FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA1951, 670 aa 1>>>pF1KSDA1951 670 - 670 aa - 670 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5360+/-0.000374; mu= 0.0059+/- 0.024 mean_var=435.3044+/-92.000, 0's: 0 Z-trim(126.1): 1622 B-trim: 1824 in 1/60 Lambda= 0.061472 statistics sampled from 49270 (51265) to 49270 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.824), E-opt: 0.2 (0.601), width: 16 Scan time: 14.430 The best scores are: opt bits E(85289) NP_597701 (OMIM: 614387) zinc finger protein 526 [ ( 670) 4740 434.6 5.6e-121 NP_001300962 (OMIM: 614387) zinc finger protein 52 ( 670) 4740 434.6 5.6e-121 NP_001305822 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 675) 717 77.9 1.4e-13 XP_011513163 (OMIM: 602277) PREDICTED: zinc finger ( 675) 717 77.9 1.4e-13 NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 715 77.6 1.5e-13 XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 715 77.6 1.5e-13 NP_001305820 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 717 77.9 1.5e-13 NP_009080 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 i ( 751) 717 77.9 1.5e-13 NP_001305821 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 717 77.9 1.5e-13 XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 715 77.6 1.5e-13 NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 715 77.7 1.6e-13 XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 715 77.7 1.6e-13 XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 720 78.3 1.6e-13 NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 65 (1059) 720 78.3 1.6e-13 NP_149350 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [ (1059) 720 78.3 1.6e-13 XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 720 78.3 1.6e-13 XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 720 78.3 1.6e-13 XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 715 77.7 1.6e-13 XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 715 77.7 1.6e-13 NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 715 77.7 1.6e-13 XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 715 77.7 1.6e-13 NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 715 77.7 1.6e-13 NP_001159354 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 864) 692 75.8 7.7e-13 NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 947) 692 75.8 8.2e-13 NP_003406 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 i ( 947) 692 75.8 8.2e-13 XP_016882719 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 684 74.9 1e-12 XP_016882718 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 684 74.9 1e-12 XP_016882717 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 684 74.9 1e-12 XP_016882712 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12 XP_011525573 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12 XP_016882714 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12 XP_011525571 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12 XP_016882710 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12 XP_016882716 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12 XP_016882706 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12 XP_016882711 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12 XP_016882709 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12 XP_016882715 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12 XP_016882708 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12 XP_016882707 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12 XP_011525569 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12 XP_011525575 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12 XP_016882713 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12 NP_003416 (OMIM: 194554) zinc finger protein 45 [H ( 682) 684 74.9 1.1e-12 NP_003424 (OMIM: 604074) zinc finger protein 132 [ ( 706) 677 74.3 1.7e-12 NP_001273627 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 364) 666 73.0 2.2e-12 XP_016881627 (OMIM: 606956) PREDICTED: zinc finger ( 474) 668 73.3 2.3e-12 NP_001252529 (OMIM: 601856) zinc finger protein 21 ( 503) 668 73.4 2.4e-12 NP_001252528 (OMIM: 601856) zinc finger protein 21 ( 555) 668 73.4 2.5e-12 XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 675 74.4 2.6e-12 >>NP_597701 (OMIM: 614387) zinc finger protein 526 [Homo (670 aa) initn: 4740 init1: 4740 opt: 4740 Z-score: 2293.0 bits: 434.6 E(85289): 5.6e-121 Smith-Waterman score: 4740; 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