Result of FASTA (omim) for
pF1KSDB1480
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB1480, 986 aa
1>>>pF1KSDB1480 986 - 986 aa - 986 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.1187+/-0.000961; mu= -21.2535+/- 0.056
mean_var=1109.0392+/-246.995, 0's: 0 Z-trim(112.1): 1105 B-trim: 0 in 0/57
Lambda= 0.038512
statistics sampled from 19844 (20947) to 19844 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.574), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16
Scan time: 10.250
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_059145 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B rece ( 986) 6629 386.8 2.9e-106
NP_001296122 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B r (1055) 6624 386.6 3.7e-106
NP_004433 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B rece ( 987) 6617 386.2 4.7e-106
XP_006710504 (OMIM: 600997,603688) PREDICTED: ephr ( 980) 6509 380.2 3e-104
NP_004432 (OMIM: 600600) ephrin type-B receptor 1 ( 984) 5057 299.5 5.8e-80
NP_004434 (OMIM: 601839) ephrin type-B receptor 3 ( 998) 4737 281.7 1.3e-74
NP_001268695 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1016) 3967 239.0 1e-61
NP_872272 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor 5 (1015) 3963 238.7 1.2e-61
NP_001275558 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor ( 993) 3958 238.4 1.4e-61
NP_004431 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor 7 ( 998) 3945 237.7 2.3e-61
XP_005248726 (OMIM: 602190) PREDICTED: ephrin type ( 994) 3925 236.6 5e-61
NP_004435 (OMIM: 600011) ephrin type-B receptor 4 ( 987) 3708 224.5 2.1e-57
NP_001296121 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B r ( 928) 3600 218.5 1.3e-55
NP_001291466 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor ( 935) 3532 214.7 1.8e-54
NP_001291465 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor ( 986) 3532 214.8 1.9e-54
NP_004429 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor 4 ( 986) 3532 214.8 1.9e-54
XP_016865854 (OMIM: 602190) PREDICTED: ephrin type ( 989) 3492 212.5 8.7e-54
XP_005246431 (OMIM: 602188) PREDICTED: ephrin type ( 949) 3413 208.1 1.8e-52
NP_005224 (OMIM: 179611) ephrin type-A receptor 3 ( 983) 3370 205.8 9.5e-52
XP_005264772 (OMIM: 179611) PREDICTED: ephrin type ( 982) 3365 205.5 1.1e-51
XP_006710505 (OMIM: 600997,603688) PREDICTED: ephr ( 956) 3263 199.8 5.7e-50
XP_005264773 (OMIM: 179611) PREDICTED: ephrin type ( 918) 3223 197.6 2.6e-49
XP_016861357 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1016) 2901 179.7 6.7e-44
XP_016861356 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1032) 2901 179.7 6.8e-44
XP_016861355 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1038) 2901 179.7 6.8e-44
NP_001092909 (OMIM: 611123) ephrin type-A receptor (1008) 2804 174.3 2.8e-42
NP_065387 (OMIM: 176945) ephrin type-A receptor 8 (1005) 2626 164.4 2.7e-39
XP_011539275 (OMIM: 176945) PREDICTED: ephrin type ( 930) 2473 155.9 9.3e-37
XP_011539272 (OMIM: 176945) PREDICTED: ephrin type ( 930) 2473 155.9 9.3e-37
XP_011539274 (OMIM: 176945) PREDICTED: ephrin type ( 930) 2473 155.9 9.3e-37
XP_011539271 (OMIM: 176945) PREDICTED: ephrin type ( 930) 2473 155.9 9.3e-37
XP_016867305 (OMIM: 600011) PREDICTED: ephrin type (1005) 2474 156.0 9.3e-37
NP_001073917 (OMIM: 600066) ephrin type-A receptor (1130) 2383 151.0 3.3e-35
XP_016863369 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 852) 2354 149.2 8.6e-35
XP_016863367 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 904) 2354 149.3 8.9e-35
XP_011510844 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type ( 394) 2243 142.5 4.1e-33
XP_016863370 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 817) 2229 142.2 1e-32
XP_016863368 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 869) 2229 142.3 1.1e-32
NP_005223 (OMIM: 179610) ephrin type-A receptor 1 ( 976) 2187 140.0 5.8e-32
XP_016861699 (OMIM: 600066) PREDICTED: ephrin type (1104) 2085 134.4 3.1e-30
NP_004430 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor 5 (1037) 2014 130.5 4.7e-29
XP_005265710 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 874) 2001 129.6 7e-29
XP_011530037 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 926) 2001 129.7 7.2e-29
NP_001305690 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor ( 969) 2001 129.7 7.4e-29
NP_001268694 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1038) 2001 129.7 7.7e-29
XP_005248728 (OMIM: 602190) PREDICTED: ephrin type ( 610) 1941 126.1 5.8e-28
NP_872585 (OMIM: 179611) ephrin type-A receptor 3 ( 539) 1923 125.0 1.1e-27
NP_001268696 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1004) 1880 123.0 8e-27
NP_001316019 (OMIM: 116600,176946) ephrin type-A r ( 922) 1796 118.3 1.9e-25
XP_016856024 (OMIM: 116600,176946) PREDICTED: ephr ( 965) 1796 118.3 2e-25
>>NP_059145 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B receptor (986 aa)
initn: 6629 init1: 6629 opt: 6629 Z-score: 2028.7 bits: 386.8 E(85289): 2.9e-106
Smith-Waterman score: 6629; 100.0% identity (100.0% similar) in 986 aa overlap (1-986:1-986)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MALRRLGAALLLLPLLAAVEETLMDSTTATAELGWMVHPPSGWEEVSGYDENMNTIRTYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 MALRRLGAALLLLPLLAAVEETLMDSTTATAELGWMVHPPSGWEEVSGYDENMNTIRTYQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VCNVFESSQNNWLRTKFIRRRGAHRIHVEMKFSVRDCSSIPSVPGSCKETFNLYYYEADF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 VCNVFESSQNNWLRTKFIRRRGAHRIHVEMKFSVRDCSSIPSVPGSCKETFNLYYYEADF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DSATKTFPNWMENPWVKVDTIAADESFSQVDLGGRVMKINTEVRSFGPVSRSGFYLAFQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 DSATKTFPNWMENPWVKVDTIAADESFSQVDLGGRVMKINTEVRSFGPVSRSGFYLAFQD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YGGCMSLIAVRVFYRKCPRIIQNGAIFQETLSGAESTSLVAARGSCIANAEEVDVPIKLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 YGGCMSLIAVRVFYRKCPRIIQNGAIFQETLSGAESTSLVAARGSCIANAEEVDVPIKLY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD CNGDGEWLVPIGRCMCKAGFEAVENGTVCRGCPSGTFKANQGDEACTHCPINSRTTSEGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 CNGDGEWLVPIGRCMCKAGFEAVENGTVCRGCPSGTFKANQGDEACTHCPINSRTTSEGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TNCVCRNGYYRADLDPLDMPCTTIPSAPQAVISSVNETSLMLEWTPPRDSGGREDLVYNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 TNCVCRNGYYRADLDPLDMPCTTIPSAPQAVISSVNETSLMLEWTPPRDSGGREDLVYNI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ICKSCGSGRGACTRCGDNVQYAPRQLGLTEPRIYISDLLAHTQYTFEIQAVNGVTDQSPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 ICKSCGSGRGACTRCGDNVQYAPRQLGLTEPRIYISDLLAHTQYTFEIQAVNGVTDQSPF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SPQFASVNITTNQAAPSAVSIMHQVSRTVDSITLSWSQPDQPNGVILDYELQYYEKELSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 SPQFASVNITTNQAAPSAVSIMHQVSRTVDSITLSWSQPDQPNGVILDYELQYYEKELSE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD YNATAIKSPTNTVTVQGLKAGAIYVFQVRARTVAGYGRYSGKMYFQTMTEAEYQTSIQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 YNATAIKSPTNTVTVQGLKAGAIYVFQVRARTVAGYGRYSGKMYFQTMTEAEYQTSIQEK
490 500 510 520 530 540
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pF1KSD LPLIIGSSAAGLVFLIAVVVIAIVCNRRGFERADSEYTDKLQHYTSGHMTPGMKIYIDPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 LPLIIGSSAAGLVFLIAVVVIAIVCNRRGFERADSEYTDKLQHYTSGHMTPGMKIYIDPF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD TYEDPNEAVREFAKEIDISCVKIEQVIGAGEFGEVCSGHLKLPGKREIFVAIKTLKSGYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 TYEDPNEAVREFAKEIDISCVKIEQVIGAGEFGEVCSGHLKLPGKREIFVAIKTLKSGYT
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670 680 690 700 710 720
pF1KSD EKQRRDFLSEASIMGQFDHPNVIHLEGVVTKSTPVMIITEFMENGSLDSFLRQNDGQFTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 EKQRRDFLSEASIMGQFDHPNVIHLEGVVTKSTPVMIITEFMENGSLDSFLRQNDGQFTV
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730 740 750 760 770 780
pF1KSD IQLVGMLRGIAAGMKYLADMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRFLEDDTSDPTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 IQLVGMLRGIAAGMKYLADMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRFLEDDTSDPTY
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD TSALGGKIPIRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMTNQDVINAIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 TSALGGKIPIRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMTNQDVINAIE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD QDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKFGQIVNTLDKMIRNPNSLKAMAPLSSGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 QDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKFGQIVNTLDKMIRNPNSLKAMAPLSSGI
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910 920 930 940 950 960
pF1KSD NLPLLDRTIPDYTSFNTVDEWLEAIKMGQYKESFANAGFTSFDVVSQMMMEDILRVGVTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_059 NLPLLDRTIPDYTSFNTVDEWLEAIKMGQYKESFANAGFTSFDVVSQMMMEDILRVGVTL
910 920 930 940 950 960
970 980
pF1KSD AGHQKKILNSIQVMRAQMNQIQSVEV
::::::::::::::::::::::::::
NP_059 AGHQKKILNSIQVMRAQMNQIQSVEV
970 980
>>NP_001296122 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B recep (1055 aa)
initn: 6624 init1: 6624 opt: 6624 Z-score: 2026.9 bits: 386.6 E(85289): 3.7e-106
Smith-Waterman score: 6624; 100.0% identity (100.0% similar) in 985 aa overlap (1-985:1-985)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MALRRLGAALLLLPLLAAVEETLMDSTTATAELGWMVHPPSGWEEVSGYDENMNTIRTYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MALRRLGAALLLLPLLAAVEETLMDSTTATAELGWMVHPPSGWEEVSGYDENMNTIRTYQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VCNVFESSQNNWLRTKFIRRRGAHRIHVEMKFSVRDCSSIPSVPGSCKETFNLYYYEADF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VCNVFESSQNNWLRTKFIRRRGAHRIHVEMKFSVRDCSSIPSVPGSCKETFNLYYYEADF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DSATKTFPNWMENPWVKVDTIAADESFSQVDLGGRVMKINTEVRSFGPVSRSGFYLAFQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DSATKTFPNWMENPWVKVDTIAADESFSQVDLGGRVMKINTEVRSFGPVSRSGFYLAFQD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YGGCMSLIAVRVFYRKCPRIIQNGAIFQETLSGAESTSLVAARGSCIANAEEVDVPIKLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YGGCMSLIAVRVFYRKCPRIIQNGAIFQETLSGAESTSLVAARGSCIANAEEVDVPIKLY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD CNGDGEWLVPIGRCMCKAGFEAVENGTVCRGCPSGTFKANQGDEACTHCPINSRTTSEGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CNGDGEWLVPIGRCMCKAGFEAVENGTVCRGCPSGTFKANQGDEACTHCPINSRTTSEGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TNCVCRNGYYRADLDPLDMPCTTIPSAPQAVISSVNETSLMLEWTPPRDSGGREDLVYNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TNCVCRNGYYRADLDPLDMPCTTIPSAPQAVISSVNETSLMLEWTPPRDSGGREDLVYNI
310 320 330 340 350 360
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pF1KSD ICKSCGSGRGACTRCGDNVQYAPRQLGLTEPRIYISDLLAHTQYTFEIQAVNGVTDQSPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ICKSCGSGRGACTRCGDNVQYAPRQLGLTEPRIYISDLLAHTQYTFEIQAVNGVTDQSPF
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pF1KSD SPQFASVNITTNQAAPSAVSIMHQVSRTVDSITLSWSQPDQPNGVILDYELQYYEKELSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPQFASVNITTNQAAPSAVSIMHQVSRTVDSITLSWSQPDQPNGVILDYELQYYEKELSE
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490 500 510 520 530 540
pF1KSD YNATAIKSPTNTVTVQGLKAGAIYVFQVRARTVAGYGRYSGKMYFQTMTEAEYQTSIQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YNATAIKSPTNTVTVQGLKAGAIYVFQVRARTVAGYGRYSGKMYFQTMTEAEYQTSIQEK
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pF1KSD LPLIIGSSAAGLVFLIAVVVIAIVCNRRGFERADSEYTDKLQHYTSGHMTPGMKIYIDPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPLIIGSSAAGLVFLIAVVVIAIVCNRRGFERADSEYTDKLQHYTSGHMTPGMKIYIDPF
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pF1KSD TYEDPNEAVREFAKEIDISCVKIEQVIGAGEFGEVCSGHLKLPGKREIFVAIKTLKSGYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TYEDPNEAVREFAKEIDISCVKIEQVIGAGEFGEVCSGHLKLPGKREIFVAIKTLKSGYT
610 620 630 640 650 660
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pF1KSD EKQRRDFLSEASIMGQFDHPNVIHLEGVVTKSTPVMIITEFMENGSLDSFLRQNDGQFTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKQRRDFLSEASIMGQFDHPNVIHLEGVVTKSTPVMIITEFMENGSLDSFLRQNDGQFTV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD IQLVGMLRGIAAGMKYLADMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRFLEDDTSDPTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IQLVGMLRGIAAGMKYLADMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRFLEDDTSDPTY
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD TSALGGKIPIRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMTNQDVINAIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSALGGKIPIRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMTNQDVINAIE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD QDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKFGQIVNTLDKMIRNPNSLKAMAPLSSGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKFGQIVNTLDKMIRNPNSLKAMAPLSSGI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD NLPLLDRTIPDYTSFNTVDEWLEAIKMGQYKESFANAGFTSFDVVSQMMMEDILRVGVTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NLPLLDRTIPDYTSFNTVDEWLEAIKMGQYKESFANAGFTSFDVVSQMMMEDILRVGVTL
910 920 930 940 950 960
970 980
pF1KSD AGHQKKILNSIQVMRAQMNQIQSVEV
:::::::::::::::::::::::::
NP_001 AGHQKKILNSIQVMRAQMNQIQSVEGQPLARRPRATGRTKRCQPRDVTKKTCNSNDGKKK
970 980 990 1000 1010 1020
>>NP_004433 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B receptor (987 aa)
initn: 3828 init1: 3828 opt: 6617 Z-score: 2025.1 bits: 386.2 E(85289): 4.7e-106
Smith-Waterman score: 6617; 99.9% identity (99.9% similar) in 987 aa overlap (1-986:1-987)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MALRRLGAALLLLPLLAAVEETLMDSTTATAELGWMVHPPSGWEEVSGYDENMNTIRTYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MALRRLGAALLLLPLLAAVEETLMDSTTATAELGWMVHPPSGWEEVSGYDENMNTIRTYQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VCNVFESSQNNWLRTKFIRRRGAHRIHVEMKFSVRDCSSIPSVPGSCKETFNLYYYEADF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VCNVFESSQNNWLRTKFIRRRGAHRIHVEMKFSVRDCSSIPSVPGSCKETFNLYYYEADF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DSATKTFPNWMENPWVKVDTIAADESFSQVDLGGRVMKINTEVRSFGPVSRSGFYLAFQD
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 YGGCMSLIAVRVFYRKCPRIIQNGAIFQETLSGAESTSLVAARGSCIANAEEVDVPIKLY
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 CNGDGEWLVPIGRCMCKAGFEAVENGTVCRGCPSGTFKANQGDEACTHCPINSRTTSEGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TNCVCRNGYYRADLDPLDMPCTTIPSAPQAVISSVNETSLMLEWTPPRDSGGREDLVYNI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ICKSCGSGRGACTRCGDNVQYAPRQLGLTEPRIYISDLLAHTQYTFEIQAVNGVTDQSPF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SPQFASVNITTNQAAPSAVSIMHQVSRTVDSITLSWSQPDQPNGVILDYELQYYEKELSE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 YNATAIKSPTNTVTVQGLKAGAIYVFQVRARTVAGYGRYSGKMYFQTMTEAEYQTSIQEK
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:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LPLIIGSSAAGLVFLIAVVVIAIVCNRRRGFERADSEYTDKLQHYTSGHMTPGMKIYIDP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FTYEDPNEAVREFAKEIDISCVKIEQVIGAGEFGEVCSGHLKLPGKREIFVAIKTLKSGY
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660 670 680 690 700 710
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNVIHLEGVVTKSTPVMIITEFMENGSLDSFLRQNDGQFT
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pF1KSD VIQLVGMLRGIAAGMKYLADMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRFLEDDTSDPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VIQLVGMLRGIAAGMKYLADMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRFLEDDTSDPT
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KSD YTSALGGKIPIRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMTNQDVINAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 YTSALGGKIPIRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMTNQDVINAI
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KSD EQDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKFGQIVNTLDKMIRNPNSLKAMAPLSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EQDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKFGQIVNTLDKMIRNPNSLKAMAPLSSG
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900 910 920 930 940 950
pF1KSD INLPLLDRTIPDYTSFNTVDEWLEAIKMGQYKESFANAGFTSFDVVSQMMMEDILRVGVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 INLPLLDRTIPDYTSFNTVDEWLEAIKMGQYKESFANAGFTSFDVVSQMMMEDILRVGVT
910 920 930 940 950 960
960 970 980
pF1KSD LAGHQKKILNSIQVMRAQMNQIQSVEV
:::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LAGHQKKILNSIQVMRAQMNQIQSVEV
970 980
>>XP_006710504 (OMIM: 600997,603688) PREDICTED: ephrin t (980 aa)
initn: 3720 init1: 3720 opt: 6509 Z-score: 1992.7 bits: 380.2 E(85289): 3e-104
Smith-Waterman score: 6509; 99.8% identity (99.9% similar) in 969 aa overlap (19-986:12-980)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MALRRLGAALLLLPLLAAVEETLMDSTTATAELGWMVHPPSGWEEVSGYDENMNTIRTYQ
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MAGYERHGRRWLEETLMDSTTATAELGWMVHPPSGWEEVSGYDENMNTIRTYQ
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pF1KSD VCNVFESSQNNWLRTKFIRRRGAHRIHVEMKFSVRDCSSIPSVPGSCKETFNLYYYEADF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VCNVFESSQNNWLRTKFIRRRGAHRIHVEMKFSVRDCSSIPSVPGSCKETFNLYYYEADF
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pF1KSD DSATKTFPNWMENPWVKVDTIAADESFSQVDLGGRVMKINTEVRSFGPVSRSGFYLAFQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DSATKTFPNWMENPWVKVDTIAADESFSQVDLGGRVMKINTEVRSFGPVSRSGFYLAFQD
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190 200 210 220 230 240
pF1KSD YGGCMSLIAVRVFYRKCPRIIQNGAIFQETLSGAESTSLVAARGSCIANAEEVDVPIKLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YGGCMSLIAVRVFYRKCPRIIQNGAIFQETLSGAESTSLVAARGSCIANAEEVDVPIKLY
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD CNGDGEWLVPIGRCMCKAGFEAVENGTVCRGCPSGTFKANQGDEACTHCPINSRTTSEGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 CNGDGEWLVPIGRCMCKAGFEAVENGTVCRGCPSGTFKANQGDEACTHCPINSRTTSEGA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TNCVCRNGYYRADLDPLDMPCTTIPSAPQAVISSVNETSLMLEWTPPRDSGGREDLVYNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TNCVCRNGYYRADLDPLDMPCTTIPSAPQAVISSVNETSLMLEWTPPRDSGGREDLVYNI
300 310 320 330 340 350
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ICKSCGSGRGACTRCGDNVQYAPRQLGLTEPRIYISDLLAHTQYTFEIQAVNGVTDQSPF
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pF1KSD SPQFASVNITTNQAAPSAVSIMHQVSRTVDSITLSWSQPDQPNGVILDYELQYYEKELSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SPQFASVNITTNQAAPSAVSIMHQVSRTVDSITLSWSQPDQPNGVILDYELQYYEKELSE
420 430 440 450 460 470
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pF1KSD YNATAIKSPTNTVTVQGLKAGAIYVFQVRARTVAGYGRYSGKMYFQTMTEAEYQTSIQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YNATAIKSPTNTVTVQGLKAGAIYVFQVRARTVAGYGRYSGKMYFQTMTEAEYQTSIQEK
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pF1KSD LPLIIGSSAAGLVFLIAVVVIAIVCNRR-GFERADSEYTDKLQHYTSGHMTPGMKIYIDP
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LPLIIGSSAAGLVFLIAVVVIAIVCNRRRGFERADSEYTDKLQHYTSGHMTPGMKIYIDP
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pF1KSD FTYEDPNEAVREFAKEIDISCVKIEQVIGAGEFGEVCSGHLKLPGKREIFVAIKTLKSGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 FTYEDPNEAVREFAKEIDISCVKIEQVIGAGEFGEVCSGHLKLPGKREIFVAIKTLKSGY
600 610 620 630 640 650
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pF1KSD TEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNVIHLEGVVTKSTPVMIITEFMENGSLDSFLRQNDGQFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNVIHLEGVVTKSTPVMIITEFMENGSLDSFLRQNDGQFT
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KSD VIQLVGMLRGIAAGMKYLADMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRFLEDDTSDPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VIQLVGMLRGIAAGMKYLADMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRFLEDDTSDPT
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KSD YTSALGGKIPIRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMTNQDVINAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YTSALGGKIPIRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMTNQDVINAI
780 790 800 810 820 830
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pF1KSD EQDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKFGQIVNTLDKMIRNPNSLKAMAPLSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EQDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKFGQIVNTLDKMIRNPNSLKAMAPLSSG
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KSD INLPLLDRTIPDYTSFNTVDEWLEAIKMGQYKESFANAGFTSFDVVSQMMMEDILRVGVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 INLPLLDRTIPDYTSFNTVDEWLEAIKMGQYKESFANAGFTSFDVVSQMMMEDILRVGVT
900 910 920 930 940 950
960 970 980
pF1KSD LAGHQKKILNSIQVMRAQMNQIQSVEV
:::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LAGHQKKILNSIQVMRAQMNQIQSVEV
960 970 980
>>NP_004432 (OMIM: 600600) ephrin type-B receptor 1 prec (984 aa)
initn: 5095 init1: 3704 opt: 5057 Z-score: 1556.6 bits: 299.5 E(85289): 5.8e-80
Smith-Waterman score: 5057; 73.5% identity (90.5% similar) in 980 aa overlap (1-980:1-978)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MALRRLGAALLLLPLLAAVEETLMDSTTATAELGWMVHPPSGWEEVSGYDENMNTIRTYQ
::: : ::: .::.::::::. :::::::: ..: ::::::::::::.:::::::
NP_004 MALDYL-LLLLLASAVAAMEETLMDTRTATAELGWTANPASGWEEVSGYDENLNTIRTYQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VCNVFESSQNNWLRTKFIRRRGAHRIHVEMKFSVRDCSSIPSVPGSCKETFNLYYYEADF
:::::: .::::: : :: :::::::..::.:.::::::.:.:::::::::::::::.:
NP_004 VCNVFEPNQNNWLLTTFINRRGAHRIYTEMRFTVRDCSSLPNVPGSCKETFNLYYYETDS
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD DSATKTFPNWMENPWVKVDTIAADESFSQVDLGGRVMKINTEVRSFGPVSRSGFYLAFQD
::: : : :..:::::::::::::::.:::.::.:::::::::..:.::::::::
NP_004 VIATKKSAFWSEAPYLKVDTIAADESFSQVDFGGRLMKVNTEVRSFGPLTRNGFYLAFQD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YGGCMSLIAVRVFYRKCPRIIQNGAIFQETLSGAESTSLVAARGSCIANAEEVDVPIKLY
::.::::..::::..::: :.:: :.: ::..:::::::: :::.:: ::::::::::::
NP_004 YGACMSLLSVRVFFKKCPSIVQNFAVFPETMTGAESTSLVIARGTCIPNAEEVDVPIKLY
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD CNGDGEWLVPIGRCMCKAGFEAVENGTVCRGCPSGTFKANQGDEACTHCPINSRTTSEGA
:::::::.:::::: :: :.: ::...:..::.:::::.: :.:.::: :::. .:..
NP_004 CNGDGEWMVPIGRCTCKPGYEP-ENSVACKACPAGTFKASQEAEGCSHCPSNSRSPAEAS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TNCVCRNGYYRADLDPLDMPCTTIPSAPQAVISSVNETSLMLEWTPPRDSGGREDLVYNI
:.::.::::::.:: .. ::..::.:. ::: :::::..::: :::..:::.:..:::
NP_004 PICTCRTGYYRADFDPPEVACTSVPSGPRNVISIVNETSIILEWHPPRETGGRDDVTYNI
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ICKSCGSGRGACTRCGDNVQYAPRQLGLTEPRIYISDLLAHTQYTFEIQAVNGVTDQSPF
:::.: . : .:.:: :::...:::::::: :. ::.: ::: :::.:::.:::...:::
NP_004 ICKKCRADRRSCSRCDDNVEFVPRQLGLTECRVSISSLWAHTPYTFDIQAINGVSSKSPF
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SPQFASVNITTNQAAPSAVSIMHQVSRTVDSITLSWSQPDQPNGVILDYELQYYEKELSE
:: .::::::::::::.: :::::: :. :::::: ::.::::.:::::..::::: .:
NP_004 PPQHVSVNITTNQAAPSTVPIMHQVSATMRSITLSWPQPEQPNGIILDYEIRYYEKEHNE
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KSD YNATAIKSPTNTVTVQGLKAGAIYVFQVRARTVAGYGRYSGKMYFQTMTEAEYQTSIQEK
.:.. .: :::. ..::. : .:: :::::::::::..:::: :::.:. .:.. ..:.
NP_004 FNSSMARSQTNTARIDGLRPGMVYVVQVRARTVAGYGKFSGKMCFQTLTDDDYKSELREQ
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KSD LPLIIGSSAAGLVFLIAVVVIAIVCNRRGFERADSEYTDKLQHYTSGHMTPGMKIYIDPF
:::: ::.:::.::....:.:.:::.:. .. :.::::::..:. .::::::::::
NP_004 LPLIAGSAAAGVVFVVSLVAISIVCSRKRAYSKEAVYSDKLQHYSTGRGSPGMKIYIDPF
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KSD TYEDPNEAVREFAKEIDISCVKIEQVIGAGEFGEVCSGHLKLPGKREIFVAIKTLKSGYT
:::::::::::::::::.: ::::.:::::::::: .:.:::::::::.:::::::.::.
NP_004 TYEDPNEAVREFAKEIDVSFVKIEEVIGAGEFGEVYKGRLKLPGKREIYVAIKTLKAGYS
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KSD EKQRRDFLSEASIMGQFDHPNVIHLEGVVTKSTPVMIITEFMENGSLDSFLRQNDGQFTV
:::::::::::::::::::::.:.:::::::: ::::::::::::.::::::::::::::
NP_004 EKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMIITEFMENGALDSFLRQNDGQFTV
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KSD IQLVGMLRGIAAGMKYLADMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRFLEDDTSDPTY
::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::
NP_004 IQLVGMLRGIAAGMKYLAEMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRYLQDDTSDPTY
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KSD TSALGGKIPIRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMTNQDVINAIE
::.::::::.:::::::: ::::::::::::::::::::::.::::::::.:::::::::
NP_004 TSSLGGKIPVRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSFGERPYWDMSNQDVINAIE
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KSD QDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKFGQIVNTLDKMIRNPNSLKAMAPLSSGI
::::::::::::.::::::::::::::: ::.:..:::::::::::: :::..: ...
NP_004 QDYRLPPPMDCPAALHQLMLDCWQKDRNSRPRFAEIVNTLDKMIRNPASLKTVATITAVP
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KSD NLPLLDRTIPDYTSFNTVDEWLEAIKMGQYKESFANAGFTSFDVVSQMMMEDILRVGVTL
. :::::.:::.:.:.:::.:: :::: ::..:: .:::::...:.:: ::.::.:.::
NP_004 SQPLLDRSIPDFTAFTTVDDWLSAIKMVQYRDSFLTAGFTSLQLVTQMTSEDLLRIGITL
900 910 920 930 940 950
970 980
pF1KSD AGHQKKILNSIQVMRAQMNQIQSVEV
:::::::::::. ::.:..:
NP_004 AGHQKKILNSIHSMRVQISQSPTAMA
960 970 980
>>NP_004434 (OMIM: 601839) ephrin type-B receptor 3 prec (998 aa)
initn: 3989 init1: 2297 opt: 4737 Z-score: 1460.5 bits: 281.7 E(85289): 1.3e-74
Smith-Waterman score: 4737; 70.4% identity (86.2% similar) in 986 aa overlap (10-986:23-998)
10 20 30 40
pF1KSD MALRRLGAALLLLPLLA------AVEETLMDSTTATAELGWMVHPPS
::::::: :.::::::. .:.::.: :: :
NP_004 MARARPPPPPSPPPGLLPLLPPLLLLPLLLLPAGCRALEETLMDTKWVTSELAWTSHPES
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD GWEEVSGYDENMNTIRTYQVCNVFESSQNNWLRTKFIRRRGAHRIHVEMKFSVRDCSSIP
:::::::::: :: ::::::::: :::::::::: :: :: ..:..::.::.::::.:::
NP_004 GWEEVSGYDEAMNPIRTYQVCNVRESSQNNWLRTGFIWRRDVQRVYVELKFTVRDCNSIP
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD SVPGSCKETFNLYYYEADFDSATKTFPNWMENPWVKVDTIAADESFSQVDLGGRVMKINT
..::::::::::.::::: : :. . : :::::.::::::: :::::..: : ..::
NP_004 NIPGSCKETFNLFYYEADSDVASASSPFWMENPYVKVDTIAPDESFSRLDAG----RVNT
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD EVRSFGPVSRSGFYLAFQDYGGCMSLIAVRVFYRKCPRIIQNGAIFQETLSGAESTSLVA
.::::::.:..:::::::: :.:::::.::.::.:: . :.: :::.::: ::::
NP_004 KVRSFGPLSKAGFYLAFQDQGACMSLISVRAFYKKCASTTAGFALFPETLTGAEPTSLVI
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD ARGSCIANAEEVDVPIKLYCNGDGEWLVPIGRCMCKAGFEAVENGTVCRGCPSGTFKANQ
: :.:: :: ::.::.::::::::::.::.: : : .: : . . . :: :: :..::.:
NP_004 APGTCIPNAVEVSVPLKLYCNGDGEWMVPVGACTCATGHEPAAKESQCRPCPPGSYKAKQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD GDEACTHCPINSRTTSEGATNCVCRNGYYRADLDPLDMPCTTIPSAPQAVISSVNETSLM
:. : :: :::::: .:. :.:.:..:::: : : :::.:: :..:::.::::::.
NP_004 GEGPCLPCPPNSRTTSPAASICTCHNNFYRADSDSADSACTTVPSPPRGVISNVNETSLI
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KSD LEWTPPRDSGGREDLVYNIICKSC--GSGRGACTRCGDNVQYAPRQLGLTEPRIYISDLL
:::. ::: :::.::.::.:::.: ..: .::.:: :::...:::::::: :..:: ::
NP_004 LEWSEPRDLGGRDDLLYNVICKKCHGAGGASACSRCDDNVEFVPRQLGLTERRVHISHLL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KSD AHTQYTFEIQAVNGVTDQSPFSPQFASVNITTNQAAPSAVSIMHQVSRTVDSITLSWSQP
:::.::::.::::::. .::. :..:.::::::::::: : .. : . .:.::::. :
NP_004 AHTRYTFEVQAVNGVSGKSPLPPRYAAVNITTNQAAPSEVPTLRLHSSSGSSLTLSWAPP
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KSD DQPNGVILDYELQYYEKELSEYNATAIKSPTNTVTVQGLKAGAIYVFQVRARTVAGYGRY
..:::::::::..:.:: :: :... : :.: ..::. : :: :::::::::::.:
NP_004 ERPNGVILDYEMKYFEK--SEGIASTVTSQMNSVQLDGLRPDARYVVQVRARTVAGYGQY
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KSD SGKMYFQTMTE-AEYQTSIQEKLPLIIGSSAAGLVFLIAVVVIAIVCNRRGFERADSEYT
: :.: .: . ..::.::::.::..:::::..::::::::: :. . .:::::
NP_004 SRPAEFETTSERGSGAQQLQEQLPLIVGSATAGLVFVVAVVVIAIVCLRKQRHGSDSEYT
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KSD DKLQHYTSGHMTPGMKIYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDISCVKIEQVIGAGEFGEVCSG
.:::.: ..::::.::::::::::::::::::::::.::::::.::::::::::: :
NP_004 EKLQQY----IAPGMKVYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSCVKIEEVIGAGEFGEVCRG
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KSD HLKLPGKREIFVAIKTLKSGYTEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNVIHLEGVVTKSTPVMII
.:: ::.::.:::::::: ::::.:::::::::::::::::::.:.:::::::: ::::.
NP_004 RLKQPGRREVFVAIKTLKVGYTERQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMIL
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KSD TEFMENGSLDSFLRQNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLADMNYVHRDLAARNILVNSNL
:::::: .:::::: ::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::
NP_004 TEFMENCALDSFLRLNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLSEMNYVHRDLAARNILVNSNL
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760 770 780 790 800 810
pF1KSD VCKVSDFGLSRFLEDDTSDPTYTSALGGKIPIRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWE
:::::::::::::::: :::::::.::::::::::::::: :::::::::::::::::::
NP_004 VCKVSDFGLSRFLEDDPSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWE
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820 830 840 850 860 870
pF1KSD VMSYGERPYWDMTNQDVINAIEQDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKFGQIVN
::::::::::::.:::::::.:::::::::::::.:::::::::: .::: ::::.::::
NP_004 VMSYGERPYWDMSNQDVINAVEQDYRLPPPMDCPTALHQLMLDCWVRDRNLRPKFSQIVN
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pF1KSD TLDKMIRNPNSLKAMAPLSSGINLPLLDRTIPDYTSFNTVDEWLEAIKMGQYKESFANAG
::::.::: :::..: .::.. ::::::.::::.:.:: .::.:::::.:::::..::
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940 950 960 970 980
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10 20 30
pF1KSD MALRRLGAALLLLPLLAAVEETLMDSTTATAELGW
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40 50 60 70 80 90
pF1KSD MVHPPSGWEEVSGYDENMNTIRTYQVCNVFESSQNNWLRTKFIRRRGAHRIHVEMKFSVR
.. : .::::.. :::. :.:::::.:.:..::::: :..: .:: :: .:.::..:
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100 110 120 130 140 150
pF1KSD DCSSIPSVPGSCKETFNLYYYEADFDSATKTFPNWMENPWVKVDTIAADESFSQVDLGGR
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NP_001 DCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESD-DQNGR---NIKENQYIKIDTIAADESFTELDLGDR
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160 170 180 190 200 210
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:::.:::::. ::.:..:::::::: :.:..:..:::.:.::: .... :.: .:..::.
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220 230 240 250 260 270
pF1KSD STSLVAARGSCIANAEEVDVPIKLYCNGDGEWLVPIGRCMCKAGFEAVENGTVCRGCPSG
:..:. . :::. : .: : :..:...::::::::.::::::.: .::: :. : :
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pF1KSD TFKANQGDEACTHCPINSRTTSEGATNCVCRNGYYRADLDPLDMPCTTIPSAPQAVISSV
:::. ..: .:: .: : :..:.:::.. :.: . :: : :: ::::. .::.:
NP_001 FFKASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPSAPRNAISNV
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pF1KSD NETSLMLEWTPPRDSGGREDLVYNIICKSCGSGRGACTRCGDNVQYAPRQLGLTEPRIYI
::::..::: :: :.:::.:. : : ::.:.: :.: .:: .:.: ::: :: . ...
NP_001 NETSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQSGLKNTSVMM
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400 410 420 430 440 450
pF1KSD SDLLAHTQYTFEIQAVNGVTDQSPFSPQFASVNITTNQAAPSAVSIMHQVSRTVDSITLS
::::::.:::::.:::::.: :: . :..:::.:::::::: :. ... . . .::.::
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520 530 540 550 560 570
pF1KSD YGRYSGKMYFQTMTEAEYQTSIQEKLPLIIGSSAAGLVFLIAVVVIAIVCNRR-GFERAD
:: .: .. :.: . .: : ..:.: : ..: :.:.:::. ... .:: :. .:
NP_001 YGVFSRRFEFETTPVSVAASSDQSQIPVIAVSVTVG-VILLAVVIGVLLSGRRCGYSKAK
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pF1KSD SEYTDKLQHYTSGHMT-PGMKIYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDISCVKIEQVIGAGEFG
.. .. .:. .::. ::.. :::: ::::::.::.::::::. ::. ::.::::::::
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640 650 660 670 680 690
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:::::.::::::::. ::::::: :::::::::::.::::::::::::.::::::::::
NP_001 EVCSGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKSK
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700 710 720 730 740 750
pF1KSD PVMIITEFMENGSLDSFLRQNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLADMNYVHRDLAARNIL
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NP_001 PVMIVTEYMENGSLDTFLKKNDGQFTVIQLVGMLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARNIL
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pF1KSD VNSNLVCKVSDFGLSRFLEDDTSDPTYTSALGGKIPIRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYG
.::::::::::::::: :::: . .::. :::::::::::::: .:::::::::::::
NP_001 INSNLVCKVSDFGLSRVLEDDP-EAAYTTR-GGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYG
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pF1KSD IVMWEVMSYGERPYWDMTNQDVINAIEQDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKF
::::::.::::::::.:::::::.:.:. :::: :::::.::.:::::::::.:: ::::
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pF1KSD GQIVNTLDKMIRNPNSLKAMAPLSSGINLPLLDRTIPDYTSFNTVDEWLEAIKMGQYKES
.::: :::.::::.:::... : .. : ... .. .: :::::::::.: :
NP_001 DEIVNMLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEHSPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRYTEI
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940 950 960 970 980
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: . :..:.:.:.:. .::. :.::::.::::::.::.: :..:.
NP_001 FMENGYSSMDAVAQVTLEDLRRLGVTLVGHQKKIMNSLQEMKVQLVNGMVPL
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pF1KSD MALRRLGAALLLLPLLAAVEETLMDSTTATAELGW
: ::: : . : .:.:: :. ..:::
NP_872 SGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRTLLASPSNEVNLLDSRTVMGDLGW
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40 50 60 70 80 90
pF1KSD MVHPPSGWEEVSGYDENMNTIRTYQVCNVFESSQNNWLRTKFIRRRGAHRIHVEMKFSVR
.. : .::::.. :::. :.:::::.:.:..::::: :..: .:: :: .:.::..:
NP_872 IAFPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISNEGASRIFIELKFTLR
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100 110 120 130 140 150
pF1KSD DCSSIPSVPGSCKETFNLYYYEADFDSATKTFPNWMENPWVKVDTIAADESFSQVDLGGR
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NP_872 DCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESD-DQNGR---NIKENQYIKIDTIAADESFTELDLGDR
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160 170 180 190 200 210
pF1KSD VMKINTEVRSFGPVSRSGFYLAFQDYGGCMSLIAVRVFYRKCPRIIQNGAIFQETLSGAE
:::.:::::. ::.:..:::::::: :.:..:..:::.:.::: .... :.: .:..::.
NP_872 VMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHLAVFPDTITGAD
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220 230 240 250 260 270
pF1KSD STSLVAARGSCIANAEEVDVPIKLYCNGDGEWLVPIGRCMCKAGFEAVENGTVCRGCPSG
:..:. . :::. : .: : :..:...::::::::.::::::.: .::: :. : :
NP_872 SSQLLEVSGSCV-NHSVTDEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEE-KNGT-CQVCRPG
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pF1KSD TFKANQGDEACTHCPINSRTTSEGATNCVCRNGYYRADLDPLDMPCTTIPSAPQAVISSV
:::. ..: .:: .: : :..:.:::.. :.: . :: : :: ::::. .::.:
NP_872 FFKASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPSAPRNAISNV
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340 350 360 370 380 390
pF1KSD NETSLMLEWTPPRDSGGREDLVYNIICKSCGSGRGACTRCGDNVQYAPRQLGLTEPRIYI
::::..::: :: :.:::.:. : : ::.:.: :.: .:: .:.: ::: :: . ...
NP_872 NETSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQSGLKNTSVMM
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pF1KSD SDLLAHTQYTFEIQAVNGVTDQSPFSPQFASVNITTNQAAPSAVSIMHQVSRTVDSITLS
::::::.:::::.:::::.: :: . :..:::.:::::::: :. ... . . .::.::
NP_872 VDLLAHTNYTFEIEAVNGVSDLSPGARQYVSVNVTTNQAAPSPVTNVKKGKIAKNSISLS
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pF1KSD WSQPDQPNGVILDYELQYYEKELSEYNATAIKSPTNTVTVQGLKAGAIYVFQVRARTVAG
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NP_872 WQEPDRPNGIILEYEIKYFEKD-QETSYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVFQIRARTAAG
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:: .: .. :.: : . .: : ..:.: : ..: :.:.:::. ... .:: :. .:
NP_872 YGVFSRRFEFET-TPVFAASSDQSQIPVIAVSVTVG-VILLAVVIGVLLSGRRCGYSKAK
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pF1KSD SEYTDKLQHYTSGHMT-PGMKIYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDISCVKIEQVIGAGEFG
.. .. .:. .::. ::.. :::: ::::::.::.::::::. ::. ::.::::::::
NP_872 QDPEEEKMHFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDPNQAVHEFAKEIEASCITIERVIGAGEFG
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pF1KSD EVCSGHLKLPGKREIFVAIKTLKSGYTEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNVIHLEGVVTKST
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NP_872 EVCSGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKSK
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pF1KSD PVMIITEFMENGSLDSFLRQNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLADMNYVHRDLAARNIL
::::.::.:::::::.::..:::::::::::::::::.::::::.::.::::::::::::
NP_872 PVMIVTEYMENGSLDTFLKKNDGQFTVIQLVGMLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARNIL
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760 770 780 790 800 810
pF1KSD VNSNLVCKVSDFGLSRFLEDDTSDPTYTSALGGKIPIRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYG
.::::::::::::::: :::: . .::. :::::::::::::: .:::::::::::::
NP_872 INSNLVCKVSDFGLSRVLEDDP-EAAYTTR-GGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYG
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pF1KSD IVMWEVMSYGERPYWDMTNQDVINAIEQDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKF
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NP_872 IVMWEVVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPSPMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRPKF
850 860 870 880 890 900
880 890 900 910 920 930
pF1KSD GQIVNTLDKMIRNPNSLKAMAPLSSGINLPLLDRTIPDYTSFNTVDEWLEAIKMGQYKES
.::: :::.::::.:::... : .. : ... .. .: :::::::::.: :
NP_872 DEIVNMLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEHSPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRYTEI
910 920 930 940 950 960
940 950 960 970 980
pF1KSD FANAGFTSFDVVSQMMMEDILRVGVTLAGHQKKILNSIQVMRAQMNQIQSVEV
: . :..:.:.:.:. .::. :.::::.::::::.::.: :..:.
NP_872 FMENGYSSMDAVAQVTLEDLRRLGVTLVGHQKKIMNSLQEMKVQLVNGMVPL
970 980 990 1000 1010
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pF1KSD MALRRLGAALLLLPLLAAVEETLMDSTTATAELGWMVHPPSGWEEVSG
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pF1KSD YDENMNTIRTYQVCNVFESSQNNWLRTKFIRRRGAHRIHVEMKFSVRDCSSIPSVPGSCK
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NP_001 LDENYTPIRTYQVCQVMEPNQNNWLRTNWISKGNAQRIFVELKFTLRDCNSLPGVLGTCK
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pF1KSD ETFNLYYYEADFDSATKTFPNWMENPWVKVDTIAADESFSQVDLGGRVMKINTEVRSFGP
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NP_001 ETFNLYYYETDYDTGR----NIRENLYVKIDTIAADESFTQGDLGERKMKLNTEVREIGP
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pF1KSD VSRSGFYLAFQDYGGCMSLIAVRVFYRKCPRIIQNGAIFQETLSGAESTSLVAARGSCIA
.:..:::::::: :.:..:..:.:.:.:: ::.: ::: .:..:.: .::: .::.:..
NP_001 LSKKGFYLAFQDVGACIALVSVKVYYKKCWSIIENLAIFPDTVTGSEFSSLVEVRGTCVS
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD NAEE-VDVPIKLYCNGDGEWLVPIGRCMCKAGFEAVENGTVCRGCPSGTFKANQGDEACT
.::: .. ...:...::::::::.:.::::.. ..: .:. : : .:... : :.
NP_001 SAEEEAENAPRMHCSAEGEWLVPIGKCICKAGYQ--QKGDTCEPCGRGFYKSSSQDLQCS
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD HCPINSRTTSEGATNCVCRNGYYRADLDPLDMPCTTIPSAPQAVISSVNETSLMLEWTPP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]