Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA2005
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA2005, 1584 aa
1>>>pF1KSDA2005 1584 - 1584 aa - 1584 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6240+/-0.00137; mu= 17.0659+/- 0.082
mean_var=85.4751+/-17.304, 0's: 0 Z-trim(100.5): 26 B-trim: 140 in 1/50
Lambda= 0.138725
statistics sampled from 6128 (6131) to 6128 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.515), E-opt: 0.2 (0.188), width: 16
Scan time: 4.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34681.1 SAMD9L gene_id:219285|Hs108|chr7 (1584) 10487 2110.2 0
CCDS34680.1 SAMD9 gene_id:54809|Hs108|chr7 (1589) 5307 1073.4 0
>>CCDS34681.1 SAMD9L gene_id:219285|Hs108|chr7 (1584 aa)
initn: 10487 init1: 10487 opt: 10487 Z-score: 11334.9 bits: 2110.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10487; 100.0% identity (100.0% similar) in 1584 aa overlap (1-1584:1-1584)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSKQVSLPEMIKDWTKEHVKKWVNEDLKINEQYGQILLSEEVTGLVLQELTEKDLVEMGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MSKQVSLPEMIKDWTKEHVKKWVNEDLKINEQYGQILLSEEVTGLVLQELTEKDLVEMGL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PWGPALLIKRSYNKLNSKSPESDNHDPGQLDNSKPSKTEHQKNPKHTKKEEENSMSSNID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PWGPALLIKRSYNKLNSKSPESDNHDPGQLDNSKPSKTEHQKNPKHTKKEEENSMSSNID
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD YDPREIRDIKQEESILMKENVLDEVANAKHKKKGKLKPEQLTCMPYPFDQFHDSHRYIEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YDPREIRDIKQEESILMKENVLDEVANAKHKKKGKLKPEQLTCMPYPFDQFHDSHRYIEH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YTLQPETGALNLIDPIHEFKALTNTETATEVDIKMKFSNEVFRFASACMNSRTNGTIHFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YTLQPETGALNLIDPIHEFKALTNTETATEVDIKMKFSNEVFRFASACMNSRTNGTIHFG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VKDKPHGEIVGVKITSKAAFIDHFNVMIKKYFEESEINEAKKCIREPRFVEVLLQNNTPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VKDKPHGEIVGVKITSKAAFIDHFNVMIKKYFEESEINEAKKCIREPRFVEVLLQNNTPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DRFVIEVDTIPKHSICNDKYFYIQMQICKDKIWKQNQNLSLFVREGASSRDILANSKQRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DRFVIEVDTIPKHSICNDKYFYIQMQICKDKIWKQNQNLSLFVREGASSRDILANSKQRD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VDFKAFLQNLKSLVASRKEAEEEYGMKAMKKESEGLKLVKLLIGNRDSLDNSYYDWYILV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VDFKAFLQNLKSLVASRKEAEEEYGMKAMKKESEGLKLVKLLIGNRDSLDNSYYDWYILV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TNKCHPNQIKHLDFLKEIKWFAVLEFDPESMINGVVKAYKESRVANLHFPNQYEDKTTNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TNKCHPNQIKHLDFLKEIKWFAVLEFDPESMINGVVKAYKESRVANLHFPNQYEDKTTNM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD WEKISTLNLYQQPSWIFCNGRSDLKSETYKPLEPHLWQRERASEVRKLILFLTDENIMTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 WEKISTLNLYQQPSWIFCNGRSDLKSETYKPLEPHLWQRERASEVRKLILFLTDENIMTR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GKFLVVFLLLSSVESPGDPLIETFWAFYQALKGMENMLCISVNSHIYQRWKDLLQTRMKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GKFLVVFLLLSSVESPGDPLIETFWAFYQALKGMENMLCISVNSHIYQRWKDLLQTRMKM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD EDELTNHSISTLNIELVNSTILKLKSVTRSSRRFLPARGSSSVILEKKKEDVLTALEILC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EDELTNHSISTLNIELVNSTILKLKSVTRSSRRFLPARGSSSVILEKKKEDVLTALEILC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD ENECTETDIEKDKSKFLEFKKSKEEHFYRGGKVSWWNFYFSSENYSSDFVKRDSYEKLKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ENECTETDIEKDKSKFLEFKKSKEEHFYRGGKVSWWNFYFSSENYSSDFVKRDSYEKLKD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD LIHCWAESPKPIFAKIINLYHHPGCGGTTLAMHVLWDLKKNFRCAVLKNKTTDFAEIAEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LIHCWAESPKPIFAKIINLYHHPGCGGTTLAMHVLWDLKKNFRCAVLKNKTTDFAEIAEQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD VINLVTYRAKSHQDYIPVLLLVDDFEEQENVYFLQNAIHSVLAEKDLRYEKTLVIILNCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VINLVTYRAKSHQDYIPVLLLVDDFEEQENVYFLQNAIHSVLAEKDLRYEKTLVIILNCM
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD RSRNPDESAKLADSIALNYQLSSKEQRAFGAKLKEIEKQHKNCENFYSFMIMKSNFDETY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RSRNPDESAKLADSIALNYQLSSKEQRAFGAKLKEIEKQHKNCENFYSFMIMKSNFDETY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD IENVVRNILKGQDVDSKEAQLISFLALLSSYVTDSTISVSQCEIFLGIIYTSTPWEPESL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IENVVRNILKGQDVDSKEAQLISFLALLSSYVTDSTISVSQCEIFLGIIYTSTPWEPESL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD EDKMGTYSTLLIKTEVAEYGRYTGVRIIHPLIALYCLKELERSYHLDKCQIALNILEENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EDKMGTYSTLLIKTEVAEYGRYTGVRIIHPLIALYCLKELERSYHLDKCQIALNILEENL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD FYDSGIGRDKFQHDVQTLLLTRQRKVYGDETDTLFSPLMEALQNKDIEKVLSAGSRRFPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FYDSGIGRDKFQHDVQTLLLTRQRKVYGDETDTLFSPLMEALQNKDIEKVLSAGSRRFPQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD NAFICQALARHFYIKEKDFNTALDWARQAKMKAPKNSYISDTLGQVYKSEIKWWLDGNKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NAFICQALARHFYIKEKDFNTALDWARQAKMKAPKNSYISDTLGQVYKSEIKWWLDGNKN
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD CRSITVNDLTHLLEAAEKASRAFKESQRQTDSKNYETENWSPQKSQRRYDMYNTACFLGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CRSITVNDLTHLLEAAEKASRAFKESQRQTDSKNYETENWSPQKSQRRYDMYNTACFLGE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD IEVGLYTIQILQLTPFFHKENELSKKHMVQFLSGKWTIPPDPRNECYLALSKFTSHLKNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IEVGLYTIQILQLTPFFHKENELSKKHMVQFLSGKWTIPPDPRNECYLALSKFTSHLKNL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD QSDLKRCFDFFIDYMVLLKMRYTQKEIAEIMLSKKVSRCFRKYTELFCHLDPCLLQSKES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QSDLKRCFDFFIDYMVLLKMRYTQKEIAEIMLSKKVSRCFRKYTELFCHLDPCLLQSKES
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD QLLQEENCRKKLEALRADRFAGLLEYLNPNYKDATTMESIVNEYAFLLQQNSKKPMTNEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QLLQEENCRKKLEALRADRFAGLLEYLNPNYKDATTMESIVNEYAFLLQQNSKKPMTNEK
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD QNSILANIILSCLKPNSKLIQPLTTLKKQLREVLQFVGLSHQYPGPYFLACLLFWPENQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QNSILANIILSCLKPNSKLIQPLTTLKKQLREVLQFVGLSHQYPGPYFLACLLFWPENQE
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD LDQDSKLIEKYVSSLNRSFRGQYKRMCRSKQASTLFYLGKRKGLNSIVHKAKIEQYFDKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LDQDSKLIEKYVSSLNRSFRGQYKRMCRSKQASTLFYLGKRKGLNSIVHKAKIEQYFDKA
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD QNTNSLWHSGDVWKKNEVKDLLRRLTGQAEGKLISVEYGTEEKIKIPVISVYSGPLRSGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QNTNSLWHSGDVWKKNEVKDLLRRLTGQAEGKLISVEYGTEEKIKIPVISVYSGPLRSGR
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580
pF1KSD NIERVSFYLGFSIEGPLAYDIEVI
::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NIERVSFYLGFSIEGPLAYDIEVI
1570 1580
>>CCDS34680.1 SAMD9 gene_id:54809|Hs108|chr7 (1589 aa)
initn: 4712 init1: 3005 opt: 5307 Z-score: 5732.0 bits: 1073.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6201; 60.3% identity (81.7% similar) in 1603 aa overlap (1-1584:1-1589)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSKQVSLPEMIKDWTKEHVKKWVNEDLKINEQYGQILLSEEVTGLVLQELTEKDLVEMGL
:.::..::: ::::: :..:. :. ::.... .:: ..:.: ::. : .. ::.::.
CCDS34 MAKQLNLPENTDDWTKEDVNQWL-ESHKIDQKHREILTEQDVNGAVLKWLKKEHLVDMGI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD PWGPALLIKRSYNKLNSKSPESDNHDPGQLDNSKPSK------TEHQKNPKHTKKEEENS
:::. :.. ...: . . : :. . ... .:::: : ::. ..:.:.....
CCDS34 THGPAIQIEELFKELRKTAIE-DSIQTSKM--GKPSKNAPKDQTVSQKERRETSKQKQKG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD MSSNIDY-DPREIRDIKQEESILMKENVLDEVANAKHKKKGKLKPEQLTCMPYPFDQFHD
. : :. .: . . . : : . :.. .:... . .:::. ::::.: .
CCDS34 -KENPDMANPSAMSTTAKGSKSLKVELIEDKIDYTKERQPSI----DLTCVSYPFDEFSN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD SHRYIEHYTLQPETGALNLIDPIHEFKALTNTETATEVDIKMKFSNEVFRFASACMNSRT
.:: ..:::::: :::::::::::.::: :::: :.::::::::::::::::::::
CCDS34 PYRYKLDFSLQPETGPGNLIDPIHEFKAFTNTATATEEDVKMKFSNEVFRFASACMNSRT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD NGTIHFGVKDKPHGEIVGVKIT--SKAAFIDHFNVMIKKYFEESEINEAKKCIREPRFVE
::::::::::::::.:::.:.: .: :.:.:::.::.::::. ....::::::::::::
CCDS34 NGTIHFGVKDKPHGKIVGIKVTNDTKEALINHFNLMINKYFEDHQVQQAKKCIREPRFVE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD VLLQNNTPSDRFVIEVDTIPKHSICNDKYFYIQMQICKDKIWKQNQNLSLFVREGASSRD
::: :.: ::::::::: ::. : :. :: :.:: ..:::.:....:::::.:.::.:
CCDS34 VLLPNSTLSDRFVIEVDIIPQFSECQYDYFQIKMQNYNNKIWEQSKKFSLFVRDGTSSKD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD ILANSKQRDVDFKAFLQNLKSLVASRKEAEEEYGMKAMKKESEGLKLVKLLIGNRDSLDN
: :. :::.:: ..:.:. ::: :::.. :. ::: :: :::::: ::.: :::
CCDS34 ITKNK----VDFRAFKADFKTLAESRKAAEEKFRAKTNKKEREGPKLVKLLTGNQDLLDN
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KSD SYYDWYILVTNKCHPNQIKHLDFLKEIKWFAVLEFDPESMINGVVKAYKESRVANLHFPN
:::. ::::::::::.: ::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::.
CCDS34 SYYEQYILVTNKCHPDQTKHLDFLKEIKWFAVLEFDPESNINGVVKAYKESRVANLHFPS
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KSD QYEDKTTNMWEKISTLNLYQQPSWIFCNGRSDLKSETYKPLEPHLWQRERASEVRKLILF
: .. :. : :::::::.:::::::::: :: :: :::..: :::::::.::::: :
CCDS34 VYVEQKTTPNETISTLNLYHQPSWIFCNGRLDLDSEKYKPFDPSSWQRERASDVRKLISF
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KSD LTDENIMTRGKFLVVFLLLSSVESPGDPLIETFWAFYQALKGMENMLCISVNSHIYQRWK
:: :.:: ::::::::::::::..: ::::::: :::: ::::::.::: :. ::.: ::
CCDS34 LTHEDIMPRGKFLVVFLLLSSVDDPRDPLIETFCAFYQDLKGMENILCICVHPHIFQGWK
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KSD DLLQTRM-KMEDELTNHSISTLNIELVNSTILKLKSVTRSSRRFLPARGSSSVILEKKKE
:::..:. : .::.... ::.:..: .:.:::::::::.::.:.::. : :.:.: ::.:
CCDS34 DLLEARLIKHQDEISSQCISALSLEEINGTILKLKSVTQSSKRLLPSIGLSTVLL-KKEE
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KSD DVLTALEILCENECTETDIEKDKSKFLEFKKSKEEHFYRGGKVSWWNFYFSSENYSSDFV
:..:::::.::::: : .::::.:::::: :::: :::::::::::::::::.::: ::
CCDS34 DIMTALEIICENECEGTLLEKDKNKFLEFKASKEEDFYRGGKVSWWNFYFSSESYSSPFV
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KSD KRDSYEKLKDLIHCWAESPKPIFAKIINLYHHPGCGGTTLAMHVLWDLKKNFRCAVLKNK
:::.::.:. .:. :.: :: .:::.:::::::::::::::.::.:.:.:::::::::
CCDS34 KRDKYERLEAMIQNCADSSKPTSTKIIHLYHHPGCGGTTLAMHILWELRKKFRCAVLKNK
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KSD TTDFAEIAEQVINLVTYRAKSHQDYIPVLLLVDDFEEQENVYFLQNAIHSVLAEKDLRYE
:.::.::.::: .:.:: : ..:.:.::::::::::::.:::.:: .:....:.: .:::
CCDS34 TVDFSEIGEQVTSLITYGAMNRQEYVPVLLLVDDFEEQDNVYLLQYSIQTAIAKKYIRYE
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KSD KTLVIILNCMRSRNPDESAKLADSIALNYQLSSKEQRAFGAKLKEIEKQHKNCENFYSFM
: ::::::::::.::..::.. ::::. ::: :::::: :::::..:::: :.:::::
CCDS34 KPLVIILNCMRSQNPEKSARIPDSIAVIQQLSPKEQRAFELKLKEIKEQHKNFEDFYSFM
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940 950
pF1KSD IMKSNFDETYIENVVRNILKGQDVDSKEAQLISFLALLSSYVTDSTISVSQCEIFLGIIY
:::.::.. :::::::::::::.. .:::.:.::::::.::: :.:::.:::: ::::
CCDS34 IMKTNFNKEYIENVVRNILKGQNIFTKEAKLFSFLALLNSYVPDTTISLSQCEKFLGIGN
890 900 910 920 930 940
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD TSTPWEPESLEDKMGTYSTLLIKTEVAEYGRYTGVRIIHPLIALYCLKELERSYHLDKCQ
.. : :..:::::::::.:::::: : : : :::::: ::: . :.::..::::.: :
CCDS34 KKAFWGTEKFEDKMGTYSTILIKTEVIECGNYCGVRIIHSLIAEFSLEELKKSYHLNKSQ
950 960 970 980 990 1000
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD IALNILEENLFYDSGIGRDKFQHDVQTLLLTRQRKVYGDETDTLFSPLMEALQ----NKD
: :..: ::::.:.:.:..:: .:..::::::.: . :: . :::..:::. :.
CCDS34 IMLDMLTENLFFDTGMGKSKFLQDMHTLLLTRHRDEHEGETGNWFSPFIEALHKDEGNEA
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD IEKVLSAGSRRFPQNAFICQALARHFYIKEKDFNTALDWARQAKMKAPKNSYISDTLGQV
.: :: . .:: :::::::::::::::.:::..::.::.:::. : :::::::::::
CCDS34 VEAVLLESIHRFNPNAFICQALARHFYIKKKDFGNALNWAKQAKIIEPDNSYISDTLGQV
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD YKSEIKWWLDGNKNCRSITVNDLTHLLEAAEKASRAFKESQRQTDSKNYETENWSPQKSQ
:::.:.::.. : . .:.:.:: ::. ::.:: ::::::.:.....::... ::.
CCDS34 YKSKIRWWIEENGGNGNISVDDLIALLDLAEHASSAFKESQQQSEDREYEVKERLYPKSK
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KSD RRYDMYNTACFLGEIEVGLYTIQILQLTPFFHKENELSKKHMVQFLSGKWTIPPDPRNEC
:::: :: : . ::::::::::::::: ::: ..:::::..::.:.::. :: :: ::
CCDS34 RRYDTYNIAGYQGEIEVGLYTIQILQLIPFFDNKNELSKRYMVNFVSGSSDIPGDPNNEY
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KSD YLALSKFTSHLKNLQSDLKRCFDFFIDYMVLLKMRYTQKEIAEIMLSKKVSRCFRKYTEL
:::... .: .:. .::. :::: .:.:::: : . :. : .::. :.::...
CCDS34 KLALKNYIPYLTKLKFSLKKSFDFFDEYFVLLKPRNNIKQNEEAKTRRKVAGYFKKYVDI
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KSD FCHLDPCL----LQSKESQLLQEENCRKKLEALRADRFAGLLEYLNPNYKDA-TTMESIV
:: :. : :: :. :: : ::..: ::.::.:.:::::: . .:: .::. ::
CCDS34 FCLLEESQNNTGLGSKFSEPLQVERCRRNLVALKADKFSGLLEYLIKSQEDAISTMKCIV
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KSD NEYAFLLQQNSKKPMTNEKQNSILANIILSCLKPNSKLIQPLTTLKKQLREVLQFVGLSH
:::.:::.: . : ...:: : :::::::::..:.:.:..:. :: ::::::: .::..
CCDS34 NEYTFLLEQCTVKIQSKEKLNFILANIILSCIQPTSRLVKPVEKLKDQLREVLQPIGLTY
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KSD QYPGPYFLACLLFWPENQELDQDSKLIEKYVSSLNRSFRGQYKRMCRSKQASTLFYLGKR
:. ::::: ::::::::.::: :. ...:...:. ::.::::.: :.:: . :.:::
CCDS34 QFSEPYFLASLLFWPENQQLDQHSEQMKEYAQALKNSFKGQYKHMHRTKQPIAYFFLGKG
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1490 1500 1510 1520 1530 1540
pF1KSD KGLNSIVHKAKIEQYFDKAQNTNSLWHSGDVWKKNEVKDLLRRLTGQAEGKLISVEYGTE
: :. .:::.::.: : :. . ::::.::::::...:..:: :: :.::.. . .::: .
CCDS34 KRLERLVHKGKIDQCFKKTPDINSLWQSGDVWKEEKVQELLLRLQGRAENNCLYIEYGIN
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1550 1560 1570 1580
pF1KSD EKIKIPVISVYSGPLRSGRNIERVSFYLGFSIEGPLAYDIEVI
::: ::. .. : :::::.::.::::::::: ::::::::..
CCDS34 EKITIPITPAFLGQLRSGRSIEKVSFYLGFSIGGPLAYDIEIV
1550 1560 1570 1580
1584 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 07:59:16 2016 done: Thu Nov 3 07:59:17 2016
Total Scan time: 4.380 Total Display time: 0.210
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]