Result of FASTA (omim) for
pF1KSDB0027
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0027, 979 aa
1>>>pF1KSDB0027 979 - 979 aa - 979 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4192+/-0.000393; mu= 14.2139+/- 0.025
mean_var=183.8266+/-37.689, 0's: 0 Z-trim(118.8): 23 B-trim: 1360 in 1/57
Lambda= 0.094595
statistics sampled from 32156 (32179) to 32156 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.704), E-opt: 0.2 (0.377), width: 16
Scan time: 14.270
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001129667 (OMIM: 603002) transportin-2 isoform ( 887) 6007 832.9 0
NP_038461 (OMIM: 603002) transportin-2 isoform 2 [ ( 887) 6007 832.9 0
NP_002261 (OMIM: 602901) transportin-1 isoform 1 [ ( 898) 5242 728.5 3.6e-209
XP_005248557 (OMIM: 602901) PREDICTED: transportin ( 890) 5240 728.3 4.4e-209
NP_694858 (OMIM: 602901) transportin-1 isoform 2 [ ( 890) 5240 728.3 4.4e-209
NP_001129668 (OMIM: 603002) transportin-2 isoform ( 897) 5162 717.6 7e-206
XP_005248558 (OMIM: 602901) PREDICTED: transportin ( 866) 4315 602.0 4.3e-171
XP_016864947 (OMIM: 602901) PREDICTED: transportin ( 858) 4313 601.7 5.1e-171
NP_001263382 (OMIM: 602738) importin subunit beta- ( 731) 292 52.9 7.2e-06
NP_002256 (OMIM: 602738) importin subunit beta-1 i ( 876) 292 53.0 8.1e-06
XP_016876051 (OMIM: 602008) PREDICTED: importin-5 (1115) 239 45.9 0.0014
XP_005254109 (OMIM: 602008) PREDICTED: importin-5 (1115) 239 45.9 0.0014
XP_011519392 (OMIM: 602008) PREDICTED: importin-5 (1115) 239 45.9 0.0014
XP_011519391 (OMIM: 602008) PREDICTED: importin-5 (1115) 239 45.9 0.0014
XP_011519389 (OMIM: 602008) PREDICTED: importin-5 (1115) 239 45.9 0.0014
NP_002262 (OMIM: 602008) importin-5 [Homo sapiens] (1115) 239 45.9 0.0014
XP_005254110 (OMIM: 602008) PREDICTED: importin-5 (1115) 239 45.9 0.0014
XP_011519390 (OMIM: 602008) PREDICTED: importin-5 (1115) 239 45.9 0.0014
>>NP_001129667 (OMIM: 603002) transportin-2 isoform 2 [H (887 aa)
initn: 6007 init1: 6007 opt: 6007 Z-score: 4440.5 bits: 832.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6007; 100.0% identity (100.0% similar) in 887 aa overlap (93-979:1-887)
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AASGAPPGSHTEPQRPSADPGPYLRSLPCAMDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPNTATQRI
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPNTATQRI
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VQDKLKQLNQFPDFNNYLIFVLTRLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHYQSFPPPVADFIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VQDKLKQLNQFPDFNNYLIFVLTRLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHYQSFPPPVADFIK
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QECLNNIGDASSLIRATIGILITTIASKGELQMWPELLPQLCNLLNSEDYNTCEGAFGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QECLNNIGDASSLIRATIGILITTIASKGELQMWPELLPQLCNLLNSEDYNTCEGAFGAL
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QKICEDSSELLDSDALNRPLNIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIACVNQFIMDRAQALMDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QKICEDSSELLDSDALNRPLNIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIACVNQFIMDRAQALMDN
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IDTFIEHLFALAVDDDPEVRKNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQRTQDHDENV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IDTFIEHLFALAVDDDPEVRKNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQRTQDHDENV
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ALEACEFWLTLAEQPICKEVLASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLKGDVEEDEAVPDSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALEACEFWLTLAEQPICKEVLASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLKGDVEEDEAVPDSE
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KSD QDIKPRFHKSRTVTLPHEAERPDGSEDAEDDDDDDALSDWNLRKCSAAALDVLANVFREE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDIKPRFHKSRTVTLPHEAERPDGSEDAEDDDDDDALSDWNLRKCSAAALDVLANVFREE
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LLPHLLPLLKGLLFHPEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMVPYLPELIPHLIQCLSDKKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLPHLLPLLKGLLFHPEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMVPYLPELIPHLIQCLSDKKAL
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VRSIACWTLSRYAHWVVSQPPDMHLKPLMTELLKRILDGNKRVQEAACSAFATLEEEACT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VRSIACWTLSRYAHWVVSQPPDMHLKPLMTELLKRILDGNKRVQEAACSAFATLEEEACT
460 470 480 490 500 510
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ELVPYLSYILDTLVFAFGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQKLMPPLIQKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELVPYLSYILDTLVFAFGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQKLMPPLIQKW
520 530 540 550 560 570
670 680 690 700 710 720
pF1KSD NELKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVTLVQKTLAQAMMYTQHPEQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NELKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVTLVQKTLAQAMMYTQHPEQY
580 590 600 610 620 630
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGHVEQLVARSNIMTLLFQCMQDSMPEVRQSSFALLGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGHVEQLVARSNIMTLLFQCMQDSMPEVRQSSFALLGD
640 650 660 670 680 690
790 800 810 820 830 840
pF1KSD LTKACFIHVKPCIAEFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEICMQMGAEMQPYVQMVLNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTKACFIHVKPCIAEFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEICMQMGAEMQPYVQMVLNN
700 710 720 730 740 750
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LVEIINRPNTPKTLLENTAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVEIINRPNTPKTLLENTAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSA
760 770 780 790 800 810
910 920 930 940 950 960
pF1KSD FRGICMMIGVNPGGVVQDFIFFCDAVASWVSPKDDLRDMFYKILHGFKDQVGEDNWQQFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FRGICMMIGVNPGGVVQDFIFFCDAVASWVSPKDDLRDMFYKILHGFKDQVGEDNWQQFS
820 830 840 850 860 870
970
pF1KSD EQFPPLLKERLAAFYGV
:::::::::::::::::
NP_001 EQFPPLLKERLAAFYGV
880
>>NP_038461 (OMIM: 603002) transportin-2 isoform 2 [Homo (887 aa)
initn: 6007 init1: 6007 opt: 6007 Z-score: 4440.5 bits: 832.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6007; 100.0% identity (100.0% similar) in 887 aa overlap (93-979:1-887)
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AASGAPPGSHTEPQRPSADPGPYLRSLPCAMDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPNTATQRI
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 MDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPNTATQRI
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VQDKLKQLNQFPDFNNYLIFVLTRLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHYQSFPPPVADFIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 VQDKLKQLNQFPDFNNYLIFVLTRLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHYQSFPPPVADFIK
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QECLNNIGDASSLIRATIGILITTIASKGELQMWPELLPQLCNLLNSEDYNTCEGAFGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 QECLNNIGDASSLIRATIGILITTIASKGELQMWPELLPQLCNLLNSEDYNTCEGAFGAL
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QKICEDSSELLDSDALNRPLNIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIACVNQFIMDRAQALMDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 QKICEDSSELLDSDALNRPLNIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIACVNQFIMDRAQALMDN
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IDTFIEHLFALAVDDDPEVRKNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQRTQDHDENV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 IDTFIEHLFALAVDDDPEVRKNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQRTQDHDENV
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ALEACEFWLTLAEQPICKEVLASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLKGDVEEDEAVPDSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 ALEACEFWLTLAEQPICKEVLASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLKGDVEEDEAVPDSE
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KSD QDIKPRFHKSRTVTLPHEAERPDGSEDAEDDDDDDALSDWNLRKCSAAALDVLANVFREE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 QDIKPRFHKSRTVTLPHEAERPDGSEDAEDDDDDDALSDWNLRKCSAAALDVLANVFREE
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LLPHLLPLLKGLLFHPEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMVPYLPELIPHLIQCLSDKKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 LLPHLLPLLKGLLFHPEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMVPYLPELIPHLIQCLSDKKAL
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VRSIACWTLSRYAHWVVSQPPDMHLKPLMTELLKRILDGNKRVQEAACSAFATLEEEACT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 VRSIACWTLSRYAHWVVSQPPDMHLKPLMTELLKRILDGNKRVQEAACSAFATLEEEACT
460 470 480 490 500 510
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ELVPYLSYILDTLVFAFGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQKLMPPLIQKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 ELVPYLSYILDTLVFAFGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQKLMPPLIQKW
520 530 540 550 560 570
670 680 690 700 710 720
pF1KSD NELKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVTLVQKTLAQAMMYTQHPEQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 NELKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVTLVQKTLAQAMMYTQHPEQY
580 590 600 610 620 630
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGHVEQLVARSNIMTLLFQCMQDSMPEVRQSSFALLGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 EAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGHVEQLVARSNIMTLLFQCMQDSMPEVRQSSFALLGD
640 650 660 670 680 690
790 800 810 820 830 840
pF1KSD LTKACFIHVKPCIAEFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEICMQMGAEMQPYVQMVLNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 LTKACFIHVKPCIAEFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEICMQMGAEMQPYVQMVLNN
700 710 720 730 740 750
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LVEIINRPNTPKTLLENTAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 LVEIINRPNTPKTLLENTAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSA
760 770 780 790 800 810
910 920 930 940 950 960
pF1KSD FRGICMMIGVNPGGVVQDFIFFCDAVASWVSPKDDLRDMFYKILHGFKDQVGEDNWQQFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 FRGICMMIGVNPGGVVQDFIFFCDAVASWVSPKDDLRDMFYKILHGFKDQVGEDNWQQFS
820 830 840 850 860 870
970
pF1KSD EQFPPLLKERLAAFYGV
:::::::::::::::::
NP_038 EQFPPLLKERLAAFYGV
880
>>NP_002261 (OMIM: 602901) transportin-1 isoform 1 [Homo (898 aa)
initn: 3274 init1: 3274 opt: 5242 Z-score: 3876.2 bits: 728.5 E(85289): 3.6e-209
Smith-Waterman score: 5242; 84.9% identity (95.3% similar) in 897 aa overlap (87-979:5-898)
60 70 80 90 100 110
pF1KSD RRHAATAASGAPPGSHTEPQRPSADPGPYLRSLPCAMDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPN
:. ..:.::::::::.:::::.::::.
NP_002 MVWDRQTKMEYEWKPDEQGLQQILQLLKESQSPD
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KSD TATQRIVQDKLKQLNQFPDFNNYLIFVLTRLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHYQSFPPP
:. :: ::.::.::::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:.::
NP_002 TTIQRTVQQKLEQLNQYPDFNNYLIFVLTKLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHFQNFPNG
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KSD VADFIKQECLNNIGDASSLIRATIGILITTIASKGELQMWPELLPQLCNLLNSEDYNTCE
:.::::.::::::::.: :::::.:::::::::::::: ::.:::.::.::.::::::::
NP_002 VTDFIKSECLNNIGDSSPLIRATVGILITTIASKGELQNWPDLLPKLCSLLDSEDYNTCE
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KSD GAFGALQKICEDSSELLDSDALNRPLNIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIACVNQFIMDRA
:::::::::::::.:.::::.:.:::::::::::::::: ::::::::.:::::::..:.
NP_002 GAFGALQKICEDSAEILDSDVLDRPLNIMIPKFLQFFKHSSPKIRSHAVACVNQFIISRT
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QALMDNIDTFIEHLFALAVDDDPEVRKNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQRTQ
:::: .::.:::.::::: :..::::::::::::::::::.:::.::::.:..:::::::
NP_002 QALMLHIDSFIENLFALAGDEEPEVRKNVCRALVMLLEVRMDRLLPHMHNIVEYMLQRTQ
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KSD DHDENVALEACEFWLTLAEQPICKEVLASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLKGDVEEDE
:.::::::::::::::::::::::.::. :: .:::.::::::::.::::::::::::::
NP_002 DQDENVALEACEFWLTLAEQPICKDVLVRHLPKLIPVLVNGMKYSDIDIILLKGDVEEDE
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KSD AVPDSEQDIKPRFHKSRTVTLPHEAERPDGSEDAEDDDD----DDALSDWNLRKCSAAAL
..:::::::.::::.::::. :. :: :. .:::: ::..:::::::::::::
NP_002 TIPDSEQDIRPRFHRSRTVAQQHDE---DGIEEEDDDDDEIDDDDTISDWNLRKCSAAAL
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KSD DVLANVFREELLPHLLPLLKGLLFHPEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMVPYLPELIPHL
::::::.:.:::::.::::: :::: :::::::::::::::::::::::.::::::::::
NP_002 DVLANVYRDELLPHILPLLKELLFHHEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMIPYLPELIPHL
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KSD IQCLSDKKALVRSIACWTLSRYAHWVVSQPPDMHLKPLMTELLKRILDGNKRVQEAACSA
::::::::::::::.::::::::::::::::: .::::::::::::::.:::::::::::
NP_002 IQCLSDKKALVRSITCWTLSRYAHWVVSQPPDTYLKPLMTELLKRILDSNKRVQEAACSA
460 470 480 490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KSD FATLEEEACTELVPYLSYILDTLVFAFGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQ
::::::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.:::::
NP_002 FATLEEEACTELVPYLAYILDTLVFAFSKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNKPEYIQ
520 530 540 550 560 570
660 670 680 690 700 710
pF1KSD KLMPPLIQKWNELKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVTLVQKTLAQA
:::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
NP_002 MLMPPLIQKWNMLKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVNLVQKTLAQA
580 590 600 610 620 630
720 730 740 750 760 770
pF1KSD MMYTQHPEQYEAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGHVEQLVARSNIMTLLFQCMQDSMPEV
:. . .:.::::::::::::::::::::::::::..:::::::::.::..:::::.::::
NP_002 MLNNAQPDQYEAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGNIEQLVARSNILTLMYQCMQDKMPEV
640 650 660 670 680 690
780 790 800 810 820 830
pF1KSD RQSSFALLGDLTKACFIHVKPCIAEFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEICMQMGAEM
:::::::::::::::: :::::::.::::::::::::::::::::::::::: .::: ::
NP_002 RQSSFALLGDLTKACFQHVKPCIADFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEISIQMGIEM
700 710 720 730 740 750
840 850 860 870 880 890
pF1KSD QPYVQMVLNNLVEIINRPNTPKTLLENTAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRN
:::. :::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QPYIPMVLHQLVEIINRPNTPKTLLENTAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRN
760 770 780 790 800 810
900 910 920 930 940 950
pF1KSD IRDNEEKDSAFRGICMMIGVNPGGVVQDFIFFCDAVASWVSPKDDLRDMFYKILHGFKDQ
::::::::::::::: ::.:::.::.:::::::::::::..::::::::: :::::::.:
NP_002 IRDNEEKDSAFRGICTMISVNPSGVIQDFIFFCDAVASWINPKDDLRDMFCKILHGFKNQ
820 830 840 850 860 870
960 970
pF1KSD VGEDNWQQFSEQFPPLLKERLAAFYGV
::..::..::.::: :::::::::::
NP_002 VGDENWRRFSDQFPLPLKERLAAFYGV
880 890
>>XP_005248557 (OMIM: 602901) PREDICTED: transportin-1 i (890 aa)
initn: 3274 init1: 3274 opt: 5240 Z-score: 3874.8 bits: 728.3 E(85289): 4.4e-209
Smith-Waterman score: 5240; 85.5% identity (95.7% similar) in 890 aa overlap (94-979:4-890)
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ASGAPPGSHTEPQRPSADPGPYLRSLPCAMDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPNTATQRIV
.:.::::::::.:::::.::::.:. :: :
XP_005 MEYEWKPDEQGLQQILQLLKESQSPDTTIQRTV
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KSD QDKLKQLNQFPDFNNYLIFVLTRLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHYQSFPPPVADFIKQ
:.::.::::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:.:: :.::::.
XP_005 QQKLEQLNQYPDFNNYLIFVLTKLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHFQNFPNGVTDFIKS
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KSD ECLNNIGDASSLIRATIGILITTIASKGELQMWPELLPQLCNLLNSEDYNTCEGAFGALQ
::::::::.: :::::.:::::::::::::: ::.:::.::.::.:::::::::::::::
XP_005 ECLNNIGDSSPLIRATVGILITTIASKGELQNWPDLLPKLCSLLDSEDYNTCEGAFGALQ
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KICEDSSELLDSDALNRPLNIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIACVNQFIMDRAQALMDNI
::::::.:.::::.:.:::::::::::::::: ::::::::.:::::::..:.:::: .:
XP_005 KICEDSAEILDSDVLDRPLNIMIPKFLQFFKHSSPKIRSHAVACVNQFIISRTQALMLHI
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DTFIEHLFALAVDDDPEVRKNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQRTQDHDENVA
:.:::.::::: :..::::::::::::::::::.:::.::::.:..::::::::.:::::
XP_005 DSFIENLFALAGDEEPEVRKNVCRALVMLLEVRMDRLLPHMHNIVEYMLQRTQDQDENVA
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LEACEFWLTLAEQPICKEVLASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLKGDVEEDEAVPDSEQ
:::::::::::::::::.::. :: .:::.::::::::.::::::::::::::..:::::
XP_005 LEACEFWLTLAEQPICKDVLVRHLPKLIPVLVNGMKYSDIDIILLKGDVEEDETIPDSEQ
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470
pF1KSD DIKPRFHKSRTVTLPHEAERPDGSEDAEDDDD----DDALSDWNLRKCSAAALDVLANVF
::.::::.::::. :. :: :. .:::: ::..:::::::::::::::::::.
XP_005 DIRPRFHRSRTVAQQHDE---DGIEEEDDDDDEIDDDDTISDWNLRKCSAAALDVLANVY
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KSD REELLPHLLPLLKGLLFHPEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMVPYLPELIPHLIQCLSDK
:.:::::.::::: :::: :::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
XP_005 RDELLPHILPLLKELLFHHEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMIPYLPELIPHLIQCLSDK
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KSD KALVRSIACWTLSRYAHWVVSQPPDMHLKPLMTELLKRILDGNKRVQEAACSAFATLEEE
:::::::.::::::::::::::::: .::::::::::::::.::::::::::::::::::
XP_005 KALVRSITCWTLSRYAHWVVSQPPDTYLKPLMTELLKRILDSNKRVQEAACSAFATLEEE
460 470 480 490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KSD ACTELVPYLSYILDTLVFAFGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQKLMPPLI
:::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::: ::::::
XP_005 ACTELVPYLAYILDTLVFAFSKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNKPEYIQMLMPPLI
520 530 540 550 560 570
660 670 680 690 700 710
pF1KSD QKWNELKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVTLVQKTLAQAMMYTQHP
:::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::. . .:
XP_005 QKWNMLKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVNLVQKTLAQAMLNNAQP
580 590 600 610 620 630
720 730 740 750 760 770
pF1KSD EQYEAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGHVEQLVARSNIMTLLFQCMQDSMPEVRQSSFAL
.::::::::::::::::::::::::::..:::::::::.::..:::::.:::::::::::
XP_005 DQYEAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGNIEQLVARSNILTLMYQCMQDKMPEVRQSSFAL
640 650 660 670 680 690
780 790 800 810 820 830
pF1KSD LGDLTKACFIHVKPCIAEFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEICMQMGAEMQPYVQMV
::::::::: :::::::.::::::::::::::::::::::::::: .::: :::::. ::
XP_005 LGDLTKACFQHVKPCIADFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEISIQMGIEMQPYIPMV
700 710 720 730 740 750
840 850 860 870 880 890
pF1KSD LNNLVEIINRPNTPKTLLENTAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEK
:..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LHQLVEIINRPNTPKTLLENTAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEK
760 770 780 790 800 810
900 910 920 930 940 950
pF1KSD DSAFRGICMMIGVNPGGVVQDFIFFCDAVASWVSPKDDLRDMFYKILHGFKDQVGEDNWQ
:::::::: ::.:::.::.:::::::::::::..::::::::: :::::::.:::..::.
XP_005 DSAFRGICTMISVNPSGVIQDFIFFCDAVASWINPKDDLRDMFCKILHGFKNQVGDENWR
820 830 840 850 860 870
960 970
pF1KSD QFSEQFPPLLKERLAAFYGV
.::.::: :::::::::::
XP_005 RFSDQFPLPLKERLAAFYGV
880 890
>>NP_694858 (OMIM: 602901) transportin-1 isoform 2 [Homo (890 aa)
initn: 3274 init1: 3274 opt: 5240 Z-score: 3874.8 bits: 728.3 E(85289): 4.4e-209
Smith-Waterman score: 5240; 85.5% identity (95.7% similar) in 890 aa overlap (94-979:4-890)
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ASGAPPGSHTEPQRPSADPGPYLRSLPCAMDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPNTATQRIV
.:.::::::::.:::::.::::.:. :: :
NP_694 MEYEWKPDEQGLQQILQLLKESQSPDTTIQRTV
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KSD QDKLKQLNQFPDFNNYLIFVLTRLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHYQSFPPPVADFIKQ
:.::.::::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:.:: :.::::.
NP_694 QQKLEQLNQYPDFNNYLIFVLTKLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHFQNFPNGVTDFIKS
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KSD ECLNNIGDASSLIRATIGILITTIASKGELQMWPELLPQLCNLLNSEDYNTCEGAFGALQ
::::::::.: :::::.:::::::::::::: ::.:::.::.::.:::::::::::::::
NP_694 ECLNNIGDSSPLIRATVGILITTIASKGELQNWPDLLPKLCSLLDSEDYNTCEGAFGALQ
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KICEDSSELLDSDALNRPLNIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIACVNQFIMDRAQALMDNI
::::::.:.::::.:.:::::::::::::::: ::::::::.:::::::..:.:::: .:
NP_694 KICEDSAEILDSDVLDRPLNIMIPKFLQFFKHSSPKIRSHAVACVNQFIISRTQALMLHI
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DTFIEHLFALAVDDDPEVRKNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQRTQDHDENVA
:.:::.::::: :..::::::::::::::::::.:::.::::.:..::::::::.:::::
NP_694 DSFIENLFALAGDEEPEVRKNVCRALVMLLEVRMDRLLPHMHNIVEYMLQRTQDQDENVA
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LEACEFWLTLAEQPICKEVLASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLKGDVEEDEAVPDSEQ
:::::::::::::::::.::. :: .:::.::::::::.::::::::::::::..:::::
NP_694 LEACEFWLTLAEQPICKDVLVRHLPKLIPVLVNGMKYSDIDIILLKGDVEEDETIPDSEQ
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470
pF1KSD DIKPRFHKSRTVTLPHEAERPDGSEDAEDDDD----DDALSDWNLRKCSAAALDVLANVF
::.::::.::::. :. :: :. .:::: ::..:::::::::::::::::::.
NP_694 DIRPRFHRSRTVAQQHDE---DGIEEEDDDDDEIDDDDTISDWNLRKCSAAALDVLANVY
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KSD REELLPHLLPLLKGLLFHPEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMVPYLPELIPHLIQCLSDK
:.:::::.::::: :::: :::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
NP_694 RDELLPHILPLLKELLFHHEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMIPYLPELIPHLIQCLSDK
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KSD KALVRSIACWTLSRYAHWVVSQPPDMHLKPLMTELLKRILDGNKRVQEAACSAFATLEEE
:::::::.::::::::::::::::: .::::::::::::::.::::::::::::::::::
NP_694 KALVRSITCWTLSRYAHWVVSQPPDTYLKPLMTELLKRILDSNKRVQEAACSAFATLEEE
460 470 480 490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KSD ACTELVPYLSYILDTLVFAFGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQKLMPPLI
:::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::: ::::::
NP_694 ACTELVPYLAYILDTLVFAFSKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNKPEYIQMLMPPLI
520 530 540 550 560 570
660 670 680 690 700 710
pF1KSD QKWNELKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVTLVQKTLAQAMMYTQHP
:::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::. . .:
NP_694 QKWNMLKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVNLVQKTLAQAMLNNAQP
580 590 600 610 620 630
720 730 740 750 760 770
pF1KSD EQYEAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGHVEQLVARSNIMTLLFQCMQDSMPEVRQSSFAL
.::::::::::::::::::::::::::..:::::::::.::..:::::.:::::::::::
NP_694 DQYEAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGNIEQLVARSNILTLMYQCMQDKMPEVRQSSFAL
640 650 660 670 680 690
780 790 800 810 820 830
pF1KSD LGDLTKACFIHVKPCIAEFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEICMQMGAEMQPYVQMV
::::::::: :::::::.::::::::::::::::::::::::::: .::: :::::. ::
NP_694 LGDLTKACFQHVKPCIADFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEISIQMGIEMQPYIPMV
700 710 720 730 740 750
840 850 860 870 880 890
pF1KSD LNNLVEIINRPNTPKTLLENTAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEK
:..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 LHQLVEIINRPNTPKTLLENTAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEK
760 770 780 790 800 810
900 910 920 930 940 950
pF1KSD DSAFRGICMMIGVNPGGVVQDFIFFCDAVASWVSPKDDLRDMFYKILHGFKDQVGEDNWQ
:::::::: ::.:::.::.:::::::::::::..::::::::: :::::::.:::..::.
NP_694 DSAFRGICTMISVNPSGVIQDFIFFCDAVASWINPKDDLRDMFCKILHGFKNQVGDENWR
820 830 840 850 860 870
960 970
pF1KSD QFSEQFPPLLKERLAAFYGV
.::.::: :::::::::::
NP_694 RFSDQFPLPLKERLAAFYGV
880 890
>>NP_001129668 (OMIM: 603002) transportin-2 isoform 1 [H (897 aa)
initn: 5993 init1: 5160 opt: 5162 Z-score: 3817.2 bits: 717.6 E(85289): 7e-206
Smith-Waterman score: 5977; 98.9% identity (98.9% similar) in 897 aa overlap (93-979:1-897)
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AASGAPPGSHTEPQRPSADPGPYLRSLPCAMDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPNTATQRI
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPNTATQRI
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VQDKLKQLNQFPDFNNYLIFVLTRLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHYQSFPPPVADFIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VQDKLKQLNQFPDFNNYLIFVLTRLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHYQSFPPPVADFIK
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QECLNNIGDASSLIRATIGILITTIASKGELQMWPELLPQLCNLLNSEDYNTCEGAFGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QECLNNIGDASSLIRATIGILITTIASKGELQMWPELLPQLCNLLNSEDYNTCEGAFGAL
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QKICEDSSELLDSDALNRPLNIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIACVNQFIMDRAQALMDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QKICEDSSELLDSDALNRPLNIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIACVNQFIMDRAQALMDN
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IDTFIEHLFALAVDDDPEVRKNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQRTQDHDENV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IDTFIEHLFALAVDDDPEVRKNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQRTQDHDENV
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ALEACEFWLTLAEQPICKEVLASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLKGDVEEDEAVPDSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALEACEFWLTLAEQPICKEVLASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLKGDVEEDEAVPDSE
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KSD QDIKPRFHKSRTVTLPHEAERPDGSEDAEDDDDDDALSDWNLRKCSAAALDVLANVFREE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDIKPRFHKSRTVTLPHEAERPDGSEDAEDDDDDDALSDWNLRKCSAAALDVLANVFREE
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LLPHLLPLLKGLLFHPEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMVPYLPELIPHLIQCLSDKKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLPHLLPLLKGLLFHPEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMVPYLPELIPHLIQCLSDKKAL
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VRSIACWTLSRYAHWVVSQPPDMHLKPLMTELLKRILDGNKRVQEAACSAFATLEEEACT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VRSIACWTLSRYAHWVVSQPPDMHLKPLMTELLKRILDGNKRVQEAACSAFATLEEEACT
460 470 480 490 500 510
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ELVPYLSYILDTLVFAFGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQKLMPPLIQKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELVPYLSYILDTLVFAFGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQKLMPPLIQKW
520 530 540 550 560 570
670 680 690 700 710 720
pF1KSD NELKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVTLVQKTLAQAMMYTQHPEQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NELKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVTLVQKTLAQAMMYTQHPEQY
580 590 600 610 620 630
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGHVEQLVARSNIMTLLFQCMQDSMPEVRQSSFALLGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGHVEQLVARSNIMTLLFQCMQDSMPEVRQSSFALLGD
640 650 660 670 680 690
790 800 810 820 830 840
pF1KSD LTKACFIHVKPCIAEFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEICMQMGAEMQPYVQMVLNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTKACFIHVKPCIAEFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEICMQMGAEMQPYVQMVLNN
700 710 720 730 740 750
850 860 870 880 890
pF1KSD LVEIINRPNTPKTLLENT----------AITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRN
:::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVEIINRPNTPKTLLENTGRLTSPSAIPAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRN
760 770 780 790 800 810
900 910 920 930 940 950
pF1KSD IRDNEEKDSAFRGICMMIGVNPGGVVQDFIFFCDAVASWVSPKDDLRDMFYKILHGFKDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IRDNEEKDSAFRGICMMIGVNPGGVVQDFIFFCDAVASWVSPKDDLRDMFYKILHGFKDQ
820 830 840 850 860 870
960 970
pF1KSD VGEDNWQQFSEQFPPLLKERLAAFYGV
:::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VGEDNWQQFSEQFPPLLKERLAAFYGV
880 890
>>XP_005248558 (OMIM: 602901) PREDICTED: transportin-1 i (866 aa)
initn: 3083 init1: 2346 opt: 4315 Z-score: 3192.7 bits: 602.0 E(85289): 4.3e-171
Smith-Waterman score: 4991; 81.9% identity (92.0% similar) in 897 aa overlap (87-979:5-866)
60 70 80 90 100 110
pF1KSD RRHAATAASGAPPGSHTEPQRPSADPGPYLRSLPCAMDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPN
:. ..:.::::::::.:::::.::::.
XP_005 MVWDRQTKMEYEWKPDEQGLQQILQLLKESQSPD
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KSD TATQRIVQDKLKQLNQFPDFNNYLIFVLTRLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHYQSFPPP
:. :: ::.::.::::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:.::
XP_005 TTIQRTVQQKLEQLNQYPDFNNYLIFVLTKLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHFQNFPNG
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KSD VADFIKQECLNNIGDASSLIRATIGILITTIASKGELQMWPELLPQLCNLLNSEDYNTCE
:.::::.::::::::.: :::::.:::::::::::::: ::.:::.::.::.::::::::
XP_005 VTDFIKSECLNNIGDSSPLIRATVGILITTIASKGELQNWPDLLPKLCSLLDSEDYNTCE
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KSD GAFGALQKICEDSSELLDSDALNRPLNIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIACVNQFIMDRA
:::::::::::::.:.::::.:.:::::::::::::::: ::::::::.:::::::..:.
XP_005 GAFGALQKICEDSAEILDSDVLDRPLNIMIPKFLQFFKHSSPKIRSHAVACVNQFIISRT
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QALMDNIDTFIEHLFALAVDDDPEVRKNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQRTQ
:::: .::.:::.::::: :..::::::::::::::::::.:::.::::.:..:::::::
XP_005 QALMLHIDSFIENLFALAGDEEPEVRKNVCRALVMLLEVRMDRLLPHMHNIVEYMLQRTQ
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KSD DHDENVALEACEFWLTLAEQPICKEVLASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLKGDVEEDE
:.::::::::::::::::::::::.::. :: .:::.::::::::.::::::::::::::
XP_005 DQDENVALEACEFWLTLAEQPICKDVLVRHLPKLIPVLVNGMKYSDIDIILLKGDVEEDE
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KSD AVPDSEQDIKPRFHKSRTVTLPHEAERPDGSEDAEDDDD----DDALSDWNLRKCSAAAL
..:::::::.::::.::::. :. :: :. .:::: ::..:::::::::::::
XP_005 TIPDSEQDIRPRFHRSRTVAQQHDE---DGIEEEDDDDDEIDDDDTISDWNLRKCSAAAL
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KSD DVLANVFREELLPHLLPLLKGLLFHPEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMVPYLPELIPHL
::::::.:.:::::.::::: :::: :::::::::::::::::::::::.::::::::::
XP_005 DVLANVYRDELLPHILPLLKELLFHHEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMIPYLPELIPHL
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KSD IQCLSDKKALVRSIACWTLSRYAHWVVSQPPDMHLKPLMTELLKRILDGNKRVQEAACSA
::::::::::::::.::::::::::::::::: .::::::::::::::.:::::::::::
XP_005 IQCLSDKKALVRSITCWTLSRYAHWVVSQPPDTYLKPLMTELLKRILDSNKRVQEAACSA
460 470 480 490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KSD FATLEEEACTELVPYLSYILDTLVFAFGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQ
::::::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.:::::
XP_005 FATLEEEACTELVPYLAYILDTLVFAFSKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNKPEYIQ
520 530 540 550 560 570
660 670 680 690 700 710
pF1KSD KLMPPLIQKWNELKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVTLVQKTLAQA
:::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
XP_005 MLMPPLIQKWNMLKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVNLVQKTLAQA
580 590 600 610 620 630
720 730 740 750 760 770
pF1KSD MMYTQHPEQYEAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGHVEQLVARSNIMTLLFQCMQDSMPEV
:. . .:.::::::::::::::::::::::::::..:::::::::.::..:::::.::::
XP_005 MLNNAQPDQYEAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGNIEQLVARSNILTLMYQCMQDKMPEV
640 650 660 670 680 690
780 790 800 810 820 830
pF1KSD RQSSFALLGDLTKACFIHVKPCIAEFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEICMQMGAEM
:::::::::::::::: :::::::.::::::::::::::::::::::::::: .::
XP_005 RQSSFALLGDLTKACFQHVKPCIADFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEISIQM----
700 710 720 730 740
840 850 860 870 880 890
pF1KSD QPYVQMVLNNLVEIINRPNTPKTLLENTAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRN
::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ----------------------------AITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRN
750 760 770
900 910 920 930 940 950
pF1KSD IRDNEEKDSAFRGICMMIGVNPGGVVQDFIFFCDAVASWVSPKDDLRDMFYKILHGFKDQ
::::::::::::::: ::.:::.::.:::::::::::::..::::::::: :::::::.:
XP_005 IRDNEEKDSAFRGICTMISVNPSGVIQDFIFFCDAVASWINPKDDLRDMFCKILHGFKNQ
780 790 800 810 820 830
960 970
pF1KSD VGEDNWQQFSEQFPPLLKERLAAFYGV
::..::..::.::: :::::::::::
XP_005 VGDENWRRFSDQFPLPLKERLAAFYGV
840 850 860
>>XP_016864947 (OMIM: 602901) PREDICTED: transportin-1 i (858 aa)
initn: 3083 init1: 2346 opt: 4313 Z-score: 3191.2 bits: 601.7 E(85289): 5.1e-171
Smith-Waterman score: 4989; 82.5% identity (92.4% similar) in 890 aa overlap (94-979:4-858)
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ASGAPPGSHTEPQRPSADPGPYLRSLPCAMDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPNTATQRIV
.:.::::::::.:::::.::::.:. :: :
XP_016 MEYEWKPDEQGLQQILQLLKESQSPDTTIQRTV
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KSD QDKLKQLNQFPDFNNYLIFVLTRLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHYQSFPPPVADFIKQ
:.::.::::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:.:: :.::::.
XP_016 QQKLEQLNQYPDFNNYLIFVLTKLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHFQNFPNGVTDFIKS
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KSD ECLNNIGDASSLIRATIGILITTIASKGELQMWPELLPQLCNLLNSEDYNTCEGAFGALQ
::::::::.: :::::.:::::::::::::: ::.:::.::.::.:::::::::::::::
XP_016 ECLNNIGDSSPLIRATVGILITTIASKGELQNWPDLLPKLCSLLDSEDYNTCEGAFGALQ
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KICEDSSELLDSDALNRPLNIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIACVNQFIMDRAQALMDNI
::::::.:.::::.:.:::::::::::::::: ::::::::.:::::::..:.:::: .:
XP_016 KICEDSAEILDSDVLDRPLNIMIPKFLQFFKHSSPKIRSHAVACVNQFIISRTQALMLHI
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DTFIEHLFALAVDDDPEVRKNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQRTQDHDENVA
:.:::.::::: :..::::::::::::::::::.:::.::::.:..::::::::.:::::
XP_016 DSFIENLFALAGDEEPEVRKNVCRALVMLLEVRMDRLLPHMHNIVEYMLQRTQDQDENVA
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LEACEFWLTLAEQPICKEVLASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLKGDVEEDEAVPDSEQ
:::::::::::::::::.::. :: .:::.::::::::.::::::::::::::..:::::
XP_016 LEACEFWLTLAEQPICKDVLVRHLPKLIPVLVNGMKYSDIDIILLKGDVEEDETIPDSEQ
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470
pF1KSD DIKPRFHKSRTVTLPHEAERPDGSEDAEDDDD----DDALSDWNLRKCSAAALDVLANVF
::.::::.::::. :. :: :. .:::: ::..:::::::::::::::::::.
XP_016 DIRPRFHRSRTVAQQHDE---DGIEEEDDDDDEIDDDDTISDWNLRKCSAAALDVLANVY
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KSD REELLPHLLPLLKGLLFHPEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMVPYLPELIPHLIQCLSDK
:.:::::.::::: :::: :::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
XP_016 RDELLPHILPLLKELLFHHEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMIPYLPELIPHLIQCLSDK
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KSD KALVRSIACWTLSRYAHWVVSQPPDMHLKPLMTELLKRILDGNKRVQEAACSAFATLEEE
:::::::.::::::::::::::::: .::::::::::::::.::::::::::::::::::
XP_016 KALVRSITCWTLSRYAHWVVSQPPDTYLKPLMTELLKRILDSNKRVQEAACSAFATLEEE
460 470 480 490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KSD ACTELVPYLSYILDTLVFAFGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQKLMPPLI
:::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::: ::::::
XP_016 ACTELVPYLAYILDTLVFAFSKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNKPEYIQMLMPPLI
520 530 540 550 560 570
660 670 680 690 700 710
pF1KSD QKWNELKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVTLVQKTLAQAMMYTQHP
:::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::. . .:
XP_016 QKWNMLKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVNLVQKTLAQAMLNNAQP
580 590 600 610 620 630
720 730 740 750 760 770
pF1KSD EQYEAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGHVEQLVARSNIMTLLFQCMQDSMPEVRQSSFAL
.::::::::::::::::::::::::::..:::::::::.::..:::::.:::::::::::
XP_016 DQYEAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGNIEQLVARSNILTLMYQCMQDKMPEVRQSSFAL
640 650 660 670 680 690
780 790 800 810 820 830
pF1KSD LGDLTKACFIHVKPCIAEFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEICMQMGAEMQPYVQMV
::::::::: :::::::.::::::::::::::::::::::::::: .::
XP_016 LGDLTKACFQHVKPCIADFMPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEISIQM-----------
700 710 720 730
840 850 860 870 880 890
pF1KSD LNNLVEIINRPNTPKTLLENTAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ---------------------AITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEK
740 750 760 770
900 910 920 930 940 950
pF1KSD DSAFRGICMMIGVNPGGVVQDFIFFCDAVASWVSPKDDLRDMFYKILHGFKDQVGEDNWQ
:::::::: ::.:::.::.:::::::::::::..::::::::: :::::::.:::..::.
XP_016 DSAFRGICTMISVNPSGVIQDFIFFCDAVASWINPKDDLRDMFCKILHGFKNQVGDENWR
780 790 800 810 820 830
960 970
pF1KSD QFSEQFPPLLKERLAAFYGV
.::.::: :::::::::::
XP_016 RFSDQFPLPLKERLAAFYGV
840 850
>>NP_001263382 (OMIM: 602738) importin subunit beta-1 is (731 aa)
initn: 233 init1: 158 opt: 292 Z-score: 226.4 bits: 52.9 E(85289): 7.2e-06
Smith-Waterman score: 397; 24.5% identity (54.4% similar) in 539 aa overlap (345-843:71-594)
320 330 340 350 360 370
pF1KSD VDDDPEVRKNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQRTQDHDENVALEACEFWLTLA
: :.: . . :: : : . : . . .
NP_001 PSNNVKLAATNALLNSLEFTKANFDKESERHFIMQVVCEATQCPDTRVRVAALQNLVKI-
50 60 70 80 90
380 390 400 410 420
pF1KSD EQPICKEVLASHL-VQLIPILVNGMKYSEIDIILLKG--------DVEEDEAVPDSE--Q
. . . . ... :. : ...:: :.:: . :.: : : : :. :: .
NP_001 -MSLYYQYMETYMGPALFAITIEAMK-SDIDEVALQGIEFWSNVCDEEMDLAIEASEAAE
100 110 120 130 140 150
430 440 450 460 470 480
pF1KSD DIKPRFHKSRTVT---LPHEAERPDGSEDAEDDDDDDALSDWNLRKCSAAALDVLANVFR
. .: : :. . : . . . .:..::: .::: : ... : .::. .
NP_001 QGRPPEHTSKFYAKGALQYLVPILTQTLTKQDENDDD--DDWNPCKAAGVCLMLLATCCE
160 170 180 190 200 210
490 500 510 520 530
pF1KSD EELLPHLLPLLKGLLFHPEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMV-PYLPELIPHLIQCLSDK
....::.::..: . .:.: ........: : :: ... : . . .: ::. ..:
NP_001 DDIVPHVLPFIKEHIKNPDWRYRDAAVMAFGCILEGPEPSQLKPLVIQAMPTLIELMKDP
220 230 240 250 260 270
540 550 560 570 580 590
pF1KSD KALVRSIACWTLSRYAHWVVSQP-PDMHLKPLMTELLKRILDGNKRVQEAACSAFATLEE
...::. : ::..: . . :..: ::. :.. :... :: .: ::..: :
NP_001 SVVVRDTAAWTVGRICELLPEAAINDVYLAPLLQCLIEG-LSAEPRVASNVCWAFSSLAE
280 290 300 310 320 330
600 610 620 630 640 650
pF1KSD EACTELVPYLSYILDTLVFAFGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQKLMPPL
: : . . . .. ... . ::. . : ::. : . . .
NP_001 AA-YEAADVADDQEEPATYCLSSSFE---LIVQKLLETTDRPDGHQNNLRSSAYESLMEI
340 350 360 370 380 390
660 670 680 690 700 710
pF1KSD IQKWNELKDE----DKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPV-YQRCVTLVQKTLAQAM
.. : :: .: . ..: :..: ..: . . . .. .:. :: ...
NP_001 VK--NSAKDCYPAVQKTTLVIMERLQQV-LQMESHIQSTSDRIQFNDLQSLLCATLQNVL
400 410 420 430 440
720 730 740 750 760
pF1KSD MYTQHPEQYEAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGHVEQ-LVARSNIMTLL----FQCMQDS
.:: . . : : : .... : : :: :. :.: :... .: .. :.
NP_001 RKVQHQDALQISDV-VMASLLRMFQSTA-GSGGVQEDALMAVSTLVEVLGGEFLKYMEAF
450 460 470 480 490 500
770 780 790 800 810
pF1KSD MP------------EVRQSSFALLGDLTKACFIHVKPCIAEFMPILGTNLNPEFI--SVC
: .: .. .:.::: .: .. : : : .: ::. : . ::
NP_001 KPFLGIGLKNYAEYQVCLAAVGLVGDLCRALQSNIIPFCDEVMQLLLENLGNENVHRSVK
510 520 530 540 550 560
820 830 840 850 860 870
pF1KSD NNATWAIGEICMQMGAEMQPYVQMVLNNLVEIINRPNTPKTLLENTAITIGRLGYVCPQE
. ..:.: . .:.:.. :...:::.:
NP_001 PQILSVFGDIALAIGGEFKKYLEVVLNTLQQASQAQVDKSDYDMVDYLNELRESCLEAYT
570 580 590 600 610 620
>>NP_002256 (OMIM: 602738) importin subunit beta-1 isofo (876 aa)
initn: 280 init1: 158 opt: 292 Z-score: 225.4 bits: 53.0 E(85289): 8.1e-06
Smith-Waterman score: 462; 23.2% identity (53.1% similar) in 793 aa overlap (104-843:2-739)
80 90 100 110 120 130
pF1KSD EPQRPSADPGPYLRSLPCAMDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPNTATQRIVQDKLKQ--LN
... .:. . ::. . .: :.. ..
NP_002 MELITILEKTVSPDRLELEAAQKFLERAAVE
10 20 30
140 150 160 170 180
pF1KSD QFPDFNNYLIFVLTRLKSEDEPTRSLSGLILKN-------NVKAHYQ----SFPPPVADF
..: : : ::. .... .: .:: .:: ..::.:: .. .
NP_002 NLPTFLVELSRVLAN-PGNSQVARVAAGLQIKNSLTSKDPDIKAQYQQRWLAIDANARRE
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230
pF1KSD IKQECLNNIGDA----SSLIRATIGILITTIASKGELQMWPELLPQLC-NLLNSEDY-NT
.:. :...: :: . . :: . : ...::::.::: :. : .. .
NP_002 VKNYVLQTLGTETYRPSSASQCVAGIACAEIP----VNQWPELIPQLVANVTNPNSTEHM
100 110 120 130 140
240 250 260 270 280 290
pF1KSD CEGAFGALQKICEDSSELLDSDALNRPLNIMIPKFLQFFKHCSPK--IRSHAI-ACVNQF
:... :. ::.: .: . :. : .. ..: ... :. .. : : .:..
NP_002 KESTLEAIGYICQD----IDPEQLQDKSNEILTAIIQGMRKEEPSNNVKLAATNALLNSL
150 160 170 180 190 200
300 310 320 330 340 350
pF1KSD IMDRAQALMDNIDTFIEHLFALAVD-DDPEVRKNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQY
. .:. .. :: .. :.. : .:: . . :: .. . . . .: .
NP_002 EFTKANFDKESERHFIMQVVCEATQCPDTRVRVAALQNLVKIMSLYYQYMETYMGPALFA
210 220 230 240 250 260
360 370 380 390 400
pF1KSD MLQRTQDHD-ENVALEACEFWLTLAEQPICKEVLASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLK
. ... : ..:::.. ::: . .: : :.:.
NP_002 ITIEAMKSDIDEVALQGIEFW-----SNVCDE--------------------EMDLA---
270 280 290
410 420 430 440 450 460
pF1KSD GDVEEDEAVPDSEQDIKPRFHKSRTVT---LPHEAERPDGSEDAEDDDDDDALSDWNLRK
.: .:: .:: .: : :. . : . . . .:..::: .::: :
NP_002 --IEASEA---AEQG-RPPEHTSKFYAKGALQYLVPILTQTLTKQDENDDD--DDWNPCK
300 310 320 330 340
470 480 490 500 510 520
pF1KSD CSAAALDVLANVFREELLPHLLPLLKGLLFHPEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMV-PYL
... : .::. .....::.::..: . .:.: ........: : :: ... : .
NP_002 AAGVCLMLLATCCEDDIVPHVLPFIKEHIKNPDWRYRDAAVMAFGCILEGPEPSQLKPLV
350 360 370 380 390 400
530 540 550 560 570 580
pF1KSD PELIPHLIQCLSDKKALVRSIACWTLSRYAHWVVSQP-PDMHLKPLMTELLKRILDGNKR
. .: ::. ..: ...::. : ::..: . . :..: ::. :.. :... :
NP_002 IQAMPTLIELMKDPSVVVRDTAAWTVGRICELLPEAAINDVYLAPLLQCLIEG-LSAEPR
410 420 430 440 450 460
590 600 610 620 630 640
pF1KSD VQEAACSAFATLEEEACTELVPYLSYILDTLVFAFGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHH
: .: ::..: : : : . . . .. ... . ::. . : ::.
NP_002 VASNVCWAFSSLAE-AAYEAADVADDQEEPATYCLSSSFE---LIVQKLLETTDRPDGHQ
470 480 490 500 510 520
650 660 670 680 690
pF1KSD LNQPEYIQKLMPPLIQKWNELKDE----DKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPV-YQ
: . . ... : :: .: . ..: :..: ..: . . . ..
NP_002 NNLRSSAYESLMEIVK--NSAKDCYPAVQKTTLVIMERLQQV-LQMESHIQSTSDRIQFN
530 540 550 560 570
700 710 720 730 740 750
pF1KSD RCVTLVQKTLAQAMMYTQHPEQYEAPDKDFMIVALDLLSGLAEGLGGHVEQ-LVARSNIM
.:. :: ... .:: . . : : : .... : : :: :. :.: :...
NP_002 DLQSLLCATLQNVLRKVQHQDALQISDV-VMASLLRMFQSTA-GSGGVQEDALMAVSTLV
580 590 600 610 620 630
760 770 780 790 800
pF1KSD TLL----FQCMQDSMP------------EVRQSSFALLGDLTKACFIHVKPCIAEFMPIL
.: .. :. : .: .. .:.::: .: .. : : : .:
NP_002 EVLGGEFLKYMEAFKPFLGIGLKNYAEYQVCLAAVGLVGDLCRALQSNIIPFCDEVMQLL
640 650 660 670 680 690
810 820 830 840 850 860
pF1KSD GTNLNPEFI--SVCNNATWAIGEICMQMGAEMQPYVQMVLNNLVEIINRPNTPKTLLENT
::. : . :: . ..:.: . .:.:.. :...:::.:
NP_002 LENLGNENVHRSVKPQILSVFGDIALAIGGEFKKYLEVVLNTLQQASQAQVDKSDYDMVD
700 710 720 730 740 750
870 880 890 900 910 920
pF1KSD AITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSAFRGICMMIGVNPGGVVQD
NP_002 YLNELRESCLEAYTGIVQGLKGDQENVHPDVMLVQPRVEFILSFIDHIAGDEDHTDGVVA
760 770 780 790 800 810
979 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 08:09:15 2016 done: Thu Nov 3 08:09:17 2016
Total Scan time: 14.270 Total Display time: 0.320
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]