FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0014, 1960 aa
1>>>pF1KSDB0014 1960 - 1960 aa - 1960 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 16.0537+/-0.00207; mu= -24.0870+/- 0.122
mean_var=704.0622+/-149.836, 0's: 0 Z-trim(107.3): 324 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.048336
statistics sampled from 9240 (9487) to 9240 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.291), width: 16
Scan time: 5.710
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS10566.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1938) 9698 694.0 1.6e-198
CCDS73984.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (1985) 8899 638.2 9.4e-182
CCDS45423.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1979) 8600 617.4 1.8e-175
CCDS45424.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1945) 8543 613.4 2.7e-174
CCDS59411.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (1995) 8464 607.9 1.3e-172
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CCDS58515.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (2007) 6426 465.8 7.7e-130
CCDS54295.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (2036) 5245 383.4 4.8e-105
CCDS9601.1 MYH7 gene_id:4625|Hs108|chr14 (1935) 4770 350.3 4.4e-95
CCDS11156.1 MYH2 gene_id:4620|Hs108|chr17 (1941) 4717 346.6 5.7e-94
CCDS11153.1 MYH8 gene_id:4626|Hs108|chr17 (1937) 4704 345.7 1.1e-93
CCDS9600.1 MYH6 gene_id:4624|Hs108|chr14 (1939) 4700 345.4 1.3e-93
CCDS11155.1 MYH1 gene_id:4619|Hs108|chr17 (1939) 4697 345.2 1.5e-93
CCDS11154.1 MYH4 gene_id:4622|Hs108|chr17 (1939) 4679 344.0 3.6e-93
CCDS11157.1 MYH3 gene_id:4621|Hs108|chr17 (1940) 4664 342.9 7.3e-93
CCDS42869.1 MYH7B gene_id:57644|Hs108|chr20 (1983) 4605 338.8 1.3e-91
CCDS45613.1 MYH13 gene_id:8735|Hs108|chr17 (1938) 4585 337.4 3.3e-91
CCDS43127.1 MYH15 gene_id:22989|Hs108|chr3 (1946) 3751 279.2 1.1e-73
CCDS42037.1 MYO5A gene_id:4644|Hs108|chr15 (1855) 2032 159.4 1.3e-37
CCDS45262.1 MYO5A gene_id:4644|Hs108|chr15 (1828) 2011 157.9 3.4e-37
CCDS42436.1 MYO5B gene_id:4645|Hs108|chr18 (1848) 1969 155.0 2.6e-36
CCDS42036.1 MYO5C gene_id:55930|Hs108|chr15 (1742) 1942 153.1 9.3e-36
CCDS46405.1 MYO7B gene_id:4648|Hs108|chr2 (2116) 1665 133.8 7.1e-30
CCDS2311.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1078) 1576 127.4 3.1e-28
CCDS82546.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1107) 1563 126.5 5.9e-28
CCDS46477.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1136) 1563 126.5 6e-28
CCDS8929.1 MYO1A gene_id:4640|Hs108|chr12 (1043) 1428 117.1 3.9e-25
CCDS53685.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (1178) 1366 112.8 8.5e-24
CCDS53684.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (2175) 1366 113.0 1.4e-23
CCDS53683.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (2215) 1366 113.0 1.4e-23
CCDS42271.1 MYO15A gene_id:51168|Hs108|chr17 (3530) 1338 111.2 7.7e-23
CCDS32254.1 MYO1E gene_id:4643|Hs108|chr15 (1108) 1287 107.2 3.7e-22
CCDS76991.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 ( 961) 1281 106.8 4.4e-22
CCDS32615.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 (1006) 1281 106.8 4.6e-22
CCDS11003.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1028) 1237 103.7 3.9e-21
CCDS45562.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1044) 1237 103.7 3.9e-21
CCDS42226.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1063) 1237 103.7 4e-21
CCDS42494.1 MYO1F gene_id:4542|Hs108|chr19 (1098) 1234 103.5 4.7e-21
CCDS46010.1 MYO9B gene_id:4650|Hs108|chr19 (2022) 1235 103.8 7.3e-21
CCDS53826.1 MYO1H gene_id:283446|Hs108|chr12 (1022) 1216 102.3 1.1e-20
CCDS46446.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1314) 1214 102.2 1.4e-20
CCDS42773.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1341) 1214 102.2 1.5e-20
CCDS54834.1 MYO10 gene_id:4651|Hs108|chr5 (2058) 1195 101.0 5.1e-20
CCDS76992.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 ( 436) 1095 93.6 1.9e-18
CCDS54112.1 MYO19 gene_id:80179|Hs108|chr17 ( 970) 1103 94.4 2.4e-18
CCDS45642.1 MYO18A gene_id:399687|Hs108|chr17 (2054) 935 82.9 1.5e-14
CCDS45641.1 MYO18A gene_id:399687|Hs108|chr17 (2039) 923 82.1 2.6e-14
>>CCDS13927.1 MYH9 gene_id:4627|Hs108|chr22 (1960 aa)
initn: 12453 init1: 12453 opt: 12453 Z-score: 4716.0 bits: 886.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 12453; 100.0% identity (100.0% similar) in 1960 aa overlap (1-1960:1-1960)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIVELVE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGLFCVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 INPYKNLPIYSEEIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGESGAGK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TENTKKVIQYLAYVASSHKSKKDQGELERQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TENTKKVIQYLAYVASSHKSKKDQGELERQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD INFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 INFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEEEQMGLLRVISGVLQLGNIVFKKERNT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLF
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pF1KSD NHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLL
550 560 570 580 590 600
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HQSSDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMAT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLDQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRAGVLAHLEEERDLKIT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAENRLTEMETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAE
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CCDS13 ELRARLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQAEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQ
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CCDS13 KLQLEKVTTEAKLKKLEEEQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAK
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CCDS13 LKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLSDQIAELQAQIAELKMQLAK
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CCDS13 KEEELQAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEE
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CCDS13 LEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEE
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CCDS13 LAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLLQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVK
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CCDS13 FNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTGLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQVEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAVAARKKLEMDLK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELDDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARIAQLEEELEE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EQGNTELINDRLKKANLQIDQINTDLNLERSHAQKNENARQQLERQNKELKVKLQEMEGT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VKSKYKASITALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRTEKKLKDVLLQVDDERRNAEQ
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pF1KSD YKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNK
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CCDS13 YKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNREVSSLKNK
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1930 1940 1950 1960
pF1KSD LRRGDLPFVVPRRMARKGAGDGSDEEVDGKADGAEAKPAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LRRGDLPFVVPRRMARKGAGDGSDEEVDGKADGAEAKPAE
1930 1940 1950 1960
>>CCDS11144.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (1976 aa)
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Smith-Waterman score: 9989; 77.8% identity (93.6% similar) in 1975 aa overlap (1-1960:1-1974)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAQQAA----DKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIV
:::... ..::.::. : :: .::::.::::::.::.. ::: ::.::: :.:..:
CCDS11 MAQRTGLEDPERYLFVDRAVIYNPATQADWTAKKLVWIPSERHGFEAASIKEERGDEVMV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD ELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGL
::.:::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS11 ELAENGKKAMVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKDRYYSGLIYTYSGL
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120 130 140 150 160 170
pF1KSD FCVVINPYKNLPIYSEEIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGES
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CCDS11 FCVVINPYKNLPIYSENIIEMYRGKKRHEMPPHIYAISESAYRCMLQDREDQSILCTGES
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pF1KSD GAGKTENTKKVIQYLAYVASSHKSKKDQ---GELERQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSS
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CCDS11 GAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKGRKDHNIPGELERQLLQANPILESFGNAKTVKNDNSS
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::::::::::::.::::::::::::::::::.::::.:::::::: ::::::::::.:::
CCDS11 RFGKFIRINFDVTGYIVGANIETYLLEKSRAVRQAKDERTFHIFYQLLSGAGEHLKSDLL
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pF1KSD LEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEEEQMGLLRVISGVLQLGNIV
:: .:.:::::::.. :::::::: ::::::::.:::. .:: ...:.:.:.:::.:::
CCDS11 LEGFNNYRFLSNGYIPIPGQQDKDNFQETMEAMHIMGFSHEEILSMLKVVSSVLQFGNIS
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:::::::::::::.::.:::. ::::.:: .:::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FKKERNTDQASMPENTVAQKLCHLLGMNVMEFTRAILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFA
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.::::::::::.::::: :::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS11 VEALAKATYERLFRWLVHRINKALDRTKRQGASFIGILDIAGFEIFELNSFEQLCINYTN
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::.:::::::::
CCDS11 EKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIERPANPPGVLALLDEECW
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:::::::.::::..::::.: :::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FPKATDKTFVEKLVQEQGSHSKFQKPRQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLN
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::.:::::::::.::.:::::::::.:::::.::.:::. .:.::.:::::::::::::.
CCDS11 DNVATLLHQSSDRFVAELWKDVDRIVGLDQVTGMTETAFGSAYKTKKGMFRTVGQLYKES
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:.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS11 LTKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKRAGKLDPHLVLDQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRIV
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::::::::::::::.:::::::::::: ::.::::: :::::::::.::::::::::::
CCDS11 FQEFRQRYEILTPNAIPKGFMDGKQACERMIRALELDPNLYRIGQSKIFFRAGVLAHLEE
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::::::::.:: ::: ::::::::::::.::::.:.::::::::::::::.:::::.:::
CCDS11 ERDLKITDIIIFFQAVCRGYLARKAFAKKQQQLSALKVLQRNCAAYLKLRHWQWWRVFTK
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:::::::.:::::..::.:::.::.::: .:..: ::: ..::. :: : :::::::
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CCDS11 ELFAEAEEMRARLAAKKQELEEILHDLESRVEEEEERNQILQNEKKKMQAHIQDLEEQLD
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:::.:::::::::::.:::.::.::: ..::::: :. :::::.:::::: ...:.::::
CCDS11 EEEGARQKLQLEKVTAEAKIKKMEEEILLLEDQNSKFIKEKKLMEDRIAECSSQLAEEEE
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:.:.:::..::.:.::.::::::..::: ::::::..:::.:..:::.:::::::::: :
CCDS11 KAKNLAKIRNKQEVMISDLEERLKKEEKTRQELEKAKRKLDGETTDLQDQIAELQAQIDE
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::.::::::::::.:::: ..:. .:: ::: .:::..::.:::::.:::.:::::::::
CCDS11 LKLQLAKKEEELQGALARGDDETLHKNNALKVVRELQAQIAELQEDFESEKASRNKAEKQ
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::::.:::::::::::::::.::::::::.:::::: :::.::::.:.::::::.:::.
CCDS11 KRDLSEELEALKTELEDTLDTTAAQQELRTKREQEVAELKKALEEETKNHEAQIQDMRQR
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CCDS11 HATALEELSEQLEQAKRFKANLEKNKQGLETDNKELACEVKVLQQVKAESEHKRKKLDAQ
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CCDS11 QELLQEETRQKLNLSSRIRQLEEEKNSLQEQQEEEEEARKNLEKQVLALQSQLADTKKKV
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.:..: .:. ::.:.:: :: :.:::: :::. :::::::::.::::::::: :::::::
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: : :::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::.: :
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:.:: :::.:..:::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS11 EFERQNKQLRADMEDLMSSKDDVGKNVHELEKSKRALEQQVEEMRTQLEELEDELQATED
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::::::::.:::::::::::: ::::.::::. :..::::.:::::::::::..:::..:
CCDS11 AKLRLEVNMQAMKAQFERDLQTRDEQNEEKKRLLIKQVRELEAELEDERKQRALAVASKK
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:.:.:::::::.:..::: :::.::::::::::::: .:::...::::.::.::.::.::
CCDS11 KMEIDLKDLEAQIEAANKARDEVIKQLRKLQAQMKDYQRELEEARASRDEIFAQSKESEK
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::::.:::..:::::::..:::.:.:.::::::::::.:: :::.:: :.::::::::::
CCDS11 KLKSLEAEILQLQEELASSERARRHAEQERDELADEITNSASGKSAL-LDEKRRLEARIA
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::::::::::.: ::.:::..:..::.: .:..: ::: :::..::::::::::::::.
CCDS11 QLEEELEEEQSNMELLNDRFRKTTLQVDTLNAELAAERSAAQKSDNARQQLERQNKELKA
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::::.::.::::.::.:.::::::.::::::..:.::: :: : :::::::::....::.
CCDS11 KLQELEGAVKSKFKATISALEAKIGQLEEQLEQEAKERAAANKLVRRTEKKLKEIFMQVE
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CCDS11 DERRHADQYKEQMEKANARMKQLKRQLEEAEEEATRANASRRKLQRELDDATEANEGLSR
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CCDS11 EVSTLKNRLRRGGPISFSSSRSGRRQLHLEGASLELSDDDTESKTSDVNETQPPQSE
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1210 1220 1230 1240 1250 1260
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KSD LQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTGLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDT
.:::: : ..:::.:.:: ::: ::: :...:::.:.....:. ::.:: ..: ::::::
CCDS10 VQELQSKCSDGERARAELNDKVHKLQNEVESVTGMLNEAEGKAIKLAKDVASLSSQLQDT
1270 1280 1290 1300 1310 1320
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pF1KSD QELLQEENRQKLSLSTKLKQVEDEKNSFREQLEEEEEAKHNLEKQIATLHAQVADMKKKM
:::::::.::::..::::.:.:.:.::...::.:: :::.:::..:.::. :..: :::.
CCDS10 QELLQEETRQKLNVSTKLRQLEEERNSLQDQLDEEMEAKQNLERHISTLNIQLSDSKKKL
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KSD EDSVGCLETAEEVKRKLQKDLEGLSQRHEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQR
.: .. .:. :: :...::..:.:.:..:::.::::::::::.:::::::::.::::.::
CCDS10 QDFASTVEALEEGKKRFQKEIENLTQQYEEKAAAYDKLEKTKNRLQQELDDLVVDLDNQR
1390 1400 1410 1420 1430 1440
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pF1KSD QSACNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKA
: . ::::::.::::::::::.::.:::.::::::::::::::::::::::::::.: :
CCDS10 QLVSNLEKKQRKFDQLLAEEKNISSKYADERDRAEAEAREKETKALSLARALEEALEAKE
1450 1460 1470 1480 1490 1500
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pF1KSD ELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQVEEMKTQLEELEDELQATED
:::: ::....:::::.::::::::.:::::::::::: :.:::::::::::::::::::
CCDS10 ELERTNKMLKAEMEDLVSSKDDVGKNVHELEKSKRALETQMEEMKTQLEELEDELQATED
1510 1520 1530 1540 1550 1560
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pF1KSD AKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAVAARK
::::::::.::.:.:::::::.::::.:::..:: ::..:.:.:::::::::..:.::.:
CCDS10 AKLRLEVNMQALKGQFERDLQARDEQNEEKRRQLQRQLHEYETELEDERKQRALAAAAKK
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KSD KLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELDDTRASREEILAQAKENEK
::: :::::: . ::: :.:.::::::::::::::: .:::.:.::::.::.: ::::::
CCDS10 KLEGDLKDLELQADSAIKGREEAIKQLRKLQAQMKDFQRELEDARASRDEIFATAKENEK
1630 1640 1650 1660 1670 1680
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pF1KSD KLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANS-SGKGALALEEKRRLEARIA
: ::.::...::::.:::::::..::. :..:::.:.:.: ::..:: .::::::::::
CCDS10 KAKSLEADLMQLQEDLAAAERARKQADLEKEELAEELASSLSGRNALQ-DEKRRLEARIA
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pF1KSD QLEEELEEEQGNTELINDRLKKANLQIDQINTDLNLERSHAQKNENARQQLERQNKELKV
:::::::::::: : ..::..::. : .:....: ::: :::::.::::::::::::.
CCDS10 QLEEELEEEQGNMEAMSDRVRKATQQAEQLSNELATERSTAQKNESARQQLERQNKELRS
1740 1750 1760 1770 1780 1790
1800 1810 1820 1830 1840 1850
pF1KSD KLQEMEGTVKSKYKASITALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRTEKKLKDVLLQVD
::.::::.::::.:..:.::::::::::::...:..:.::: :.... .::::..::::.
CCDS10 KLHEMEGAVKSKFKSTIAALEAKIAQLEEQVEQEAREKQAATKSLKQKDKKLKEILLQVE
1800 1810 1820 1830 1840 1850
1860 1870 1880 1890 1900 1910
pF1KSD DERRNAEQYKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNR
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CCDS10 DERKMAEQYKEQAEKGNARVKQLKRQLEEAEEESQRINANRRKLQRELDEATESNEAMGR
1860 1870 1880 1890 1900 1910
1920 1930 1940 1950 1960
pF1KSD EVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGA------GDGSDEEVDGK-ADGAEAKPAE
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CCDS10 EVNALKSKLRRGNETSFVPSR--RSGGRRVIENADGSEEETDTRDADFNGTKASE
1920 1930 1940 1950 1960 1970
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CCDS10 ELVENGKKVTVGKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLRERYFSGLIYTYSGL
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CCDS10 GAGKTENTKKVIQYLAVVASSHKGKKDTSITGELEKQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSS
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CCDS10 LEGFNNYTFLSNGFVPIPAAQDDEMFQETVEAMAIMGFSEEEQLSILKVVSSVLQLGNIV
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::::::::::::::::::::: ::.:::::::::.::::::::::: :::::::::::::
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CCDS10 VEALAKATYERLFRWILTRVNKALDKTHRQGASFLGILDIAGFEIFEVNSFEQLCINYTN
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CCDS10 EKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIELIERPNNPPGVLALLDEECW
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:.:::.:::::.:::::::::::::..:::: :::.:::::::::::::::::::::.:
CCDS10 LGKLMTTLRNTTPNFVRCIIPNHEKRSGKLDAFLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRIV
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CCDS10 FQEFRQRYEILAANAIPKGFMDGKQACILMIKALELDPNLYRIGQSKIFFRTGVLAHLEE
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CCDS10 EEEAARQKLQLEKVTAEAKIKKLEDEILVMDDQNNKLSKERKLLEERISDLTTNLAEEEE
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:.:.:.:::::::.::..:: ::..:::.:::::: .::::::..:. .:::.:::::::
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CCDS10 ELERTNKMLKAEMEDLVSSKDDVGKNVHELEKSKRALETQMEEMKTQLEELEDELQATED
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CCDS10 AKLRLEVNMQALKGQFERDLQARDEQNEEKRRQLQRQLHEYETELEDERKQRALAAAAKK
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CCDS10 KLEGDLKDLELQADSAIKGREEAIKQLRKLQAQMKDFQRELEDARASRDEIFATAKENEK
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CCDS10 KAKSLEADLMQLQEDLAAAERARKQADLEKEELAEELASSLSGRNALQ-DEKRRLEARIA
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CCDS10 QLEEELEEEQGNMEAMSDRVRKATQQAEQLSNELATERSTAQKNESARQQLERQNKELRS
1740 1750 1760 1770 1780 1790
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CCDS10 KLHEMEGAVKSKFKSTIAALEAKIAQLEEQVEQEAREKQAATKSLKQKDKKLKEILLQVE
1800 1810 1820 1830 1840 1850
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pF1KSD DERRNAEQYKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATETADAMNR
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CCDS10 DERKMAEQYKEQAEKGNARVKQLKRQLEEAEEESQRINANRRKLQRELDEATESNEAMGR
1860 1870 1880 1890 1900 1910
1920 1930 1940 1950 1960
pF1KSD EVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDGSDEEVDGKADGAEAKPAE
::..::.::: : :
CCDS10 EVNALKSKLR-GPPPQETSQ
1920 1930
>>CCDS73984.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (1985 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KSD MAQQAA----DKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGEEAIV
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CCDS73 MAQRTGLEDPERYLFVDRAVIYNPATQADWTAKKLVWIPSERHGFEAASIKEERGDEVMV
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pF1KSD ELVENGKKVKVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKERYYSGLIYTYSGL
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CCDS73 ELAENGKKAMVNKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLKDRYYSGLIYTYSGL
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pF1KSD FCVVINPYKNLPIYSEEIVEMYKGKKRHEMPPHIYAITDTAYRSMMQDREDQSILCTGES
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CCDS73 FCVVINPYKNLPIYSENIIEMYRGKKRHEMPPHIYAISESAYRCMLQDREDQSILCTGES
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pF1KSD GAGKTENTKKVIQYLAYVASSHKSKKD------------QGELERQLLQANPILEAFGNA
::::::::::::::::.::::::..:: ::::::::::::::::.::::
CCDS73 GAGKTENTKKVIQYLAHVASSHKGRKDHNIPESPKPVKHQGELERQLLQANPILESFGNA
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pF1KSD KTVKNDNSSRFGKFIRINFDVNGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKEERTFHIFYYLLSGA
:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::.:::::::: :::::
CCDS73 KTVKNDNSSRFGKFIRINFDVTGYIVGANIETYLLEKSRAVRQAKDERTFHIFYQLLSGA
250 260 270 280 290 300
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pF1KSD GEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEEEQMGLLRVIS
:::::.::::: .:.:::::::.. :::::::: ::::::::.:::. .:: ...:.:.:
CCDS73 GEHLKSDLLLEGFNNYRFLSNGYIPIPGQQDKDNFQETMEAMHIMGFSHEEILSMLKVVS
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pF1KSD GVLQLGNIVFKKERNTDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKA
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...:.:::::.:.:::..::.:.::.::::::..::: ::::::..:::.:..:::.:::
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::::::: :::.::::::::::.:::: ..:. .:: ::: .:::..::.:::::.:::.
CCDS73 AELQAQIDELKLQLAKKEEELQGALARGDDETLHKNNALKVVRELQAQIAELQEDFESEK
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:..:::..::.:.:::::::.:..::: :::.::::::::::::: .:::...::::.::
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.::.::.::::::.:::..:::::::..:::.:.:.::::::::::.:: :::.:: :.:
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:::::::::::::::::::.: ::.:::..:..::.: .:..: ::: :::..::::::
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::::::::.::::.::.::::.::.:.::::::.::::::..:.::: :: : :::::::
CCDS73 ERQNKELKAKLQELEGAVKSKFKATISALEAKIGQLEEQLEQEAKERAAANKLVRRTEKK
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CCDS73 TEANEGLSREVSTLKNRLRRGGPISFSSSRSGRRQLHLEGASLELSDDDTESKTSDVNET
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1960
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CCDS73 QPPQSE
1980
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CCDS45 VDLDNQRQLVSNLEKKQRKFDQLLAEEKNISSKYADERDRAEAEAREKETKALSLARALE
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::.: : :::: ::....:::::.::::::::.:::::::::::: :.::::::::::::
CCDS45 EALEAKEELERTNKMLKAEMEDLVSSKDDVGKNVHELEKSKRALETQMEEMKTQLEELED
1510 1520 1530 1540 1550 1560
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pF1KSD ELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRS
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CCDS45 ELQATEDAKLRLEVNMQALKGQFERDLQARDEQNEEKRRQLQRQLHEYETELEDERKQRA
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1610 1620 1630 1640 1650 1660
pF1KSD MAVAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELDDTRASREEILA
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CCDS45 LAAAAKKKLEGDLKDLELQADSAIKGREEAIKQLRKLQAQMKDFQRELEDARASRDEIFA
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1670 1680 1690 1700 1710 1720
pF1KSD QAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANS-SGKGALALEEKR
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CCDS45 TAKENEKKAKSLEADLMQLQEDLAAAERARKQADLEKEELAEELASSLSGRNALQ-DEKR
1690 1700 1710 1720 1730
1730 1740 1750 1760 1770 1780
pF1KSD RLEARIAQLEEELEEEQGNTELINDRLKKANLQIDQINTDLNLERSHAQKNENARQQLER
::::::::::::::::::: : ..::..::. : .:....: ::: :::::.:::::::
CCDS45 RLEARIAQLEEELEEEQGNMEAMSDRVRKATQQAEQLSNELATERSTAQKNESARQQLER
1740 1750 1760 1770 1780 1790
1790 1800 1810 1820 1830 1840
pF1KSD QNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASITALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRTEKKLK
:::::. ::.::::.::::.:..:.::::::::::::...:..:.::: :.... .::::
CCDS45 QNKELRSKLHEMEGAVKSKFKSTIAALEAKIAQLEEQVEQEAREKQAATKSLKQKDKKLK
1800 1810 1820 1830 1840 1850
1850 1860 1870 1880 1890 1900
pF1KSD DVLLQVDDERRNAEQYKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATE
..::::.:::. :::::.::.:...:.:::::::::::::.:: ::.::::::::..:::
CCDS45 EILLQVEDERKMAEQYKEQAEKGNARVKQLKRQLEEAEEESQRINANRRKLQRELDEATE
1860 1870 1880 1890 1900 1910
1910 1920 1930 1940 1950
pF1KSD TADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGA------GDGSDEEVDGK-ADGAEAKP
. .::.:::..::.:::::. :: : :.:. .:::.::.: . :: .:
CCDS45 SNEAMGREVNALKSKLRRGNETSFVPSR--RSGGRRVIENADGSEEETDTRDADFNGTKA
1920 1930 1940 1950 1960 1970
1960
pF1KSD AE
.:
CCDS45 SE
>>CCDS45424.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1945 aa)
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::: : .: :.:.:::::::.:.::::::::.::::::.:.::: ::.::: :.:..:
CCDS45 MAQKGQLSDDEKFLFVDKNFINSPVAQADWAAKRLVWVPSEKQGFEAASIKEEKGDEVVV
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CCDS45 ELVENGKKVTVGKDDIQKMNPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLRERYFSGLIYTYSGL
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CCDS45 FCVVVNPYKHLPIYSEKIVDMYKGKKRHEMPPHIYAIADTAYRSMLQDREDQSILCTGES
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:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::..:::::::::...:: :
CCDS45 VKNDNSSRFGKFIRINFDVTGYIVGANIETYLLEKSRAIRQARDERTFHIFYYMIAGAKE
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....::::: .:.: ::::: : ::. :: .:::::.::: :::. ::::...:.:.:.:
CCDS45 KMRSDLLLEGFNNYTFLSNGFVPIPAAQDDEMFQETVEAMAIMGFSEEEQLSILKVVSSV
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:::::::::::::::::::::::::::: ::.:::::::::.::::::::::: ::::::
CCDS45 LQLGNIVFKKERNTDQASMPDNTAAQKVCHLMGINVTDFTRSILTPRIKVGRDVVQKAQT
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:::::::.::::::::::.:::.. :.:::::::.::::::.:::::::::::..:::::
CCDS45 KEQADFAVEALAKATYERLFRWILTRVNKALDKTHRQGASFLGILDIAGFEIFEVNSFEQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.: .:::.::
CCDS45 LCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIELIERPNNPPGVLA
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pF1KSD GFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRAG
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CCDS45 EQLQAETELYAEAEEMRVRLAAKKQELEEILHEMEARLEEEEDRGQQLQAERKKMAQQML
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CCDS45 DLEEQLEEEEAARQKLQLEKVTAEAKIKKLEDEILVMDDQNNKLSKERKLLEERISDLTT
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CCDS45 NLAEEEEKAKNLTKLKNKHESMISELEVRLKKEEKSRQELEKLKRKLEGDASDFHEQIAD
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CCDS45 VQEMRQKHAQAVEELTEQLEQFKRAKANLDKNKQTLEKENADLAGELRVLGQAKQEVEHK
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.::.:::.:::: : ..:::.:.:: ::: ::: :...:::.:.....:. ::.:: ..:
CCDS45 KKKLEAQVQELQSKCSDGERARAELNDKVHKLQNEVESVTGMLNEAEGKAIKLAKDVASL
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pF1KSD ESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQVEDEKNSFREQLEEEEEAKHNLEKQIATLHAQV
:::::::::::::.::::..::::.:.:.:.::...::.:: :::.:::..:.::. :.
CCDS45 SSQLQDTQELLQEETRQKLNVSTKLRQLEEERNSLQDQLDEEMEAKQNLERHISTLNIQL
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pF1KSD ADMKKKMEDSVGCLETAEEVKRKLQKDLEGLSQRHEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLL
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CCDS45 SDSKKKLQDFASTVEALEEGKKRFQKEIENLTQQYEEKAAAYDKLEKTKNRLQQELDDLV
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CCDS45 VDLDNQRQLVSNLEKKQRKFDQLLAEEKNISSKYADERDRAEAEAREKETKALSLARALE
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pF1KSD EAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQVEEMKTQLEELED
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CCDS45 EALEAKEELERTNKMLKAEMEDLVSSKDDVGKNVHELEKSKRALETQMEEMKTQLEELED
1510 1520 1530 1540 1550 1560
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pF1KSD ELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRS
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CCDS45 ELQATEDAKLRLEVNMQALKGQFERDLQARDEQNEEKRRQLQRQLHEYETELEDERKQRA
1570 1580 1590 1600 1610 1620
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pF1KSD MAVAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELDDTRASREEILA
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CCDS45 LAAAAKKKLEGDLKDLELQADSAIKGREEAIKQLRKLQAQMKDFQRELEDARASRDEIFA
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1670 1680 1690 1700 1710 1720
pF1KSD QAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANS-SGKGALALEEKR
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CCDS45 TAKENEKKAKSLEADLMQLQEDLAAAERARKQADLEKEELAEELASSLSGRNALQ-DEKR
1690 1700 1710 1720 1730
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pF1KSD RLEARIAQLEEELEEEQGNTELINDRLKKANLQIDQINTDLNLERSHAQKNENARQQLER
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CCDS45 RLEARIAQLEEELEEEQGNMEAMSDRVRKATQQAEQLSNELATERSTAQKNESARQQLER
1740 1750 1760 1770 1780 1790
1790 1800 1810 1820 1830 1840
pF1KSD QNKELKVKLQEMEGTVKSKYKASITALEAKIAQLEEQLDNETKERQAACKQVRRTEKKLK
:::::. ::.::::.::::.:..:.::::::::::::...:..:.::: :.... .::::
CCDS45 QNKELRSKLHEMEGAVKSKFKSTIAALEAKIAQLEEQVEQEAREKQAATKSLKQKDKKLK
1800 1810 1820 1830 1840 1850
1850 1860 1870 1880 1890 1900
pF1KSD DVLLQVDDERRNAEQYKDQADKASTRLKQLKRQLEEAEEEAQRANASRRKLQRELEDATE
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CCDS45 EILLQVEDERKMAEQYKEQAEKGNARVKQLKRQLEEAEEESQRINANRRKLQRELDEATE
1860 1870 1880 1890 1900 1910
1910 1920 1930 1940 1950 1960
pF1KSD TADAMNREVSSLKNKLRRGDLPFVVPRRMARKGAGDGSDEEVDGKADGAEAKPAE
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CCDS45 SNEAMGREVNALKSKLR-GPPPQETSQ
1920 1930 1940
>>CCDS59411.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (1995 aa)
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pF1KSD MAQQAADKYLYVDKNFINNPLAQADWAAKKLVWVPSDKSGFEPASLKEEVGE
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CCDS59 PGPVPEAAQPFLFTPRGPSAGGGPGSGTSPQVEWTARRLVWVPSELHGFEAAALRDEGEE
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CCDS59 YSGLFCVVINPYKQLPIYTEAIVEMYRGKKRHEVPPHVYAVTEGAYRSMLQDREDQSILC
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CCDS59 TGESGAGKTENTKKVIQYLAHVASSPKGRKEPGVPGELERQLLQANPILEAFGNAKTVKN
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CCDS59 DNSSRFGKFIRINFDVAGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKDECSFHIFYQLLGGAGEQLK
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CCDS59 ADLLLEPCSHYRFLTNGPSSSPGQE-RELFQETLESLRVLGFSHEEIISMLRMVSAVLQF
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:::..:.:::::::.:::::::::. .:::..::::.:..::::::::::::::::::::
CCDS59 GNIALKRERNTDQATMPDNTAAQKLCRLLGLGVTDFSRALLTPRIKVGRDYVQKAQTKEQ
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::::.::::::::::.:::::::.:.:::.. ::::::.:::::::::::.:::::::::
CCDS59 ADFALEALAKATYERLFRWLVLRLNRALDRSPRQGASFLGILDIAGFEIFQLNSFEQLCI
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pF1KSD NYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLD
::::::::::::::::.::::::::::: :.:.::::::::::::::.::.:::.:::::
CCDS59 NYTNEKLQQLFNHTMFVLEQEEYQREGIPWTFLDFGLDLQPCIDLIERPANPPGLLALLD
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::::::::::::::::: :::: :::::.:..:.:.::: ..::::::::::.:::::::
CCDS59 EECWFPKATDKSFVEKVAQEQGGHPKFQRPRHLRDQADFSVLHYAGKVDYKANEWLMKNM
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CCDS59 DPLNDNVAALLHQSTDRLTAEIWKDVEGIVGLEQVSSLGDGP-PGG-RPRRGMFRTVGQL
620 630 640 650 660 670
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pF1KSD YKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLDQLRCNGVLEGIRICRQGFP
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::..::::::::::::::.:::::::::::: ::.::::: ::::.::::.::::::::
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.::.:::::::: :.::.:.::::: . .::::: :::: ...:.:::..::.:::::
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....:. .: ::..::..:. .. :.:.:: ::. . :.::. . :::::::: .::
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: . :::: :. .:.:.: :.::::::::::::::.. :. :: ......:. ::::::
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::::::: .:..:.:.. ::.....::.:::::.:::::. ::...::.:::::..: .
CCDS59 AARKKLEGELEELKAQMASAGQGKEEAVKQLRKMQAQMKELWREVEETRTSREEIFSQNR
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:. .: : .. .....: .:.:::.:.:: ::::..::.:: . : :::.::.::.:.:
CCDS59 LRGRLGEEDAGARARHKMTIAALESKLAQAEEQLEQETRERILSGKLVRRAEKRLKEVVL
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CCDS59 QVEEERRVADQLRDQLEKGNLRVKQLKRQLEEAEEEASRAQAGRRRLQRELEDVTESAES
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CCDS59 MNREVTTLRNRLRRGPLTFTTRTVRQVFRLEEGVASDEEAEEAQPGSGPSPEPEGSPPAH
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CCDS59 PQ
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::::: .::. .: : .. .....: .:.:::.:.:: ::::..::.:: . : :::.:
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1850 1860 1870 1880 1890 1900
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1960
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2000
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]