Result of FASTA (ccds) for pF1KSDB0027
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDB0027, 979 aa
  1>>>pF1KSDB0027 979 - 979 aa - 979 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0929+/-0.000943; mu= 15.8931+/- 0.057
 mean_var=165.8269+/-32.565, 0's: 0 Z-trim(111.2): 22  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.099597
 statistics sampled from 12217 (12229) to 12217 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.706), E-opt: 0.2 (0.376), width:  16
 Scan time:  3.840

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS45992.1 TNPO2 gene_id:30000|Hs108|chr19        ( 887) 6007 875.9       0
CCDS43329.1 TNPO1 gene_id:3842|Hs108|chr5          ( 898) 5242 766.0       0
CCDS4016.1 TNPO1 gene_id:3842|Hs108|chr5           ( 890) 5240 765.7       0
CCDS45991.1 TNPO2 gene_id:30000|Hs108|chr19        ( 897) 5162 754.5 2.1e-217


>>CCDS45992.1 TNPO2 gene_id:30000|Hs108|chr19             (887 aa)
 initn: 6007 init1: 6007 opt: 6007  Z-score: 4672.7  bits: 875.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6007; 100.0% identity (100.0% similar) in 887 aa overlap (93-979:1-887)

             70        80        90       100       110       120  
pF1KSD AASGAPPGSHTEPQRPSADPGPYLRSLPCAMDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPNTATQRI
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45                               MDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPNTATQRI
                                             10        20        30

            130       140       150       160       170       180  
pF1KSD VQDKLKQLNQFPDFNNYLIFVLTRLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHYQSFPPPVADFIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VQDKLKQLNQFPDFNNYLIFVLTRLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHYQSFPPPVADFIK
               40        50        60        70        80        90

            190       200       210       220       230       240  
pF1KSD QECLNNIGDASSLIRATIGILITTIASKGELQMWPELLPQLCNLLNSEDYNTCEGAFGAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QECLNNIGDASSLIRATIGILITTIASKGELQMWPELLPQLCNLLNSEDYNTCEGAFGAL
              100       110       120       130       140       150

            250       260       270       280       290       300  
pF1KSD QKICEDSSELLDSDALNRPLNIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIACVNQFIMDRAQALMDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QKICEDSSELLDSDALNRPLNIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIACVNQFIMDRAQALMDN
              160       170       180       190       200       210

            310       320       330       340       350       360  
pF1KSD IDTFIEHLFALAVDDDPEVRKNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQRTQDHDENV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IDTFIEHLFALAVDDDPEVRKNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQRTQDHDENV
              220       230       240       250       260       270

            370       380       390       400       410       420  
pF1KSD ALEACEFWLTLAEQPICKEVLASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLKGDVEEDEAVPDSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ALEACEFWLTLAEQPICKEVLASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLKGDVEEDEAVPDSE
              280       290       300       310       320       330

            430       440       450       460       470       480  
pF1KSD QDIKPRFHKSRTVTLPHEAERPDGSEDAEDDDDDDALSDWNLRKCSAAALDVLANVFREE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QDIKPRFHKSRTVTLPHEAERPDGSEDAEDDDDDDALSDWNLRKCSAAALDVLANVFREE
              340       350       360       370       380       390

            490       500       510       520       530       540  
pF1KSD LLPHLLPLLKGLLFHPEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMVPYLPELIPHLIQCLSDKKAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LLPHLLPLLKGLLFHPEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMVPYLPELIPHLIQCLSDKKAL
              400       410       420       430       440       450

            550       560       570       580       590       600  
pF1KSD VRSIACWTLSRYAHWVVSQPPDMHLKPLMTELLKRILDGNKRVQEAACSAFATLEEEACT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VRSIACWTLSRYAHWVVSQPPDMHLKPLMTELLKRILDGNKRVQEAACSAFATLEEEACT
              460       470       480       490       500       510

            610       620       630       640       650       660  
pF1KSD ELVPYLSYILDTLVFAFGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQKLMPPLIQKW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ELVPYLSYILDTLVFAFGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQKLMPPLIQKW
              520       530       540       550       560       570

            670       680       690       700       710       720  
pF1KSD NELKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVTLVQKTLAQAMMYTQHPEQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NELKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVTLVQKTLAQAMMYTQHPEQY
              580       590       600       610       620       630

            730       740       750       760       770       780  
pF1KSD EAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGHVEQLVARSNIMTLLFQCMQDSMPEVRQSSFALLGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGHVEQLVARSNIMTLLFQCMQDSMPEVRQSSFALLGD
              640       650       660       670       680       690

            790       800       810       820       830       840  
pF1KSD LTKACFIHVKPCIAEFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEICMQMGAEMQPYVQMVLNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LTKACFIHVKPCIAEFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEICMQMGAEMQPYVQMVLNN
              700       710       720       730       740       750

            850       860       870       880       890       900  
pF1KSD LVEIINRPNTPKTLLENTAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LVEIINRPNTPKTLLENTAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSA
              760       770       780       790       800       810

            910       920       930       940       950       960  
pF1KSD FRGICMMIGVNPGGVVQDFIFFCDAVASWVSPKDDLRDMFYKILHGFKDQVGEDNWQQFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FRGICMMIGVNPGGVVQDFIFFCDAVASWVSPKDDLRDMFYKILHGFKDQVGEDNWQQFS
              820       830       840       850       860       870

            970         
pF1KSD EQFPPLLKERLAAFYGV
       :::::::::::::::::
CCDS45 EQFPPLLKERLAAFYGV
              880       

>>CCDS43329.1 TNPO1 gene_id:3842|Hs108|chr5               (898 aa)
 initn: 3274 init1: 3274 opt: 5242  Z-score: 4078.5  bits: 766.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5242; 84.9% identity (95.3% similar) in 897 aa overlap (87-979:5-898)

         60        70        80        90       100       110      
pF1KSD RRHAATAASGAPPGSHTEPQRPSADPGPYLRSLPCAMDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPN
                                     :.    ..:.::::::::.:::::.::::.
CCDS43                           MVWDRQTKMEYEWKPDEQGLQQILQLLKESQSPD
                                         10        20        30    

        120       130       140       150       160       170      
pF1KSD TATQRIVQDKLKQLNQFPDFNNYLIFVLTRLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHYQSFPPP
       :. :: ::.::.::::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:.::  
CCDS43 TTIQRTVQQKLEQLNQYPDFNNYLIFVLTKLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHFQNFPNG
           40        50        60        70        80        90    

        180       190       200       210       220       230      
pF1KSD VADFIKQECLNNIGDASSLIRATIGILITTIASKGELQMWPELLPQLCNLLNSEDYNTCE
       :.::::.::::::::.: :::::.:::::::::::::: ::.:::.::.::.::::::::
CCDS43 VTDFIKSECLNNIGDSSPLIRATVGILITTIASKGELQNWPDLLPKLCSLLDSEDYNTCE
          100       110       120       130       140       150    

        240       250       260       270       280       290      
pF1KSD GAFGALQKICEDSSELLDSDALNRPLNIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIACVNQFIMDRA
       :::::::::::::.:.::::.:.:::::::::::::::: ::::::::.:::::::..:.
CCDS43 GAFGALQKICEDSAEILDSDVLDRPLNIMIPKFLQFFKHSSPKIRSHAVACVNQFIISRT
          160       170       180       190       200       210    

        300       310       320       330       340       350      
pF1KSD QALMDNIDTFIEHLFALAVDDDPEVRKNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQRTQ
       :::: .::.:::.::::: :..::::::::::::::::::.:::.::::.:..:::::::
CCDS43 QALMLHIDSFIENLFALAGDEEPEVRKNVCRALVMLLEVRMDRLLPHMHNIVEYMLQRTQ
          220       230       240       250       260       270    

        360       370       380       390       400       410      
pF1KSD DHDENVALEACEFWLTLAEQPICKEVLASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLKGDVEEDE
       :.::::::::::::::::::::::.::. :: .:::.::::::::.::::::::::::::
CCDS43 DQDENVALEACEFWLTLAEQPICKDVLVRHLPKLIPVLVNGMKYSDIDIILLKGDVEEDE
          280       290       300       310       320       330    

        420       430       440       450           460       470  
pF1KSD AVPDSEQDIKPRFHKSRTVTLPHEAERPDGSEDAEDDDD----DDALSDWNLRKCSAAAL
       ..:::::::.::::.::::.  :.    :: :. .::::    ::..:::::::::::::
CCDS43 TIPDSEQDIRPRFHRSRTVAQQHDE---DGIEEEDDDDDEIDDDDTISDWNLRKCSAAAL
          340       350          360       370       380       390 

            480       490       500       510       520       530  
pF1KSD DVLANVFREELLPHLLPLLKGLLFHPEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMVPYLPELIPHL
       ::::::.:.:::::.::::: :::: :::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS43 DVLANVYRDELLPHILPLLKELLFHHEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMIPYLPELIPHL
             400       410       420       430       440       450 

            540       550       560       570       580       590  
pF1KSD IQCLSDKKALVRSIACWTLSRYAHWVVSQPPDMHLKPLMTELLKRILDGNKRVQEAACSA
       ::::::::::::::.::::::::::::::::: .::::::::::::::.:::::::::::
CCDS43 IQCLSDKKALVRSITCWTLSRYAHWVVSQPPDTYLKPLMTELLKRILDSNKRVQEAACSA
             460       470       480       490       500       510 

            600       610       620       630       640       650  
pF1KSD FATLEEEACTELVPYLSYILDTLVFAFGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQ
       ::::::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS43 FATLEEEACTELVPYLAYILDTLVFAFSKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNKPEYIQ
             520       530       540       550       560       570 

            660       670       680       690       700       710  
pF1KSD KLMPPLIQKWNELKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVTLVQKTLAQA
        :::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS43 MLMPPLIQKWNMLKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVNLVQKTLAQA
             580       590       600       610       620       630 

            720       730       740       750       760       770  
pF1KSD MMYTQHPEQYEAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGHVEQLVARSNIMTLLFQCMQDSMPEV
       :. . .:.::::::::::::::::::::::::::..:::::::::.::..:::::.::::
CCDS43 MLNNAQPDQYEAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGNIEQLVARSNILTLMYQCMQDKMPEV
             640       650       660       670       680       690 

            780       790       800       810       820       830  
pF1KSD RQSSFALLGDLTKACFIHVKPCIAEFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEICMQMGAEM
       :::::::::::::::: :::::::.::::::::::::::::::::::::::: .::: ::
CCDS43 RQSSFALLGDLTKACFQHVKPCIADFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEISIQMGIEM
             700       710       720       730       740       750 

            840       850       860       870       880       890  
pF1KSD QPYVQMVLNNLVEIINRPNTPKTLLENTAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRN
       :::. :::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QPYIPMVLHQLVEIINRPNTPKTLLENTAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRN
             760       770       780       790       800       810 

            900       910       920       930       940       950  
pF1KSD IRDNEEKDSAFRGICMMIGVNPGGVVQDFIFFCDAVASWVSPKDDLRDMFYKILHGFKDQ
       ::::::::::::::: ::.:::.::.:::::::::::::..::::::::: :::::::.:
CCDS43 IRDNEEKDSAFRGICTMISVNPSGVIQDFIFFCDAVASWINPKDDLRDMFCKILHGFKNQ
             820       830       840       850       860       870 

            960       970         
pF1KSD VGEDNWQQFSEQFPPLLKERLAAFYGV
       ::..::..::.:::  :::::::::::
CCDS43 VGDENWRRFSDQFPLPLKERLAAFYGV
             880       890        

>>CCDS4016.1 TNPO1 gene_id:3842|Hs108|chr5                (890 aa)
 initn: 3274 init1: 3274 opt: 5240  Z-score: 4077.0  bits: 765.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5240; 85.5% identity (95.7% similar) in 890 aa overlap (94-979:4-890)

            70        80        90       100       110       120   
pF1KSD ASGAPPGSHTEPQRPSADPGPYLRSLPCAMDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPNTATQRIV
                                     .:.::::::::.:::::.::::.:. :: :
CCDS40                            MEYEWKPDEQGLQQILQLLKESQSPDTTIQRTV
                                          10        20        30   

           130       140       150       160       170       180   
pF1KSD QDKLKQLNQFPDFNNYLIFVLTRLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHYQSFPPPVADFIKQ
       :.::.::::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:.::  :.::::.
CCDS40 QQKLEQLNQYPDFNNYLIFVLTKLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHFQNFPNGVTDFIKS
            40        50        60        70        80        90   

           190       200       210       220       230       240   
pF1KSD ECLNNIGDASSLIRATIGILITTIASKGELQMWPELLPQLCNLLNSEDYNTCEGAFGALQ
       ::::::::.: :::::.:::::::::::::: ::.:::.::.::.:::::::::::::::
CCDS40 ECLNNIGDSSPLIRATVGILITTIASKGELQNWPDLLPKLCSLLDSEDYNTCEGAFGALQ
           100       110       120       130       140       150   

           250       260       270       280       290       300   
pF1KSD KICEDSSELLDSDALNRPLNIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIACVNQFIMDRAQALMDNI
       ::::::.:.::::.:.:::::::::::::::: ::::::::.:::::::..:.:::: .:
CCDS40 KICEDSAEILDSDVLDRPLNIMIPKFLQFFKHSSPKIRSHAVACVNQFIISRTQALMLHI
           160       170       180       190       200       210   

           310       320       330       340       350       360   
pF1KSD DTFIEHLFALAVDDDPEVRKNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQRTQDHDENVA
       :.:::.::::: :..::::::::::::::::::.:::.::::.:..::::::::.:::::
CCDS40 DSFIENLFALAGDEEPEVRKNVCRALVMLLEVRMDRLLPHMHNIVEYMLQRTQDQDENVA
           220       230       240       250       260       270   

           370       380       390       400       410       420   
pF1KSD LEACEFWLTLAEQPICKEVLASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLKGDVEEDEAVPDSEQ
       :::::::::::::::::.::. :: .:::.::::::::.::::::::::::::..:::::
CCDS40 LEACEFWLTLAEQPICKDVLVRHLPKLIPVLVNGMKYSDIDIILLKGDVEEDETIPDSEQ
           280       290       300       310       320       330   

           430       440       450           460       470         
pF1KSD DIKPRFHKSRTVTLPHEAERPDGSEDAEDDDD----DDALSDWNLRKCSAAALDVLANVF
       ::.::::.::::.  :.    :: :. .::::    ::..:::::::::::::::::::.
CCDS40 DIRPRFHRSRTVAQQHDE---DGIEEEDDDDDEIDDDDTISDWNLRKCSAAALDVLANVY
           340       350          360       370       380       390

     480       490       500       510       520       530         
pF1KSD REELLPHLLPLLKGLLFHPEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMVPYLPELIPHLIQCLSDK
       :.:::::.::::: :::: :::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS40 RDELLPHILPLLKELLFHHEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMIPYLPELIPHLIQCLSDK
              400       410       420       430       440       450

     540       550       560       570       580       590         
pF1KSD KALVRSIACWTLSRYAHWVVSQPPDMHLKPLMTELLKRILDGNKRVQEAACSAFATLEEE
       :::::::.::::::::::::::::: .::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS40 KALVRSITCWTLSRYAHWVVSQPPDTYLKPLMTELLKRILDSNKRVQEAACSAFATLEEE
              460       470       480       490       500       510

     600       610       620       630       640       650         
pF1KSD ACTELVPYLSYILDTLVFAFGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQKLMPPLI
       :::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::: ::::::
CCDS40 ACTELVPYLAYILDTLVFAFSKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNKPEYIQMLMPPLI
              520       530       540       550       560       570

     660       670       680       690       700       710         
pF1KSD QKWNELKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVTLVQKTLAQAMMYTQHP
       :::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::. . .:
CCDS40 QKWNMLKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVNLVQKTLAQAMLNNAQP
              580       590       600       610       620       630

     720       730       740       750       760       770         
pF1KSD EQYEAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGHVEQLVARSNIMTLLFQCMQDSMPEVRQSSFAL
       .::::::::::::::::::::::::::..:::::::::.::..:::::.:::::::::::
CCDS40 DQYEAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGNIEQLVARSNILTLMYQCMQDKMPEVRQSSFAL
              640       650       660       670       680       690

     780       790       800       810       820       830         
pF1KSD LGDLTKACFIHVKPCIAEFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEICMQMGAEMQPYVQMV
       ::::::::: :::::::.::::::::::::::::::::::::::: .::: :::::. ::
CCDS40 LGDLTKACFQHVKPCIADFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEISIQMGIEMQPYIPMV
              700       710       720       730       740       750

     840       850       860       870       880       890         
pF1KSD LNNLVEIINRPNTPKTLLENTAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEK
       :..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 LHQLVEIINRPNTPKTLLENTAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEK
              760       770       780       790       800       810

     900       910       920       930       940       950         
pF1KSD DSAFRGICMMIGVNPGGVVQDFIFFCDAVASWVSPKDDLRDMFYKILHGFKDQVGEDNWQ
       :::::::: ::.:::.::.:::::::::::::..::::::::: :::::::.:::..::.
CCDS40 DSAFRGICTMISVNPSGVIQDFIFFCDAVASWINPKDDLRDMFCKILHGFKNQVGDENWR
              820       830       840       850       860       870

     960       970         
pF1KSD QFSEQFPPLLKERLAAFYGV
       .::.:::  :::::::::::
CCDS40 RFSDQFPLPLKERLAAFYGV
              880       890

>>CCDS45991.1 TNPO2 gene_id:30000|Hs108|chr19             (897 aa)
 initn: 5993 init1: 5160 opt: 5162  Z-score: 4016.4  bits: 754.5 E(32554): 2.1e-217
Smith-Waterman score: 5977; 98.9% identity (98.9% similar) in 897 aa overlap (93-979:1-897)

             70        80        90       100       110       120  
pF1KSD AASGAPPGSHTEPQRPSADPGPYLRSLPCAMDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPNTATQRI
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45                               MDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPNTATQRI
                                             10        20        30

            130       140       150       160       170       180  
pF1KSD VQDKLKQLNQFPDFNNYLIFVLTRLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHYQSFPPPVADFIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VQDKLKQLNQFPDFNNYLIFVLTRLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHYQSFPPPVADFIK
               40        50        60        70        80        90

            190       200       210       220       230       240  
pF1KSD QECLNNIGDASSLIRATIGILITTIASKGELQMWPELLPQLCNLLNSEDYNTCEGAFGAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QECLNNIGDASSLIRATIGILITTIASKGELQMWPELLPQLCNLLNSEDYNTCEGAFGAL
              100       110       120       130       140       150

            250       260       270       280       290       300  
pF1KSD QKICEDSSELLDSDALNRPLNIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIACVNQFIMDRAQALMDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QKICEDSSELLDSDALNRPLNIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIACVNQFIMDRAQALMDN
              160       170       180       190       200       210

            310       320       330       340       350       360  
pF1KSD IDTFIEHLFALAVDDDPEVRKNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQRTQDHDENV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IDTFIEHLFALAVDDDPEVRKNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQRTQDHDENV
              220       230       240       250       260       270

            370       380       390       400       410       420  
pF1KSD ALEACEFWLTLAEQPICKEVLASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLKGDVEEDEAVPDSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ALEACEFWLTLAEQPICKEVLASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLKGDVEEDEAVPDSE
              280       290       300       310       320       330

            430       440       450       460       470       480  
pF1KSD QDIKPRFHKSRTVTLPHEAERPDGSEDAEDDDDDDALSDWNLRKCSAAALDVLANVFREE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QDIKPRFHKSRTVTLPHEAERPDGSEDAEDDDDDDALSDWNLRKCSAAALDVLANVFREE
              340       350       360       370       380       390

            490       500       510       520       530       540  
pF1KSD LLPHLLPLLKGLLFHPEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMVPYLPELIPHLIQCLSDKKAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LLPHLLPLLKGLLFHPEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMVPYLPELIPHLIQCLSDKKAL
              400       410       420       430       440       450

            550       560       570       580       590       600  
pF1KSD VRSIACWTLSRYAHWVVSQPPDMHLKPLMTELLKRILDGNKRVQEAACSAFATLEEEACT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VRSIACWTLSRYAHWVVSQPPDMHLKPLMTELLKRILDGNKRVQEAACSAFATLEEEACT
              460       470       480       490       500       510

            610       620       630       640       650       660  
pF1KSD ELVPYLSYILDTLVFAFGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQKLMPPLIQKW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ELVPYLSYILDTLVFAFGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQKLMPPLIQKW
              520       530       540       550       560       570

            670       680       690       700       710       720  
pF1KSD NELKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVTLVQKTLAQAMMYTQHPEQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NELKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVTLVQKTLAQAMMYTQHPEQY
              580       590       600       610       620       630

            730       740       750       760       770       780  
pF1KSD EAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGHVEQLVARSNIMTLLFQCMQDSMPEVRQSSFALLGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGHVEQLVARSNIMTLLFQCMQDSMPEVRQSSFALLGD
              640       650       660       670       680       690

            790       800       810       820       830       840  
pF1KSD LTKACFIHVKPCIAEFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEICMQMGAEMQPYVQMVLNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LTKACFIHVKPCIAEFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEICMQMGAEMQPYVQMVLNN
              700       710       720       730       740       750

            850       860                 870       880       890  
pF1KSD LVEIINRPNTPKTLLENT----------AITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRN
       ::::::::::::::::::          ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LVEIINRPNTPKTLLENTGRLTSPSAIPAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRN
              760       770       780       790       800       810

            900       910       920       930       940       950  
pF1KSD IRDNEEKDSAFRGICMMIGVNPGGVVQDFIFFCDAVASWVSPKDDLRDMFYKILHGFKDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IRDNEEKDSAFRGICMMIGVNPGGVVQDFIFFCDAVASWVSPKDDLRDMFYKILHGFKDQ
              820       830       840       850       860       870

            960       970         
pF1KSD VGEDNWQQFSEQFPPLLKERLAAFYGV
       :::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VGEDNWQQFSEQFPPLLKERLAAFYGV
              880       890       




979 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 08:09:14 2016 done: Thu Nov  3 08:09:15 2016
 Total Scan time:  3.840 Total Display time:  0.150

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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