FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDB0027, 979 aa 1>>>pF1KSDB0027 979 - 979 aa - 979 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0929+/-0.000943; mu= 15.8931+/- 0.057 mean_var=165.8269+/-32.565, 0's: 0 Z-trim(111.2): 22 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.099597 statistics sampled from 12217 (12229) to 12217 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.706), E-opt: 0.2 (0.376), width: 16 Scan time: 3.840 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS45992.1 TNPO2 gene_id:30000|Hs108|chr19 ( 887) 6007 875.9 0 CCDS43329.1 TNPO1 gene_id:3842|Hs108|chr5 ( 898) 5242 766.0 0 CCDS4016.1 TNPO1 gene_id:3842|Hs108|chr5 ( 890) 5240 765.7 0 CCDS45991.1 TNPO2 gene_id:30000|Hs108|chr19 ( 897) 5162 754.5 2.1e-217 >>CCDS45992.1 TNPO2 gene_id:30000|Hs108|chr19 (887 aa) initn: 6007 init1: 6007 opt: 6007 Z-score: 4672.7 bits: 875.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6007; 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