Result of FASTA (ccds) for pF1KSDB0059
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDB0059, 1137 aa
  1>>>pF1KSDB0059 1137 - 1137 aa - 1137 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3801+/-0.000832; mu= 22.4602+/- 0.050
 mean_var=78.1053+/-15.650, 0's: 0 Z-trim(107.8): 32  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.145122
 statistics sampled from 9756 (9787) to 9756 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.301), width:  16
 Scan time:  4.520

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8888.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12          (1137) 7704 1623.2       0
CCDS55832.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12         (1141) 7444 1568.8       0
CCDS44914.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12         (1044) 6509 1373.0       0
CCDS2249.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2           (1073) 3020 642.5 1.5e-183
CCDS46451.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2          (1091) 3020 642.5 1.5e-183
CCDS82534.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2          ( 954) 2582 550.8 5.6e-156
CCDS2669.1 ITGA9 gene_id:3680|Hs108|chr3           (1035)  811 180.0 2.5e-44
CCDS42788.1 ITGA4 gene_id:3676|Hs108|chr2          (1032)  634 142.9 3.5e-33
CCDS32433.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16         (1170)  559 127.3 2.1e-28
CCDS45291.1 ITGA11 gene_id:22801|Hs108|chr15       (1188)  553 126.0   5e-28
CCDS45461.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16         (1086)  552 125.8 5.4e-28
CCDS11558.1 ITGA3 gene_id:3675|Hs108|chr17         (1051)  549 125.2 8.2e-28
CCDS45470.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16         (1152)  468 108.2 1.1e-22
CCDS54004.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16         (1153)  466 107.8 1.5e-22
CCDS10711.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16         (1163)  446 103.6 2.8e-21
CCDS67014.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16         (1169)  446 103.6 2.8e-21
CCDS32531.1 ITGAE gene_id:3682|Hs108|chr17         (1179)  442 102.8   5e-21
CCDS32438.1 ITGAD gene_id:3681|Hs108|chr16         (1161)  434 101.1 1.6e-20
CCDS31155.1 ITGA8 gene_id:8516|Hs108|chr10         (1063)  433 100.9 1.7e-20
CCDS32665.1 ITGA2B gene_id:3674|Hs108|chr17        (1039)  412 96.5 3.5e-19
CCDS46471.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2          (1002)  369 87.5 1.7e-16
CCDS46470.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2          (1012)  369 87.5 1.8e-16
CCDS2292.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2           (1048)  369 87.5 1.8e-16


>>CCDS8888.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12               (1137 aa)
 initn: 7704 init1: 7704 opt: 7704  Z-score: 8708.3  bits: 1623.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7704; 100.0% identity (100.0% similar) in 1137 aa overlap (1-1137:1-1137)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAGARSRDPWGASGICYLFGSLLVELLFSRAVAFNLDVMGALRKEGEPGSLFGFSVALHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 MAGARSRDPWGASGICYLFGSLLVELLFSRAVAFNLDVMGALRKEGEPGSLFGFSVALHR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD QLQPRPQSWLLVGAPQALALPGQQANRTGGLFACPLSLEETDCYRVDIDQGADMQKESKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 QLQPRPQSWLLVGAPQALALPGQQANRTGGLFACPLSLEETDCYRVDIDQGADMQKESKE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD NQWLGVSVRSQGPGGKIVTCAHRYEARQRVDQILETRDMIGRCFVLSQDLAIRDELDGGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 NQWLGVSVRSQGPGGKIVTCAHRYEARQRVDQILETRDMIGRCFVLSQDLAIRDELDGGE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD WKFCEGRPQGHEQFGFCQQGTAAAFSPDSHYLLFGAPGTYNWKGLLFVTNIDSSDPDQLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 WKFCEGRPQGHEQFGFCQQGTAAAFSPDSHYLLFGAPGTYNWKGLLFVTNIDSSDPDQLV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD YKTLDPADRLPGPAGDLALNSYLGFSIDSGKGLVRAEELSFVAGAPRANHKGAVVILRKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 YKTLDPADRLPGPAGDLALNSYLGFSIDSGKGLVRAEELSFVAGAPRANHKGAVVILRKD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SASRLVPEVMLSGERLTSGFGYSLAVADLNSDGWPDLIVGAPYFFERQEELGGAVYVYLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 SASRLVPEVMLSGERLTSGFGYSLAVADLNSDGWPDLIVGAPYFFERQEELGGAVYVYLN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD QGGHWAGISPLRLCGSPDSMFGISLAVLGDLNQDGFPDIAVGAPFDGDGKVFIYHGSSLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 QGGHWAGISPLRLCGSPDSMFGISLAVLGDLNQDGFPDIAVGAPFDGDGKVFIYHGSSLG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD VVAKPSQVLEGEAVGIKSFGYSLSGSLDMDGNQYPDLLVGSLADTAVLFRARPILHVSHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 VVAKPSQVLEGEAVGIKSFGYSLSGSLDMDGNQYPDLLVGSLADTAVLFRARPILHVSHE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD VSIAPRSIDLEQPNCAGGHSVCVDLRVCFSYIAVPSSYSPTVALDYVLDADTDRRLRGQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 VSIAPRSIDLEQPNCAGGHSVCVDLRVCFSYIAVPSSYSPTVALDYVLDADTDRRLRGQV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD PRVTFLSRNLEEPKHQASGTVWLKHQHDRVCGDAMFQLQENVKDKLRAIVVTLSYSLQTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PRVTFLSRNLEEPKHQASGTVWLKHQHDRVCGDAMFQLQENVKDKLRAIVVTLSYSLQTP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD RLRRQAPGQGLPPVAPILNAHQPSTQRAEIHFLKQGCGEDKICQSNLQLVRARFCTRVSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 RLRRQAPGQGLPPVAPILNAHQPSTQRAEIHFLKQGCGEDKICQSNLQLVRARFCTRVSD
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD TEFQPLPMDVDGTTALFALSGQPVIGLELMVTNLPSDPAQPQADGDDAHEAQLLVMLPDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 TEFQPLPMDVDGTTALFALSGQPVIGLELMVTNLPSDPAQPQADGDDAHEAQLLVMLPDS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD LHYSGVRALDPAEKPLCLSNENASHVECELGNPMKRGAQVTFYLILSTSGISIETTELEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LHYSGVRALDPAEKPLCLSNENASHVECELGNPMKRGAQVTFYLILSTSGISIETTELEV
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD ELLLATISEQELHPVSARARVFIELPLSIAGMAIPQQLFFSGVVRGERAMQSERDVGSKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 ELLLATISEQELHPVSARARVFIELPLSIAGMAIPQQLFFSGVVRGERAMQSERDVGSKV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD KYEVTVSNQGQSLRTLGSAFLNIMWPHEIANGKWLLYPMQVELEGGQGPGQKGLCSPRPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 KYEVTVSNQGQSLRTLGSAFLNIMWPHEIANGKWLLYPMQVELEGGQGPGQKGLCSPRPN
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD ILHLDVDSRDRRRRELEPPEQQEPGERQEPSMSWWPVSSAEKKKNITLDCARGTANCVVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 ILHLDVDSRDRRRRELEPPEQQEPGERQEPSMSWWPVSSAEKKKNITLDCARGTANCVVF
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD SCPLYSFDRAAVLHVWGRLWNSTFLEEYSAVKSLEVIVRANITVKSSIKNLMLRDASTVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 SCPLYSFDRAAVLHVWGRLWNSTFLEEYSAVKSLEVIVRANITVKSSIKNLMLRDASTVI
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD PVMVYLDPMAVVAEGVPWWVILLAVLAGLLVLALLVLLLWKMGFFKRAKHPEATVPQYHA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PVMVYLDPMAVVAEGVPWWVILLAVLAGLLVLALLVLLLWKMGFFKRAKHPEATVPQYHA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130       
pF1KSD VKIPREDRQQFKEEKTGTILRNNWGSPRREGPDAHPILAADGHPELGPDGHPGPGTA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 VKIPREDRQQFKEEKTGTILRNNWGSPRREGPDAHPILAADGHPELGPDGHPGPGTA
             1090      1100      1110      1120      1130       

>>CCDS55832.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12              (1141 aa)
 initn: 7454 init1: 5898 opt: 7444  Z-score: 8414.1  bits: 1568.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7444; 97.0% identity (97.3% similar) in 1148 aa overlap (1-1137:1-1141)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAGARSRDPWGASGICYLFGSLLVELLFSRAVAFNLDVMGALRKEGEPGSLFGFSVALHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MAGARSRDPWGASGICYLFGSLLVELLFSRAVAFNLDVMGALRKEGEPGSLFGFSVALHR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD QLQPRPQSWLLVGAPQALALPGQQANRTGGLFACPLSLEETDCYRVDIDQGADMQKESKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QLQPRPQSWLLVGAPQALALPGQQANRTGGLFACPLSLEETDCYRVDIDQGADMQKESKE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD NQWLGVSVRSQGPGGKIVTCAHRYEARQRVDQILETRDMIGRCFVLSQDLAIRDELDGGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NQWLGVSVRSQGPGGKIVTCAHRYEARQRVDQILETRDMIGRCFVLSQDLAIRDELDGGE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220            230     
pF1KSD WKFCEGRPQGHEQFGFCQQGTAAAFSPDSHYLLFGAPGTYNWKGLLFVT-----NIDSSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::   :      . : . 
CCDS55 WKFCEGRPQGHEQFGFCQQGTAAAFSPDSHYLLFGAPGTYNWKGTARVELCAQGSADLAH
              190       200       210       220       230       240

         240            250        260       270       280         
pF1KSD PDQLVY-----KTLDPADRL-PGPAGDLALNSYLGFSIDSGKGLVRAEELSFVAGAPRAN
        :.  :     :  ::  :: : ::     :::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LDDGPYEAGGEKEQDP--RLIPVPA-----NSYFGFSIDSGKGLVRAEELSFVAGAPRAN
              250         260            270       280       290   

     290       300       310       320       330       340         
pF1KSD HKGAVVILRKDSASRLVPEVMLSGERLTSGFGYSLAVADLNSDGWPDLIVGAPYFFERQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HKGAVVILRKDSASRLVPEVMLSGERLTSGFGYSLAVADLNSDGWPDLIVGAPYFFERQE
           300       310       320       330       340       350   

     350       360       370       380       390       400         
pF1KSD ELGGAVYVYLNQGGHWAGISPLRLCGSPDSMFGISLAVLGDLNQDGFPDIAVGAPFDGDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ELGGAVYVYLNQGGHWAGISPLRLCGSPDSMFGISLAVLGDLNQDGFPDIAVGAPFDGDG
           360       370       380       390       400       410   

     410       420       430       440       450       460         
pF1KSD KVFIYHGSSLGVVAKPSQVLEGEAVGIKSFGYSLSGSLDMDGNQYPDLLVGSLADTAVLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KVFIYHGSSLGVVAKPSQVLEGEAVGIKSFGYSLSGSLDMDGNQYPDLLVGSLADTAVLF
           420       430       440       450       460       470   

     470       480       490       500       510       520         
pF1KSD RARPILHVSHEVSIAPRSIDLEQPNCAGGHSVCVDLRVCFSYIAVPSSYSPTVALDYVLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RARPILHVSHEVSIAPRSIDLEQPNCAGGHSVCVDLRVCFSYIAVPSSYSPTVALDYVLD
           480       490       500       510       520       530   

     530       540       550       560       570       580         
pF1KSD ADTDRRLRGQVPRVTFLSRNLEEPKHQASGTVWLKHQHDRVCGDAMFQLQENVKDKLRAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ADTDRRLRGQVPRVTFLSRNLEEPKHQASGTVWLKHQHDRVCGDAMFQLQENVKDKLRAI
           540       550       560       570       580       590   

     590       600       610       620       630       640         
pF1KSD VVTLSYSLQTPRLRRQAPGQGLPPVAPILNAHQPSTQRAEIHFLKQGCGEDKICQSNLQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VVTLSYSLQTPRLRRQAPGQGLPPVAPILNAHQPSTQRAEIHFLKQGCGEDKICQSNLQL
           600       610       620       630       640       650   

     650       660       670       680       690       700         
pF1KSD VRARFCTRVSDTEFQPLPMDVDGTTALFALSGQPVIGLELMVTNLPSDPAQPQADGDDAH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VRARFCTRVSDTEFQPLPMDVDGTTALFALSGQPVIGLELMVTNLPSDPAQPQADGDDAH
           660       670       680       690       700       710   

     710       720       730       740       750       760         
pF1KSD EAQLLVMLPDSLHYSGVRALDPAEKPLCLSNENASHVECELGNPMKRGAQVTFYLILSTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EAQLLVMLPDSLHYSGVRALDPAEKPLCLSNENASHVECELGNPMKRGAQVTFYLILSTS
           720       730       740       750       760       770   

     770       780       790       800       810       820         
pF1KSD GISIETTELEVELLLATISEQELHPVSARARVFIELPLSIAGMAIPQQLFFSGVVRGERA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GISIETTELEVELLLATISEQELHPVSARARVFIELPLSIAGMAIPQQLFFSGVVRGERA
           780       790       800       810       820       830   

     830       840       850       860       870       880         
pF1KSD MQSERDVGSKVKYEVTVSNQGQSLRTLGSAFLNIMWPHEIANGKWLLYPMQVELEGGQGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MQSERDVGSKVKYEVTVSNQGQSLRTLGSAFLNIMWPHEIANGKWLLYPMQVELEGGQGP
           840       850       860       870       880       890   

     890       900       910       920       930       940         
pF1KSD GQKGLCSPRPNILHLDVDSRDRRRRELEPPEQQEPGERQEPSMSWWPVSSAEKKKNITLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GQKGLCSPRPNILHLDVDSRDRRRRELEPPEQQEPGERQEPSMSWWPVSSAEKKKNITLD
           900       910       920       930       940       950   

     950       960       970       980       990      1000         
pF1KSD CARGTANCVVFSCPLYSFDRAAVLHVWGRLWNSTFLEEYSAVKSLEVIVRANITVKSSIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 CARGTANCVVFSCPLYSFDRAAVLHVWGRLWNSTFLEEYSAVKSLEVIVRANITVKSSIK
           960       970       980       990      1000      1010   

    1010      1020      1030      1040      1050      1060         
pF1KSD NLMLRDASTVIPVMVYLDPMAVVAEGVPWWVILLAVLAGLLVLALLVLLLWKMGFFKRAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NLMLRDASTVIPVMVYLDPMAVVAEGVPWWVILLAVLAGLLVLALLVLLLWKMGFFKRAK
          1020      1030      1040      1050      1060      1070   

    1070      1080      1090      1100      1110      1120         
pF1KSD HPEATVPQYHAVKIPREDRQQFKEEKTGTILRNNWGSPRREGPDAHPILAADGHPELGPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HPEATVPQYHAVKIPREDRQQFKEEKTGTILRNNWGSPRREGPDAHPILAADGHPELGPD
          1080      1090      1100      1110      1120      1130   

    1130       
pF1KSD GHPGPGTA
       ::::::::
CCDS55 GHPGPGTA
          1140 

>>CCDS44914.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12              (1044 aa)
 initn: 6511 init1: 5898 opt: 6509  Z-score: 7356.7  bits: 1373.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6509; 94.7% identity (95.8% similar) in 1036 aa overlap (114-1137:17-1044)

            90       100       110       120        130       140  
pF1KSD QANRTGGLFACPLSLEETDCYRVDIDQGADMQKESKENQ-WLGVSVRSQGPGGKIVTCAH
                                     .:....  : :   ..: .   ::  ::::
CCDS44               MAPFATPMVQALTTTRIQRQAEGFQCWRECGTRRSPFEGK-ETCAH
                             10        20        30        40      

            150       160       170       180       190       200  
pF1KSD RYEARQRVDQILETRDMIGRCFVLSQDLAIRDELDGGEWKFCEGRPQGHEQFGFCQQGTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RYEARQRVDQILETRDMIGRCFVLSQDLAIRDELDGGEWKFCEGRPQGHEQFGFCQQGTA
          50        60        70        80        90       100     

            210       220            230       240            250  
pF1KSD AAFSPDSHYLLFGAPGTYNWKGLLFVT-----NIDSSDPDQLVY-----KTLDPADRL-P
       ::::::::::::::::::::::   :      . : .  :.  :     :  ::  :: :
CCDS44 AAFSPDSHYLLFGAPGTYNWKGTARVELCAQGSADLAHLDDGPYEAGGEKEQDP--RLIP
         110       120       130       140       150         160   

             260       270       280       290       300       310 
pF1KSD GPAGDLALNSYLGFSIDSGKGLVRAEELSFVAGAPRANHKGAVVILRKDSASRLVPEVML
        ::     :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VPA-----NSYFGFSIDSGKGLVRAEELSFVAGAPRANHKGAVVILRKDSASRLVPEVML
                170       180       190       200       210        

             320       330       340       350       360       370 
pF1KSD SGERLTSGFGYSLAVADLNSDGWPDLIVGAPYFFERQEELGGAVYVYLNQGGHWAGISPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SGERLTSGFGYSLAVADLNSDGWPDLIVGAPYFFERQEELGGAVYVYLNQGGHWAGISPL
      220       230       240       250       260       270        

             380       390       400       410       420       430 
pF1KSD RLCGSPDSMFGISLAVLGDLNQDGFPDIAVGAPFDGDGKVFIYHGSSLGVVAKPSQVLEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RLCGSPDSMFGISLAVLGDLNQDGFPDIAVGAPFDGDGKVFIYHGSSLGVVAKPSQVLEG
      280       290       300       310       320       330        

             440       450       460       470       480       490 
pF1KSD EAVGIKSFGYSLSGSLDMDGNQYPDLLVGSLADTAVLFRARPILHVSHEVSIAPRSIDLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EAVGIKSFGYSLSGSLDMDGNQYPDLLVGSLADTAVLFRARPILHVSHEVSIAPRSIDLE
      340       350       360       370       380       390        

             500       510       520       530       540       550 
pF1KSD QPNCAGGHSVCVDLRVCFSYIAVPSSYSPTVALDYVLDADTDRRLRGQVPRVTFLSRNLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QPNCAGGHSVCVDLRVCFSYIAVPSSYSPTVALDYVLDADTDRRLRGQVPRVTFLSRNLE
      400       410       420       430       440       450        

             560       570       580       590       600       610 
pF1KSD EPKHQASGTVWLKHQHDRVCGDAMFQLQENVKDKLRAIVVTLSYSLQTPRLRRQAPGQGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EPKHQASGTVWLKHQHDRVCGDAMFQLQENVKDKLRAIVVTLSYSLQTPRLRRQAPGQGL
      460       470       480       490       500       510        

             620       630       640       650       660       670 
pF1KSD PPVAPILNAHQPSTQRAEIHFLKQGCGEDKICQSNLQLVRARFCTRVSDTEFQPLPMDVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PPVAPILNAHQPSTQRAEIHFLKQGCGEDKICQSNLQLVRARFCTRVSDTEFQPLPMDVD
      520       530       540       550       560       570        

             680       690       700       710       720       730 
pF1KSD GTTALFALSGQPVIGLELMVTNLPSDPAQPQADGDDAHEAQLLVMLPDSLHYSGVRALDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GTTALFALSGQPVIGLELMVTNLPSDPAQPQADGDDAHEAQLLVMLPDSLHYSGVRALDP
      580       590       600       610       620       630        

             740       750       760       770       780       790 
pF1KSD AEKPLCLSNENASHVECELGNPMKRGAQVTFYLILSTSGISIETTELEVELLLATISEQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AEKPLCLSNENASHVECELGNPMKRGAQVTFYLILSTSGISIETTELEVELLLATISEQE
      640       650       660       670       680       690        

             800       810       820       830       840       850 
pF1KSD LHPVSARARVFIELPLSIAGMAIPQQLFFSGVVRGERAMQSERDVGSKVKYEVTVSNQGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LHPVSARARVFIELPLSIAGMAIPQQLFFSGVVRGERAMQSERDVGSKVKYEVTVSNQGQ
      700       710       720       730       740       750        

             860       870       880       890       900       910 
pF1KSD SLRTLGSAFLNIMWPHEIANGKWLLYPMQVELEGGQGPGQKGLCSPRPNILHLDVDSRDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SLRTLGSAFLNIMWPHEIANGKWLLYPMQVELEGGQGPGQKGLCSPRPNILHLDVDSRDR
      760       770       780       790       800       810        

             920       930       940       950       960       970 
pF1KSD RRRELEPPEQQEPGERQEPSMSWWPVSSAEKKKNITLDCARGTANCVVFSCPLYSFDRAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RRRELEPPEQQEPGERQEPSMSWWPVSSAEKKKNITLDCARGTANCVVFSCPLYSFDRAA
      820       830       840       850       860       870        

             980       990      1000      1010      1020      1030 
pF1KSD VLHVWGRLWNSTFLEEYSAVKSLEVIVRANITVKSSIKNLMLRDASTVIPVMVYLDPMAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VLHVWGRLWNSTFLEEYSAVKSLEVIVRANITVKSSIKNLMLRDASTVIPVMVYLDPMAV
      880       890       900       910       920       930        

            1040      1050      1060      1070      1080      1090 
pF1KSD VAEGVPWWVILLAVLAGLLVLALLVLLLWKMGFFKRAKHPEATVPQYHAVKIPREDRQQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VAEGVPWWVILLAVLAGLLVLALLVLLLWKMGFFKRAKHPEATVPQYHAVKIPREDRQQF
      940       950       960       970       980       990        

            1100      1110      1120      1130       
pF1KSD KEEKTGTILRNNWGSPRREGPDAHPILAADGHPELGPDGHPGPGTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KEEKTGTILRNNWGSPRREGPDAHPILAADGHPELGPDGHPGPGTA
     1000      1010      1020      1030      1040    

>>CCDS2249.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2                (1073 aa)
 initn: 2525 init1: 635 opt: 3020  Z-score: 3408.6  bits: 642.5 E(32554): 1.5e-183
Smith-Waterman score: 3412; 48.4% identity (76.1% similar) in 1094 aa overlap (12-1083:4-1059)

               10        20        30           40        50       
pF1KSD MAGARSRDPWGASGICYLFGSLLVELLFSR-AVAFNLDVM--GALRKEGEPGSLFGFSVA
                  :. .: :.   :   :.:: ..:::::.   ...:: :.::::::::.:
CCDS22         MAAAGQLCLLY---LSAGLLSRLGAAFNLDTREDNVIRKYGDPGSLFGFSLA
                       10           20        30        40         

        60        70        80        90       100       110       
pF1KSD LHRQLQPRPQSWLLVGAPQALALPGQQANRTGGLFACPLSLEETDCYRVDIDQGADMQKE
       .: ::::. .  ::::::.: ::: :.:::::::..: ..  .  : :...:. ::  .:
CCDS22 MHWQLQPEDKRLLLVGAPRAEALPLQRANRTGGLYSCDIT-ARGPCTRIEFDNDADPTSE
      50        60        70        80         90       100        

       120       130       140       150       160       170       
pF1KSD SKENQWLGVSVRSQGPGGKIVTCAHRYEARQRVDQILETRDMIGRCFVLSQDLAIRDELD
       :::.::.::.:.:::::::.:::::::: ::.:.   :.::..:::.::::.: :.:..:
CCDS22 SKEDQWMGVTVQSQGPGGKVVTCAHRYEKRQHVNTKQESRDIFGRCYVLSQNLRIEDDMD
      110       120       130       140       150       160        

       180       190       200       210       220                 
pF1KSD GGEWKFCEGRPQGHEQFGFCQQGTAAAFSPDSHYLLFGAPGTYNWKGLL---------FV
       ::.:.::.:: .:::.:: ::::.::.:. : ::..:::::::::::..         : 
CCDS22 GGDWSFCDGRLRGHEKFGSCQQGVAATFTKDFHYIVFGAPGTYNWKGIVRVEQKNNTFFD
      170       180       190       200       210       220        

      230       240       250       260       270       280        
pF1KSD TNIDSSDPDQLVYKTLDPADRLPGPAGDLALNSYLGFSIDSGKGLVRAEELSFVAGAPRA
        ::  . : ..  .:    . .: ::     :::::::.:::::.:  .:..::.:::::
CCDS22 MNIFEDGPYEVGGETEHDESLVPVPA-----NSYLGFSLDSGKGIVSKDEITFVSGAPRA
      230       240       250            260       270       280   

      290       300        310       320       330       340       
pF1KSD NHKGAVVILRKDSAS-RLVPEVMLSGERLTSGFGYSLAVADLNSDGWPDLIVGAPYFFER
       ::.::::.:..:  : .:.:: ...:: :.:.:::..::.:::.::: :...::: .:.:
CCDS22 NHSGAVVLLKRDMKSAHLLPEHIFDGEGLASSFGYDVAVVDLNKDGWQDIVIGAPQYFDR
           290       300       310       320       330       340   

       350       360       370       380       390       400       
pF1KSD QEELGGAVYVYLNQGGHWAGISPLRLCGSPDSMFGISLAVLGDLNQDGFPDIAVGAPFDG
       . :.:::::::.:: :.: ...:.:: :. ::::::..  .::.::::.::::::::.: 
CCDS22 DGEVGGAVYVYMNQQGRWNNVKPIRLNGTKDSMFGIAVKNIGDINQDGYPDIAVGAPYDD
           350       360       370       380       390       400   

       410       420       430       440       450       460       
pF1KSD DGKVFIYHGSSLGVVAKPSQVLEGEAVGIKSFGYSLSGSLDMDGNQYPDLLVGSLADTAV
        :::::::::. :. .::.:::.: .     ::::..:..:.: :.:::. ::::.:...
CCDS22 LGKVFIYHGSANGINTKPTQVLKGIS---PYFGYSIAGNMDLDRNSYPDVAVGSLSDSVT
           410       420          430       440       450       460

       470       480       490        500       510       520      
pF1KSD LFRARPILHVSHEVSIAPRSIDLEQPN-CAGGHSVCVDLRVCFSYIAVPSSYSPTVALDY
       .::.::...... ....:  :::.: . :..  ..:.... :: : : :..:.:....  
CCDS22 IFRSRPVINIQKTITVTPNRIDLRQKTACGAPSGICLQVKSCFEYTANPAGYNPSISIVG
              470       480       490       500       510       520

        530       540       550       560       570       580      
pF1KSD VLDADTDRRLRGQVPRVTFLSRNLEEPKHQASGTVWLKHQHDRVCGDAMFQLQENVKDKL
       .:.:. .::  :   :: : ...  :::.    :  ::.:...:: .  . ::.:..:::
CCDS22 TLEAEKERRKSGLSSRVQFRNQG-SEPKYTQELT--LKRQKQKVCMEETLWLQDNIRDKL
              530       540        550         560       570       

        590       600       610       620       630       640      
pF1KSD RAIVVTLSYSLQTPRLRRQAPGQGLPPVAPILNAHQPSTQRAEIHFLKQGCGEDKICQSN
       : : .: :  .: :  ::..  ..:: : ::::. .:.: . ..::::.:::.:..:.::
CCDS22 RPIPITASVEIQEPSSRRRV--NSLPEVLPILNSDEPKTAHIDVHFLKEGCGDDNVCNSN
       580       590         600       610       620       630     

        650       660        670       680       690       700     
pF1KSD LQLVRARFCTRVSDTE-FQPLPMDVDGTTALFALSGQPVIGLELMVTNLPSDPAQPQADG
       :.: . .:::: .. . :. ::..  :.  : .:. :  :.::. ::: ::.: .:  ::
CCDS22 LKL-EYKFCTREGNQDKFSYLPIQ-KGVPEL-VLKDQKDIALEITVTNSPSNPRNPTKDG
          640       650        660        670       680       690  

         710       720       730         740       750       760   
pF1KSD DDAHEAQLLVMLPDSLHYSGVRALD--PAEKPLCLSNENASHVECELGNPMKRGAQVTFY
       ::::::.:.. .::.: ::. : :   : ..  :..:.:.:...::::::.::...::::
CCDS22 DDAHEAKLIATFPDTLTYSAYRELRAFPEKQLSCVANQNGSQADCELGNPFKRNSNVTFY
            700       710       720       730       740       750  

           770       780       790        800       810       820  
pF1KSD LILSTSGISIETTELEVELLLATISEQE-LHPVSARARVFIELPLSIAGMAIPQQLFFSG
       :.:::. ....: .:...: : : :.:. : :..:.:.: ::: ::..:.: :.:..:.:
CCDS22 LVLSTTEVTFDTPDLDINLKLETTSNQDNLAPITAKAKVVIELLLSVSGVAKPSQVYFGG
            760       770       780       790       800       810  

            830       840       850       860       870       880  
pF1KSD VVRGERAMQSERDVGSKVKYEVTVSNQGQSLRTLGSAFLNIMWPHEIANGKWLLYPMQVE
       .: ::.::.:: .::: ..::  : : :. : .::.: :::.::.::.::::::: ..::
CCDS22 TVVGEQAMKSEDEVGSLIEYEFRVINLGKPLTNLGTATLNIQWPKEISNGKWLLYLVKVE
            820       830       840       850       860       870  

            890       900       910       920       930       940  
pF1KSD LEGGQGPGQKGLCSPRPNILHLDVDSRDRRRRELEPPEQQEPGERQEPSMSWWPVSSAEK
        .:     .:  : :. .:  :..      :.. :  :.:   .:.   .: .    ::.
CCDS22 SKGL----EKVTCEPQKEINSLNLTESHNSRKKREITEKQIDDNRK---FSLF----AER
                880       890       900       910              920 

            950       960       970       980       990      1000  
pF1KSD KKNITLDCARGTANCVVFSCPLYSFDRAAVLHVWGRLWNSTFLEEYSAVKSLEVIVRANI
       : . ::.:. .. ::: . ::: ..:  : : . .:::::::::::: .. :....:: :
CCDS22 KYQ-TLNCSVNV-NCVNIRCPLRGLDSKASLILRSRLWNSTFLEEYSKLNYLDILMRAFI
              930        940       950       960       970         

           1010      1020      1030        1040      1050      1060
pF1KSD TVKSSIKNLMLRDASTVIPVMVYLDPMAVVAE--GVPWWVILLAVLAGLLVLALLVLLLW
        : .. .:. : .:.: . : :.  :  .::.  :::::.::.:.:::.:.:::::..::
CCDS22 DVTAAAENIRLPNAGTQVRVTVF--PSKTVAQYSGVPWWIILVAILAGILMLALLVFILW
     980       990      1000        1010      1020      1030       

               1070      1080      1090      1100      1110        
pF1KSD KMGFFKRAK--HPEATVPQYHAVKIPREDRQQFKEEKTGTILRNNWGSPRREGPDAHPIL
       : ::::: :  : .::   :: ..:                                   
CCDS22 KCGFFKRNKKDHYDAT---YHKAEIHAQPSDKERLTSDA                     
      1040      1050         1060      1070                        

>>CCDS46451.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2               (1091 aa)
 initn: 2528 init1: 635 opt: 3020  Z-score: 3408.5  bits: 642.5 E(32554): 1.5e-183
Smith-Waterman score: 3473; 48.0% identity (76.4% similar) in 1113 aa overlap (12-1104:4-1080)

               10        20        30           40        50       
pF1KSD MAGARSRDPWGASGICYLFGSLLVELLFSR-AVAFNLDVM--GALRKEGEPGSLFGFSVA
                  :. .: :.   :   :.:: ..:::::.   ...:: :.::::::::.:
CCDS46         MAAAGQLCLLY---LSAGLLSRLGAAFNLDTREDNVIRKYGDPGSLFGFSLA
                       10           20        30        40         

        60        70        80        90       100       110       
pF1KSD LHRQLQPRPQSWLLVGAPQALALPGQQANRTGGLFACPLSLEETDCYRVDIDQGADMQKE
       .: ::::. .  ::::::.: ::: :.:::::::..: ..  .  : :...:. ::  .:
CCDS46 MHWQLQPEDKRLLLVGAPRAEALPLQRANRTGGLYSCDIT-ARGPCTRIEFDNDADPTSE
      50        60        70        80         90       100        

       120       130       140       150       160       170       
pF1KSD SKENQWLGVSVRSQGPGGKIVTCAHRYEARQRVDQILETRDMIGRCFVLSQDLAIRDELD
       :::.::.::.:.:::::::.:::::::: ::.:.   :.::..:::.::::.: :.:..:
CCDS46 SKEDQWMGVTVQSQGPGGKVVTCAHRYEKRQHVNTKQESRDIFGRCYVLSQNLRIEDDMD
      110       120       130       140       150       160        

       180       190       200       210       220                 
pF1KSD GGEWKFCEGRPQGHEQFGFCQQGTAAAFSPDSHYLLFGAPGTYNWKGLL---------FV
       ::.:.::.:: .:::.:: ::::.::.:. : ::..:::::::::::..         : 
CCDS46 GGDWSFCDGRLRGHEKFGSCQQGVAATFTKDFHYIVFGAPGTYNWKGIVRVEQKNNTFFD
      170       180       190       200       210       220        

      230       240       250       260       270       280        
pF1KSD TNIDSSDPDQLVYKTLDPADRLPGPAGDLALNSYLGFSIDSGKGLVRAEELSFVAGAPRA
        ::  . : ..  .:    . .: ::     :::::::.:::::.:  .:..::.:::::
CCDS46 MNIFEDGPYEVGGETEHDESLVPVPA-----NSYLGFSLDSGKGIVSKDEITFVSGAPRA
      230       240       250            260       270       280   

      290       300        310       320       330       340       
pF1KSD NHKGAVVILRKDSAS-RLVPEVMLSGERLTSGFGYSLAVADLNSDGWPDLIVGAPYFFER
       ::.::::.:..:  : .:.:: ...:: :.:.:::..::.:::.::: :...::: .:.:
CCDS46 NHSGAVVLLKRDMKSAHLLPEHIFDGEGLASSFGYDVAVVDLNKDGWQDIVIGAPQYFDR
           290       300       310       320       330       340   

       350       360       370       380       390       400       
pF1KSD QEELGGAVYVYLNQGGHWAGISPLRLCGSPDSMFGISLAVLGDLNQDGFPDIAVGAPFDG
       . :.:::::::.:: :.: ...:.:: :. ::::::..  .::.::::.::::::::.: 
CCDS46 DGEVGGAVYVYMNQQGRWNNVKPIRLNGTKDSMFGIAVKNIGDINQDGYPDIAVGAPYDD
           350       360       370       380       390       400   

       410       420       430       440       450       460       
pF1KSD DGKVFIYHGSSLGVVAKPSQVLEGEAVGIKSFGYSLSGSLDMDGNQYPDLLVGSLADTAV
        :::::::::. :. .::.:::.: .     ::::..:..:.: :.:::. ::::.:...
CCDS46 LGKVFIYHGSANGINTKPTQVLKGIS---PYFGYSIAGNMDLDRNSYPDVAVGSLSDSVT
           410       420          430       440       450       460

       470       480       490        500       510       520      
pF1KSD LFRARPILHVSHEVSIAPRSIDLEQPN-CAGGHSVCVDLRVCFSYIAVPSSYSPTVALDY
       .::.::...... ....:  :::.: . :..  ..:.... :: : : :..:.:....  
CCDS46 IFRSRPVINIQKTITVTPNRIDLRQKTACGAPSGICLQVKSCFEYTANPAGYNPSISIVG
              470       480       490       500       510       520

        530       540       550       560       570       580      
pF1KSD VLDADTDRRLRGQVPRVTFLSRNLEEPKHQASGTVWLKHQHDRVCGDAMFQLQENVKDKL
       .:.:. .::  :   :: : ...  :::.    :  ::.:...:: .  . ::.:..:::
CCDS46 TLEAEKERRKSGLSSRVQFRNQG-SEPKYTQELT--LKRQKQKVCMEETLWLQDNIRDKL
              530       540        550         560       570       

        590       600       610       620       630       640      
pF1KSD RAIVVTLSYSLQTPRLRRQAPGQGLPPVAPILNAHQPSTQRAEIHFLKQGCGEDKICQSN
       : : .: :  .: :  ::..  ..:: : ::::. .:.: . ..::::.:::.:..:.::
CCDS46 RPIPITASVEIQEPSSRRRV--NSLPEVLPILNSDEPKTAHIDVHFLKEGCGDDNVCNSN
       580       590         600       610       620       630     

        650       660        670       680       690       700     
pF1KSD LQLVRARFCTRVSDTE-FQPLPMDVDGTTALFALSGQPVIGLELMVTNLPSDPAQPQADG
       :.: . .:::: .. . :. ::..  :.  : .:. :  :.::. ::: ::.: .:  ::
CCDS46 LKL-EYKFCTREGNQDKFSYLPIQ-KGVPEL-VLKDQKDIALEITVTNSPSNPRNPTKDG
          640       650        660        670       680       690  

         710       720       730         740       750       760   
pF1KSD DDAHEAQLLVMLPDSLHYSGVRALD--PAEKPLCLSNENASHVECELGNPMKRGAQVTFY
       ::::::.:.. .::.: ::. : :   : ..  :..:.:.:...::::::.::...::::
CCDS46 DDAHEAKLIATFPDTLTYSAYRELRAFPEKQLSCVANQNGSQADCELGNPFKRNSNVTFY
            700       710       720       730       740       750  

           770       780       790        800       810       820  
pF1KSD LILSTSGISIETTELEVELLLATISEQE-LHPVSARARVFIELPLSIAGMAIPQQLFFSG
       :.:::. ....: .:...: : : :.:. : :..:.:.: ::: ::..:.: :.:..:.:
CCDS46 LVLSTTEVTFDTPDLDINLKLETTSNQDNLAPITAKAKVVIELLLSVSGVAKPSQVYFGG
            760       770       780       790       800       810  

            830       840       850       860       870       880  
pF1KSD VVRGERAMQSERDVGSKVKYEVTVSNQGQSLRTLGSAFLNIMWPHEIANGKWLLYPMQVE
       .: ::.::.:: .::: ..::  : : :. : .::.: :::.::.::.::::::: ..::
CCDS46 TVVGEQAMKSEDEVGSLIEYEFRVINLGKPLTNLGTATLNIQWPKEISNGKWLLYLVKVE
            820       830       840       850       860       870  

            890       900       910       920       930       940  
pF1KSD LEGGQGPGQKGLCSPRPNILHLDVDSRDRRRRELEPPEQQEPGERQEPSMSWWPVSSAEK
        .:     .:  : :. .:  :..      :.. :  :.:   .:.   .: .    ::.
CCDS46 SKG----LEKVTCEPQKEINSLNLTESHNSRKKREITEKQIDDNRK---FSLF----AER
                880       890       900       910              920 

            950       960       970       980       990      1000  
pF1KSD KKNITLDCARGTANCVVFSCPLYSFDRAAVLHVWGRLWNSTFLEEYSAVKSLEVIVRANI
       : . ::.:. .. ::: . ::: ..:  : : . .:::::::::::: .. :....:: :
CCDS46 KYQ-TLNCSVNV-NCVNIRCPLRGLDSKASLILRSRLWNSTFLEEYSKLNYLDILMRAFI
              930        940       950       960       970         

           1010      1020      1030        1040      1050      1060
pF1KSD TVKSSIKNLMLRDASTVIPVMVYLDPMAVVAE--GVPWWVILLAVLAGLLVLALLVLLLW
        : .. .:. : .:.: . : :.  :  .::.  :::::.::.:.:::.:.:::::..::
CCDS46 DVTAAAENIRLPNAGTQVRVTVF--PSKTVAQYSGVPWWIILVAILAGILMLALLVFILW
     980       990      1000        1010      1020      1030       

             1070      1080      1090      1100      1110      1120
pF1KSD KMGFFKRAKHPEATVPQYHAVKIPREDRQQFKEEKTGTILRNNWGSPRREGPDAHPILAA
       : :::::... . .::.::::.: .:.:.   :.   .. ...:                
CCDS46 KCGFFKRSRYDD-SVPRYHAVRIRKEEREIKDEKYIDNLEKKQWITKWNENESYS     
      1040       1050      1060      1070      1080      1090      

             1130       
pF1KSD DGHPELGPDGHPGPGTA

>>CCDS82534.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2               (954 aa)
 initn: 2358 init1: 1160 opt: 2582  Z-score: 2913.8  bits: 550.8 E(32554): 5.6e-156
Smith-Waterman score: 3167; 49.3% identity (77.8% similar) in 970 aa overlap (124-1083:1-940)

           100       110       120       130       140       150   
pF1KSD CPLSLEETDCYRVDIDQGADMQKESKENQWLGVSVRSQGPGGKIVTCAHRYEARQRVDQI
                                     .::.:.:::::::.:::::::: ::.:.  
CCDS82                               MGVTVQSQGPGGKVVTCAHRYEKRQHVNTK
                                             10        20        30

           160       170       180       190       200       210   
pF1KSD LETRDMIGRCFVLSQDLAIRDELDGGEWKFCEGRPQGHEQFGFCQQGTAAAFSPDSHYLL
        :.::..:::.::::.: :.:..:::.:.::.:: .:::.:: ::::.::.:. : ::..
CCDS82 QESRDIFGRCYVLSQNLRIEDDMDGGDWSFCDGRLRGHEKFGSCQQGVAATFTKDFHYIV
               40        50        60        70        80        90

           220       230       240       250       260       270   
pF1KSD FGAPGTYNWKGLLFVTNIDSSDPDQLVYKTLDPADRLPGPAGDLALNSYLGFSIDSGKGL
       ::::::::::::::.:... .::::.::::  : .. :    :. .:::::::.:::::.
CCDS82 FGAPGTYNWKGLLFLTSVSYTDPDQFVYKTRPPREQ-PDTFPDVMMNSYLGFSLDSGKGI
              100       110       120        130       140         

           280       290       300        310       320       330  
pF1KSD VRAEELSFVAGAPRANHKGAVVILRKDSAS-RLVPEVMLSGERLTSGFGYSLAVADLNSD
       :  .:..::.:::::::.::::.:..:  : .:.:: ...:: :.:.:::..::.:::.:
CCDS82 VSKDEITFVSGAPRANHSGAVVLLKRDMKSAHLLPEHIFDGEGLASSFGYDVAVVDLNKD
     150       160       170       180       190       200         

            340       350       360       370       380       390  
pF1KSD GWPDLIVGAPYFFERQEELGGAVYVYLNQGGHWAGISPLRLCGSPDSMFGISLAVLGDLN
       :: :...::: .:.:. :.:::::::.:: :.: ...:.:: :. ::::::..  .::.:
CCDS82 GWQDIVIGAPQYFDRDGEVGGAVYVYMNQQGRWNNVKPIRLNGTKDSMFGIAVKNIGDIN
     210       220       230       240       250       260         

            400       410       420       430       440       450  
pF1KSD QDGFPDIAVGAPFDGDGKVFIYHGSSLGVVAKPSQVLEGEAVGIKSFGYSLSGSLDMDGN
       :::.::::::::.:  :::::::::. :. .::.:::.: .     ::::..:..:.: :
CCDS82 QDGYPDIAVGAPYDDLGKVFIYHGSANGINTKPTQVLKGIS---PYFGYSIAGNMDLDRN
     270       280       290       300       310          320      

            460       470       480       490        500       510 
pF1KSD QYPDLLVGSLADTAVLFRARPILHVSHEVSIAPRSIDLEQPN-CAGGHSVCVDLRVCFSY
       .:::. ::::.:....::.::...... ....:  :::.: . :..  ..:.... :: :
CCDS82 SYPDVAVGSLSDSVTIFRSRPVINIQKTITVTPNRIDLRQKTACGAPSGICLQVKSCFEY
        330       340       350       360       370       380      

             520       530       540       550       560       570 
pF1KSD IAVPSSYSPTVALDYVLDADTDRRLRGQVPRVTFLSRNLEEPKHQASGTVWLKHQHDRVC
        : :..:.:....  .:.:. .::  :   :: : ...  :::.    :  ::.:...::
CCDS82 TANPAGYNPSISIVGTLEAEKERRKSGLSSRVQFRNQG-SEPKYTQELT--LKRQKQKVC
        390       400       410       420        430         440   

             580       590       600       610       620       630 
pF1KSD GDAMFQLQENVKDKLRAIVVTLSYSLQTPRLRRQAPGQGLPPVAPILNAHQPSTQRAEIH
        .  . ::.:..:::: : .: :  .: :  ::..  ..:: : ::::. .:.: . ..:
CCDS82 MEETLWLQDNIRDKLRPIPITASVEIQEPSSRRRV--NSLPEVLPILNSDEPKTAHIDVH
           450       460       470         480       490       500 

             640       650       660        670       680       690
pF1KSD FLKQGCGEDKICQSNLQLVRARFCTRVSDTE-FQPLPMDVDGTTALFALSGQPVIGLELM
       :::.:::.:..:.:::.: . .:::: .. . :. ::..  :.  : .:. :  :.::. 
CCDS82 FLKEGCGDDNVCNSNLKL-EYKFCTREGNQDKFSYLPIQ-KGVPEL-VLKDQKDIALEIT
             510        520       530        540        550        

              700       710       720       730         740        
pF1KSD VTNLPSDPAQPQADGDDAHEAQLLVMLPDSLHYSGVRALD--PAEKPLCLSNENASHVEC
       ::: ::.: .:  ::::::::.:.. .::.: ::. : :   : ..  :..:.:.:...:
CCDS82 VTNSPSNPRNPTKDGDDAHEAKLIATFPDTLTYSAYRELRAFPEKQLSCVANQNGSQADC
      560       570       580       590       600       610        

      750       760       770       780       790        800       
pF1KSD ELGNPMKRGAQVTFYLILSTSGISIETTELEVELLLATISEQE-LHPVSARARVFIELPL
       :::::.::...:::::.:::. ....: .:...: : : :.:. : :..:.:.: ::: :
CCDS82 ELGNPFKRNSNVTFYLVLSTTEVTFDTPDLDINLKLETTSNQDNLAPITAKAKVVIELLL
      620       630       640       650       660       670        

       810       820       830       840       850       860       
pF1KSD SIAGMAIPQQLFFSGVVRGERAMQSERDVGSKVKYEVTVSNQGQSLRTLGSAFLNIMWPH
       :..:.: :.:..:.:.: ::.::.:: .::: ..::  : : :. : .::.: :::.::.
CCDS82 SVSGVAKPSQVYFGGTVVGEQAMKSEDEVGSLIEYEFRVINLGKPLTNLGTATLNIQWPK
      680       690       700       710       720       730        

       870       880       890       900       910       920       
pF1KSD EIANGKWLLYPMQVELEGGQGPGQKGLCSPRPNILHLDVDSRDRRRRELEPPEQQEPGER
       ::.::::::: ..:: .: .    :  : :. .:  :..      :.. :  :.:   .:
CCDS82 EISNGKWLLYLVKVESKGLE----KVTCEPQKEINSLNLTESHNSRKKREITEKQIDDNR
      740       750           760       770       780       790    

       930       940       950       960       970       980       
pF1KSD QEPSMSWWPVSSAEKKKNITLDCARGTANCVVFSCPLYSFDRAAVLHVWGRLWNSTFLEE
       .   .: .    ::.: . ::.:. .. ::: . ::: ..:  : : . .::::::::::
CCDS82 K---FSLF----AERKYQ-TLNCSVNV-NCVNIRCPLRGLDSKASLILRSRLWNSTFLEE
                 800        810        820       830       840     

       990      1000      1010      1020      1030        1040     
pF1KSD YSAVKSLEVIVRANITVKSSIKNLMLRDASTVIPVMVYLDPMAVVAE--GVPWWVILLAV
       :: .. :....:: : : .. .:. : .:.: . : :.  :  .::.  :::::.::.:.
CCDS82 YSKLNYLDILMRAFIDVTAAAENIRLPNAGTQVRVTVF--PSKTVAQYSGVPWWIILVAI
         850       860       870       880         890       900   

        1050      1060        1070      1080      1090      1100   
pF1KSD LAGLLVLALLVLLLWKMGFFKRAK--HPEATVPQYHAVKIPREDRQQFKEEKTGTILRNN
       :::.:.:::::..::: ::::: :  : .::   :: ..:                    
CCDS82 LAGILMLALLVFILWKCGFFKRNKKDHYDAT---YHKAEIHAQPSDKERLTSDA      
           910       920       930          940       950          

          1110      1120      1130       
pF1KSD WGSPRREGPDAHPILAADGHPELGPDGHPGPGTA

>>CCDS2669.1 ITGA9 gene_id:3680|Hs108|chr3                (1035 aa)
 initn: 513 init1: 206 opt: 811  Z-score: 909.4  bits: 180.0 E(32554): 2.5e-44
Smith-Waterman score: 1257; 28.0% identity (57.4% similar) in 1103 aa overlap (9-1067:7-1009)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAGARSRDPWGASGICYLFGSLLVELLFSRAVAFNLDVMGALRKEGEPGSLFGFSVALHR
               : ::. .  :. .:.:  .   : :.::: .  .. .:   :.::..:  : 
CCDS26   MGGPAAPRGAGRLRALLLALVVAGI--PAGAYNLDPQRPVHFQGPADSFFGYAVLEHF
                 10        20          30        40        50      

               70        80        90        100       110         
pF1KSD QLQPRPQSWLLVGAPQALALPGQQANRTGGLFACPLSLE-ETDCYRVDIDQGADMQ----
       . . :   :.:::::.: .  . ...  :..: : .  . .  : ..:. .: .      
CCDS26 HDNTR---WVLVGAPKADSKYSPSVKSPGAVFKCRVHTNPDRRCTELDMARGKNRGTSCG
         60           70        80        90       100       110   

            120        130       140        150       160       170
pF1KSD ---KESKENQWLGVSV-RSQGPGGKIVTCAHRYEA-RQRVDQILETRDMIGRCFVLSQDL
          .:.....:.:::. :.    :....::::..    ..:.::      : :... ..:
CCDS26 KTCREDRDDEWMGVSLARQPKADGRVLACAHRWKNIYYEADHILPH----GFCYIIPSNL
           120       130       140       150           160         

              180         190       200       210       220        
pF1KSD AIRDELDGGEWKFC--EGRPQGHEQFGFCQQGTAAAFSPDSHYLLFGAPGTYNWKGLLFV
         .    :     :  : . .  :. : :: : :. :. .   ...::::.. : : . :
CCDS26 QAK----GRTLIPCYEEYKKKYGEEHGSCQAGIAGFFTEE--LVVMGAPGSFYWAGTIKV
     170           180       190       200         210       220   

      230       240       250       260          270       280     
pF1KSD TNIDSSDPDQLVYKTLDPADRLPGPAGDLALN---SYLGFSIDSGKGLVRAEELSFVAGA
        :.     :.   :  :          .. .:   .:::... .:. . .   .. :.::
CCDS26 LNLT----DNTYLKLND----------EVIMNRRYTYLGYAVTAGH-FSHPSTIDVVGGA
               230                 240       250        260        

         290       300        310       320       330       340    
pF1KSD PRANHKGAVVILRKDSAS-RLVPEVMLSGERLTSGFGYSLAVADLNSDGWPDLIVGAPYF
       :. .  : : :.: :  :  :.   . ::... : :: :: ..:::.::  ::.::::.:
CCDS26 PQDKGIGKVYIFRADRRSGTLIKIFQASGKKMGSYFGSSLCAVDLNGDGLSDLLVGAPMF
      270       280       290       300       310       320        

          350       360        370       380       390       400   
pF1KSD FERQEELGGAVYVYLNQG-GHWAGISPLRLCGSPDSMFGISLAVLGDLNQDGFPDIAVGA
        : ..:  : : ::.:.: :       :   :. .. :: :.: : ::..:::::.:.::
CCDS26 SEIRDE--GQVTVYINRGNGALEEQLALTGDGAYNAHFGESIASLDDLDNDGFPDVAIGA
      330         340       350       360       370       380      

             410       420       430         440       450         
pF1KSD PFDGD--GKVFIYHGSSLGVVAKPSQVLEGEAVG--IKSFGYSLSGSLDMDGNQYPDLLV
       : . :  : :.::::.. :.: . :. : :. ..  .. :: :.::..::::: :::. :
CCDS26 PKEDDFAGAVYIYHGDAGGIVPQYSMKLSGQKINPVLRMFGQSISGGIDMDGNGYPDVTV
        390       400       410       420       430       440      

     460        470       480        490       500         510     
pF1KSD GS-LADTAVLFRARPILHVSHEVSI-APRSIDLEQPNCAGGHSV--CVDLRVCFSYIAVP
       :. ..:..::.::::.. :  .:::  : ::..  :.:  :..   :... .:::.    
CCDS26 GAFMSDSVVLLRARPVITV--DVSIFLPGSINITAPQCHDGQQPVNCLNVTTCFSF---H
        450       460         470       480       490       500    

         520        530       540       550       560       570    
pF1KSD SSYSP-TVALDYVLDADTDRRLRGQVPRVTFLSRNLEEPKHQASGTVWLKHQHDRVCGDA
       ... :  ..:.::: ::. .. .::.::: :.   : :   :..  . : .. ...:   
CCDS26 GKHVPGEIGLNYVLMADVAKKEKGQMPRVYFVL--LGETMGQVTEKLQLTYM-EETCRHY
             510       520       530         540       550         

          580       590       600       610         620       630  
pF1KSD MFQLQENVKDKLRAIVVTLSYSLQTPRLRRQAPGQGLPPVAPIL--NAHQPSTQRAEIHF
       . .... :.: .  ::   .:::.     ..   . :::..:.:  .  :  .:. .  :
CCDS26 VAHVKRRVQDVISPIVFEAAYSLSEHVTGEEE--RELPPLTPVLRWKKGQKIAQKNQTVF
      560       570       580       590         600       610      

            640       650       660       670       680       690  
pF1KSD LKQGCGEDKICQSNLQLVRARFCTRVSDTEFQPLPMDVDGTTALFALSGQPVIGLELMVT
        ..  .::  : ..:::            . . :  ..:  :  .::..   :.:.. ..
CCDS26 ERNCRSED--CAADLQL------------QGKLLLSSMDEKTLYLALGAVKNISLNISIS
        620         630                   640       650       660  

            700       710       720       730       740       750  
pF1KSD NLPSDPAQPQADGDDAHEAQLLVMLPDSLHYSGVRALDPAEKPLCLSNENASHVECELGN
       ::          ::::..:..   .   : .  .   .  :  .     ... ..: .: 
CCDS26 NL----------GDDAYDANVSFNVSRELFF--INMWQKEEMGISCELLESDFLKCSVGF
                      670       680         690       700       710

             760       770       780       790       800           
pF1KSD P-MKRGAQVTFYLILSTSGISIETTELEVELLLATISEQELHPVSARARVFI-----ELP
       : :.  ..  : .:..:: .: :   :   .   . . .. . .   . :..     :. 
CCDS26 PFMRSKSKYEFSVIFDTSHLSGEEEVLSFIVTAQSGNTERSESLHDNTLVLMVPLMHEVD
              720       730       740       750       760       770

        810       820       830          840       850       860   
pF1KSD LSIAGMAIPQQLFFSGVVRGERAMQSERDVGSK---VKYEVTVSNQGQSLRTLGSAFLNI
        ::.:.  : .. ..  : .   .: . :.  .   ..  . : : : :  :: .. ..:
CCDS26 TSITGIMSPTSFVYGESVDAANFIQLD-DLECHFQPINITLQVYNTGPS--TLPGSSVSI
              780       790        800       810         820       

           870       880       890       900       910       920   
pF1KSD MWPHEIANGKWLLYPMQVELEGGQGPGQKGLCSPRPNILHLDVDSRDRRRRELEPPEQQE
        .:.....:   .. .: :.  ::   .:: :: . :                 :     
CCDS26 SFPNRLSSGGAEMFHVQ-EMVVGQ---EKGNCSFQKN-----------------PTPCII
       830       840        850          860                       

           930       940       950       960         970       980 
pF1KSD PGERQEPSMSWWPVSSAEKKKNITLDCARGTANCVVFSCPLYSF--DRAAVLHVWGRLWN
       : :...   . .   .   .:  .::: .   .:..  : . ..  ... .. ..  : :
CCDS26 PQEQENIFHTIFAFFTKSGRK--VLDCEKPGISCLTAHCNFSALAKEESRTIDIY-MLLN
        870       880         890       900       910        920   

             990      1000      1010           1020      1030      
pF1KSD STFLEEYSAVKSLEVIVRANITVKSSIKNLML-----RDASTVIPVMVYLDPMAVVAEGV
       . .:.. :. . .. . ::.. :  ... . .     .....:. ..  :.: . :. : 
CCDS26 TEILKKDSS-SVIQFMSRAKVKVDPALRVVEIAHGNPEEVTVVFEALHNLEPRGYVV-G-
           930        940       950       960       970        980 

       1040      1050      1060      1070      1080      1090      
pF1KSD PWWVILLAVLAGLLVLALLVLLLWKMGFFKRAKHPEATVPQYHAVKIPREDRQQFKEEKT
         :.: ...:.:.:.. ::..::::::::.:                             
CCDS26 --WIIAISLLVGILIFLLLAVLLWKMGFFRRRYKEIIEAEKNRKENEDSWDWVQKNQ   
                990      1000      1010      1020      1030        

       1100      1110      1120      1130       
pF1KSD GTILRNNWGSPRREGPDAHPILAADGHPELGPDGHPGPGTA

>>CCDS42788.1 ITGA4 gene_id:3676|Hs108|chr2               (1032 aa)
 initn: 541 init1: 120 opt: 634  Z-score: 709.1  bits: 142.9 E(32554): 3.5e-33
Smith-Waterman score: 1068; 27.2% identity (56.7% similar) in 1104 aa overlap (1-1067:1-1007)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAGARSRDPWGASGICYLFGSLLVELLFSRAVAFNLDVMGALRKEGEPGSLFGFSVALHR
       ::    :.:    .       ::. :    .  .:.:. .::  .:  ..:::.::.:: 
CCDS42 MAWEARREPGPRRAAVRETVMLLLCLGVPTGRPYNVDTESALLYQGPHNTLFGYSVVLHS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100        110         
pF1KSD QLQPRPQSWLLVGAPQALALPGQQANRTGGLFACPLSLEETD-CYRVDIDQ--GADMQK-
       .   :   ::::::: :  : . ..   :... : .. .  . : .... .  :    : 
CCDS42 HGANR---WLLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQLGSPNGEPCGKT
                  70        80        90       100       110       

          120        130       140       150       160       170   
pF1KSD --ESKENQWLGVSV-RSQGPGGKIVTCAHRYEARQRVDQILETRDMIGRCFVLSQDLAIR
         : ..::::::.. :. : .:.::::.::..    . .  :..   : :. .  ::  :
CCDS42 CLEERDNQWLGVTLSRQPGENGSIVTCGHRWKNIFYIKN--ENKLPTGGCYGVPPDL--R
       120       130       140       150         160       170     

           180         190       200       210       220       230 
pF1KSD DELDGGEWKFC--EGRPQGHEQFGFCQQGTAAAFSPDSHYLLFGAPGTYNWKGLLFVTNI
        ::.  .   :  .   .  :.:. :: : .. .. :   ...::::.  : : ::: ::
CCDS42 TELSK-RIAPCYQDYVKKFGENFASCQAGISSFYTKD--LIVMGAPGSSYWTGSLFVYNI
            180       190       200         210       220       230

             240        250       260       270       280          
pF1KSD DSSDPDQLVYKT-LDPADRLPGPAGDLALNSYLGFSIDSGKGLVRAEELS-FVAGAPRAN
        ..      ::. ::  ...        ..::::.:.  : :  :... .  :.:::. .
CCDS42 TTNK-----YKAFLDKQNQV-------KFGSYLGYSV--GAGHFRSQHTTEVVGGAPQHE
                   240              250         260       270      

     290       300       310       320       330       340         
pF1KSD HKGAVVILRKDSASRLVPEVMLSGERLTSGFGYSLAVADLNSDGWPDLIVGAPYFFERQE
       . : . :.  :     . . : .:..: : :: :. ..:::.::. ::.::::.    .:
CCDS42 QIGKAYIFSIDEKELNILHEM-KGKKLGSYFGASVCAVDLNADGFSDLLVGAPMQSTIRE
        280       290        300       310       320       330     

     350       360        370         380       390       400      
pF1KSD ELGGAVYVYLNQG-GHWAGISPLRLCGSPD--SMFGISLAVLGDLNQDGFPDIAVGAPFD
       :  : :.::.:.: :   .     : ::    . :: :.. :::...::: :.:.::: .
CCDS42 E--GRVFVYINSGSGAVMNAMETNLVGSDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQE
           340       350       360       370       380       390   

          410       420       430         440       450       460  
pF1KSD GD--GKVFIYHGSSLGVVAKPSQVLEGEAVG--IKSFGYSLSGSLDMDGNQYPDLLVGSL
        :  : ..::.: . :. .  :: .::  ..  .. :: :.::..: :.: : :. ::..
CCDS42 DDLQGAIYIYNGRADGISSTFSQRIEGLQISKSLSMFGQSISGQIDADNNGYVDVAVGAF
           400       410       420       430       440       450   

             470       480       490         500       510         
pF1KSD -ADTAVLFRARPILHVSHEVSIAPRSIDLEQPNCA--GGHSVCVDLRVCFSYIA--VPSS
        .:.:::.:.::.. :.  .:  :.:..  . .:.  :  :::.:: .:::: .  ::. 
CCDS42 RSDSAVLLRTRPVVIVDASLS-HPESVNRTKFDCVENGWPSVCIDLTLCFSYKGKEVPG-
           460       470        480       490       500       510  

       520       530       540       550       560       570       
pF1KSD YSPTVALDYVLDADTDRRLRGQVPRVTFLSRNLEEPKHQASGTVWLKHQHDRVCGDAMFQ
           ..: : .. :..:. ..  ::  : : .  .     .:.. .. . .  :   .  
CCDS42 ---YIVLFYNMSLDVNRKAESP-PRFYFSSNGTSDV---ITGSIQVSSR-EANCRTHQAF
                520       530        540          550        560   

       580       590       600       610       620        630      
pF1KSD LQENVKDKLRAIVVTLSYSLQTPRLRRQAPGQGLPPVAPILNAHQPST-QRAEIHFLKQG
       ....:.: :  : .  .: :  :..  .   . .::. :::. .. .  ..  :.: .  
CCDS42 MRKDVRDILTPIQIEAAYHLG-PHVISKRSTEEFPPLQPILQQKKEKDIMKKTINFARF-
           570       580        590       600       610       620  

        640       650       660       670       680       690      
pF1KSD CGEDKICQSNLQLVRARFCTRVSDTEFQPLPMDVDGTTALFALSGQPVIGLELMVTNLPS
       :.... :...:: : :..        ..:     .. : : :.... .. :.. . :   
CCDS42 CAHEN-CSADLQ-VSAKIGF------LKPH----ENKTYL-AVGSMKTLMLNVSLFNA--
              630              640            650       660        

        700       710       720       730        740         750   
pF1KSD DPAQPQADGDDAHEAQLLVMLPDSLHYSGVRALDPAEKPL-CLSNENAS--HVECELGNP
               ::::.:. : : :: .:..  .. :.  :: . :  ..:..  ...: .:  
CCDS42 --------GDDAYETTLHVKLPVGLYF--IKILELEEKQINCEVTDNSGVVQLDCSIGYI
                670       680         690       700       710      

            760       770       780       790       800            
pF1KSD -MKRGAQVTFYLILSTSGISIETTELEVELLLATISEQELHPVSARARVFIELPL-----
        . . ... . ..:..:..:    .: . .  .  .:.:.  .. ..:: . .::     
CCDS42 YVDHLSRIDISFLLDVSSLSRAEEDLSITVHATCENEEEMDNLK-HSRVTVAIPLKYEVK
        720       730       740       750       760        770     

        810       820       830       840       850       860      
pF1KSD -SIAGMAIPQQLFFSGVVRGERAMQSERDVGSKVKYEVTVSNQGQSLRTLGSAFLNIMWP
        .. :.. : .. ...  ..:     :  .  :..    : : :.:.    .. ..:: :
CCDS42 LTVHGFVNPTSFVYGSNDENE----PETCMVEKMNLTFHVINTGNSMAP--NVSVEIMVP
         780       790           800       810       820           

        870        880       890       900       910       920     
pF1KSD HEIA-NGKWLLYPMQVELEGGQGPGQKGLCSPRPNILHLDVDSRDRRRRELEPPEQQEPG
       . .. .   :.  ..:.   :.       :       :..  .:      .   :::. .
CCDS42 NSFSPQTDKLFNILDVQTTTGE-------C-------HFENYQR------VCALEQQKSA
     830       840       850                           860         

         930       940       950       960         970       980   
pF1KSD ERQEPSMSWWPVSSAEKKKNITLDCARGTANCVVFSCPLYSFD--RAAVLHVWGRLWNST
        .   ..  . .:...:.    : : ..  .:. : : . ...  . : .:.  .: .  
CCDS42 MQTLKGIVRF-LSKTDKR---LLYCIKADPHCLNFLCNFGKMESGKEASVHI--QLEGRP
     870        880          890       900       910         920   

           990      1000      1010      1020      1030      1040   
pF1KSD FLEEYSAVKSLEVIVRANITVKSSIKNLMLRDASTVIPVMVYLDPMAVVAEGVPWWVILL
        . :.. ...:.  .::.   . . . . :    .:  :..         .     .:  
CCDS42 SILEMDETSALKFEIRATGFPEPNPRVIELNKDENVAHVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISS
           930       940       950       960       970       980   

          1050      1060      1070      1080      1090      1100   
pF1KSD AVLAGLLVLALLVLLLWKMGFFKRAKHPEATVPQYHAVKIPREDRQQFKEEKTGTILRNN
       ..: ::.:: :.  ..:: :::::                                    
CCDS42 SLLLGLIVLLLISYVMWKAGFFKRQYKSILQEENRRDSWSYINSKSNDD           
           990      1000      1010      1020      1030             

>>CCDS32433.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16              (1170 aa)
 initn: 435 init1: 195 opt: 559  Z-score: 623.5  bits: 127.3 E(32554): 2.1e-28
Smith-Waterman score: 684; 26.1% identity (52.8% similar) in 940 aa overlap (185-1091:335-1143)

          160       170       180       190       200         210  
pF1KSD ETRDMIGRCFVLSQDLAIRDELDGGEWKFCEGRPQGHEQFGFCQQGTAAAFSPD--SHYL
                                     ::  . ..  .: .. .....: :    . 
CCDS32 KPASEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIYVIEGTSK-QDLTSFNMELSSSGISADLSRGHA
          310       320       330        340       350       360   

            220       230       240       250       260       270  
pF1KSD LFGAPGTYNWKGLLFVTNIDSSDPDQLVYKTLDPADRLPGPAGDLALNSYLGFSIDSGKG
       . :: :. .: : ..  . : .:   .  . : :  :    ::      :::...     
CCDS32 VVGAVGAKDWAGGFLDLKADLQDDTFIGNEPLTPEVR----AG------YLGYTVT---W
           370       380       390       400                    410

            280        290       300       310        320       330
pF1KSD LVRAEELSFVA-GAPRANHKGAVVILRKDSASRLVPEVM-LSGERLTSGFGYSLAVADLN
       :   .. :..: :::: .: : :..... ...    .:. . : .. : ::  :  .:..
CCDS32 LPSRQKTSLLASGAPRYQHMGRVLLFQEPQGGGHWSQVQTIHGTQIGSYFGGELCGVDVD
              420       430       440       450       460       470

               340       350       360       370        380        
pF1KSD SDGWPDLI-VGAPYFFERQEELGGAVYVYLNQGGHWAGISPLRLC-GSPDSMFGISLAVL
       .::  .:. .::: :. .:.  :: :..:  .   .  .: :.   : : . :: ....:
CCDS32 QDGETELLLIGAPLFYGEQR--GGRVFIYQRRQLGFEEVSELQGDPGYPLGRFGEAITAL
              480       490         500       510       520        

      390       400       410       420       430         440      
pF1KSD GDLNQDGFPDIAVGAPFDGDGKVFIYHGSSLGVVAKPSQVLEGEAV--GIKSFGYSLSGS
        :.: ::. :.:::::.. .: :.:..:   :.  .::: .::  :  ::. :: :. : 
CCDS32 TDINGDGLVDVAVGAPLEEQGAVYIFNGRHGGLSPQPSQRIEGTQVLSGIQWFGRSIHGV
      530       540       550       560       570       580        

        450       460       470       480       490       500      
pF1KSD LDMDGNQYPDLLVGSLADTAVLFRARPILHVSHEVSIAPRSIDLEQPNCAGGHSVC----
        :..:.   :. ::. ..  ::  .::.. .   .:..:  : ... .:. . :      
CCDS32 KDLEGDGLADVAVGAESQMIVL-SSRPVVDMVTLMSFSPAEIPVHEVECSYSTSNKMKEG
      590       600       610        620       630       640       

            510        520        530        540       550         
pF1KSD VDLRVCFSYIA-VPSSYSPTVA-LDYVLDADTDR-RLRGQVPRVTFLSRNLEEPKHQASG
       :.. .::.  . .:.  .  :: : :.:. :  : : ::  :            .:.   
CCDS32 VNITICFQIKSLIPQFQGRLVANLTYTLQLDGHRTRRRGLFP----------GGRHELRR
       650       660       670       680                 690       

     560       570       580       590           600       610     
pF1KSD TVWLKHQHDRVCGDAMFQLQENVKDKLRAIVVTLSYSLQ----TPRLRRQAPGQGLPPVA
       .. .  . .  : :  :..   :.: .  : :.:..::     ::: .: : :. .::. 
CCDS32 NIAVTTSMS--CTDFSFHFPVCVQDLISPINVSLNFSLWEEEGTPRDQR-AQGKDIPPIL
       700         710       720       730       740        750    

          620       630       640       650       660       670    
pF1KSD -PILNAHQPSTQRAEIHFLKQGCGEDKICQSNLQLVRARFCTRVSDTEFQPLPMDVDGTT
        : :.     ..  :: : ...::::: :..::         :::   :.:    .   :
CCDS32 RPSLH-----SETWEIPF-EKNCGEDKKCEANL---------RVS---FSPARSRALRLT
               760        770       780                   790      

          680       690       700       710       720       730    
pF1KSD ALFALSGQPVIGLELMVTNLPSDPAQPQADGDDAHEAQLLVMLPDSLHYSGVRALDP-AE
       :. .::      .:: ..::           .::. .:: . .: .: .  :. : : ..
CCDS32 AFASLS------VELSLSNLE----------EDAYWVQLDLHFPPGLSFRKVEMLKPHSQ
        800             810                 820       830       840

              740          750        760       770         780    
pF1KSD KPL-C--LSNEN---ASHVECELGNPM-KRGAQVTFYLILSTSGISI--ETTELEVELLL
        :. :  : .:.   .  . :....:. : : .:.. ....:   :   ...::....  
CCDS32 IPVSCEELPEESRLLSRALSCNVSSPIFKAGHSVALQMMFNTLVNSSWGDSVELHANVTC
              850       860       870       880       890       900

          790       800       810          820       830       840 
pF1KSD ATISEQELHPVSARARVFIELPLSIAGMAIPQQ---LFFSGVVRGERAMQSERDVGSKVK
        . . . :.  :: . . :  :..:  .   :.   :. : . .: .  :    :    .
CCDS32 NNEDSDLLEDNSATTIIPILYPINI--LIQDQEDSTLYVSFTPKGPKIHQ----VKHMYQ
              910       920         930       940           950    

             850       860       870       880       890       900 
pF1KSD YEVTVSNQGQSLRTLGSAFLNIMWPHEIANGKWLLYPMQVELEGGQGPGQKGLCSPRPNI
        ..  : . ... ::  : ...  :.  ..:  . .  .:..:    :       : :  
CCDS32 VRIQPSIHDHNIPTL-EAVVGV--PQPPSEGP-ITHQWSVQME----P-------PVPC-
          960        970         980        990                    

             910       920       930       940       950       960 
pF1KSD LHLDVDSRDRRRRELEPPEQQEPGERQEPSMSWWPVSSAEKKKNITLDCARGTANCVVFS
        : .    : .:     :.  ::                         :  :.    .: 
CCDS32 -HYE----DLERL----PDAAEP-------------------------CLPGA----LFR
      1000              1010                                   1020

             970       980       990      1000      1010      1020 
pF1KSD CPLYSFDRAAVLHVWGRLWNSTFLEEYSAVKSLEVIVRANITVKSSIKNLMLRDASTVIP
       ::.  : .  ...: : :    .. :  : . . .    .:. .:: .  .  . ...  
CCDS32 CPVV-FRQEILVQVIGTL---ELVGEIEASSMFSLCSSLSISFNSSKHFHLYGSNASLAQ
              1030         1040      1050      1060      1070      

            1030      1040      1050      1060      1070      1080 
pF1KSD VMVYLDPMAVVAEGVPWWVILLAVLAGLLVLALLVLLLWKMGFFKRAKHPEATVPQYHAV
       :.. .:   :: :    .. .:. ..:::.: :. ..:.:.:::::  . .  . .    
CCDS32 VVMKVD---VVYEKQMLYLYVLSGIGGLLLLLLIFIVLYKVGFFKRNLKEKMEAGRGVPN
       1080         1090      1100      1110      1120      1130   

            1090      1100      1110      1120      1130       
pF1KSD KIPREDRQQFKEEKTGTILRNNWGSPRREGPDAHPILAADGHPELGPDGHPGPGTA
        :: :: .:.                                              
CCDS32 GIPAEDSEQLASGQEAGDPGCLKPLHEKDSESGGGKD                   
          1140      1150      1160      1170                   

>>CCDS45291.1 ITGA11 gene_id:22801|Hs108|chr15            (1188 aa)
 initn: 461 init1: 150 opt: 553  Z-score: 616.6  bits: 126.0 E(32554): 5e-28
Smith-Waterman score: 731; 24.8% identity (54.7% similar) in 937 aa overlap (164-1069:330-1173)

           140       150       160       170        180        190 
pF1KSD GGKIVTCAHRYEARQRVDQILETRDMIGRCFVLSQDLAIRDELDG-GEWKFC-EGRPQGH
                                     : .... :..: .:. :.  :  ::  ...
CCDS45 LGYYNRRGINPETFLNEIKYIASDPDDKHFFNVTDEAALKDIVDALGDRIFSLEGTNKNE
     300       310       320       330       340       350         

               200       210       220        230       240        
pF1KSD EQFGF--CQQGTAAAFSPDSHYLLFGAPGTYNWKG-LLFVTNIDSSDPDQLVYKTLDPAD
        .::.   : : ..    :.  .:.:: :.:.:.: .:  :.  .  : .  :    : .
CCDS45 TSFGLEMSQTGFSSHVVEDG--VLLGAVGAYDWNGAVLKETSAGKVIPLRESYLKEFP-E
     360       370         380       390       400       410       

      250       260       270       280        290       300       
pF1KSD RLPGPAGDLALNSYLGFSIDSGKGLVRAEELS-FVAGAPRANHKGAVVILRKDSASRLVP
       .: . .      .:::... :   .: ...   .:::::: :: : :...   .   :. 
CCDS45 ELKNHG------AYLGYTVTS---VVSSRQGRVYVAGAPRFNHTGKVILFTMHNNRSLTI
        420             430          440       450       460       

       310       320       330        340       350       360      
pF1KSD EVMLSGERLTSGFGYSLAVADLNSDGWPD-LIVGAPYFFERQEELGGAVYVYLNQGGHWA
       .  . :... : ::  .. .:...::  : :.::::..:.. .: :  ::::  . . ..
CCDS45 HQAMRGQQIGSYFGSEITSVDIDGDGVTDVLLVGAPMYFNEGRERG-KVYVYELRQNLFV
       470       480       490       500       510        520      

        370        380       390       400         410       420   
pF1KSD GISPLRLCGS-PDSMFGISLAVLGDLNQDGFPDIAVGAPFDGD--GKVFIYHGSSLGVVA
         . :.   :  .. :: :.: . :::::.. :..::::.. .  : ..:.::   ... 
CCDS45 YNGTLKDSHSYQNARFGSSIASVRDLNQDSYNDVVVGAPLEDNHAGAIYIFHGFRGSILK
        530       540       550       560       570       580      

            430        440       450       460       470       480 
pF1KSD KPSQ-VLEGE-AVGIKSFGYSLSGSLDMDGNQYPDLLVGSLADTAVLFRARPILHVSHEV
        :.: .  .: :.:.. :: :. :.::.. .   :: ::.:.. ::.. .::.....  .
CCDS45 TPKQRITASELATGLQYFGCSIHGQLDLNEDGLIDLAVGALGN-AVILWSRPVVQINASL
        590       600       610       620        630       640     

             490         500       510        520       530        
pF1KSD SIAPRSIDLEQPNC--AGGHSVCVDLRVCFSYIAV-PSSYSPTVALDYVLDADTDRRLRG
        . : .:.. . .:  .:  ..:.   .::. : . :   . ::.. :  .:  :.:   
CCDS45 HFEPSKINIFHRDCKRSGRDATCLAAFLCFTPIFLAPHFQTTTVGIRY--NATMDERRY-
         650       660       670       680       690         700   

      540       550       560       570       580       590        
pF1KSD QVPRVTFLSRNLEEPKHQASGTVWLKHQHDRVCGDAMFQLQENVKDKLRAIVVTLSYSLQ
        .::.     .:.:   . .. . :  . ...:    :.. ... : .. .. .. :::.
CCDS45 -TPRA-----HLDEGGDRFTNRAVLLSSGQELCERINFHVLDTA-DYVKPVTFSVEYSLE
                  710       720       730       740        750     

      600       610       620       630       640        650       
pF1KSD TPRLRRQAPGQGLPPVAPILNAHQPSTQRAEIHFLKQGCGEDKICQSNLQL-VRA-----
        :        .:     :.:.   :.: :. . : . ::.::. :  .: : .:.     
CCDS45 DP-------DHG-----PMLDDGWPTTLRVSVPFWN-GCNEDEHCVPDLVLDARSDLPTA
                760            770        780       790       800  

                  660       670       680       690       700      
pF1KSD -RFCTRV-----SDTEFQPLPMDVDGTTALFALSGQPVIGLELMVTNLPSDPAQPQADGD
        ..: ::     .:     : .:   ::...  : .  ...:  . :           :.
CCDS45 MEYCQRVLRKPAQDCSAYTLSFD---TTVFIIESTRQRVAVEATLEN----------RGE
            810       820          830       840                   

        710       720        730       740        750        760   
pF1KSD DAHEAQLLVMLPDSLHYSG-VRALDPAEKPLCLSNENASHVE-CELGNPMKRG-AQVTFY
       .:. . : .    .:.... ..  :   .  :...:   . . :... :. :. :.:.: 
CCDS45 NAYSTVLNISQSANLQFASLIQKEDSDGSIECVNEERRLQKQVCNVSYPFFRAKAKVAFR
     850       860       870       880       890       900         

           770       780        790       800       810       820  
pF1KSD LILSTSGISIETTELEVELLLATIS-EQELHPVSARARVFIELPLSIAGMAIPQQLFFSG
       : .  :  ::   .::.::  .. : :..    .  : . ..:      .   .. .   
CCDS45 LDFEFSK-SIFLHHLEIELAAGSDSNERDSTKEDNVAPLRFHLKYEADVLFTRSSSLSHY
     910        920       930       940       950       960        

            830       840       850       860       870       880  
pF1KSD VVRGERAMQSERDVGSKVKYEVTVSNQGQSLRTLGSAFLNIMWPHEIANGKWLLYPMQVE
        :. . ...    .:   .    ..: :  :  . . ...:  :    .:. ::     .
CCDS45 EVKPNSSLERYDGIGPPFSCIFRIQNLG--LFPIHGMMMKITIPIATRSGNRLL-----K
      970       980       990        1000      1010      1020      

            890       900       910       920       930       940  
pF1KSD LEGGQGPGQKGLCSPRPNILHLDVDSRDRRRRELEPPEQQEPGERQEPSMSWWPVSSAEK
       :.       .  :.   :       : . :      :   :   :. :...       ..
CCDS45 LRDFLTDEANTSCNIWGN-------STEYR------PTPVEEDLRRAPQLN-------HS
            1030             1040            1050             1060 

            950       960       970       980       990      1000  
pF1KSD KKNITLDCARGTANCVVFSCPLYSFDRAAVLHVWGRLWNSTFLEEYSAVKSLEVIVRANI
       .....      . :: .   :    ..   .:. : ::  ..  .    ::....: : .
CCDS45 NSDVV------SINCNIRLVP----NQEINFHLLGNLWLRSL--KALKYKSMKIMVNAAL
                  1070          1080      1090        1100         

           1010      1020      1030      1040      1050      1060  
pF1KSD TVKSSIKNLMLRDASTVIPVMVYLDPMAVVAEGVPWWVILLAVLAGLLVLALLVLLLWKM
         ..  . ...:. .    ..  .. .      :: :.:. ..:.:::.:::::: :::.
CCDS45 Q-RQFHSPFIFREEDPSRQIVFEISKQE--DWQVPIWIIVGSTLGGLLLLALLVLALWKL
    1110       1120      1130        1140      1150      1160      

           1070      1080      1090      1100      1110      1120  
pF1KSD GFFKRAKHPEATVPQYHAVKIPREDRQQFKEEKTGTILRNNWGSPRREGPDAHPILAADG
       :::. :.                                                     
CCDS45 GFFRSARRRREPGLDPTPKVLE                                      
       1170      1180                                              




1137 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 08:25:18 2016 done: Thu Nov  3 08:25:19 2016
 Total Scan time:  4.520 Total Display time:  0.470

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com