Result of FASTA (omim) for
pF1KSDB0025
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0025, 564 aa
1>>>pF1KSDB0025 564 - 564 aa - 564 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9878+/-0.000445; mu= 20.4378+/- 0.027
mean_var=71.1716+/-13.854, 0's: 0 Z-trim(109.2): 31 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.152027
statistics sampled from 17281 (17308) to 17281 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.203), width: 16
Scan time: 9.590
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001240653 (OMIM: 608383) dihydropyrimidinase-re ( 564) 3751 832.7 0
NP_064519 (OMIM: 608383) dihydropyrimidinase-relat ( 564) 3751 832.7 0
NP_001240652 (OMIM: 608383) dihydropyrimidinase-re ( 564) 3751 832.7 0
NP_001376 (OMIM: 222748,613326) dihydropyrimidinas ( 519) 2002 449.1 1.6e-125
NP_001014809 (OMIM: 602462) dihydropyrimidinase-re ( 686) 1979 444.1 6.7e-124
NP_001275591 (OMIM: 602462) dihydropyrimidinase-re ( 566) 1973 442.7 1.4e-123
NP_001275590 (OMIM: 602462) dihydropyrimidinase-re ( 570) 1973 442.7 1.4e-123
NP_001304 (OMIM: 602462) dihydropyrimidinase-relat ( 572) 1973 442.7 1.5e-123
NP_001184222 (OMIM: 602463) dihydropyrimidinase-re ( 677) 1973 442.8 1.6e-123
NP_001377 (OMIM: 602463) dihydropyrimidinase-relat ( 572) 1967 441.4 3.6e-123
XP_011535876 (OMIM: 601168) PREDICTED: dihydropyri ( 566) 1937 434.8 3.4e-121
NP_001378 (OMIM: 601168) dihydropyrimidinase-relat ( 570) 1936 434.6 4e-121
NP_001184223 (OMIM: 601168) dihydropyrimidinase-re ( 684) 1936 434.7 4.6e-121
NP_006417 (OMIM: 608407) dihydropyrimidinase-relat ( 572) 1894 425.4 2.4e-118
NP_001231533 (OMIM: 602463) dihydropyrimidinase-re ( 536) 1866 419.2 1.6e-116
XP_011537427 (OMIM: 608407) PREDICTED: dihydropyri ( 509) 1693 381.3 4.1e-105
XP_005252715 (OMIM: 608407) PREDICTED: dihydropyri ( 509) 1693 381.3 4.1e-105
XP_016870971 (OMIM: 608407) PREDICTED: dihydropyri ( 509) 1693 381.3 4.1e-105
XP_016870972 (OMIM: 608407) PREDICTED: dihydropyri ( 509) 1693 381.3 4.1e-105
XP_016868656 (OMIM: 222748,613326) PREDICTED: dihy ( 454) 1692 381.0 4.3e-105
XP_011515205 (OMIM: 222748,613326) PREDICTED: dihy ( 517) 1692 381.1 4.8e-105
XP_005250875 (OMIM: 222748,613326) PREDICTED: dihy ( 555) 1692 381.1 5.1e-105
XP_006716581 (OMIM: 222748,613326) PREDICTED: dihy ( 502) 1148 261.7 3.9e-69
>>NP_001240653 (OMIM: 608383) dihydropyrimidinase-relate (564 aa)
initn: 3751 init1: 3751 opt: 3751 Z-score: 4447.0 bits: 832.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3751; 100.0% identity (100.0% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLANSASVRILIKGGKVVNDDCTHEADVYIENGIIQQVGRELMIPGGAKVIDATGKLVIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLANSASVRILIKGGKVVNDDCTHEADVYIENGIIQQVGRELMIPGGAKVIDATGKLVIP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GGIDTSTHFHQTFMNATCVDDFYHGTKAALVGGTTMIIGHVLPDKETSLVDAYEKCRGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGIDTSTHFHQTFMNATCVDDFYHGTKAALVGGTTMIIGHVLPDKETSLVDAYEKCRGLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DPKVCCDYALHVGITWWAPKVKAEMETLVREKGVNSFQMFMTYKDLYMLRDSELYQVLHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DPKVCCDYALHVGITWWAPKVKAEMETLVREKGVNSFQMFMTYKDLYMLRDSELYQVLHA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD CKDIGAIARVHAENGELVAEGAKEALDLGITGPEGIEISRPEELEAEATHRVITIANRTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CKDIGAIARVHAENGELVAEGAKEALDLGITGPEGIEISRPEELEAEATHRVITIANRTH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD CPIYLVNVSSISAGDVIAAAKMQGKVVLAETTTAHATLTGLHYYHQDWSHAAAYVTVPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CPIYLVNVSSISAGDVIAAAKMQGKVVLAETTTAHATLTGLHYYHQDWSHAAAYVTVPPL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD RLDTNTSTYLMSLLANDTLNIVASDHRPFTTKQKAMGKEDFTKIPHGVSGVQDRMSVIWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLDTNTSTYLMSLLANDTLNIVASDHRPFTTKQKAMGKEDFTKIPHGVSGVQDRMSVIWE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RGVVGGKMDENRFVAVTSSNAAKLLNLYPRKGRIIPGADADVVVWDPEATKTISASTQVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGVVGGKMDENRFVAVTSSNAAKLLNLYPRKGRIIPGADADVVVWDPEATKTISASTQVQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GGDFNLYENMRCHGVPLVTISRGRVVYENGVFMCAEGTGKFCPLRSFPDTVYKKLVQREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGDFNLYENMRCHGVPLVTISRGRVVYENGVFMCAEGTGKFCPLRSFPDTVYKKLVQREK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD TLKVRGVDRTPYLGDVAVVVHPGKKEMGTPLADTPTRPVTRHGGMRDLHESSFSLSGSQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLKVRGVDRTPYLGDVAVVVHPGKKEMGTPLADTPTRPVTRHGGMRDLHESSFSLSGSQI
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KSD DDHVPKRASARILAPPGGRSSGIW
::::::::::::::::::::::::
NP_001 DDHVPKRASARILAPPGGRSSGIW
550 560
>>NP_064519 (OMIM: 608383) dihydropyrimidinase-related p (564 aa)
initn: 3751 init1: 3751 opt: 3751 Z-score: 4447.0 bits: 832.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3751; 100.0% identity (100.0% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLANSASVRILIKGGKVVNDDCTHEADVYIENGIIQQVGRELMIPGGAKVIDATGKLVIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 MLANSASVRILIKGGKVVNDDCTHEADVYIENGIIQQVGRELMIPGGAKVIDATGKLVIP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GGIDTSTHFHQTFMNATCVDDFYHGTKAALVGGTTMIIGHVLPDKETSLVDAYEKCRGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 GGIDTSTHFHQTFMNATCVDDFYHGTKAALVGGTTMIIGHVLPDKETSLVDAYEKCRGLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DPKVCCDYALHVGITWWAPKVKAEMETLVREKGVNSFQMFMTYKDLYMLRDSELYQVLHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 DPKVCCDYALHVGITWWAPKVKAEMETLVREKGVNSFQMFMTYKDLYMLRDSELYQVLHA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD CKDIGAIARVHAENGELVAEGAKEALDLGITGPEGIEISRPEELEAEATHRVITIANRTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 CKDIGAIARVHAENGELVAEGAKEALDLGITGPEGIEISRPEELEAEATHRVITIANRTH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD CPIYLVNVSSISAGDVIAAAKMQGKVVLAETTTAHATLTGLHYYHQDWSHAAAYVTVPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 CPIYLVNVSSISAGDVIAAAKMQGKVVLAETTTAHATLTGLHYYHQDWSHAAAYVTVPPL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD RLDTNTSTYLMSLLANDTLNIVASDHRPFTTKQKAMGKEDFTKIPHGVSGVQDRMSVIWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 RLDTNTSTYLMSLLANDTLNIVASDHRPFTTKQKAMGKEDFTKIPHGVSGVQDRMSVIWE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RGVVGGKMDENRFVAVTSSNAAKLLNLYPRKGRIIPGADADVVVWDPEATKTISASTQVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 RGVVGGKMDENRFVAVTSSNAAKLLNLYPRKGRIIPGADADVVVWDPEATKTISASTQVQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GGDFNLYENMRCHGVPLVTISRGRVVYENGVFMCAEGTGKFCPLRSFPDTVYKKLVQREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 GGDFNLYENMRCHGVPLVTISRGRVVYENGVFMCAEGTGKFCPLRSFPDTVYKKLVQREK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD TLKVRGVDRTPYLGDVAVVVHPGKKEMGTPLADTPTRPVTRHGGMRDLHESSFSLSGSQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 TLKVRGVDRTPYLGDVAVVVHPGKKEMGTPLADTPTRPVTRHGGMRDLHESSFSLSGSQI
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KSD DDHVPKRASARILAPPGGRSSGIW
::::::::::::::::::::::::
NP_064 DDHVPKRASARILAPPGGRSSGIW
550 560
>>NP_001240652 (OMIM: 608383) dihydropyrimidinase-relate (564 aa)
initn: 3751 init1: 3751 opt: 3751 Z-score: 4447.0 bits: 832.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3751; 100.0% identity (100.0% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLANSASVRILIKGGKVVNDDCTHEADVYIENGIIQQVGRELMIPGGAKVIDATGKLVIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLANSASVRILIKGGKVVNDDCTHEADVYIENGIIQQVGRELMIPGGAKVIDATGKLVIP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GGIDTSTHFHQTFMNATCVDDFYHGTKAALVGGTTMIIGHVLPDKETSLVDAYEKCRGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGIDTSTHFHQTFMNATCVDDFYHGTKAALVGGTTMIIGHVLPDKETSLVDAYEKCRGLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DPKVCCDYALHVGITWWAPKVKAEMETLVREKGVNSFQMFMTYKDLYMLRDSELYQVLHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DPKVCCDYALHVGITWWAPKVKAEMETLVREKGVNSFQMFMTYKDLYMLRDSELYQVLHA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD CKDIGAIARVHAENGELVAEGAKEALDLGITGPEGIEISRPEELEAEATHRVITIANRTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CKDIGAIARVHAENGELVAEGAKEALDLGITGPEGIEISRPEELEAEATHRVITIANRTH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD CPIYLVNVSSISAGDVIAAAKMQGKVVLAETTTAHATLTGLHYYHQDWSHAAAYVTVPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CPIYLVNVSSISAGDVIAAAKMQGKVVLAETTTAHATLTGLHYYHQDWSHAAAYVTVPPL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD RLDTNTSTYLMSLLANDTLNIVASDHRPFTTKQKAMGKEDFTKIPHGVSGVQDRMSVIWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLDTNTSTYLMSLLANDTLNIVASDHRPFTTKQKAMGKEDFTKIPHGVSGVQDRMSVIWE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RGVVGGKMDENRFVAVTSSNAAKLLNLYPRKGRIIPGADADVVVWDPEATKTISASTQVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGVVGGKMDENRFVAVTSSNAAKLLNLYPRKGRIIPGADADVVVWDPEATKTISASTQVQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GGDFNLYENMRCHGVPLVTISRGRVVYENGVFMCAEGTGKFCPLRSFPDTVYKKLVQREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGDFNLYENMRCHGVPLVTISRGRVVYENGVFMCAEGTGKFCPLRSFPDTVYKKLVQREK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD TLKVRGVDRTPYLGDVAVVVHPGKKEMGTPLADTPTRPVTRHGGMRDLHESSFSLSGSQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLKVRGVDRTPYLGDVAVVVHPGKKEMGTPLADTPTRPVTRHGGMRDLHESSFSLSGSQI
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KSD DDHVPKRASARILAPPGGRSSGIW
::::::::::::::::::::::::
NP_001 DDHVPKRASARILAPPGGRSSGIW
550 560
>>NP_001376 (OMIM: 222748,613326) dihydropyrimidinase [H (519 aa)
initn: 1868 init1: 1868 opt: 2002 Z-score: 2374.3 bits: 449.1 E(85289): 1.6e-125
Smith-Waterman score: 2002; 57.5% identity (80.9% similar) in 518 aa overlap (5-518:2-519)
10 20 30 40 50
pF1KSD MLANSASVRILIKGGKVVNDDCTHEADVYIENGIIQQVGRELMIPGGA----KVIDATGK
.: :.::.::.::::: .. ::: .:.:... .:..:. :::: .:.::.::
NP_001 MAAPSRLLIRGGRVVNDDFSEVADVLVEDGVVRALGHDLLPPGGAPAGLRVLDAAGK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LVIPGGIDTSTHFHQTFMNATCVDDFYHGTKAALVGGTTMIIGHVLPDKETSLVDAYEKC
::.:::::: ::.. ::.. .:::..:::::: ::::::: ..:.: ::..:.:
NP_001 LVLPGGIDTHTHMQFPFMGSRSIDDFHQGTKAALSGGTTMIIDFAIPQKGGSLIEAFETW
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD RGLADPKVCCDYALHVGITWWAPKVKAEMETLVREKGVNSFQMFMTYKDLYMLRDSELYQ
:. :::::::::.:::..:::. .:: ::. ::..::::::.:::.::::::. : :::.
NP_001 RSWADPKVCCDYSLHVAVTWWSDQVKEEMKILVQDKGVNSFKMFMAYKDLYMVTDLELYE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD VLHACKDIGAIARVHAENGELVAEGAKEALDLGITGPEGIEISRPEELEAEATHRVITIA
.. ::.:::::.::::::.:.:::::. : :::::::: :. ::: .::::: :.::::
NP_001 AFSRCKEIGAIAQVHAENGDLIAEGAKKMLALGITGPEGHELCRPEAVEAEATLRAITIA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD NRTHCPIYLVNVSSISAGDVIAAAKMQGKVVLAETTTAHATLTGLHYYHQDWSHAAAYVT
. ..::.:.:.: : ::. ::: :. .:::: .: .: : ::....: ::: .:
NP_001 SAVNCPLYIVHVMSKSAAKVIADARRDGKVVYGEPIAASLGTDGTHYWNKEWHHAAHHVM
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD VPPLRLDTNTSTYLMSLLANDTLNIVASDHRPFTTKQKAMGKEDFTKIPHGVSGVQDRMS
:::: : .: .::.::::: :. ...:. :.: :::.::.::::::.::.::.::::
NP_001 GPPLRPDPSTPDFLMNLLANDDLTTTGTDNCTFNTCQKALGKDDFTKIPNGVNGVEDRMS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD VIWERGVVGGKMDENRFVAVTSSNAAKLLNLYPRKGRIIPGADADVVVWDPEATKTISAS
::::.:: .:::::::::::::.::::..::::::::: :.:::.:.:::..:.::::.
NP_001 VIWEKGVHSGKMDENRFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADIVIWDPKGTRTISAK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD TQVQGGDFNLYENMRCHGVPLVTISRGRVVYENGVFMCAEGTGKFCPLRSFPDTVYKKLV
:. :. .::..:.: ::::::::::::.:::: ::: . : ::: : . : . .::..
NP_001 THHQAVNFNIFEGMVCHGVPLVTISRGKVVYEAGVFSVTAGDGKFIPRKPFAEYIYKRIK
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD QREKTLKVRGVDRTPYLGDVAVVVHPGKKEMGTPLADTPTRPVTRHGGMRDLHESSFSLS
::..: :.:.:: :.::.. :: .: . ..:
NP_001 QRDRTCTPTPVERAPYKGEVATLKSRVTKEDATAGTRKQAHP
480 490 500 510
540 550 560
pF1KSD GSQIDDHVPKRASARILAPPGGRSSGIW
>>NP_001014809 (OMIM: 602462) dihydropyrimidinase-relate (686 aa)
initn: 1925 init1: 1773 opt: 1979 Z-score: 2345.4 bits: 444.1 E(85289): 6.7e-124
Smith-Waterman score: 1979; 50.9% identity (81.1% similar) in 560 aa overlap (4-561:125-681)
10 20 30
pF1KSD MLANSASVRILIKGGKVVNDDCTHEADVYIENG
:. : :.:::::...::: . ::::.:.:
NP_001 AVSSPGERDERPPTLRIRRPAPRDLPLGRDNGQSDRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDG
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KSD IIQQVGRELMIPGGAKVIDATGKLVIPGGIDTSTHFHQTFMNATCVDDFYHGTKAALVGG
.:.:.:..:..:::.:.:.:.:..:::::::..:.... .. : .:::..::.::::::
NP_001 LIKQIGENLIVPGGVKTIEANGRMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGG
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KSD TTMIIGHVLPDKETSLVDAYEKCRGLADPKVCCDYALHVGITWWAPKVKAEMETLVREKG
::::: ::.:. .::. ..:: . :: : ::::.::: :: : :. :.:.::..::
NP_001 TTMIIDHVVPEPGSSLLTSFEKWHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKG
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KSD VNSFQMFMTYKDLYMLRDSELYQVLHACKDIGAIARVHAENGELVAEGAKEALDLGITGP
:::::..:.:::.:.. ::.::... : .::. ::::::.:.:. :. :..:::::
NP_001 VNSFQVYMAYKDVYQMSDSQLYEAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGP
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KSD EGIEISRPEELEAEATHRVITIANRTHCPIYLVNVSSISAGDVIAAAKMQGKVVLAETTT
:: .::::::::::. :.::::.: .::.:...: : ::.:.:: :. .: .:..: .
NP_001 EGHALSRPEELEAEAVFRAITIAGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIA
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KSD AHATLTGLHYYHQDWSHAAAYVTVPPLRLDTNTSTYLMSLLANDTLNIVASDHRPFTTKQ
: : ::. ..:..:::.:: ::: : .: :: :::: :....: : :..: :
NP_001 ASLGTDGTHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQ
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340 350 360 370 380 390
pF1KSD KAMGKEDFTKIPHGVSGVQDRMSVIWERGVVGGKMDENRFVAVTSSNAAKLLNLYPRKGR
::.::..:: ::.::.:...::.:.:...:. ::::::.::::::.::::..::::::::
NP_001 KAVGKDNFTLIPEGVNGIEERMTVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGR
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400 410 420 430 440 450
pF1KSD IIPGADADVVVWDPEATKTISASTQVQGGDFNLYENMRCHGVPLVTISRGRVVYENGVFM
: :.:::::.:::. :::.:... .. ..:..:.:.::: :::.::.:..:.:.: .
NP_001 IAVGSDADVVIWDPDKLKTITAKSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNIN
520 530 540 550 560 570
460 470 480 490 500 510
pF1KSD CAEGTGKFCPLRSFPDTVYKKLVQREKTLKVRGVDRTPYLGDVAVVVHPGKKEMGTPLAD
.: :.: : ..::. .:... :.:.. ..::.: : : : : :. ...:: .
NP_001 VNKGMGRFIPRKAFPEHLYQRVKIRNKVFGLQGVSRGMYDGPVYEV--PATPKYATPAPS
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520 530 540 550 560
pF1KSD TPTRPVTRHGG--MRDLHESSFSLSGSQIDDHVPKRASARILAPPGGRSSGIW
. . : ..: .:.::.:.:::::.::::. :.:.. ::.:::::::.
NP_001 AKSSP-SKHQPPPIRNLHQSNFSLSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
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>>NP_001275591 (OMIM: 602462) dihydropyrimidinase-relate (566 aa)
initn: 1925 init1: 1773 opt: 1973 Z-score: 2339.4 bits: 442.7 E(85289): 1.4e-123
Smith-Waterman score: 1973; 51.0% identity (81.1% similar) in 557 aa overlap (7-561:8-561)
10 20 30 40 50
pF1KSD MLANSASVRILIKGGKVVNDDCTHEADVYIENGIIQQVGRELMIPGGAKVIDATGKLVI
: :.:::::...::: . ::::.:.:.:.:.:..:..:::.:.:.:.:..::
NP_001 MRTTGAHSDRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEANGRMVI
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD PGGIDTSTHFHQTFMNATCVDDFYHGTKAALVGGTTMIIGHVLPDKETSLVDAYEKCRGL
:::::..:.... .. : .:::..::.::::::::::: ::.:. .::. ..:: .
NP_001 PGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSFEKWHEA
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pF1KSD ADPKVCCDYALHVGITWWAPKVKAEMETLVREKGVNSFQMFMTYKDLYMLRDSELYQVLH
:: : ::::.::: :: : :. :.:.::..:::::::..:.:::.:.. ::.::...
NP_001 ADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKGVNSFQVYMAYKDVYQMSDSQLYEAFT
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pF1KSD ACKDIGAIARVHAENGELVAEGAKEALDLGITGPEGIEISRPEELEAEATHRVITIANRT
: .::. ::::::.:.:. :. :..::::::: .::::::::::. :.::::.:
NP_001 FLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGPEGHALSRPEELEAEAVFRAITIAGRI
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pF1KSD HCPIYLVNVSSISAGDVIAAAKMQGKVVLAETTTAHATLTGLHYYHQDWSHAAAYVTVPP
.::.:...: : ::.:.:: :. .: .:..: .: : ::. ..:..:::.:: ::
NP_001 NCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIAASLGTDGTHYWSKNWAKAAAFVTSPP
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pF1KSD LRLDTNTSTYLMSLLANDTLNIVASDHRPFTTKQKAMGKEDFTKIPHGVSGVQDRMSVIW
: : .: :: :::: :....: : :..: :::.::..:: ::.::.:...::.:.:
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pF1KSD ERGVVGGKMDENRFVAVTSSNAAKLLNLYPRKGRIIPGADADVVVWDPEATKTISASTQV
...:. ::::::.::::::.::::..::::::::: :.:::::.:::. :::.:...
NP_001 DKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADVVIWDPDKLKTITAKSHK
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pF1KSD QGGDFNLYENMRCHGVPLVTISRGRVVYENGVFMCAEGTGKFCPLRSFPDTVYKKLVQRE
.. ..:..:.:.::: :::.::.:..:.:.: . .: :.: : ..::. .:... :.
NP_001 SAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNINVNKGMGRFIPRKAFPEHLYQRVKIRN
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pF1KSD KTLKVRGVDRTPYLGDVAVVVHPGKKEMGTPLADTPTRPVTRHGG--MRDLHESSFSLSG
:.. ..::.: : : : : :. ...:: .. . : ..: .:.::.:.:::::
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pF1KSD SQIDDHVPKRASARILAPPGGRSSGIW
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NP_001 AQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
540 550 560
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Smith-Waterman score: 1973; 51.0% identity (81.1% similar) in 557 aa overlap (7-561:12-565)
10 20 30 40 50
pF1KSD MLANSASVRILIKGGKVVNDDCTHEADVYIENGIIQQVGRELMIPGGAKVIDATG
: :.:::::...::: . ::::.:.:.:.:.:..:..:::.:.:.:.:
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pF1KSD KLVIPGGIDTSTHFHQTFMNATCVDDFYHGTKAALVGGTTMIIGHVLPDKETSLVDAYEK
..:::::::..:.... .. : .:::..::.::::::::::: ::.:. .::. ..::
NP_001 RMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSFEK
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pF1KSD CRGLADPKVCCDYALHVGITWWAPKVKAEMETLVREKGVNSFQMFMTYKDLYMLRDSELY
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NP_001 WHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKGVNSFQVYMAYKDVYQMSDSQLY
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pF1KSD QVLHACKDIGAIARVHAENGELVAEGAKEALDLGITGPEGIEISRPEELEAEATHRVITI
... : .::. ::::::.:.:. :. :..::::::: .::::::::::. :.:::
NP_001 EAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGPEGHALSRPEELEAEAVFRAITI
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pF1KSD ANRTHCPIYLVNVSSISAGDVIAAAKMQGKVVLAETTTAHATLTGLHYYHQDWSHAAAYV
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NP_001 AGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIAASLGTDGTHYWSKNWAKAAAFV
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pF1KSD TVPPLRLDTNTSTYLMSLLANDTLNIVASDHRPFTTKQKAMGKEDFTKIPHGVSGVQDRM
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NP_001 TSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQKAVGKDNFTLIPEGVNGIEERM
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pF1KSD SVIWERGVVGGKMDENRFVAVTSSNAAKLLNLYPRKGRIIPGADADVVVWDPEATKTISA
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NP_001 TVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADVVIWDPDKLKTITA
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pF1KSD STQVQGGDFNLYENMRCHGVPLVTISRGRVVYENGVFMCAEGTGKFCPLRSFPDTVYKKL
... .. ..:..:.:.::: :::.::.:..:.:.: . .: :.: : ..::. .:...
NP_001 KSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNINVNKGMGRFIPRKAFPEHLYQRV
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pF1KSD VQREKTLKVRGVDRTPYLGDVAVVVHPGKKEMGTPLADTPTRPVTRHGG--MRDLHESSF
:.:.. ..::.: : : : : :. ...:: .. . : ..: .:.::.:.:
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NP_001 SLSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
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>>NP_001304 (OMIM: 602462) dihydropyrimidinase-related p (572 aa)
initn: 1925 init1: 1773 opt: 1973 Z-score: 2339.4 bits: 442.7 E(85289): 1.5e-123
Smith-Waterman score: 1973; 51.0% identity (81.1% similar) in 557 aa overlap (7-561:14-567)
10 20 30 40 50
pF1KSD MLANSASVRILIKGGKVVNDDCTHEADVYIENGIIQQVGRELMIPGGAKVIDA
: :.:::::...::: . ::::.:.:.:.:.:..:..:::.:.:.:
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10 20 30 40 50 60
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pF1KSD TGKLVIPGGIDTSTHFHQTFMNATCVDDFYHGTKAALVGGTTMIIGHVLPDKETSLVDAY
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NP_001 NGRMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSF
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pF1KSD EKCRGLADPKVCCDYALHVGITWWAPKVKAEMETLVREKGVNSFQMFMTYKDLYMLRDSE
:: . :: : ::::.::: :: : :. :.:.::..:::::::..:.:::.:.. ::.
NP_001 EKWHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKGVNSFQVYMAYKDVYQMSDSQ
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180 190 200 210 220 230
pF1KSD LYQVLHACKDIGAIARVHAENGELVAEGAKEALDLGITGPEGIEISRPEELEAEATHRVI
::... : .::. ::::::.:.:. :. :..::::::: .::::::::::. :.:
NP_001 LYEAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGPEGHALSRPEELEAEAVFRAI
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pF1KSD TIANRTHCPIYLVNVSSISAGDVIAAAKMQGKVVLAETTTAHATLTGLHYYHQDWSHAAA
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NP_001 TIAGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIAASLGTDGTHYWSKNWAKAAA
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pF1KSD YVTVPPLRLDTNTSTYLMSLLANDTLNIVASDHRPFTTKQKAMGKEDFTKIPHGVSGVQD
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NP_001 FVTSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQKAVGKDNFTLIPEGVNGIEE
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pF1KSD RMSVIWERGVVGGKMDENRFVAVTSSNAAKLLNLYPRKGRIIPGADADVVVWDPEATKTI
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NP_001 RMTVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADVVIWDPDKLKTI
370 380 390 400 410 420
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pF1KSD SASTQVQGGDFNLYENMRCHGVPLVTISRGRVVYENGVFMCAEGTGKFCPLRSFPDTVYK
.:... .. ..:..:.:.::: :::.::.:..:.:.: . .: :.: : ..::. .:.
NP_001 TAKSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNINVNKGMGRFIPRKAFPEHLYQ
430 440 450 460 470 480
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pF1KSD KLVQREKTLKVRGVDRTPYLGDVAVVVHPGKKEMGTPLADTPTRPVTRHGG--MRDLHES
.. :.:.. ..::.: : : : : :. ...:: .. . : ..: .:.::.:
NP_001 RVKIRNKVFGLQGVSRGMYDGPVYEV--PATPKYATPAPSAKSSP-SKHQPPPIRNLHQS
490 500 510 520 530
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pF1KSD SFSLSGSQIDDHVPKRASARILAPPGGRSSGIW
.:::::.::::. :.:.. ::.:::::::.
NP_001 NFSLSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
540 550 560 570
>>NP_001184222 (OMIM: 602463) dihydropyrimidinase-relate (677 aa)
initn: 1961 init1: 1769 opt: 1973 Z-score: 2338.4 bits: 442.8 E(85289): 1.6e-123
Smith-Waterman score: 1973; 52.0% identity (81.1% similar) in 560 aa overlap (4-561:116-672)
10 20 30
pF1KSD MLANSASVRILIKGGKVVNDDCTHEADVYIENG
:. : :.::::::.:::: . ::.:.:.:
NP_001 GRRAGGEPSVESGRKVEIRRASGKEALQNINDQSDRLLIKGGKIVNDDQSFYADIYMEDG
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pF1KSD IIQQVGRELMIPGGAKVIDATGKLVIPGGIDTSTHFHQTFMNATCVDDFYHGTKAALVGG
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NP_001 LIKQIGENLIVPGGVKTIEAHSRMVIPGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQGTKAALAGG
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pF1KSD TTMIIGHVLPDKETSLVDAYEKCRGLADPKVCCDYALHVGITWWAPKVKAEMETLVREKG
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NP_001 TTMIIDHVVPEPGTSLLAAFDQWREWADSKSCCDYSLHVDISEWHKGIQEEMEALVKDHG
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pF1KSD VNSFQMFMTYKDLYMLRDSELYQVLHACKDIGAIARVHAENGELVAEGAKEALDLGITGP
:::: ..:..:: ..: : ..:.:: . .::::::.::::::...:: .. ::::::::
NP_001 VNSFLVYMAFKDRFQLTDCQIYEVLSVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLGITGP
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220 230 240 250 260 270
pF1KSD EGIEISRPEELEAEATHRVITIANRTHCPIYLVNVSSISAGDVIAAAKMQGKVVLAETTT
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NP_001 EGHVLSRPEEVEAEAVNRAITIANQTNCPLYITKVMSKSSAEVIAQARKKGTVVYGEPIT
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pF1KSD AHATLTGLHYYHQDWSHAAAYVTVPPLRLDTNTSTYLMSLLANDTLNIVASDHRPFTTKQ
: : ::. ..:..:::.:: ::: : .: .: :::. :....: : :.: :
NP_001 ASLGTDGSHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSAHCTFNTAQ
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pF1KSD KAMGKEDFTKIPHGVSGVQDRMSVIWERGVVGGKMDENRFVAVTSSNAAKLLNLYPRKGR
::.::..:: ::.:..:...::::::...:: ::::::.::::::.::::..::::::::
NP_001 KAVGKDNFTLIPEGTNGTEERMSVIWDKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKVFNLYPRKGR
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pF1KSD IIPGADADVVVWDPEATKTISASTQVQGGDFNLYENMRCHGVPLVTISRGRVVYENGVFM
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NP_001 IAVGSDADLVIWDPDSVKTISAKTHNSSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKIVLEDGTLH
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460 470 480 490 500 510
pF1KSD CAEGTGKFCPLRSFPDTVYKKLVQREKTLKVRGVDRTPYLGDVA-VVVHPGKKEMGTPLA
.::.:.. : . ::: :::.. : . ..::: : : : : : : : . :: .
NP_001 VTEGSGRYIPRKPFPDFVYKRIKARSRLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTP---KTVTPAS
570 580 590 600 610 620
520 530 540 550 560
pF1KSD DTPTRPVTRHGG-MRDLHESSFSLSGSQIDDHVPKRASARILAPPGGRSSGIW
.. : :. ... .:.::.:.:::::.::::..:.:.. ::.::::::..
NP_001 SAKTSPAKQQAPPVRNLHQSGFSLSGAQIDDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG
630 640 650 660 670
>>NP_001377 (OMIM: 602463) dihydropyrimidinase-related p (572 aa)
initn: 1951 init1: 1769 opt: 1967 Z-score: 2332.3 bits: 441.4 E(85289): 3.6e-123
Smith-Waterman score: 1967; 52.1% identity (81.1% similar) in 557 aa overlap (7-561:14-567)
10 20 30 40 50
pF1KSD MLANSASVRILIKGGKVVNDDCTHEADVYIENGIIQQVGRELMIPGGAKVIDA
: :.::::::.:::: . ::.:.:.:.:.:.:..:..:::.:.:.:
NP_001 MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGKIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEA
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD TGKLVIPGGIDTSTHFHQTFMNATCVDDFYHGTKAALVGGTTMIIGHVLPDKETSLVDAY
...:::::::. :.:.. .. : .:::..::::::.::::::: ::.:. :::. :.
NP_001 HSRMVIPGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAF
70 80 90 100 110 120
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pF1KSD EKCRGLADPKVCCDYALHVGITWWAPKVKAEMETLVREKGVNSFQMFMTYKDLYMLRDSE
.. : :: : ::::.::: :. : .. :::.::...::::: ..:..:: ..: : .
NP_001 DQWREWADSKSCCDYSLHVDISEWHKGIQEEMEALVKDHGVNSFLVYMAFKDRFQLTDCQ
130 140 150 160 170 180
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pF1KSD LYQVLHACKDIGAIARVHAENGELVAEGAKEALDLGITGPEGIEISRPEELEAEATHRVI
.:.:: . .::::::.::::::...:: .. :::::::::: .:::::.::::..:.:
NP_001 IYEVLSVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLGITGPEGHVLSRPEEVEAEAVNRAI
190 200 210 220 230 240
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pF1KSD TIANRTHCPIYLVNVSSISAGDVIAAAKMQGKVVLAETTTAHATLTGLHYYHQDWSHAAA
::::.:.::.:...: : :...::: :. .: :: .: :: : ::. ..:..:::
NP_001 TIANQTNCPLYITKVMSKSSAEVIAQARKKGTVVYGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAA
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