Result of FASTA (omim) for
pF1KSDB0003
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0003, 502 aa
1>>>pF1KSDB0003 502 - 502 aa - 502 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9248+/-0.000337; mu= 21.2612+/- 0.021
mean_var=76.0684+/-15.103, 0's: 0 Z-trim(115.5): 209 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.147052
statistics sampled from 25731 (25946) to 25731 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.673), E-opt: 0.2 (0.304), width: 16
Scan time: 8.620
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_005266988 (OMIM: 604645) PREDICTED: cAMP-specif ( 502) 3461 743.7 2.8e-214
NP_061818 (OMIM: 604645) cAMP-specific 3',5'-cycli ( 450) 2894 623.4 4.2e-178
XP_011534057 (OMIM: 604645) PREDICTED: cAMP-specif ( 489) 2894 623.4 4.4e-178
XP_016866230 (OMIM: 604645) PREDICTED: cAMP-specif ( 343) 2365 511.1 2.1e-144
XP_016869027 (OMIM: 171885) PREDICTED: high affini ( 448) 1817 394.9 2.5e-109
NP_001229247 (OMIM: 171885) high affinity cAMP-spe ( 482) 1807 392.8 1.2e-108
XP_011515842 (OMIM: 171885) PREDICTED: high affini ( 456) 1806 392.6 1.3e-108
NP_002594 (OMIM: 171885) high affinity cAMP-specif ( 456) 1806 392.6 1.3e-108
XP_016865059 (OMIM: 600129,606799,614613) PREDICTE ( 553) 784 175.9 2.7e-43
XP_016865060 (OMIM: 600129,606799,614613) PREDICTE ( 553) 784 175.9 2.7e-43
NP_001184151 (OMIM: 600129,606799,614613) cAMP-spe ( 585) 784 175.9 2.9e-43
XP_011541779 (OMIM: 600129,606799,614613) PREDICTE ( 662) 784 175.9 3.1e-43
XP_005248595 (OMIM: 600129,606799,614613) PREDICTE ( 673) 784 175.9 3.2e-43
NP_006194 (OMIM: 600129,606799,614613) cAMP-specif ( 673) 784 175.9 3.2e-43
NP_001184149 (OMIM: 600129,606799,614613) cAMP-spe ( 679) 784 175.9 3.2e-43
NP_001184148 (OMIM: 600129,606799,614613) cAMP-spe ( 687) 784 175.9 3.2e-43
XP_005248594 (OMIM: 600129,606799,614613) PREDICTE ( 699) 784 175.9 3.2e-43
XP_016865058 (OMIM: 600129,606799,614613) PREDICTE ( 699) 784 175.9 3.2e-43
XP_016865057 (OMIM: 600129,606799,614613) PREDICTE ( 738) 784 176.0 3.4e-43
XP_016865056 (OMIM: 600129,606799,614613) PREDICTE ( 743) 784 176.0 3.4e-43
NP_001184147 (OMIM: 600129,606799,614613) cAMP-spe ( 745) 784 176.0 3.4e-43
XP_016865055 (OMIM: 600129,606799,614613) PREDICTE ( 748) 784 176.0 3.4e-43
XP_011541775 (OMIM: 600129,606799,614613) PREDICTE ( 748) 784 176.0 3.4e-43
XP_011541773 (OMIM: 600129,606799,614613) PREDICTE ( 748) 784 176.0 3.4e-43
NP_001159371 (OMIM: 600129,606799,614613) cAMP-spe ( 748) 784 176.0 3.4e-43
NP_001184150 (OMIM: 600129,606799,614613) cAMP-spe ( 507) 782 175.4 3.5e-43
NP_001184152 (OMIM: 600129,606799,614613) cAMP-spe ( 518) 782 175.4 3.5e-43
XP_011541771 (OMIM: 600129,606799,614613) PREDICTE ( 797) 784 176.0 3.6e-43
XP_016865054 (OMIM: 600129,606799,614613) PREDICTE ( 797) 784 176.0 3.6e-43
XP_011541772 (OMIM: 600129,606799,614613) PREDICTE ( 797) 784 176.0 3.6e-43
NP_001098101 (OMIM: 600129,606799,614613) cAMP-spe ( 809) 784 176.0 3.6e-43
XP_005270981 (OMIM: 600127) PREDICTED: cAMP-specif ( 517) 746 167.8 7e-41
XP_005270982 (OMIM: 600127) PREDICTED: cAMP-specif ( 517) 746 167.8 7e-41
XP_011539868 (OMIM: 600127) PREDICTED: cAMP-specif ( 530) 746 167.8 7.1e-41
XP_016856935 (OMIM: 600127) PREDICTED: cAMP-specif ( 530) 746 167.8 7.1e-41
XP_006710743 (OMIM: 600127) PREDICTED: cAMP-specif ( 531) 746 167.8 7.1e-41
NP_001032416 (OMIM: 600127) cAMP-specific 3',5'-cy ( 564) 746 167.8 7.4e-41
XP_016856934 (OMIM: 600127) PREDICTED: cAMP-specif ( 597) 746 167.8 7.7e-41
NP_001284369 (OMIM: 600127) cAMP-specific 3',5'-cy ( 644) 746 167.8 8.2e-41
NP_001284370 (OMIM: 600127) cAMP-specific 3',5'-cy ( 661) 746 167.9 8.3e-41
NP_001032417 (OMIM: 600127) cAMP-specific 3',5'-cy ( 721) 746 167.9 8.9e-41
NP_002591 (OMIM: 600127) cAMP-specific 3',5'-cycli ( 736) 746 167.9 9e-41
NP_001032418 (OMIM: 600127) cAMP-specific 3',5'-cy ( 736) 746 167.9 9e-41
NP_001284371 (OMIM: 600127) cAMP-specific 3',5'-cy ( 503) 742 166.9 1.2e-40
XP_005259990 (OMIM: 600126) PREDICTED: cAMP-specif ( 582) 742 167.0 1.4e-40
NP_006193 (OMIM: 600126) cAMP-specific 3',5'-cycli ( 647) 742 167.0 1.5e-40
NP_001104779 (OMIM: 600126) cAMP-specific 3',5'-cy ( 825) 742 167.1 1.8e-40
NP_001104778 (OMIM: 600126) cAMP-specific 3',5'-cy ( 860) 742 167.1 1.8e-40
XP_011526356 (OMIM: 600126) PREDICTED: cAMP-specif ( 864) 742 167.1 1.8e-40
NP_001230050 (OMIM: 600126) cAMP-specific 3',5'-cy ( 864) 742 167.1 1.8e-40
>>XP_005266988 (OMIM: 604645) PREDICTED: cAMP-specific 3 (502 aa)
initn: 3461 init1: 3461 opt: 3461 Z-score: 3968.0 bits: 743.7 E(85289): 2.8e-214
Smith-Waterman score: 3461; 100.0% identity (100.0% similar) in 502 aa overlap (1-502:1-502)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPVLERYFHPAELGRRWTGPEGVLPSSPGSRPGCQQGPLPWDLPEMIRMVKLVWKSKSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MPVLERYFHPAELGRRWTGPEGVLPSSPGSRPGCQQGPLPWDLPEMIRMVKLVWKSKSEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QATKQRGILDNEDALRSFPGDIRLRGQTGVRAERRGSYPFIDFRLLNSTTYSGEIGTKKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QATKQRGILDNEDALRSFPGDIRLRGQTGVRAERRGSYPFIDFRLLNSTTYSGEIGTKKK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VKRLLSFQRYFHASRLLRGIIPQAPLHLLDEDYLGQARHMLSKVGMWDFDIFLFDRLTNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VKRLLSFQRYFHASRLLRGIIPQAPLHLLDEDYLGQARHMLSKVGMWDFDIFLFDRLTNG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NSLVTLLCHLFNTHGLIHHFKLDMVTLHRFLVMVQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NSLVTLLCHLFNTHGLIHHFKLDMVTLHRFLVMVQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LKEPKLASFLTPLDIMLGLLAAAAHDVDHPGVNQPFLIKTNHHLANLYQNMSVLENHHWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LKEPKLASFLTPLDIMLGLLAAAAHDVDHPGVNQPFLIKTNHHLANLYQNMSVLENHHWR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD STIGMLRESRLLAHLPKEMTQDIEQQLGSLILATDINRQNEFLTRLKAHLHNKDLRLEDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 STIGMLRESRLLAHLPKEMTQDIEQQLGSLILATDINRQNEFLTRLKAHLHNKDLRLEDA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QDRHFMLQIALKCADICNPCRIWEMSKQWSERVCEEFYRQGELEQKFELEISPLCNQQKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QDRHFMLQIALKCADICNPCRIWEMSKQWSERVCEEFYRQGELEQKFELEISPLCNQQKD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SIPSIQIGFMSYIVEPLFREWAHFTGNSTLSENMLGHLAHNKAQWKSLLPRQHRSRGSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SIPSIQIGFMSYIVEPLFREWAHFTGNSTLSENMLGHLAHNKAQWKSLLPRQHRSRGSSG
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KSD SGPDHDHAGQGTESEEQEGDSP
::::::::::::::::::::::
XP_005 SGPDHDHAGQGTESEEQEGDSP
490 500
>>NP_061818 (OMIM: 604645) cAMP-specific 3',5'-cyclic ph (450 aa)
initn: 2894 init1: 2894 opt: 2894 Z-score: 3318.6 bits: 623.4 E(85289): 4.2e-178
Smith-Waterman score: 2894; 100.0% identity (100.0% similar) in 423 aa overlap (80-502:28-450)
50 60 70 80 90 100
pF1KSD VKLVWKSKSELQATKQRGILDNEDALRSFPGDIRLRGQTGVRAERRGSYPFIDFRLLNST
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 MSCLMVERCGEILFENPDQNAKCVCMLGDIRLRGQTGVRAERRGSYPFIDFRLLNST
10 20 30 40 50
110 120 130 140 150 160
pF1KSD TYSGEIGTKKKVKRLLSFQRYFHASRLLRGIIPQAPLHLLDEDYLGQARHMLSKVGMWDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 TYSGEIGTKKKVKRLLSFQRYFHASRLLRGIIPQAPLHLLDEDYLGQARHMLSKVGMWDF
60 70 80 90 100 110
170 180 190 200 210 220
pF1KSD DIFLFDRLTNGNSLVTLLCHLFNTHGLIHHFKLDMVTLHRFLVMVQEDYHSQNPYHNAVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 DIFLFDRLTNGNSLVTLLCHLFNTHGLIHHFKLDMVTLHRFLVMVQEDYHSQNPYHNAVH
120 130 140 150 160 170
230 240 250 260 270 280
pF1KSD AADVTQAMHCYLKEPKLASFLTPLDIMLGLLAAAAHDVDHPGVNQPFLIKTNHHLANLYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 AADVTQAMHCYLKEPKLASFLTPLDIMLGLLAAAAHDVDHPGVNQPFLIKTNHHLANLYQ
180 190 200 210 220 230
290 300 310 320 330 340
pF1KSD NMSVLENHHWRSTIGMLRESRLLAHLPKEMTQDIEQQLGSLILATDINRQNEFLTRLKAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 NMSVLENHHWRSTIGMLRESRLLAHLPKEMTQDIEQQLGSLILATDINRQNEFLTRLKAH
240 250 260 270 280 290
350 360 370 380 390 400
pF1KSD LHNKDLRLEDAQDRHFMLQIALKCADICNPCRIWEMSKQWSERVCEEFYRQGELEQKFEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 LHNKDLRLEDAQDRHFMLQIALKCADICNPCRIWEMSKQWSERVCEEFYRQGELEQKFEL
300 310 320 330 340 350
410 420 430 440 450 460
pF1KSD EISPLCNQQKDSIPSIQIGFMSYIVEPLFREWAHFTGNSTLSENMLGHLAHNKAQWKSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 EISPLCNQQKDSIPSIQIGFMSYIVEPLFREWAHFTGNSTLSENMLGHLAHNKAQWKSLL
360 370 380 390 400 410
470 480 490 500
pF1KSD PRQHRSRGSSGSGPDHDHAGQGTESEEQEGDSP
:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 PRQHRSRGSSGSGPDHDHAGQGTESEEQEGDSP
420 430 440 450
>>XP_011534057 (OMIM: 604645) PREDICTED: cAMP-specific 3 (489 aa)
initn: 2894 init1: 2894 opt: 2894 Z-score: 3318.1 bits: 623.4 E(85289): 4.4e-178
Smith-Waterman score: 2894; 100.0% identity (100.0% similar) in 423 aa overlap (80-502:67-489)
50 60 70 80 90 100
pF1KSD VKLVWKSKSELQATKQRGILDNEDALRSFPGDIRLRGQTGVRAERRGSYPFIDFRLLNST
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SPHPSSLLIKRCGEILFENPDQNAKCVCMLGDIRLRGQTGVRAERRGSYPFIDFRLLNST
40 50 60 70 80 90
110 120 130 140 150 160
pF1KSD TYSGEIGTKKKVKRLLSFQRYFHASRLLRGIIPQAPLHLLDEDYLGQARHMLSKVGMWDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TYSGEIGTKKKVKRLLSFQRYFHASRLLRGIIPQAPLHLLDEDYLGQARHMLSKVGMWDF
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KSD DIFLFDRLTNGNSLVTLLCHLFNTHGLIHHFKLDMVTLHRFLVMVQEDYHSQNPYHNAVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DIFLFDRLTNGNSLVTLLCHLFNTHGLIHHFKLDMVTLHRFLVMVQEDYHSQNPYHNAVH
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KSD AADVTQAMHCYLKEPKLASFLTPLDIMLGLLAAAAHDVDHPGVNQPFLIKTNHHLANLYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AADVTQAMHCYLKEPKLASFLTPLDIMLGLLAAAAHDVDHPGVNQPFLIKTNHHLANLYQ
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KSD NMSVLENHHWRSTIGMLRESRLLAHLPKEMTQDIEQQLGSLILATDINRQNEFLTRLKAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NMSVLENHHWRSTIGMLRESRLLAHLPKEMTQDIEQQLGSLILATDINRQNEFLTRLKAH
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KSD LHNKDLRLEDAQDRHFMLQIALKCADICNPCRIWEMSKQWSERVCEEFYRQGELEQKFEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LHNKDLRLEDAQDRHFMLQIALKCADICNPCRIWEMSKQWSERVCEEFYRQGELEQKFEL
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KSD EISPLCNQQKDSIPSIQIGFMSYIVEPLFREWAHFTGNSTLSENMLGHLAHNKAQWKSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EISPLCNQQKDSIPSIQIGFMSYIVEPLFREWAHFTGNSTLSENMLGHLAHNKAQWKSLL
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500
pF1KSD PRQHRSRGSSGSGPDHDHAGQGTESEEQEGDSP
:::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PRQHRSRGSSGSGPDHDHAGQGTESEEQEGDSP
460 470 480
>>XP_016866230 (OMIM: 604645) PREDICTED: cAMP-specific 3 (343 aa)
initn: 2365 init1: 2365 opt: 2365 Z-score: 2713.6 bits: 511.1 E(85289): 2.1e-144
Smith-Waterman score: 2365; 100.0% identity (100.0% similar) in 343 aa overlap (160-502:1-343)
130 140 150 160 170 180
pF1KSD YFHASRLLRGIIPQAPLHLLDEDYLGQARHMLSKVGMWDFDIFLFDRLTNGNSLVTLLCH
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MLSKVGMWDFDIFLFDRLTNGNSLVTLLCH
10 20 30
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LFNTHGLIHHFKLDMVTLHRFLVMVQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLASF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LFNTHGLIHHFKLDMVTLHRFLVMVQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLASF
40 50 60 70 80 90
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LTPLDIMLGLLAAAAHDVDHPGVNQPFLIKTNHHLANLYQNMSVLENHHWRSTIGMLRES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LTPLDIMLGLLAAAAHDVDHPGVNQPFLIKTNHHLANLYQNMSVLENHHWRSTIGMLRES
100 110 120 130 140 150
310 320 330 340 350 360
pF1KSD RLLAHLPKEMTQDIEQQLGSLILATDINRQNEFLTRLKAHLHNKDLRLEDAQDRHFMLQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RLLAHLPKEMTQDIEQQLGSLILATDINRQNEFLTRLKAHLHNKDLRLEDAQDRHFMLQI
160 170 180 190 200 210
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ALKCADICNPCRIWEMSKQWSERVCEEFYRQGELEQKFELEISPLCNQQKDSIPSIQIGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALKCADICNPCRIWEMSKQWSERVCEEFYRQGELEQKFELEISPLCNQQKDSIPSIQIGF
220 230 240 250 260 270
430 440 450 460 470 480
pF1KSD MSYIVEPLFREWAHFTGNSTLSENMLGHLAHNKAQWKSLLPRQHRSRGSSGSGPDHDHAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MSYIVEPLFREWAHFTGNSTLSENMLGHLAHNKAQWKSLLPRQHRSRGSSGSGPDHDHAG
280 290 300 310 320 330
490 500
pF1KSD QGTESEEQEGDSP
:::::::::::::
XP_016 QGTESEEQEGDSP
340
>>XP_016869027 (OMIM: 171885) PREDICTED: high affinity c (448 aa)
initn: 1784 init1: 1714 opt: 1817 Z-score: 2083.7 bits: 394.9 E(85289): 2.5e-109
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30 40 50 60 70
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.: .. .:. ..:: . :. : .
XP_016 MWMEHQLFQGCQRRGAISYDSSDQTALYIR
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80 90 100 110 120 130
pF1KSD --GDIRLRGQTGVRAERRGSYPFIDFRLLNSTTYSGEIGTKKKVKRLLSFQRYFHASRLL
::.:.:...: ..:::::.:.::::...: . . ....::::::::...::..
XP_016 MLGDVRVRSRAGFESERRGSHPYIDFRIFHSQSEIEVSVSARNIRRLLSFQRYLRSSRFF
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
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:: . :..::.:: :::. :: ::: :.::::::::::::::::.: :::. ::::
XP_016 RGTAVSNSLNILDDDYNGQAKCMLEKVGNWNFDIFLFDRLTNGNSLVSLTFHLFSLHGLI
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KSD HHFKLDMVTLHRFLVMVQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLASFLTPLDIML
..:.:::. :.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::. .:: ::.:
XP_016 EYFHLDMMKLRRFLVMIQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLANSVTPWDILL
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.:.:::.::.:::::::::::::::.::.::.: ::::::::::..:.:::: :..:::
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: :..: :.:.:::::::.::::.:. ...:: :: :::.. ::..::.::::::::
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:::: ::.::::::.: :::..::..:.:..: .::::... .:: .::::::.:.::::
XP_016 NPCRTWELSKQWSEKVTEEFFHQGDIEKKYHLGVSPLCDRHTESIANIQIGFMTYLVEPL
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: :::.:. :. ::..::::.. :::.::.: .: :. ....
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500
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10 20 30 40 50
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: : : :: : .:. . : . ..:.:
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: : ...:: . :. : . ::.:.:...: ..:::::.:.::::..
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pF1KSD NSTTYSGEIGTKKKVKRLLSFQRYFHASRLLRGIIPQAPLHLLDEDYLGQARHMLSKVGM
.: . . ....::::::::...::..:: . :..::.:: :::. :: :::
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:.::::::::::::::::.: :::. ::::..:.:::. :.:::::.::::::::::::
NP_001 WNFDIFLFDRLTNGNSLVSLTFHLFSLHGLIEYFHLDMMKLRRFLVMIQEDYHSQNPYHN
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:::::::::::::::::::::. .:: ::.:.:.:::.::.:::::::::::::::.::.
NP_001 AVHAADVTQAMHCYLKEPKLANSVTPWDILLSLIAAATHDLDHPGVNQPFLIKTNHYLAT
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pF1KSD LYQNMSVLENHHWRSTIGMLRESRLLAHLPKEMTQDIEQQLGSLILATDINRQNEFLTRL
::.: ::::::::::..:.:::: :..::: : :..: :.:.:::::::.::::.:. .
NP_001 LYKNTSVLENHHWRSAVGLLRESGLFSHLPLESRQQMETQIGALILATDISRQNEYLSLF
280 290 300 310 320 330
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pF1KSD KAHLHNKDLRLEDAQDRHFMLQIALKCADICNPCRIWEMSKQWSERVCEEFYRQGELEQK
..:: :: :::.. ::..::.:::::::::::: ::.::::::.: :::..::..:.:
NP_001 RSHLDRGDLCLEDTRHRHLVLQMALKCADICNPCRTWELSKQWSEKVTEEFFHQGDIEKK
340 350 360 370 380 390
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pF1KSD FELEISPLCNQQKDSIPSIQIGFMSYIVEPLFREWAHFTGNSTLSENMLGHLAHNKAQWK
..: .::::... .:: .::::::.:.::::: :::.:. :. ::..::::.. :::.::
NP_001 YHLGVSPLCDRHTESIANIQIGFMTYLVEPLFTEWARFS-NTRLSQTMLGHVGLNKASWK
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pF1KSD SLLPRQHRSRGSSGSGPDHDHAGQGTESEEQEGDSP
.: .: :. ....
NP_001 GLQREQSSSEDTDAAFELNSQLLPQENRLS
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>>XP_011515842 (OMIM: 171885) PREDICTED: high affinity c (456 aa)
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40 50 60 70 80
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.:.:: . :. : . ::.:.:..
XP_011 MGITLIWCLALVLIKWITSKRRGAISYDSSDQTALYIRMLGDVRVRSR
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90 100 110 120 130 140
pF1KSD TGVRAERRGSYPFIDFRLLNSTTYSGEIGTKKKVKRLLSFQRYFHASRLLRGIIPQAPLH
.: ..:::::.:.::::...: . . ....::::::::...::..:: . :.
XP_011 AGFESERRGSHPYIDFRIFHSQSEIEVSVSARNIRRLLSFQRYLRSSRFFRGTAVSNSLN
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pF1KSD LLDEDYLGQARHMLSKVGMWDFDIFLFDRLTNGNSLVTLLCHLFNTHGLIHHFKLDMVTL
.::.:: :::. :: ::: :.::::::::::::::::.: :::. ::::..:.:::. :
XP_011 ILDDDYNGQAKCMLEKVGNWNFDIFLFDRLTNGNSLVSLTFHLFSLHGLIEYFHLDMMKL
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pF1KSD HRFLVMVQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLASFLTPLDIMLGLLAAAAHDV
.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::. .:: ::.:.:.:::.::.
XP_011 RRFLVMIQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLANSVTPWDILLSLIAAATHDL
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:::::::::::::::.::.::.: ::::::::::..:.:::: :..::: : :..: :.
XP_011 DHPGVNQPFLIKTNHYLATLYKNTSVLENHHWRSAVGLLRESGLFSHLPLESRQQMETQI
230 240 250 260 270 280
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:.:::::::.::::.:. ...:: :: :::.. ::..::.:::::::::::: ::.::
XP_011 GALILATDISRQNEYLSLFRSHLDRGDLCLEDTRHRHLVLQMALKCADICNPCRTWELSK
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::::.: :::..::..:.:..: .::::... .:: .::::::.:.::::: :::.:. :
XP_011 QWSEKVTEEFFHQGDIEKKYHLGVSPLCDRHTESIANIQIGFMTYLVEPLFTEWARFS-N
350 360 370 380 390 400
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. ::..::::.. :::.::.: .: :. ....
XP_011 TRLSQTMLGHVGLNKASWKGLQREQSSSEDTDAAFELNSQLLPQENRLS
410 420 430 440 450
>>NP_002594 (OMIM: 171885) high affinity cAMP-specific 3 (456 aa)
initn: 1784 init1: 1714 opt: 1806 Z-score: 2071.0 bits: 392.6 E(85289): 1.3e-108
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40 50 60 70 80
pF1KSD GCQQGPLPWDLPEMIRMVKLVWKSKSELQATKQRGIL--DNEDALRSFP---GDIRLRGQ
.:.:: . :. : . ::.:.:..
NP_002 MGITLIWCLALVLIKWITSKRRGAISYDSSDQTALYIRMLGDVRVRSR
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KSD TGVRAERRGSYPFIDFRLLNSTTYSGEIGTKKKVKRLLSFQRYFHASRLLRGIIPQAPLH
.: ..:::::.:.::::...: . . ....::::::::...::..:: . :.
NP_002 AGFESERRGSHPYIDFRIFHSQSEIEVSVSARNIRRLLSFQRYLRSSRFFRGTAVSNSLN
50 60 70 80 90 100
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pF1KSD LLDEDYLGQARHMLSKVGMWDFDIFLFDRLTNGNSLVTLLCHLFNTHGLIHHFKLDMVTL
.::.:: :::. :: ::: :.::::::::::::::::.: :::. ::::..:.:::. :
NP_002 ILDDDYNGQAKCMLEKVGNWNFDIFLFDRLTNGNSLVSLTFHLFSLHGLIEYFHLDMMKL
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.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::. .:: ::.:.:.:::.::.
NP_002 RRFLVMIQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEPKLANSVTPWDILLSLIAAATHDL
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pF1KSD DHPGVNQPFLIKTNHHLANLYQNMSVLENHHWRSTIGMLRESRLLAHLPKEMTQDIEQQL
:::::::::::::::.::.::.: ::::::::::..:.:::: :..::: : :..: :.
NP_002 DHPGVNQPFLIKTNHYLATLYKNTSVLENHHWRSAVGLLRESGLFSHLPLESRQQMETQI
230 240 250 260 270 280
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:.:::::::.::::.:. ...:: :: :::.. ::..::.:::::::::::: ::.::
NP_002 GALILATDISRQNEYLSLFRSHLDRGDLCLEDTRHRHLVLQMALKCADICNPCRTWELSK
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pF1KSD QWSERVCEEFYRQGELEQKFELEISPLCNQQKDSIPSIQIGFMSYIVEPLFREWAHFTGN
::::.: :::..::..:.:..: .::::... .:: .::::::.:.::::: :::.:. :
NP_002 QWSEKVTEEFFHQGDIEKKYHLGVSPLCDRHTESIANIQIGFMTYLVEPLFTEWARFS-N
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pF1KSD STLSENMLGHLAHNKAQWKSLLPRQHRSRGSSGSGPDHDHAGQGTESEEQEGDSP
. ::..::::.. :::.::.: .: :. ....
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>>XP_016865059 (OMIM: 600129,606799,614613) PREDICTED: c (553 aa)
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: : : .. . . .: ::. ..: . .
XP_016 MCNQPSINKATITEEAYQKLASETLEELDWCLDQLETL--QTRHSVSEMASNKFKRM
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:. : . . ...: .. . : :.: . . : : . . :. ....
XP_016 LNRELT------HLSEMSRSGNQVSEFISNTFLDKQHEVEIPSPTQKEKEKKKRPMSQIS
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. .. .:.: : . ::. .. .:: :.. : :. : . .: . .:. :: .:
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pF1KSD LLCH-LFNTHGLIHHFKLDMVTLHRFLVMVQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEP
.. : .:. . :.. ::. . :: .:. ... ::.. ::: .:::::.:. : :. :
XP_016 VIMHTIFQERDLLKTFKIPVDTLITYLMTLEDHYHADVAYHNNIHAADVVQSTHVLLSTP
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: . .: :.:. ...:.: ::::::::.. :::.:: .:: .:.. ::::::: .
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pF1KSD MLRESR--LLAHLPKEMTQDIEQQLGSLILATDINRQNEFLTRLKAHLHNKD------LR
.:.: .. .: :.. :...... ...::::.... ..:. ::. ...: :
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:.. .:: .:: ..:::. :: . .. .::..:. :::.:::. :.. .::::.:.
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pF1KSD GSSGSGPDHDHAGQGTESEEQEGDSP
: . .:: . :. ..:.
XP_016 -SPSPAPDDPEEGRQGQTEKFQFELTLEEDGESDTEKDSGSQVEEDTSCSDSKTLCTQDS
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>>XP_016865060 (OMIM: 600129,606799,614613) PREDICTED: c (553 aa)
initn: 682 init1: 345 opt: 784 Z-score: 898.1 bits: 175.9 E(85289): 2.7e-43
Smith-Waterman score: 784; 30.4% identity (64.9% similar) in 470 aa overlap (39-496:28-477)
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pF1KSD HPAELGRRWTGPEGVLPSSPGSRPGCQQGPLPWDLPEMIRMVKLVWKSKSELQATKQRGI
: : : .. . . .: ::. ..: . .
XP_016 MCNQPSINKATITEEAYQKLASETLEELDWCLDQLETL--QTRHSVSEMASNKFKRM
10 20 30 40 50
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:. : . . ...: .. . : :.: . . : : . . :. ....
XP_016 LNRELT------HLSEMSRSGNQVSEFISNTFLDKQHEVEIPSPTQKEKEKKKRPMSQIS
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pF1KSD SFQRYFHASRLLRGIIPQAPLHLLDEDYLGQARHMLSKVGMWDFDIFLFDRLTNGNSLVT
. .. .:.: : . ::. .. .:: :.. : :. : . .: . .:. :: .:
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pF1KSD LLCH-LFNTHGLIHHFKLDMVTLHRFLVMVQEDYHSQNPYHNAVHAADVTQAMHCYLKEP
.. : .:. . :.. ::. . :: .:. ... ::.. ::: .:::::.:. : :. :
XP_016 VIMHTIFQERDLLKTFKIPVDTLITYLMTLEDHYHADVAYHNNIHAADVVQSTHVLLSTP
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KLASFLTPLDIMLGLLAAAAHDVDHPGVNQPFLIKTNHHLANLYQNMSVLENHHWRSTIG
: . .: :.:. ...:.: ::::::::.. :::.:: .:: .:.. ::::::: .
XP_016 ALEAVFTDLEILAAIFASAIHDVDHPGVSNQFLINTNSELALMYNDSSVLENHHLAVGFK
230 240 250 260 270 280
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pF1KSD MLRESR--LLAHLPKEMTQDIEQQLGSLILATDINRQNEFLTRLKAHLHNKD------LR
.:.: .. .: :.. :...... ...::::.... ..:. ::. ...: :
XP_016 LLQEENCDIFQNLTKKQRQSLRKMVIDIVLATDMSKHMNLLADLKTMVETKKVTSSGVLL
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pF1KSD LEDAQDRHFMLQIALKCADICNPCRIWEMSKQWSERVCEEFYRQGELEQKFELEISPLCN
:.. .:: .:: ..:::. :: . .. .::..:. :::.:::. :.. .::::.:.
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XP_016 -SPSPAPDDPEEGRQGQTEKFQFELTLEEDGESDTEKDSGSQVEEDTSCSDSKTLCTQDS
460 470 480 490 500 510
502 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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