Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDB0238
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0238, 1257 aa
1>>>pF1KSDB0238 1257 - 1257 aa - 1257 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3730+/-0.00125; mu= 12.5559+/- 0.073
mean_var=178.7460+/-37.968, 0's: 0 Z-trim(106.7): 208 B-trim: 302 in 1/50
Lambda= 0.095930
statistics sampled from 8885 (9132) to 8885 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.632), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 4.170
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14733.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1257) 8540 1196.2 0
CCDS14734.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1253) 8499 1190.5 0
CCDS48192.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1248) 8433 1181.3 0
CCDS55153.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1192) 2665 383.0 2.4e-105
CCDS58812.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1208) 2539 365.6 4.3e-100
CCDS5751.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1183) 2063 299.7 2.9e-80
CCDS75652.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1211) 2063 299.7 2.9e-80
CCDS47686.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1304) 2059 299.2 4.5e-80
CCDS30982.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 (1169) 1988 289.3 3.8e-77
CCDS53462.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 (1174) 1988 289.3 3.8e-77
CCDS2556.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1224) 1873 273.4 2.4e-72
CCDS74887.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1171) 1864 272.2 5.6e-72
CCDS53461.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 ( 619) 1578 232.3 2.9e-60
CCDS53460.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 (1240) 1576 232.3 5.8e-60
CCDS53696.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 (1100) 1508 222.9 3.6e-57
CCDS53697.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 (1026) 1506 222.6 4.2e-57
CCDS33790.1 CNTN3 gene_id:5067|Hs108|chr3 (1028) 1473 218.0 9.9e-56
CCDS58168.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 ( 911) 1340 199.6 3.2e-50
CCDS43041.1 CNTN4 gene_id:152330|Hs108|chr3 (1026) 1331 198.4 8.1e-50
CCDS2557.1 CNTN6 gene_id:27255|Hs108|chr3 (1028) 1327 197.8 1.2e-49
CCDS1449.1 CNTN2 gene_id:6900|Hs108|chr1 (1040) 1220 183.0 3.5e-45
CCDS8738.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12 (1007) 1149 173.2 3.1e-42
CCDS8737.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12 (1018) 1149 173.2 3.1e-42
CCDS34590.1 SDK1 gene_id:221935|Hs108|chr7 (2213) 987 151.1 3e-35
CCDS45769.1 SDK2 gene_id:54549|Hs108|chr17 (2172) 978 149.8 7e-35
CCDS2558.1 CNTN4 gene_id:152330|Hs108|chr3 ( 698) 837 129.8 2.4e-29
CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1910) 729 115.3 1.5e-24
CCDS11952.1 DCC gene_id:1630|Hs108|chr18 (1447) 721 114.1 2.7e-24
CCDS42929.1 DSCAM gene_id:1826|Hs108|chr21 (2012) 669 107.0 5e-22
CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1898) 651 104.5 2.7e-21
CCDS43786.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1912) 637 102.6 1e-20
CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1907) 627 101.2 2.7e-20
CCDS45930.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1948) 616 99.7 7.9e-20
CCDS8384.1 DSCAML1 gene_id:57453|Hs108|chr11 (2113) 577 94.3 3.5e-18
CCDS4884.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1070) 547 89.9 3.9e-17
CCDS59021.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1078) 547 89.9 3.9e-17
CCDS58225.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12 ( 627) 483 80.8 1.2e-14
CCDS55288.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1502) 476 80.2 4.5e-14
CCDS42910.1 NCAM2 gene_id:4685|Hs108|chr21 ( 837) 460 77.7 1.4e-13
CCDS6472.2 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 462 78.3 1.7e-13
CCDS55290.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1506) 462 78.3 1.7e-13
CCDS75813.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1496) 448 76.3 6.5e-13
CCDS4887.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1014) 429 73.5 3.1e-12
CCDS54610.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1551) 423 72.9 7.4e-12
CCDS46872.2 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1606) 423 72.9 7.5e-12
CCDS3160.1 IGSF10 gene_id:285313|Hs108|chr3 (2623) 423 73.1 1.1e-11
CCDS43109.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3 (1378) 414 71.6 1.6e-11
CCDS54609.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3 (1394) 411 71.2 2.2e-11
CCDS30808.1 LRIG2 gene_id:9860|Hs108|chr1 (1065) 404 70.1 3.5e-11
CCDS55289.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 406 70.5 3.7e-11
>>CCDS14733.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1257 aa)
initn: 8540 init1: 8540 opt: 8540 Z-score: 6398.8 bits: 1196.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8540; 100.0% identity (100.0% similar) in 1257 aa overlap (1-1257:1-1257)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVVALRYVWPLLLCSPCLLIQIPEEYEGHHVMEPPVITEQSPRRLVVFPTDDISLKCEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MVVALRYVWPLLLCSPCLLIQIPEEYEGHHVMEPPVITEQSPRRLVVFPTDDISLKCEAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQGIYRCFASNKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQGIYRCFASNKL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRIYWMNSKILHIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRIYWMNSKILHIK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRVKATNSMIDRKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRVKATNSMIDRKP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RLLFPTNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPTPTIKWLRPSGPMPADRVTYQNHNKTLQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RLLFPTNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPTPTIKWLRPSGPMPADRVTYQNHNKTLQLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVEAAPYWLHKPQSHLYGPGETARLDCQVQGRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVEAAPYWLHKPQSHLYGPGETARLDCQVQGRP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALILSNVQPSDTMVTQCEARNRHGLLLANAYIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALILSNVQPSDTMVTQCEARNRHGLLLANAYIY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSVQWLDEDGTTVLQDERFFPYANG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSVQWLDEDGTTVLQDERFFPYANG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD TLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDATQITQGPRSTIEKKGSRVTFTCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDATQITQGPRSTIEKKGSRVTFTCQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ASFDPSLQPSITWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDGRLVIHSLDYSDQGNYSCVASTELDVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ASFDPSLQPSITWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDGRLVIHSLDYSDQGNYSCVASTELDVV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ESRAQLLVVGSPGPVPRLVLSDLHLLTQSQVRVSWSPAEDHNAPIEKYDIEFEDKEMAPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ESRAQLLVVGSPGPVPRLVLSDLHLLTQSQVRVSWSPAEDHNAPIEKYDIEFEDKEMAPE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPYVHYTFRVTAINKYGPGEPSPVSETVVTPEAAPEKNPVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPYVHYTFRVTAINKYGPGEPSPVSETVVTPEAAPEKNPVD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD VKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQGTRGPWQEQIVSDPFLVVSNTST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQGTRGPWQEQIVSDPFLVVSNTST
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD FVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGEDYPQAIPELEGIEILNSSAVLVKWRPVDLAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGEDYPQAIPELEGIEILNSSAVLVKWRPVDLAQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD VKGHLRGYNVTYWREGSQRKHSKRHIHKDHVVVPANTTSVILSGLRPYSSYHLEVQAFNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VKGHLRGYNVTYWREGSQRKHSKRHIHKDHVVVPANTTSVILSGLRPYSSYHLEVQAFNG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD RGSGPASEFTFSTPEGVPGHPEALHLECQSNTSLLLRWQPPLSHNGVLTGYVLSYHPLDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RGSGPASEFTFSTPEGVPGHPEALHLECQSNTSLLLRWQPPLSHNGVLTGYVLSYHPLDE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD GGKGQLSFNLRDPELRTHNLTDLSPHLRYRFQLQATTKEGPGEAIVREGGTMALSGISDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GGKGQLSFNLRDPELRTHNLTDLSPHLRYRFQLQATTKEGPGEAIVREGGTMALSGISDF
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD GNISATAGENYSVVSWVPKEGQCNFRFHILFKALGEEKGGASLSPQYVSYNQSSYTQWDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GNISATAGENYSVVSWVPKEGQCNFRFHILFKALGEEKGGASLSPQYVSYNQSSYTQWDL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD QPDTDYEIHLFKERMFRHQMAVKTNGTGRVRLPPAGFATEGWFIGFVSAIILLLLVLLIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QPDTDYEIHLFKERMFRHQMAVKTNGTGRVRLPPAGFATEGWFIGFVSAIILLLLVLLIL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD CFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMKDETFGEYRSLESDNEEKAFGSSQPSLNGDIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMKDETFGEYRSLESDNEEKAFGSSQPSLNGDIK
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD PLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKEKEAAGGNDSSGATSPINPAVALE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKEKEAAGGNDSSGATSPINPAVALE
1210 1220 1230 1240 1250
>>CCDS14734.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1253 aa)
initn: 8503 init1: 8013 opt: 8499 Z-score: 6368.1 bits: 1190.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8499; 99.7% identity (99.7% similar) in 1257 aa overlap (1-1257:1-1253)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVVALRYVWPLLLCSPCLLIQIPEEYEGHHVMEPPVITEQSPRRLVVFPTDDISLKCEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MVVALRYVWPLLLCSPCLLIQIPEEYEGHHVMEPPVITEQSPRRLVVFPTDDISLKCEAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQGIYRCFASNKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQGIYRCFASNKL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRIYWMNSKILHIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRIYWMNSKILHIK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRVKATNSMIDRKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRVKATNSMIDRKP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RLLFPTNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPTPTIKWLRPSGPMPADRVTYQNHNKTLQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RLLFPTNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPTPTIKWLRPSGPMPADRVTYQNHNKTLQLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVEAAPYWLHKPQSHLYGPGETARLDCQVQGRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVEAAPYWLHKPQSHLYGPGETARLDCQVQGRP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALILSNVQPSDTMVTQCEARNRHGLLLANAYIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALILSNVQPSDTMVTQCEARNRHGLLLANAYIY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSVQWLDEDGTTVLQDERFFPYANG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSVQWLDEDGTTVLQDERFFPYANG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD TLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDATQITQGPRSTIEKKGSRVTFTCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDATQITQGPRSTIEKKGSRVTFTCQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ASFDPSLQPSITWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDGRLVIHSLDYSDQGNYSCVASTELDVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ASFDPSLQPSITWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDGRLVIHSLDYSDQGNYSCVASTELDVV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ESRAQLLVVGSPGPVPRLVLSDLHLLTQSQVRVSWSPAEDHNAPIEKYDIEFEDKEMAPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ESRAQLLVVGSPGPVPRLVLSDLHLLTQSQVRVSWSPAEDHNAPIEKYDIEFEDKEMAPE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPYVHYTFRVTAINKYGPGEPSPVSETVVTPEAAPEKNPVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPYVHYTFRVTAINKYGPGEPSPVSETVVTPEAAPEKNPVD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD VKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQGTRGPWQEQIVSDPFLVVSNTST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQGTRGPWQEQIVSDPFLVVSNTST
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD FVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGEDYPQAIPELEGIEILNSSAVLVKWRPVDLAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGEDYPQAIPELEGIEILNSSAVLVKWRPVDLAQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD VKGHLRGYNVTYWREGSQRKHSKRHIHKDHVVVPANTTSVILSGLRPYSSYHLEVQAFNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VKGHLRGYNVTYWREGSQRKHSKRHIHKDHVVVPANTTSVILSGLRPYSSYHLEVQAFNG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD RGSGPASEFTFSTPEGVPGHPEALHLECQSNTSLLLRWQPPLSHNGVLTGYVLSYHPLDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RGSGPASEFTFSTPEGVPGHPEALHLECQSNTSLLLRWQPPLSHNGVLTGYVLSYHPLDE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD GGKGQLSFNLRDPELRTHNLTDLSPHLRYRFQLQATTKEGPGEAIVREGGTMALSGISDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GGKGQLSFNLRDPELRTHNLTDLSPHLRYRFQLQATTKEGPGEAIVREGGTMALSGISDF
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD GNISATAGENYSVVSWVPKEGQCNFRFHILFKALGEEKGGASLSPQYVSYNQSSYTQWDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GNISATAGENYSVVSWVPKEGQCNFRFHILFKALGEEKGGASLSPQYVSYNQSSYTQWDL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD QPDTDYEIHLFKERMFRHQMAVKTNGTGRVRLPPAGFATEGWFIGFVSAIILLLLVLLIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QPDTDYEIHLFKERMFRHQMAVKTNGTGRVRLPPAGFATEGWFIGFVSAIILLLLVLLIL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD CFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMKDETFGEYRSLESDNEEKAFGSSQPSLNGDIK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS14 CFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMKDETFGEY----SDNEEKAFGSSQPSLNGDIK
1150 1160 1170 1180 1190
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD PLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKEKEAAGGNDSSGATSPINPAVALE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKEKEAAGGNDSSGATSPINPAVALE
1200 1210 1220 1230 1240 1250
>>CCDS48192.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1248 aa)
initn: 8443 init1: 7790 opt: 8433 Z-score: 6318.8 bits: 1181.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8433; 99.2% identity (99.3% similar) in 1257 aa overlap (1-1257:1-1248)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVVALRYVWPLLLCSPCLLIQIPEEYEGHHVMEPPVITEQSPRRLVVFPTDDISLKCEAS
::::::::::::::::::::::::: .:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MVVALRYVWPLLLCSPCLLIQIPEE-----LMEPPVITEQSPRRLVVFPTDDISLKCEAS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQGIYRCFASNKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQGIYRCFASNKL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRIYWMNSKILHIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRIYWMNSKILHIK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRVKATNSMIDRKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRVKATNSMIDRKP
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RLLFPTNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPTPTIKWLRPSGPMPADRVTYQNHNKTLQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RLLFPTNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPTPTIKWLRPSGPMPADRVTYQNHNKTLQLL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVEAAPYWLHKPQSHLYGPGETARLDCQVQGRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVEAAPYWLHKPQSHLYGPGETARLDCQVQGRP
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALILSNVQPSDTMVTQCEARNRHGLLLANAYIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALILSNVQPSDTMVTQCEARNRHGLLLANAYIY
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSVQWLDEDGTTVLQDERFFPYANG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSVQWLDEDGTTVLQDERFFPYANG
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KSD TLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDATQITQGPRSTIEKKGSRVTFTCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDATQITQGPRSTIEKKGSRVTFTCQ
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ASFDPSLQPSITWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDGRLVIHSLDYSDQGNYSCVASTELDVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 ASFDPSLQPSITWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDGRLVIHSLDYSDQGNYSCVASTELDVV
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ESRAQLLVVGSPGPVPRLVLSDLHLLTQSQVRVSWSPAEDHNAPIEKYDIEFEDKEMAPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 ESRAQLLVVGSPGPVPRLVLSDLHLLTQSQVRVSWSPAEDHNAPIEKYDIEFEDKEMAPE
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPYVHYTFRVTAINKYGPGEPSPVSETVVTPEAAPEKNPVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPYVHYTFRVTAINKYGPGEPSPVSETVVTPEAAPEKNPVD
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KSD VKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQGTRGPWQEQIVSDPFLVVSNTST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQGTRGPWQEQIVSDPFLVVSNTST
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KSD FVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGEDYPQAIPELEGIEILNSSAVLVKWRPVDLAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 FVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGEDYPQAIPELEGIEILNSSAVLVKWRPVDLAQ
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KSD VKGHLRGYNVTYWREGSQRKHSKRHIHKDHVVVPANTTSVILSGLRPYSSYHLEVQAFNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VKGHLRGYNVTYWREGSQRKHSKRHIHKDHVVVPANTTSVILSGLRPYSSYHLEVQAFNG
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KSD RGSGPASEFTFSTPEGVPGHPEALHLECQSNTSLLLRWQPPLSHNGVLTGYVLSYHPLDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RGSGPASEFTFSTPEGVPGHPEALHLECQSNTSLLLRWQPPLSHNGVLTGYVLSYHPLDE
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD GGKGQLSFNLRDPELRTHNLTDLSPHLRYRFQLQATTKEGPGEAIVREGGTMALSGISDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GGKGQLSFNLRDPELRTHNLTDLSPHLRYRFQLQATTKEGPGEAIVREGGTMALSGISDF
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD GNISATAGENYSVVSWVPKEGQCNFRFHILFKALGEEKGGASLSPQYVSYNQSSYTQWDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GNISATAGENYSVVSWVPKEGQCNFRFHILFKALGEEKGGASLSPQYVSYNQSSYTQWDL
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD QPDTDYEIHLFKERMFRHQMAVKTNGTGRVRLPPAGFATEGWFIGFVSAIILLLLVLLIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QPDTDYEIHLFKERMFRHQMAVKTNGTGRVRLPPAGFATEGWFIGFVSAIILLLLVLLIL
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD CFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMKDETFGEYRSLESDNEEKAFGSSQPSLNGDIK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS48 CFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMKDETFGEY----SDNEEKAFGSSQPSLNGDIK
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD PLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKEKEAAGGNDSSGATSPINPAVALE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKEKEAAGGNDSSGATSPINPAVALE
1200 1210 1220 1230 1240
>>CCDS55153.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1192 aa)
initn: 2853 init1: 1225 opt: 2665 Z-score: 2004.8 bits: 383.0 E(32554): 2.4e-105
Smith-Waterman score: 3024; 39.3% identity (66.6% similar) in 1256 aa overlap (11-1251:21-1186)
10 20 30 40
pF1KSD MVVALRYVWPLLLCSPCLLIQIPEEYEG-HHVMEPPVITEQSPRRLVVFP
:.::. ...: . . . ...::.::.:::. .. :
CCDS55 MQLKIMPKKKRLSAGRVPLILFLCQMISALEVPLDPKLLEDLVQPPTITQQSPKDYIIDP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD TDDISLKCEASGKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQ
..: ..:::.::: .: :::.:.:: .. ::. .: .:.. :. . . :. ..
CCDS55 RENIVIQCEAKGKPPPSFSWTRNGTHFDIDKDPLVTM--KPGTGTLIINIMSEGKAETYE
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD GIYRCFASNKLGTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRI
:.:.: : :. :.:.:..: . .: : :: ..:. .. :.:.:::: :: . : :
CCDS55 GVYQCTARNERGAAVSNNIVVRPSRSPLWTKEKLEPITLQSGQSLVLPCRPPIGLPPPII
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD YWMNSKILHIKQDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRV
.::.... .. :.:::..: ::.:::.::: :.. ::::.:.: :.:: ::.::...:
CCDS55 FWMDNSFQRLPQSERVSQGLNGDLYFSNVLPEDTREDYICYARFNHTQTIQQKQPISVKV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD KATNSMIDRKPRLLFPTNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPTPTIKWLRPSGPMPADRVT
...: .: : .: : ...:. :.:. : :::::::.::: : : . .: .: .:..
CCDS55 ISAKSSRERPPTFLTPEGNASNKEELRGNVLSLECIAEGLPTPIIYWAKEDGMLPKNRTV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD YQNHNKTLQLLKVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVEAAPYWLHKPQSHLYGPGET
:.: .::::...:.: :.:.:.:.:.:.::. .:. : :.:::::. ::. . .:::
CCDS55 YKNFEKTLQIIHVSEADSGNYQCIAKNALGAIHHTISVRVKAAPYWITAPQNLVLSPGED
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD ARLDCQVQGRPQPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALILSNVQPSDTMVTQCEARNR
. : :...: :.:...: ::.:.: : . .:. ..:.:::: .. : ::.: :.
CCDS55 GTLICRANGNPKPRISWLTNGVPIEIAPDDPSRKIDGDTIIFSNVQERSSAVYQCNASNE
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD HGLLLANAYIYVVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSVQWLDEDGTTVL
.: :::::.. :. : .::: : :... . : : : ::.:.:...:. ..:
CCDS55 YGYLLANAFVNVLAEPPRILTPANTLYQVIANRPALLDCAFFGSPLPTIEWFKGAKGSAL
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD QDERFFPYANGTLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDATQITQGPRSTIE
... . . :::: : : ..:: : :.: : . . ..:..:: : :.. :. ..
CCDS55 HEDIYVLHENGTLEIPVAQKDSTGTYTCVARNKLGMAKNEVHLEIKDPTWIVKQPEYAVV
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KSD KKGSRVTFTCQASFDPSLQPSITWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDGRLVIHSLDYSDQGNY
..:: :.: :... : .:. .. : :.: :: ..... .. .::. ... .:.:.:
CCDS55 QRGSMVSFECKVKHDHTLSLTVLWLKDNR---ELPSDERFTVDKDHLVVADVSDDDSGTY
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KSD SCVASTELDVVESRAQLLVVGSPGPVPRLVLS------DLHLLTQ--SQVRVSWSPAEDH
.:::.: :: : . : : :: .: :.: : . ::.: : ..:..::.:..:.
CCDS55 TCVANTTLDSVSASAVLSVV-APTPTPAPVYDVPNPPFDLELTDQLDKSVQLSWTPGDDN
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KSD NAPIEKYDIEFEDKEMAPEKWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPYVHYTFRVTAINKYGPGEPS
:.:: :. ::.:: : :. .: :.::.. :::::::.:.::: :.:. : . ::
CCDS55 NSPITKFIIEYEDAMHKPGLWHHQTEVSGTQTTAQLKLSPYVNYSFRVMAVNSIGKSLPS
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KSD PVSETVVTPEAAPEKNPVDVKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQGTRG
.:: .: . :.:::. :.: :.: :.::::::: .. :.: .::.:.:: .
CCDS55 EASEQYLTKASEPDKNPTAVEGLGSEPDNLVITWKPLNGFESNGPGLQYKVSWRQKDGDD
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KSD PWQEQIVSD-PFLVVSNTSTFVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGEDYPQAIPELEG
: .:.. .::.: ::::: :::::.:..: .::: :..:.:::: :.. :
CCDS55 EWTSVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLIKVQALNDMGFAPEPAVVMGHSGEDLPMVAPGNVR
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KSD IEILNSSAVLVKWRPVDLAQVKGHLRGYNVTYWREGSQRKHSKRHIHKDHVVVPANTTSV
....::. . :.: :: : ...:::.:: . ::. :. :...:::.: .. .. :
CCDS55 VNVVNSTLAEVHWDPVPLKSIRGHLQGYRIYYWKTQSSSKRNRRHIEKKILTFQGSKTHG
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930
pF1KSD ILSGLRPYSSYHLEVQAFNGRGSGPAS-EFTFSTPEGVPGHPEALHLECQSNTSLLLRWQ
.: ::.:.: : :.:.. ::.: :::: . .:.::::::. : .:.. . :: :.:.
CCDS55 MLPGLEPFSHYTLNVRVVNGKGEGPASPDRVFNTPEGVPSAPSSLKIVNPTLDSLTLEWD
900 910 920 930 940 950
940 950 960 970 980 990
pF1KSD PPLSHNGVLTGYVLSYHPLDEGGK-GQLSFNLRDPELRTH-NLTDLSPHLRYRFQLQATT
:: ::.:: :.:.:.:.. . : : .:. : .:. .: .:. ::.: . : :
CCDS55 PPSHPNGILTEYTLKYQPINSTHELGPL-VDLKIPANKTRWTLKNLNFSTRYKFYFYAQT
960 970 980 990 1000 1010
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD KEGPGEAIVREGGTMALSGISDFGNISATAGENYSVVSWVPKEGQCNFRFHILFKALGEE
. : : :..: :.. ... : :: .:
CCDS55 SAGSGSQITEE----AVTTVDEAG---------------------------ILPPDVGAG
1020 1030 1040
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD KGGASLSPQYVSYNQSSYTQWDLQPDTDYEIHLFKERMFRHQMAVKTNGTGRVRLPPAGF
:. :: : :.
CCDS55 KAMAS-------------RQVDI-------------------------------------
1050
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD ATEGWFIGFVSAIILLLLVLLILCFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMK--DETFGE
::.:::::.. :. ::.:.:::.:::.:.::::: ::.:::...: : .::: : ::::
CCDS55 ATQGWFIGLMCAVALLILILLIVCFIRRNKGGKYPVKEKEDAHADPEIQPMKEDDGTFGE
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD YRSLESDNEEKAFGSSQPSLNGDIKPLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKEK
: . : :.. :: :: . .: :::::.::: .:. ::::::::::::::::::
CCDS55 YSDAE-DHKPLKKGSRTPS-DRTVKKEDSDDSLVDYGEGVNGQFNEDGSFIGQYSGKKEK
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1240 1250
pF1KSD EAAGGNDSSGATSPINPAVALE
: : ::.:: : ::.:
CCDS55 EPAEGNESSEAPSPVNAMNSFV
1180 1190
>>CCDS58812.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1208 aa)
initn: 2303 init1: 1016 opt: 2539 Z-score: 1910.5 bits: 365.6 E(32554): 4.3e-100
Smith-Waterman score: 2908; 39.0% identity (66.3% similar) in 1245 aa overlap (18-1250:17-1206)
10 20 30 40 50
pF1KSD MVVALRYVWPLLLCSPCLLIQIPEEYE-GHHVMEPPVITEQSPRRLVVFPTDD-ISLKCE
::... . : :.. :.: .:: . :.:: :. ....::
CCDS58 MEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQS-KVQVAFPFDEYFQIECE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD ASGKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQGIYRCFASN
:.:.:: : ::.:: : .. . : .::.: : : . ..::: :::::::
CCDS58 AKGNPEPTFSWTKDGNPFYFTDH---RIIPSNNSGTFRIP--NEGHISHFQGKYRCFASN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD KLGTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRIYWMNSKILH
::: :::.::.... ..::.::: . :.:::::. .::::::: . ::.::::: .. :
CCDS58 KLGIAMSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD IKQDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRVKATNSMIDR
:.::::: :.:.:.:::::: .:...:: : : :: :::.:: :. : :...::. .:
CCDS58 IEQDERVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSSNSIKQR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD KPRLLFP---TNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPTPTIKWLRPSGPMPADRVTYQNHNK
::.::.: ..: : .. :.:. :.:::.:::.::: . : . .: .: : : .:..:
CCDS58 KPKLLLPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIGGDLPKGRETKENYGK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TLQLLKVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVEAAPYWLHKPQSHLYGPGETARLDCQ
::.. .:. .: :.::: : : ::.: : ..: :: : : .:::: .:. : .. : :.
CCDS58 TLKIENVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQSAVYSTGSNGILLCE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD VQGRPQPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALILSNVQPSDTMVTQCEARNRHGLLLA
..:.::: . ::.:: ::.. . : . ..:.::. : : :::: : :: .::
CCDS58 AEGEPQPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPR-EISFTNLQPNHTAVYQCEASNVHGTILA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD NAYIYVVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSVQWLDEDGTTVLQDERFF
:: : ::.. : : :...: .: : .:.: :. :..: :.: . . :. .:.
CCDS58 NANIDVVDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSWQKVEEVKPLEGRRYH
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD PYANGTLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDATQITQGPRSTIEKKGSRV
: :::: : .:.: : : . : ..... ::: ...::.. .:.. : .
CCDS58 IYENGTLQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKLRVSPKNPRIPKLHML
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD TFTCQASFDPSLQPSI--TWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDG-RLVIHSLDYSDQGNYSCV
. :... : :. :. .: ::. .. : : .: :: :.: .. ::: : :
CCDS58 ELHCESKCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLTISNVTLEDQGIYCCS
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD ASTELDVVESRAQLLVVGSPGPVPRLVLSDLHLLTQSQVRVSWSPAEDHNAPIEKYDIEF
: : :: . . .:. :. : : : ::. . . .::..: . :::. : .: .::
CCDS58 AHTALDSAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQ---NRSVRLTWEAGADHNSNISEYIVEF
600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KSD EDKEMAPEKWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPYVHYTFRVTAINKYGPGEPSPVSETVVTPEA
: .. : .: : .: :..:.. : :.:.:.: ::: :.:. : ..:: :. :: :
CCDS58 EGNKEEPGRWEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQPSDHHETPPA
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KSD APEKNPVDVKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQGTRGPWQEQIVSDPF
::..:: ... .... .:.: :.::. :. :.: ..::: :.:::. :.:. :..
CCDS58 APDRNPQNIRVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQGAPVEWEEETVTNHT
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KSD LVVSNTSTFVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGEDYPQAIPELEGIEILNSSAVLVK
: : . ....::..::::.:. :.::.:: . :::::::.. : ..:....::. : :
CCDS58 LRVMTPAVYAPYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPVIHGVDVINSTLVKVT
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KSD WRPVDLAQVKGHLRGYNVTYWREGSQRKHSKRHIHKDHVV-VPANTTSVILSGLRPYSSY
: : .:.:.:.::....:. : .. : .. ... .. .: .. .: .: .
CCDS58 WSTVPKDRVHGRLKGYQINWWKTKSLLD-GRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSLDAFSEF
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940 950
pF1KSD HLEVQAFNGRGSGPASE-FTFSTPEGVPGHPEALHLECQSNTSLLLRWQPPLSHNGVLTG
:: : :.:..:.:: :: . :.:::::: .: :.. .. . : : : . :: :::
CCDS58 HLTVLAYNSKGAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTATLSWGLPKKLNGNLTG
890 900 910 920 930 940
960 970 980 990 1000
pF1KSD YVLSYHPLDEGGK-GQLS-FNLRDPELRTHNLTDLSPHLRYRFQLQATTKEGPGEAIVRE
:.:.:. ... . :.:. .:. : . .:..:. .:.: :.: :..: :. :..:
CCDS58 YLLQYQIINDTYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYLRACTSQGCGKPITEE
950 960 970 980 990 1000
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD GGTMALSGISDFGNISATAGENYSVVSWVPKEGQCNFRFHILFKALGEEKGGASLSPQYV
..:.. : . .:.:: : : . . : : .:. :: . .
CCDS58 SSTLG-EGSKGIGKIS---GVNLTQKTH-PIE---------VFEP------GAEHIVRLM
1010 1020 1030 1040
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD SYNQSSYTQWDLQPDTDYEIHLFKERMFRHQMAVKTNGTGRVRLPPAGFATEGWFIGFVS
. : : :.: .:.. ...: : . : ..:.:::::..
CCDS58 TKN------WG---DND---SIFQD-------VIETRGREYAGLYD-DISTQGWFIGLMC
1050 1060 1070 1080
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD AIILLLLVLLILCFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMKDETFGEYRSLESDNEEKAF
:: :: :.:: .::.::..:::::::.::: . : : . .:::::::: ::..:: .
CCDS58 AIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEIQSVKDETFGEY----SDSDEKPL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KSD GSSQPSLNGDIKPLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKEKEAAGGNDSSGATS
.: ::: :..: : :::..:: . :.::::::: :.:.::: .. .: :: ::
CCDS58 KGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDHGLFSEDGSFIGAYAGSKEKGSVESNGSSTATF
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1250
pF1KSD PINPAVALE
:.
CCDS58 PLRA
>>CCDS5751.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1183 aa)
initn: 2890 init1: 859 opt: 2063 Z-score: 1554.6 bits: 299.7 E(32554): 2.9e-80
Smith-Waterman score: 2951; 38.5% identity (65.0% similar) in 1266 aa overlap (11-1251:21-1177)
10 20 30 40 50
pF1KSD MVVALRYVWPLLLCSPCLLIQIPEEYEGHHVMEPPVITEQSPRRLVVFPT
:.::. ...: . ...::.::.:::. .. :
CCDS57 MQLKIMPKKKRLSAGRVPLILFLCQMISALEVPLD-----LVQPPTITQQSPKDYIIDPR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD DDISLKCEASGKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQG
..: ..:::.::: .: :::.:.:: .. ::. .: .:.. :. . . :. ..:
CCDS57 ENIVIQCEAKGKPPPSFSWTRNGTHFDIDKDPLVTM--KPGTGTLIINIMSEGKAETYEG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IYRCFASNKLGTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRIY
.:.: : :. :.:.:..: . .: : :: ..:. .. :.:.:::: :: . : :.
CCDS57 VYQCTARNERGAAVSNNIVVRPSRSPLWTKEKLEPITLQSGQSLVLPCRPPIGLPPPIIF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD WMNSKILHIKQDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRVK
::.... .. :.:::..: ::.:::.::: :.. ::::.:.: :.:: ::.::...:
CCDS57 WMDNSFQRLPQSERVSQGLNGDLYFSNVLPEDTREDYICYARFNHTQTIQQKQPISVKVI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270
pF1KSD ATNSMID-------------------RKPRLLFPTNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPT
... . : : : .: : ...:. :.:. : :::::::.::
CCDS57 SVDELNDTIAANLSDTEFYGAKSSRERPPTFLTPEGNASNKEELRGNVLSLECIAEGLPT
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD PTIKWLRPSGPMPADRVTYQNHNKTLQLLKVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVEA
: : : . .: .: .:..:.: .::::...:.: :.:.:.:.:.:.::. .:. : :.:
CCDS57 PIIYWAKEDGMLPKNRTVYKNFEKTLQIIHVSEADSGNYQCIAKNALGAIHHTISVRVKA
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KSD APYWLHKPQSHLYGPGETARLDCQVQGRPQPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALIL
::::. ::. . .::: . : :...: :.:...: ::.:.: : . .:. ..:.
CCDS57 APYWITAPQNLVLSPGEDGTLICRANGNPKPRISWLTNGVPIEIAPDDPSRKIDGDTIIF
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KSD SNVQPSDTMVTQCEARNRHGLLLANAYIYVVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAF
:::: .. : ::.: :..: :::::.. :. : .::: : :... . : : : :
CCDS57 SNVQERSSAVYQCNASNEYGYLLANAFVNVLAEPPRILTPANTLYQVIANRPALLDCAFF
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KSD GAPVPSVQWLDEDGTTVLQDERFFPYANGTLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMAN
:.:.:...:. ..:... . . :::: : : ..:: : :.: : . . ..
CCDS57 GSPLPTIEWFKGAKGSALHEDIYVLHENGTLEIPVAQKDSTGTYTCVARNKLGMAKNEVH
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KSD LKVKDATQITQGPRSTIEKKGSRVTFTCQASFDPSLQPSITWRGDGRDLQELGDSDKYFI
:..:: : :.. :. .. ..:: :.: :... : .:. .. : :.: :: ..... .
CCDS57 LEIKDPTWIVKQPEYAVVQRGSMVSFECKVKHDHTLSLTVLWLKDNR---ELPSDERFTV
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KSD EDGRLVIHSLDYSDQGNYSCVASTELDVVESRAQLLVVGSPGPVPRLVLSDLHLLTQSQV
. .::. ... .:.:.:.:::.: :: : . : : :: :.: : :.: : .: :
CCDS57 DKDHLVVADVSDDDSGTYTCVANTTLDSVSASAVLSVVDVPNPPFDLELTDQ--LDKS-V
600 610 620 630 640
640 650 660 670 680 690
pF1KSD RVSWSPAEDHNAPIEKYDIEFEDKEMAPEKWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPYVHYTFRVTA
..::.:..:.:.:: :. ::.:: : :. .: :.::.. :::::::.:.::: :
CCDS57 QLSWTPGDDNNSPITKFIIEYEDAMHKPGLWHHQTEVSGTQTTAQLKLSPYVNYSFRVMA
650 660 670 680 690 700
700 710 720 730 740 750
pF1KSD INKYGPGEPSPVSETVVTPEAAPEKNPVDVKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYR
.:. : . :: .:: .: . :.:::. :.: :.: :.::::::: .. :.: .::.
CCDS57 VNSIGKSLPSEASEQYLTKASEPDKNPTAVEGLGSEPDNLVITWKPLNGFESNGPGLQYK
710 720 730 740 750 760
760 770 780 790 800 810
pF1KSD VQWRPQGTRGPWQEQIVSD-PFLVVSNTSTFVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGED
:.:: . : .:.. .::.: ::::: :::::.:..: .::: :..:.::::
CCDS57 VSWRQKDGDDEWTSVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLIKVQALNDMGFAPEPAVVMGHSGED
770 780 790 800 810 820
820 830 840 850 860 870
pF1KSD YPQAIPELEGIEILNSSAVLVKWRPVDLAQVKGHLRGYNVTYWREGSQRKHSKRHIHKDH
:.. : ....::. . :.: :: : ...:::.:: . ::. :. :...:::.:
CCDS57 LPMVAPGNVRVNVVNSTLAEVHWDPVPLKSIRGHLQGYRIYYWKTQSSSKRNRRHIEKKI
830 840 850 860 870 880
880 890 900 910 920
pF1KSD VVVPANTTSVILSGLRPYSSYHLEVQAFNGRGSGPAS-EFTFSTPEGVPGHPEALHLECQ
.. .. : .: ::.:.: : :.:.. ::.: :::: . .:.::::::. : .:..
CCDS57 LTFQGSKTHGMLPGLEPFSHYTLNVRVVNGKGEGPASPDRVFNTPEGVPSAPSSLKIVNP
890 900 910 920 930 940
930 940 950 960 970 980
pF1KSD SNTSLLLRWQPPLSHNGVLTGYVLSYHPLDEGGK-GQLSFNLRDPELRTH-NLTDLSPHL
. :: :.:.:: ::.:: :.:.:.:.. . : : .:. : .:. .: .:.
CCDS57 TLDSLTLEWDPPSHPNGILTEYTLKYQPINSTHELGPL-VDLKIPANKTRWTLKNLNFST
950 960 970 980 990 1000
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KSD RYRFQLQATTKEGPGEAIVREGGTMALSGISDFGNISATAGENYSVVSWVPKEGQCNFRF
::.: . : :. : : :..: :.. ..
CCDS57 RYKFYFYAQTSAGSGSQITEE----AVTTVD-----------------------------
1010 1020 1030
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KSD HILFKALGEEKGGASLSPQYVSYNQSSYTQWDLQPDTDYEIHLFKERMFRHQMAVKTNGT
: : .:. .
CCDS57 ---------------------------------------------EAMASRQVDI-----
1040
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KSD GRVRLPPAGFATEGWFIGFVSAIILLLLVLLILCFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARP
::.:::::.. :. ::.:.:::.:::.:.::::: ::.:::...: : .:
CCDS57 ----------ATQGWFIGLMCAVALLILILLIVCFIRRNKGGKYPVKEKEDAHADPEIQP
1050 1060 1070 1080 1090
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KSD MK--DETFGEYRSLESDNEEKAFGSSQPSLNGDIKPLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSF
:: : ::::: . : :.. :: :: . .: :::::.::: .:. ::::::::
CCDS57 MKEDDGTFGEYSDAE-DHKPLKKGSRTPS-DRTVKKEDSDDSLVDYGEGVNGQFNEDGSF
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1230 1240 1250
pF1KSD IGQYSGKKEKEAAGGNDSSGATSPINPAVALE
::::::::::: : ::.:: : ::.:
CCDS57 IGQYSGKKEKEPAEGNESSEAPSPVNAMNSFV
1160 1170 1180
>>CCDS75652.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1211 aa)
initn: 2796 init1: 859 opt: 2063 Z-score: 1554.4 bits: 299.7 E(32554): 2.9e-80
Smith-Waterman score: 2984; 38.7% identity (65.6% similar) in 1275 aa overlap (11-1251:21-1205)
10 20 30 40
pF1KSD MVVALRYVWPLLLCSPCLLIQIPEEYEG-HHVMEPPVITEQSPRRLVVFP
:.::. ...: . . . ...::.::.:::. .. :
CCDS75 MQLKIMPKKKRLSAGRVPLILFLCQMISALEVPLDPKLLEDLVQPPTITQQSPKDYIIDP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD TDDISLKCEASGKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQ
..: ..:::.::: .: :::.:.:: .. ::. .: .:.. :. . . :. ..
CCDS75 RENIVIQCEAKGKPPPSFSWTRNGTHFDIDKDPLVTM--KPGTGTLIINIMSEGKAETYE
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD GIYRCFASNKLGTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRI
:.:.: : :. :.:.:..: . .: : :: ..:. .. :.:.:::: :: . : :
CCDS75 GVYQCTARNERGAAVSNNIVVRPSRSPLWTKEKLEPITLQSGQSLVLPCRPPIGLPPPII
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD YWMNSKILHIKQDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRV
.::.... .. :.:::..: ::.:::.::: :.. ::::.:.: :.:: ::.::...:
CCDS75 FWMDNSFQRLPQSERVSQGLNGDLYFSNVLPEDTREDYICYARFNHTQTIQQKQPISVKV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KSD KATNSMID-------------------RKPRLLFPTNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFP
... . : : : .: : ...:. :.:. : :::::::.:
CCDS75 ISVDELNDTIAANLSDTEFYGAKSSRERPPTFLTPEGNASNKEELRGNVLSLECIAEGLP
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD TPTIKWLRPSGPMPADRVTYQNHNKTLQLLKVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVE
:: : : . .: .: .:..:.: .::::...:.: :.:.:.:.:.:.::. .:. : :.
CCDS75 TPIIYWAKEDGMLPKNRTVYKNFEKTLQIIHVSEADSGNYQCIAKNALGAIHHTISVRVK
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KSD AAPYWLHKPQSHLYGPGETARLDCQVQGRPQPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALI
:::::. ::. . .::: . : :...: :.:...: ::.:.: : . .:. ..:
CCDS75 AAPYWITAPQNLVLSPGEDGTLICRANGNPKPRISWLTNGVPIEIAPDDPSRKIDGDTII
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KSD LSNVQPSDTMVTQCEARNRHGLLLANAYIYVVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKA
.:::: .. : ::.: :..: :::::.. :. : .::: : :... . : : :
CCDS75 FSNVQERSSAVYQCNASNEYGYLLANAFVNVLAEPPRILTPANTLYQVIANRPALLDCAF
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KSD FGAPVPSVQWLDEDGTTVLQDERFFPYANGTLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMA
::.:.:...:. ..:... . . :::: : : ..:: : :.: : . . .
CCDS75 FGSPLPTIEWFKGAKGSALHEDIYVLHENGTLEIPVAQKDSTGTYTCVARNKLGMAKNEV
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KSD NLKVKDATQITQGPRSTIEKKGSRVTFTCQASFDPSLQPSITWRGDGRDLQELGDSDKYF
.:..:: : :.. :. .. ..:: :.: :... : .:. .. : :.: :: .....
CCDS75 HLEIKDPTWIVKQPEYAVVQRGSMVSFECKVKHDHTLSLTVLWLKDNR---ELPSDERFT
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620
pF1KSD IEDGRLVIHSLDYSDQGNYSCVASTELDVVESRAQLLVVGSPGPVPRLVLS------DLH
.. .::. ... .:.:.:.:::.: :: : . : : :: .: :.: : . ::.
CCDS75 VDKDHLVVADVSDDDSGTYTCVANTTLDSVSASAVLSVV-APTPTPAPVYDVPNPPFDLE
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KSD LLTQ--SQVRVSWSPAEDHNAPIEKYDIEFEDKEMAPEKWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPY
: : ..:..::.:..:.:.:: :. ::.:: : :. .: :.::.. ::::::
CCDS75 LTDQLDKSVQLSWTPGDDNNSPITKFIIEYEDAMHKPGLWHHQTEVSGTQTTAQLKLSPY
660 670 680 690 700 710
690 700 710 720 730 740
pF1KSD VHYTFRVTAINKYGPGEPSPVSETVVTPEAAPEKNPVDVKGEGNETTNMVITWKPLRWMD
:.:.::: :.:. : . :: .:: .: . :.:::. :.: :.: :.::::::: ..
CCDS75 VNYSFRVMAVNSIGKSLPSEASEQYLTKASEPDKNPTAVEGLGSEPDNLVITWKPLNGFE
720 730 740 750 760 770
750 760 770 780 790 800
pF1KSD WNAPQVQYRVQWRPQGTRGPWQEQIVSD-PFLVVSNTSTFVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQ
:.: .::.:.:: . : .:.. .::.: ::::: :::::.:..: .:::
CCDS75 SNGPGLQYKVSWRQKDGDDEWTSVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLIKVQALNDMGFAPEPA
780 790 800 810 820 830
810 820 830 840 850 860
pF1KSD VTIGYSGEDYPQAIPELEGIEILNSSAVLVKWRPVDLAQVKGHLRGYNVTYWREGSQRKH
:..:.:::: :.. : ....::. . :.: :: : ...:::.:: . ::. :. :.
CCDS75 VVMGHSGEDLPMVAPGNVRVNVVNSTLAEVHWDPVPLKSIRGHLQGYRIYYWKTQSSSKR
840 850 860 870 880 890
870 880 890 900 910 920
pF1KSD SKRHIHKDHVVVPANTTSVILSGLRPYSSYHLEVQAFNGRGSGPAS-EFTFSTPEGVPGH
..:::.: .. .. : .: ::.:.: : :.:.. ::.: :::: . .:.::::::.
CCDS75 NRRHIEKKILTFQGSKTHGMLPGLEPFSHYTLNVRVVNGKGEGPASPDRVFNTPEGVPSA
900 910 920 930 940 950
930 940 950 960 970
pF1KSD PEALHLECQSNTSLLLRWQPPLSHNGVLTGYVLSYHPLDEGGK-GQLSFNLRDPELRTH-
: .:.. . :: :.:.:: ::.:: :.:.:.:.. . : : .:. : .:.
CCDS75 PSSLKIVNPTLDSLTLEWDPPSHPNGILTEYTLKYQPINSTHELGPL-VDLKIPANKTRW
960 970 980 990 1000 1010
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD NLTDLSPHLRYRFQLQATTKEGPGEAIVREGGTMALSGISDFGNISATAGENYSVVSWVP
.: .:. ::.: . : :. : : :..: :.. ... :
CCDS75 TLKNLNFSTRYKFYFYAQTSAGSGSQITEE----AVTTVDEAG-----------------
1020 1030 1040 1050
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD KEGQCNFRFHILFKALGEEKGGASLSPQYVSYNQSSYTQWDLQPDTDYEIHLFKERMFRH
:: .: :. :: : :.
CCDS75 ----------ILPPDVGAGKAMAS-------------RQVDI------------------
1060 1070
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD QMAVKTNGTGRVRLPPAGFATEGWFIGFVSAIILLLLVLLILCFIKRSKGGKYSVKDKED
::.:::::.. :. ::.:.:::.:::.:.::::: ::.:::
CCDS75 -------------------ATQGWFIGLMCAVALLILILLIVCFIRRNKGGKYPVKEKED
1080 1090 1100 1110
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KSD TQVDSEARPMK--DETFGEYRSLESDNEEKAFGSSQPSLNGDIKPLGSDDSLADYGGSVD
...: : .::: : ::::: . : :.. :: :: . .: :::::.::: .:.
CCDS75 AHADPEIQPMKEDDGTFGEYSDAE-DHKPLKKGSRTPS-DRTVKKEDSDDSLVDYGEGVN
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1220 1230 1240 1250
pF1KSD VQFNEDGSFIGQYSGKKEKEAAGGNDSSGATSPINPAVALE
::::::::::::::::::: : ::.:: : ::.:
CCDS75 GQFNEDGSFIGQYSGKKEKEPAEGNESSEAPSPVNAMNSFV
1180 1190 1200 1210
>>CCDS47686.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1304 aa)
initn: 2774 init1: 859 opt: 2059 Z-score: 1551.0 bits: 299.2 E(32554): 4.5e-80
Smith-Waterman score: 3155; 39.4% identity (67.9% similar) in 1292 aa overlap (11-1251:21-1298)
10 20 30 40
pF1KSD MVVALRYVWPLLLCSPCLLIQIPEEYEG-HHVMEPPVITEQSPRRLVVFP
:.::. ...: . . . ...::.::.:::. .. :
CCDS47 MQLKIMPKKKRLSAGRVPLILFLCQMISALEVPLDPKLLEDLVQPPTITQQSPKDYIIDP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD TDDISLKCEASGKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQ
..: ..:::.::: .: :::.:.:: .. ::. .: .:.. :. . . :. ..
CCDS47 RENIVIQCEAKGKPPPSFSWTRNGTHFDIDKDPLVTM--KPGTGTLIINIMSEGKAETYE
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD GIYRCFASNKLGTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRI
:.:.: : :. :.:.:..: . .: : :: ..:. .. :.:.:::: :: . : :
CCDS47 GVYQCTARNERGAAVSNNIVVRPSRSPLWTKEKLEPITLQSGQSLVLPCRPPIGLPPPII
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD YWMNSKILHIKQDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRV
.::.... .. :.:::..: ::.:::.::: :.. ::::.:.: :.:: ::.::...:
CCDS47 FWMDNSFQRLPQSERVSQGLNGDLYFSNVLPEDTREDYICYARFNHTQTIQQKQPISVKV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KSD KATNSMID-------------------RKPRLLFPTNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFP
... . : : : .: : ...:. :.:. : :::::::.:
CCDS47 ISVDELNDTIAANLSDTEFYGAKSSRERPPTFLTPEGNASNKEELRGNVLSLECIAEGLP
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD TPTIKWLRPSGPMPADRVTYQNHNKTLQLLKVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVE
:: : : . .: .: .:..:.: .::::...:.: :.:.:.:.:.:.::. .:. : :.
CCDS47 TPIIYWAKEDGMLPKNRTVYKNFEKTLQIIHVSEADSGNYQCIAKNALGAIHHTISVRVK
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KSD AAPYWLHKPQSHLYGPGETARLDCQVQGRPQPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALI
:::::. ::. . .::: . : :...: :.:...: ::.:.: : . .:. ..:
CCDS47 AAPYWITAPQNLVLSPGEDGTLICRANGNPKPRISWLTNGVPIEIAPDDPSRKIDGDTII
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KSD LSNVQPSDTMVTQCEARNRHGLLLANAYIYVVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKA
.:::: .. : ::.: :..: :::::.. :. : .::: : :... . : : :
CCDS47 FSNVQERSSAVYQCNASNEYGYLLANAFVNVLAEPPRILTPANTLYQVIANRPALLDCAF
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KSD FGAPVPSVQWLDEDGTTVLQDERFFPYANGTLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMA
::.:.:...:. ..:... . . :::: : : ..:: : :.: : . . .
CCDS47 FGSPLPTIEWFKGAKGSALHEDIYVLHENGTLEIPVAQKDSTGTYTCVARNKLGMAKNEV
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KSD NLKVKDATQITQGPRSTIEKKGSRVTFTCQASFDPSLQPSITWRGDGRDLQELGDSDKYF
.:..:: : :.. :. .. ..:: :.: :... : .:. .. : :.: :: .....
CCDS47 HLEIKDPTWIVKQPEYAVVQRGSMVSFECKVKHDHTLSLTVLWLKDNR---ELPSDERFT
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620
pF1KSD IEDGRLVIHSLDYSDQGNYSCVASTELDVVESRAQLLVVGSPGPVPRLVLS------DLH
.. .::. ... .:.:.:.:::.: :: : . : : :: .: :.: : . ::.
CCDS47 VDKDHLVVADVSDDDSGTYTCVANTTLDSVSASAVLSVV-APTPTPAPVYDVPNPPFDLE
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KSD LLTQ--SQVRVSWSPAEDHNAPIEKYDIEFEDKEMAPEKWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPY
: : ..:..::.:..:.:.:: :. ::.:: : :. .: :.::.. ::::::
CCDS47 LTDQLDKSVQLSWTPGDDNNSPITKFIIEYEDAMHKPGLWHHQTEVSGTQTTAQLKLSPY
660 670 680 690 700 710
690 700 710 720 730 740
pF1KSD VHYTFRVTAINKYGPGEPSPVSETVVTPEAAPEKNPVDVKGEGNETTNMVITWKPLRWMD
:.:.::: :.:. : . :: .:: .: . :.:::. :.: :.: :.::::::: ..
CCDS47 VNYSFRVMAVNSIGKSLPSEASEQYLTKASEPDKNPTAVEGLGSEPDNLVITWKPLNGFE
720 730 740 750 760 770
750 760 770 780 790 800
pF1KSD WNAPQVQYRVQWRPQGTRGPWQEQIVSD-PFLVVSNTSTFVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQ
:.: .::.:.:: . : .:.. .::.: ::::: :::::.:..: .:::
CCDS47 SNGPGLQYKVSWRQKDGDDEWTSVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLIKVQALNDMGFAPEPA
780 790 800 810 820 830
810 820 830 840 850 860
pF1KSD VTIGYSGEDYPQAIPELEGIEILNSSAVLVKWRPVDLAQVKGHLRGYNVTYWREGSQRKH
:..:.:::: :.. : ....::. . :.: :: : ...:::.:: . ::. :. :.
CCDS47 VVMGHSGEDLPMVAPGNVRVNVVNSTLAEVHWDPVPLKSIRGHLQGYRIYYWKTQSSSKR
840 850 860 870 880 890
870 880 890 900 910 920
pF1KSD SKRHIHKDHVVVPANTTSVILSGLRPYSSYHLEVQAFNGRGSGPAS-EFTFSTPEGVPGH
..:::.: .. .. : .: ::.:.: : :.:.. ::.: :::: . .:.::::::.
CCDS47 NRRHIEKKILTFQGSKTHGMLPGLEPFSHYTLNVRVVNGKGEGPASPDRVFNTPEGVPSA
900 910 920 930 940 950
930 940 950 960 970
pF1KSD PEALHLECQSNTSLLLRWQPPLSHNGVLTGYVLSYHPLDEGGK-GQLSFNLRDPELRTH-
: .:.. . :: :.:.:: ::.:: :.:.:.:.. . : : .:. : .:.
CCDS47 PSSLKIVNPTLDSLTLEWDPPSHPNGILTEYTLKYQPINSTHELGPL-VDLKIPANKTRW
960 970 980 990 1000 1010
980 990 1000 1010 1020
pF1KSD NLTDLSPHLRYRFQLQATTKEGPGEAIVREG-GTMALSGI--SDFG------------NI
.: .:. ::.: . : :. : : :..:. :. .:: : : :.
CCDS47 TLKNLNFSTRYKFYFYAQTSAGSGSQITEEAVTTVDEAGILPPDVGAGKVQAVNPRISNL
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD SATAGENYSVVSWVPKEGQCNFRFHILFKALGEEKGGASLSPQYVSYNQSSYTQWDLQPD
.:.:.:.:. .:: :: . :.. . . : .. . :. ..: . :.:
CCDS47 TAAAAETYANISW-EYEGPEHVNFYVEYGVAGSKE---EWRKEIVNGSRSFFGLKGLMPG
1080 1090 1100 1110 1120
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD TDYEIHL--FKERMFRHQMAVKTNGTGRVRLPPAGFATEGWFIGFVSAIILLLLVLLILC
: :.... . : . : .: . . . .::.:::::.. :. ::.:.:::.:
CCDS47 TAYKVRVGAVGDSGFVSSEDVFETGPAMASRQ-VDIATQGWFIGLMCAVALLILILLIVC
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD FIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMK--DETFGEYRSLESDNEEKAFGSSQPSLNGDI
::.:.::::: ::.:::...: : .::: : ::::: . : :.. :: :: . .
CCDS47 FIRRNKGGKYPVKEKEDAHADPEIQPMKEDDGTFGEYSDAE-DHKPLKKGSRTPS-DRTV
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD KPLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKEKEAAGGNDSSGATSPINPAVALE
: :::::.::: .:. ::::::::::::::::::: : ::.:: : ::.:
CCDS47 KKEDSDDSLVDYGEGVNGQFNEDGSFIGQYSGKKEKEPAEGNESSEAPSPVNAMNSFV
1250 1260 1270 1280 1290 1300
>>CCDS30982.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 (1169 aa)
initn: 2433 init1: 875 opt: 1988 Z-score: 1498.5 bits: 289.3 E(32554): 3.8e-77
Smith-Waterman score: 2799; 37.7% identity (63.8% similar) in 1267 aa overlap (11-1256:14-1168)
10 20 30 40 50
pF1KSD MVVALRYVWPLLLCSPCL--LIQIPEEYEGHHVMEPPVITEQSPRRLVVFPTDDISL
.::: : :.:: . . .::.::.:: . .: : :.: .
CCDS30 MARQPPPPWVHAAFLLCLLSLGGAIEIPMD-----LTQPPTITKQSAKDHIVDPRDNILI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD KCEASGKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQGIYRCF
.:::.:.: .:.:::.. :. .. :.. . .::...: ... ....: :.::
CCDS30 ECEAKGNPAPSFHWTRNSRFFNIAKDPRVSMRR--RSGTLVIDFRSGGRPEEYEGEYQCF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD ASNKLGTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRIYWMNSK
: ::.:::.:..:::.. .: ::::.. :: :.:: ..: :::::. :.::.:.
CCDS30 ARNKFGTALSNRIRLQVSKSPLWPKENLDPVVVQEGAPLTLQCNPPPGLPSPVIFWMSSS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ILHIKQDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRVKATNSM
. : ::.::..:.::.:::.::. .: ..:: :.:.: :.:: ::.:. :.: ... .
CCDS30 MEPITQDKRVSQGHNGDLYFSNVMLQDMQTDYSCNARFHFTHTIQQKNPFTLKVLTNHPY
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270
pF1KSD ID-----------------RKPRLLFPTNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPTPTIKWLR
: : : ...: ...: ..:.:. :.::::: : ::: : : .
CCDS30 NDSSLRNHPDMYSARGVAERTPSFMYPQGTASSQMVLRGMDLLLECIASGVPTPDIAWYK
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD PSGPMPADRVTYQNHNKTLQLLKVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVEAAPYWLHK
.: .:.:.. ..: ::.:.. .:.:::.::: ::: :..:: ::. : :.:::::: .
CCDS30 KGGDLPSDKAKFENFNKALRITNVSEEDSGEYFCLASNKMGSIRHTISVRVKAAPYWLDE
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KSD PQSHLYGPGETARLDCQVQGRPQPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALILSNVQPSD
:.. . .::: .:: :...: :.: : : .:: :.. . . .. ..:. ..: :.
CCDS30 PKNLILAPGEDGRLVCRANGNPKPTVQWMVNGEPLQSAPPNPNREVAGDTIIFRDTQISS
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KSD TMVTQCEARNRHGLLLANAYIYVVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSV
: ::.. :.:: :::::.. :...: ..:. :: .. . . : : ::.:.:..
CCDS30 RAVYQCNTSNEHGYLLANAFVSVLDVPPRMLSPRNQLIRVILYNRTRLDCPFFGSPIPTL
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KSD QWLDEDGTTVLQDERFFPYANGTLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDAT
.:. . . :. . : ::.: :. .. .: : : :.:.: ... .. :.::: :
CCDS30 RWFKNGQGSNLDGGNYHVYENGSLEIKMIRKEDQGIYTCVATNILGKAENQVRLEVKDPT
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KSD QITQGPRSTIEKKGSRVTFTCQASFDPSLQPSITWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDGRLVI
.: . :.. . ..:. : . :... ::::. ...: : . : .:. : :: :.:
CCDS30 RIYRMPEDQVARRGTTVQLECRVKHDPSLKLTVSWLKDDEPLY-IGNRMKK--EDDSLTI
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KSD HSLDYSDQGNYSCVASTELDVVESRAQLLVVGSPGPVPR-LVLSDLHLLTQSQVRVSWSP
.. :::.:.:::::::: ..: : :.: : :: : :.:: .. .::..: :
CCDS30 FGVAERDQGSYTCVASTELDQDLAKAYLTVLGRPDR-PRDLELTDL---AERSVRLTWIP
600 610 620 630 640
640 650 660 670 680 690
pF1KSD AEDHNAPIEKYDIEFEDKEMAPEKWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPYVHYTFRVTAINKYGP
.. .:.:: : ..::. .. : :.. .: ::. .:..:.:::::.: ::: :::. :
CCDS30 GDANNSPITDYVVQFEEDQFQPGVWHDHSKYPGSVNSAVLRLSPYVNYQFRVIAINEVGS
650 660 670 680 690 700
700 710 720 730 740 750
pF1KSD GEPSPVSETVVTPEAAPEKNPVDVKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQ
..:: :: : : ::.:: ::::::.. .:: ::: :. . .:...: :.:: .
CCDS30 SHPSLPSERYRTSGAPPESNPGDVKGEGTRKNNMEITWTPMNATSAFGPNLRYIVKWRRR
710 720 730 740 750 760
760 770 780 790 800 810
pF1KSD GTRGPWQEQIVSDPFLVVSNTSTFVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGEDYPQAIPE
:: :.. : ::..: ..:::::.::: :. ::::::. .:::::::::.: :
CCDS30 ETREAWNNVTVWGSRYVVGQTPVYVPYEIRVQAENDFGKGPEPESVIGYSGEDYPRAAPT
770 780 790 800 810 820
820 830 840 850 860 870
pF1KSD LEGIEILNSSAVLVKWRPVDLAQVKGHLRGYNVTYWREGSQRKHSKRHIHKDHVVVPANT
....::.:. ..: : :.:.:: : . ::::.: :. ..... :..
CCDS30 EVKVRVMNSTAISLQWNRVYSDTVQGQLREYRAYYWRESSLLKNLWVSQKRQQASFPGDR
830 840 850 860 870 880
880 890 900 910 920 930
pF1KSD TSVILSGLRPYSSYHLEVQAFNGRGSGPASEFT-FSTPEGVPGHPEALHLECQSNTSLLL
..: : :::.:.::. . ::::.:: :: :.::::::. :. .... . .. :
CCDS30 LRGVVSRLFPYSNYKLEMVVVNGRGDGPRSETKEFTTPEGVPSAPRRFRVRQPNLETINL
890 900 910 920 930 940
940 950 960 970 980 990
pF1KSD RWQPPLSHNGVLTGYVLSYHPLDEGGKGQLSFNLRDPELRTHNLTDLSPHLRYRFQLQAT
.:. : ::.. ::.:.: .. :. . .:. .. .: :::: :.:
CCDS30 EWDHPEHPNGIMIGYTLKYVAFNGTKVGKQIVENFSPNQTKFTVQRTDPVSRYRFTLSAR
950 960 970 980 990 1000
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD TKEGPGEAIVREGGTMALSGISDFGNISATAGENYSVVSWVPKEGQCNFRFHILFKALGE
:. : :::...:
CCDS30 TQVGSGEAVTEE------------------------------------------------
1010
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD EKGGASLSPQYVSYNQSSYTQWDLQPDTDYEIHLFKERMFRHQMAVKTNGTGRVRLPPAG
:: :. : ::. :
CCDS30 -------SPA--------------PPNEAY-----------------TNNQ-------AD
1020 1030
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD FATEGWFIGFVSAIILLLLVLLILCFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMKDETFGEY
.::.:::::.. :: ::.:.:::.::::::.:::: :..:.:. . : .: .: .:
CCDS30 IATQGWFIGLMCAIALLVLILLIVCFIKRSRGGKYPVREKKDVPLGPEDPKEEDGSF-DY
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD RSLESDNEEKAFGSSQPSLNGDIKPLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKEKE
::...: . .:: ::.: :: :::::.::: . . ::::::::::::. ::.::
CCDS30 ----SDEDNKPLQGSQTSLDGTIKQQESDDSLVDYGEGGEGQFNEDGSFIGQYTVKKDKE
1100 1110 1120 1130 1140
1240 1250
pF1KSD AAGGNDSSGATSPINPAVALE
. ::.:: ::::.: .:
CCDS30 ETEGNESSEATSPVNAIYSLA
1150 1160
>>CCDS53462.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 (1174 aa)
initn: 2423 init1: 875 opt: 1988 Z-score: 1498.5 bits: 289.3 E(32554): 3.8e-77
Smith-Waterman score: 2807; 37.8% identity (64.2% similar) in 1267 aa overlap (11-1256:14-1173)
10 20 30 40 50
pF1KSD MVVALRYVWPLLLCSPCL--LIQIPEEYEGHHVMEPPVITEQSPRRLVVFPTDDISL
.::: : :.:: . . .::.::.:: . .: : :.: .
CCDS53 MARQPPPPWVHAAFLLCLLSLGGAIEIPMD-----LTQPPTITKQSAKDHIVDPRDNILI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD KCEASGKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQGIYRCF
.:::.:.: .:.:::.. :. .. :.. . .::...: ... ....: :.::
CCDS53 ECEAKGNPAPSFHWTRNSRFFNIAKDPRVSMRR--RSGTLVIDFRSGGRPEEYEGEYQCF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD ASNKLGTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRIYWMNSK
: ::.:::.:..:::.. .: ::::.. :: :.:: ..: :::::. :.::.:.
CCDS53 ARNKFGTALSNRIRLQVSKSPLWPKENLDPVVVQEGAPLTLQCNPPPGLPSPVIFWMSSS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ILHIKQDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRVKATNSM
. : ::.::..:.::.:::.::. .: ..:: :.:.: :.:: ::.:. :.: ... .
CCDS53 MEPITQDKRVSQGHNGDLYFSNVMLQDMQTDYSCNARFHFTHTIQQKNPFTLKVLTNHPY
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270
pF1KSD ID-----------------RKPRLLFPTNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPTPTIKWLR
: : : ...: ...: ..:.:. :.::::: : ::: : : .
CCDS53 NDSSLRNHPDMYSARGVAERTPSFMYPQGTASSQMVLRGMDLLLECIASGVPTPDIAWYK
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD PSGPMPADRVTYQNHNKTLQLLKVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVEAAPYWLHK
.: .:.:.. ..: ::.:.. .:.:::.::: ::: :..:: ::. : :.:::::: .
CCDS53 KGGDLPSDKAKFENFNKALRITNVSEEDSGEYFCLASNKMGSIRHTISVRVKAAPYWLDE
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KSD PQSHLYGPGETARLDCQVQGRPQPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALILSNVQPSD
:.. . .::: .:: :...: :.: : : .:: :.. . . .. ..:. ..: :.
CCDS53 PKNLILAPGEDGRLVCRANGNPKPTVQWMVNGEPLQSAPPNPNREVAGDTIIFRDTQISS
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KSD TMVTQCEARNRHGLLLANAYIYVVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSV
: ::.. :.:: :::::.. :...: ..:. :: .. . . : : ::.:.:..
CCDS53 RAVYQCNTSNEHGYLLANAFVSVLDVPPRMLSPRNQLIRVILYNRTRLDCPFFGSPIPTL
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KSD QWLDEDGTTVLQDERFFPYANGTLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDAT
.:. . . :. . : ::.: :. .. .: : : :.:.: ... .. :.::: :
CCDS53 RWFKNGQGSNLDGGNYHVYENGSLEIKMIRKEDQGIYTCVATNILGKAENQVRLEVKDPT
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KSD QITQGPRSTIEKKGSRVTFTCQASFDPSLQPSITWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDGRLVI
.: . :.. . ..:. : . :... ::::. ...: : . : .:. : :: :.:
CCDS53 RIYRMPEDQVARRGTTVQLECRVKHDPSLKLTVSWLKDDEPLY-IGNRMKK--EDDSLTI
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KSD HSLDYSDQGNYSCVASTELDVVESRAQLLVVGSPGPVPR-LVLSDLHLLTQSQVRVSWSP
.. :::.:.:::::::: ..: : :.: : :: : :.:: .. .::..: :
CCDS53 FGVAERDQGSYTCVASTELDQDLAKAYLTVLGRPDR-PRDLELTDL---AERSVRLTWIP
600 610 620 630 640
640 650 660 670 680 690
pF1KSD AEDHNAPIEKYDIEFEDKEMAPEKWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPYVHYTFRVTAINKYGP
.. .:.:: : ..::. .. : :.. .: ::. .:..:.:::::.: ::: :::. :
CCDS53 GDANNSPITDYVVQFEEDQFQPGVWHDHSKYPGSVNSAVLRLSPYVNYQFRVIAINEVGS
650 660 670 680 690 700
700 710 720 730 740 750
pF1KSD GEPSPVSETVVTPEAAPEKNPVDVKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQ
..:: :: : : ::.:: ::::::.. .:: ::: :. . .:...: :.:: .
CCDS53 SHPSLPSERYRTSGAPPESNPGDVKGEGTRKNNMEITWTPMNATSAFGPNLRYIVKWRRR
710 720 730 740 750 760
760 770 780 790 800 810
pF1KSD GTRGPWQEQIVSDPFLVVSNTSTFVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGEDYPQAIPE
:: :.. : ::..: ..:::::.::: :. ::::::. .:::::::::.: :
CCDS53 ETREAWNNVTVWGSRYVVGQTPVYVPYEIRVQAENDFGKGPEPESVIGYSGEDYPRAAPT
770 780 790 800 810 820
820 830 840 850 860 870
pF1KSD LEGIEILNSSAVLVKWRPVDLAQVKGHLRGYNVTYWREGSQRKHSKRHIHKDHVVVPANT
....::.:. ..: : :.:.:: : . ::::.: :. ..... :..
CCDS53 EVKVRVMNSTAISLQWNRVYSDTVQGQLREYRAYYWRESSLLKNLWVSQKRQQASFPGDR
830 840 850 860 870 880
880 890 900 910 920 930
pF1KSD TSVILSGLRPYSSYHLEVQAFNGRGSGPASEFT-FSTPEGVPGHPEALHLECQSNTSLLL
..: : :::.:.::. . ::::.:: :: :.::::::. :. .... . .. :
CCDS53 LRGVVSRLFPYSNYKLEMVVVNGRGDGPRSETKEFTTPEGVPSAPRRFRVRQPNLETINL
890 900 910 920 930 940
940 950 960 970 980 990
pF1KSD RWQPPLSHNGVLTGYVLSYHPLDEGGKGQLSFNLRDPELRTHNLTDLSPHLRYRFQLQAT
.:. : ::.. ::.:.: .. :. . .:. .. .: :::: :.:
CCDS53 EWDHPEHPNGIMIGYTLKYVAFNGTKVGKQIVENFSPNQTKFTVQRTDPVSRYRFTLSAR
950 960 970 980 990 1000
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD TKEGPGEAIVREGGTMALSGISDFGNISATAGENYSVVSWVPKEGQCNFRFHILFKALGE
:. : :::...:
CCDS53 TQVGSGEAVTEE------------------------------------------------
1010
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD EKGGASLSPQYVSYNQSSYTQWDLQPDTDYEIHLFKERMFRHQMAVKTNGTGRVRLPPAG
: .: :... : :. ::. :
CCDS53 -----SPAPP----NEATPT------------------------AAYTNNQ-------AD
1020 1030
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD FATEGWFIGFVSAIILLLLVLLILCFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMKDETFGEY
.::.:::::.. :: ::.:.:::.::::::.:::: :..:.:. . : .: .: .:
CCDS53 IATQGWFIGLMCAIALLVLILLIVCFIKRSRGGKYPVREKKDVPLGPEDPKEEDGSF-DY
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD RSLESDNEEKAFGSSQPSLNGDIKPLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKEKE
::...: . .:: ::.: :: :::::.::: . . ::::::::::::. ::.::
CCDS53 ----SDEDNKPLQGSQTSLDGTIKQQESDDSLVDYGEGGEGQFNEDGSFIGQYTVKKDKE
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1240 1250
pF1KSD AAGGNDSSGATSPINPAVALE
. ::.:: ::::.: .:
CCDS53 ETEGNESSEATSPVNAIYSLA
1160 1170
1257 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 08:32:32 2016 done: Thu Nov 3 08:32:33 2016
Total Scan time: 4.170 Total Display time: 0.580
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]