDYHYIMENLFLYVISSLELLVAEDYMIVYL
.:..::::::.::::::::::::::::: ::::.::::::::::.:::.::::::::::
CCDS83 RVISHGGYYGDGLNAIIVFAACFLPDSSRADYHYVMENLFLYVISTLELMVAEDYMIVYL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD NGATPRRRMPGIGWLKKCYQMIDRRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTVLAISRPFISVKFINK
:::::::::::.::.:::::::::::::::::.:::::::::::.::..::::: :: .:
CCDS83 NGATPRRRMPGLGWMKKCYQMIDRRLRKNLKSFIIVHPSWFIRTILAVTRPFISSKFSSK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD IQYVHSLEDLEQLIPMEHVQIPDCVLQYEEERLKARRESARPQPEFVLPRSEEKPEVAPV
:.::.:: .: ::::. ..::. ... .:: :. :.:.
CCDS83 IKYVNSLSELSGLIPMDCIHIPESIIKLDEE-LREASEAAKTSCLYNDPEMSSMEKDIDL
290 300 310 320 330 340
360 370
pF1KSD ENRSALVSEDQETSMS
CCDS83 KLKEKP
350
>>CCDS47982.1 PRUNE2 gene_id:158471|Hs108|chr9 (3088 aa)
initn: 1286 init1: 962 opt: 1012 Z-score: 1163.5 bits: 227.0 E(32554): 1.7e-58
Smith-Waterman score: 1268; 61.0% identity (81.9% similar) in 315 aa overlap (22-336:2763-3063)
10 20 30 40 50
pF1KSD MGTTEATLRMENVDVKEEWQDEDLPRPLPEETGVELLGSPVEDTSSPPNTL
::. .: : :: : : .. :::.:
CCDS47 KNMIPDTEMEEETEFLELGTRISRPNGLLSEDVGMDIPFEEGV-LSPSAADMRPEPPNSL
2740 2750 2760 2770 2780 2790
60 70 80 90 100 110
pF1KSD NFNGAHRKRKTLVAPEINISLDQSEGSLLSDDFLDTPDDLDINVDDIETPDETDSLEFLG
..: .: .: :.::.::.::::::::.:::: ::.::..:::::...::::.::.:. :
CCDS47 DLNDTHPRRIKLTAPNINLSLDQSEGSILSDDNLDSPDEIDINVDELDTPDEADSFEYTG
2800 2810 2820 2830 2840 2850
120 130 140 150 160 170
pF1KSD NGNELEWEDDTPVATAKNMPGDSADLFGDGTTEDGSAANGRLWRTVIIGEQEHRIDLHMI
. : ::.. :. .. . . :.:. : ::::::.:::::.:::...:
CCDS47 HD---------P--TANKDSGQESESIPEYTAEEEREDN-RLWRTVVIGEQEQRIDMKVI
2860 2870 2880 2890
180 190 200 210 220 230
pF1KSD RPYMKVVTHGGYYGEGLNAIIVFAACFLPDSSLPDYHYIMENLFLYVISSLELLVAEDYM
.:: .:..::::::.::::::::::::::::: ::::.::::::::::.:::.::::::
CCDS47 EPYRRVISHGGYYGDGLNAIIVFAACFLPDSSRADYHYVMENLFLYVISTLELMVAEDYM
2900 2910 2920 2930 2940 2950
240 250 260 270 280 290
pF1KSD IVYLNGATPRRRMPGIGWLKKCYQMIDRRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTVLAISRPFISVK
:::::::::::::::.::.:::::::::::::::::.:::::::::::.::..::::: :
CCDS47 IVYLNGATPRRRMPGLGWMKKCYQMIDRRLRKNLKSFIIVHPSWFIRTILAVTRPFISSK
2960 2970 2980 2990 3000 3010
300 310 320 330 340 350
pF1KSD FINKIQYVHSLEDLEQLIPMEHVQIPDCVLQYEEERLKARRESARPQPEFVLPRSEEKPE
: .::.::.:: .: ::::. ..::. ... .:: :. :.:.
CCDS47 FSSKIKYVNSLSELSGLIPMDCIHIPESIIKLDEE-LREASEAAKTSCLYNDPEMSSMEK
3020 3030 3040 3050 3060 3070
360 370
pF1KSD VAPVENRSALVSEDQETSMS
CCDS47 DIDLKLKEKP
3080
>>CCDS81889.1 BNIP2 gene_id:663|Hs108|chr15 (376 aa)
initn: 1191 init1: 886 opt: 974 Z-score: 1133.2 bits: 218.3 E(32554): 8.5e-57
Smith-Waterman score: 1200; 53.8% identity (78.5% similar) in 340 aa overlap (5-340:58-375)
10 20 30
pF1KSD MGTTEATLRMENVDVKEEWQDEDLPRPLPEETGV
:. ::::.:..::::::::.: ::::. ..
CCDS81 YDQRPSWYRTKKLGLLDIGSLDYQEFVVDIESRLRMEGVELKEEWQDEDFPIPLPEDDSI
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KSD ELLGSPVEDTSSPPNTLNFNGAHRKRKTLVAPEINISLDQSEGSLLSDDFLDTPDDLDIN
: . . :..:. :: .. :: :.::.:...:: :.::.:::: :: ..:.
CCDS81 EADILAITGPEDQPGSLEVNG-NKVRKKLMAPDISLTLDPSDGSVLSDD-LDESGEIDL-
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KSD VDDIETPDETDSLEFLGNGNELEWEDDTPVATAKNMPGDSADLFGDGTTEDGSAA----N
: ..::.: :.::.::::: : : ..... :. . .:: .
CCDS81 -DGLDTPSE--------NSNEFEWEDDLP------KP-KTTEVIRKGSITEYTAAEEKED
150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD GRLWRTVIIGEQEHRIDLHMIRPYMKVVTHGGYYGEGLNAIIVFAACFLPDSSLPDYHYI
:: :: ::::.::.:.. :.:: ::..::::::.:::::.:::.::.:.:: :.:.:.
CCDS81 GRRWRMFRIGEQDHRVDMKAIEPYKKVISHGGYYGDGLNAIVVFAVCFMPESSQPNYRYL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KSD MENLFLYVISSLELLVAEDYMIVYLNGATPRRRMPGIGWLKKCYQMIDRRLRKNLKSLII
:.::: :::..:::::::.:::::::::: ::.::..:::.::::.::::::::::::::
CCDS81 MDNLFKYVIGTLELLVAENYMIVYLNGATTRRKMPSLGWLRKCYQQIDRRLRKNLKSLII
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KSD VHPSWFIRTVLAISRPFISVKFINKIQYVHSLEDLEQLIPMEHVQIPDCVLQYEEERLKA
:::::::::.::..::::: :: .::.:: .: .: .:.:::.: ::.:. : ..: :..
CCDS81 VHPSWFIRTLLAVTRPFISSKFSQKIRYVFNLAELAELVPMEYVGIPECIKQVDQE-LNG
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370
pF1KSD RRESARPQPEFVLPRSEEKPEVAPVENRSALVSEDQETSMS
... .:. :
CCDS81 KQD--EPKNEQ
370
>>CCDS10174.2 BNIP2 gene_id:663|Hs108|chr15 (435 aa)
initn: 1191 init1: 886 opt: 974 Z-score: 1132.2 bits: 218.4 E(32554): 9.6e-57
Smith-Waterman score: 1200; 53.8% identity (78.5% similar) in 340 aa overlap (5-340:117-434)
10 20 30
pF1KSD MGTTEATLRMENVDVKEEWQDEDLPRPLPEETGV
:. ::::.:..::::::::.: ::::. ..
CCDS10 PAWRGEEDEGAKASSGDIGSLDYQEFVVDIESRLRMEGVELKEEWQDEDFPIPLPEDDSI
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KSD ELLGSPVEDTSSPPNTLNFNGAHRKRKTLVAPEINISLDQSEGSLLSDDFLDTPDDLDIN
: . . :..:. :: .. :: :.::.:...:: :.::.:::: :: ..:.
CCDS10 EADILAITGPEDQPGSLEVNG-NKVRKKLMAPDISLTLDPSDGSVLSDD-LDESGEIDL-
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KSD VDDIETPDETDSLEFLGNGNELEWEDDTPVATAKNMPGDSADLFGDGTTEDGSAA----N
: ..::.: :.::.::::: : : ..... :. . .:: .
CCDS10 -DGLDTPSE--------NSNEFEWEDDLP------KP-KTTEVIRKGSITEYTAAEEKED
210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KSD GRLWRTVIIGEQEHRIDLHMIRPYMKVVTHGGYYGEGLNAIIVFAACFLPDSSLPDYHYI
:: :: ::::.::.:.. :.:: ::..::::::.:::::.:::.::.:.:: :.:.:.
CCDS10 GRRWRMFRIGEQDHRVDMKAIEPYKKVISHGGYYGDGLNAIVVFAVCFMPESSQPNYRYL
250 260 270 280 290 300
220 230 240 250 260 270
pF1KSD MENLFLYVISSLELLVAEDYMIVYLNGATPRRRMPGIGWLKKCYQMIDRRLRKNLKSLII
:.::: :::..:::::::.:::::::::: ::.::..:::.::::.::::::::::::::
CCDS10 MDNLFKYVIGTLELLVAENYMIVYLNGATTRRKMPSLGWLRKCYQQIDRRLRKNLKSLII
310 320 330 340 350 360
280 290 300 310 320 330
pF1KSD VHPSWFIRTVLAISRPFISVKFINKIQYVHSLEDLEQLIPMEHVQIPDCVLQYEEERLKA
:::::::::.::..::::: :: .::.:: .: .: .:.:::.: ::.:. : ..: :..
CCDS10 VHPSWFIRTLLAVTRPFISSKFSQKIRYVFNLAELAELVPMEYVGIPECIKQVDQE-LNG
370 380 390 400 410 420
340 350 360 370
pF1KSD RRESARPQPEFVLPRSEEKPEVAPVENRSALVSEDQETSMS
... .:. :
CCDS10 KQD--EPKNEQ
430
>>CCDS978.2 BNIPL gene_id:149428|Hs108|chr1 (357 aa)
initn: 897 init1: 760 opt: 969 Z-score: 1127.7 bits: 217.3 E(32554): 1.7e-56
Smith-Waterman score: 969; 42.9% identity (77.8% similar) in 329 aa overlap (6-326:26-350)
10 20 30
pF1KSD MGTTEATLRMENVDVKEEWQDEDLPRPLPEETGV-ELLGS
:.:: ....:::::::..:: ::::.:. : .
CCDS97 MGTIQEAGKKTDVGVREIAEAPELGAALRHGELELKEEWQDEEFPRLLPEEAGTSEDPED
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD PVEDTSSP---PNTLNFNGAHRKRKTLVAPEINISLDQ---SEGSLLSDDFLDTPD-DLD
: :... :.:: . : . :: : :::. .:: . ..:. ... ..:: . :
CCDS97 PKGDSQAAAGTPSTLALCGQRPMRKRLSAPELRLSLTKGPGNDGASPTQSAPSSPDGSSD
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD INVDDIETPDETDSLEFLGNGNELEWEDDTPVATAKNMPGDSADLFGDGTTEDGSAANGR
...:..:::.....:. .:.:.::::. : : . . ...:. .: : : .. .:.
CCDS97 LEIDELETPSDSEQLD---SGHEFEWEDELPRAEGLGT-SETAERLGRGCMWDVTGEDGH
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KSD LWRTVIIGEQEHRIDLHMIRPYMKVVTHGGYYGEGLNAIIVFAACFLPDSSLPDYHYIME
::. .: .:.:.:. .:.:: ::..::::.:.::::.:.::.:.:: ::.:.: :.::
CCDS97 HWRVFRMGPREQRVDMTVIEPYKKVLSHGGYHGDGLNAVILFASCYLPRSSIPNYTYVME
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KSD NLFLYVISSLELLVAEDYMIVYLNGATPRRRMPGIGWLKKCYQMIDRRLRKNLKSLIIVH
.:: :....:::::::.:..:.:.:.: : ..: ..:...::. .::::::::..:..::
CCDS97 HLFRYMVGTLELLVAENYLLVHLSGGTSRAQVPPLSWIRQCYRTLDRRLRKNLRALVVVH
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD PSWFIRTVLAISRPFISVKFINKIQYVHSLEDLEQLIPMEHVQIPDCVLQYEEERLKARR
.:.... ::. ::::: :: ::... :: .: ::: ...:.::. : : ...
CCDS97 ATWYVKAFLALLRPFISSKFTRKIRFLDSLGELAQLISLDQVHIPEAVRQLDRDLHGSGG
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370
pF1KSD ESARPQPEFVLPRSEEKPEVAPVENRSALVSEDQETSMS
CCDS97 T
>>CCDS78407.1 PRUNE2 gene_id:158471|Hs108|chr9 (3062 aa)
initn: 1269 init1: 788 opt: 976 Z-score: 1121.8 bits: 219.3 E(32554): 3.7e-56
Smith-Waterman score: 1232; 60.4% identity (81.2% similar) in 313 aa overlap (22-331:2763-3061)
10 20 30 40 50
pF1KSD MGTTEATLRMENVDVKEEWQDEDLPRPLPEETGVELLGSPVEDTSSPPNTL
::. .: : :: : : .. :::.:
CCDS78 KNMIPDTEMEEETEFLELGTRISRPNGLLSEDVGMDIPFEEGV-LSPSAADMRPEPPNSL
2740 2750 2760 2770 2780 2790
60 70 80 90 100 110
pF1KSD NFNGAHRKRKTLVAPEINISLDQSEGSLLSDDFLDTPDDLDINVDDIETPDETDSLEFLG
..: .: .: :.::.::.::::::::.:::: ::.::..:::::...::::.::.:. :
CCDS78 DLNDTHPRRIKLTAPNINLSLDQSEGSILSDDNLDSPDEIDINVDELDTPDEADSFEYTG
2800 2810 2820 2830 2840 2850
120 130 140 150 160 170
pF1KSD NGNELEWEDDTPVATAKNMPGDSADLFGDGTTEDGSAANGRLWRTVIIGEQEHRIDLHMI
. : ::.. :. .. . . :.:. : ::::::.:::::.:::...:
CCDS78 HD---------P--TANKDSGQESESIPEYTAEEEREDN-RLWRTVVIGEQEQRIDMKVI
2860 2870 2880 2890
180 190 200 210 220
pF1KSD RPYMKVVTHGG---YYGEGLNAIIVFAACFLPDSSLPDYHYIMENLFLYVISSLELLVAE
.:: .:..::: :::.::::::::::::::::: ::::.::::::::::.:::.:::
CCDS78 EPYRRVISHGGDSGYYGDGLNAIIVFAACFLPDSSRADYHYVMENLFLYVISTLELMVAE
2900 2910 2920 2930 2940 2950
230 240 250 260 270 280
pF1KSD DYMIVYLNGATPRRRMPGIGWLKKCYQMIDRRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTVLAISRPFI
::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::.:::::::::::.::..::::
CCDS78 DYMIVYLNGATPRRRMPGLGWMKKCYQMIDRRLRKNLKSFIIVHPSWFIRTILAVTRPFI
2960 2970 2980 2990 3000 3010
290 300 310 320 330 340
pF1KSD SVKFINKIQYVHSLEDLEQLIPMEHVQIPDCVLQYEEERLKARRESARPQPEFVLPRSEE
: :: .::.::.:: .: ::::. ..::. ... . .:: .
CCDS78 SSKFSSKIKYVNSLSELSGLIPMDCIHIPESIINIDL-KLKEKP
3020 3030 3040 3050 3060
350 360 370
pF1KSD KPEVAPVENRSALVSEDQETSMS
>>CCDS53362.1 BNIPL gene_id:149428|Hs108|chr1 (275 aa)
initn: 796 init1: 739 opt: 845 Z-score: 985.5 bits: 190.6 E(32554): 1.4e-48
Smith-Waterman score: 845; 43.2% identity (79.7% similar) in 271 aa overlap (60-326:2-268)
30 40 50 60 70 80
pF1KSD EETGVELLGSPVEDTSSPPNTLNFNGAHRKRKTLVAPEINISLDQ---SEGSLLSDDFLD
:: : :::. .:: . ..:. ... .
CCDS53 MRKRLSAPELRLSLTKGPGNDGASPTQSAPS
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KSD TPD-DLDINVDDIETPDETDSLEFLGNGNELEWEDDTPVATAKNMPGDSADLFGDGTTED
.:: . :...:..:::.....:. .:.:.::::. : : . . ...:. .: : :
CCDS53 SPDGSSDLEIDELETPSDSEQLD---SGHEFEWEDELPRAEGLGT-SETAERLGRGCMWD
40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KSD GSAANGRLWRTVIIGEQEHRIDLHMIRPYMKVVTHGGYYGEGLNAIIVFAACFLPDSSLP
.. .:. ::. .: .:.:.:. .:.:: ::..::::.:.::::.:.::.:.:: ::.:
CCDS53 VTGEDGHHWRVFRMGPREQRVDMTVIEPYKKVLSHGGYHGDGLNAVILFASCYLPRSSIP
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KSD DYHYIMENLFLYVISSLELLVAEDYMIVYLNGATPRRRMPGIGWLKKCYQMIDRRLRKNL
.: :.::.:: :....:::::::.:..:.:.:.: : ..: ..:...::. .::::::::
CCDS53 NYTYVMEHLFRYMVGTLELLVAENYLLVHLSGGTSRAQVPPLSWIRQCYRTLDRRLRKNL
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KSD KSLIIVHPSWFIRTVLAISRPFISVKFINKIQYVHSLEDLEQLIPMEHVQIPDCVLQYEE
..:..:: .:.... ::. ::::: :: ::... :: .: ::: ...:.::. : : ..
CCDS53 RALVVVHATWYVKAFLALLRPFISSKFTRKIRFLDSLGELAQLISLDQVHIPEAVRQLDR
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370
pF1KSD ERLKARRESARPQPEFVLPRSEEKPEVAPVENRSALVSEDQETSMS
.
CCDS53 DLHGSGGT
270
>>CCDS56233.1 ARHGAP8 gene_id:23779|Hs108|chr22 (305 aa)
initn: 280 init1: 280 opt: 348 Z-score: 407.8 bits: 83.8 E(32554): 2.1e-16
Smith-Waterman score: 348; 32.4% identity (62.6% similar) in 182 aa overlap (173-350:13-189)
150 160 170 180 190
pF1KSD TEDGSAANGRLWRTVIIGEQEHRIDLHMIRPYMKVVTHGGYYGEGLNA----IIVFAACF
:.. :. :: : . ...:. :
CCDS56 MAGQDPALSTSHPFYDVARHGILQVAGDDRFGRRVVTFSCCR
10 20 30 40
200 210 220 230 240 250
pF1KSD LPDSSLPDYHYIMENLFLYVISSLELLVAEDYMIVYLNGATPRRRMPGIGWLKKCYQMID
.: : :.. ..: :. .:. : .:: :::.. . : :..:::.. :. .:
CCDS56 MPPSHELDHQRLLE----YLKYTLDQYVENDYTIVYFHYGLNSRNKPSLGWLQSAYKEFD
50 60 70 80 90
260 270 280 290 300 310
pF1KSD RRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTVLAISRPFISVKFINKIQYVHSLEDLEQLIPMEHVQIPD
:. .::::.: .:::. ::... : .:.:: :: .:. : . : .:.. . .... ::
CCDS56 RKYKKNLKALYVVHPTSFIKVLWNILKPLISHKFGKKVIYFNYLSELHEHLKYDQLVIPP
100 110 120 130 140 150
320 330 340 350 360 370
pF1KSD CVLQYEEERLKARRESARPQPEFVLPRSEEKPEVAPVENRSALVSEDQETSMS
::.:.: .:.. .:. : : . : :
CCDS56 EVLRYDE-KLQSLHEGRTPPPTKTPPPRPPLPTQQFGVSLQYLKDKNQGELIPPVLRFTV
160 170 180 190 200 210
CCDS56 TYLREKGLRTEGLFRRSASVQTVREIQRLYNQGKPVNFDDYGDIHIPAVILKTFLRELPQ
220 230 240 250 260 270
>>CCDS7922.1 ARHGAP1 gene_id:392|Hs108|chr11 (439 aa)
initn: 329 init1: 287 opt: 349 Z-score: 406.6 bits: 84.1 E(32554): 2.5e-16
Smith-Waterman score: 358; 30.7% identity (56.8% similar) in 257 aa overlap (89-345:2-234)
60 70 80 90 100 110
pF1KSD KRKTLVAPEINISLDQSEGSLLSDDFLDTPDDLDINVDDIETPDETDSLEFLGNGNELEW
: :. ::. : ...: :.:.
CCDS79 MDPLSELQDDLTLDDTSEAL------NQLKL
10 20
120 130 140 150 160 170
pF1KSD EDDTPVATAKNMPGDSADLFGDGTTEDGSAANGRLWRTVIIGEQEHRIDLHMIRPYMKVV
. :: :.: : ..:..... .: . . . : :.: :
CCDS79 AS----IDEKNWPSDEMPDFPK--SDDSKSSSPELVTHLKWDDPYYDIARHQIVE----V
30 40 50 60 70
180 190 200 210 220 230
pF1KSD THGGYYGEGLNAIIVFAACFLPDSSLPDYHYIMENLFLYVISSLELLVAEDYMIVYLNGA
. ::. ::::.:: .: : :. .:. :. .:. : :: ..::. .
CCDS79 AGDDKYGR---KIIVFSACRMPPSHQLDHS----KLLGYLKHTLDQYVESDYTLLYLHHG
80 90 100 110 120
240 250 260 270 280 290
pF1KSD TPRRRMPGIGWLKKCYQMIDRRLRKNLKSLIIVHPSWFIRTVLAISRPFISVKFINKIQY
:...::. :. .::. .::.:.: ::::. ::.:.: . .:.:: :: .:: :
CCDS79 LTSDNKPSLSWLRDAYREFDRKYKKNIKALYIVHPTMFIKTLLILFKPLISFKFGQKIFY
130 140 150 160 170 180
300 310 320 330 340 350
pF1KSD VHSLEDLEQLIPMEHVQIPDCVLQYEEERLKARRESARPQPEFVLPRSEEKPEVAPVENR
:. : .: . . .:.. :: ::.:.. ::. ..: :. . ::
CCDS79 VNYLSELSEHVKLEQLGIPRQVLKYDDF-LKSTQKSPATAPKPMPPRPPLPNQQFGVSLQ
190 200 210 220 230 240
360 370
pF1KSD SALVSEDQETSMS
CCDS79 HLQEKNPEQEPIPIVLRETVAYLQAHALTTEGIFRRSANTQVVREVQQKYNMGLPVDFDQ
250 260 270 280 290 300
371 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 07:34:07 2016 done: Thu Nov 3 07:34:08 2016
Total Scan time: 2.620 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]