Result of FASTA (omim) for
pF1KSDB0238
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0238, 1257 aa
1>>>pF1KSDB0238 1257 - 1257 aa - 1257 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6771+/-0.000542; mu= 5.4739+/- 0.033
mean_var=288.9332+/-61.251, 0's: 0 Z-trim(114.1): 642 B-trim: 96 in 1/56
Lambda= 0.075453
statistics sampled from 23051 (23828) to 23051 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.628), E-opt: 0.2 (0.279), width: 16
Scan time: 16.800
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000416 (OMIM: 303350,304100,307000,308840) neur (1257) 8540 945.6 0
NP_001265045 (OMIM: 303350,304100,307000,308840) n (1257) 8540 945.6 0
NP_076493 (OMIM: 303350,304100,307000,308840) neur (1253) 8499 941.1 0
NP_001137435 (OMIM: 303350,304100,307000,308840) n (1248) 8433 933.9 0
XP_016867731 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1273) 3106 354.0 3.6e-96
XP_016867746 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1192) 2665 306.0 9.8e-82
NP_001180512 (OMIM: 601581) neuronal cell adhesion (1192) 2665 306.0 9.8e-82
XP_016867736 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1196) 2665 306.0 9.8e-82
XP_016867738 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1195) 2661 305.6 1.3e-81
XP_016867739 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1199) 2661 305.6 1.3e-81
XP_016867729 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1285) 2661 305.6 1.4e-81
XP_016867727 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1288) 2661 305.6 1.4e-81
XP_016867730 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1289) 2661 305.6 1.4e-81
XP_011514564 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1292) 2661 305.6 1.4e-81
XP_016867728 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1286) 2660 305.5 1.5e-81
NP_001180513 (OMIM: 601581) neuronal cell adhesion (1180) 2659 305.3 1.5e-81
XP_011507617 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1332) 2565 295.2 2e-78
XP_005245050 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1234) 2562 294.8 2.4e-78
XP_016856223 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1403) 2562 294.9 2.6e-78
NP_001240316 (OMIM: 607416) neural cell adhesion m (1208) 2539 292.3 1.3e-77
XP_016861058 (OMIM: 607416) PREDICTED: neural cell (1208) 2539 292.3 1.3e-77
XP_011531596 (OMIM: 607416) PREDICTED: neural cell (1208) 2539 292.3 1.3e-77
XP_016861059 (OMIM: 607416) PREDICTED: neural cell (1208) 2539 292.3 1.3e-77
XP_011531597 (OMIM: 607416) PREDICTED: neural cell (1208) 2539 292.3 1.3e-77
XP_016861060 (OMIM: 607416) PREDICTED: neural cell (1208) 2539 292.3 1.3e-77
XP_016867726 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1292) 2504 288.5 1.9e-76
XP_016867744 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1189) 2475 285.3 1.6e-75
XP_006716070 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1296) 2269 262.9 9.8e-69
XP_016867735 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1205) 2073 241.6 2.5e-62
XP_016867725 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1298) 2066 240.8 4.4e-62
XP_011514573 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1186) 2065 240.7 4.5e-62
XP_016867741 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1192) 2065 240.7 4.5e-62
XP_016867737 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1196) 2065 240.7 4.5e-62
XP_011514563 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1295) 2065 240.7 4.7e-62
XP_011514561 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1301) 2065 240.7 4.8e-62
XP_016867748 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1115) 2063 240.4 5e-62
XP_016867747 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1121) 2063 240.4 5e-62
NP_005001 (OMIM: 601581) neuronal cell adhesion mo (1183) 2063 240.5 5.2e-62
XP_016867743 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1189) 2063 240.5 5.2e-62
XP_016867740 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1193) 2063 240.5 5.2e-62
NP_001180511 (OMIM: 601581) neuronal cell adhesion (1211) 2063 240.5 5.3e-62
XP_006716075 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1215) 2063 240.5 5.3e-62
XP_011514572 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1202) 2059 240.0 7.1e-62
XP_011514571 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1206) 2059 240.0 7.1e-62
XP_005250440 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1214) 2059 240.0 7.1e-62
XP_011514570 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1215) 2059 240.0 7.2e-62
XP_011514569 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1218) 2059 240.0 7.2e-62
XP_011514568 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1230) 2059 240.0 7.2e-62
XP_011514567 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1239) 2059 240.1 7.2e-62
XP_016867734 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1253) 2059 240.1 7.3e-62
>>NP_000416 (OMIM: 303350,304100,307000,308840) neural c (1257 aa)
initn: 8540 init1: 8540 opt: 8540 Z-score: 5044.4 bits: 945.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8540; 100.0% identity (100.0% similar) in 1257 aa overlap (1-1257:1-1257)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVVALRYVWPLLLCSPCLLIQIPEEYEGHHVMEPPVITEQSPRRLVVFPTDDISLKCEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MVVALRYVWPLLLCSPCLLIQIPEEYEGHHVMEPPVITEQSPRRLVVFPTDDISLKCEAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQGIYRCFASNKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQGIYRCFASNKL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRIYWMNSKILHIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRIYWMNSKILHIK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRVKATNSMIDRKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRVKATNSMIDRKP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RLLFPTNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPTPTIKWLRPSGPMPADRVTYQNHNKTLQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RLLFPTNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPTPTIKWLRPSGPMPADRVTYQNHNKTLQLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVEAAPYWLHKPQSHLYGPGETARLDCQVQGRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVEAAPYWLHKPQSHLYGPGETARLDCQVQGRP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALILSNVQPSDTMVTQCEARNRHGLLLANAYIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALILSNVQPSDTMVTQCEARNRHGLLLANAYIY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSVQWLDEDGTTVLQDERFFPYANG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSVQWLDEDGTTVLQDERFFPYANG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD TLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDATQITQGPRSTIEKKGSRVTFTCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDATQITQGPRSTIEKKGSRVTFTCQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ASFDPSLQPSITWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDGRLVIHSLDYSDQGNYSCVASTELDVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ASFDPSLQPSITWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDGRLVIHSLDYSDQGNYSCVASTELDVV
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610 620 630 640 650 660
pF1KSD ESRAQLLVVGSPGPVPRLVLSDLHLLTQSQVRVSWSPAEDHNAPIEKYDIEFEDKEMAPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ESRAQLLVVGSPGPVPRLVLSDLHLLTQSQVRVSWSPAEDHNAPIEKYDIEFEDKEMAPE
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670 680 690 700 710 720
pF1KSD KWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPYVHYTFRVTAINKYGPGEPSPVSETVVTPEAAPEKNPVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPYVHYTFRVTAINKYGPGEPSPVSETVVTPEAAPEKNPVD
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730 740 750 760 770 780
pF1KSD VKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQGTRGPWQEQIVSDPFLVVSNTST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQGTRGPWQEQIVSDPFLVVSNTST
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD FVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGEDYPQAIPELEGIEILNSSAVLVKWRPVDLAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGEDYPQAIPELEGIEILNSSAVLVKWRPVDLAQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD VKGHLRGYNVTYWREGSQRKHSKRHIHKDHVVVPANTTSVILSGLRPYSSYHLEVQAFNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VKGHLRGYNVTYWREGSQRKHSKRHIHKDHVVVPANTTSVILSGLRPYSSYHLEVQAFNG
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910 920 930 940 950 960
pF1KSD RGSGPASEFTFSTPEGVPGHPEALHLECQSNTSLLLRWQPPLSHNGVLTGYVLSYHPLDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RGSGPASEFTFSTPEGVPGHPEALHLECQSNTSLLLRWQPPLSHNGVLTGYVLSYHPLDE
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pF1KSD GGKGQLSFNLRDPELRTHNLTDLSPHLRYRFQLQATTKEGPGEAIVREGGTMALSGISDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GGKGQLSFNLRDPELRTHNLTDLSPHLRYRFQLQATTKEGPGEAIVREGGTMALSGISDF
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD GNISATAGENYSVVSWVPKEGQCNFRFHILFKALGEEKGGASLSPQYVSYNQSSYTQWDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GNISATAGENYSVVSWVPKEGQCNFRFHILFKALGEEKGGASLSPQYVSYNQSSYTQWDL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD QPDTDYEIHLFKERMFRHQMAVKTNGTGRVRLPPAGFATEGWFIGFVSAIILLLLVLLIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QPDTDYEIHLFKERMFRHQMAVKTNGTGRVRLPPAGFATEGWFIGFVSAIILLLLVLLIL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD CFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMKDETFGEYRSLESDNEEKAFGSSQPSLNGDIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 CFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMKDETFGEYRSLESDNEEKAFGSSQPSLNGDIK
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD PLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKEKEAAGGNDSSGATSPINPAVALE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKEKEAAGGNDSSGATSPINPAVALE
1210 1220 1230 1240 1250
>>NP_001265045 (OMIM: 303350,304100,307000,308840) neura (1257 aa)
initn: 8540 init1: 8540 opt: 8540 Z-score: 5044.4 bits: 945.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8540; 100.0% identity (100.0% similar) in 1257 aa overlap (1-1257:1-1257)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVVALRYVWPLLLCSPCLLIQIPEEYEGHHVMEPPVITEQSPRRLVVFPTDDISLKCEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVVALRYVWPLLLCSPCLLIQIPEEYEGHHVMEPPVITEQSPRRLVVFPTDDISLKCEAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQGIYRCFASNKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQGIYRCFASNKL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRIYWMNSKILHIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRIYWMNSKILHIK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRVKATNSMIDRKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRVKATNSMIDRKP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RLLFPTNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPTPTIKWLRPSGPMPADRVTYQNHNKTLQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLLFPTNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPTPTIKWLRPSGPMPADRVTYQNHNKTLQLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVEAAPYWLHKPQSHLYGPGETARLDCQVQGRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVEAAPYWLHKPQSHLYGPGETARLDCQVQGRP
310 320 330 340 350 360
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pF1KSD QPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALILSNVQPSDTMVTQCEARNRHGLLLANAYIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALILSNVQPSDTMVTQCEARNRHGLLLANAYIY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSVQWLDEDGTTVLQDERFFPYANG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSVQWLDEDGTTVLQDERFFPYANG
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490 500 510 520 530 540
pF1KSD TLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDATQITQGPRSTIEKKGSRVTFTCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDATQITQGPRSTIEKKGSRVTFTCQ
490 500 510 520 530 540
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pF1KSD ASFDPSLQPSITWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDGRLVIHSLDYSDQGNYSCVASTELDVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASFDPSLQPSITWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDGRLVIHSLDYSDQGNYSCVASTELDVV
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610 620 630 640 650 660
pF1KSD ESRAQLLVVGSPGPVPRLVLSDLHLLTQSQVRVSWSPAEDHNAPIEKYDIEFEDKEMAPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ESRAQLLVVGSPGPVPRLVLSDLHLLTQSQVRVSWSPAEDHNAPIEKYDIEFEDKEMAPE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPYVHYTFRVTAINKYGPGEPSPVSETVVTPEAAPEKNPVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPYVHYTFRVTAINKYGPGEPSPVSETVVTPEAAPEKNPVD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD VKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQGTRGPWQEQIVSDPFLVVSNTST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQGTRGPWQEQIVSDPFLVVSNTST
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NP_001 FVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGEDYPQAIPELEGIEILNSSAVLVKWRPVDLAQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 PLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKEKEAAGGNDSSGATSPINPAVALE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KSD VKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQGTRGPWQEQIVSDPFLVVSNTST
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NP_001 FVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGEDYPQAIPELEGIEILNSSAVLVKWRPVDLAQ
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pF1KSD VKGHLRGYNVTYWREGSQRKHSKRHIHKDHVVVPANTTSVILSGLRPYSSYHLEVQAFNG
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NP_001 VKGHLRGYNVTYWREGSQRKHSKRHIHKDHVVVPANTTSVILSGLRPYSSYHLEVQAFNG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_001 GGKGQLSFNLRDPELRTHNLTDLSPHLRYRFQLQATTKEGPGEAIVREGGTMALSGISDF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GNISATAGENYSVVSWVPKEGQCNFRFHILFKALGEEKGGASLSPQYVSYNQSSYTQWDL
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pF1KSD QPDTDYEIHLFKERMFRHQMAVKTNGTGRVRLPPAGFATEGWFIGFVSAIILLLLVLLIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QPDTDYEIHLFKERMFRHQMAVKTNGTGRVRLPPAGFATEGWFIGFVSAIILLLLVLLIL
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pF1KSD CFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMKDETFGEYRSLESDNEEKAFGSSQPSLNGDIK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
NP_001 CFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMKDETFGEY----SDNEEKAFGSSQPSLNGDIK
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pF1KSD PLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKEKEAAGGNDSSGATSPINPAVALE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKEKEAAGGNDSSGATSPINPAVALE
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>>XP_016867731 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal cell a (1273 aa)
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10 20 30 40
pF1KSD MVVALRYVWPLLLCSPCLLIQIPEEYEG-HHVMEPPVITEQSPRRLVVFP
:.::. ...: . . . ...::.::.:::. .. :
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10 20 30 40 50 60
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pF1KSD TDDISLKCEASGKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQ
..: ..:::.::: .: :::.:.:: .. ::. .: .:.. :. . . :. ..
XP_016 RENIVIQCEAKGKPPPSFSWTRNGTHFDIDKDPLVTM--KPGTGTLIINIMSEGKAETYE
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD GIYRCFASNKLGTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRI
:.:.: : :. :.:.:..: . .: : :: ..:. .. :.:.:::: :: . : :
XP_016 GVYQCTARNERGAAVSNNIVVRPSRSPLWTKEKLEPITLQSGQSLVLPCRPPIGLPPPII
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD YWMNSKILHIKQDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRV
.::.... .. :.:::..: ::.:::.::: :.. ::::.:.: :.:: ::.::...:
XP_016 FWMDNSFQRLPQSERVSQGLNGDLYFSNVLPEDTREDYICYARFNHTQTIQQKQPISVKV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD KATNSMIDRKPRLLFPTNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPTPTIKWLRPSGPMPADRVT
...: .: : .: : ...:. :.:. : :::::::.::: : : . .: .: .:..
XP_016 ISAKSSRERPPTFLTPEGNASNKEELRGNVLSLECIAEGLPTPIIYWAKEDGMLPKNRTV
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD YQNHNKTLQLLKVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVEAAPYWLHKPQSHLYGPGET
:.: .::::...:.: :.:.:.:.:.:.::. .:. : :.:::::. ::. . .:::
XP_016 YKNFEKTLQIIHVSEADSGNYQCIAKNALGAIHHTISVRVKAAPYWITAPQNLVLSPGED
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350 360 370 380 390 400
pF1KSD ARLDCQVQGRPQPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALILSNVQPSDTMVTQCEARNR
. : :...: :.:...: ::.:.: : . .:. ..:.:::: .. : ::.: :.
XP_016 GTLICRANGNPKPRISWLTNGVPIEIAPDDPSRKIDGDTIIFSNVQERSSAVYQCNASNE
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD HGLLLANAYIYVVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSVQWLDEDGTTVL
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XP_016 YGYLLANAFVNVLAEPPRILTPANTLYQVIANRPALLDCAFFGSPLPTIEWFKGAKGSAL
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470 480 490 500 510 520
pF1KSD QDERFFPYANGTLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDATQITQGPRSTIE
... . . :::: : : ..:: : :.: : . . ..:..:: : :.. :. ..
XP_016 HEDIYVLHENGTLEIPVAQKDSTGTYTCVARNKLGMAKNEVHLEIKDPTWIVKQPEYAVV
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pF1KSD KKGSRVTFTCQASFDPSLQPSITWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDGRLVIHSLDYSDQGNY
..:: :.: :... : .:. .. : :.: :: ..... .. .::. ... .:.:.:
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pF1KSD SCVASTELDVVESRAQLLVVGSPGPVPRLVLS------DLHLLTQ--SQVRVSWSPAEDH
.:::.: :: : . : : :: .: :.: : . ::.: : ..:..::.:..:.
XP_016 TCVANTTLDSVSASAVLSVV-APTPTPAPVYDVPNPPFDLELTDQLDKSVQLSWTPGDDN
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XP_016 NSPITKFIIEYEDAMHKPGLWHHQTEVSGTQTTAQLKLSPYVNYSFRVMAVNSIGKSLPS
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XP_016 EWTSVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLIKVQALNDMGFAPEPAVVMGHSGEDLPMVAPGNVR
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....::. . :.: :: : ...:::.:: . ::. :. :...:::.: .. .. :
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1000 1010 1020 1030 1040 1050
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XP_016 SAGSGSQITEEAVTTVDEVQAVNPRISNLTAAAAETYANISW-EYEGPEHVNFYVEYGVA
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XP_016 GSKE---EWRKEIVNGSRSFFGLKGLMPGTAYKVRVGAVGDSGFVSSEDVFETGPAMASR
1080 1090 1100 1110 1120
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pF1KSD PPAGFATEGWFIGFVSAIILLLLVLLILCFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMK--D
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pF1KSD ETFGEYRSLESDNEEKAFGSSQPSLNGDIKPLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYS
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XP_016 GTFGEYSDAE-DHKPLKKGSRTPS-DRTVKKEDSDDSLVDYGEGVNGQFNEDGSFIGQYS
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1240 1250
pF1KSD GKKEKEAAGGNDSSGATSPINPAVALE
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XP_016 GKKEKEPAEGNESSEAPSPVNAMNSFV
1250 1260 1270
>>XP_016867746 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal cell a (1192 aa)
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10 20 30 40
pF1KSD MVVALRYVWPLLLCSPCLLIQIPEEYEG-HHVMEPPVITEQSPRRLVVFP
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pF1KSD GIYRCFASNKLGTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRI
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XP_016 ISAKSSRERPPTFLTPEGNASNKEELRGNVLSLECIAEGLPTPIIYWAKEDGMLPKNRTV
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XP_016 GTLICRANGNPKPRISWLTNGVPIEIAPDDPSRKIDGDTIIFSNVQERSSAVYQCNASNE
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pF1KSD HGLLLANAYIYVVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSVQWLDEDGTTVL
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XP_016 YGYLLANAFVNVLAEPPRILTPANTLYQVIANRPALLDCAFFGSPLPTIEWFKGAKGSAL
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pF1KSD QDERFFPYANGTLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDATQITQGPRSTIE
... . . :::: : : ..:: : :.: : . . ..:..:: : :.. :. ..
XP_016 HEDIYVLHENGTLEIPVAQKDSTGTYTCVARNKLGMAKNEVHLEIKDPTWIVKQPEYAVV
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pF1KSD KKGSRVTFTCQASFDPSLQPSITWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDGRLVIHSLDYSDQGNY
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XP_016 QRGSMVSFECKVKHDHTLSLTVLWLKDNR---ELPSDERFTVDKDHLVVADVSDDDSGTY
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pF1KSD SCVASTELDVVESRAQLLVVGSPGPVPRLVLS------DLHLLTQ--SQVRVSWSPAEDH
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XP_016 TCVANTTLDSVSASAVLSVV-APTPTPAPVYDVPNPPFDLELTDQLDKSVQLSWTPGDDN
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XP_016 NSPITKFIIEYEDAMHKPGLWHHQTEVSGTQTTAQLKLSPYVNYSFRVMAVNSIGKSLPS
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pF1KSD PVSETVVTPEAAPEKNPVDVKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQGTRG
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XP_016 EASEQYLTKASEPDKNPTAVEGLGSEPDNLVITWKPLNGFESNGPGLQYKVSWRQKDGDD
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pF1KSD PWQEQIVSD-PFLVVSNTSTFVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGEDYPQAIPELEG
: .:.. .::.: ::::: :::::.:..: .::: :..:.:::: :.. :
XP_016 EWTSVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLIKVQALNDMGFAPEPAVVMGHSGEDLPMVAPGNVR
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pF1KSD IEILNSSAVLVKWRPVDLAQVKGHLRGYNVTYWREGSQRKHSKRHIHKDHVVVPANTTSV
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XP_016 VNVVNSTLAEVHWDPVPLKSIRGHLQGYRIYYWKTQSSSKRNRRHIEKKILTFQGSKTHG
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pF1KSD ILSGLRPYSSYHLEVQAFNGRGSGPAS-EFTFSTPEGVPGHPEALHLECQSNTSLLLRWQ
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XP_016 MLPGLEPFSHYTLNVRVVNGKGEGPASPDRVFNTPEGVPSAPSSLKIVNPTLDSLTLEWD
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XP_016 PPSHPNGILTEYTLKYQPINSTHELGPL-VDLKIPANKTRWTLKNLNFSTRYKFYFYAQT
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pF1KSD KEGPGEAIVREGGTMALSGISDFGNISATAGENYSVVSWVPKEGQCNFRFHILFKALGEE
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XP_016 SAGSGSQITEE----AVTTVDEAG---------------------------ILPPDVGAG
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pF1KSD KGGASLSPQYVSYNQSSYTQWDLQPDTDYEIHLFKERMFRHQMAVKTNGTGRVRLPPAGF
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XP_016 KAMAS-------------RQVDI-------------------------------------
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pF1KSD ATEGWFIGFVSAIILLLLVLLILCFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMK--DETFGE
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XP_016 ATQGWFIGLMCAVALLILILLIVCFIRRNKGGKYPVKEKEDAHADPEIQPMKEDDGTFGE
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD YRSLESDNEEKAFGSSQPSLNGDIKPLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKEK
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XP_016 YSDAE-DHKPLKKGSRTPS-DRTVKKEDSDDSLVDYGEGVNGQFNEDGSFIGQYSGKKEK
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1240 1250
pF1KSD EAAGGNDSSGATSPINPAVALE
: : ::.:: : ::.:
XP_016 EPAEGNESSEAPSPVNAMNSFV
1180 1190
>>NP_001180512 (OMIM: 601581) neuronal cell adhesion mol (1192 aa)
initn: 2853 init1: 1225 opt: 2665 Z-score: 1588.4 bits: 306.0 E(85289): 9.8e-82
Smith-Waterman score: 3024; 39.3% identity (66.6% similar) in 1256 aa overlap (11-1251:21-1186)
10 20 30 40
pF1KSD MVVALRYVWPLLLCSPCLLIQIPEEYEG-HHVMEPPVITEQSPRRLVVFP
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NP_001 MQLKIMPKKKRLSAGRVPLILFLCQMISALEVPLDPKLLEDLVQPPTITQQSPKDYIIDP
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pF1KSD TDDISLKCEASGKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQ
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NP_001 RENIVIQCEAKGKPPPSFSWTRNGTHFDIDKDPLVTM--KPGTGTLIINIMSEGKAETYE
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pF1KSD GIYRCFASNKLGTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRI
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NP_001 GVYQCTARNERGAAVSNNIVVRPSRSPLWTKEKLEPITLQSGQSLVLPCRPPIGLPPPII
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170 180 190 200 210 220
pF1KSD YWMNSKILHIKQDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRV
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NP_001 FWMDNSFQRLPQSERVSQGLNGDLYFSNVLPEDTREDYICYARFNHTQTIQQKQPISVKV
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pF1KSD KATNSMIDRKPRLLFPTNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPTPTIKWLRPSGPMPADRVT
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NP_001 GTLICRANGNPKPRISWLTNGVPIEIAPDDPSRKIDGDTIIFSNVQERSSAVYQCNASNE
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD HGLLLANAYIYVVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSVQWLDEDGTTVL
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NP_001 YGYLLANAFVNVLAEPPRILTPANTLYQVIANRPALLDCAFFGSPLPTIEWFKGAKGSAL
420 430 440 450 460 470
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pF1KSD QDERFFPYANGTLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDATQITQGPRSTIE
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NP_001 HEDIYVLHENGTLEIPVAQKDSTGTYTCVARNKLGMAKNEVHLEIKDPTWIVKQPEYAVV
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KSD KKGSRVTFTCQASFDPSLQPSITWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDGRLVIHSLDYSDQGNY
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NP_001 QRGSMVSFECKVKHDHTLSLTVLWLKDNR---ELPSDERFTVDKDHLVVADVSDDDSGTY
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KSD SCVASTELDVVESRAQLLVVGSPGPVPRLVLS------DLHLLTQ--SQVRVSWSPAEDH
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NP_001 TCVANTTLDSVSASAVLSVV-APTPTPAPVYDVPNPPFDLELTDQLDKSVQLSWTPGDDN
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pF1KSD NAPIEKYDIEFEDKEMAPEKWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPYVHYTFRVTAINKYGPGEPS
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NP_001 NSPITKFIIEYEDAMHKPGLWHHQTEVSGTQTTAQLKLSPYVNYSFRVMAVNSIGKSLPS
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pF1KSD PVSETVVTPEAAPEKNPVDVKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQGTRG
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NP_001 EASEQYLTKASEPDKNPTAVEGLGSEPDNLVITWKPLNGFESNGPGLQYKVSWRQKDGDD
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KSD PWQEQIVSD-PFLVVSNTSTFVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGEDYPQAIPELEG
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NP_001 EWTSVVVANVSKYIVSGTPTFVPYLIKVQALNDMGFAPEPAVVMGHSGEDLPMVAPGNVR
780 790 800 810 820 830
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