Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDB1467
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB1467, 1634 aa
1>>>pF1KSDB1467 1634 - 1634 aa - 1634 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5484+/-0.00111; mu= 3.5460+/- 0.067
mean_var=201.6902+/-40.287, 0's: 0 Z-trim(110.1): 86 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.090309
statistics sampled from 11254 (11336) to 11254 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.348), width: 16
Scan time: 6.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1446.1 PIK3C2B gene_id:5287|Hs108|chr1 (1634) 11140 1465.5 0
CCDS7824.1 PIK3C2A gene_id:5286|Hs108|chr11 (1686) 3924 525.3 6.7e-148
CCDS44839.1 PIK3C2G gene_id:5288|Hs108|chr12 (1445) 2175 297.4 2.3e-79
CCDS73452.1 PIK3C2G gene_id:5288|Hs108|chr12 (1486) 2175 297.4 2.4e-79
CCDS43171.1 PIK3CA gene_id:5290|Hs108|chr3 (1068) 1249 176.7 3.7e-43
CCDS3104.1 PIK3CB gene_id:5291|Hs108|chr3 (1070) 1154 164.3 2e-39
CCDS104.1 PIK3CD gene_id:5293|Hs108|chr1 (1044) 1132 161.4 1.4e-38
CCDS5739.1 PIK3CG gene_id:5294|Hs108|chr7 (1102) 900 131.2 1.9e-29
CCDS77180.1 PIK3C3 gene_id:5289|Hs108|chr18 ( 824) 557 86.5 4.1e-16
CCDS11920.1 PIK3C3 gene_id:5289|Hs108|chr18 ( 887) 557 86.5 4.4e-16
>>CCDS1446.1 PIK3C2B gene_id:5287|Hs108|chr1 (1634 aa)
initn: 11140 init1: 11140 opt: 11140 Z-score: 7850.1 bits: 1465.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 11140; 100.0% identity (100.0% similar) in 1634 aa overlap (1-1634:1-1634)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSSTQGNGEHWKSLESVGISRKELAMAEALQMEYDALSRLRHDKEENRAKQNADPSLISW
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CCDS14 MSSTQGNGEHWKSLESVGISRKELAMAEALQMEYDALSRLRHDKEENRAKQNADPSLISW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DEPGVDFYSKPAGRRTDLKLLRGLSGSDPTLNYNSLSPQEGPPNHSTSQGPQPGSDPWPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DEPGVDFYSKPAGRRTDLKLLRGLSGSDPTLNYNSLSPQEGPPNHSTSQGPQPGSDPWPK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GSLSGDYLYIFDGSDGGVSSSPGPGDIEGSCKKLSPPPLPPRASIWDTPPLPPRKGSPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GSLSGDYLYIFDGSDGGVSSSPGPGDIEGSCKKLSPPPLPPRASIWDTPPLPPRKGSPSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SKISQPSDINTFSLVEQLPGKLLEHRILEEEEVLGGGGQGRLLGSVDYDGINDAITRLNL
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CCDS14 SKISQPSDINTFSLVEQLPGKLLEHRILEEEEVLGGGGQGRLLGSVDYDGINDAITRLNL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KSTYDAEMLRDATRGWKEGRGPLDFSKDTSGKPVARSKTMPPQVPPRTYASRYGNRKNAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KSTYDAEMLRDATRGWKEGRGPLDFSKDTSGKPVARSKTMPPQVPPRTYASRYGNRKNAT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PGKNRRISAAPVGSRPHTVANGHELFEVSEERDEEVAAFCHMLDILRSGSDIQDYFLTGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PGKNRRISAAPVGSRPHTVANGHELFEVSEERDEEVAAFCHMLDILRSGSDIQDYFLTGY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VWSAVTPSPEHLGDEVNLKVTVLCDRLQEALTFTCNCSSTVDLLIYQTLCYTHDDLRNVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VWSAVTPSPEHLGDEVNLKVTVLCDRLQEALTFTCNCSSTVDLLIYQTLCYTHDDLRNVD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VGDFVLKPCGLEEFLQNKHALGSHEYIQYCRKFDIDIRLQLMEQKVVRSDLARTVNDDQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VGDFVLKPCGLEEFLQNKHALGSHEYIQYCRKFDIDIRLQLMEQKVVRSDLARTVNDDQS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD PSTLNYLVHLQERPVKQTISRQALSLLFDTYHNEVDAFLLADGDFPLKADRVVQSVKAIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PSTLNYLVHLQERPVKQTISRQALSLLFDTYHNEVDAFLLADGDFPLKADRVVQSVKAIC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD NALAAVETPEITSALNQLPPCPSRMQPKIQKDPSVLAVRENREKVVEALTAAILDLVELY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NALAAVETPEITSALNQLPPCPSRMQPKIQKDPSVLAVRENREKVVEALTAAILDLVELY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD CNTFNADFQTAVPGSRKHDLVQEACHFARSLAFTVYATHRIPIIWATSYEDFYLSCSLSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CNTFNADFQTAVPGSRKHDLVQEACHFARSLAFTVYATHRIPIIWATSYEDFYLSCSLSH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD GGKELCSPLQTRRAHFSKYLFHLIVWDQQICFPVQVNRLPRETLLCATLYALPIPPPGSS
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CCDS14 GGKELCSPLQTRRAHFSKYLFHLIVWDQQICFPVQVNRLPRETLLCATLYALPIPPPGSS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SEANKQRRVPEALGWVTTPLFNFRQVLTCGRKLLGLWPATQENPSARWSAPNFHQPDSVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SEANKQRRVPEALGWVTTPLFNFRQVLTCGRKLLGLWPATQENPSARWSAPNFHQPDSVI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD LQIDFPTSAFDIKFTSPPGDKFSPRYEFGSLREEDQRKLKDIMQKESLYWLTDADKKRLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LQIDFPTSAFDIKFTSPPGDKFSPRYEFGSLREEDQRKLKDIMQKESLYWLTDADKKRLW
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD EKRYYCHSEVSSLPLVLASAPSWEWACLPDIYVLLKQWTHMNHQDALGLLHATFPDQEVR
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CCDS14 EKRYYCHSEVSSLPLVLASAPSWEWACLPDIYVLLKQWTHMNHQDALGLLHATFPDQEVR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD RMAVQWIGSLSDAELLDYLPQLVQALKYECYLDSPLVRFLLKRAVSDLRVTHYFFWLLKD
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CCDS14 RMAVQWIGSLSDAELLDYLPQLVQALKYECYLDSPLVRFLLKRAVSDLRVTHYFFWLLKD
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD GLKDSQFSIRYQYLLAALLCCCGKGLREEFNRQCWLVNALAKLAQQVREAAPSARQGILR
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CCDS14 GLKDSQFSIRYQYLLAALLCCCGKGLREEFNRQCWLVNALAKLAQQVREAAPSARQGILR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD TGLEEVKQFFALNGSCRLPLSPSLLVKGIVPRDCSYFNSNAVPLKLSFQNVDPLGENIRV
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CCDS14 TGLEEVKQFFALNGSCRLPLSPSLLVKGIVPRDCSYFNSNAVPLKLSFQNVDPLGENIRV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD IFKCGDDLRQDMLTLQMIRIMSKIWVQEGLDMRMVIFRCFSTGRGRGMVEMIPNAETLRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IFKCGDDLRQDMLTLQMIRIMSKIWVQEGLDMRMVIFRCFSTGRGRGMVEMIPNAETLRK
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD IQVEHGVTGSFKDRPLADWLQKHNPGEDEYEKAVENFIYSCAGCCVATYVLGICDRHNDN
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CCDS14 IQVEHGVTGSFKDRPLADWLQKHNPGEDEYEKAVENFIYSCAGCCVATYVLGICDRHNDN
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD IMLKTTGHMFHIDFGRFLGHAQMFGNIKRDRAPFVFTSDMAYVINGGDKPSSRFHDFVDL
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CCDS14 IMLKTTGHMFHIDFGRFLGHAQMFGNIKRDRAPFVFTSDMAYVINGGDKPSSRFHDFVDL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD CCQAYNLIRKHTHLFLNLLGLMLSCGIPELSDLEDLKYVYDALRPQDTEANATTYFTRLI
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CCDS14 CCQAYNLIRKHTHLFLNLLGLMLSCGIPELSDLEDLKYVYDALRPQDTEANATTYFTRLI
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD ESSLGSVATKLNFFIHNLAQMKFTGSDDRLTLSFASRTHTLKSSGRISDVFLCRHEKIFH
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CCDS14 ESSLGSVATKLNFFIHNLAQMKFTGSDDRLTLSFASRTHTLKSSGRISDVFLCRHEKIFH
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD PNKGYIYVVKVMRENTHEATYIQRTFEEFQELHNKLRLLFPSSHLPSFPSRFVIGRSRGE
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CCDS14 PNKGYIYVVKVMRENTHEATYIQRTFEEFQELHNKLRLLFPSSHLPSFPSRFVIGRSRGE
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD AVAERRREELNGYIWHLIHAPPEVAECDLVYTFFHPLPRDEKAMGTSPAPKSSDGTWARP
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CCDS14 AVAERRREELNGYIWHLIHAPPEVAECDLVYTFFHPLPRDEKAMGTSPAPKSSDGTWARP
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD VGKVGGEVKLSISYKNNKLFIMVMHIRGLQLLQDGNDPDPYVKIYLLPDPQKTTKRKTKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VGKVGGEVKLSISYKNNKLFIMVMHIRGLQLLQDGNDPDPYVKIYLLPDPQKTTKRKTKV
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KSD ARKTCNPTYNEMLVYDGIPKGDLQQRELQLSVLSEQGFWENVLLGEVNIRLRELDLAQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ARKTCNPTYNEMLVYDGIPKGDLQQRELQLSVLSEQGFWENVLLGEVNIRLRELDLAQEK
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630
pF1KSD TGWFALGSRSHGTL
::::::::::::::
CCDS14 TGWFALGSRSHGTL
1630
>>CCDS7824.1 PIK3C2A gene_id:5286|Hs108|chr11 (1686 aa)
initn: 3433 init1: 1981 opt: 3924 Z-score: 2768.8 bits: 525.3 E(32554): 6.7e-148
Smith-Waterman score: 4507; 47.2% identity (73.6% similar) in 1573 aa overlap (84-1631:189-1685)
60 70 80 90 100 110
pF1KSD DPSLISWDEPGVDFYSKPAGRRTDLKLLRGLSGSDPTLNYNSLSPQEGPPNHSTSQGPQP
: :..: ..: :.: . : : ::
CCDS78 PSTYSKQAAFQNGFNPRMPTFPSTEPIYLSLPGQSPYFSY-PLTP--ATPFH-----PQ-
160 170 180 190 200
120 130 140 150 160
pF1KSD GSDPWPKGSLSGDYLYIFD---GSDGGVSSSPGPGDIEGSCKKLSPPPLPPRA---SIWD
:: : . .: :. .:: ... .... . :.: . .:.: . :.. : .:
CCDS78 GSLPIYRPVVSTDMAKLFDKIASTSEFLKNGKARTDLEITDSKVSNLQVSPKSEDISKFD
210 220 230 240 250 260
170 180 190 200 210 220
pF1KSD TPPLPPRKGSPSSSKISQPSDINTFSLVEQLPGKLLEHRILEEEEVLGGGGQGRLLGSVD
: : .:.:. :. ..:.: :::. ... ::..
CCDS78 WLDLDP---------LSKPKVDNV---------EVLDH---EEEKNVSS-----LLAKDP
270 280 290 300
230 240 250 260 270 280
pF1KSD YDGINDAITRLNLKSTYDAEMLRDATRGWKEGRGPLDFSKDTSGKPVARSKTMPPQVPPR
.:.. :. .:: . .. : .. .:. : :.::... ..
CCDS78 WDAV-----LLEERSTANCHLERKVN------------GKSLSVATVTRSQSL--NIRTT
310 320 330 340
290 300 310 320 330 340
pF1KSD TYASRYGNRKNATPGKNRRISAAPVGSRPHTVANGHELFEVSEERDEEVAAFCHMLDILR
:. :. .. :. . :. :.:: :.. : ..::.::::. . :.
CCDS78 QLAKAQGHISQKDPNGT---SSLPTGSS---------LLQEVEVQNEEMAAFCRSITKLK
350 360 370 380 390
350 360 370 380 390 400
pF1KSD SGSDIQDYFLT-GYVWSAVTPSPEHLGDEVNLKVTVLCDRLQEALTFTCNCSSTVDLLIY
. .. . ::. : :: . . :.....::.. . .: .::::. ::::...:.
CCDS78 TKFPYTNHRTNPGYLLSPVTAQRNICGENASVKVSIDIEGFQLPVTFTCDVSSTVEIIIM
400 410 420 430 440 450
410 420 430 440 450 460
pF1KSD QTLCYTHDDLRNVDVGDFVLKPCGLEEFLQNKHALGSHEYIQYCRKFDIDIRLQLMEQKV
:.::..:::: .::::..::: :: :: :::.: :::::.:: :::.: .:::::. ..
CCDS78 QALCWVHDDLNQVDVGSYVLKVCGQEEVLQNNHCLGSHEHIQNCRKWDTEIRLQLLTFSA
460 470 480 490 500 510
470 480 490 500 510 520
pF1KSD VRSDLARTVNDDQSPSTLNYLVHLQERPVKQTISRQALSLLFDTYHNEVDAFLLADGDFP
. ..::::..::..: :: .. :.: :....:. . :.:.:::.:. : ...
CCDS78 MCQNLARTAEDDETPVDLNKHLYQIEKPCKEAMTRHPVEELLDSYHNQVELALQIENQHR
520 530 540 550 560 570
530 540 550 560 570
pF1KSD LKADRVVQSVKAICNALAAVETPEITSALNQLPPCPSRMQPKIQ--------KDPSVLAV
.:.:...:. ::.:: .::: :: ....: . . : .: : ..
CCDS78 -AVDQVIKAVRKICSALDGVETLAITESVKKLKRAVNLPRSKTADVTSLFGGEDTSRSST
580 590 600 610 620 630
580 590 600 610 620 630
pF1KSD R-----ENREKV-VEALTAAILDLVELYCNTFNADFQTAVPGSRKHDLVQEACHFARSLA
: :: .: .. ::::: ::..:. :. . . : : : :.:: ...:
CCDS78 RGSLNPENPVQVSINQLTAAIYDLLRLHANSGRSPTDCA--QSSKS--VKEAWTTTEQLQ
640 650 660 670 680
640 650 660 670 680 690
pF1KSD FTVYATHRIPIIWATSYEDFYLSCSLSHGGKELCSPLQTRRAHFSKYLFHLIVWDQQICF
::..:.: : :...:: .:: :::::.::.: .:.:.... : .:.:: ::. : :
CCDS78 FTIFAAHGISSNWVSNYEKYYLICSLSHNGKDLFKPIQSKKVGTYKNFFYLIKWDELIIF
690 700 710 720 730 740
700 710 720 730 740 750
pF1KSD PVQVNRLPRETLLCATLYALPIPPPGSSSEANKQRRVPEALGWVTTPLFNFRQVLTCGRK
:.:...:: :..: ::... ::: ..::::. ::::: :. :::.:.. :::: :
CCDS78 PIQISQLPLESVLHLTLFGILNQSSGSSPDSNKQRKGPEALGKVSLPLFDFKRFLTCGTK
750 760 770 780 790 800
760 770 780 790 800 810
pF1KSD LLGLWPATQENPSARWSAPNFHQPDSVILQIDFPTSAFDIKFTSPPGDK-FSPRYEFGSL
:: :: ... : . . . . ..::.:::. :::: .:.: :. . .... .:
CCDS78 LLYLWTSSHTNSVPGTVTKKGYVMERIVLQVDFPSPAFDIIYTTPQVDRSIIQQHNLETL
810 820 830 840 850 860
820 830 840 850 860 870
pF1KSD REEDQRKLKDIMQKESLYWLTDADKKRLWEKRYYCHSEVSSLPLVLASAPSWEWACLPDI
... . :: ::..:.: :. :: :::::::: .. . :: .:::::.:.:. :
CCDS78 ENDIKGKLLDILHKDSSLGLSKEDKAFLWEKRYYCFKHPNCLPKILASAPNWKWVNLAKT
870 880 890 900 910 920
880 890 900 910 920 930
pF1KSD YVLLKQWTHMNHQDALGLLHATFPDQEVRRMAVQWIGSLSDAELLDYLPQLVQALKYECY
: ::.:: . :: :: . : ::::: .:: :: ..:: :: : :::.::::::: :
CCDS78 YSLLHQWPALYPLIALELLDSKFADQEVRSLAVTWIEAISDDELTDLLPQFVQALKYEIY
930 940 950 960 970 980
940 950 960 970 980 990
pF1KSD LDSPLVRFLLKRAVSDLRVTHYFFWLLKDGLKDSQFSIRYQYLLAALLCCCGKGLREEFN
:.: ::.:::.::.......: ..:::::.:.: ::: ::...:.::: :: ::::.
CCDS78 LNSSLVQFLLSRALGNIQIAHNLYWLLKDALHDVQFSTRYEHVLGALLSVGGKRLREELL
990 1000 1010 1020 1030 1040
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD RQCWLVNALAKLAQQVREAAPSARQGILRTGLEEVKQFFALNGSCRLPLSPSLLVKGIVP
.: ::. :. .:..::.:. :::: .:. ..:.:..:: : .:::::.:::..: .
CCDS78 KQTKLVQLLGGVAEKVRQASGSARQVVLQRSMERVQSFFQKN-KCRLPLKPSLVAKELNI
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD RDCSYFNSNAVPLKLSFQNVDPLGENIRVIFKCGDDLRQDMLTLQMIRIMSKIWVQEGLD
..::.:.:::::::... :.::.::.: :.:: :.:::::::.::::.::.:::..::::
CCDS78 KSCSFFSSNAVPLKVTMVNADPMGEEINVMFKVGEDLRQDMLALQMIKIMDKIWLKEGLD
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD MRMVIFRCFSTGRGRGMVEMIPNAETLRKIQVEHGVTGSFKDRPLADWLQKHNPGEDEYE
.:::::.:.:::: :::::..: ..::::::::.::::::::.:::.::.:.::.:.:::
CCDS78 LRMVIFKCLSTGRDRGMVELVPASDTLRKIQVEYGVTGSFKDKPLAEWLRKYNPSEEEYE
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD KAVENFIYSCAGCCVATYVLGICDRHNDNIMLKTTGHMFHIDFGRFLGHAQMFGNIKRDR
:: :::::::::::::::::::::::::::::..::::::::::.:::::::::..::::
CCDS78 KASENFIYSCAGCCVATYVLGICDRHNDNIMLRSTGHMFHIDFGKFLGHAQMFGSFKRDR
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KSD APFVFTSDMAYVINGGDKPSSRFHDFVDLCCQAYNLIRKHTHLFLNLLGLMLSCGIPELS
::::.:::::::::::.::. ::. ::::::::::::::.:.::::::.::. :.:::.
CCDS78 APFVLTSDMAYVINGGEKPTIRFQLFVDLCCQAYNLIRKQTNLFLNLLSLMIPSGLPELT
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1300 1310 1320 1330 1340
pF1KSD DLEDLKYVYDALRPQDTEANATTYFTRLIESSLGSVATKLNFFIHNLAQMKFTG--SDDR
...::::: :::.:: :.:.:: .:::::::::::.:::.:::::::::..:.: :.:.
CCDS78 SIQDLKYVRDALQPQTTDAEATIFFTRLIESSLGSIATKFNFFIHNLAQLRFSGLPSNDE
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1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KSD LTLSFASRTHTLKSSGRISDVFLCRHEKIFHPNKGYIYVVKVMRENTHEATYIQRTFEEF
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1410 1420 1430 1440 1450 1460
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KSD QELHNKLRLLFPSSHLPSFPSRFVIGRSRGEAVAERRREELNGYIWHLIHAPPEVAECDL
::::::: ..:: .::.::.:.:.::.. . :: .:. :::.:. :..: .::::::
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1470 1480 1490 1500 1510 1520
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1530 1540 1550 1560 1570 1580
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1590 1600 1610 1620 1630
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CCDS78 QLSVLSAESLRENFFLGGVTLPLKDFNLSKETVKWYQLTAATYL
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CCDS73 RATILG----FSKKSSNLYLIQVTHSN-NETSLTEKSFEQFSKLHSQLQKQFASLTLPEF
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CCDS73 IRLCSVPLDKEK--WYPLGNSII
1470 1480
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CCDS43 R-----WNEWLNYDIYIPDLPRAARLCLSICSV------KGRKGAKEEHCP--LAWGNIN
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CCDS43 LFDYTDTLVSGKMALNLWPVPHGLEDLLNPIGVTGSNPNKETP-CLELEFDWFSSV--VK
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CCDS43 FPDMSVIEEHANWSVSREAGFSYSHAGLSNRLARDNELRENDKEQLKAISTRDPLSEITE
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CCDS43 QEKDFLWSHRHYCVTIPEILPKLLLSV-KWNSRDEVAQMYCLVKDWPPIKPEQAMELLDC
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CCDS43 HFFFWHLKSEMHNKTVSQRFGLLLESYCRACGMYLKH-LNRQVEAMEKLINLTDILKQEK
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CCDS43 KDETQKVQMKFLVEQMRRPDFMDALQGFLS-PLNPAHQLGNLRLEECRIMSSAKRPLWLN
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CCDS43 WENPDIMSELLFQNNEIIFKNGDDLRQDMLTLQIIRIMENIWQNQGLDLRMLPYGCLSIG
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CCDS43 DCVGLIEVVRNSHTIMQIQCKGGLKGALQFNSHTLHQWLKDKNKGEI-YDAAIDLFTRSC
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CCDS43 AGYCVATFILGIGDRHNSNIMVKDDGQLFHIDFGHFLDHKKKKFG-YKRERVPFVLTQDF
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CCDS43 LIVISKGAQECTKTREFERFQEMCYKAYLAIRQHANLFINLFSMMLGSGMPELQSFDDIA
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pF1KSD YVYDALRPQDTEANATTYFTRLI-ESSLGSVATKLNFFIHNLAQMKFTGSDDRLTLSFAS
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CCDS43 YIRKTLALDKTEQEALEYFMKQMNDAHHGGWTTKMDWIFHTIKQHALN
1030 1040 1050 1060
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CCDS31 IISHVWENNNPFQIVLVKGNKLNTEETVKVHVRAGLFHGTELLCKTIVS--SEVSGKNDH
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pF1KSD LIVWDQQICFPVQVNRLPRETLLCATLYAL--PIPPPGSSSEANKQR--------RVPEA
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CCDS31 --IWNEPLEFDINICDLPRMARLCFAVYAVLDKVKTKKSTKTINPSKYQTIRKAGKVHYP
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CCDS31 VAWVNTMVFDFKGQLRTGDIILHSWSSFPDELEEMLNPMGTVQT-NPYTENATALHVKFP
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CCDS31 ENK-KQPYYYPPFDKIIEKAAEIASSDSANVSSRGGKKFLPVLKEILDRDPLSQLCENEM
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CCDS31 DLIWTLRQDCR-EIFPQSLPKLLLSI---KWNKLEDVAQLQALLQIWPKLPPREALELLD
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CCDS31 FNYPDQYVREYAVGCLRQMSDEELSQYLLQLVQVLKYEPFLDCALSRFLLERALGNRRIG
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CCDS31 QFLFWHLRSEVHIPAVSVQFGVILEAY--CRGSVGHMKVLSKQVEALNKLKTLNSLIKLN
680 690 700 710 720
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CCDS31 AVKLNRAKGKEAMHTCLKQSAYREALS-DLQSPLNPCVILSELYVEKCKYMDSKMKPLWL
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CCDS31 VYNN-KVFGEDSVGVIFKNGDDLRQDMLTLQMLRLMDLLWKEAGLDLRMLPYGCLATGDR
790 800 810 820 830 840
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CCDS31 SGLIEVVSTSETIADIQLNSSNVAAAAAFNKDALLNWLKEYNSGDD-LDRAIEEFTLSCA
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CCDS31 GYCVASYVLGIGDRHSDNIMVKKTGQLFHIDFGHILGNFKSKFGIKRERVPFILTYDFIH
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CCDS31 VIQQGKTGNTEKFGRFRQCCEDAYLILRRHGNLFITLFALMLTAGLPELTSVKDIQYLKD
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CCDS31 SLALGKSEEEALKQFKQKFDEALRESWTTKVNWMAHTVRKDYRS
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CCDS10 DEQRRLCDVQPFLPVLRLVAREGDRVKKLINSQISLLIGKGL-HEFDSLCDPEVNDFRAK
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: . :: .. :: . ..:: .... : ..: . : :: . : .
CCDS10 MCQFCEEAAARRQQLGWEAWLQYSFPLQLEPSAQTWGPGTLRLPNRALLVNVKFEGSEES
150 160 170 180 190 200
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CCDS10 FTFQVSTKDVPLALMACALRKKATVFRQPLVEQPEDYTLQVNGRHEYLYGSYPLC-----
210 220 230 240 250
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CCDS10 -QFQYICSCLHSGLTPHLTMVHSSSILAMRDEQSNPAPQVQK-P------RAKPPPIPAK
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CCDS10 KPSSVSLWSLE-QPFRIEL---IQGSK------------------VNADERMKLV-----
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CCDS10 ----VQAGLFHGNEMLCKTVSSSEVSVCSE----PVWKQRLEFDINICDLPRMARLCFAL
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CCDS10 YAVIEKAKKARSTKKKSKKADCPIAWANLMLFDYKDQLKTGERCLYMWPSVPDEKGELLN
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CCDS10 PTGTVRSNPN--TDSAAALLICLPEVAPHPVYY-PALEKILELGRHSECVHVTEEEQLQL
460 470 480 490 500 510
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CCDS10 REILERRGSGELYEHEKDLVWKLR---HEVQEHFPEALARLLLVTKWNKHEDVAQMLYLL
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CCDS10 CSWPELPVLSALELLDFSFPDCHVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCE
570 580 590 600 610 620
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CCDS10 LTKFLLDRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLILEAY--CRGSTHHMKVLMKQG
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CCDS10 EALSKLKALNDFVKLSSQ-KTPKPQTKE-LMHLCMRQEAYLEALS-HLQSPLDPSTLLAE
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CCDS10 VCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSGGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQ
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CCDS10 EGLDLRMTPYGCLPTGDRTGLIEVVLRSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKN
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pF1KSD PGEDEYEKAVENFIYSCAGCCVATYVLGICDRHNDNIMLKTTGHMFHIDFGRFLGHAQM-
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CCDS10 PGE-ALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTK
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CCDS10 FG-INRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNSEKFERFRGYCERAYTILRRHGLLFLHLFALM
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pF1KSD LSCGIPELSDLEDLKYVYDALRPQDTEANATTYF-TRLIESSLGSVATKLNFFIHNLAQM
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CCDS10 RAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVSKD
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pF1KSD KFTGSDDRLTLSFASRTHTLKSSGRISDVFLCRHEKIFHPNKGYIYVVKVMRENTHEATY
CCDS10 NRQ
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CCDS57 TIHGKDHESVFTVSLWDCDRKFRVKIRGIDIPVLPRNTDLTVFVEANIQHGQQVLCQ---
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CCDS57 -RRTS-PKPFTEEVLWNVWLEFSIKIKDLPKGALLNLQIYCGKAPALSSKASAESPSSES
400 410 420 430 440 450
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CCDS57 KGKVQLLYYVNLLLIDHRFLLRRGEYVLHMWQISGKGEDQGSFNADKLTSATNPDKENSM
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CCDS57 SISILLDNYCHPIAL---PKHQPTPDPEGDRVRAEMPNQLRKQLEAIIATDPLNPLTAED
520 530 540 550 560 570
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CCDS57 KELLWHFRYESLKHPKAYPKLFSSVKWGQQEIVAKTYQLLARREVWDQSALDVGLTMQLL
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pF1KSD HATFPDQEVRRMAVQWIGSLSDAELLDYLPQLVQALKYECYLDSPLVRFLLKRAVSDLRV
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CCDS57 DCNFSDENVRAIAVQKLESLEDDDVLHYLLQLVQAVKFEPYHDSALARFLLKRGLRNKRI
640 650 660 670 680 690
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CCDS11 QDKFRLDLSDEEAVHYMQSLIDESVHALFAAVVEQIHKFAQYWRK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]