FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDF0070, 1302 aa
1>>>pF1KSDF0070 1302 - 1302 aa - 1302 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7596+/-0.000972; mu= 4.4020+/- 0.059
mean_var=301.8013+/-58.586, 0's: 0 Z-trim(115.6): 156 B-trim: 6 in 1/53
Lambda= 0.073827
statistics sampled from 16005 (16166) to 16005 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.787), E-opt: 0.2 (0.497), width: 16
Scan time: 6.320
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44647.1 LTBP3 gene_id:4054|Hs108|chr11 (1303) 9814 1059.9 0
CCDS8103.1 LTBP3 gene_id:4054|Hs108|chr11 (1256) 8124 879.9 0
CCDS54345.1 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1342) 1978 225.3 8.6e-58
CCDS74370.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19 (1557) 1457 169.9 4.8e-41
CCDS74368.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19 (1587) 1457 169.9 4.9e-41
CCDS74369.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19 (1624) 1457 169.9 5e-41
CCDS54344.1 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1353) 1235 146.2 5.7e-34
CCDS33178.2 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1395) 1133 135.3 1.1e-30
CCDS33177.2 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1721) 1133 135.4 1.3e-30
CCDS34222.1 FBN2 gene_id:2201|Hs108|chr5 (2912) 1049 126.7 9.2e-28
CCDS9831.1 LTBP2 gene_id:4053|Hs108|chr14 (1821) 1036 125.1 1.7e-27
CCDS12196.1 FBN3 gene_id:84467|Hs108|chr19 (2809) 961 117.3 5.9e-25
CCDS46761.1 FBLN2 gene_id:2199|Hs108|chr3 (1231) 812 101.1 2e-20
CCDS46762.1 FBLN2 gene_id:2199|Hs108|chr3 (1184) 796 99.4 6.2e-20
CCDS32232.1 FBN1 gene_id:2200|Hs108|chr15 (2871) 777 97.7 4.8e-19
CCDS14048.1 SCUBE1 gene_id:80274|Hs108|chr22 ( 988) 728 92.0 8.2e-18
CCDS4800.1 SCUBE3 gene_id:222663|Hs108|chr6 ( 993) 710 90.1 3.1e-17
CCDS41237.1 MEGF6 gene_id:1953|Hs108|chr1 (1541) 687 87.9 2.3e-16
CCDS8116.1 EFEMP2 gene_id:30008|Hs108|chr11 ( 443) 665 85.0 4.8e-16
CCDS1857.1 EFEMP1 gene_id:2202|Hs108|chr2 ( 493) 652 83.7 1.4e-15
CCDS908.1 NOTCH2 gene_id:4853|Hs108|chr1 (2471) 664 85.6 1.8e-15
CCDS30956.1 HMCN1 gene_id:83872|Hs108|chr1 (5635) 654 84.9 6.8e-15
CCDS55265.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 ( 937) 631 81.7 1e-14
CCDS55264.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 ( 956) 631 81.7 1e-14
CCDS83309.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 ( 915) 630 81.6 1.1e-14
CCDS9898.1 FBLN5 gene_id:10516|Hs108|chr14 ( 448) 589 76.9 1.3e-13
CCDS14069.1 FBLN1 gene_id:2192|Hs108|chr22 ( 683) 560 74.0 1.5e-12
CCDS43028.1 FBLN1 gene_id:2192|Hs108|chr22 ( 566) 549 72.7 3e-12
CCDS14068.1 FBLN1 gene_id:2192|Hs108|chr22 ( 601) 549 72.8 3.2e-12
CCDS14067.1 FBLN1 gene_id:2192|Hs108|chr22 ( 703) 549 72.8 3.5e-12
CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19 (2321) 560 74.5 3.7e-12
CCDS13149.1 CD93 gene_id:22918|Hs108|chr20 ( 652) 537 71.5 8.1e-12
CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9 (2555) 536 72.0 2.3e-11
>>CCDS44647.1 LTBP3 gene_id:4054|Hs108|chr11 (1303 aa)
initn: 9658 init1: 9658 opt: 9814 Z-score: 5661.8 bits: 1059.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9814; 99.9% identity (99.9% similar) in 1303 aa overlap (1-1302:1-1303)
10 20 30 40 50
pF1KSD MPGPRGAAGGLAPEMRGAGAAGLLALLLLLLLLL-GLGGRVEGGPAGERGAGGGGALARE
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CCDS44 MPGPRGAAGGLAPEMRGAGAAGLLALLLLLLLLLLGLGGRVEGGPAGERGAGGGGALARE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD RFKVVFAPVICKRTCLKGQCRDSCQQGSNMTLIGENGHSTDTLTGSGFRVVVCPLPCMNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RFKVVFAPVICKRTCLKGQCRDSCQQGSNMTLIGENGHSTDTLTGSGFRVVVCPLPCMNG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD GQCSSRNQCLCPPDFTGRFCQVPAGGAGGGTGGSGPGLSRTGALSTGALPPLAPEGDSVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GQCSSRNQCLCPPDFTGRFCQVPAGGAGGGTGGSGPGLSRTGALSTGALPPLAPEGDSVA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD SKHAIYAVQVIADPPGPGEGPPAQHAAFLVPLGPGQISAEVQAPPPVVNVRVHHPPEASV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SKHAIYAVQVIADPPGPGEGPPAQHAAFLVPLGPGQISAEVQAPPPVVNVRVHHPPEASV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD QVHRIESSNAESAAPSQHLLPHPKPSHPRPPTQKPLGRCFQDTLPKQPCGSNPLPGLTKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QVHRIESSNAESAAPSQHLLPHPKPSHPRPPTQKPLGRCFQDTLPKQPCGSNPLPGLTKQ
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD EDCCGSIGTAWGQSKCHKCPQLQYTGVQKPGPVRGEVGADCPQGYKRLNSTHCQDINECA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EDCCGSIGTAWGQSKCHKCPQLQYTGVQKPGPVRGEVGADCPQGYKRLNSTHCQDINECA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD MPGVCRHGDCLNNPGSYRCVCPPGHSLGPSRTQCIADKPEEKSLCFRLVSPEHQCQHPLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MPGVCRHGDCLNNPGSYRCVCPPGHSLGPSRTQCIADKPEEKSLCFRLVSPEHQCQHPLT
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD TRLTRQLCCCSVGKAWGARCQRCPTDGTAAFKEICPAGKGYHILTSHQTLTIQGESDFSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TRLTRQLCCCSVGKAWGARCQRCPTDGTAAFKEICPAGKGYHILTSHQTLTIQGESDFSL
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD FLHPDGPPKPQQLPESPSQAPPPEDTEEERGVTTDSPVSEERSVQQSHPTATTTPARPYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FLHPDGPPKPQQLPESPSQAPPPEDTEEERGVTTDSPVSEERSVQQSHPTATTTPARPYP
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD ELISRPSPPTMRWFLPDLPPSRSAVEIAPTQVTETDECRLNQNICGHGECVPGPPDYSCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ELISRPSPPTMRWFLPDLPPSRSAVEIAPTQVTETDECRLNQNICGHGECVPGPPDYSCH
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD CNPGYRSHPQHRYCVDVNECEAEPCGPGRGICMNTGGSYNCHCNRGYRLHVGAGGRSCVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CNPGYRSHPQHRYCVDVNECEAEPCGPGRGICMNTGGSYNCHCNRGYRLHVGAGGRSCVD
610 620 630 640 650 660
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pF1KSD LNECAKPHLCGDGGFCINFPGHYKCNCYPGYRLKASRPPVCEDIDECRDPSSCPDGKCEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LNECAKPHLCGDGGFCINFPGHYKCNCYPGYRLKASRPPVCEDIDECRDPSSCPDGKCEN
670 680 690 700 710 720
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pF1KSD KPGSFKCIACQPGYRSQGGGACRDVNECAEGSPCSPGWCENLPGSFRCTCAQGYAPAPDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KPGSFKCIACQPGYRSQGGGACRDVNECAEGSPCSPGWCENLPGSFRCTCAQGYAPAPDG
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780 790 800 810 820 830
pF1KSD RSCLDVDECEAGDVCDNGICSNTPGSFQCQCLSGYHLSRDRSHCEDIDECDFPAACIGGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RSCLDVDECEAGDVCDNGICSNTPGSFQCQCLSGYHLSRDRSHCEDIDECDFPAACIGGD
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KSD CINTNGSYRCLCPQGHRLVGGRKCQDIDECSQDPSLCLPHGACKNLQGSYVCVCDEGFTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CINTNGSYRCLCPQGHRLVGGRKCQDIDECSQDPSLCLPHGACKNLQGSYVCVCDEGFTP
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900 910 920 930 940 950
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CCDS44 TQDQHGCEEVEQPHHKKECYLNFDDTVFCDSVLATNVTQQECCCSLGAGWGDHCEIYPCP
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960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD VYSSAEFHSLCPDGKGYTQDNNIVNYGIPAHRDIDECMLFGSEICKEGKCVNTQPGYECY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VYSSAEFHSLCPDGKGYTQDNNIVNYGIPAHRDIDECMLFGSEICKEGKCVNTQPGYECY
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD CKQGFYYDGNLLECVDVDECLDESNCRNGVCENTRGGYRCACTPPAEYSPAQRQCLSPEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CKQGFYYDGNLLECVDVDECLDESNCRNGVCENTRGGYRCACTPPAEYSPAQRQCLSPEE
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1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD MDVDECQDPAACRPGRCVNLPGSYRCECRPPWVPGPSGRDCQLPESPAERAPERRDVCWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDVDECQDPAACRPGRCVNLPGSYRCECRPPWVPGPSGRDCQLPESPAERAPERRDVCWS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD QRGEDGMCAGPLAGPALTFDDCCCRQGRGWGAQCRPCPPRGAGSHCPTSQSESNSFWDTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QRGEDGMCAGPLAGPALTFDDCCCRQGRGWGAQCRPCPPRGAGSHCPTSQSESNSFWDTS
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1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD PLLLGKPPRDEDSSEEDSDECRCVSGRCVPRPGGAVCECPGGFQLDASRARCVDIDECRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PLLLGKPPRDEDSSEEDSDECRCVSGRCVPRPGGAVCECPGGFQLDASRARCVDIDECRE
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1260 1270 1280 1290 1300
pF1KSD LNQRGLLCKSERCVNTSGSFRCVCKAGFARSRPHGACVPQRRR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LNQRGLLCKSERCVNTSGSFRCVCKAGFARSRPHGACVPQRRR
1270 1280 1290 1300
>>CCDS8103.1 LTBP3 gene_id:4054|Hs108|chr11 (1256 aa)
initn: 7935 init1: 7935 opt: 8124 Z-score: 4689.2 bits: 879.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9326; 96.3% identity (96.3% similar) in 1303 aa overlap (1-1302:1-1256)
10 20 30 40 50
pF1KSD MPGPRGAAGGLAPEMRGAGAAGLLALLLLLLLLL-GLGGRVEGGPAGERGAGGGGALARE
:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MPGPRGAAGGLAPEMRGAGAAGLLALLLLLLLLLLGLGGRVEGGPAGERGAGGGGALARE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD RFKVVFAPVICKRTCLKGQCRDSCQQGSNMTLIGENGHSTDTLTGSGFRVVVCPLPCMNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RFKVVFAPVICKRTCLKGQCRDSCQQGSNMTLIGENGHSTDTLTGSGFRVVVCPLPCMNG
70 80 90 100 110 120
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pF1KSD GQCSSRNQCLCPPDFTGRFCQVPAGGAGGGTGGSGPGLSRTGALSTGALPPLAPEGDSVA
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CCDS81 GQCSSRNQCLCPPDFTGRFCQVPAGGAGGGTGGSGPGLSRTGALSTGALPPLAPEGDSVA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SKHAIYAVQVIADPPGPGEGPPAQHAAFLVPLGPGQISAEVQAPPPVVNVRVHHPPEASV
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240 250 260 270 280 290
pF1KSD QVHRIESSNAESAAPSQHLLPHPKPSHPRPPTQKPLGRCFQDTLPKQPCGSNPLPGLTKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QVHRIESSNAESAAPSQHLLPHPKPSHPRPPTQKPLGRCFQDTLPKQPCGSNPLPGLTKQ
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pF1KSD EDCCGSIGTAWGQSKCHKCPQLQYTGVQKPGPVRGEVGADCPQGYKRLNSTHCQDINECA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EDCCGSIGTAWGQSKCHKCPQLQYTGVQKPGPVRGEVGADCPQGYKRLNSTHCQDINECA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD MPGVCRHGDCLNNPGSYRCVCPPGHSLGPSRTQCIADKPEEKSLCFRLVSPEHQCQHPLT
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CCDS81 MPGVCRHGDCLNNPGSYRCVCPPGHSLGPSRTQCIADKPEEKSLCFRLVSPEHQCQHPLT
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CCDS81 TRLTRQLCCCSVGKAWGARCQRCPTDGTAAFKEICPAGKGYHILTSHQTLTIQGESDFSL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 FLHPDGPPKPQQLPESPSQAPPPEDTEEERGVTTDSPVSEERSVQQSHPTATTTPARPYP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ELISRPSPPTMRWFLPDLPPSRSAVEIAPTQVTETDECRLNQNICGHGECVPGPPDYSCH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 CNPGYRSHPQHRYCVDVNECEAEPCGPGRGICMNTGGSYNCHCNRGYRLHVGAGGRSCVD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LNECAKPHLCGDGGFCINFPGHYKCNCYPGYRLKASRPPVCEDIDECRDPSSCPDGKCEN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KPGSFKCIACQPGYRSQGGGACRDVNECAEGSPCSPGWCENLPGSFRCTCAQGYAPAPDG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RSCLDVDECEAGDVCDNGICSNTPGSFQCQCLSGYHLSRDRSHCEDIDECDFPAACIGGD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 CINTNGSYRCLCPQGHRLVGGRKCQDIDECSQDPSLCLPHGACKNLQGSYVCVCDEGFTP
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900 910 920 930 940 950
pF1KSD TQDQHGCEEVEQPHHKKECYLNFDDTVFCDSVLATNVTQQECCCSLGAGWGDHCEIYPCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TQDQHGCEEVEQPHHKKECYLNFDDTVFCDSVLATNVTQQECCCSLGAGWGDHCEIYPCP
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD VYSSAEFHSLCPDGKGYTQDNNIVNYGIPAHRDIDECMLFGSEICKEGKCVNTQPGYECY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VYSSAEFHSLCPDGKGYTQDNNIVNYGIPAHRDIDECMLFGSEICKEGKCVNTQPGYECY
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD CKQGFYYDGNLLECVDVDECLDESNCRNGVCENTRGGYRCACTPPAEYSPAQRQCLSPEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 CKQGFYYDGNLLECVDVDECLDESNCRNGVCENTRGGYRCACTPPAEYSPAQRQCLSPEE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD MDVDECQDPAACRPGRCVNLPGSYRCECRPPWVPGPSGRDCQLPESPAERAPERRDVCWS
: ::::::::::::
CCDS81 M-----------------------------------------------ERAPERRDVCWS
1090
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pF1KSD QRGEDGMCAGPLAGPALTFDDCCCRQGRGWGAQCRPCPPRGAGSHCPTSQSESNSFWDTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QRGEDGMCAGPLAGPALTFDDCCCRQGRGWGAQCRPCPPRGAGSHCPTSQSESNSFWDTS
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD PLLLGKPPRDEDSSEEDSDECRCVSGRCVPRPGGAVCECPGGFQLDASRARCVDIDECRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PLLLGKPPRDEDSSEEDSDECRCVSGRCVPRPGGAVCECPGGFQLDASRARCVDIDECRE
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1260 1270 1280 1290 1300
pF1KSD LNQRGLLCKSERCVNTSGSFRCVCKAGFARSRPHGACVPQRRR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LNQRGLLCKSERCVNTSGSFRCVCKAGFARSRPHGACVPQRRR
1220 1230 1240 1250
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30 40 50 60 70 80
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:.::::.: ::: :: ::.:..::..:..
CCDS54 MDTKLMCLLFFFSLPPLLVSNHTGRIKVVFTPSICKVTCTKGSCQNSCEKGNTT
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90 100 110 120 130 140
pF1KSD TLIGENGHSTDTLTGSGFRVVVCPLPCMNGGQCSSRNQCLCPPDFTGRFCQVPAGGAGGG
:::.::::..::::...::::.: ::::::::::::..: :::.:::..::.:. ::
CCDS54 TLISENGHAADTLTATNFRVVICHLPCMNGGQCSSRDKCQCPPNFTGKLCQIPVHGA---
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KSD TGGSGPGLSRTGALSTGALPPLAPEGDSVASKHAIYAVQVIADPPGPGEGPPAQHAAFLV
..: : .: .. :: . : . :.. .
CCDS54 -----------------SVPKLY--------QH--------SQQPGKALGTHVIHSTHTL
120 130
210 220 230 240 250
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:: .: ...:. :: .::..:.::::::::.: ::.. .... : :.:
CCDS54 PLTVTSQQGVKVKFPPNIVNIHVKHPPEASVQIHQVSRIDGPTGQKTKEAQPGQSQVSYQ
140 150 160 170 180 190
260 270 280 290 300
pF1KSD -LP-------HPKPSHPR------PPTQKP-LGRCFQDTLPKQPCGSNPLPGLTKQEDCC
:: : :: . : . : ::::::.:. .: ::. ::::.::::::
CCDS54 GLPVQKTQTIHSTYSHQQVIPHVYPVAAKTQLGRCFQETIGSQ-CGKA-LPGLSKQEDCC
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GSIGTAWGQSKCHKCPQLQYTGVQKPGPVRGEVGADCPQGYKRLNSTHCQDINECAMPGV
:..::.:: .::.:::. ::. . .: ::::.:.: ::::::: . ::
CCDS54 GTVGTSWGFNKCQKCPK-------KPSYHGYNQMMECLPGYKRVNNTFCQDINECQLQGV
260 270 280 290 300
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pF1KSD CRHGDCLNNPGSYRCVCPPGHSLGPSRTQCIADKP---EEKSLCFRLVSPEHQCQHPLTT
: .:.:::. :::::.: : . :. ..:. : : :::. :.:::: .::.:::..
CCDS54 CPNGECLNTMGSYRCTCKIGFGPDPTFSSCVPDPPVISEEKGPCYRLVSSGRQCMHPLSV
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RLTRQLCCCSVGKAWGARCQRCPTDGTAAFKEICPAGKGYHILTSHQTLTIQGESDFSLF
.::.:::::::::::: .:..:: ::: . . ..::.. :
CCDS54 HLTKQLCCCSVGKAWGPHCEKCPLPGTAKEEPV-------------EALTFSRE------
370 380 390 400 410
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pF1KSD LHPDGPPKPQQLPESPSQAPPPEDTEEERGVTTDSPVSEERSVQQSHPTATTTPARP-YP
: : .:. : . : : :. . . .: : : .: .: .:
CCDS54 -HGPGVAEPEVATAPPEKEIPSLDQEKTK-LEPGQP--------QLSPGISTIHLHPQFP
420 430 440 450 460
540 550 560 570 580 590
pF1KSD ELISRPSPPTMRWFLPDLPPSRSAVEIAPTQVTETDECRLNQNICGHGECVPGPPDYSCH
.: . :::. :. : .. :::::::: .:: .: .::: :.:. : :.:
CCDS54 VVIEKTSPPVPVEVAPEASTSSASQVIAPTQVTEINECTVNPDICGAGHCINLPVRYTCI
470 480 490 500 510 520
600 610 620 630 640 650
pF1KSD CNPGYRSHPQHRYCVDVNECEAEP--CGPGRGICMNTGGSYNCHCNRGYRLHVGAGGRSC
: ::: :.: :::..:: :. :: : :: ::. : : :. .. : .:
CCDS54 CYEGYRFSEQQRKCVDIDECTQVQHLCSQGR--CENTEGSFLCICPAGF--MASEEGTNC
530 540 550 560 570
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pF1KSD VDLNECAKPHLCGDGGFCINFPGHYKCN-CYPGYRLKASRPPVCEDIDECRDPSSCPDGK
.:..:: .: .::.: :.: : ..:. : :::. .. ::::::: .::.::: .
CCDS54 IDVDECLRPDVCGEG-HCVNTVGAFRCEYCDSGYRM--TQRGRCEDIDECLNPSTCPDEQ
580 590 600 610 620 630
720 730 740 750 760 770
pF1KSD CENKPGSFKCIACQPGYRSQGGGACRDVNECAEGSPCSPGWCENLPGSFRCTCAQGYAPA
: :.:::..:. : :.:. .: : ::.:: : . :. : : :: ::. :.: .::. .
CCDS54 CVNSPGSYQCVPCTEGFRGWNG-QCLDVDECLEPNVCANGDCSNLEGSYMCSCHKGYTRT
640 650 660 670 680 690
780 790 800 810 820 830
pF1KSD PDGRSCLDVDECEAGDVCDNGICSNTPGSFQCQCLSGYHLSRDRSHCEDIDECD------
:: . : :.:::. :..: :: :.:: :::.: : .::.:: ...:::::::.
CCDS54 PDHKHCRDIDECQQGNLCVNGQCKNTEGSFRCTCGQGYQLSAAKDQCEDIDECQHRHLCA
700 710 720 730 740 750
840 850
pF1KSD ----------FPAAC--------IG------------------GDCINTNGSYRCLCPQG
: .: .: :::::: ::: : ::.:
CCDS54 HGQCRNTEGSFQCVCDQGYRASGLGDHCEDINECLEDKSVCQRGDCINTAGSYDCTCPDG
760 770 780 790 800 810
860 870 880 890 900
pF1KSD HRLVGGRKCQDIDECSQDPSLCLPHGACKNLQGSYVCVCDEGFTPTQD------------
.: .. ::::.:: . :.:: :.: : : .::. :::..::. . :
CCDS54 FQLDDNKTCQDINEC-EHPGLCGPQGECLNTEGSFHCVCQQGFSISADGRTCEDIDECVN
820 830 840 850 860 870
910
pF1KSD -----QHG-------------------------------------------CEEVE----
.:: ::.::
CCDS54 NTVCDSHGFCDNTAGSFRCLCYQGFQAPQDGQGCVDVNECELLSGVCGEAFCENVEGSFL
880 890 900 910 920 930
920 930
pF1KSD ------------------------------QPHH-KKECYLNFDDTVFCDSVLATNVTQQ
::.. ::::: :..:. .::.::: :::.:
CCDS54 CVCADENQEYSPMTGQCRSRTSTDLDVDVDQPKEEKKECYYNLNDASLCDNVLAPNVTKQ
940 950 960 970 980 990
940 950 960 970 980 990
pF1KSD ECCCSLGAGWGDHCEIYPCPVYSSAEFHSLCPDGKGYTQ-DNNIVNYGIPAHRDIDECML
::::. :.::::.:::.:::: ..::: .:: :::.. .. . : ..: :::.:
CCDS54 ECCCTSGVGWGDNCEIFPCPVLGTAEFTEMCPKGKGFVPAGESSSEAGGENYKDADECLL
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD FGSEICKEGKCVNTQPGYECYCKQGFYYDGNLLECVDVDECLDESNCRNGVCENTRGGYR
::.::::.: :.::.:::::::::: ::: :.: :.::: : :.: .: : ::.:.:
CCDS54 FGQEICKNGFCLNTRPGYECYCKQGTYYDPVKLQCFDMDECQDPSSCIDGQCVNTEGSYN
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD CACTPPAEYSPAQRQCLSPEEMDVDECQDPAACRPGRCVNLPGSYRCECRPPWVPGPSGR
: :: : . ....:. : :
CCDS54 CFCTHPMVLDASEKRCIRPAE--------------------------------------S
1120 1130
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD DCQLPESPAERAPERRDVCWSQRGEDGMCAGPLAGPALTFDDCCCRQGRGWGAQCRPCPP
. :. :. . .:.:: . ... .:. ::.: :. .::: :..:: :: ::
CCDS54 NEQIEETDV-----YQDLCWEHLSDEYVCSRPLVGKQTTYTECCCLYGEAWGMQCALCPL
1140 1150 1160 1170 1180
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KSD RGAGSH---C--PTSQSES----NSFWDTSPLLLGK--PPRDED----SSEE-DSDECR-
. . .. : :.. .. ... : : . : .: : :: ...::
CCDS54 KDSDDYAQLCNIPVTGRRQPYGRDALVDFSEQYTPEADPYFIQDRFLNSFEELQAEECGI
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1230 1240 1250 1260 1270
pF1KSD ---CVSGRCVPRPGGAVCECPGGFQLDASRARCVDIDECRELNQRGLLCKSERCVNTSGS
: .:::: : .:.: :..::... :::..:: :::
CCDS54 LNGCENGRCVRVQEGYTCDCFDGYHLDTAKMTCVDVNECDELNNRMSLCKNAKCINTDGS
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1280 1290 1300
pF1KSD FRCVCKAGFARSRPHGACVPQRRR
CCDS54 YKCLCLPGYVPSDKPNYCTPLNTALNLEKDSDLE
1310 1320 1330 1340
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10 20 30 40 50 60
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CCDS74 MAGGVRLLWVSLLVLL-------AQLGP--QPGLGRLG----ER
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pF1KSD FKVVFAPVICKRTCLKG----QCRDSCQQGSNMTLIGENGHSTDTLTGSGFRVVVCPLPC
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CCDS74 LRVRFTPVVCGLRCVHGPTGSRCTPTCAP-RNATSVDSGAPGGAAPGGPGFRAFLCPLIC
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KSD MNGGQCSSRNQCLCPPDFTGRFCQVPAGGAGGGTGGSGPGLSRTGALSTGALPPLAPEGD
::: : . ..:::::::.:.:::. ..:: . . :::.: :. ..: :: . :
CCDS74 HNGGVCVKPDRCLCPPDFAGKFCQLHSSGARP-PAPAVPGLTR----SVYTMP-LANHRD
100 110 120 130 140
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pF1KSD SVASKHAIYAVQVIADPPGPGEGPPAQHAAFLVPLGPGQISAEVQAPPPVVNVRVHHPPE
. .:.. : .: . : :. . : . : :: . :...:
CCDS74 D---EHGV-ASMVSVHVEHPQEASVVVHQVERVS-GPWE-EADAEA--------------
150 160 170 180
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pF1KSD ASVQVHRIESSN-AESAAPSQHLLPHPKPSHPRPPTQKPLGRCFQDTLPKQPCGSNPLPG
: : :.. ::.::: .: . : . . .: ::.. : :.: ::::
CCDS74 ----VARAEAAARAEAAAP-YTVLAQSAPREDGYSDASGFGYCFRE-LRGGECAS-PLPG
190 200 210 220 230
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pF1KSD LTKQEDCCGSIGTAWGQSKCHKCPQLQYTGVQKPGPVRGEVGADCPQGYKRLNSTHCQDI
: :: :: . : ::: :. : . .. . .: . :: :..:.:.. :.:.
CCDS74 LRTQEVCCRGAGLAWGVHDCQLCSERLGNSERVSAP-----DGPCPTGFERVNGS-CEDV
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD NECAMPGVCRHGDCLNNPGSYRCVCPPGHSLGPSRTQCIADK--PEEKSLCFRLVSPEHQ
.::: : :.::.: :. :.: :::: : : ::..::... : :. :::.. .
CCDS74 DECATGGRCQHGECANTRGGYTCVCPDGFLLDSSRSSCISQHVISEAKGPCFRVLR-DGG
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD CQHPLTTRLTRQLCCCS-VGKAWGARCQRCPTDGTAAFKEICPAGKGYHILTSHQTLTIQ
:. :. .:.:.:::: :::::: :: :: :. .:.:::::: :::
CCDS74 CSLPILRNITKQICCCSRVGKAWGRGCQLCPPFGSEGFREICPAGPGYHY----------
360 370 380 390 400
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pF1KSD GESDFSLFLHPDG--PPK-----PQQLPES--PSQA--------PPPEDTEEER-GVTTD
. ::. .: : ::. :. :: . :: . : :: . : :
CCDS74 SASDLRYNTRPLGQEPPRVSLSQPRTLPATSRPSAGFLPTHRLEPRPEPRPDPRPGPELP
410 420 430 440 450 460
520 530 540 550 560
pF1KSD SPVSEERS---VQQSHPTATTTPARPY---P-ELISRPSPPTMRWFLPDLPPSRSAVEIA
: . . .: :.. : : . ::::: : :. ...
CCDS74 LPSIPAWTGPEIPESGPSSGMCQRNPQVCGPGRCISRPSGYTC--------ACDSGFRLS
470 480 490 500 510
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pF1KSD P--TQVTETDECRLNQNICGHGECVPGPPDYSCHCNPGYRSHPQHRYCVDVNECE--AEP
: :. ..:::: :. :.: .: .. : :.::.:. :. :.::.::. :
CCDS74 PQGTRCIDVDECRRVPPPCAPGRCENSPGSFRCVCGPGFRAGPRAAECLDVDECHRVPPP
520 530 540 550 560 570
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pF1KSD CGPGRGICMNTGGSYNCHCNRGYRLHVGAGGRSCVDLNECAK-PHLCGDGGFCINFPGHY
: :: : :: ::. : : :: ... : :: :..::.. : ::: :. : :.:: .
CCDS74 CDLGR--CENTPGSFLCVCPAGY--QAAPHGASCQDVDECTQSPGLCGRGA-CKNLPGSF
580 590 600 610 620
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pF1KSD KCNCYPGYRLKASRPPVCE-DIDEC-RDPSSCPDGKCENKPGSFKCIACQPGYRSQGGGA
.: : :.: .: :: :.::: ..: : :.:.: :::.: :: :.::.: ::
CCDS74 RCVCPAGFRGSA-----CEEDVDECAQEPPPCGPGRCDNTAGSFHC-ACPAGFRSRGPGA
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:.::.:::.. : :. : ::: :::.:.: .:. : : : :::::: .: .
CCDS74 PCQDVDECARSPPPCTYGRCENTEGSFQCVCPMGFQPNTAGSECEDVDECENHLACPGQE
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: :.::::::. : ::.:: : : : :.:::. : : : : ::.::.:: : :.
CCDS74 CVNSPGSFQCRTCPSGHHLHRGR--CTDVDECSSGAPPCGPHGHCTNTEGSFRCSCAPGY
750 760 770 780 790
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: .:: : :..:: . ..:.::: : : .::..:.: :. : .: .:.
CCDS74 RAPSGRPGPCADVNEC-LEGDFCFPHGECLNTDGSFACTCAPGYRPGPRGASCLDVD---
800 810 820 830 840 850
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CCDS74 ---EC--SEED--LCQSGICTNTDGSFECICPPGHRAGPDLASCLDVDECRERGPALCGS
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pF1KSD L-CPDGKGY---TQDNNIVNYGIPAHR--DIDECMLFGSEICKEGKCVNTQPGYECY--C
: .. : ..: . .. : :.:::. .: ::: .: :: .:.: :
CCDS74 QRCENSPGSYRCVRDCDPGYHAGPEGTCDDVDECQEYGPEICGAQRCENTPGSYRCTPAC
910 920 930 940 950 960
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: : : ::::: ..: : ..::.: :...: : : . :.:.
CCDS74 DPG-YQPTPGGGCQDVDECRNRSFCGAHAVCQNLPGSFQCLCDQGYEGARDGRHCV----
970 980 990 1000 1010 1020
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pF1KSD MDVDECQD-PAACRPGRCVNLPGSYRC--------------ECRPPWVPGPS--GRDCQL
::.::. ..: . : :. ::. : .: :: . . . : . :
CCDS74 -DVNECETLQGVCGAALCENVEGSFLCVCPNSPEEFDPMTGRCVPPRTSAGTFPGSQPQA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1130 1140 1150 1160
pF1KSD PESPAERA-------PER------------RDVCWSQRGEDGMCAGPLAGPALTFDDCCC
: ::. : :.: : :. . . : . :: .:...:::
CCDS74 PASPVLPARPPPPPLPRRPSTPRQGPVGSGRRECYFDTAAPDACDNILAR-NVTWQECCC
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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:.:::. :: ..:: .:. . . : : : . : ..: :::.
CCDS74 TVGEGWGSGCRI-------QQCPG--TETAEYQSLCPHGRGYLAPSGDLSLRRDVDECQL
1150 1160 1170 1180 1190
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pF1KSD -----CVSGRCVPRPGGAVCECPGGFQLDASRARCVDIDECRELNQRGLLCKSERCVNTS
: :: :: : : : .:. ..: .:.: :::
CCDS74 FRDQVCKSGVCVNTAPGYSCYCSNGYYYHTQRLECIDNDECADEEPACEGGRCVNTVGSY
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1280 1290 1300
pF1KSD GSFRCVCKAGFARSRPHGACVPQRRR
CCDS74 HCTCEPPLVLDGSQRRCVSNESQSLDDNLGVCWQEVGADLVCSHPRLDRQATYTECCCLY
1260 1270 1280 1290 1300 1310
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80 90 100 110 120 130
pF1KSD RDSCQQGSNMTLIGENGHSTDTLTGSGFRVVVCPLPCMNGGQCSSRNQCLCPPDFTGRFC
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CCDS74 LLKRRRPRGPGGRGLLRRRPPQRAPAGKAPVLCPLICHNGGVCVKPDRCLCPPDFAGKFC
90 100 110 120 130 140
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pF1KSD QVPAGGAGGGTGGSGPGLSRTGALSTGALPPLAPEGDSVASKHAIYAVQVIADPPGPGEG
:. ..:: . . :::.: :. ..: :: . :. .:.. : .: . : :.
CCDS74 QLHSSGARP-PAPAVPGLTR----SVYTMP-LANHRDD---EHGV-ASMVSVHVEHPQEA
150 160 170 180 190
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pF1KSD PPAQHAAFLVPLGPGQISAEVQAPPPVVNVRVHHPPEASVQVHRIESSN-AESAAPSQHL
. : . : :: . :...: : : :.. ::.::: .
CCDS74 SVVVHQVERVS-GPWE-EADAEA------------------VARAEAAARAEAAAPYT-V
200 210 220 230
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pF1KSD LPHPKPSHPRPPTQKPLGRCFQDTLPKQPCGSNPLPGLTKQEDCCGSIGTAWGQSKCHKC
: . : . . .: ::.. : :.: ::::: :: :: . : ::: :. :
CCDS74 LAQSAPREDGYSDASGFGYCFRE-LRGGECAS-PLPGLRTQEVCCRGAGLAWGVHDCQLC
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD PQLQYTGVQKPGPVRGEVGADCPQGYKRLNSTHCQDINECAMPGVCRHGDCLNNPGSYRC
. .. . .: . :: :..:.:.. :.:..::: : :.::.: :. :.: :
CCDS74 SERLGNSERVSAP-----DGPCPTGFERVNGS-CEDVDECATGGRCQHGECANTRGGYTC
300 310 320 330 340
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pF1KSD VCPPGHSLGPSRTQCIADK--PEEKSLCFRLVSPEHQCQHPLTTRLTRQLCCCS-VGKAW
::: : : ::..::... : :. :::.. . :. :. .:.:.:::: :::::
CCDS74 VCPDGFLLDSSRSSCISQHVISEAKGPCFRVLR-DGGCSLPILRNITKQICCCSRVGKAW
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440 450 460 470 480
pF1KSD GARCQRCPTDGTAAFKEICPAGKGYHILTSHQTLTIQGESDFSLFLHPDG--PPK-----
: :: :: :. .:.:::::: ::: . ::. .: : ::.
CCDS74 GRGCQLCPPFGSEGFREICPAGPGYHY----------SASDLRYNTRPLGQEPPRVSLSQ
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:. :: . :: . : :: . : : : . . .: :..
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: : . ::::: : :. ...: :. ..:::: :. :.
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: .: .. : :.::.:. :. :.::.::. :: :: : :: ::. : : ::
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. .. : :: :..::.. : ::: :. : :.:: ..: : :.: .: :: :.:
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:: ..: : :.:.: :::.: :: :.::.: :: :.::.:::.. : :. : :::
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.::: : : .::..:.: :. : .: .:. :: . .: .:.: . ::.
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. :: : : : : .. : . : : : .. : ..: . ..
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: :.:::. .: ::: .: :: .:.: : : : : ::::: ..:
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: ..::.: :...: : : . :.:. ::.::. ..: . : :. :
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: :. . . : . :: .:...::: :.:::. :: ..::
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.:. . . : : : . : ..: :::. : :: :: : : :
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CCDS74 SFLCVCPNSPEEFDPMTGRCVPPRTSAGTFPGSQPQAPASPVLPARPPPPPLPRRPSTPR
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CCDS74 QGPVGSGRRECYFDTAAPDACDNILAR-NVTWQECCCTVGEGWGSGCRI-------QQCP
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1190 1200 1210 1220 1230
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CCDS74 NGYYYHTQRLECIDNDECADEEPACEGGRCVNTVGSYHCTCEPPLVLDGSQRRCVSNESQ
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pF1KSD TLIGENGHSTDTLTGSGFRVVVCPLPCMNGGQCSSRNQCLCPPDFTGRFCQVPAGGAGGG
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CCDS54 TLISENGHAADTLTATNFRVVICHLPCMNGGQCSSRDKCQCPPNFTGKLCQIPVHGA---
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pF1KSD TGGSGPGLSRTGALSTGALPPLAPEGDSVASKHAIYAVQVIADPPGPGEGPPAQHAAFLV
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CCDS54 -----------------SVPKLY--------QHS--------QQPGKALGTHVIHSTHTL
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pF1KSD PLG-PGQISAEVQAPPPVVNVRVHHPPEASVQVH---RIESSNAES---AAPSQHL----
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CCDS54 PLTVTSQQGVKVKFPPNIVNIHVKHPPEASVQIHQVSRIDGPTGQKTKEAQPGQSQVSYQ
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:: : :: . : . : ::::::.:. .: ::. ::::.::::::
CCDS54 GLPVQKTQTIHSTYSHQQVIPHVYPVAAKTQLGRCFQETIGSQ-CGKA-LPGLSKQEDCC
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CCDS54 GTVGTSWGFNKCQKCPK-------KPSYHGYNQMMECLPGYKRVNNTFCQDINECQLQGV
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CCDS54 CPNGECLNTMGSYRCTCKIGFGPDPTFSSCVPDPPVISEEKGPCYRLVSSGRQCMHPLSV
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.::.:::::::::::: .:..:: ::::::::::.: :: . :. :. . . .
CCDS54 HLTKQLCCCSVGKAWGPHCEKCPLPGTAAFKEICPGGMGYTVSGVHRRRPIHHHVGKGPV
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:..: . : : . : :.. : : .:.: :.: : .: :..: .
CCDS54 FVKPKNTQPVAKSTHPPPLPAKEEPVEALTFSREHGPGVAEPEVATAPPEKEIPSLDQEK
430 440 450 460 470 480
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pF1KSD -----------PTATTTPARP-YPELISRPSPPTMRWFLPDLPPSRSAVEIAPTQVTETD
: .: .: .: .: . :::. :. : .. :::::::: .
CCDS54 TKLEPGQPQLSPGISTIHLHPQFPVVIEKTSPPVPVEVAPEASTSSASQVIAPTQVTEIN
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pF1KSD ECRLNQNICGHGECVPGPPDYSCHCNPGYRSHPQHRYCVDVNECEAEP--CGPGRGICMN
:: .: .::: :.:. : :.: : ::: :.: :::..:: :. :: : :
CCDS54 ECTVNPDICGAGHCINLPVRYTCICYEGYRFSEQQRKCVDIDECTQVQHLCSQGR--CEN
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pF1KSD TGGSYNCHCNRGYRLHVGAGGRSCVDLNECAKPHLCGDGGFCINFPGHYKCN-CYPGYRL
: ::. : : :. .. : .:.:..:: .: .::.: :.: : ..:. : :::.
CCDS54 TEGSFLCICPAGF--MASEEGTNCIDVDECLRPDVCGEG-HCVNTVGAFRCEYCDSGYRM
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.. ::::::: .::.::: .: :.:::..:. : :.:. .: : ::.:: : .
CCDS54 --TQRGRCEDIDECLNPSTCPDEQCVNSPGSYQCVPCTEGFRGWNG-QCLDVDECLEPNV
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CCDS54 CANGDCSNLEGSYMCSCHKGYTRTPDHKHCRDIDECQQGNLCVNGQCKNTEGSFRCTCGQ
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910 920 930 940 950
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::: ..::: .:: :::.. .. . : ..: :::.:::.::::.: :.::.:::
CCDS54 CPVLGTAEFTEMCPKGKGFVPAGESSSEAGGENYKDADECLLFGQEICKNGFCLNTRPGY
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pF1KSD ECYCKQGFYYDGNLLECVDVDECLDESNCRNGVCENTRGGYRCACTPPAEYSPAQRQCLS
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CCDS54 ECYCKQGTYYDPVKLQCFDMDECQDPSSCIDGQCVNTEGSYNCFCTHPMVLDASEKRCIR
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: : . :. :. . .:.
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1140 1150 1160 1170 1180 1190
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:: . ... .:. ::.: :. .::: :..:: :: :: . . .. : :.. .
CCDS54 CWEHLSDEYVCSRPLVGKQTTYTECCCLYGEAWGMQCALCPLKDSDDYAQLCNIPVTGRR
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1200 1210 1220 1230
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. ... : : . : .: : :: ...:: : .:::: : .:
CCDS54 QPYGRDALVDFSEQYTPEADPYFIQDRFLNSFEELQAEECGILNGCENGRCVRVQEGYTC
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1240 1250 1260 1270 1280 1290
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.: :..::... :::..:: :::.: :::. .:.::.::..:.: :.. : . :
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CCDS33 TLISENGHAADTLTATNFRVVICHLPCMNGGQCSSRDKCQCPPNFTGKLCQIPVHGA---
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CCDS34 GMCINEDGSFKCICKPGFVLAPNGRYCTDVDECQTPGICMNGHCINSEGSFRCDCPPGLA
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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