Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDB0022
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0022, 520 aa
1>>>pF1KSDB0022 520 - 520 aa - 520 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.6231+/-0.00117; mu= -12.2164+/- 0.071
mean_var=502.4979+/-100.574, 0's: 0 Z-trim(116.4): 39 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.057215
statistics sampled from 16960 (16995) to 16960 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.796), E-opt: 0.2 (0.522), width: 16
Scan time: 4.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1143.1 MEF2D gene_id:4209|Hs108|chr1 ( 521) 3519 304.8 1.6e-82
CCDS60304.1 MEF2D gene_id:4209|Hs108|chr1 ( 514) 3448 298.9 9.1e-81
CCDS81920.1 MEF2A gene_id:4205|Hs108|chr15 ( 505) 1516 139.4 9.1e-33
CCDS53978.1 MEF2A gene_id:4205|Hs108|chr15 ( 497) 1492 137.4 3.6e-32
CCDS45362.1 MEF2A gene_id:4205|Hs108|chr15 ( 499) 1450 134.0 3.9e-31
CCDS45363.1 MEF2A gene_id:4205|Hs108|chr15 ( 437) 990 96.0 9.6e-20
CCDS54878.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5 ( 483) 934 91.4 2.5e-18
CCDS78034.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5 ( 465) 929 90.9 3.3e-18
CCDS47245.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5 ( 473) 905 89.0 1.3e-17
CCDS47244.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5 ( 463) 856 84.9 2.1e-16
CCDS58401.1 MEF2A gene_id:4205|Hs108|chr15 ( 429) 810 81.1 2.8e-15
>>CCDS1143.1 MEF2D gene_id:4209|Hs108|chr1 (521 aa)
initn: 3705 init1: 3519 opt: 3519 Z-score: 1595.1 bits: 304.8 E(32554): 1.6e-82
Smith-Waterman score: 3519; 99.8% identity (100.0% similar) in 520 aa overlap (1-520:1-520)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGRKKIQIQRITDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNHSNKLFQYAST
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CCDS11 MGRKKIQIQRITDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNHSNKLFQYAST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNADIIETLRKKGFNGCDSPEPDGEDSLEQSPLLEDKYRRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNADIIETLRKKGFNGCDSPEPDGEDSLEQSPLLEDKYRRA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SEELDGLFRRYGSTVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSSLTDPRLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SEELDGLFRRYGSTVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSSLTDPRLLS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD PQQPALQRNSVSPGLPQRPASAGAMLGGDLNSANGACPSPVGNGYVSARASPGLLPVANG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PQQPALQRNSVSPGLPQRPASAGAMLGGDLNSANGACPSPVGNGYVSARASPGLLPVANG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD NSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAGKGLMHHLTEDHLDLNNAQRLGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAGKGLMHHLTEDHLDLNNAQRLGV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGLPFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPAFSSPGGLSLGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGLPFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPAFSSPGGLSLGN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQQPQQPPQQQSHLVPVSLSNLIPGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQQPQQPPQQQSHLVPVSLSNLIPGSP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRERSPAPPPPAVFPAARPEPGDGLSSPAGGSYET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRERSPAPPPPAVFPAARPEPGDGLSSPAGGSYET
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KSD GDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEAEGSAVKRMRLDTWVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS11 GDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEAEGSAVKRMRLDTWTLK
490 500 510 520
>>CCDS60304.1 MEF2D gene_id:4209|Hs108|chr1 (514 aa)
initn: 3502 init1: 1933 opt: 3448 Z-score: 1563.5 bits: 298.9 E(32554): 9.1e-81
Smith-Waterman score: 3448; 98.5% identity (98.7% similar) in 520 aa overlap (1-520:1-513)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGRKKIQIQRITDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNHSNKLFQYAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MGRKKIQIQRITDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNHSNKLFQYAST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNADIIETLRKKGFNGCDSPEPDGEDSLEQSPLLEDKYRRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNADIIETLRKKGFNGCDSPEPDGEDSLEQSPLLEDKYRRA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SEELDGLFRRYGSTVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSSLTDPRLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SEELDGLFRRYGSTVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSSLTDPRLLS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD PQQPALQRNSVSPGLPQRPASAGAMLGGDLNSANGACPSPVGNGYVSARASPGLLPVANG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PQQPALQRNSVSPGLPQRPASAGAMLGGDLNSANGACPSPVGNGYVSARASPGLLPVANG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD NSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAGKGLMHHLTEDHLDLNNAQRLGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS60 NSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAGKGLMHHL-------NNAQRLGV
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGLPFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPAFSSPGGLSLGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGLPFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPAFSSPGGLSLGN
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQQPQQPPQQQSHLVPVSLSNLIPGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQQPQQPPQQQSHLVPVSLSNLIPGSP
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRERSPAPPPPAVFPAARPEPGDGLSSPAGGSYET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRERSPAPPPPAVFPAARPEPGDGLSSPAGGSYET
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520
pF1KSD GDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEAEGSAVKRMRLDTWVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS60 GDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEAEGSAVKRMRLDTWTLK
480 490 500 510
>>CCDS81920.1 MEF2A gene_id:4205|Hs108|chr15 (505 aa)
initn: 1544 init1: 620 opt: 1516 Z-score: 701.8 bits: 139.4 E(32554): 9.1e-33
Smith-Waterman score: 1699; 54.3% identity (73.2% similar) in 549 aa overlap (1-519:1-504)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGRKKIQIQRITDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNHSNKLFQYAST
:::::::: :: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS81 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYAST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNADIIETLRKKGFNGCDSPEPDGEDSLEQSPLLEDKYRRA
:::::::::::::::::::::.::.:::::::.:::.: ::..: .:.::: ::.. .
CCDS81 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCES--PDADDYFEHSPLSEDRFSKL
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KSD SEELDGLFRRYGSTVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSS-LTDPRLL
.:. : .:.: .: ::.: :::::.. ..:...::..:::.:::..:: ::: .:
CCDS81 NEDSDFIFKRGPPGLPPQNFSMSVTVPVTSPNALSYTNPGSSLVSPSLAASSTLTDSSML
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD SPQQPALQRNSVSPGLPQRPAS---AGAMLGG-DLNSANGACPSPVGNGYVSARASPGLL
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CCDS81 SPPQTTLHRN-VSPGAPQRPPSTGNAGGMLSTTDLTVPNGAGSSPVGNGFVNSRASPNLI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD PVANGNSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAGKGLMHHLTEDH-LDLNN
....:::.::.:.:::::: .. :: ::::::::. ..::.: :.:.. :.::.
CCDS81 GATGANSLGKVMPTKSPPPPGGGN-LGMNSRKPDLRVVIPPSSKGMMPPLSEEEELELNT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD AQRLGVSQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGLPFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPAFSSPG
::.. ::.:. :.::::::.:::: ::: .:.:::::::::.::::.::.: .:.:::
CCDS81 -QRISSSQATQPLATPVVSVTTPSLPPQGLVYSAMPTAYNTDYSLTSADLSALQGFNSPG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD GLSLGNVTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQQPQQPPQQQSHLVPVSLSN
::::.:.:::: :: ..::.
CCDS81 MLSLGQVSAWQQ--------------------------------------HHLGQAALSS
360 370
420 430 440 450
pF1KSD LIPGSPLPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRER-SPA--------------PPPPAVF
:. :. : . :. :...:. .:::::::.:: :.: .:. ::::
CCDS81 LVAGGQLSQ-GSNLSINTNQNISIKSEPISPPRDRMTPSGFQQQQQQQQQQQPPPPPQPQ
380 390 400 410 420 430
460 470 480 490 500 510
pF1KSD PAA-RPEP----G----DGLSSPAGGSYETGDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEAEGSAV
: .:.: : :.::: ...::. .::.: :::: . : :: . :. .:
CCDS81 PQPPQPQPRQEMGRSPVDSLSS-SSSSYDGSDREDPRGDFHSPIVLGRPPNTEDRESPSV
440 450 460 470 480 490
520
pF1KSD KRMRLDTWVL
::::.:.::
CCDS81 KRMRMDAWVT
500
>>CCDS53978.1 MEF2A gene_id:4205|Hs108|chr15 (497 aa)
initn: 1622 init1: 620 opt: 1492 Z-score: 691.1 bits: 137.4 E(32554): 3.6e-32
Smith-Waterman score: 1675; 53.8% identity (72.1% similar) in 548 aa overlap (1-519:1-496)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGRKKIQIQRITDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNHSNKLFQYAST
:::::::: :: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS53 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYAST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNADIIETLRKKGFNGCDSPEPDGEDSLEQSPLLEDKYRRA
:::::::::::::::::::::.::.:::::::.:::.: ::..: .:.::: ::.. .
CCDS53 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCES--PDADDYFEHSPLSEDRFSKL
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KSD SEELDGLFRRYGSTVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSS-LTDPRLL
.:. : .:.: .: ::.: :::::.. ..:...::..:::.:::..:: ::: .:
CCDS53 NEDSDFIFKRGPPGLPPQNFSMSVTVPVTSPNALSYTNPGSSLVSPSLAASSTLTDSSML
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD SPQQPALQRNSVSPGLPQRPAS---AGAMLGG-DLNSANGACPSPVGNGYVSARASPGLL
:: : .:.:: :::: :::: : ::.::. ::. ::: ::::::.:..::::.:.
CCDS53 SPPQTTLHRN-VSPGAPQRPPSTGNAGGMLSTTDLTVPNGAGSSPVGNGFVNSRASPNLI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD PVANGNSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAGKGLMHHLTEDHLDLNNA
....:::.::.:.:::::: .. :: ::::::::. ..::.: : :.
CCDS53 GATGANSLGKVMPTKSPPPPGGGN-LGMNSRKPDLRVVIPPSSKGMMPPL--------NT
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QRLGVSQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGLPFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPAFSSPGG
::.. ::.:. :.::::::.:::: ::: .:.:::::::::.::::.::.: .:.:::
CCDS53 QRISSSQATQPLATPVVSVTTPSLPPQGLVYSAMPTAYNTDYSLTSADLSALQGFNSPGM
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LSLGNVTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQQPQQPPQQQSHLVPVSLSNL
::::.:.:::: :: ..::.:
CCDS53 LSLGQVSAWQQ--------------------------------------HHLGQAALSSL
350 360 370
420 430 440 450 460
pF1KSD IPGSPLPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRER-SPA--------------PPPPAVFP
. :. : . :. :...:. .:::::::.:: :.: .:. :::: :
CCDS53 VAGGQLSQ-GSNLSINTNQNISIKSEPISPPRDRMTPSGFQQQQQQQQQQQPPPPPQPQP
380 390 400 410 420
470 480 490 500 510
pF1KSD AA-RPEP----G----DGLSSPAGGSYETGDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEAEGSAVK
.:.: : :.::: ...::. .::.: :::: . : :: . :. .::
CCDS53 QPPQPQPRQEMGRSPVDSLSS-SSSSYDGSDREDPRGDFHSPIVLGRPPNTEDRESPSVK
430 440 450 460 470 480
520
pF1KSD RMRLDTWVL
:::.:.::
CCDS53 RMRMDAWVT
490
>>CCDS45362.1 MEF2A gene_id:4205|Hs108|chr15 (499 aa)
initn: 1766 init1: 764 opt: 1450 Z-score: 672.4 bits: 134.0 E(32554): 3.9e-31
Smith-Waterman score: 1633; 52.9% identity (71.1% similar) in 550 aa overlap (1-519:1-498)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGRKKIQIQRITDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNHSNKLFQYAST
:::::::: :: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS45 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYAST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNADIIETLRKKGFNGCDSPEPDGEDSLEQSPLLEDKYRRA
:::::::::::::::::::::.::.:.: :: :::::.:: : .: :.::..
CCDS45 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVEALNKKEHRGCDSPDPD--TSYVLTPHTEEKYKKI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KSD SEELDGLFR--RYGSTVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSS-LTDPR
.::.:...: . . .: ::.: :::::.. ..:...::..:::.:::..:: :::
CCDS45 NEEFDNMMRNHKIAPGLPPQNFSMSVTVPVTSPNALSYTNPGSSLVSPSLAASSTLTDSS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LLSPQQPALQRNSVSPGLPQRPAS---AGAMLGG-DLNSANGACPSPVGNGYVSARASPG
.::: : .:.:: :::: :::: : ::.::. ::. ::: ::::::.:..::::.
CCDS45 MLSPPQTTLHRN-VSPGAPQRPPSTGNAGGMLSTTDLTVPNGAGSSPVGNGFVNSRASPN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD LLPVANGNSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAGKGLMHHLTEDHLDLN
:. ....:::.::.:.:::::: .. :: ::::::::. ..::.: :
CCDS45 LIGATGANSLGKVMPTKSPPPPGGGN-LGMNSRKPDLRVVIPPSSKGMMPPL--------
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD NAQRLGVSQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGLPFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPAFSSP
:.::.. ::.:. :.::::::.:::: ::: .:.:::::::::.::::.::.: .:.::
CCDS45 NTQRISSSQATQPLATPVVSVTTPSLPPQGLVYSAMPTAYNTDYSLTSADLSALQGFNSP
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KSD GGLSLGNVTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQQPQQPPQQQSHLVPVSLS
: ::::.:.:::: :: ..::
CCDS45 GMLSLGQVSAWQQ--------------------------------------HHLGQAALS
350 360 370
420 430 440 450
pF1KSD NLIPGSPLPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRER-SPA--------------PPPPAV
.:. :. : . :. :...:. .:::::::.:: :.: .:. ::::
CCDS45 SLVAGGQLSQ-GSNLSINTNQNISIKSEPISPPRDRMTPSGFQQQQQQQQQQQPPPPPQP
380 390 400 410 420
460 470 480 490 500
pF1KSD FPAA-RPEP----G----DGLSSPAGGSYETGDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEAEGSA
: .:.: : :.::: ...::. .::.: :::: . : :: . :. .
CCDS45 QPQPPQPQPRQEMGRSPVDSLSS-SSSSYDGSDREDPRGDFHSPIVLGRPPNTEDRESPS
430 440 450 460 470 480
510 520
pF1KSD VKRMRLDTWVL
:::::.:.::
CCDS45 VKRMRMDAWVT
490
>>CCDS45363.1 MEF2A gene_id:4205|Hs108|chr15 (437 aa)
initn: 1195 init1: 432 opt: 990 Z-score: 467.9 bits: 96.0 E(32554): 9.6e-20
Smith-Waterman score: 1173; 46.8% identity (69.0% similar) in 464 aa overlap (86-519:18-436)
60 70 80 90 100 110
pF1KSD QYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNADIIETLRKKGFNGCDSPEPDGEDSLEQSPLLED
.::::::.:::.:: :..: .:.::: ::
CCDS45 MGRKKIQITRIMDERNRQTLRKKGLNGCESP--DADDYFEHSPLSED
10 20 30 40
120 130 140 150 160 170
pF1KSD KYRRASEELDGLFRRYGSTVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSS-LT
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CCDS45 RFSKLNEDSDFIFKRGPPGLPPQNFSMSVTVPVTSPNALSYTNPGSSLVSPSLAASSTLT
50 60 70 80 90 100
180 190 200 210 220 230
pF1KSD DPRLLSPQQPALQRNSVSPGLPQRPAS---AGAMLGG-DLNSANGACPSPVGNGYVSARA
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CCDS45 DSSMLSPPQTTLHRN-VSPGAPQRPPSTGNAGGMLSTTDLTVPNGAGSSPVGNGFVNSRA
110 120 130 140 150 160
240 250 260 270 280
pF1KSD SPGLLPVANGNSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAGKGLMHHLTEDH-
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CCDS45 SPNLIGATGANSLGKVMPTKSPPPPGGGN-LGMNSRKPDLRVVIPPSSKGMMPPLSEEEE
170 180 190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KSD LDLNNAQRLGVSQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGLPFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPA
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CCDS45 LELNT-QRISSSQATQPLATPVVSVTTPSLPPQGLVYSAMPTAYNTDYSLTSADLSALQG
230 240 250 260 270 280
350 360 370 380 390 400
pF1KSD FSSPGGLSLGNVTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQQPQQPPQQQSHLVP
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CCDS45 FNSPGMLSLGQVSAWQQ--------------------------------------HHLGQ
290 300
410 420 430 440 450
pF1KSD VSLSNLIPGSPLPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRER-SPA--------------PP
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CCDS45 AALSSLVAGGQLSQ-GSNLSINTNQNISIKSEPISPPRDRMTPSGFQQQQQQQQQQQPPP
310 320 330 340 350 360
460 470 480 490 500
pF1KSD PPAVFPAA-RPEP----G----DGLSSPAGGSYETGDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEA
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CCDS45 PPQPQPQPPQPQPRQEMGRSPVDSLSS-SSSSYDGSDREDPRGDFHSPIVLGRPPNTEDR
370 380 390 400 410 420
510 520
pF1KSD EGSAVKRMRLDTWVL
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CCDS45 ESPSVKRMRMDAWVT
430
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGRKKIQIQRITDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNHSNKLFQYAST
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CCDS54 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYAST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
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:::::::::::::::::::::.::.:::::::.::::::.::..:: :..
CCDS54 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSALNKKENKGCESPD
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110 120 130 140 150 160
pF1KSD -------SPLLEDKYRRASEELDGLFRRYG-STVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSG
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CCDS54 PDSSYALTPRTEEKYKKINEEFDNMIKSHKIPAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNP--
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170 180 190 200 210
pF1KSD SLVTPSLVTSSLTDPRLLSPQQPALQRNSVSPGLPQRPASAG---AMLGGDLNSANGACP
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CCDS54 --------VSSLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLTSGAG---
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220 230 240 250 260 270
pF1KSD SPVGNGYVSARASPGLLPVANGNSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAG
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CCDS54 TSAGNGYGNPRNSPGLL-VSPGN-LNKNMQAKSPPP----MNLGMNNRKPDLRVLIPPGS
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KSD KGLMHHLTEDHLDLNNAQRLGVSQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGL---PFSSMPTAYNT
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CCDS54 KNTMPSVN---------QRINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYP-SAISTTYGT
290 300 310 320 330
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pF1KSD DYQLTSAELSSLPAFSSPGGLSLGNVTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQ
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CCDS54 EYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMP----------------------
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pF1KSD QPQQPPQQQSHLVPVSLSNLIPGSPLPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRERSPAP--
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CCDS54 -----PSALSQLGACTSTHLSQSS-------NLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSR
370 380 390 400 410
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pF1KSD -PPPAVFPAARPEPGDGLSSPAGGSYETGDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEAEGSAVKR
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CCDS54 YPQHTRHEAGRS-PVDSLSS-CSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPD-ERESPSVKR
420 430 440 450 460 470
520
pF1KSD MRL-DTWVL
::: . :
CCDS54 MRLSEGWAT
480
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGRKKIQIQRITDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNHSNKLFQYAST
:::::::: :: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::
CCDS78 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYAST
10 20 30 40 50 60
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CCDS78 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKI
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pF1KSD SEELDGLF-RRYGSTVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSSLTDPRLL
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CCDS78 NEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNP----------VSSLGNPNLL
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CCDS78 PLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLTSGAG---TSAGNGYGNPRNSPGLL-
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pF1KSD VANGNSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAGKGLMHHLTEDHLDLNNAQ
:. :: ::: . :::::: .:: .:::::::. ..:. : .. :
CCDS78 VSPGN-LNKNMQAKSPPP----MNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVN---------Q
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pF1KSD RLGVSQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGL---PFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPAFSSP
:.. :::..::.:::::::::.: .::. : :.. :.:.:.:.:.::.:::: .:..
CCDS78 RINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYP-SAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTA
280 290 300 310 320 330
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pF1KSD GGLSLGNVTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQQPQQPPQQQSHLVPVSLS
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CCDS78 SALHLGSVTGWQQQHLHNMP---------------------------PSALSQLGACTST
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420 430 440 450 460 470
pF1KSD NLIPGSPLPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRERSPAP---PPPAVFPAARPEPGDGL
.: .: :.. . ..:::::::: :.:. .: : . :.: : :.:
CCDS78 HLSQSS-------NLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRS-PVDSL
370 380 390 400 410
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pF1KSD SSPAGGSYETGDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEAEGSAVKRMRL-DTWVL
:: ..::. .::.: :..: .:: ::.:. : :. .:::::: . :
CCDS78 SS-CSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPD-ERESPSVKRMRLSEGWAT
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGRKKIQIQRITDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNHSNKLFQYAST
:::::::: :: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::
CCDS47 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYAST
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNADIIETLRKKGFNGCDSPEPDGEDSLEQSPLLEDKYRRA
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CCDS47 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKI
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pF1KSD SEELDGLF-RRYGSTVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSSLTDPRLL
.:..: .. :. .:: ::: :::..:::...:: .::: .::: .: ::
CCDS47 NEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNP----------VSSLGNPNLL
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pF1KSD SPQQPALQRNSVSPGLPQRPASAG---AMLGGDLNSANGACPSPVGNGYVSARASPGLLP
.:.:::::.:::. .:: ::: ...::::.:. : . .:::: . : :::::
CCDS47 PLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLTSGAG---TSAGNGYGNPRNSPGLL-
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VANGNSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAGKGLMHHLTEDHLDLNNAQ
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CCDS47 VSPGN-LNKNMQAKSPPP----MNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVSED-VDLLLNQ
230 240 250 260 270 280
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pF1KSD RLGVSQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGL---PFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPAFSSP
:.. :::..::.:::::::::.: .::. : :.. :.:.:.:.:.::.:::: .:..
CCDS47 RINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYP-SAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTA
290 300 310 320 330
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pF1KSD GGLSLGNVTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQQPQQPPQQQSHLVPVSLS
..: ::.::.::: . ..: :. :.: . .
CCDS47 SALHLGSVTGWQQQHLHNMP---------------------------PSALSQLGACTST
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420 430 440 450 460 470
pF1KSD NLIPGSPLPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRERSPAP---PPPAVFPAARPEPGDGL
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CCDS47 HLSQSS-------NLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRS-PVDSL
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pF1KSD SSPAGGSYETGDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEAEGSAVKRMRL-DTWVL
:: ..::. .::.: :..: .:: ::.:. : :. .:::::: . :
CCDS47 SS-CSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPD-ERESPSVKRMRLSEGWAT
430 440 450 460 470
>>CCDS47244.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5 (463 aa)
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pF1KSD MGRKKIQIQRITDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNHSNKLFQYAST
:::::::: :: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::
CCDS47 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYAST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNADIIETLRKKGFNGCDSPEPDGEDSLEQSPLLEDKYRRA
:::::::::::::::::::::.::.:.: :: .::.::.::. .: .: :.::..
CCDS47 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVEALNKKENKGCESPDPDSSYAL--TPRTEEKYKKI
70 80 90 100 110
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pF1KSD SEELDGLFRRYG-STVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSSLTDPRLL
.::.:.... . .:: ::: :::..:::...:: .::: .::: .: ::
CCDS47 NEEFDNMIKSHKIPAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNP----------VSSLGNPNLL
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KSD SPQQPALQRNSVSPGLPQRPASAG---AMLGGDLNSANGACPSPVGNGYVSARASPGLLP
.:.:::::.:::. .:: ::: ...::::.:. : . .:::: . : :::::
CCDS47 PLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLTSGAG---TSAGNGYGNPRNSPGLL-
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VANGNSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAGKGLMHHLTEDHLDLNNAQ
:. :: ::: . :::::: .:: .:::::::. ..:. : .. :
CCDS47 VSPGN-LNKNMQAKSPPP----MNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVN---------Q
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD RLGVSQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGL---PFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPAFSSP
:.. :::..::.:::::::::.: .::. : :.. :.:.:.:.:.::.:::: .:..
CCDS47 RINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYP-SAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTA
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KSD GGLSLGNVTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQQPQQPPQQQSHLVPVSLS
..: ::.::.::: . ..: :. :.: . .
CCDS47 SALHLGSVTGWQQQHLHNMP---------------------------PSALSQLGACTST
330 340 350 360
420 430 440 450 460 470
pF1KSD NLIPGSPLPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRERSPAP---PPPAVFPAARPEPGDGL
.: .: :.. . ..:::::::: :.:. .: : . :.: : :.:
CCDS47 HLSQSS-------NLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRS-PVDSL
370 380 390 400 410
480 490 500 510 520
pF1KSD SSPAGGSYETGDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEAEGSAVKRMRL-DTWVL
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CCDS47 SS-CSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPD-ERESPSVKRMRLSEGWAT
420 430 440 450 460
520 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 08:07:33 2016 done: Thu Nov 3 08:07:34 2016
Total Scan time: 4.340 Total Display time: 0.110
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]