Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDB0061
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0061, 1098 aa
1>>>pF1KSDB0061 1098 - 1098 aa - 1098 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2685+/-0.00148; mu= 0.2875+/- 0.089
mean_var=324.4341+/-66.756, 0's: 0 Z-trim(109.0): 121 B-trim: 3 in 1/49
Lambda= 0.071205
statistics sampled from 10490 (10596) to 10490 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.66), E-opt: 0.2 (0.325), width: 16
Scan time: 5.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42494.1 MYO1F gene_id:4542|Hs108|chr19 (1098) 7388 774.2 0
CCDS32254.1 MYO1E gene_id:4643|Hs108|chr15 (1108) 5358 565.7 2.1e-160
CCDS53826.1 MYO1H gene_id:283446|Hs108|chr12 (1022) 2004 221.1 1e-56
CCDS53685.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (1178) 1639 183.6 2.2e-45
CCDS53684.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (2175) 1639 183.9 3.5e-45
CCDS53683.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (2215) 1639 183.9 3.5e-45
CCDS2311.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1078) 1461 165.3 6.6e-40
CCDS82546.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1107) 1461 165.3 6.7e-40
CCDS46477.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1136) 1461 165.3 6.9e-40
CCDS11003.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1028) 1438 162.9 3.3e-39
CCDS45562.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1044) 1438 162.9 3.3e-39
CCDS42226.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1063) 1438 162.9 3.4e-39
CCDS54834.1 MYO10 gene_id:4651|Hs108|chr5 (2058) 1393 158.6 1.3e-37
CCDS42036.1 MYO5C gene_id:55930|Hs108|chr15 (1742) 1353 154.4 2.1e-36
CCDS46405.1 MYO7B gene_id:4648|Hs108|chr2 (2116) 1343 153.5 4.8e-36
CCDS8929.1 MYO1A gene_id:4640|Hs108|chr12 (1043) 1331 151.9 6.8e-36
CCDS42271.1 MYO15A gene_id:51168|Hs108|chr17 (3530) 1342 153.6 7.5e-36
CCDS42436.1 MYO5B gene_id:4645|Hs108|chr18 (1848) 1311 150.1 4.3e-35
CCDS45262.1 MYO5A gene_id:4644|Hs108|chr15 (1828) 1295 148.5 1.3e-34
CCDS42037.1 MYO5A gene_id:4644|Hs108|chr15 (1855) 1295 148.5 1.3e-34
CCDS76991.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 ( 961) 1285 147.2 1.7e-34
CCDS32615.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 (1006) 1285 147.2 1.7e-34
CCDS46010.1 MYO9B gene_id:4650|Hs108|chr19 (2022) 1232 142.0 1.3e-32
CCDS13927.1 MYH9 gene_id:4627|Hs108|chr22 (1960) 1227 141.5 1.8e-32
CCDS11144.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (1976) 1186 137.3 3.3e-31
CCDS10566.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1938) 1179 136.6 5.3e-31
CCDS10565.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1972) 1179 136.6 5.4e-31
CCDS9601.1 MYH7 gene_id:4625|Hs108|chr14 (1935) 1163 134.9 1.7e-30
CCDS76992.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 ( 436) 1135 131.5 4.1e-30
CCDS59411.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (1995) 1135 132.1 1.3e-29
CCDS11157.1 MYH3 gene_id:4621|Hs108|chr17 (1940) 1134 132.0 1.3e-29
CCDS54112.1 MYO19 gene_id:80179|Hs108|chr17 ( 970) 1124 130.7 1.6e-29
CCDS11153.1 MYH8 gene_id:4626|Hs108|chr17 (1937) 1115 130.0 5.1e-29
CCDS43127.1 MYH15 gene_id:22989|Hs108|chr3 (1946) 1102 128.7 1.3e-28
CCDS7148.1 MYO3A gene_id:53904|Hs108|chr10 (1616) 951 113.1 5.3e-24
CCDS46446.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1314) 923 110.1 3.3e-23
CCDS42773.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1341) 923 110.1 3.4e-23
CCDS73984.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (1985) 878 105.7 1.1e-21
CCDS9600.1 MYH6 gene_id:4624|Hs108|chr14 (1939) 876 105.4 1.3e-21
CCDS42869.1 MYH7B gene_id:57644|Hs108|chr20 (1983) 855 103.3 5.7e-21
CCDS11156.1 MYH2 gene_id:4620|Hs108|chr17 (1941) 835 101.2 2.3e-20
CCDS32008.1 MYO16 gene_id:23026|Hs108|chr13 (1858) 829 100.6 3.4e-20
CCDS73598.1 MYO16 gene_id:23026|Hs108|chr13 (1880) 829 100.6 3.5e-20
CCDS11154.1 MYH4 gene_id:4622|Hs108|chr17 (1939) 822 99.9 5.9e-20
CCDS45613.1 MYH13 gene_id:8735|Hs108|chr17 (1938) 817 99.4 8.4e-20
CCDS11155.1 MYH1 gene_id:4619|Hs108|chr17 (1939) 815 99.2 9.6e-20
CCDS34629.1 MYO1G gene_id:64005|Hs108|chr7 (1018) 808 98.2 9.9e-20
CCDS45654.1 MYO19 gene_id:80179|Hs108|chr17 ( 770) 705 87.5 1.2e-16
CCDS10239.1 MYO9A gene_id:4649|Hs108|chr15 (2548) 684 85.8 1.3e-15
CCDS75481.1 MYO6 gene_id:4646|Hs108|chr6 (1262) 670 84.1 2.1e-15
>>CCDS42494.1 MYO1F gene_id:4542|Hs108|chr19 (1098 aa)
initn: 7388 init1: 7388 opt: 7388 Z-score: 4120.4 bits: 774.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7388; 99.9% identity (99.9% similar) in 1098 aa overlap (1-1098:1-1098)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGSKERFHWQSHNVKQSGVDDMVLLPQITEDAIAANLRKRFMDDYIFTYIGSVLISVNPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MGSKERFHWQSHNVKQSGVDDMVLLPQITEDAIAANLRKRFMDDYIFTYIGSVLISVNPF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KQMPYFTDREIDLYQGAAQYENPPHIYALTDNMYRNMLIDCENQCVIISGESGAGKTVAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KQMPYFTDREIDLYQGAAQYENPPHIYALTDNMYRNMLIDCENQCVIISGESGAGKTVAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD KYIMGYISKVSGGGEKVQHVKDIILQSNPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKYFEIQFSRGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KYIMGYISKVSGGGEKVQHVKDIILQSNPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKYFEIQFSRGG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EPDGGKISNFLLEKSRVVMQNENERNFHIYYQLLEGASQEQRQNLGLMTPDYYYYLNQSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EPDGGKISNFLLEKSRVVMQNENERNFHIYYQLLEGASQEQRQNLGLMTPDYYYYLNQSD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TYQVDGTDDRSDFGETLSAMQVIGIPPSIQQLVLQLVAGILHLGNISFCEDGNYARVESV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TYQVDGTDDRSDFGETLSAMQVIGIPPSIQQLVLQLVAGILHLGNISFCEDGNYARVESV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DLLAFPAYLLGIDSGRLQEKLTSRKMDSRWGGRSESINVTLNVEQAAYTRDALAKGLYAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DLLAFPAYLLGIDSGRLQEKLTSRKMDSRWGGRSESINVTLNVEQAAYTRDALAKGLYAR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LFDFLVEAINRAMQKPQEEYSIGVLDIYGFEIFQKNGFEQFCINFVNEKLQQIFIELTLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LFDFLVEAINRAMQKPQEEYSIGVLDIYGFEIFQKNGFEQFCINFVNEKLQQIFIELTLK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD AEQEEYVQAGIRWTPIQYFNNKVVCDLIENKLSPPGIMSVLDDVCATMHATGGGADQTLL
:::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AEQEEYVQEGIRWTPIQYFNNKVVCDLIENKLSPPGIMSVLDDVCATMHATGGGADQTLL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QKLQAAVGTHEHFNSWSAGFVIHHYAGKVSYDVSGFCERNRDVLFSDLIELMQTSEQAFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QKLQAAVGTHEHFNSWSAGFVIHHYAGKVSYDVSGFCERNRDVLFSDLIELMQTSEQAFL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RMLFPEKLDGDKKGRPSTAGSKIKKQANDLVATLMRCTPHYIRCIKPNETKRPRDWEENR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RMLFPEKLDGDKKGRPSTAGSKIKKQANDLVATLMRCTPHYIRCIKPNETKRPRDWEENR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD VKHQVEYLGLKENIRVRRAGFAYRRQFAKFLQRYAILTPETWPRWRGDERQGVQHLLRAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VKHQVEYLGLKENIRVRRAGFAYRRQFAKFLQRYAILTPETWPRWRGDERQGVQHLLRAV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD NMEPDQYQMGSTKVFVKNPESLFLLEEVRERKFDGFARTIQKAWRRHVAVRKYEEMREEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NMEPDQYQMGSTKVFVKNPESLFLLEEVRERKFDGFARTIQKAWRRHVAVRKYEEMREEA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SNILLNKKERRRNSINRNFVGDYLGLEERPELRQFLGKRERVDFADSVTKYDRRFKPIKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SNILLNKKERRRNSINRNFVGDYLGLEERPELRQFLGKRERVDFADSVTKYDRRFKPIKR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DLILTPKCVYVIGREKVKKGPEKGQVCEVLKKKVDIQALRGVSLSTRQDDFFILQEDAAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DLILTPKCVYVIGREKVKKGPEKGQVCEVLKKKVDIQALRGVSLSTRQDDFFILQEDAAD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD SFLESVFKTEFVSLLCKRFEEATRRPLPLTFSDTLQFRVKKEGWGGGGTRSVTFSRGFGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SFLESVFKTEFVSLLCKRFEEATRRPLPLTFSDTLQFRVKKEGWGGGGTRSVTFSRGFGD
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD LAVLKVGGRTLTVSVGDGLPKSSKPTRKGMAKGKPRRSSQAPTRAAPAPPRGMDRNGVPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LAVLKVGGRTLTVSVGDGLPKSSKPTRKGMAKGKPRRSSQAPTRAAPAPPRGMDRNGVPP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD SARGGPLPLEIMSGGGTHRPPRGPPSTSLGASRRPRARPPSEHNTEFLNVPDQGMAGMQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SARGGPLPLEIMSGGGTHRPPRGPPSTSLGASRRPRARPPSEHNTEFLNVPDQGMAGMQR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD KRSVGQRPVPGVGRPKPQPRTHGPRCRALYQYVGQDVDELSFNVNEVIEILMEDPSGWWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KRSVGQRPVPGVGRPKPQPRTHGPRCRALYQYVGQDVDELSFNVNEVIEILMEDPSGWWK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090
pF1KSD GRLHGQEGLFPGNYVEKI
::::::::::::::::::
CCDS42 GRLHGQEGLFPGNYVEKI
1090
>>CCDS32254.1 MYO1E gene_id:4643|Hs108|chr15 (1108 aa)
initn: 5332 init1: 4731 opt: 5358 Z-score: 2993.3 bits: 565.7 E(32554): 2.1e-160
Smith-Waterman score: 5362; 71.6% identity (87.6% similar) in 1116 aa overlap (1-1098:1-1108)
10 20 30 40 50
pF1KSD MGSK--ERFHWQSHNVKQSGVDDMVLLPQITEDAIAANLRKRFMDDYIFTYIGSVLISVN
:::: ..::::::::.::::::::: .:::..:. ::.::.:::::::::::::::::
CCDS32 MGSKGVYQYHWQSHNVKHSGVDDMVLLSKITENSIVENLKKRYMDDYIFTYIGSVLISVN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD PFKQMPYFTDREIDLYQGAAQYENPPHIYALTDNMYRNMLIDCENQCVIISGESGAGKTV
:::::::: ..::..::::::::::::::::.:::::::.:: :::::::::::::::::
CCDS32 PFKQMPYFGEKEIEMYQGAAQYENPPHIYALADNMYRNMIIDRENQCVIISGESGAGKTV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD AAKYIMGYISKVSGGGEKVQHVKDIILQSNPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKYFEIQFSR
::::::.:::.::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AAKYIMSYISRVSGGGTKVQHVKDIILQSNPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKYFEIQFSP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD GGEPDGGKISNFLLEKSRVVMQNENERNFHIYYQLLEGASQEQRQNLGLMTPDYYYYLNQ
:::::::::::::::::::::.: .::.:::.:::.:::: ::...::. . ::::::.
CCDS32 GGEPDGGKISNFLLEKSRVVMRNPGERSFHIFYQLIEGASAEQKHSLGITSMDYYYYLSL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SDTYQVDGTDDRSDFGETLSAMQVIGIPPSIQQLVLQLVAGILHLGNISFCEDGNYARVE
: .:.:: ::: .: ::: ::.:::: : ::::.:::::::::::: : :::: ::
CCDS32 SGSYKVDDIDDRREFQETLHAMNVIGIFAEEQTLVLQIVAGILHLGNISFKEVGNYAAVE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD SVDLLAFPAYLLGIDSGRLQEKLTSRKMDSRWGGRSESINVTLNVEQAAYTRDALAKGLY
: ..::::::::::.. ::.::::::.:::.:::.::::.:::::::: ::::::::.:.
CCDS32 SEEFLAFPAYLLGINQDRLKEKLTSRQMDSKWGGKSESIHVTLNVEQACYTRDALAKALH
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD ARLFDFLVEAINRAMQKPQEEYSIGVLDIYGFEIFQKNGFEQFCINFVNEKLQQIFIELT
::.:::::..::.::.: .:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ARVFDFLVDSINKAMEKDHEEYNIGVLDIYGFEIFQKNGFEQFCINFVNEKLQQIFIELT
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD LKAEQEEYVQAGIRWTPIQYFNNKVVCDLIENKLSPPGIMSVLDDVCATMHATGGGADQT
:::::::::: :::::::.:::::.::::::::..::::::.::::::::::.: :::::
CCDS32 LKAEQEEYVQEGIRWTPIEYFNNKIVCDLIENKVNPPGIMSILDDVCATMHAVGEGADQT
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD LLQKLQAAVGTHEHFNSWSAGFVIHHYAGKVSYDVSGFCERNRDVLFSDLIELMQTSEQA
:::::: .:.:::::::. ::.:::::::::::..::::::::::: :::::::.::
CCDS32 LLQKLQMQIGSHEHFNSWNQGFIIHHYAGKVSYDMDGFCERNRDVLFMDLIELMQSSELP
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD FLRMLFPEKLDGDKKGRPSTAGSKIKKQANDLVATLMRCTPHYIRCIKPNETKRPRDWEE
:.. ::::.:..::::::.::::::::::::::.:::.:::::::::::::::.::::::
CCDS32 FIKSLFPENLQADKKGRPTTAGSKIKKQANDLVSTLMKCTPHYIRCIKPNETKKPRDWEE
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD NRVKHQVEYLGLKENIRVRRAGFAYRRQFAKFLQRYAILTPETWPRWRGDERQGVQHLLR
.:::::::::::::::::::::.:::: : :::::::::: ::: :.:.:.::: :::.
CCDS32 SRVKHQVEYLGLKENIRVRRAGYAYRRIFQKFLQRYAILTKATWPSWQGEEKQGVLHLLQ
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KSD AVNMEPDQYQMGSTKVFVKNPESLFLLEEVRERKFDGFARTIQKAWRRHVAVRKYEEMRE
.:::. ::.:.: .:::.: :::::::::.::::.::.::.:::.::. :: .:: .:::
CCDS32 SVNMDSDQFQLGRSKVFIKAPESLFLLEEMRERKYDGYARVIQKSWRKFVARKKYVQMRE
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KSD EASNILLNKKERRRNSINRNFVGDYLGLEERPELRQFLGKRERVDFADSVTKYDRRFKPI
:::..::::::::::::::::.:::.:.::.:::.::.::::..::::.::::::::: .
CCDS32 EASDLLLNKKERRRNSINRNFIGDYIGMEEHPELQQFVGKREKIDFADTVTKYDRRFKGV
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KSD KRDLILTPKCVYVIGREKVKKGPEKGQVCEVLKKKVDIQALRGVSLSTRQDDFFILQEDA
::::.:::::.:.:::::::.::.:: : ::::.:..:. . .::::: :::.:::.:.
CCDS32 KRDLLLTPKCLYLIGREKVKQGPDKGLVKEVLKRKIEIERILSVSLSTMQDDIFILHEQE
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KSD ADSFLESVFKTEFVSLLCKRFEEATRRPLPLTFSDTLQFRVKKEGWG---GGGTRSVTFS
::.:::::::::.::: ::.:: :.. ::: ::.::....:::.:: .::.:.: :
CCDS32 YDSLLESVFKTEFLSLLAKRYEEKTQKQLPLKFSNTLELKLKKENWGPWSAGGSRQVQFH
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CCDS53 S-GFEDLERGRREMVEEDLDAALPLPDEDEEDLSEYKFAKFAATYFQGTTTHSYTRRPLK
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CCDS53 LCDSGQVQVVDDEDNEHWISPQNATHIKPMHPTSVHGVEDMIRLGDLNEAGILRNLLIRY
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50 60 70 80 90 100
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CCDS53 RDHLIYTYTGSILVAVNPYQLLSIYSPEHIRQYTNKKIGEMPPHIFAIADNCYFNMKRNS
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150
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..:: ::::::::::: ..: :. ... .:: :: ... .:...:.:::::::::
CCDS53 RDQCCIISGESGAGKTESTKLILQFLAAISG-----QHSWIEQQVLEATPILEAFGNAKT
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160 170 180 190 200 210
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.::.::::::::..:.:.. : .:.:: ..::::::: : .:::.:..: .::: :.
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220 230 240 250 260 270
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.:...::: . : :: ... .: : ..... :::.:. . . . . .:.:.
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280 290 300 310 320 330
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::::::... : .. ... ..: : : :: .. :. :::: . .: .
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:.... :. ::: .:::..::.:.::: ..:. :: :. :: . :::.:::.
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390 400 410 420 430 440
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.:: : :...:: :.:::.: .:.:.:...:.. :....: . .. . : : .:.
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570 580 590 600 610 620
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: .:..:..:: .: : . : .. :: : :.. .:: :..:.:.::.:.:. ..
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690 700 710
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..: :..: ..: :. . : ::. :: : ..: ::
CCDS53 MLLEVERDKAITDRVILLQKVIRGFKDRSNFLKLKNAATLIQRHWRGHNCRKNYGLMR--
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. . :. .: :. .. .. .. . . : .: . :.:. . .: : : .
CCDS53 LGFLRLQALHRSRKLHQQYRLARQRIIQFQARCRAYLVRKAFRHRLWAVLTVQAYARGMI
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. : . .. . ::.. . :. :. ::. .: : .:. . : .
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. :. :. .. . : ...:.: : :.. :: .. : .:: : .. .
CCDS53 EDAERELKEKEAARRKKELLEQMERA--RHEPVNHSDMVDKMFGFLGTSGGLPGQEGQAP
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900 910 920 930 940 950
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: :: ::
CCDS53 S-GFEDLERGRREMVEEDLDAALPLPDEDEEDLSEYKFAKFAATYFQGTTTHSYTRRPLK
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10 20 30 40 50 60
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..... . : : :::.. :.. .. : .... .:....:::: :: :.::::
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..: :.:. :: . : . .:... :::: . . :: ::::..: .. :. .:.
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.:.::::::::. : . ..: : ::..:::: ::.::::::.:.:. . :.:: .
CCDS23 KNPNYIRCIKPNDKKAAHIFNEALVCHQIRYLGLLENVRVRRAGYAFRQAYEPCLERYKM
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: ::: .: : : . : .. : ...: ... . .: .:. : . :
CCDS23 ATLIQKIYRGWKCRTHFLLMKKSQIVIAAWYRRYAQQKRYQQTKSSALVIQSYIRGWKAR
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::.. ... . . ... :
CCDS23 KILRELKHQKRCKEAVTTIAAYWHGTQVRREYRKFFRANAGKKIYEFTLQRIVQKYFLEM
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGSKERFHWQSHNVKQSGVDDMVLLPQITEDAIAANLRKRFMDDYIFTYIGSVLISVNPF
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CCDS82 MAKMEVKTSLLDNMIGVGDMVLLEPLNEETFINNLKKRFDHSEIYTYIGSVVISVNPY
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CCDS82 RSLPIYSPEKVEEYRNRNFYELSPHIFALSDEAYRSLRDQDKDQCILITGESGAGKTEAS
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CCDS82 KLVMSYVAAVCGKGAEVNQVKEQLLQSNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKYMDIEFDFKG
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CCDS82 DPLGGVISNYLLEKSRVVKQPRGERNFHVFYQLLSGASEELLNKLKLER-DFSRYNYLSL
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CCDS82 GTVTDETFLEKLNQVCATHQHFESRMSKCSRFLNDTSLPHSCFRIQHYAGKVLYQVEGFV
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CCDS82 DKNNDLLYRDLSQAMWKASHALIKSLFPEGNPAKINLKRPPTAGSQFKASVATLMKNLQT
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CCDS82 KNPNYIRCIKPNDKKAAHIFNEALVCHQIRYLGLLENVRVRRAGYAFRQAYEPCLERYKM
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CCDS82 LCKQTWPHWKGPARSGVEVLFNELEIPVEEYSFGRSKIFIRNPRTLFKLEDLRKQRLEDL
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CCDS82 ATLIQKIYRGWKCRTHFLLMKKSQIVIAAWYRRYAQQKRYQQTKSSALVIQSYIRGWKAR
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pF1KSD PELRQFLGKRERVDFADSVTKYDRRFKPIKRDLILTPKCVYVIGREKVKKGPEKGQVCEV
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CCDS82 KILRELKHQKRCKEAVTTIAAYWHGTQARRELKRLKEEARRKHAVAVIWAYWLGLKVRRE
770 780 790 800 810 820
>>CCDS46477.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1136 aa)
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CCDS46 MAKMEVKTSLLDNMIGVGDMVLLEPLNEETFINNLKKRFDHSEIYTYIGSVVISVNPY
10 20 30 40 50
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CCDS46 RSLPIYSPEKVEEYRNRNFYELSPHIFALSDEAYRSLRDQDKDQCILITGESGAGKTEAS
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pF1KSD KYIMGYISKVSGGGEKVQHVKDIILQSNPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKYFEIQFSRGG
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CCDS46 KLVMSYVAAVCGKGAEVNQVKEQLLQSNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKYMDIEFDFKG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KSD EPDGGKISNFLLEKSRVVMQNENERNFHIYYQLLEGASQEQRQNLGLMTPDY--YYYLNQ
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CCDS46 DPLGGVISNYLLEKSRVVKQPRGERNFHVFYQLLSGASEELLNKLKLER-DFSRYNYLSL
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CCDS46 -DSAKVNGVDDAANFRTVRNAMQIVGFMDHEAESVLAVVAAVLKLGNIEFKPESRVNGLD
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CCDS46 ESKIKDKNELKEICELTGIDQSVLERAFSFRTVEAK----QEKVSTTLNVAQAYYARDAL
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pF1KSD AKGLYARLFDFLVEAINRAM--QKPQEEYSIGVLDIYGFEIFQKNGFEQFCINFVNEKLQ
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CCDS46 AKNLYSRLFSWLVNRINESIKAQTKVRKKVMGVLDIYGFEIFEDNSFEQFIINYCNEKLQ
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CCDS46 QIFIELTLKEEQEEYIREDIEWTHIDYFNNAIICDLIENNTN--GILAMLDEECLR---P
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