Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDB0057
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0057, 793 aa
1>>>pF1KSDB0057 793 - 793 aa - 793 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4825+/-0.00115; mu= -1.3339+/- 0.069
mean_var=353.4870+/-73.211, 0's: 0 Z-trim(112.6): 87 B-trim: 115 in 2/53
Lambda= 0.068216
statistics sampled from 13233 (13315) to 13233 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.718), E-opt: 0.2 (0.409), width: 16
Scan time: 4.920
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1719.1 KIF3C gene_id:3797|Hs108|chr2 ( 793) 5144 520.9 3.2e-147
CCDS13200.1 KIF3B gene_id:9371|Hs108|chr20 ( 747) 1315 144.0 8.5e-34
CCDS75296.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 726) 940 107.1 1.1e-22
CCDS44079.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1028) 867 100.1 2e-20
CCDS213.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1029) 867 100.1 2e-20
CCDS72722.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 ( 929) 604 74.1 1.2e-12
CCDS75295.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 702) 600 73.6 1.2e-12
CCDS58054.1 KIF21B gene_id:23046|Hs108|chr1 (1610) 604 74.4 1.7e-12
CCDS58055.1 KIF21B gene_id:23046|Hs108|chr1 (1623) 604 74.4 1.7e-12
CCDS30965.1 KIF21B gene_id:23046|Hs108|chr1 (1624) 604 74.4 1.7e-12
CCDS58056.1 KIF21B gene_id:23046|Hs108|chr1 (1637) 604 74.4 1.7e-12
CCDS34235.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 699) 594 73.0 1.9e-12
CCDS53776.1 KIF21A gene_id:55605|Hs108|chr12 (1674) 563 70.3 2.9e-11
CCDS34042.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2701) 566 70.8 3.3e-11
CCDS68768.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2580) 562 70.4 4.2e-11
CCDS53774.1 KIF21A gene_id:55605|Hs108|chr12 (1621) 554 69.4 5.2e-11
CCDS53775.1 KIF21A gene_id:55605|Hs108|chr12 (1637) 554 69.4 5.2e-11
CCDS31773.1 KIF21A gene_id:55605|Hs108|chr12 (1661) 554 69.5 5.3e-11
>>CCDS1719.1 KIF3C gene_id:3797|Hs108|chr2 (793 aa)
initn: 5144 init1: 5144 opt: 5144 Z-score: 2756.4 bits: 520.9 E(32554): 3.2e-147
Smith-Waterman score: 5144; 100.0% identity (100.0% similar) in 793 aa overlap (1-793:1-793)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTLRNPRAAPGELPKTFTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTLRNPRAAPGELPKTFTF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPELRGVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 DAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPELRGVI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PNAFEHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGVYIKDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 PNAFEHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGVYIKDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIFIITVECSERGSDGQDHIRVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 SSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIFIITVECSERGSDGQDHIRVG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGGGSGGGAGGERPKEASKINLSLSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 KLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGGGSGGGAGGERPKEASKINLSLSAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLSTLRFAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 GNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLSTLRFAN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIARLKAQLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAVSAPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 RAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIARLKAQLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAVSAPPG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD YPEGPVIEAWVAEEEDDNNNNHRPPQPILESALEKNMENYLQEQKERLEEEKAAIQDDRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 YPEGPVIEAWVAEEEDDNNNNHRPPQPILESALEKNMENYLQEQKERLEEEKAAIQDDRS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LVSEEKQKLLEEKEKMLEDLRREQQATELLAAKYKAMESKLLIGGRNIMDHTNEQQKMLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 LVSEEKQKLLEEKEKMLEDLRREQQATELLAAKYKAMESKLLIGGRNIMDHTNEQQKMLE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD LKRQEIAEQKRREREMQQEMMLRDEETMELRGTYTSLQQEVEVKTKKLKKLYAKLQAVKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 LKRQEIAEQKRREREMQQEMMLRDEETMELRGTYTSLQQEVEVKTKKLKKLYAKLQAVKA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD EIQDQHDEYIRVRQDLEEAQNEQTRELKLKYLIIENFIPPEEKNKIMNRLFLDCEEEQWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 EIQDQHDEYIRVRQDLEEAQNEQTRELKLKYLIIENFIPPEEKNKIMNRLFLDCEEEQWK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD FQPLVPAGVSSSQMKKRPTSAVGYKRPISQYARVAMAMGSHPRYRAENIMFLELDVSPPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 FQPLVPAGVSSSQMKKRPTSAVGYKRPISQYARVAMAMGSHPRYRAENIMFLELDVSPPA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD VFEMEFSHDQEQDPRALHMERLMRLDSFLERPSTSKVRKSRSWCQSPQRPPPSTTHASLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 VFEMEFSHDQEQDPRALHMERLMRLDSFLERPSTSKVRKSRSWCQSPQRPPPSTTHASLA
730 740 750 760 770 780
790
pF1KSD SASLRPATVADHE
:::::::::::::
CCDS17 SASLRPATVADHE
790
>>CCDS13200.1 KIF3B gene_id:9371|Hs108|chr20 (747 aa)
initn: 2445 init1: 1289 opt: 1315 Z-score: 720.2 bits: 144.0 E(32554): 8.5e-34
Smith-Waterman score: 2978; 61.9% identity (81.9% similar) in 790 aa overlap (3-788:2-741)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTLRNPRAAPGELPKTFTF
:: :.::...::.::::.. ::.::...... .:::::::...::... :.::::::
CCDS13 MSKLKSSESVRVVVRCRPMNGKEKAASYDKVVDVDVKLGQVSVKNPKGTAHEMPKTFTF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPELRGVI
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CCDS13 DAVYDWNAKQFELYDETFRPLVDSVLQGFNGTIFAYGQTGTGKTYTMEGIRGDPEKRGVI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PNAFEHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGVYIKDL
::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::. ::::::: :.::::.:::
CCDS13 PNSFDHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKDQTKRLELKERPDTGVYVKDL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIFIITVECSERGSDGQDHIRVG
::::::.:::::::::.:::.:.::.:.::: ::::::::.::.:::: : ::..:::::
CCDS13 SSFVTKSVKEIEHVMNVGNQNRSVGATNMNEHSSRSHAIFVITIECSEVGLDGENHIRVG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGGGSGGGAGGERPKEASKINLSLSAL
::::::::::::: :.: : ::: :::.:::::::::
CCDS13 KLNLVDLAGSERQAKTG------------------------AQGERLKEATKINLSLSAL
240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLSTLRFAN
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CCDS13 GNVISALVDGKSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTVMVANVGPASYNVEETLTTLRYAN
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIARLKAQLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAVSAPPG
:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.. :.: ::.. ::. . :. :
CCDS13 RAKNIKNKPRVNEDPKDALLREFQEEIARLKAQLEKRSI-GRRKRREK-RREGGGSGGGG
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD YPEGPVIEAWVAEEEDDNNNNHRPPQPILESALEKNMENYLQEQKERLEEEKAAIQDDRS
: :. .::: :.... : .::.:.:: :: :: .:.:
CCDS13 EEEEE--EGEEGEEEGDDKDD------------------YWREQQEKLEIEKRAIVEDHS
400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LVSEEKQKLLEEKEKMLEDLRREQQATELLAAKYKAMESKLLIGGRNIMDHTNEQQKMLE
::.:::..::.:::: .::::::..:.:.:.:: ::::::::.::.::.::::::::.::
CCDS13 LVAEEKMRLLKEKEKKMEDLRREKDAAEMLGAKIKAMESKLLVGGKNIVDHTNEQQKILE
440 450 460 470 480 490
550 560 570 580 590 600
pF1KSD LKRQEIAEQKRREREMQQEMMLRDEETMELRGTYTSLQQEVEVKTKKLKKLYAKLQAVKA
::::::::::::::.::.: :::::.::. ::.::::::..::::::::..:::::::
CCDS13 QKRQEIAEQKRREREIQQQMESRDEETLELKETYSSLQQEVDIKTKKLKKLFSKLQAVKA
500 510 520 530 540 550
610 620 630 640 650 660
pF1KSD EIQDQHDEYIRVRQDLEEAQNEQTRELKLKYLIIENFIPPEEKNKIMNRLFLDCEEEQWK
::.: ..:.:. ::.::..::: :::::::.:::::::: :::.::::: :.: ::..::
CCDS13 EIHDLQEEHIKERQELEQTQNELTRELKLKHLIIENFIPLEEKSKIMNRAFFDEEEDHWK
560 570 580 590 600 610
670 680 690 700 710 720
pF1KSD FQPLVPAGVSSSQMKKRPTSAVGYKRPISQYARVAMAMGSHPRYRAENIMFLELDVSPPA
..:.. . ..:: :::.::::::::.::.::..: . . :::::::..::::. .
CCDS13 LHPIT--RLENQQMMKRPVSAVGYKRPLSQHARMSMMIRPEARYRAENIVLLELDMPSRT
620 630 640 650 660 670
730 740 750 760 770
pF1KSD VFEME----FSHDQEQDPRALHMERLMRLDSFLERPSTSKVRKSRSWCQSPQRPPPSTTH
. ..: . : ::. : ...:. . ...: :.: .: .. :..
CCDS13 TRDYEGPAIAPKVQAALDAALQDEDEIQVDASSFESTANKKSKARP--KSGRKSGSSSSS
680 690 700 710 720
780 790
pF1KSD ASLASASLRPATVADHE
.. ...: : .
CCDS13 SGTPASQLYPQSRGLVPK
730 740
>>CCDS75296.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 (726 aa)
initn: 1464 init1: 551 opt: 940 Z-score: 520.9 bits: 107.1 E(32554): 1.1e-22
Smith-Waterman score: 1860; 44.3% identity (73.9% similar) in 698 aa overlap (4-687:8-670)
10 20 30 40 50
pF1KSD MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTLRNPRAAPGELPK
: .. . .:::.:::::...:.. ..: ...: : .:... .. .: ::
CCDS75 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGTITVHKTDSS-NEPPK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD TFTFDAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPEL
:::::.:. ::: :.:. :.::.:::::.:.:::.:::::::::::.::.:. . :::
CCDS75 TFTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIPEL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD RGVIPNAFEHIFTHISRSQ-NQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGV
::.:::.: ::: ::.... . ..:::.::::::.::.::::.:. .:::.:: :..::
CCDS75 RGIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDVGV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD YIKDLSSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIFIITVECSERGSDGQD
::::::..:..:. .....:.::...:.::.:.::: :::::::: ::.::::.: ::.
CCDS75 YIKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDGNM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD HIRVGKLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGGGSGGGAGGERPKEASKINL
:.:.:::.:::::::::: :.: : :.: :::.::::
CCDS75 HVRMGKLHLVDLAGSERQAKTG------------------------ATGQRLKEATKINL
240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD SLSALGNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLST
:::.:::::.::. ..:::.:::.::::::::::::::.::.: :..:::...:::..::
CCDS75 SLSTLGNVISALVDGKSTHVPYRNSKLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETIST
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LRFANRAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIARLKAQLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAV
::.:::::::::: :.::::::.:::.::.:: .:: .::. :. . : .
CCDS75 LRYANRAKNIKNKARINEDPKDALLRQFQKEIEELKKKLEE----GE----EISGSDISG
340 350 360 370 380
420 430 440 450 460
pF1KSD SAPPGYPEGPVIEAWVAEEE---DDNNNNHRPPQPILESALEKNMENY----------LQ
: :: : : ... ...... ..:. :.: . : .
CCDS75 SEEDDDEEGEVGEDGEKRKKRRGSSSSSSSDSTCSVIEKPLDKFLPNQAGKKKVSPDKMI
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KSD EQKERLEEEKAAIQDDRSLVSEEKQKLLEEKEKMLEDLRREQQATELLAAKYKAMESKLL
:.. ...::. :.. .. ::..: : :: .:: . :: . : : .:.:.:..
CCDS75 EMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARAELEKREKDLLKAQQEHQSLLEKLSALEKKVI
450 460 470 480 490 500
530 540 550 560 570 580
pF1KSD IGGRNIMDHTNEQQKMLELKRQEIAEQKRREREMQQEMMLRDEETMELRGTYTSLQQEVE
.:: ... ...::.:.:: . .:. :...: .....:. ...: .... :::::.:..
CCDS75 VGGVDLLAKAEEQEKLLEESNMELEERRKRAEQLRRELEEKEQERLDIEEKYTSLQEEAQ
510 520 530 540 550 560
590 600 610 620 630 640
pF1KSD VKTKKLKKLYAKLQAVKAEIQDQHDEYIRVRQDLEEAQNEQTRELKLKYLIIENFIPPEE
:::::::... :.:.:.:. : ..:. : . : : . .:::.:..:::.:::: .
CCDS75 GKTKKLKKVWTMLMAAKSEMADLQQEHQREIEGLLENIRQLSRELRLQMLIIDNFIPRDY
570 580 590 600 610 620
650 660 670 680 690 700
pF1KSD KNKIMNRLFLDCEEEQWKFQPLVPAGVSSSQMKKRPTSAVGYKRPISQYARVAMAMGSHP
.. : : . . . .:... .. .: ... :. :. : :
CCDS75 QEMIENYVHWNEDIGEWQLKCVAYTG--NNMRKQTPVPDKKEKDPFEVDLSHVYLAYTEE
630 640 650 660 670 680
710 720 730 740 750 760
pF1KSD RYRAENIMFLELDVSPPAVFEMEFSHDQEQDPRALHMERLMRLDSFLERPSTSKVRKSRS
CCDS75 SLRQSLMKLERPRTSKGKARPKTGRRKRSAKPETVIDSLLQ
690 700 710 720
>>CCDS44079.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1028 aa)
initn: 841 init1: 756 opt: 867 Z-score: 480.2 bits: 100.1 E(32554): 2e-20
Smith-Waterman score: 1419; 48.0% identity (70.2% similar) in 517 aa overlap (7-516:2-472)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTLRNPRAAPGELPKTFTF
::::.:::.::::....:. . ..:.: .: ..:: :: : :: :::
CCDS44 MASEAVKVVVRCRPMNQRERELRCQPVVTVDCARAQCCIQNPGAAD-EPPKQFTF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPELRGVI
:..: .. ..:.: . ::...: .:.:::.:::::::.::..:::: : ::.:
CCDS44 DGAYHVDHVTEQIYNEIAYPLVEGVTEGYNGTIFAYGQTGSGKSFTMQGLPDPPSQRGII
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PNAFEHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGVYIKDL
: ::::.: .. ..: ..::::::::::.:..::::. . ..:::::.:: :::.: :
CCDS44 PRAFEHVFESVQCAENTKFLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVYVKGL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIFIITVECSERGSDGQDHIRVG
: ....: . ::.:. : ..:.:: : ::. :::::.:: :..: : :.::.:.:
CCDS44 SMHTVHSVAQCEHIMETGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGKDHLRAG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGGGSGGGAGGERPKEASKINLSLSAL
:::::::::::::.:.: : ::: :::.:::::::::
CCDS44 KLNLVDLAGSERQSKTG------------------------ATGERLKEATKINLSLSAL
240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLSTLRFAN
::::.::. .: :.::::::::::::::::::.::.::: :.::...:::.:::::.::
CCDS44 GNVISALVDGRCKHVPYRDSKLTRLLQDSLGGNTKTLMVACLSPADNNYDETLSTLRYAN
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIARLKAQLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAVSAPPG
:::::.::::.::::::.::::.:::: .::: : .. : :. .. : ::
CCDS44 RAKNIRNKPRINEDPKDALLREYQEEIKKLKAILTQQ----MSPSSLSALLSRQV--PPD
340 350 360 370 380
430 440 450 460 470
pF1KSD YPEGPVIEAWVAEEEDDNNNNHRPPQPILESALEKNMENYLQEQKERLEEEKA---AIQD
:: : :. :::... .: . . .: .::: . :: : :.
CCDS44 ----PV---QVEEKLL--------PQPVIQHDVEAEKQLIREEYEERLARLKADYKAEQE
390 400 410 420
480 490 500 510 520 530
pF1KSD DRSLVSEEKQKLLEEKEKML----EDLRREQQATELLAAKYKAMESKLLIGGRNIMDHTN
.:. . :. . . . : :.::.: .:. ... :::
CCDS44 SRARLEEDITAMRNSYDVRLSTLEENLRKETEAVLQVGVLYKAEVMSRAEFASSAEYPPA
430 440 450 460 470 480
540 550 560 570 580 590
pF1KSD EQQKMLELKRQEIAEQKRREREMQQEMMLRDEETMELRGTYTSLQQEVEVKTKKLKKLYA
CCDS44 FQYETVVKPKVFSTTDTLPSDDVSKTQVSSRFAELPKVEPSKSEISLGSSESSSLEETSV
490 500 510 520 530 540
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10 20 30 40 50 60
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::::.:::.::::....:. . ..:.: .: ..:: :: : :: :::
CCDS21 MASEAVKVVVRCRPMNQRERELRCQPVVTVDCARAQCCIQNPGAAD-EPPKQFTF
10 20 30 40 50
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pF1KSD DAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPELRGVI
:..: .. ..:.: . ::...: .:.:::.:::::::.::..:::: : ::.:
CCDS21 DGAYHVDHVTEQIYNEIAYPLVEGVTEGYNGTIFAYGQTGSGKSFTMQGLPDPPSQRGII
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PNAFEHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGVYIKDL
: ::::.: .. ..: ..::::::::::.:..::::. . ..:::::.:: :::.: :
CCDS21 PRAFEHVFESVQCAENTKFLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVYVKGL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIFIITVECSERGSDGQDHIRVG
: ....: . ::.:. : ..:.:: : ::. :::::.:: :..: : :.::.:.:
CCDS21 SMHTVHSVAQCEHIMETGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGKDHLRAG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGGGSGGGAGGERPKEASKINLSLSAL
:::::::::::::.:.: : ::: :::.:::::::::
CCDS21 KLNLVDLAGSERQSKTG------------------------ATGERLKEATKINLSLSAL
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310 320 330 340 350 360
pF1KSD GNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLSTLRFAN
::::.::. .: :.::::::::::::::::::.::.::: :.::...:::.:::::.::
CCDS21 GNVISALVDGRCKHVPYRDSKLTRLLQDSLGGNTKTLMVACLSPADNNYDETLSTLRYAN
280 290 300 310 320 330
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pF1KSD RAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIARLKAQLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAVSAPPG
:::::.::::.::::::.::::.:::: .::: : .. : :. .. : ::
CCDS21 RAKNIRNKPRINEDPKDALLREYQEEIKKLKAILTQQ----MSPSSLSALLSRQV--PPD
340 350 360 370 380
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pF1KSD YPEGPVIEAWVAEEEDDNNNNHRPPQPILESALEKNMENYLQEQKERLEEEKA---AIQD
:: : :. :::... .: . . .: .::: . :: : :.
CCDS21 ----PV---QVEEKLL--------PQPVIQHDVEAEKQLIREEYEERLARLKADYKAEQE
390 400 410 420
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pF1KSD DRSLVSEEKQKLLEEKEKML----EDLRREQQATELLAAKYKAMESKLLIGGRNIMDHTN
.:. . :. . . . : :.::.: .:. ... :::
CCDS21 SRARLEEDITAMRNSYDVRLSTLEENLRKETEAVLQVGVLYKAEVMSRAEFASSAEYPPA
430 440 450 460 470 480
540 550 560 570 580 590
pF1KSD EQQKMLELKRQEIAEQKRREREMQQEMMLRDEETMELRGTYTSLQQEVEVKTKKLKKLYA
CCDS21 FQYETVVKPKVFSTTDTLPSDDVSKTQVSSRFAELPKVEPSKSEISLGSSESSSLEETSV
490 500 510 520 530 540
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pF1KSD TVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPELRGVIPNAFEHIFTHISRSQN
::: : ::.:: ::::.: .. ..:
CCDS72 MQGLPDPPSQRGIIPRAFEHVFESVQCAEN
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140 150 160 170 180 190
pF1KSD QQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGVYIKDLSSFVTKNVKEIEHVMN
..::::::::::.:..::::. . ..:::::.:: :::.: :: ....: . ::.:.
CCDS72 TKFLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVYVKGLSMHTVHSVAQCEHIME
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KSD LGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIFIITVECSERGSDGQDHIRVGKLNLVDLAGSERQNKA
: ..:.:: : ::. :::::.:: :..: : :.::.:.::::::::::::::.:.
CCDS72 TGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGKDHLRAGKLNLVDLAGSERQSKT
100 110 120 130 140 150
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pF1KSD GPNTAGGAATPSSGGGGGGGGSGGGAGGERPKEASKINLSLSALGNVIAALAGNRSTHIP
: : ::: :::.:::::::::::::.::. .: :.:
CCDS72 G------------------------ATGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGRCKHVP
160 170 180
320 330 340 350 360 370
pF1KSD YRDSKLTRLLQDSLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLSTLRFANRAKNIKNKPRVNEDPK
:::::::::::::::::.::.::: :.::...:::.:::::.:::::::.::::.:::::
CCDS72 YRDSKLTRLLQDSLGGNTKTLMVACLSPADNNYDETLSTLRYANRAKNIRNKPRINEDPK
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pF1KSD DTLLREFQEEIARLKAQLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAVSAPPGYPEGPVIEAWVAEEED
:.::::.:::: .::: : .. : :. .. : :: :: : :.
CCDS72 DALLREYQEEIKKLKAILTQQ----MSPSSLSALLSRQV--PPD----PV---QVEEKLL
250 260 270 280 290
440 450 460 470 480 490
pF1KSD DNNNNHRPPQPILESALEKNMENYLQEQKERLEEEKA---AIQDDRSLVSEEKQKLLEEK
:::... .: . . .: .::: . :: : :..:. . :. . .
CCDS72 --------PQPVIQHDVEAEKQLIREEYEERLARLKADYKAEQESRARLEEDITAMRNSY
300 310 320 330 340
500 510 520 530 540
pF1KSD EKML----EDLRREQQATELLAAKYKAMESKLLIGGRNIMDHTNEQQKMLELKRQEIAEQ
. : :.::.: .:. ... :::
CCDS72 DVRLSTLEENLRKETEAVLQVGVLYKAEVMSRAEFASSAEYPPAFQYETVVKPKVFSTTD
350 360 370 380 390 400
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pF1KSD MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTLRNPRAAPGELPK
: .. . .:::.:::::...:.. ..: ...: : .:... .. .: ::
CCDS75 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGTITVHKTDSS-NEPPK
10 20 30 40 50
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pF1KSD TFTFDAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPEL
:::::.:. ::: :.:. :.::.:::::.:.:::.:::::::::::.::.:. . :::
CCDS75 TFTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIPEL
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD RGVIPNAFEHIFTHISRSQ-NQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGV
::.:::.: ::: ::.... . ..:::.::::::.::.::::.:. .:::.:: :..::
CCDS75 RGIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDVGV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD YIKDLSSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIFIITVECSERGSDGQD
::::::..:..:. .....:.::...:.::.:.::: :::::::: ::.::::.: ::.
CCDS75 YIKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDGNM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD HIRVGKLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGGGSGGGAGGERPKEASKINL
:.:.:::.:::::::::: :.: : :.: :::.::::
CCDS75 HVRMGKLHLVDLAGSERQAKTG------------------------ATGQRLKEATKINL
240 250 260 270
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pF1KSD SLSALGNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLST
:::.:::::.::. ..:::.:::.::::::::::::::.::.: :..:::...:::..::
CCDS75 SLSTLGNVISALVDGKSTHVPYRNSKLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETIST
280 290 300 310 320 330
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pF1KSD LRFANRAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIARLKAQLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAV
::.:::::::::: :.::::::.:::.::.:: .:: .::. :. . : .
CCDS75 LRYANRAKNIKNKARINEDPKDALLRQFQKEIEELKKKLEE----GE----EISGSDISG
340 350 360 370 380
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pF1KSD SAPPGYPEGPVIEAWVAEEEDDNNNNHRPPQPILESALEKNMENYLQEQKERLEEEKAAI
: :: : :: .. ..: : .. .: . . :.. ...::. :.
CCDS75 SEEDDDEEGEV-------GEDGEKRKKRRDQ----AGKKKVSPDKMIEMQAKIDEERKAL
390 400 410 420 430
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pF1KSD QDDRSLVSEEKQKLLEEKEKMLEDLRREQQATELLAAKYKAMESKLLIGGRNIMDHTNEQ
. .. ::..: : :: .:: . :: . : : .:.:.:...:: ... ...::
CCDS75 ETKLDMEEEERNKARAELEKREKDLLKAQQEHQSLLEKLSALEKKVIVGGVDLLAKAEEQ
440 450 460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KSD QKMLELKRQEIAEQKRREREMQQEMMLRDEETMELRGTYTSLQQEVEVKTKKLKKLYAKL
.:.:: . .:. :...: .....:. ...: .... :::::.:.. :::::::... :
CCDS75 EKLLEESNMELEERRKRAEQLRRELEEKEQERLDIEEKYTSLQEEAQGKTKKLKKVWTML
500 510 520 530 540 550
600 610 620 630 640 650
pF1KSD QAVKAEIQDQHDEYIRVRQDLEEAQNEQTRELKLKYLIIENFIPPEEKNKIMNRLFLDCE
.:.:.:. : ..:. : . : : . .:::.:..:::.:::: . .. : : . . .
CCDS75 MAAKSEMADLQQEHQREIEGLLENIRQLSRELRLQMLIIDNFIPRDYQEMIENYVHWNED
560 570 580 590 600 610
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pF1KSD EEQWKFQPLVPAGVSSSQMKKRPTSAVGYKRPISQYARVAMAMGSHPRYRAENIMFLELD
.:... .. .: ... :. :. : :
CCDS75 IGEWQLKCVAYTG--NNMRKQTPVPDKKEKDPFEVDLSHVYLAYTEESLRQSLMKLERPR
620 630 640 650 660 670
720 730 740 750 760 770
pF1KSD VSPPAVFEMEFSHDQEQDPRALHMERLMRLDSFLERPSTSKVRKSRSWCQSPQRPPPSTT
CCDS75 TSKGKARPKTGRRKRSAKPETVIDSLLQ
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.::..: :: ::. : .: : .:: .:.. :. :.::.
CCDS58 MAGQGDCCVKVAVRIRPQLSKEKIEGC-HICT------SVTPGEPQVLLGK-DKAFTY
10 20 30 40 50
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pF1KSD DAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVE----PEL
: :.: .. : ..:. : ::.. ..:.:.::.::::::.:::::: :: . :
CCDS58 DFVFDLDTWQEQIYSTCVSKLIEGCFEGYNATVLAYGQTGAGKTYTM-GTGFDMATSEEE
60 70 80 90 100
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pF1KSD RGVIPNAFEHIFTHIS----RSQNQ-----QYLVRASYLEIYQEEIRDLL--SKEPGKR-
.:.:: :. :.: :. :.:.: .. : :..::.:.::: ::. ...: :
CCDS58 QGIIPRAIAHLFGGIAERKRRAQEQGVAGPEFKVSAQFLELYNEEILDLFDSTRDPDTRH
110 120 130 140 150 160
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pF1KSD ----LELKENPETGVYIKDLSSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIF
....:. . :.: ..: . .. .:. . .. : .:...::.:: ::::::::
CCDS58 RRSNIKIHEDANGGIYTTGVTSRLIHSQEELIQCLKQGALSRTTASTQMNVQSSRSHAIF
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pF1KSD IITVECSERGSDGQDHIRVGKLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGGGSGG
: . :. : : . . .: : :. ... :: . .:. .
CCDS58 TIHL-CQMRMCTQPDLVNEAVTGLPD--GTPPSSEYETLTAKFHFVDLAGSE---RLKRT
230 240 250 260 270 280
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pF1KSD GAGGERPKEASKINLSLSALGNVIAALAGNRS---THIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTI
:: ::: ::. .:: .: ::::::.:: :..: .:.::::::::::::::::::..::
CCDS58 GATGERAKEGISINCGLLALGNVISAL-GDQSKKVVHVPYRDSKLTRLLQDSLGGNSQTI
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KSD MVATLGPASHSYDESLSTLRFANRAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIARLKAQLEKR
:.: ..:..... :.:.::..::::.::::: ::.: . . .. :::::. .: .
CCDS58 MIACVSPSDRDFMETLNTLKYANRARNIKNKVVVNQDKTSQQISALRAEIARLQMELMEY
350 360 370 380 390 400
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pF1KSD GMLGKRPRRKSSRRKKAVSAPPGYPEGPVIEAWVAEEEDDNNNNHRPPQPILESALE--K
:...: . .. :: . .: . .: :. : .. :.. .
CCDS58 ---------KAGKRVIGEDGAEGYSDLFRENAMLQKE----NGALRLRVKAMQEAIDAIN
410 420 430 440
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pF1KSD NMENYLQEQKERLEEEKAA---------IQDDRSLVSEEKQKLLEEKEKMLEDLRRE-QQ
: . :. :. : ::. ::. . : . :::: .: : :.::: ..
CCDS58 NRVTQLMSQEANLLLAKAGDGNEAIGALIQNYIREIEELRTKLLE-SEAMNESLRRSLSR
450 460 470 480 490 500
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pF1KSD ATELLAAKYKAMESKLLIGGR--NIMDHTNE-----QQKMLELKRQEIAEQKRR--ERE-
:. . : . .:: . :. ..: .: . .::..:. .:.:. :.:
CCDS58 ASARSPYSLGASPAAPAFGGSPASSMEDASEVIRRAKQDLERLKKKEV-RQRRKSPEKEA
510 520 530 540 550 560
560 570 580 590 600 610
pF1KSD MQQEMMLRDEETMELRGTYTSLQQEVEVKTKKLKKLYAKLQAVKAEIQDQHDEYIRVRQD
.... :..:.. : :. .. : . .. .. . .. . : .:. .: : .:
CCDS58 FKKRAKLQQENSEE-----TDENEAEEEEEERDESGCEEEEGREDEDEDSGSEESLVDSD
570 580 590 600 610 620
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pF1KSD LEEAQNEQTRELKLKYLIIENFIPPEEKNKIMNRLFLDCEEEQWKFQPLVPAGVSSSQMK
. ..: . . : : : : :.:....: :. : ..: :
CCDS58 SDPEEKEVNFQADLADLTCEIEI----KQKLIDEL----ENSQRRLQTLKHQYEEKLILL
630 640 650 660 670
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pF1KSD KRPTSAVGYKRPISQYARVAMAMGSHPRYRAENIMFLELDVSPPAVFEMEFSHDQEQDPR
CCDS58 QNKIRDTQLERDRVLQNLSTMECYTEEKANKIKADYEKRLREMNRDLQKLQAAQKEHARL
680 690 700 710 720 730
>>CCDS58055.1 KIF21B gene_id:23046|Hs108|chr1 (1623 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTLRNPRAAPGELPKTFTF
.::..: :: ::. : .: : .:: .:.. :. :.::.
CCDS58 MAGQGDCCVKVAVRIRPQLSKEKIEGC-HICT------SVTPGEPQVLLGK-DKAFTY
10 20 30 40 50
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pF1KSD DAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVE----PEL
: :.: .. : ..:. : ::.. ..:.:.::.::::::.:::::: :: . :
CCDS58 DFVFDLDTWQEQIYSTCVSKLIEGCFEGYNATVLAYGQTGAGKTYTM-GTGFDMATSEEE
60 70 80 90 100
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pF1KSD RGVIPNAFEHIFTHIS----RSQNQ-----QYLVRASYLEIYQEEIRDLL--SKEPGKR-
.:.:: :. :.: :. :.:.: .. : :..::.:.::: ::. ...: :
CCDS58 QGIIPRAIAHLFGGIAERKRRAQEQGVAGPEFKVSAQFLELYNEEILDLFDSTRDPDTRH
110 120 130 140 150 160
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pF1KSD ----LELKENPETGVYIKDLSSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIF
....:. . :.: ..: . .. .:. . .. : .:...::.:: ::::::::
CCDS58 RRSNIKIHEDANGGIYTTGVTSRLIHSQEELIQCLKQGALSRTTASTQMNVQSSRSHAIF
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KSD IITVECSERGSDGQDHIRVGKLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGGGSGG
: . :. : : . . .: : :. ... :: . .:. .
CCDS58 TIHL-CQMRMCTQPDLVNEAVTGLPD--GTPPSSEYETLTAKFHFVDLAGSE---RLKRT
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