Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDB0034
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0034, 703 aa
1>>>pF1KSDB0034 703 - 703 aa - 703 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3372+/-0.00107; mu= -0.6313+/- 0.065
mean_var=309.5540+/-62.892, 0's: 0 Z-trim(113.3): 15 B-trim: 101 in 1/54
Lambda= 0.072896
statistics sampled from 13941 (13949) to 13941 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.744), E-opt: 0.2 (0.428), width: 16
Scan time: 4.200
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35144.1 FAM129B gene_id:64855|Hs108|chr9 ( 733) 4703 508.5 1.4e-143
CCDS35145.1 FAM129B gene_id:64855|Hs108|chr9 ( 746) 4703 508.5 1.4e-143
CCDS1364.1 FAM129A gene_id:116496|Hs108|chr1 ( 928) 1425 163.9 9.9e-40
CCDS82314.1 FAM129C gene_id:199786|Hs108|chr19 ( 620) 688 86.2 1.6e-16
CCDS42521.1 FAM129C gene_id:199786|Hs108|chr19 ( 651) 688 86.2 1.6e-16
CCDS82315.1 FAM129C gene_id:199786|Hs108|chr19 ( 666) 688 86.2 1.7e-16
CCDS12362.1 FAM129C gene_id:199786|Hs108|chr19 ( 697) 688 86.3 1.7e-16
>>CCDS35144.1 FAM129B gene_id:64855|Hs108|chr9 (733 aa)
initn: 4703 init1: 4703 opt: 4703 Z-score: 2691.3 bits: 508.5 E(32554): 1.4e-143
Smith-Waterman score: 4703; 100.0% identity (100.0% similar) in 703 aa overlap (1-703:31-733)
10 20 30
pF1KSD MRHEIEGTGLPQAQLLWRKVPLDERIVFSG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MGWMGEKTGKILTEFLQFYEDQYGVALFNSMRHEIEGTGLPQAQLLWRKVPLDERIVFSG
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD NLFQHQEDSKKWRNRFSLVPHNYGLVLYENKAAYERQVPPRAVINSAGYKILTSVDQYLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NLFQHQEDSKKWRNRFSLVPHNYGLVLYENKAAYERQVPPRAVINSAGYKILTSVDQYLE
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD LIGNSLPGTTAKSGSAPILKCPTQFPLILWHPYARHYYFCMMTEAEQDKWQAVLQDCIRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LIGNSLPGTTAKSGSAPILKCPTQFPLILWHPYARHYYFCMMTEAEQDKWQAVLQDCIRH
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD CNNGIPEDSKVEGPAFTDAIRMYRQSKELYGTWEMLCGNEVQILSNLVMEELGPELKAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 CNNGIPEDSKVEGPAFTDAIRMYRQSKELYGTWEMLCGNEVQILSNLVMEELGPELKAEL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KSD GPRLKGKPQERQRQWIQISDAVYHMVYEQAKARFEEVLSKVQQVQPAMQAVIRTDMDQII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GPRLKGKPQERQRQWIQISDAVYHMVYEQAKARFEEVLSKVQQVQPAMQAVIRTDMDQII
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KSD TSKEHLASKIRAFILPKAEVCVRNHVQPYIPSILEALMVPTSQGFTEVRDVFFKEVTDMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TSKEHLASKIRAFILPKAEVCVRNHVQPYIPSILEALMVPTSQGFTEVRDVFFKEVTDMN
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KSD LNVINEGGIDKLGEYMEKLSRLAYHPLKMQSCYEKMESLRLDGLQQRFDVSSTSVFKQRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LNVINEGGIDKLGEYMEKLSRLAYHPLKMQSCYEKMESLRLDGLQQRFDVSSTSVFKQRA
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KSD QIHMREQMDNAVYTFETLLHQELGKGPTKEELCKSIQRVLERVLKKYDYDSSSVRKRFFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QIHMREQMDNAVYTFETLLHQELGKGPTKEELCKSIQRVLERVLKKYDYDSSSVRKRFFR
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KSD EALLQISIPFLLKKLAPTCKSELPRFQELIFEDFARFILVENTYEEVVLQTVMKDILQAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EALLQISIPFLLKKLAPTCKSELPRFQELIFEDFARFILVENTYEEVVLQTVMKDILQAV
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KSD KEAAVQRKHNLYRDSMVMHNSDPNLHLLAEGAPIDWGEEYSNSGGGGSPSPSTPESATLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KEAAVQRKHNLYRDSMVMHNSDPNLHLLAEGAPIDWGEEYSNSGGGGSPSPSTPESATLS
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KSD EKRRRAKQVVSVVQDEEVGLPFEASPESPPPASPDGVTEIRGLLAQGLRPESPPPAGPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EKRRRAKQVVSVVQDEEVGLPFEASPESPPPASPDGVTEIRGLLAQGLRPESPPPAGPLL
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KSD NGAPAGESPQPKAAPEASSPPASPLQHLLPGKAVDLGPPKPSDQETGEQVSSPSSHPALH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NGAPAGESPQPKAAPEASSPPASPLQHLLPGKAVDLGPPKPSDQETGEQVSSPSSHPALH
670 680 690 700 710 720
700
pF1KSD TTTEDSAGVQTEF
:::::::::::::
CCDS35 TTTEDSAGVQTEF
730
>>CCDS35145.1 FAM129B gene_id:64855|Hs108|chr9 (746 aa)
initn: 4703 init1: 4703 opt: 4703 Z-score: 2691.2 bits: 508.5 E(32554): 1.4e-143
Smith-Waterman score: 4703; 100.0% identity (100.0% similar) in 703 aa overlap (1-703:44-746)
10 20 30
pF1KSD MRHEIEGTGLPQAQLLWRKVPLDERIVFSG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 RQHIAEKTGKILTEFLQFYEDQYGVALFNSMRHEIEGTGLPQAQLLWRKVPLDERIVFSG
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KSD NLFQHQEDSKKWRNRFSLVPHNYGLVLYENKAAYERQVPPRAVINSAGYKILTSVDQYLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NLFQHQEDSKKWRNRFSLVPHNYGLVLYENKAAYERQVPPRAVINSAGYKILTSVDQYLE
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KSD LIGNSLPGTTAKSGSAPILKCPTQFPLILWHPYARHYYFCMMTEAEQDKWQAVLQDCIRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LIGNSLPGTTAKSGSAPILKCPTQFPLILWHPYARHYYFCMMTEAEQDKWQAVLQDCIRH
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KSD CNNGIPEDSKVEGPAFTDAIRMYRQSKELYGTWEMLCGNEVQILSNLVMEELGPELKAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 CNNGIPEDSKVEGPAFTDAIRMYRQSKELYGTWEMLCGNEVQILSNLVMEELGPELKAEL
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KSD GPRLKGKPQERQRQWIQISDAVYHMVYEQAKARFEEVLSKVQQVQPAMQAVIRTDMDQII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GPRLKGKPQERQRQWIQISDAVYHMVYEQAKARFEEVLSKVQQVQPAMQAVIRTDMDQII
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KSD TSKEHLASKIRAFILPKAEVCVRNHVQPYIPSILEALMVPTSQGFTEVRDVFFKEVTDMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TSKEHLASKIRAFILPKAEVCVRNHVQPYIPSILEALMVPTSQGFTEVRDVFFKEVTDMN
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KSD LNVINEGGIDKLGEYMEKLSRLAYHPLKMQSCYEKMESLRLDGLQQRFDVSSTSVFKQRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LNVINEGGIDKLGEYMEKLSRLAYHPLKMQSCYEKMESLRLDGLQQRFDVSSTSVFKQRA
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KSD QIHMREQMDNAVYTFETLLHQELGKGPTKEELCKSIQRVLERVLKKYDYDSSSVRKRFFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QIHMREQMDNAVYTFETLLHQELGKGPTKEELCKSIQRVLERVLKKYDYDSSSVRKRFFR
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KSD EALLQISIPFLLKKLAPTCKSELPRFQELIFEDFARFILVENTYEEVVLQTVMKDILQAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EALLQISIPFLLKKLAPTCKSELPRFQELIFEDFARFILVENTYEEVVLQTVMKDILQAV
500 510 520 530 540 550
520 530 540 550 560 570
pF1KSD KEAAVQRKHNLYRDSMVMHNSDPNLHLLAEGAPIDWGEEYSNSGGGGSPSPSTPESATLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KEAAVQRKHNLYRDSMVMHNSDPNLHLLAEGAPIDWGEEYSNSGGGGSPSPSTPESATLS
560 570 580 590 600 610
580 590 600 610 620 630
pF1KSD EKRRRAKQVVSVVQDEEVGLPFEASPESPPPASPDGVTEIRGLLAQGLRPESPPPAGPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EKRRRAKQVVSVVQDEEVGLPFEASPESPPPASPDGVTEIRGLLAQGLRPESPPPAGPLL
620 630 640 650 660 670
640 650 660 670 680 690
pF1KSD NGAPAGESPQPKAAPEASSPPASPLQHLLPGKAVDLGPPKPSDQETGEQVSSPSSHPALH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NGAPAGESPQPKAAPEASSPPASPLQHLLPGKAVDLGPPKPSDQETGEQVSSPSSHPALH
680 690 700 710 720 730
700
pF1KSD TTTEDSAGVQTEF
:::::::::::::
CCDS35 TTTEDSAGVQTEF
740
>>CCDS1364.1 FAM129A gene_id:116496|Hs108|chr1 (928 aa)
initn: 1238 init1: 1028 opt: 1425 Z-score: 826.7 bits: 163.9 E(32554): 9.9e-40
Smith-Waterman score: 1429; 36.1% identity (64.8% similar) in 710 aa overlap (1-702:44-725)
10 20
pF1KSD MRHEIEGTGLPQAQLLWRKVPLDE-RIVFS
.: :.: .:.: : :: :..
CCDS13 CAYIRGKTEAAIKNFSPYYSRQYSVAFCNHVRTEVEQQRDLTSQFLKTKPPLAPGTILYE
20 30 40 50 60 70
30 40 50 60 70 80
pF1KSD GNLFQHQEDSKKWRNRFSLVPHNYGLVLYENKAAYERQVPPRAVINSAGYKILTSVDQYL
..: : .:: :::..:. .: ..:.. :::: ::.: . :. : :: :.::: :.:
CCDS13 AELSQFSEDIKKWKERYVVVKNDYAVESYENKEAYQRGAAPKCRILPAGGKVLTSEDEYN
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KSD ELIGNSLP---GTTAKSGSAPILKCPTQFPLILWHPYARHYYFCMMTEAEQDKWQAVLQD
: .: ... : .. :.. : .::. ::.:. :: :::. :.: ...:.:.:
CCDS13 LLSDRHFPDPLASSEKENTQPFVVLPKEFPVYLWQPFFRHGYFCFHEAADQKRFSALLSD
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KSD CIRHCNNGIPEDSKVEGPAFTDAIRMYRQSKELYGTWEMLCGNEVQILSNLVMEELGPEL
:.:: :. .. :. :: .:....:: : ::.:::. :.:.::::::::::: : :
CCDS13 CVRHLNHDYMKQMTFEAQAFLEAVQFFRQEKGHYGSWEMITGDEIQILSNLVMEELLPTL
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KSD KAELGPRLKGKPQERQRQWIQISDAVYHMVYEQAKARFEEVLSKVQQVQPAMQAVIRTDM
...: :..::: ..:.: :. . . .: .: .:.. . . . . . .....::.::
CCDS13 QTDLLPKMKGKKNDRKRTWLGLLEEAYTLVQHQVSEGLSALKEECRALTKGLEGTIRSDM
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KSD DQIITSKEHLASKIRAFILPKAEVCVRNHVQPYIPSILEALMVPTSQGFTEVRDVFFKEV
:::..::..: .::.:.. :: . :::.. :::: :: :.:.::.::: .: :::
CCDS13 DQIVNSKNYLIGKIKAMVAQPAEKSCLESVQPFLASILEELMGPVSSGFSEVRVLFEKEV
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KSD TDMNLNVINEGGIDKLGEYMEKLSRLAYHPLKMQSCYEKMESL--RLDGLQQRFDVSSTS
.... : . .: :....: : : .::. :: :.. : ::. :..:: .
CCDS13 NEVSQNFQTTKDSVQLKEHLDRLMNLPLHSVKMEPCYTKVNLLHERLQDLKSRFRFPHID
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430 440
pF1KSD VFKQRAQIHMREQMDNAVYTFETLLHQELGKGPTKEELCKSIQRVLERVLKKYDYDSSSV
. ::.: .:.: :.:::.::: :: .: .: . .:..: ::::.::::::..
CCDS13 LVVQRTQNYMQELMENAVFTFEQLLSPHLQGEASKTAV--AIEKVKLRVLKQYDYDSSTI
440 450 460 470 480 490
450 460 470 480 490 500
pF1KSD RKRFFREALLQISIPFLLKKLAPTCKSELPRFQELIFEDFARFILVENTYEEVVLQTVMK
::..:.:::.::..: . : :: ::: :: .....:: : . .: :::.:::.. : ..
CCDS13 RKKIFQEALVQITLPTVQKALASTCKPELQKYEQFIFADHTNMIHVENVYEEILHQILLD
500 510 520 530 540 550
510 520 530 540 550 560
pF1KSD DILQAVKEAAVQRKHNLYRDSMVMHNSDPNLHLLAEGAPIDWGEEYSNSGGGGSPSPSTP
. :...::::. .::::..:.:.. . .. :.. : :... ::.
CCDS13 ETLKVIKEAAILKKHNLFEDNMALPSE--SVSSLTDLKP---------PTGSNQASPARR
560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KSD ESATLSEKRRRAKQVVSVVQDEEVGLPFEASPESPPPASPDGVTEIRGLLAQGLRPESPP
:: : . : . ..:: :. : : : :..... ..: : : :::
CCDS13 ASAILP------GVLGSETLSNEV---FQESEEEKQPEVPSSLAKGESLSLPG--P-SPP
610 620 630 640
630 640 650 660 670 680
pF1KSD PAGPLLNGAPAGESP--QPKAAPEASSPPASPLQHLLPGKAVDLGPPKPSDQETGEQVSS
: : ..: .: :. .... :.. ..: : ... : :: : ...
CCDS13 PDGTEQVIISRVDDPVVNPVATEDTAGLPGTCSSELEFGGTLEDEEPA---QEEPEPITA
650 660 670 680 690 700
690 700
pF1KSD PSSHPALHTTTEDSAGVQTEF
.: ::. :. : ..
CCDS13 SGSLKALRKLLTASVEVPVDSAPVMEEDTNGESHVPQENEEEEEKEPSQAAAIHPDNCEE
710 720 730 740 750 760
>>CCDS82314.1 FAM129C gene_id:199786|Hs108|chr19 (620 aa)
initn: 638 init1: 406 opt: 688 Z-score: 410.2 bits: 86.2 E(32554): 1.6e-16
Smith-Waterman score: 688; 27.0% identity (56.6% similar) in 511 aa overlap (7-512:49-559)
10 20 30
pF1KSD MRHEIEGTGLPQAQLLWRKVPLDERIVFSGNLFQHQ
: : .. : :. : . : : : .
CCDS82 GQVDTLLRNFLPCYRGQLAASVLRQISRELGPQEPTGSQLLRSKKLPRVREHRGPLTQLR
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KSD EDSKKWRNRFSLVPHNYGLVLYENKAAYERQVPPRAVINSAGYKILTSVDQYLELIGNSL
.:. : .. . : . .: :: . .:: .::: .::.:.
CCDS82 GHPPRWQPIFCVLRGDGRLEWFSHKEEYENGGHCLGSTALTGYTLLTSQREYLRLLDALC
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KSD P---GTTAKSGSAPILKCPTQFPLILWHPYARHYYFCMMTEAEQDKWQAVLQDCIRHCNN
: : .. .:. :..:::.: ::. :: : :. : :. .:: :: .
CCDS82 PESLGDHTQEEPDSLLEVPVSFPLFLQHPFRRHLCFSAATREAQHAWRLALQGGIRLQGI
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KSD GIPEDSKVEGPAFTDAIRMYRQSKELYGTWEMLCGNEVQILSNLVMEELGPELKAELGPR
. ... . :: ::.:.::: . .: .. :.....:. ..:.: : :.:. :
CCDS82 VLQRSQAPAARAFLDAVRLYRQHQGHFGDDDVTLGSDAEVLTAVLMREQLPALRAQTLPG
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KSD LKGKPQERQRQWIQISDAVYHMVYEQAKARFEEVLSKVQQVQPAMQAVIRTDMDQIITSK
:.: . : : .. :::. : :.: . . ... ... .:: :.::.. ..
CCDS82 LRGAGRARAWAWTELLDAVHAAVLAGASAGLCAFQPEKDELLASLEKTIRPDVDQLLRQR
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KSD EHLASKIRAFILPKAEVCVRNHVQPYIPSILEALMVPTSQGFTEVRDVFFKEVTDMNLNV
..:...:. : : :.: .:.: .: ....:. . .. :: .. . . .. .
CCDS82 ARVAGRLRTDIRGPLESCLRREVDPQLPRVVQTLLRTVEASLEAVRTLLAQGMDRLSHRL
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KSD INEGGIDKLGEYMEKLSRLAYHPLKMQSCYEKMESLR--LDGLQQRFDVSSTSVFKQRAQ
. . .: . . ..... . ::.::.. : : : : : . . . ::
CCDS82 RQSPSGTRLRREVYSFGEMPWDLALMQTCYREAERSRGRLGQLAAPFGFLGMQSLVFGAQ
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KSD IHMREQMDNAVYTFETLLHQELGKGPTKEELCKSIQRVLERVLKKYDYDSSSVRKRFFRE
.. : .:: :: : : : . . .. . ..:: :::::. ::. ...::.:
CCDS82 DLAQQLMADAVATFLQLADQCLTTALNCDQAAQRLERVRGRVLKKFKSDSGLAQRRFIRG
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KSD ALLQISIPFLLKKLAPTCKSELPRFQELIFEDFARFILVENTYEEVVLQTVMKDILQAVK
: : .::.:..: : ::.:::.:. .. .. . .:. ::.:. ... : : .:
CCDS82 WGLCIFLPFVLSQLEPGCKKELPEFEGDVLAVGSQALTTEGIYEDVIRGCLLQRIDQELK
500 510 520 530 540 550
520 530 540 550 560 570
pF1KSD EAAVQRKHNLYRDSMVMHNSDPNLHLLAEGAPIDWGEEYSNSGGGGSPSPSTPESATLSE
.
CCDS82 KTLGANDVSCTLDGCLEVPWEQEGADEETEAEREGGACPRQPDSGAQIQPLCPPPSPGTF
560 570 580 590 600 610
>>CCDS42521.1 FAM129C gene_id:199786|Hs108|chr19 (651 aa)
initn: 638 init1: 406 opt: 688 Z-score: 409.9 bits: 86.2 E(32554): 1.6e-16
Smith-Waterman score: 688; 27.0% identity (56.6% similar) in 511 aa overlap (7-512:80-590)
10 20 30
pF1KSD MRHEIEGTGLPQAQLLWRKVPLDERIVFSGNLFQHQ
: : .. : :. : . : : : .
CCDS42 GQVDTLLRNFLPCYRGQLAASVLRQISRELGPQEPTGSQLLRSKKLPRVREHRGPLTQLR
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