Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDB0003
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0003, 502 aa
1>>>pF1KSDB0003 502 - 502 aa - 502 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4177+/-0.000818; mu= 18.3491+/- 0.049
mean_var=73.7706+/-14.714, 0's: 0 Z-trim(108.6): 75 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.149325
statistics sampled from 10216 (10292) to 10216 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.689), E-opt: 0.2 (0.316), width: 16
Scan time: 3.190
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5175.1 PDE7B gene_id:27115|Hs108|chr6 ( 450) 2894 632.7 2.6e-181
CCDS56538.1 PDE7A gene_id:5150|Hs108|chr8 ( 482) 1807 398.5 8.6e-111
CCDS34901.1 PDE7A gene_id:5150|Hs108|chr8 ( 456) 1806 398.3 9.6e-111
CCDS54858.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 673) 784 178.2 2.5e-44
CCDS56371.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 679) 784 178.2 2.5e-44
CCDS56372.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 687) 784 178.2 2.5e-44
CCDS56370.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 507) 782 177.7 2.7e-44
CCDS56373.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 745) 784 178.2 2.7e-44
CCDS54859.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 748) 784 178.2 2.7e-44
CCDS56369.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 518) 782 177.7 2.7e-44
CCDS47213.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 809) 784 178.3 2.9e-44
CCDS30743.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 564) 746 170.0 6.3e-42
CCDS30742.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 721) 746 170.0 7.7e-42
CCDS632.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 736) 746 170.0 7.8e-42
CCDS72802.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 503) 742 169.1 1e-41
CCDS12238.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 647) 742 169.1 1.3e-41
CCDS45963.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 825) 742 169.2 1.6e-41
CCDS45962.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 860) 742 169.2 1.6e-41
CCDS58649.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 864) 742 169.2 1.6e-41
CCDS45961.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 886) 742 169.2 1.6e-41
CCDS46016.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 606) 722 164.8 2.4e-40
CCDS42523.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 680) 722 164.9 2.6e-40
CCDS12373.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 712) 722 164.9 2.7e-40
CCDS73477.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 ( 495) 590 136.3 7.4e-32
CCDS53800.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 ( 516) 590 136.3 7.7e-32
CCDS8882.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 ( 536) 590 136.3 7.9e-32
CCDS74612.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 501) 587 135.7 1.2e-31
CCDS58741.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 519) 587 135.7 1.2e-31
CCDS33344.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 535) 587 135.7 1.2e-31
CCDS2285.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 545) 587 135.7 1.3e-31
CCDS5437.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 ( 634) 558 129.5 1.1e-29
CCDS55099.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 ( 709) 558 129.5 1.2e-29
CCDS55100.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 ( 769) 558 129.6 1.3e-29
CCDS42947.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 433) 519 121.0 2.7e-27
CCDS42944.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 459) 519 121.0 2.8e-27
CCDS33571.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 465) 519 121.0 2.8e-27
CCDS42946.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 466) 519 121.0 2.8e-27
CCDS33570.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 491) 519 121.0 3e-27
CCDS42943.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 492) 519 121.0 3e-27
CCDS42941.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 507) 519 121.0 3e-27
CCDS42945.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 526) 519 121.0 3.1e-27
CCDS33568.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 533) 519 121.1 3.2e-27
CCDS33567.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 540) 519 121.1 3.2e-27
CCDS42942.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 552) 519 121.1 3.3e-27
CCDS33569.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 567) 519 121.1 3.3e-27
CCDS13690.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 593) 519 121.1 3.4e-27
CCDS34055.1 PDE5A gene_id:8654|Hs108|chr4 ( 833) 480 112.8 1.5e-24
CCDS3713.1 PDE5A gene_id:8654|Hs108|chr4 ( 875) 480 112.8 1.6e-24
CCDS42786.1 PDE11A gene_id:50940|Hs108|chr2 ( 489) 445 105.1 1.9e-22
CCDS46459.1 PDE11A gene_id:50940|Hs108|chr2 ( 575) 445 105.1 2.1e-22
>>CCDS5175.1 PDE7B gene_id:27115|Hs108|chr6 (450 aa)
initn: 2894 init1: 2894 opt: 2894 Z-score: 3368.5 bits: 632.7 E(32554): 2.6e-181
Smith-Waterman score: 2894; 100.0% identity (100.0% similar) in 423 aa overlap (80-502:28-450)
50 60 70 80 90 100
pF1KSD VKLVWKSKSELQATKQRGILDNEDALRSFPGDIRLRGQTGVRAERRGSYPFIDFRLLNST
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 MSCLMVERCGEILFENPDQNAKCVCMLGDIRLRGQTGVRAERRGSYPFIDFRLLNST
10 20 30 40 50
110 120 130 140 150 160
pF1KSD TYSGEIGTKKKVKRLLSFQRYFHASRLLRGIIPQAPLHLLDEDYLGQARHMLSKVGMWDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 TYSGEIGTKKKVKRLLSFQRYFHASRLLRGIIPQAPLHLLDEDYLGQARHMLSKVGMWDF
60 70 80 90 100 110
170 180 190 200 210 220
pF1KSD DIFLFDRLTNGNSLVTLLCHLFNTHGLIHHFKLDMVTLHRFLVMVQEDYHSQNPYHNAVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 DIFLFDRLTNGNSLVTLLCHLFNTHGLIHHFKLDMVTLHRFLVMVQEDYHSQNPYHNAVH
120 130 140 150 160 170
230 240 250 260 270 280
pF1KSD AADVTQAMHCYLKEPKLASFLTPLDIMLGLLAAAAHDVDHPGVNQPFLIKTNHHLANLYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 AADVTQAMHCYLKEPKLASFLTPLDIMLGLLAAAAHDVDHPGVNQPFLIKTNHHLANLYQ
180 190 200 210 220 230
290 300 310 320 330 340
pF1KSD NMSVLENHHWRSTIGMLRESRLLAHLPKEMTQDIEQQLGSLILATDINRQNEFLTRLKAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 NMSVLENHHWRSTIGMLRESRLLAHLPKEMTQDIEQQLGSLILATDINRQNEFLTRLKAH
240 250 260 270 280 290
350 360 370 380 390 400
pF1KSD LHNKDLRLEDAQDRHFMLQIALKCADICNPCRIWEMSKQWSERVCEEFYRQGELEQKFEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 LHNKDLRLEDAQDRHFMLQIALKCADICNPCRIWEMSKQWSERVCEEFYRQGELEQKFEL
300 310 320 330 340 350
410 420 430 440 450 460
pF1KSD EISPLCNQQKDSIPSIQIGFMSYIVEPLFREWAHFTGNSTLSENMLGHLAHNKAQWKSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 EISPLCNQQKDSIPSIQIGFMSYIVEPLFREWAHFTGNSTLSENMLGHLAHNKAQWKSLL
360 370 380 390 400 410
470 480 490 500
pF1KSD PRQHRSRGSSGSGPDHDHAGQGTESEEQEGDSP
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 PRQHRSRGSSGSGPDHDHAGQGTESEEQEGDSP
420 430 440 450
>>CCDS56538.1 PDE7A gene_id:5150|Hs108|chr8 (482 aa)
initn: 1784 init1: 1714 opt: 1807 Z-score: 2102.5 bits: 398.5 E(32554): 8.6e-111
Smith-Waterman score: 1820; 57.8% identity (81.9% similar) in 465 aa overlap (34-481:4-467)
10 20 30 40 50
pF1KSD LERYFHPAELGRRWTGPEGVLPSSPGSRPGCQQGP-LPWD--LPEMI--RMVKLVWKSKS
: : : :: : .:. . : . ..:.:
CCDS56 MEVCYQLPVLPLDRPVPQHVLSRRGAISFSSSS
10 20 30
60 70 80 90 100
pF1KSD EL-------QATKQRGIL--DNEDALRSFP---GDIRLRGQTGVRAERRGSYPFIDFRLL
: : ...:: . :. : . ::.:.:...: ..:::::.:.::::..
CCDS56 ALFGCPNPRQLSQRRGAISYDSSDQTALYIRMLGDVRVRSRAGFESERRGSHPYIDFRIF
40 50 60 70 80 90
110 120 130 140 150 160
pF1KSD NSTTYSGEIGTKKKVKRLLSFQRYFHASRLLRGIIPQAPLHLLDEDYLGQARHMLSKVGM
.: . . ....::::::::...::..:: . :..::.:: :::. :: :::
CCDS56 HSQSEIEVSVSARNIRRLLSFQRYLRSSRFFRGTAVSNSLNILDDDYNGQAKCMLEKVGN
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KSD WDFDIFLFDRLTNGNSLVTLLCHLFNTHGLIHHFKLDMVTLHRFLVMVQEDYHSQNPYHN
:.::::::::::::::::.: :::. ::::..:.:::. :.:::::.::::::::::::
CCDS56 WNFDIFLFDRLTNGNSLVSLTFHLFSLHGLIEYFHLDMMKLRRFLVMIQEDYHSQNPYHN
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KSD AVHAADVTQAMHCYLKEPKLASFLTPLDIMLGLLAAAAHDVDHPGVNQPFLIKTNHHLAN
:::::::::::::::::::::. .:: ::.:.:.:::.::.:::::::::::::::.::.
CCDS56 AVHAADVTQAMHCYLKEPKLANSVTPWDILLSLIAAATHDLDHPGVNQPFLIKTNHYLAT
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KSD LYQNMSVLENHHWRSTIGMLRESRLLAHLPKEMTQDIEQQLGSLILATDINRQNEFLTRL
::.: ::::::::::..:.:::: :..::: : :..: :.:.:::::::.::::.:. .
CCDS56 LYKNTSVLENHHWRSAVGLLRESGLFSHLPLESRQQMETQIGALILATDISRQNEYLSLF
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KSD KAHLHNKDLRLEDAQDRHFMLQIALKCADICNPCRIWEMSKQWSERVCEEFYRQGELEQK
..:: :: :::.. ::..::.:::::::::::: ::.::::::.: :::..::..:.:
CCDS56 RSHLDRGDLCLEDTRHRHLVLQMALKCADICNPCRTWELSKQWSEKVTEEFFHQGDIEKK
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KSD FELEISPLCNQQKDSIPSIQIGFMSYIVEPLFREWAHFTGNSTLSENMLGHLAHNKAQWK
..: .::::... .:: .::::::.:.::::: :::.:. :. ::..::::.. :::.::
CCDS56 YHLGVSPLCDRHTESIANIQIGFMTYLVEPLFTEWARFS-NTRLSQTMLGHVGLNKASWK
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500
pF1KSD SLLPRQHRSRGSSGSGPDHDHAGQGTESEEQEGDSP
.: .: :. ....
CCDS56 GLQREQSSSEDTDAAFELNSQLLPQENRLS
460 470 480
>>CCDS34901.1 PDE7A gene_id:5150|Hs108|chr8 (456 aa)
initn: 1784 init1: 1714 opt: 1806 Z-score: 2101.7 bits: 398.3 E(32554): 9.6e-111
Smith-Waterman score: 1806; 60.8% identity (85.4% similar) in 424 aa overlap (63-481:19-441)
40 50 60 70 80
pF1KSD GCQQGPLPWDLPEMIRMVKLVWKSKSELQATKQRGIL--DNEDALRSFP---GDIRLRGQ
.:.:: . :. : . ::.:.:..
CCDS34 MGITLIWCLALVLIKWITSKRRGAISYDSSDQTALYIRMLGDVRVRSR
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KSD TGVRAERRGSYPFIDFRLLNSTTYSGEIGTKKKVKRLLSFQRYFHASRLLRGIIPQAPLH
.: ..:::::.:.::::...: . . ....::::::::...::..:: . :.
CCDS34 AGFESERRGSHPYIDFRIFHSQSEIEVSVSARNIRRLLSFQRYLRSSRFFRGTAVSNSLN
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KSD LLDEDYLGQARHMLSKVGMWDFDIFLFDRLTNGNSLVTLLCHLFNTHGLIHHFKLDMVTL
.::.:: :::. :: ::: :.::::::::::::::::.: :::. ::::..:.:::. :
CCDS34 ILDDDYNGQAKCMLEKVGNWNFDIFLFDRLTNGNSLVSLTFHLFSLHGLIEYFHLDMMKL
110 120 130 140 150 160
210 220 230 240 250 260
pF1KSD HRFLVMVQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLASFLTPLDIMLGLLAAAAHDV
.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::. .:: ::.:.:.:::.::.
CCDS34 RRFLVMIQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLANSVTPWDILLSLIAAATHDL
170 180 190 200 210 220
270 280 290 300 310 320
pF1KSD DHPGVNQPFLIKTNHHLANLYQNMSVLENHHWRSTIGMLRESRLLAHLPKEMTQDIEQQL
:::::::::::::::.::.::.: ::::::::::..:.:::: :..::: : :..: :.
CCDS34 DHPGVNQPFLIKTNHYLATLYKNTSVLENHHWRSAVGLLRESGLFSHLPLESRQQMETQI
230 240 250 260 270 280
330 340 350 360 370 380
pF1KSD GSLILATDINRQNEFLTRLKAHLHNKDLRLEDAQDRHFMLQIALKCADICNPCRIWEMSK
:.:::::::.::::.:. ...:: :: :::.. ::..::.:::::::::::: ::.::
CCDS34 GALILATDISRQNEYLSLFRSHLDRGDLCLEDTRHRHLVLQMALKCADICNPCRTWELSK
290 300 310 320 330 340
390 400 410 420 430 440
pF1KSD QWSERVCEEFYRQGELEQKFELEISPLCNQQKDSIPSIQIGFMSYIVEPLFREWAHFTGN
::::.: :::..::..:.:..: .::::... .:: .::::::.:.::::: :::.:. :
CCDS34 QWSEKVTEEFFHQGDIEKKYHLGVSPLCDRHTESIANIQIGFMTYLVEPLFTEWARFS-N
350 360 370 380 390 400
450 460 470 480 490 500
pF1KSD STLSENMLGHLAHNKAQWKSLLPRQHRSRGSSGSGPDHDHAGQGTESEEQEGDSP
. ::..::::.. :::.::.: .: :. ....
CCDS34 TRLSQTMLGHVGLNKASWKGLQREQSSSEDTDAAFELNSQLLPQENRLS
410 420 430 440 450
>>CCDS54858.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 (673 aa)
initn: 656 init1: 345 opt: 784 Z-score: 909.3 bits: 178.2 E(32554): 2.5e-44
Smith-Waterman score: 784; 30.4% identity (64.9% similar) in 470 aa overlap (39-496:148-597)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD HPAELGRRWTGPEGVLPSSPGSRPGCQQGPLPWDLPEMIRMVKLVWKSKSELQATKQRGI
: : : .. . . .: ::. ..: . .
CCDS54 RSPMCNQPSINKATITEEAYQKLASETLEELDWCLDQLETL--QTRHSVSEMASNKFKRM
120 130 140 150 160 170
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LDNEDALRSFPGDIRLRGQTGVRAERRGSYPFIDFRL---LNSTTYSGEIGTKKKVKRLL
:. : . . ...: .. . : :.: . . : : . . :. ....
CCDS54 LNRELT------HLSEMSRSGNQVSEFISNTFLDKQHEVEIPSPTQKEKEKKKRPMSQIS
180 190 200 210 220
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SFQRYFHASRLLRGIIPQAPLHLLDEDYLGQARHMLSKVGMWDFDIFLFDRLTNGNSLVT
. .. .:.: : . ::. .. .:: :.. : :. : . .: . .:. :: .:
CCDS54 GVKKLMHSSSLTNSSIPRFGVKTEQEDVLAKE---LEDVNKWGLHVFRIAELS-GNRPLT
230 240 250 260 270 280
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LLCH-LFNTHGLIHHFKLDMVTLHRFLVMVQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEP
.. : .:. . :.. ::. . :: .:. ... ::.. ::: .:::::.:. : :. :
CCDS54 VIMHTIFQERDLLKTFKIPVDTLITYLMTLEDHYHADVAYHNNIHAADVVQSTHVLLSTP
290 300 310 320 330 340
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KLASFLTPLDIMLGLLAAAAHDVDHPGVNQPFLIKTNHHLANLYQNMSVLENHHWRSTIG
: . .: :.:. ...:.: ::::::::.. :::.:: .:: .:.. ::::::: .
CCDS54 ALEAVFTDLEILAAIFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDSSVLENHHLAVGFK
350 360 370 380 390 400
310 320 330 340 350
pF1KSD MLRESR--LLAHLPKEMTQDIEQQLGSLILATDINRQNEFLTRLKAHLHNKD------LR
.:.: .. .: :.. :...... ...::::.... ..:. ::. ...: :
CCDS54 LLQEENCDIFQNLTKKQRQSLRKMVIDIVLATDMSKHMNLLADLKTMVETKKVTSSGVLL
410 420 430 440 450 460
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LEDAQDRHFMLQIALKCADICNPCRIWEMSKQWSERVCEEFYRQGELEQKFELEISPLCN
:.. .:: .:: ..:::. :: . .. .::..:. :::.:::. :.. .::::.:.
CCDS54 LDNYSDRIQVLQNMVHCADLSNPTKPLQLYRQWTDRIMEEFFRQGDRERERGMEISPMCD
470 480 490 500 510 520
420 430 440 450 460 470
pF1KSD QQKDSIPSIQIGFMSYIVEPLFREWAHFTGNSTLSENMLGHLAHNKAQWKSLLPRQHRSR
... :. . :.::..:::.::.. :: .. . ....: : :. ..: .:.
CCDS54 KHNASVEKSQVGFIDYIVHPLWETWADLVHPD--AQDILDTLEDNREWYQSTIPQ-----
530 540 550 560 570
480 490 500
pF1KSD GSSGSGPDHDHAGQGTESEEQEGDSP
: . .:: . :. ..:.
CCDS54 -SPSPAPDDPEEGRQGQTEKFQFELTLEEDGESDTEKDSGSQVEEDTSCSDSKTLCTQDS
580 590 600 610 620 630
>>CCDS56371.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 (679 aa)
initn: 656 init1: 345 opt: 784 Z-score: 909.3 bits: 178.2 E(32554): 2.5e-44
Smith-Waterman score: 784; 30.4% identity (64.9% similar) in 470 aa overlap (39-496:154-603)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD HPAELGRRWTGPEGVLPSSPGSRPGCQQGPLPWDLPEMIRMVKLVWKSKSELQATKQRGI
: : : .. . . .: ::. ..: . .
CCDS56 RSPMCNQPSINKATITEEAYQKLASETLEELDWCLDQLETL--QTRHSVSEMASNKFKRM
130 140 150 160 170 180
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LDNEDALRSFPGDIRLRGQTGVRAERRGSYPFIDFRL---LNSTTYSGEIGTKKKVKRLL
:. : . . ...: .. . : :.: . . : : . . :. ....
CCDS56 LNRELT------HLSEMSRSGNQVSEFISNTFLDKQHEVEIPSPTQKEKEKKKRPMSQIS
190 200 210 220 230
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SFQRYFHASRLLRGIIPQAPLHLLDEDYLGQARHMLSKVGMWDFDIFLFDRLTNGNSLVT
. .. .:.: : . ::. .. .:: :.. : :. : . .: . .:. :: .:
CCDS56 GVKKLMHSSSLTNSSIPRFGVKTEQEDVLAKE---LEDVNKWGLHVFRIAELS-GNRPLT
240 250 260 270 280 290
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LLCH-LFNTHGLIHHFKLDMVTLHRFLVMVQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEP
.. : .:. . :.. ::. . :: .:. ... ::.. ::: .:::::.:. : :. :
CCDS56 VIMHTIFQERDLLKTFKIPVDTLITYLMTLEDHYHADVAYHNNIHAADVVQSTHVLLSTP
300 310 320 330 340 350
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KLASFLTPLDIMLGLLAAAAHDVDHPGVNQPFLIKTNHHLANLYQNMSVLENHHWRSTIG
: . .: :.:. ...:.: ::::::::.. :::.:: .:: .:.. ::::::: .
CCDS56 ALEAVFTDLEILAAIFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDSSVLENHHLAVGFK
360 370 380 390 400 410
310 320 330 340 350
pF1KSD MLRESR--LLAHLPKEMTQDIEQQLGSLILATDINRQNEFLTRLKAHLHNKD------LR
.:.: .. .: :.. :...... ...::::.... ..:. ::. ...: :
CCDS56 LLQEENCDIFQNLTKKQRQSLRKMVIDIVLATDMSKHMNLLADLKTMVETKKVTSSGVLL
420 430 440 450 460 470
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LEDAQDRHFMLQIALKCADICNPCRIWEMSKQWSERVCEEFYRQGELEQKFELEISPLCN
:.. .:: .:: ..:::. :: . .. .::..:. :::.:::. :.. .::::.:.
CCDS56 LDNYSDRIQVLQNMVHCADLSNPTKPLQLYRQWTDRIMEEFFRQGDRERERGMEISPMCD
480 490 500 510 520 530
420 430 440 450 460 470
pF1KSD QQKDSIPSIQIGFMSYIVEPLFREWAHFTGNSTLSENMLGHLAHNKAQWKSLLPRQHRSR
... :. . :.::..:::.::.. :: .. . ....: : :. ..: .:.
CCDS56 KHNASVEKSQVGFIDYIVHPLWETWADLVHPD--AQDILDTLEDNREWYQSTIPQ-----
540 550 560 570 580
480 490 500
pF1KSD GSSGSGPDHDHAGQGTESEEQEGDSP
: . .:: . :. ..:.
CCDS56 -SPSPAPDDPEEGRQGQTEKFQFELTLEEDGESDTEKDSGSQVEEDTSCSDSKTLCTQDS
590 600 610 620 630 640
>>CCDS56372.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 (687 aa)
initn: 656 init1: 345 opt: 784 Z-score: 909.2 bits: 178.2 E(32554): 2.5e-44
Smith-Waterman score: 784; 30.4% identity (64.9% similar) in 470 aa overlap (39-496:162-611)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD HPAELGRRWTGPEGVLPSSPGSRPGCQQGPLPWDLPEMIRMVKLVWKSKSELQATKQRGI
: : : .. . . .: ::. ..: . .
CCDS56 RSPMCNQPSINKATITEEAYQKLASETLEELDWCLDQLETL--QTRHSVSEMASNKFKRM
140 150 160 170 180
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LDNEDALRSFPGDIRLRGQTGVRAERRGSYPFIDFRL---LNSTTYSGEIGTKKKVKRLL
:. : . . ...: .. . : :.: . . : : . . :. ....
CCDS56 LNRELT------HLSEMSRSGNQVSEFISNTFLDKQHEVEIPSPTQKEKEKKKRPMSQIS
190 200 210 220 230 240
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SFQRYFHASRLLRGIIPQAPLHLLDEDYLGQARHMLSKVGMWDFDIFLFDRLTNGNSLVT
. .. .:.: : . ::. .. .:: :.. : :. : . .: . .:. :: .:
CCDS56 GVKKLMHSSSLTNSSIPRFGVKTEQEDVLAKE---LEDVNKWGLHVFRIAELS-GNRPLT
250 260 270 280 290
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LLCH-LFNTHGLIHHFKLDMVTLHRFLVMVQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEP
.. : .:. . :.. ::. . :: .:. ... ::.. ::: .:::::.:. : :. :
CCDS56 VIMHTIFQERDLLKTFKIPVDTLITYLMTLEDHYHADVAYHNNIHAADVVQSTHVLLSTP
300 310 320 330 340 350
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KLASFLTPLDIMLGLLAAAAHDVDHPGVNQPFLIKTNHHLANLYQNMSVLENHHWRSTIG
: . .: :.:. ...:.: ::::::::.. :::.:: .:: .:.. ::::::: .
CCDS56 ALEAVFTDLEILAAIFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDSSVLENHHLAVGFK
360 370 380 390 400 410
310 320 330 340 350
pF1KSD MLRESR--LLAHLPKEMTQDIEQQLGSLILATDINRQNEFLTRLKAHLHNKD------LR
.:.: .. .: :.. :...... ...::::.... ..:. ::. ...: :
CCDS56 LLQEENCDIFQNLTKKQRQSLRKMVIDIVLATDMSKHMNLLADLKTMVETKKVTSSGVLL
420 430 440 450 460 470
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LEDAQDRHFMLQIALKCADICNPCRIWEMSKQWSERVCEEFYRQGELEQKFELEISPLCN
:.. .:: .:: ..:::. :: . .. .::..:. :::.:::. :.. .::::.:.
CCDS56 LDNYSDRIQVLQNMVHCADLSNPTKPLQLYRQWTDRIMEEFFRQGDRERERGMEISPMCD
480 490 500 510 520 530
420 430 440 450 460 470
pF1KSD QQKDSIPSIQIGFMSYIVEPLFREWAHFTGNSTLSENMLGHLAHNKAQWKSLLPRQHRSR
... :. . :.::..:::.::.. :: .. . ....: : :. ..: .:.
CCDS56 KHNASVEKSQVGFIDYIVHPLWETWADLVHPD--AQDILDTLEDNREWYQSTIPQ-----
540 550 560 570 580 590
480 490 500
pF1KSD GSSGSGPDHDHAGQGTESEEQEGDSP
: . .:: . :. ..:.
CCDS56 -SPSPAPDDPEEGRQGQTEKFQFELTLEEDGESDTEKDSGSQVEEDTSCSDSKTLCTQDS
600 610 620 630 640 650
>>CCDS56370.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 (507 aa)
initn: 656 init1: 345 opt: 782 Z-score: 908.8 bits: 177.7 E(32554): 2.7e-44
Smith-Waterman score: 782; 33.0% identity (68.6% similar) in 388 aa overlap (118-496:56-431)
90 100 110 120 130 140
pF1KSD TGVRAERRGSYPFIDFRLLNSTTYSGEIGTKKKVKRLLSFQRYFHASRLLRGIIPQAPLH
:. .... . .. .:.: : . ::. ..
CCDS56 QVSEFISNTFLDKQHEVEIPSPTQKEKEKKKRPMSQISGVKKLMHSSSLTNSSIPRFGVK
30 40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KSD LLDEDYLGQARHMLSKVGMWDFDIFLFDRLTNGNSLVTLLCH-LFNTHGLIHHFKLDMVT
.:: :.. : :. : . .: . .:. :: .:.. : .:. . :.. ::. . :
CCDS56 TEQEDVLAKE---LEDVNKWGLHVFRIAELS-GNRPLTVIMHTIFQERDLLKTFKIPVDT
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KSD LHRFLVMVQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLASFLTPLDIMLGLLAAAAHD
: .:. ... ::.. ::: .:::::.:. : :. : : . .: :.:. ...:.: ::
CCDS56 LITYLMTLEDHYHADVAYHNNIHAADVVQSTHVLLSTPALEAVFTDLEILAAIFASAIHD
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KSD VDHPGVNQPFLIKTNHHLANLYQNMSVLENHHWRSTIGMLRESR--LLAHLPKEMTQDIE
::::::.. :::.:: .:: .:.. ::::::: . .:.: .. .: :.. :...
CCDS56 VDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDSSVLENHHLAVGFKLLQEENCDIFQNLTKKQRQSLR
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370
pF1KSD QQLGSLILATDINRQNEFLTRLKAHLHNKD------LRLEDAQDRHFMLQIALKCADICN
... ...::::.... ..:. ::. ...: : :.. .:: .:: ..:::. :
CCDS56 KMVIDIVLATDMSKHMNLLADLKTMVETKKVTSSGVLLLDNYSDRIQVLQNMVHCADLSN
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KSD PCRIWEMSKQWSERVCEEFYRQGELEQKFELEISPLCNQQKDSIPSIQIGFMSYIVEPLF
: . .. .::..:. :::.:::. :.. .::::.:.... :. . :.::..:::.::.
CCDS56 PTKPLQLYRQWTDRIMEEFFRQGDRERERGMEISPMCDKHNASVEKSQVGFIDYIVHPLW
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480 490
pF1KSD REWAHFTGNSTLSENMLGHLAHNKAQWKSLLPRQHRSRGSSGSGPDHDHAGQGTESEEQE
. :: .. . ....: : :. ..: .:. : . .:: . :. ..:.
CCDS56 ETWADLVHPD--AQDILDTLEDNREWYQSTIPQ------SPSPAPDDPEEGRQGQTEKFQ
390 400 410 420 430
500
pF1KSD GDSP
CCDS56 FELTLEEDGESDTEKDSGSQVEEDTSCSDSKTLCTQDSESTEIPLDEQVEEEAVGEEEES
440 450 460 470 480 490
>>CCDS56373.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 (745 aa)
initn: 656 init1: 345 opt: 784 Z-score: 908.7 bits: 178.2 E(32554): 2.7e-44
Smith-Waterman score: 784; 30.4% identity (64.9% similar) in 470 aa overlap (39-496:220-669)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD HPAELGRRWTGPEGVLPSSPGSRPGCQQGPLPWDLPEMIRMVKLVWKSKSELQATKQRGI
: : : .. . . .: ::. ..: . .
CCDS56 RSPMCNQPSINKATITEEAYQKLASETLEELDWCLDQLETL--QTRHSVSEMASNKFKRM
190 200 210 220 230 240
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LDNEDALRSFPGDIRLRGQTGVRAERRGSYPFIDFRL---LNSTTYSGEIGTKKKVKRLL
:. : . . ...: .. . : :.: . . : : . . :. ....
CCDS56 LNRELT------HLSEMSRSGNQVSEFISNTFLDKQHEVEIPSPTQKEKEKKKRPMSQIS
250 260 270 280 290 300
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SFQRYFHASRLLRGIIPQAPLHLLDEDYLGQARHMLSKVGMWDFDIFLFDRLTNGNSLVT
. .. .:.: : . ::. .. .:: :.. : :. : . .: . .:. :: .:
CCDS56 GVKKLMHSSSLTNSSIPRFGVKTEQEDVLAKE---LEDVNKWGLHVFRIAELS-GNRPLT
310 320 330 340 350
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LLCH-LFNTHGLIHHFKLDMVTLHRFLVMVQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEP
.. : .:. . :.. ::. . :: .:. ... ::.. ::: .:::::.:. : :. :
CCDS56 VIMHTIFQERDLLKTFKIPVDTLITYLMTLEDHYHADVAYHNNIHAADVVQSTHVLLSTP
360 370 380 390 400 410
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KLASFLTPLDIMLGLLAAAAHDVDHPGVNQPFLIKTNHHLANLYQNMSVLENHHWRSTIG
: . .: :.:. ...:.: ::::::::.. :::.:: .:: .:.. ::::::: .
CCDS56 ALEAVFTDLEILAAIFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDSSVLENHHLAVGFK
420 430 440 450 460 470
310 320 330 340 350
pF1KSD MLRESR--LLAHLPKEMTQDIEQQLGSLILATDINRQNEFLTRLKAHLHNKD------LR
.:.: .. .: :.. :...... ...::::.... ..:. ::. ...: :
CCDS56 LLQEENCDIFQNLTKKQRQSLRKMVIDIVLATDMSKHMNLLADLKTMVETKKVTSSGVLL
480 490 500 510 520 530
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LEDAQDRHFMLQIALKCADICNPCRIWEMSKQWSERVCEEFYRQGELEQKFELEISPLCN
:.. .:: .:: ..:::. :: . .. .::..:. :::.:::. :.. .::::.:.
CCDS56 LDNYSDRIQVLQNMVHCADLSNPTKPLQLYRQWTDRIMEEFFRQGDRERERGMEISPMCD
540 550 560 570 580 590
420 430 440 450 460 470
pF1KSD QQKDSIPSIQIGFMSYIVEPLFREWAHFTGNSTLSENMLGHLAHNKAQWKSLLPRQHRSR
... :. . :.::..:::.::.. :: .. . ....: : :. ..: .:.
CCDS56 KHNASVEKSQVGFIDYIVHPLWETWADLVHPD--AQDILDTLEDNREWYQSTIPQ-----
600 610 620 630 640 650
480 490 500
pF1KSD GSSGSGPDHDHAGQGTESEEQEGDSP
: . .:: . :. ..:.
CCDS56 -SPSPAPDDPEEGRQGQTEKFQFELTLEEDGESDTEKDSGSQVEEDTSCSDSKTLCTQDS
660 670 680 690 700
>>CCDS54859.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 (748 aa)
initn: 656 init1: 345 opt: 784 Z-score: 908.7 bits: 178.2 E(32554): 2.7e-44
Smith-Waterman score: 784; 30.4% identity (64.9% similar) in 470 aa overlap (39-496:223-672)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD HPAELGRRWTGPEGVLPSSPGSRPGCQQGPLPWDLPEMIRMVKLVWKSKSELQATKQRGI
: : : .. . . .: ::. ..: . .
CCDS54 RSPMCNQPSINKATITEEAYQKLASETLEELDWCLDQLETL--QTRHSVSEMASNKFKRM
200 210 220 230 240 250
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LDNEDALRSFPGDIRLRGQTGVRAERRGSYPFIDFRL---LNSTTYSGEIGTKKKVKRLL
:. : . . ...: .. . : :.: . . : : . . :. ....
CCDS54 LNRELT------HLSEMSRSGNQVSEFISNTFLDKQHEVEIPSPTQKEKEKKKRPMSQIS
260 270 280 290 300
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SFQRYFHASRLLRGIIPQAPLHLLDEDYLGQARHMLSKVGMWDFDIFLFDRLTNGNSLVT
. .. .:.: : . ::. .. .:: :.. : :. : . .: . .:. :: .:
CCDS54 GVKKLMHSSSLTNSSIPRFGVKTEQEDVLAKE---LEDVNKWGLHVFRIAELS-GNRPLT
310 320 330 340 350 360
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LLCH-LFNTHGLIHHFKLDMVTLHRFLVMVQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEP
.. : .:. . :.. ::. . :: .:. ... ::.. ::: .:::::.:. : :. :
CCDS54 VIMHTIFQERDLLKTFKIPVDTLITYLMTLEDHYHADVAYHNNIHAADVVQSTHVLLSTP
370 380 390 400 410 420
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KLASFLTPLDIMLGLLAAAAHDVDHPGVNQPFLIKTNHHLANLYQNMSVLENHHWRSTIG
: . .: :.:. ...:.: ::::::::.. :::.:: .:: .:.. ::::::: .
CCDS54 ALEAVFTDLEILAAIFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDSSVLENHHLAVGFK
430 440 450 460 470 480
310 320 330 340 350
pF1KSD MLRESR--LLAHLPKEMTQDIEQQLGSLILATDINRQNEFLTRLKAHLHNKD------LR
.:.: .. .: :.. :...... ...::::.... ..:. ::. ...: :
CCDS54 LLQEENCDIFQNLTKKQRQSLRKMVIDIVLATDMSKHMNLLADLKTMVETKKVTSSGVLL
490 500 510 520 530 540
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LEDAQDRHFMLQIALKCADICNPCRIWEMSKQWSERVCEEFYRQGELEQKFELEISPLCN
:.. .:: .:: ..:::. :: . .. .::..:. :::.:::. :.. .::::.:.
CCDS54 LDNYSDRIQVLQNMVHCADLSNPTKPLQLYRQWTDRIMEEFFRQGDRERERGMEISPMCD
550 560 570 580 590 600
420 430 440 450 460 470
pF1KSD QQKDSIPSIQIGFMSYIVEPLFREWAHFTGNSTLSENMLGHLAHNKAQWKSLLPRQHRSR
... :. . :.::..:::.::.. :: .. . ....: : :. ..: .:.
CCDS54 KHNASVEKSQVGFIDYIVHPLWETWADLVHPD--AQDILDTLEDNREWYQSTIPQ-----
610 620 630 640 650
480 490 500
pF1KSD GSSGSGPDHDHAGQGTESEEQEGDSP
: . .:: . :. ..:.
CCDS54 -SPSPAPDDPEEGRQGQTEKFQFELTLEEDGESDTEKDSGSQVEEDTSCSDSKTLCTQDS
660 670 680 690 700 710
>>CCDS56369.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 (518 aa)
initn: 656 init1: 345 opt: 782 Z-score: 908.7 bits: 177.7 E(32554): 2.7e-44
Smith-Waterman score: 782; 33.0% identity (68.6% similar) in 388 aa overlap (118-496:67-442)
90 100 110 120 130 140
pF1KSD TGVRAERRGSYPFIDFRLLNSTTYSGEIGTKKKVKRLLSFQRYFHASRLLRGIIPQAPLH
:. .... . .. .:.: : . ::. ..
CCDS56 QVSEFISNTFLDKQHEVEIPSPTQKEKEKKKRPMSQISGVKKLMHSSSLTNSSIPRFGVK
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KSD LLDEDYLGQARHMLSKVGMWDFDIFLFDRLTNGNSLVTLLCH-LFNTHGLIHHFKLDMVT
.:: :.. : :. : . .: . .:. :: .:.. : .:. . :.. ::. . :
CCDS56 TEQEDVLAKE---LEDVNKWGLHVFRIAELS-GNRPLTVIMHTIFQERDLLKTFKIPVDT
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KSD LHRFLVMVQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLASFLTPLDIMLGLLAAAAHD
: .:. ... ::.. ::: .:::::.:. : :. : : . .: :.:. ...:.: ::
CCDS56 LITYLMTLEDHYHADVAYHNNIHAADVVQSTHVLLSTPALEAVFTDLEILAAIFASAIHD
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KSD VDHPGVNQPFLIKTNHHLANLYQNMSVLENHHWRSTIGMLRESR--LLAHLPKEMTQDIE
::::::.. :::.:: .:: .:.. ::::::: . .:.: .. .: :.. :...
CCDS56 VDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDSSVLENHHLAVGFKLLQEENCDIFQNLTKKQRQSLR
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370
pF1KSD QQLGSLILATDINRQNEFLTRLKAHLHNKD------LRLEDAQDRHFMLQIALKCADICN
... ...::::.... ..:. ::. ...: : :.. .:: .:: ..:::. :
CCDS56 KMVIDIVLATDMSKHMNLLADLKTMVETKKVTSSGVLLLDNYSDRIQVLQNMVHCADLSN
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KSD PCRIWEMSKQWSERVCEEFYRQGELEQKFELEISPLCNQQKDSIPSIQIGFMSYIVEPLF
: . .. .::..:. :::.:::. :.. .::::.:.... :. . :.::..:::.::.
CCDS56 PTKPLQLYRQWTDRIMEEFFRQGDRERERGMEISPMCDKHNASVEKSQVGFIDYIVHPLW
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KSD REWAHFTGNSTLSENMLGHLAHNKAQWKSLLPRQHRSRGSSGSGPDHDHAGQGTESEEQE
. :: .. . ....: : :. ..: .:. : . .:: . :. ..:.
CCDS56 ETWADLVHPD--AQDILDTLEDNREWYQSTIPQ------SPSPAPDDPEEGRQGQTEKFQ
400 410 420 430 440
500
pF1KSD GDSP
CCDS56 FELTLEEDGESDTEKDSGSQVEEDTSCSDSKTLCTQDSESTEIPLDEQVEEEAVGEEEES
450 460 470 480 490 500
502 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 08:02:02 2016 done: Thu Nov 3 08:02:02 2016
Total Scan time: 3.190 Total Display time: 0.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]