FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDB0041, 463 aa 1>>>pF1KSDB0041 463 - 463 aa - 463 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5591+/-0.000365; mu= 4.8364+/- 0.023 mean_var=219.0332+/-44.382, 0's: 0 Z-trim(120.6): 60 B-trim: 0 in 0/55 Lambda= 0.086660 statistics sampled from 35991 (36051) to 35991 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.749), E-opt: 0.2 (0.423), width: 16 Scan time: 10.360 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001107565 (OMIM: 610677) protein LSM14 homolog ( 463) 3146 405.9 1.2e-112 NP_056393 (OMIM: 610677) protein LSM14 homolog A i ( 463) 3105 400.8 4e-111 XP_005258776 (OMIM: 610677) PREDICTED: protein LSM ( 487) 3099 400.1 7e-111 XP_016882066 (OMIM: 610677) PREDICTED: protein LSM ( 402) 1706 225.9 1.6e-58 XP_005258778 (OMIM: 610677) PREDICTED: protein LSM ( 426) 1706 225.9 1.7e-58 XP_016882065 (OMIM: 610677) PREDICTED: protein LSM ( 404) 1601 212.7 1.5e-54 XP_016882064 (OMIM: 610677) PREDICTED: protein LSM ( 404) 1560 207.6 5.1e-53 XP_005258777 (OMIM: 610677) PREDICTED: protein LSM ( 428) 1554 206.9 9e-53 XP_011525010 (OMIM: 610677) PREDICTED: protein LSM ( 367) 1177 159.7 1.2e-38 >>NP_001107565 (OMIM: 610677) protein LSM14 homolog A is (463 aa) initn: 3146 init1: 3146 opt: 3146 Z-score: 2143.7 bits: 405.9 E(85289): 1.2e-112 Smith-Waterman score: 3146; 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