Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDF0018
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDF0018, 1386 aa
1>>>pF1KSDF0018 1386 - 1386 aa - 1386 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4452+/-0.000935; mu= -3.5909+/- 0.056
mean_var=318.6029+/-64.713, 0's: 0 Z-trim(116.2): 106 B-trim: 181 in 2/52
Lambda= 0.071854
statistics sampled from 16673 (16782) to 16673 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.786), E-opt: 0.2 (0.516), width: 16
Scan time: 4.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33022.2 PLEKHG2 gene_id:64857|Hs108|chr19 (1386) 9503 999.6 0
CCDS76690.1 PLEKHG3 gene_id:26030|Hs108|chr14 (1219) 1173 136.0 6.2e-31
CCDS34552.1 PLEKHG1 gene_id:57480|Hs108|chr6 (1385) 1119 130.5 3.4e-29
>>CCDS33022.2 PLEKHG2 gene_id:64857|Hs108|chr19 (1386 aa)
initn: 9503 init1: 9503 opt: 9503 Z-score: 5334.8 bits: 999.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9503; 99.9% identity (99.9% similar) in 1386 aa overlap (1-1386:1-1386)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPEGAQGLSLSKPSPSLGCGRRGEVCDCGTVCETRTAPAAPTMASPRGSGSSTSLSTVGS
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CCDS33 MPEGAQGLSLSKPSPSLGCGRRGEVCDCGTVCETRTAPAAPTMASPRGSGSSTSLSTVGS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EGDPAPGPTPACSASRPEPLPGPPIRLHLSPVGIPGSARPSRLERVAREIVETERAYVRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EGDPAPGPTPACSASRPEPLPGPPIRLHLSPVGIPGSARPSRLERVAREIVETERAYVRD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LRSIVEDYLGPLLDGGVLGLSVEQVGTLFANIEDIYEFSSELLEDLENSSSAGGIAECFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LRSIVEDYLGPLLDGGVLGLSVEQVGTLFANIEDIYEFSSELLEDLENSSSAGGIAECFV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QRSEDFDIYTLYCMNYPSSLALLRELSLSPPAALWLQERQAQLRHSLPLQSFLLKPVQRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QRSEDFDIYTLYCMNYPSSLALLRELSLSPPAALWLQERQAQLRHSLPLQSFLLKPVQRI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LKYHLLLQELGKHWAEGPGTGGREMVEEAIVSMTAVAWYINDMKRKQEHAARLQEVQRRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LKYHLLLQELGKHWAEGPGTGGREMVEEAIVSMTAVAWYINDMKRKQEHAARLQEVQRRL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GGWTGPELSAFGELVLEGAFRGGGGGGPRLRGGERLLFLFSRMLLVAKRRGLEYTYKGHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GGWTGPELSAFGELVLEGAFRGGGGGGPRLRGGERLLFLFSRMLLVAKRRGLEYTYKGHI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD FCCNLSVSESPRDPLGFKVSDLTIPKHRHLLQAKNQEEKRLWIHCLQRLFFENHPASIPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FCCNLSVSESPRDPLGFKVSDLTIPKHRHLLQAKNQEEKRLWIHCLQRLFFENHPASIPA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KAKQVLLENSLHCAPKSKPVLEPLTPPLGSPRPRDARSFTPGRRNTAPSPGPSVIRRGRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KAKQVLLENSLHCAPKSKPVLEPLTPPLGSPRPRDARSFTPGRRNTAPSPGPSVIRRGRR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QSEPVKDPYVMFPQNAKPGFKHAGSEGELYPPESQPPVSGSAPPEDLEDAGPPTLDPSGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QSEPVKDPYVMFPQNAKPGFKHAGSEGELYPPESQPPVSGSAPPEDLEDAGPPTLDPSGT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SITEEILELLNQRGLRDPGPSTHDIPKFPGDSQVPGDSETLTFQALPSRDSSEEEEEEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SITEEILELLNQRGLRDPGPSTHDIPKFPGDSQVPGDSETLTFQALPSRDSSEEEEEEEE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GLEMDERGPSPLHVLEGLESSIAAEMPSIPCLTKIPDVPNLPEIPSRCEIPEGSRLPSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GLEMDERGPSPLHVLEGLESSIAAEMPSIPCLTKIPDVPNLPEIPSRCEIPEGSRLPSLS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD DISDVFEMPCLPAIPSVPNTPSLSSTPTLSCDSWLQGPLQEPAEAPATRRELFSGSNPGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DISDVFEMPCLPAIPSVPNTPSLSSTPTLSCDSWLQGPLQEPAEAPATRRELFSGSNPGK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD LGEPPSGGKAGPEEDEEGVSFTDFQPQDVTQHQGFPDELAFRSCSEIRSAWQALEQGQLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LGEPPSGGKAGPEEDEEGVSFTDFQPQDVTQHQGFPDELAFRSCSEIRSAWQALEQGQLA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD RPGFPEPLLILEDSDLGGDSGSGKAGAPSSERTASRVRELARLYSERIQQMQRAETRASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RPGFPEPLLILEDSDLGGDSGSGKAGAPSSERTASRVRELARLYSERIQQMQRAETRASA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD NAPRRRPRVLAQPQPSPCLPQEQAEPGLLPAFGHVLVCELAFPLTCAQESVPLGPAVWVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NAPRRRPRVLAQPQPSPCLPQEQAEPGLLPAFGHVLVCELAFPLTCAQESVPLGPAVWVQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD AAIPLSKQGGSPDGQGLHVSNLPKQDLPGIHVSAATLLPEQGGSRHVQAPAATPLPKQEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AAIPLSKQGGSPDGQGLHVSNLPKQDLPGIHVSAATLLPEQGGSRHVQAPAATPLPKQEG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD PLHLQVPALTTFSDQGHPEIQVPATTPLPEHKSHMVIPAPSTAFCPEQGHCADIHVPTTP
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PLHLQVPALTTFSDQGHPEIQVPATTPLPEHRSHMVIPAPSTAFCPEQGHCADIHVPTTP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD ALPKEICSDFTVSVTTPVPKQEGHLDSESPTNIPLTKQGGSRDVQGPDPVCSQPIQPLSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ALPKEICSDFTVSVTTPVPKQEGHLDSESPTNIPLTKQGGSRDVQGPDPVCSQPIQPLSW
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD HGSSLDPQGPGDTLPPLPCHLPDLQIPGTSPLPAHGSHLDHRIPANAPLSLSQELPDTQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HGSSLDPQGPGDTLPPLPCHLPDLQIPGTSPLPAHGSHLDHRIPANAPLSLSQELPDTQV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD PATTPLPLPQVLTDIWVQALPTSPKQGSLPDIQGPAAAPPLPEPSLTDTQVQKLTPSLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PATTPLPLPQVLTDIWVQALPTSPKQGSLPDIQGPAAAPPLPEPSLTDTQVQKLTPSLEQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD KSLIDAHVPAATPLPERGGSLDIQGLSPTPVQTTMVLSKPGGSLASHVARLESSDLTPPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KSLIDAHVPAATPLPERGGSLDIQGLSPTPVQTTMVLSKPGGSLASHVARLESSDLTPPH
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD SPPPSSRQLLGPNAAALSRYLAASYISQSLARRQGPGGGAPAASRGSWSSAPTSRASSPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SPPPSSRQLLGPNAAALSRYLAASYISQSLARRQGPGGGAPAASRGSWSSAPTSRASSPP
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD PQPQPPPPAARRLSYATTVNIHVGGGGRLRPAKAQVRLNHPALLASTQESMGLHRAQGAP
:::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PQPQPPPPPARRLSYATTVNIHVGGGGRLRPAKAQVRLNHPALLASTQESMGLHRAQGAP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD DAPFHM
::::::
CCDS33 DAPFHM
>>CCDS76690.1 PLEKHG3 gene_id:26030|Hs108|chr14 (1219 aa)
initn: 1146 init1: 441 opt: 1173 Z-score: 668.8 bits: 136.0 E(32554): 6.2e-31
Smith-Waterman score: 1237; 30.3% identity (53.4% similar) in 1264 aa overlap (29-1185:27-1193)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPEGAQGLSLSKPSPSLGCGRRGEVCDCGTVCETRTAPAAPTMASPRGSGSSTSLSTVGS
:. :..:.: :. . ..... :: .
CCDS76 MPVSTSLHQDGSQERPVSLTSTTSSSGSSCDSRSAMEEPSSSEAPAKNGAGSLRS---
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EGDPAPGPTPACSASRPEPLPGPPIRLHLSPVGIPGSARPSRLERVAREIVETERAYVRD
:. ..: . :: .. .. :. . : : ::.:::::::: ::.:
CCDS76 ----RHLPNSNNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAGPAHHKLSYLGRVVREIVETERMYVQD
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KSD LRSIVEDYLGPLLDGGVLGLSVEQVGTLFANIEDIYEFSSELLEDLENSSSAG-GIAECF
::::::::: ..: : :. :::..::.:::.:: ..:.::.::.. .: ..: ::
CCDS76 LRSIVEDYLLKIIDTPGL-LKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDSCNSDPVAVASCF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD VQRSEDFDIYTLYCMNYPSSLALLRELSLSPPAALWLQERQAQLRHSLPLQSFLLKPVQR
:.::..::::: :: :::.:.: : : . : ....:: :.::::: :.:::::::
CCDS76 VERSQEFDIYTQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQHSLPLGSYLLKPVQR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD ILKYHLLLQELGKHWAEGPGTGGREMVEEAIVSMTAVAWYINDMKRKQEHAARLQEVQRR
::::::::::..::. : : :.::.:: .:: ::::::::::..:::.::::.:
CCDS76 ILKYHLLLQEIAKHFDEEED--GFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKRRHEHAVRLQEIQSL
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD LGGWTGPELSAFGELVLEGAFRGGGGGGPRLRGGERLLFLFSRMLLVAKRRGLEYTYKGH
: .: ::.:...:::::::.:: :.:. :: .:::.. ::..:.:: ...:::.
CCDS76 LINWKGPDLTTYGELVLEGTFR-----VHRVRN-ERTFFLFDKTLLITKKRGDHFVYKGN
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KSD IFCCNLSVSESPRDPLGFKVSDLTIPKHRHLLQAKNQEEKRLWIHCLQRLFFENHPASIP
: : .: . :: :: : : :. :... .:::. :::: : : ..::..::: :.::
CCDS76 IPCSSLMLIESTRDSLCFTVTHYKHSKQQYSIQAKTVEEKRNWTHHIKRLILENHHATIP
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KSD AKAKQVLLENSLHCAPKSKPVLEPLTPPLGSPRPRDARSFTPGRRNTAPSP---------
:::...:: . . . . : : .: . . . . :::.. :.
CCDS76 QKAKEAILEMDSYYPNRYRCSPERLKKAWSS-QDEVSTNVRQGRRQSEPTKHLLRQLNEK
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510
pF1KSD --GPSVIRRGRRQSEPVKD---PYVMFPQNAKP--GFK------------HAGSEGELYP
. .. .:::.:: .. : : ... .:. .:::: :..
CCDS76 ARAAGMKGKGRRESESSRSSRRPSGRSPTSTEKRMSFESISSLPEVEPDPEAGSEQEVFS
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550
pF1KSD ----PESQPPVSGSAPPEDLE---DA--GPPTLDPSGTSI-------TEEILELLNQR--
: .. : . :: :: :: : .:: : . ::.. : ...
CCDS76 AVEGPSAEETPSDTESPEVLETQLDAHQGLLGMDPPGDMVDFVAAESTEDLKALSSEEEE
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590
pF1KSD ----GLRDP----GPSTHD---------IPKFPGDSQVPG-DSETLTFQA--LPSRDSSE
. ..: ::. : . .: :.: ::.. : . : ::.::
CCDS76 EMGGAAQEPESLLPPSVLDQASVIAERFVSSFSRRSSVAQEDSKSSGFGSPRLVSRSSSV
590 600 610 620 630 640
600 610 620 630 640
pF1KSD EEEE-EEEGLEMDERGPSPL--HVLEGLESSIAAEMPSIPCLTKI-PDVPNLPEIPSR--
: :.:: . . : .. .. :... . : .. . : :. : :.:
CCDS76 LSLEGSEKGLARHGSATDSLSCQLSPEVDISVGVATEDSPSVNGMEPPSPGCPVEPDRSS
650 660 670 680 690 700
650 660 670 680 690
pF1KSD CEIPEGS-----RLPSLSDISDVFE-MPCLPAIPSVPNTPSLSSTP------TLSCDSWL
:. :.. :: :. :.. .: : :: ::: : ..: . :
CCDS76 CKKKESALSTRDRL-LLDKIKSYYENAEHHDAGFSVRRRESLSYIPKGLVRNSISRFNSL
710 720 730 740 750 760
700 710 720 730 740 750
pF1KSD QGPLQEPAEAPATRRELFSGSNPGK--LGEPPSGGKAGPEEDEEGVSFTDFQPQDVTQHQ
: ::. ...:.. :: : . : : : :: . .: .: ... .
CCDS76 PRPDPEPVPPVGSKRQV--GSRPTSWALFELP-----GPSQAVKG------DPPPISDAE
770 780 790 800
760 770 780 790 800
pF1KSD GFPDELAFRSCSEIRSAWQALEQ---------GQLARPGFP--EPLLILEDSDLGGDSGS
:: ::: . :...:. :: :: :::.:::. .::. .
CCDS76 -------FRPSSEIVKIWEGMESSGGSPGKGPGQGQANGFDLHEPLFILEEHELGAITEE
810 820 830 840 850 860
810 820 830 840 850 860
pF1KSD GKAGAP-SSERTASRV-RELARLYSERIQQMQRAETRASANAPRRRPRVLAQPQPSPCLP
. ...: :: : .: .::: .: ..... . :.. :: . ::.. : : .
CCDS76 SATASPESSSPTEGRSPAHLARELKELVKELS-SSTQGELVAPLH-PRIV---QLSHVMD
870 880 890 900 910
870 880 890 900 910 920
pF1KSD QEQAEPGLLPAFGHVLVCELAFPLTCAQESVPLGPAVWVQAAIPLSKQGGSPDGQGLHVS
.. .: . . :. . .. . . . : : ..: : ..: :: :.
CCDS76 SHVSE--RVKNKVYQLARQYSLRIKSNKPVMARPPLQWEKVA-P-ERDGKSPTVPCLQEE
920 930 940 950 960 970
930 940 950 960 970 980
pF1KSD NLPKQDLPGIHVSAATLLPEQGGSRHVQAPAATPLPKQEGPLHLQVPALTTFSDQGHPEI
: . . .:. . . ..: : :.. : . : :. .. .
CCDS76 AGEPLGGKGKRKPVLSLFDYEQLMAQEHSP---PKPSSAGEMS---PQRFFFNPSA---V
980 990 1000 1010 1020
990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD QVPATTP--LPEHKSHMVIPAPSTAFCPEQGHCADIHVPTTPALPKEICSDFTVSVTTPV
. .:.: : .: . .:. .: . : . .:.:: .. .
CCDS76 SQRTTSPGGRPSARSPL---SPTETF-------------SWPDV-RELCSKYA---SRDE
1030 1040 1050 1060
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD PKQEGHLDSESPTNIPLTKQGGSRDVQGPDPVCSQPIQPLSWHGSSLDPQ---GPGDTLP
.. : . : . :... :..: :. . :.. . ::. . : :..
CCDS76 ARRAG---GGRPRGPPVNR---SHSV--PENMVEPPLSGRVGRCRSLSTKRGRGGGEAA-
1070 1080 1090 1100 1110
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD PLPCHLPDLQIPGTSPLPAHGSHLDHRIPANAPLSLSQELPDTQVPATTPLPLPQVLTDI
: :: ::: . . ..: :.: .. . : ::: : . .
CCDS76 ---------QSPG--PLPQSKPDGGETLYVTADLTL-EDNRRVIVMEKGPLPSPTAGLEE
1120 1130 1140 1150 1160
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KSD WVQALPTSPKQ--GSLPDIQGPAAAPPLPEPSLTDTQVQKLTPSLEQKSLIDAHVPAATP
:.:: :.. :.: : : : :
CCDS76 SSGQGPSSPVALLGQVQDFQQSAECQPKEEGSRDPADPSQQGRVRNLREKFQALNSVG
1170 1180 1190 1200 1210
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KSD LPERGGSLDIQGLSPTPVQTTMVLSKPGGSLASHVARLESSDLTPPHSPPPSSRQLLGPN
>>CCDS34552.1 PLEKHG1 gene_id:57480|Hs108|chr6 (1385 aa)
initn: 1117 init1: 318 opt: 1119 Z-score: 637.7 bits: 130.5 E(32554): 3.4e-29
Smith-Waterman score: 1188; 33.3% identity (59.1% similar) in 872 aa overlap (63-887:71-898)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD ETRTAPAAPTMASPRGSGSSTSLSTVGSEGDPAPGPTPACSASRPEPLPGPPIRLHLSPV
.:: : : .:. : . . .:
CCDS34 GLFNQDKEVGAIKLELIPARPFSSSELQRDNPATGQQNADEGSERPPRAQWRVDSNGAPK
50 60 70 80 90 100
100 110 120 130 140
pF1KSD GIPGSARPSRL---ERVAREIVETERAYVRDLRSIVEDYLGPLLDGGVLGLSVEQVGTLF
: :: .: .::..::.::::.::.::.::::::: . : : :..:. ..::
CCDS34 TIADSATSPKLLYVDRVVQEILETERTYVQDLKSIVEDYLDCIRDQTKLPLGTEERSALF
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KSD ANIEDIYEFSSELLEDLENSSSAG-GIAECFVQRSEDFDIYTLYCMNYPSSLALLRELSL
.::.:::.:.::::.:::: . .::::::..::.: ::: :: ::: :.:.: :
CCDS34 GNIQDIYHFNSELLQDLENCENDPVAIAECFVSKSEEFHIYTQYCTNYPRSVAVLTECMR
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KSD SPPAALWLQERQAQLRHSLPLQSFLLKPVQRILKYHLLLQELGKHWAEGPGTGGREMVEE
. : ...::: :.::::: :.:::::::::::::::.:. .: . : : ..: .
CCDS34 NKILAKFFRERQETLKHSLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLHEIENHLDKD--TEGYDVVLD
230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KSD AIVSMTAVAWYINDMKRKQEHAARLQEVQRRLGGWTGPELSAFGELVLEGAFRGGGGGGP
:: .: :::.:::::::.:::.::::.: : .: ::.:...:::::::.::
CCDS34 AIDTMQRVAWHINDMKRKHEHAVRLQEIQSLLTNWKGPDLTSYGELVLEGTFRI-----Q
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KSD RLRGGERLLFLFSRMLLVAKRRGLEYTYKGHIFCCNLSVSES-PRDPLGFKVSDLTIPKH
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CCDS34 RAKN-ERTLFLFDKLLLITKKRDDTFTYKAHILCGNLMLVEVIPKEPLSFSVFHYKNPKL
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:
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