Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1969
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1969, 576 aa
1>>>pF1KSDA1969 576 - 576 aa - 576 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3283+/-0.00111; mu= 16.5955+/- 0.069
mean_var=343.0338+/-66.476, 0's: 0 Z-trim(108.8): 2097 B-trim: 103 in 2/50
Lambda= 0.069248
statistics sampled from 14589 (16929) to 14589 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.497), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16
Scan time: 7.810
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_775802 (OMIM: 603982) zinc finger protein 100 [ ( 542) 2880 303.5 1.2e-81
NP_689839 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 is ( 586) 2795 295.1 4.3e-79
NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 2779 293.5 1.3e-78
NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 ( 572) 2758 291.4 5.5e-78
NP_975011 (OMIM: 604768) zinc finger protein 254 i ( 659) 2710 286.7 1.6e-76
NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 852) 2694 285.3 5.5e-76
XP_011525900 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 2687 284.2 7.4e-76
XP_005259754 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 2687 284.2 7.4e-76
NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 73 ( 536) 2684 283.9 9e-76
XP_011525901 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 2684 283.9 9.1e-76
XP_006722660 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 2684 283.9 9.1e-76
NP_066971 (OMIM: 604756) zinc finger protein 273 [ ( 569) 2666 282.2 3.2e-75
XP_016867177 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 569) 2666 282.2 3.2e-75
NP_258429 (OMIM: 606957) zinc finger protein 257 i ( 563) 2653 280.9 7.9e-75
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 2655 281.7 9.5e-75
NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 2619 277.5 8.7e-74
XP_011526007 (OMIM: 603980) PREDICTED: zinc finger ( 531) 2590 274.5 6e-73
NP_001243582 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 818) 2589 274.8 7.8e-73
NP_003414 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 is ( 809) 2588 274.7 8.3e-73
XP_016882704 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72
XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72
XP_016882705 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72
XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72
XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72
XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72
XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72
NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2572 273.0 2.5e-72
XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72
XP_016882697 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72
XP_011526561 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2572 273.0 2.5e-72
XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72
NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2572 273.0 2.5e-72
XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2572 273.0 2.5e-72
NP_001073878 (OMIM: 603981) zinc finger protein 99 ( 864) 2562 272.1 5.2e-72
NP_001265606 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2552 270.8 8.9e-72
XP_016883005 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2552 270.8 8.9e-72
NP_001265591 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2552 270.8 8.9e-72
XP_011526746 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2552 270.8 8.9e-72
XP_016883004 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2552 270.8 8.9e-72
NP_001265590 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2552 270.8 8.9e-72
XP_016883003 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2552 270.8 8.9e-72
XP_011526745 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2552 270.8 8.9e-72
XP_016881605 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2529 268.4 4e-71
NP_001303925 (OMIM: 606957) zinc finger protein 25 ( 531) 2505 266.0 2.2e-70
XP_016867181 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2495 265.0 4.2e-70
XP_016867186 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2495 265.0 4.2e-70
XP_016867183 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2495 265.0 4.2e-70
XP_016867187 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2495 265.0 4.2e-70
XP_016867180 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2495 265.0 4.2e-70
>>NP_775802 (OMIM: 603982) zinc finger protein 100 [Homo (542 aa)
initn: 5579 init1: 2469 opt: 2880 Z-score: 1587.1 bits: 303.5 E(85289): 1.2e-81
Smith-Waterman score: 2901; 74.2% identity (84.0% similar) in 570 aa overlap (1-569:1-542)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDDLKYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLY
::: .::. ::: :::::::::.::: ::::: :::::::::::::::.::. :::.::
NP_775 MDDPRYGMCPLKGASGCPGAERSLLVQSYFEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDSAQQGLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KSD MNVMLENYKNLVFL-GVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPE
.::::::.::::: :.:..: : .::::: :::::.:::::: .::..::.: .::: :
NP_775 RKVMLENYRNLVFLAGIALTKPDLITCLEQGKEPWNIKRHEMVAKPPVICSHFPQDLWAE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD QDIKDSFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCD
::::::::..::..::: :.::::.:: :::: ::::: :.::::: ::::.:: ::
NP_775 QDIKDSFQEAILKKYGKYGHDNLQLQKGCKSVDECKVHKEHDNKLNQCLITTQSNIFQCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KYVKVFHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGK
.:::: : :.:::: ::: ::::::::: :::::::::.::::.:: ::::::..:::
NP_775 PSAKVFHTFSNSNRHKIRHTRKKPFKCKKCEKSFCMLLHLTQHKRFHITENSYQCKDCGK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD AFKWFSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNR
::.:::::: :.::::::::.:::::::::..:: :::::::::::::::::::::::::
NP_775 AFNWFSTLTTHRRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD SSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYL
:::::::: :::: ::::: :::::::.:: :.::..::.:::::::::: ::::. : :
NP_775 SSHLTTHKRIHTGVKPYKCTECGKAFNRSSHLTTHRIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD TKHKIIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHK
: ::: :.::: ::::::::.: : ::::: ::::: :::: :::.:: :: :: ::
NP_775 TTHKITHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKTSHTGEKFYKCEECGKGFNWSSALTKHK
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD MIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHT
::::::::::::::::::.: .::.::.::::::::::.::::::..:: ::.:: :::
NP_775 RIHTGEKPYKCEECGKAFNESSNLTTHKMIHTGEKPYKCDECGKAFNRSSQLTAHKMIHT
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD GEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKP
::::::::::::::::::.:::::: :::::::: ::::: :::: .:
NP_775 GEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKITHTGEKSYKWEECGKDFNQSLSL------------
490 500 510 520
540 550 560 570
pF1KSD YNCEECDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL
::::::::::::::
NP_775 ----------------IKQNNSYWRETLQM
530 540
>>NP_689839 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 isofor (586 aa)
initn: 2794 init1: 2794 opt: 2795 Z-score: 1541.0 bits: 295.1 E(85289): 4.3e-79
Smith-Waterman score: 2795; 75.9% identity (86.4% similar) in 528 aa overlap (35-562:4-531)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD KYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLYMNVM
:::::: ::::::::.::. ::.::: .::
NP_689 MGPLTFRDVKIEFSLEEWQCLDTAQRNLYRDVM
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LENYKNLVFLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPEQDIKD
::::.::::::.:::: : .: ::: :::::.:::::::. :.:::.:..:.:::..:::
NP_689 LENYRNLVFLGIAVSKPDLITWLEQGKEPWNLKRHEMVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKD
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDKYVKV
:::.:::: ::: :::::::: ::: ::.: ::: ::::::::.:::: :::::::
NP_689 SFQKVILRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD FHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKAFKWF
:::: :.::.: :::::::::::. ::::::: .:.:::.:: :: ::.::::::::.:
NP_689 FHKFPNVNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWS
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD STLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRSSHLT
::::.:: :::::::.:::::::::..::.:: :::::::::::.:::::::::::: ::
NP_689 STLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLT
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD THKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLTKHKI
:: ::: ::::::::::::::: : :. :: :: .:::::::: ::: :: : ::::
NP_689 KHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKI
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD IHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKMIHTG
:::::: ::::::::.:: :.::::: ::::::::::. ::::::.::.:: :: ::::
NP_689 IHTGEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTG
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTGEKPY
:::::::::::::..: :: ::::::::::::::.:::::: :: .: ::: : .:::
NP_689 EKPYKCEECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPY
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPYNCEE
:::::::::. :.::::::::: :: :::::::::::::: .:::. :::. : :.::.
NP_689 KCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEK
460 470 480 490 500 510
550 560 570
pF1KSD CDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL
: :.::::::: .. :
NP_689 CGNAFNQSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCKHECGRAF
520 530 540 550 560 570
>>NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 isofor (595 aa)
initn: 6238 init1: 2436 opt: 2779 Z-score: 1532.3 bits: 293.5 E(85289): 1.3e-78
Smith-Waterman score: 2785; 72.5% identity (84.4% similar) in 553 aa overlap (35-558:4-556)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD KYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLYMNVM
::::::::::::.::.::. ::.::: :::
NP_003 MGPLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRNVM
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LENYKNLVFLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHE-MVDEPPAMCSYFTKDLWPEQDIK
::::.::::::..::: : .::::: :: :.::::: :: .: .:::.:..::::::.::
NP_003 LENYRNLVFLGITVSKPDLITCLEQGKEAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQNIK
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DSFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDKYVK
::::.: :.:::::.:::: :::: :.:: :.:: : : ::::::.:::::: ::::::
NP_003 DSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVK
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VFHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKAFKW
: ::: :.:::. ::: :::::: :::::: :. :..:.::: : : :.::::::::.:
NP_003 VAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNW
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRSSHL
::::.::::::::::.:::::::::.:::.: :: ::::::::.::::::.::: : :
NP_003 SSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTL
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLTKHK
:::::::::::::::.:::::::.::::.::. ::.:::::::::: :::.. : :: ::
NP_003 TTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHK
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD IIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKMIHT
::::::: :::..:::.:: :. :: :. ::::::::::: ::::::. :.:::::.:::
NP_003 IIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHT
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTGEKP
:::::::.::::::..: :: :::::::::::::.:: :::.::: :: ::.:::::::
NP_003 GEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKP
400 410 420 430 440 450
490 500 510
pF1KSD YKCEECGKAFNRSSNLTKHK----------------------------IIHTGEKSYKCE
:.::.::::::.:::::.:: ::::::: ::::
NP_003 YECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCE
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KSD ECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPYNCEECDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWES
:::::::::: ::::.:::: .:::.:::: ..::::::: :.
NP_003 ECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDK
520 530 540 550 560 570
pF1KSD L
NP_003 AFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
580 590
>>NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 [Ho (572 aa)
initn: 6391 init1: 2755 opt: 2758 Z-score: 1521.1 bits: 291.4 E(85289): 5.5e-78
Smith-Waterman score: 2758; 73.4% identity (87.0% similar) in 538 aa overlap (30-567:8-545)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDDLKYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLY
.: .:::::::.:::::::.::. ::::::
NP_001 MPGPLGSLEMGVLTFRDVALEFSLEEWQCLDTAQQNLY
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD MNVMLENYKNLVFLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPEQ
:::::::.::::.:.:.:: : .::::: :::::.:::::: :::.. :::..::::.:
NP_001 RNVMLENYRNLVFVGIAASKPDLITCLEQGKEPWNVKRHEMVTEPPVVYSYFAQDLWPKQ
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DIKDSFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDK
:. ::.:::: : :: .::::::: :.:: ::::: :: :::::::::.::: ::
NP_001 GKKNYFQKVILRTYKKCGRENLQLRKYCKSMDECKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQYDK
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YVKVFHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKA
:::::::: :.:::: ::::: ::::.: :::::: ::.:::::: :. :.:.:::::
NP_001 YVKVFHKFSNSNRHKIGHTGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKA
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FKWFSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRS
.. :.:. :::::::.::.:::::::::.. : ::::::::::.:::.:::::::::.:
NP_001 YNEASNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQS
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLT
..::::: ::::::::::::::.::.:::::..::.::::::::::::: :::.. : ::
NP_001 ANLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLT
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KHKIIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKM
::::::::: ::::::::.:. : :: :::::.:::::::: :::::..::.:::::
NP_001 THKIIHTGEKFYKCEECGKAFSRLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKR
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD IHTGEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTG
::.::: :::: :.:::.: .::.:: :::::::::::::::::. :: ::::: ::::
NP_001 IHAGEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTG
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD EKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPY
::::::::::::::.::.:.:::.:::::: :::::::::::::: :: :. ::: .:::
NP_001 EKPYKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPY
460 470 480 490 500 510
550 560 570
pF1KSD NCEECDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL
.:::: ..::.:: : ... . : :
NP_001 KCEECGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
520 530 540 550 560 570
>>NP_975011 (OMIM: 604768) zinc finger protein 254 isofo (659 aa)
initn: 13056 init1: 2703 opt: 2710 Z-score: 1494.7 bits: 286.7 E(85289): 1.6e-76
Smith-Waterman score: 2710; 73.0% identity (85.4% similar) in 541 aa overlap (18-558:2-536)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDDLKYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLY
:: :.: : :::::::::::::::. :. ::::::
NP_975 MPGPPRSL------EMGLLTFRDVAIEFSLEEWQHLDIAQQNLY
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD MNVMLENYKNLVFLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPEQ
:::::::.::.:::.:::: : .::::: ::::::::::::::::.:: .:..::::::
NP_975 RNVMLENYRNLAFLGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHEMVDEPPGMCPHFAQDLWPEQ
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DIKDSFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDK
..::::..::::::: ::::::::: :::::::.::::: ::::.::.:::.: :::
NP_975 GMEDSFQKAILRRYGKYGHENLQLRKGCKSVDEYKVNKEGYNGLNQCFTTAQSKVFQCDK
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YVKVFHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKA
:.:::.::::.:: : ::: :: ::::: : :::: : .::: :. ::.::.:.::::.
NP_975 YLKVFYKFLNSNRPKIRHTEKKSFKCKKRVKLFCMLSHKTQHKSIYHREKSYKCKECGKT
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FKWFSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRS
:.: :::: :..:.: :::.:::: .:. :: ::::::.:::.::: :.:::::.:::::
NP_975 FNWSSTLTNHRKIYTEEKPYKCEEYNKSPKQLSTLTTHEIIHAGEKLYKCEECGEAFNRS
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLT
:.::::::::::::::::::::::: ::::. :: ::. .:::::::: ::: : ::
NP_975 SNLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFIWSSTLTEHKKIHTRKKPYKCEECGKAFIWSSTLT
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KHKIIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKM
.:: .::::: ::::::::.:. ::::: :: :::::: ::: :::::.. :.:::::.
NP_975 RHKRMHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGEKRYKCLECGKAFKQLSTLTTHKI
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD IHTGEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTG
::.::: ::::::::.:::: .::.:::::::::::::::::::: :: :: ::::::
NP_975 IHVGEKLYKCEECGKGFNRSSNLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFIWSSTLTKHKRIHTR
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD EKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPY
::::::::::::: ::.::.:: .::::: ::::::::.:.:::::: :. ::: .:::
NP_975 EKPYKCEECGKAFIWSSTLTRHKRMHTGEKPYKCEECGKSFSQSSTLTTHKIIHTGEKPY
460 470 480 490 500 510
550 560 570
pF1KSD NCEECDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL
.:::: ..:: ::.: :.
NP_975 KCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTEEKPYKCEKCGKAFKQSSILTNHKRIHTGEKPYKCEE
520 530 540 550 560 570
>--
initn: 2342 init1: 620 opt: 620 Z-score: 366.2 bits: 77.9 E(85289): 1.2e-13
Smith-Waterman score: 620; 71.5% identity (89.4% similar) in 123 aa overlap (447-569:537-659)
420 430 440 450 460 470
pF1KSD THKMIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKR
::::: :::::::.:::::.::::::.:::
NP_975 THKIIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTEEKPYKCEKCGKAFKQSSILTNHKR
510 520 530 540 550 560
480 490 500 510 520 530
pF1KSD IHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTR
:::::::::::::::.:::::..::::.:::: : :::::::::: :::::::..:::
NP_975 IHTGEKPYKCEECGKSFNRSSTFTKHKVIHTGVKPYKCEECGKAFFWSSTLTKHKRIHTG
570 580 590 600 610 620
540 550 560 570
pF1KSD QKPYNCEECDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL
..::. :. ..::.::.: .. ..::: ::.
NP_975 EQPYKWEKFGKAFNRSSHLTTDKITHWREILQV
630 640 650
>>NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 107 is (852 aa)
initn: 11252 init1: 2689 opt: 2694 Z-score: 1485.1 bits: 285.3 E(85289): 5.5e-76
Smith-Waterman score: 2694; 71.9% identity (87.6% similar) in 526 aa overlap (33-558:2-527)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD DLKYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLYMN
: :::.:::::::::::.::. ::..:: :
NP_001 MEPLTFKDVAIEFSLEEWQCLDTAQRDLYRN
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VMLENYKNLVFLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPEQDI
:.::::.::::::.:::: .:::::.:::::.:::::: .::.: .:..::::::.:
NP_001 VLLENYRNLVFLGIAVSKPYLITCLEQKKEPWNIKRHEMVAKPPVMSFHFAQDLWPEQNI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD KDSFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDKYV
:::::.: ::::::::.:::::::: ::: :: :.: .:::::.: :::: :.:::
NP_001 KDSFQKVTLRRYGKCEYENLQLRKGCKHVDECTGHKGGHNTVNQCLTATPSKIFQCNKYV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KVFHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKAFK
::: :: :.::.: ::::.: ::::.:.::::.: .:.::.::: : :::.::::::::.
NP_001 KVFDKFSNSNRYKRRHTGNKHFKCKECSKSFCVLSQLTQHRRIHTRVNSYKCEECGKAFN
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD WFSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRSSH
::::::.::::::::::.:::::::::.::: :: :::::: ::: .::::::::...::
NP_001 WFSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSQLTRHKIIHTEEKPNKCEECGKAFKQASH
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLTKH
:: :::::::::::: :::::.:.::: :.:.:..:.::. :::.:: :::: :: ::.:
NP_001 LTIHKIIHTGEKPYKYEECGKVFSQSSHLTTQKILHTGENLYKCKECGKAFNLFSNLTNH
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KIIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKMIH
: ::.::: :::.:::..:: ::.:.:...:::: : ::: : ::::.: .::.:: :
NP_001 KRIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIHTGGKLNKCEECDKAFNRSLKLTAHKKIL
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TGEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTGEK
:::::::::::.::. :: :::::::::::::.::::::.::: :: ::.:::.::
NP_001 MEEKPYKCEECGKVFNQFSTLTRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNQSSNLTEHKKIHTAEK
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD PYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPYNC
:::::::::::. ::: .:. :..::: :::::::::::.:::::.:.:::: .:::.:
NP_001 SYKCEECGKAFNQHSNLINHRKIYSGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTRHKKIHTGEKPYKC
460 470 480 490 500 510
550 560 570
pF1KSD EECDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL
:::: .:.::::: ..
NP_001 EECDRAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECG
520 530 540 550 560 570
>--
initn: 1647 init1: 1647 opt: 1647 Z-score: 919.8 bits: 180.7 E(85289): 1.7e-44
Smith-Waterman score: 1647; 73.8% identity (87.2% similar) in 321 aa overlap (223-543:528-848)
200 210 220 230 240 250
pF1KSD RHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKAFKWFSTLTRHKR
:.:: :. :.::::::::. :::::.:::
NP_001 RHKKIHTGEKPYKCEECDRAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKR
500 510 520 530 540 550
260 270 280 290 300 310
pF1KSD IHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRSSHLTTHKIIHTG
:::::::.:::::::::.:: :: :::.:: :: .::: ::::..::: : :::::::
NP_001 IHTGEKPYKCEECGKAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTG
560 570 580 590 600 610
320 330 340 350 360 370
pF1KSD EKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLTKHKIIHTGEKSY
:::::::: ::.:::::.:.:.:.::.::. :: :: :::: :: .:.::::.:::: .
NP_001 EKPYKCEEHGKVFNQSSNLTTQKIIHTGENLYKFEEHGKAFNLFSNITNHKIIYTGEKPH
620 630 640 650 660 670
380 390 400 410 420 430
pF1KSD KCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKMIHTGEKPYKCEE
:::::::..: :.:: :::::::::::.: :::::: ::.:. ::.::::::::::.:
NP_001 KCEECGKAYNRFSNLTIHKRIHTGEKPYQCAECGKAFNCSSTLNRHKIIHTGEKPYKCKE
680 690 700 710 720 730
440 450 460 470 480 490
pF1KSD CGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTGEKPYKCEECGKA
:::::: : ::::: :::::::::::::::::.::: :::::.:::.:::::::::::.
NP_001 CGKAFNLSSTLTAHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLTTHKKIHTSEKPYKCEECGKS
740 750 760 770 780 790
500 510 520 530 540 550
pF1KSD FNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPYNCEECDNTFNQS
::. :.:. ::::::::: ::: . :.::: ::.:: :.:::: .:::.::
NP_001 FNQFSSLNIHKIIHTGEKPYKCGDYGRAFNLSSNLTTHKKIHTGEKPYKCEYGKT
800 810 820 830 840 850
560 570
pF1KSD SNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL
>>XP_011525900 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger pro (551 aa)
initn: 6099 init1: 2683 opt: 2687 Z-score: 1482.9 bits: 284.2 E(85289): 7.4e-76
Smith-Waterman score: 2687; 72.1% identity (87.1% similar) in 527 aa overlap (35-561:4-530)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD KYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLYMNVM
: :::::::::::::.::. ::.::: :::
XP_011 MGPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRNVM
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LENYKNLVFLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPEQDIKD
::::.::::::..::: : .::::: :.: .::.:::: .: . ::.:..::::::.:::
XP_011 LENYRNLVFLGIVVSKPDLITCLEQGKKPLTMKKHEMVANPSVTCSHFARDLWPEQSIKD
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDKYVKV
:::.: :::: . :.:::..:: :::: ::::.::: ::: ::::::::: :::::::
XP_011 SFQKVTLRRYENYGHDNLQFKKGCESVDECKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIFQCDKYVKV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD FHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKAFKWF
.::: :.:::: :::::::::: .:::.: . :. ::.:: :. ..::::::::.:
XP_011 IHKFSNSNRHKIRHTGKKPFKCIECGKAFNQSSTLTTHKKIHTGEKPFKCEECGKAFNWS
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD STLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRSSHLT
: :: ::::::::: .:::.:::::.. : ::.:::::.:::::.::::::::.:::.::
XP_011 SHLTTHKRIHTGEKRYKCEDCGKAFSRFSYLTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKRSSNLT
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD THKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLTKHKI
:::::::::::::::::::::..:: :..::.::.:::::::::: :::.. : :: ::
XP_011 THKIIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSILTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKHPSVLTTHKR
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD IHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKMIHTG
:::::: :::::::..:.. :.:: :: ::.:::::::: :::::: ::.::::: ::::
XP_011 IHTGEKPYKCEECGRAFKYFSSLTTHKIIHSGEKPYKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTG
340 350 360 370 380 390
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pF1KSD EKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTGEKPY
::::::::::.::. : .::.:::::::..:.:::::::::. ::::::::::::::::
XP_011 EKPYKCEECGEAFKYSSSLTTHKIIHTGQQPFKCEECGKAFKCFSILTTHKRIHTGEKPY
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPYNCEE
:::::::::: ::.:: :: :::::: ::::.:::::..: ::.:..::: .:::.:::
XP_011 KCEECGKAFNSSSHLTAHKRIHTGEKPYKCERCGKAFKRSFILTRHKRIHTGEKPYKCEE
460 470 480 490 500 510
550 560 570
pF1KSD CDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL
: . :. :.: .. :
XP_011 CGKGFKCPSTLTTHKRSGCPTRKLLLSSVSTLNNSEWK
520 530 540 550
>>XP_005259754 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger pro (551 aa)
initn: 6099 init1: 2683 opt: 2687 Z-score: 1482.9 bits: 284.2 E(85289): 7.4e-76
Smith-Waterman score: 2687; 72.1% identity (87.1% similar) in 527 aa overlap (35-561:4-530)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD KYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLYMNVM
: :::::::::::::.::. ::.::: :::
XP_005 MGPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRNVM
10 20 30
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pF1KSD LENYKNLVFLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPEQDIKD
::::.::::::..::: : .::::: :.: .::.:::: .: . ::.:..::::::.:::
XP_005 LENYRNLVFLGIVVSKPDLITCLEQGKKPLTMKKHEMVANPSVTCSHFARDLWPEQSIKD
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDKYVKV
:::.: :::: . :.:::..:: :::: ::::.::: ::: ::::::::: :::::::
XP_005 SFQKVTLRRYENYGHDNLQFKKGCESVDECKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIFQCDKYVKV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD FHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKAFKWF
.::: :.:::: :::::::::: .:::.: . :. ::.:: :. ..::::::::.:
XP_005 IHKFSNSNRHKIRHTGKKPFKCIECGKAFNQSSTLTTHKKIHTGEKPFKCEECGKAFNWS
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD STLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRSSHLT
: :: ::::::::: .:::.:::::.. : ::.:::::.:::::.::::::::.:::.::
XP_005 SHLTTHKRIHTGEKRYKCEDCGKAFSRFSYLTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKRSSNLT
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD THKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLTKHKI
:::::::::::::::::::::..:: :..::.::.:::::::::: :::.. : :: ::
XP_005 THKIIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSILTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKHPSVLTTHKR
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD IHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKMIHTG
:::::: :::::::..:.. :.:: :: ::.:::::::: :::::: ::.::::: ::::
XP_005 IHTGEKPYKCEECGRAFKYFSSLTTHKIIHSGEKPYKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTG
340 350 360 370 380 390
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pF1KSD EKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTGEKPY
::::::::::.::. : .::.:::::::..:.:::::::::. ::::::::::::::::
XP_005 EKPYKCEECGEAFKYSSSLTTHKIIHTGQQPFKCEECGKAFKCFSILTTHKRIHTGEKPY
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pF1KSD KCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPYNCEE
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XP_005 KCEECGKAFNSSSHLTAHKRIHTGEKPYKCERCGKAFKRSFILTRHKRIHTGEKPYKCEE
460 470 480 490 500 510
550 560 570
pF1KSD CDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL
: . :. :.: .. :
XP_005 CGKGFKCPSTLTTHKRSGCPTRKLLLSSVSTLNNSEWK
520 530 540 550
>>NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 737 [H (536 aa)
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Smith-Waterman score: 2684; 72.7% identity (87.5% similar) in 521 aa overlap (35-555:4-524)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD KYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLYMNVM
: :::::::::::::.::. ::.::: :::
NP_001 MGPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRNVM
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pF1KSD LENYKNLVFLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPEQDIKD
::::.::::::..::: : .::::: :.: .::.:::: .: . ::.:..::::::.:::
NP_001 LENYRNLVFLGIVVSKPDLITCLEQGKKPLTMKKHEMVANPSVTCSHFARDLWPEQSIKD
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130 140 150 160 170 180
pF1KSD SFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDKYVKV
:::.: :::: . :.:::..:: :::: ::::.::: ::: ::::::::: :::::::
NP_001 SFQKVTLRRYENYGHDNLQFKKGCESVDECKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIFQCDKYVKV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD FHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKAFKWF
.::: :.:::: :::::::::: .:::.: . :. ::.:: :. ..::::::::.:
NP_001 IHKFSNSNRHKIRHTGKKPFKCIECGKAFNQSSTLTTHKKIHTGEKPFKCEECGKAFNWS
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pF1KSD STLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRSSHLT
: :: ::::::::: .:::.:::::.. : ::.:::::.:::::.::::::::.:::.::
NP_001 SHLTTHKRIHTGEKRYKCEDCGKAFSRFSYLTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKRSSNLT
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD THKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLTKHKI
:::::::::::::::::::::..:: :..::.::.:::::::::: :::.. : :: ::
NP_001 THKIIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSILTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKHPSVLTTHKR
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pF1KSD IHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKMIHTG
:::::: :::::::..:.. :.:: :: ::.:::::::: :::::: ::.::::: ::::
NP_001 IHTGEKPYKCEECGRAFKYFSSLTTHKIIHSGEKPYKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTG
340 350 360 370 380 390
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pF1KSD EKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTGEKPY
::::::::::.::. : .::.:::::::..:.:::::::::. ::::::::::::::::
NP_001 EKPYKCEECGEAFKYSSSLTTHKIIHTGQQPFKCEECGKAFKCFSILTTHKRIHTGEKPY
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490 500 510 520 530 540
pF1KSD KCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPYNCEE
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NP_001 KCEECGKAFNSSSHLTAHKRIHTGEKPYKCERCGKAFKRSFILTRHKRIHTGEKPYKCEE
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pF1KSD CDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL
: . :. :.:
NP_001 CGKGFKCPSTLTTHKVIHTGEKL
520 530
>>XP_011525901 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger pro (550 aa)
initn: 4395 init1: 2680 opt: 2684 Z-score: 1481.2 bits: 283.9 E(85289): 9.1e-76
Smith-Waterman score: 2684; 72.7% identity (87.5% similar) in 521 aa overlap (35-555:4-524)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD KYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLYMNVM
: :::::::::::::.::. ::.::: :::
XP_011 MGPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRNVM
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70 80 90 100 110 120
pF1KSD LENYKNLVFLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPEQDIKD
::::.::::::..::: : .::::: :.: .::.:::: .: . ::.:..::::::.:::
XP_011 LENYRNLVFLGIVVSKPDLITCLEQGKKPLTMKKHEMVANPSVTCSHFARDLWPEQSIKD
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDKYVKV
:::.: :::: . :.:::..:: :::: ::::.::: ::: ::::::::: :::::::
XP_011 SFQKVTLRRYENYGHDNLQFKKGCESVDECKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIFQCDKYVKV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD FHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKAFKWF
.::: :.:::: :::::::::: .:::.: . :. ::.:: :. ..::::::::.:
XP_011 IHKFSNSNRHKIRHTGKKPFKCIECGKAFNQSSTLTTHKKIHTGEKPFKCEECGKAFNWS
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD STLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRSSHLT
: :: ::::::::: .:::.:::::.. : ::.:::::.:::::.::::::::.:::.::
XP_011 SHLTTHKRIHTGEKRYKCEDCGKAFSRFSYLTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKRSSNLT
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD THKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLTKHKI
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XP_011 THKIIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSILTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKHPSVLTTHKR
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XP_011 IHTGEKPYKCEECGRAFKYFSSLTTHKIIHSGEKPYKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTG
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pF1KSD KCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPYNCEE
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XP_011 KCEECGKAFNSSSHLTAHKRIHTGEKPYKCERCGKAFKRSFILTRHKRIHTGEKPYKCEE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]