Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1956
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1956, 676 aa
1>>>pF1KSDA1956 676 - 676 aa - 676 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3002+/-0.00233; mu= 17.9603+/- 0.139
mean_var=347.6001+/-64.635, 0's: 0 Z-trim(104.3): 943 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.068791
statistics sampled from 6789 (7815) to 6789 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.544), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16
Scan time: 3.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 676) 4903 502.4 8.4e-142
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 4897 501.9 1.3e-141
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 4323 444.8 1.7e-124
CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 3232 336.8 7.8e-92
CCDS74469.1 ZNF417 gene_id:147687|Hs108|chr19 ( 574) 2600 273.7 5e-73
CCDS12965.1 ZNF417 gene_id:147687|Hs108|chr19 ( 575) 2600 273.7 5e-73
CCDS56110.1 ZNF587 gene_id:84914|Hs108|chr19 ( 574) 2585 272.3 1.4e-72
CCDS12964.1 ZNF587 gene_id:84914|Hs108|chr19 ( 575) 2585 272.3 1.4e-72
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 2483 262.3 1.7e-69
CCDS12966.1 ZNF256 gene_id:10172|Hs108|chr19 ( 627) 2470 260.9 4e-69
CCDS12955.1 ZNF530 gene_id:348327|Hs108|chr19 ( 599) 2205 234.6 3.2e-61
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 2169 231.2 4.2e-60
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 2071 221.7 4.1e-57
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 2071 221.8 4.2e-57
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 2059 220.0 7e-57
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 2059 220.2 7.8e-57
CCDS42636.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 662) 2010 215.3 2.2e-55
CCDS82405.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 664) 2010 215.3 2.2e-55
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1980 212.3 1.8e-54
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 1979 212.2 1.9e-54
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 1979 212.2 1.9e-54
CCDS46165.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 674) 1965 210.9 5e-54
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1958 210.3 8.6e-54
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1958 210.3 8.6e-54
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1958 210.3 8.8e-54
CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3 (1029) 1952 209.9 1.5e-53
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 1953 210.2 1.5e-53
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 1948 209.4 1.9e-53
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1938 208.2 3.2e-53
CCDS47539.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 ( 659) 1937 208.1 3.4e-53
CCDS6755.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 584) 1936 207.9 3.5e-53
CCDS65096.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 612) 1936 207.9 3.5e-53
CCDS6754.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 626) 1936 207.9 3.6e-53
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 1929 207.4 6.4e-53
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 1929 207.5 6.5e-53
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1928 207.3 6.9e-53
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1928 207.3 6.9e-53
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1928 207.3 6.9e-53
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 1927 207.3 7.9e-53
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1920 206.3 1.1e-52
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1920 206.4 1.1e-52
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1920 206.4 1.1e-52
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1920 206.4 1.1e-52
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1913 205.8 1.9e-52
CCDS12963.1 ZNF552 gene_id:79818|Hs108|chr19 ( 407) 1903 204.3 2.9e-52
CCDS56109.1 ZNF587B gene_id:100293516|Hs108|chr19 ( 402) 1893 203.3 5.7e-52
CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 1895 204.1 6.7e-52
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 1893 203.6 6.8e-52
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1893 203.7 7e-52
CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 1895 204.2 7.1e-52
>>CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 (676 aa)
initn: 4903 init1: 4903 opt: 4903 Z-score: 2659.3 bits: 502.4 E(32554): 8.4e-142
Smith-Waterman score: 4903; 100.0% identity (100.0% similar) in 676 aa overlap (1-676:1-676)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MQGTVAFEDVAVNFSQEEWSLLSEVQRCLYHDVMLENWVLISSLGCWCGSEDEEAPSKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MQGTVAFEDVAVNFSQEEWSLLSEVQRCLYHDVMLENWVLISSLGCWCGSEDEEAPSKKS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ISIQRVSQVSTPGAGVSPKKAHSCEMCGAILGDILHLADHQGTHHKQKLHRCEAWGNKLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ISIQRVSQVSTPGAGVSPKKAHSCEMCGAILGDILHLADHQGTHHKQKLHRCEAWGNKLY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DSSNRPHQNQYLGEKPYRSSVEEALFVKRCKFHVSEESSIFIQSGKDFLPSSGLLLQEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DSSNRPHQNQYLGEKPYRSSVEEALFVKRCKFHVSEESSIFIQSGKDFLPSSGLLLQEAT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD HTGEKSNSKPECESPFQWGDTHYSCGECMKHSSTKHVFVQQQRLPSREECYCWECGKSFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HTGEKSNSKPECESPFQWGDTHYSCGECMKHSSTKHVFVQQQRLPSREECYCWECGKSFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYECEECGKCFTQKGNLIQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYECEECGKCFTQKGNLIQH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTRERPYECGECGKSFSRKGHLRNHQRGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTRERPYECGECGKSFSRKGHLRNHQRGH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSHLIEHQRVHTGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSHLIEHQRVHTGER
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD PYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSECGKSFPQSCSLLRHRRVHTGERPYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSECGKSFPQSCSLLRHRRVHTGERPYEC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GECGKSFHQSSSLLRHQKTHTAERPYECRECGKFFSSLLEHRRVHTGERPYECRECGKTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GECGKSFHQSSSLLRHQKTHTAERPYECRECGKFFSSLLEHRRVHTGERPYECRECGKTF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD TRRSAHFKHQRLHTRGKPYECSECGKSFAETFSLTEHRRVHTGERPYECSECGKSFHRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TRRSAHFKHQRLHTRGKPYECSECGKSFAETFSLTEHRRVHTGERPYECSECGKSFHRSS
610 620 630 640 650 660
670
pF1KSD SLLRHQRVHTERSPYK
::::::::::::::::
CCDS42 SLLRHQRVHTERSPYK
670
>>CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 (697 aa)
initn: 4897 init1: 4897 opt: 4897 Z-score: 2655.9 bits: 501.9 E(32554): 1.3e-141
Smith-Waterman score: 4897; 99.9% identity (100.0% similar) in 676 aa overlap (1-676:22-697)
10 20 30
pF1KSD MQGTVAFEDVAVNFSQEEWSLLSEVQRCLYHDVMLENWV
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MQEGLHRMTWDCIAIGSHENSVQGTVAFEDVAVNFSQEEWSLLSEVQRCLYHDVMLENWV
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD LISSLGCWCGSEDEEAPSKKSISIQRVSQVSTPGAGVSPKKAHSCEMCGAILGDILHLAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LISSLGCWCGSEDEEAPSKKSISIQRVSQVSTPGAGVSPKKAHSCEMCGAILGDILHLAD
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD HQGTHHKQKLHRCEAWGNKLYDSSNRPHQNQYLGEKPYRSSVEEALFVKRCKFHVSEESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 HQGTHHKQKLHRCEAWGNKLYDSSNRPHQNQYLGEKPYRSSVEEALFVKRCKFHVSEESS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD IFIQSGKDFLPSSGLLLQEATHTGEKSNSKPECESPFQWGDTHYSCGECMKHSSTKHVFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IFIQSGKDFLPSSGLLLQEATHTGEKSNSKPECESPFQWGDTHYSCGECMKHSSTKHVFV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KSD QQQRLPSREECYCWECGKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QQQRLPSREECYCWECGKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRV
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KSD HTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 HTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGE
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KSD RPYECEECGKCFTQKGNLIQHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTRERPYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RPYECEECGKCFTQKGNLIQHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTRERPYE
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KSD CGECGKSFSRKGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECREC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 CGECGKSFSRKGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECREC
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KSD RKLFRGKSHLIEHQRVHTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSECGKSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RKLFRGKSHLIEHQRVHTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSECGKSF
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KSD PQSCSLLRHRRVHTGERPYECGECGKSFHQSSSLLRHQKTHTAERPYECRECGKFFSSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PQSCSLLRHRRVHTGERPYECGECGKSFHQSSSLLRHQKTHTAERPYECRECGKFFSSLL
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KSD EHRRVHTGERPYECRECGKTFTRRSAHFKHQRLHTRGKPYECSECGKSFAETFSLTEHRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EHRRVHTGERPYECRECGKTFTRRSAHFKHQRLHTRGKPYECSECGKSFAETFSLTEHRR
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670
pF1KSD VHTGERPYECSECGKSFHRSSSLLRHQRVHTERSPYK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VHTGERPYECSECGKSFHRSSSLLRHQRVHTERSPYK
670 680 690
>>CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 (591 aa)
initn: 4323 init1: 4323 opt: 4323 Z-score: 2348.6 bits: 444.8 E(32554): 1.7e-124
Smith-Waterman score: 4323; 100.0% identity (100.0% similar) in 591 aa overlap (86-676:1-591)
60 70 80 90 100 110
pF1KSD PSKKSISIQRVSQVSTPGAGVSPKKAHSCEMCGAILGDILHLADHQGTHHKQKLHRCEAW
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MCGAILGDILHLADHQGTHHKQKLHRCEAW
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KSD GNKLYDSSNRPHQNQYLGEKPYRSSVEEALFVKRCKFHVSEESSIFIQSGKDFLPSSGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GNKLYDSSNRPHQNQYLGEKPYRSSVEEALFVKRCKFHVSEESSIFIQSGKDFLPSSGLL
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LQEATHTGEKSNSKPECESPFQWGDTHYSCGECMKHSSTKHVFVQQQRLPSREECYCWEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LQEATHTGEKSNSKPECESPFQWGDTHYSCGECMKHSSTKHVFVQQQRLPSREECYCWEC
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KSD GKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGKRPYECGECGKSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGKRPYECGECGKSF
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KSD SHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYECEECGKCFTQKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYECEECGKCFTQKG
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KSD NLIQHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTRERPYECGECGKSFSRKGHLRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 NLIQHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTRERPYECGECGKSFSRKGHLRN
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KSD HQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSHLIEHQRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 HQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSHLIEHQRV
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KSD HTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSECGKSFPQSCSLLRHRRVHTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 HTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSECGKSFPQSCSLLRHRRVHTGE
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KSD RPYECGECGKSFHQSSSLLRHQKTHTAERPYECRECGKFFSSLLEHRRVHTGERPYECRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RPYECGECGKSFHQSSSLLRHQKTHTAERPYECRECGKFFSSLLEHRRVHTGERPYECRE
460 470 480 490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KSD CGKTFTRRSAHFKHQRLHTRGKPYECSECGKSFAETFSLTEHRRVHTGERPYECSECGKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 CGKTFTRRSAHFKHQRLHTRGKPYECSECGKSFAETFSLTEHRRVHTGERPYECSECGKS
520 530 540 550 560 570
660 670
pF1KSD FHRSSSLLRHQRVHTERSPYK
:::::::::::::::::::::
CCDS82 FHRSSSLLRHQRVHTERSPYK
580 590
>>CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 (855 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KSD MQGTVAFEDVAVNFSQEEWSLLSEVQRCLYHDVMLENWVLISSLGCWCGS
::::.::::::::. :::.::::.:::::.:: ::: .::::::::::
CCDS46 MAAAATLRLSAQGTVTFEDVAVNFTWEEWNLLSEAQRCLYRDVTLENLALISSLGCWCGV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD EDEEAPSKKSISIQRVSQVSTPGAGVSPKKAHSCEMCGAILGDILHLADHQGTHHKQKLH
::: ::::.:: ::: .:: :: ::::::::: ::::: :::::::.:::::::::::::
CCDS46 EDEAAPSKQSIYIQRETQVRTPMAGVSPKKAHPCEMCGPILGDILHVADHQGTHHKQKLH
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120 130 140 150 160
pF1KSD RCEAWGNKLYDSSN-RPHQNQYLGEKPYRSSVEEALFVKRCKFHVSEESSIFIQSGKDFL
::::::::::::.: . :::...::::::.:::::::.::::.::: :::.: .::::::
CCDS46 RCEAWGNKLYDSGNFHQHQNEHIGEKPYRGSVEEALFAKRCKLHVSGESSVFSESGKDFL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KSD PSSGLLLQEATHTGEKSNSKPECESPFQWGDTHYSCGECMKHSSTKHVFVQQQRLPSREE
: :::: :::.::::::::: :: ::.: : .:::::: ::: ::::.. :.::: .:::
CCDS46 PRSGLLQQEASHTGEKSNSKTECVSPIQCGGAHYSCGESMKHFSTKHILSQHQRLLTREE
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260
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:: : ::::::::: :.:::::::: :: . .::::
CCDS46 CYVCCECGKSFSKYASLSNHQRVHTEKKHECGECGKSFSKYVSFSNHQRVHTEKKHECGE
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
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::::::. :. .:::::::::::::::::::::. .:. .:::::: .. :::::::::
CCDS46 CGKSFSKYVSFSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSKYASFSNHQRVHTEKKHYECGECGKS
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330 340 350 360 370 380
pF1KSD FSQNGTLIKHQRVHTGERPYECEECGKCFTQKGNLIQHQRGHTSERPYECEECGKCFSQK
::. .. .:::::::.::::: :::: :.. ... .::: ::... ::: :::: ::::
CCDS46 FSKYVSFSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSKYASFSNHQRVHTDKKHYECGECGKSFSQK
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KSD GTLTEHHRVHTRERPYECGECGKSFSRKGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLI
..: .:.: :: :.:: : ::::::: .::::.::: :.::::..:::: ::::.: .:.
CCDS46 SSLIQHQRFHTGEKPYGCEECGKSFSSEGHLRSHQRVHAGERPFKCGECVKSFSHKRSLV
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KSD QHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSHLIEHQRVHTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVHQR
.::: :.:::::.: :: : : :..:. ::::::: :::::.::::::.... .: ::.
CCDS46 HHQRVHSGERPYQCGECGKSFSQKGNLVLHQRVHTGARPYECGECGKSFSSKGHLRNHQQ
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KSD VHTGEKPFECSECGKSFPQSCSLLRHRRVHTGERPYECGECGKSFHQSSSLLRHQKTHTA
.:::.. .::.:::::: .. .:. :.::: :: : :::::::: . . : ::..::.
CCDS46 IHTGDRLYECGECGKSFSHKGTLILHQRVHPRERSYGCGECGKSFSSIGHLRSHQRVHTG
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610
pF1KSD ERPYECRECGKFFS---SLLEHRRVHTGERPYECRECGKTFTRRSAHFKHQRLHTRGKPY
:::::: :::: :: ::..:.:.:::::::.: .:::.:.... .:::.:: .:.
CCDS46 ERPYECGECGKSFSHKRSLVHHQRMHTGERPYKCGDCGKSFNEKGHLRNHQRVHTTERPF
610 620 630 640 650 660
620 630 640 650 660 670
pF1KSD ECSECGKSFAETFSLTEHRRVHTGERPYECSECGKSFHRSSSLLRHQRVHTERSPYK
.:.:::: :.. .: :.. ::::::: : :::: :...: :: :::.:. ..::
CCDS46 KCGECGKCFSHKGNLILHQHGHTGERPYVCRECGKLFKKKSHLLVHQRIHNGEKPYACEA
670 680 690 700 710 720
CCDS46 CQKFFRNKYQLIAHQRVHTGERPYECNDCGKSFTHSSTFCVHKRIHTGEKPYECSECGKS
730 740 750 760 770 780
>--
initn: 2334 init1: 621 opt: 666 Z-score: 385.9 bits: 82.1 E(32554): 3.6e-15
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430 440 450 460 470 480
pF1KSD YECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSHLIEHQRVHTGERPYECN
:. :.:.::.: .:: ::::::::::::::
CCDS46 YVCRECGKLFKKKSHLLVHQRIHNGEKPYACEACQKFFRNKYQLIAHQRVHTGERPYECN
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490 500 510 520 530 540
pF1KSD ECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSECGKSFPQSCSLLRHRRVHTGERPYECGECGK
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CCDS46 DCGKSFTHSSTFCVHKRIHTGEKPYECSECGKSFAESSSFTKHKRVHTGEKPYECSECGK
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550 560 570 580 590 600
pF1KSD SFHQSSSLLRHQKTHTAERPYECRECGKFF---SSLLEHRRVHTGERPYECRECGKTFTR
:: .:::: .:...::.:.::.:..:::.: : :: :. :
CCDS46 SFAESSSLTKHKRVHTGEKPYKCEKCGKLFNKKSHLLVHQSSHWRKAI
810 820 830 840 850
610 620 630 640 650 660
pF1KSD RSAHFKHQRLHTRGKPYECSECGKSFAETFSLTEHRRVHTGERPYECSECGKSFHRSSSL
>>CCDS74469.1 ZNF417 gene_id:147687|Hs108|chr19 (574 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KSD MQGTVAFEDVAVNFSQEEWSLLSEVQRCLYHDVMLENWVLISSLGCWCGSE
::::.::::::::::::: ::::.:::::.:::::: .:::::::::::.
CCDS74 MAAAAPRRPTQGTVTFEDVAVNFSQEEWCLLSEAQRCLYRDVMLENLALISSLGCWCGSK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD DEEAPSKKSISIQRVSQVSTPGAGVSPKKAHSCEMCGAILGDILHLADHQGTHHKQKLHR
::::: :. ::.:: :: :: ::::::::: ::::: :: :..:.:::: :::::::.:
CCDS74 DEEAPCKQRISVQRESQSRTPRAGVSPKKAHPCEMCGLILEDVFHFADHQETHHKQKLNR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD CEAWGNKLYDSSN-RPHQNQYLGEKPYRSSVEEALFVKRCKFHVSEESSIFIQSGKDFLP
: :..: :.. . ::.:..::: ::.::.:: :::. :..::.: .: . ::: ::
CCDS74 SGACGKNLDDTAYLHQHQKQHIGEKFYRKSVREASFVKKRKLRVSQEPFVFREFGKDVLP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD SSGLLLQEATHTGEKSNSKPECESPFQWGDTHYSCGECMKHSSTKHVFVQQQRLPSREEC
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CCDS74 SSGLC-QEAAAV-EKTDSETMHGPPFQEGKTNYSCGKRTKAFSTKHSVIPHQKLFTRDGC
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pF1KSD Y-CWECGKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGKRPYECG
: : .::::::.: : ::::: ::.: ::.:::::::.:.:.::.::::::::: : :
CCDS74 YVCSDCGKSFSRYVSFSNHQRDHTAKGPYDCGECGKSYSRKSSLIQHQRVHTGKTAYPCE
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD ECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYECEECGK
:::::::.::::..::::::::::::: : ::::.:.:.::.::. ::::: :.: ::::
CCDS74 ECGKSFSQKGSLISHQRVHTGERPYECREYGKSFGQKGNLIQHQQGHTGERAYHCGECGK
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350 360 370 380 390 400
pF1KSD CFTQKGNLIQHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTRERPYECGECGKSFSR
: :: .:.::: ::.::::.: :::: :.:::.:..:.: :: :::::: ::::::
CCDS74 SFRQKFCFINHQRVHTGERPYKCGECGKSFGQKGNLVQHQRGHTGERPYECKECGKSFRY
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pF1KSD KGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSHL
..:: .::: :::::::.: :::: :.:: .:. :.: ::::::: :. : ::: .:. .
CCDS74 RSHLTEHQRLHTGERPYNCRECGKLFNRKYHLLVHERVHTGERPYACEVCGKLFGNKNCV
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD IEHQRVHTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSECGKSFPQSCSLLRHR
:::.:::::::::::::::: .::...::.:::.:.::..:::::::: . ::..::
CCDS74 TIHQRIHTGERPYECNECGKSFLSSSALHVHKRVHSGQKPYKCSECGKSFAECSSLIKHR
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KSD RVHTGERPYECGECGKSFHQSSSLLRHQKTHTAERPYECRECGKFFSSLLEHRRVHTGER
:.::::::::: .:::.:..::.::.::..:
CCDS74 RIHTGERPYECTKCGKTFQRSSTLLHHQSSHRRKAL
540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KSD PYECRECGKTFTRRSAHFKHQRLHTRGKPYECSECGKSFAETFSLTEHRRVHTGERPYEC
>>CCDS12965.1 ZNF417 gene_id:147687|Hs108|chr19 (575 aa)
initn: 2242 init1: 2242 opt: 2600 Z-score: 1424.6 bits: 273.7 E(32554): 5e-73
Smith-Waterman score: 2600; 65.8% identity (83.4% similar) in 561 aa overlap (2-560:12-570)
10 20 30 40 50
pF1KSD MQGTVAFEDVAVNFSQEEWSLLSEVQRCLYHDVMLENWVLISSLGCWCGS
::::.::::::::::::: ::::.:::::.:::::: .:::::::::::
CCDS12 MAAAAPRRPTQQGTVTFEDVAVNFSQEEWCLLSEAQRCLYRDVMLENLALISSLGCWCGS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD EDEEAPSKKSISIQRVSQVSTPGAGVSPKKAHSCEMCGAILGDILHLADHQGTHHKQKLH
.::::: :. ::.:: :: :: ::::::::: ::::: :: :..:.:::: :::::::.
CCDS12 KDEEAPCKQRISVQRESQSRTPRAGVSPKKAHPCEMCGLILEDVFHFADHQETHHKQKLN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KSD RCEAWGNKLYDSSN-RPHQNQYLGEKPYRSSVEEALFVKRCKFHVSEESSIFIQSGKDFL
: : :..: :.. . ::.:..::: ::.::.:: :::. :..::.: .: . ::: :
CCDS12 RSGACGKNLDDTAYLHQHQKQHIGEKFYRKSVREASFVKKRKLRVSQEPFVFREFGKDVL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KSD PSSGLLLQEATHTGEKSNSKPECESPFQWGDTHYSCGECMKHSSTKHVFVQQQRLPSREE
::::: :::. . ::..:. ::: : :.::::. : :::: . .:.: .:.
CCDS12 PSSGLC-QEAAAV-EKTDSETMHGPPFQEGKTNYSCGKRTKAFSTKHSVIPHQKLFTRDG
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pF1KSD CY-CWECGKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGKRPYEC
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CCDS12 CYVCSDCGKSFSRYVSFSNHQRDHTAKGPYDCGECGKSYSRKSSLIQHQRVHTGKTAYPC
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD GECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYECEECG
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CCDS12 EECGKSFSQKGSLISHQRVHTGERPYECREYGKSFGQKGNLIQHQQGHTGERAYHCGECG
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pF1KSD KCFTQKGNLIQHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTRERPYECGECGKSFS
: : :: .:.::: ::.::::.: :::: :.:::.:..:.: :: :::::: ::::::
CCDS12 KSFRQKFCFINHQRVHTGERPYKCGECGKSFGQKGNLVQHQRGHTGERPYECKECGKSFR
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pF1KSD RKGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSH
..:: .::: :::::::.: :::: :.:: .:. :.: ::::::: :. : ::: .:.
CCDS12 YRSHLTEHQRLHTGERPYNCRECGKLFNRKYHLLVHERVHTGERPYACEVCGKLFGNKNC
420 430 440 450 460 470
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pF1KSD LIEHQRVHTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSECGKSFPQSCSLLRH
. :::.:::::::::::::::: .::...::.:::.:.::..:::::::: . ::..:
CCDS12 VTIHQRIHTGERPYECNECGKSFLSSSALHVHKRVHSGQKPYKCSECGKSFAECSSLIKH
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pF1KSD RRVHTGERPYECGECGKSFHQSSSLLRHQKTHTAERPYECRECGKFFSSLLEHRRVHTGE
::.::::::::: .:::.:..::.::.::..:
CCDS12 RRIHTGERPYECTKCGKTFQRSSTLLHHQSSHRRKAL
540 550 560 570
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initn: 2220 init1: 2220 opt: 2585 Z-score: 1416.5 bits: 272.3 E(32554): 1.4e-72
Smith-Waterman score: 2585; 65.1% identity (82.9% similar) in 561 aa overlap (2-560:11-569)
10 20 30 40 50
pF1KSD MQGTVAFEDVAVNFSQEEWSLLSEVQRCLYHDVMLENWVLISSLGCWCGSE
::::.::::::::::::: ::::.:::::.:::::: .:::::::::::.
CCDS56 MAAAVPRRPTQGTVTFEDVAVNFSQEEWCLLSEAQRCLYRDVMLENLALISSLGCWCGSK
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD DEEAPSKKSISIQRVSQVSTPGAGVSPKKAHSCEMCGAILGDILHLADHQGTHHKQKLHR
::::: :. ::.:: :: :: ::::::::: ::::: :: :..:.:::: :::::::.:
CCDS56 DEEAPCKQRISVQRESQSRTPRAGVSPKKAHPCEMCGLILEDVFHFADHQETHHKQKLNR
70 80 90 100 110 120
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pF1KSD CEAWGNKLYDSSN-RPHQNQYLGEKPYRSSVEEALFVKRCKFHVSEESSIFIQSGKDFLP
: :..: :.. . ::.:..::: ::.::.:: :::. :..::.: .: . ::: ::
CCDS56 SGACGKNLDDTAYLHQHQKQHIGEKFYRKSVREASFVKKRKLRVSQEPFVFREFGKDVLP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD SSGLLLQEATHTGEKSNSKPECESPFQWGDTHYSCGECMKHSSTKHVFVQQQRLPSREEC
:::: .::. ::..:. ::: : :.::::. : :::: . .:.: .:. :
CCDS56 SSGLCQEEAAV--EKTDSETMHGPPFQEGKTNYSCGKRTKAFSTKHSVIPHQKLFTRDGC
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KSD Y-CWECGKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGKRPYECG
: : .::::::.: : ::::: ::.: ::.:::::::.:.:.::.::::::::. : :
CCDS56 YVCSDCGKSFSRYVSFSNHQRDHTAKGPYDCGECGKSYSRKSSLIQHQRVHTGQTAYPCE
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD ECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYECEECGK
:::::::.::::..:: ::::: :::: ::::::.:.:.::.::. ::::: :.: ::::
CCDS56 ECGKSFSQKGSLISHQLVHTGEGPYECRECGKSFGQKGNLIQHQQGHTGERAYHCGECGK
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD CFTQKGNLIQHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTRERPYECGECGKSFSR
: :: .:.::: ::.::::.: :::: :.:::.:..:.: :: :::::: ::::::
CCDS56 SFRQKFCFINHQRVHTGERPYKCGECGKSFGQKGNLVHHQRGHTGERPYECKECGKSFRY
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD KGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSHL
..:: .::: :::::::.: :::: :.:: .:. :.: ::::::: :. : ::: .: .
CCDS56 RSHLTEHQRLHTGERPYNCRECGKLFNRKYHLLVHERVHTGERPYACEVCGKLFGNKHSV
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD IEHQRVHTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSECGKSFPQSCSLLRHR
:::.:::::::::.:::::: .::...::.:::.:.::..:::::::: . ::..::
CCDS56 TIHQRIHTGERPYECSECGKSFLSSSALHVHKRVHSGQKPYKCSECGKSFSECSSLIKHR
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KSD RVHTGERPYECGECGKSFHQSSSLLRHQKTHTAERPYECRECGKFFSSLLEHRRVHTGER
:.::::::::: .:::.:..::.::.::..:
CCDS56 RIHTGERPYECTKCGKTFQRSSTLLHHQSSHRRKAL
540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KSD PYECRECGKTFTRRSAHFKHQRLHTRGKPYECSECGKSFAETFSLTEHRRVHTGERPYEC
>>CCDS12964.1 ZNF587 gene_id:84914|Hs108|chr19 (575 aa)
initn: 3657 init1: 2220 opt: 2585 Z-score: 1416.5 bits: 272.3 E(32554): 1.4e-72
Smith-Waterman score: 2585; 65.1% identity (82.9% similar) in 561 aa overlap (2-560:12-570)
10 20 30 40 50
pF1KSD MQGTVAFEDVAVNFSQEEWSLLSEVQRCLYHDVMLENWVLISSLGCWCGS
::::.::::::::::::: ::::.:::::.:::::: .:::::::::::
CCDS12 MAAAVPRRPTQQGTVTFEDVAVNFSQEEWCLLSEAQRCLYRDVMLENLALISSLGCWCGS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD EDEEAPSKKSISIQRVSQVSTPGAGVSPKKAHSCEMCGAILGDILHLADHQGTHHKQKLH
.::::: :. ::.:: :: :: ::::::::: ::::: :: :..:.:::: :::::::.
CCDS12 KDEEAPCKQRISVQRESQSRTPRAGVSPKKAHPCEMCGLILEDVFHFADHQETHHKQKLN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KSD RCEAWGNKLYDSSN-RPHQNQYLGEKPYRSSVEEALFVKRCKFHVSEESSIFIQSGKDFL
: : :..: :.. . ::.:..::: ::.::.:: :::. :..::.: .: . ::: :
CCDS12 RSGACGKNLDDTAYLHQHQKQHIGEKFYRKSVREASFVKKRKLRVSQEPFVFREFGKDVL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
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190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
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CCDS12 CYVCSDCGKSFSRYVSFSNHQRDHTAKGPYDCGECGKSYSRKSSLIQHQRVHTGQTAYPC
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD GECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYECEECG
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pF1KSD RKGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSH
..:: .::: :::::::.: :::: :.:: .:. :.: ::::::: :. : ::: .:
CCDS12 YRSHLTEHQRLHTGERPYNCRECGKLFNRKYHLLVHERVHTGERPYACEVCGKLFGNKHS
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10 20 30
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40 50 60 70 80 90
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: .: :::: ::::::.:::..:. ...: .::. ::::::.::.:::..::....:..:
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CCDS12 TGEKPYECSECGKAFAHSSTLIEHWRVHTKERPYECNECGKFFSQNSILIKHQKVHTGEK
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CCDS12 PYKCSECGKFFSRKSSLICHWRVHTGERPYECSECGRAFSSNSHLVRHQRVHTQERPYEC
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CCDS12 IQCGKAFSERSTLVRHQKVHTRERTYECSQCGKLFSHLCNLAQHKKIHT
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CCDS12 DEEAPYQQSTSPQRVSQVRIPKALPSPQKTNPCEICGPVLRQILHLVEHQGTHHGQKLYT
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CCDS12 RSRFLQQQAAHTRKKSN-RTKSAVAFHSVKNHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIRERS
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CCDS12 YMCSECGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEKPYTCGECGKSYRQSSSLITHRRIHTGVRPHQCD
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CCDS12 SFIHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKLFTY
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